Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA003725

[Submit comment/correction]

Sequence
AA003725
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA003725
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCACAAGTTAACTACGGTCTACCTCCTCTCGCCGCCGCGGCTGAGACCTA
AGCCCTAAACCCACCCCGCATAGCTCGTCCCTTGTGCGCCTCCCCACCCA
TGGCGCGCCTCACCCCCTCTACGTCCGGCGGCAAGTCCAAGCCCTCCACG
GATTCCGCCGCCCCTACCGCGGAGCACAGGCCGCGGCGGCGGCCGCAGAT
GAAGTCGAAGGCGGCGGGCAAGAAGAAGGCGGCGCAGGCGGCGCATAAGA
AGCCCAAGTCGGGCGGGTTCGAGTCCCTGGGGCTCTGCGAGGAGGTCTAC
CGCGGGGTGCGCCACAAGGGGTACCGCGTGCCCACGCCGATCCAGCGCAA
GGCGATGCCGCTCATCCTCGCAGGGCTCGACGTCGCAGCCATGGCCCGTA
CTGGGTCCGGGAAGACCGCTGCCTTCCTGGTGCCCATGCTCCAGCGCCTC
CGCCGCCGCGACCCCGGTGCTGGTATCCGGGCGCTCATCCTCTCGCCTAC
CCGCGACCTCGCAACTCAGACGCTCAAGTTCACCCACCAGCTCGGCAAGT
TCACTGGTGCGTACCGCTCTCCTACCATGCCTTGTTTTGCACGATCGGAA
CTGTGGTTCCTGTAGCAGTTAAGCTCTGGACGGTGGTTACTTTTTTTTTT
CAATTTGTAGTGGCTACTATCTGAGACCTCGATGTTTTGTGGTATGATCG
GTACTTAGAGCTGTCTAAGGTTAGGCTGCCTTCAGTTCGCTGTTTATCTC
TAGAACGGCATGATTACTACTACCTCCATTTCAAAATATAAGACGTTTTG
GTAGGCTTATAATTTGGAATAGAGGTACTTATTAGATGTTTTAATGTGCT
ATTTGGCTTGGATCATGTATGGATGTGATAAAATAAGCTTAGTGTTATTG
ATAAATTGAATGTGTCACTGGTTATGCACGCAGAGTTCCTTGTATGCAAA
GTTAATTAAAAAGATTTTGTGCTTGTCATGCATTATGTCACTATATGAGC
CAATTTGTATTATTAGTGGTGATTGAACCCTCATTGTAAATTGGAAATCA
TTTTCTTTCTATATAGATTTTGTCTTTTGCATTTGCAAAAGAAATGCTAC
ACCAATGTTGATGAACTATGCAATTTTTCCTTTCTGTAGATCTAAAAACT
GGCCTAATCGTTGGTGGAGGTAGTATGGACAGTCAGTTTGAGGTATTGGC
TGACAATCCTGATATCATAATTGCGACACCTGGTAGGTTTGTGCACATTT
TGGATATGGTTGATGACTTGTCACTGCGATCGGTTGAATATGTTGTGTTT
GATGAAGCGGATTCCCTCTTTAGCTTGGGGTTTGCCGAGCAATTGCACAA
AATTCTACATAAGCTGAGTGATACACGGCAAACATTGCTCTTCAGTGCTA
CTATGCCACAAGCCCTAGCGGAATTTGCAAAAGCTGGCCTACGTGATCCT
CAAGTTATAAGACTTGATTTGGATAAAAAGATAAGCCCTGATCTGAAGCT
CGTCTTCTTCACACTGCGCCAGGAAGAGAAACTAGCTGCTTTACTGTATT
TGGTCAGGGAGCGGATCAGCTCCGAGGAACAGACAATGATATTTGTTTCA
ACGAAGTATCATGTGGAATTCCTGAGTATTCTTTTCCGCGAGGAGGGCCT
AGCAGCTTCCCTTTCCTATGGTGCTATGGATCAAGAAGCCCGCACTGAGC
ATATTGCAAAATTCAGGGCAAGGAGGACCATGCTACTCATTGTGACAGAT
GTTGCTGCAAGGGGTCTGGATATTCCATTGCTTGACAATGTAGTGAACTG
GGACTTCCCTGCAAAACCTAAGTTATTTGTTCATAGAGTTGGCCGGGTAG
CTCGACAAGGCAGAACTGGGACAGCATATACATTTGTCACTTCAGAGGAC
ATGCCGTTTCTATTGGACCTACACCTCTTTCTTTCAAAGCCTCTTAGACC
TGCTCCTACAGAAGAGGAACTGCTGAAAGACATGGATGGAATCAATTTGA
AGATCGACCAGTCTCTTGCTAATGGGGAAACAGTATATGGACGTTTTCCT
CAGACAATCATTGATCTTTGCTCTGATGGAGTAAAAGAAGTCATGAATAG
CTGCACGGAATTGATTGCATTGGAGAAGCCATGTGCTAATGCTTTCCGTT
TGTATCTGAAGACTCGTGCCATGCCTTCAAAGGAATCTATCAGAAGGGCG
AAAGATTTTCCCCGTGAAGGTCTTCATCCAATTTTCAGAGATGTTCTCAG
ATCAGATGAAATTTTAGCTCTTGCGTTCTCAGAGCGCCTCAAATCATTTA
GGTAGTTTCTTCAGCTAGCGATTCTTTATATTGCTTGTATCTGCTCATTT
TGTGCCTTCTAATGGGACCTTTTCATTCTTAATGGTTATCAGGCCAAAGC
AAACTATTCTAGAGGCTGAAGGTGAAGCTGCTAAATCAAGGAGTTTTAAA
GTAACGCATTGCTGCTTCATTTTTTTGTTTTGTTCTGAAAATTTTCAGCA
TTATATGTGTTTTTATTTTCATATCTGCAACATGCAGCTAGTATACTAAT
AGCTCTGATCTCTTTACCTGATTAATGGCGAAACTAACTTCCCATACGGT
GTTTAGGCATCCCAAATGTGGTCCATGCAAACATTACAAATATGTGTATT
ACCATATTCTTTAATACTAACCCGACCATCGGATTTTCATTGTAGGGTAG
TAATCAGTTTTTAGATGTGATGAAGAAGAAAAGAGAAGTCCACGAGGGGA
TCATAAATTTGGTGCATGAACAAAAATCTGGTGATCGGGCAACAAAGGTA
ATTATTATTCTGAAGCCATATATTTGTTTGTTCTCAACTTCTCATTTAAA
CACAGCAAGCTGCGAACCAATTAATGACTTGATACACTTGATATTCCTTG
AAGATGCTAGATATGACAATGTTACTCGGCTGGGGGTATTAGACTAGACT
ATTGGAGTGCCTTATCATTTATGTGGAGAATTCTATCCTGGAAGATTGGT
TGTTGCATCAAAGATTCCTGGAACAAACTAAAGTTATTTTTTTCAAAGCC
GATCAGCAAGAATGTATTACACTGGCCTAGAAGTTCCATACTTTTTGGCG
ACTGTTTTCTCTGTGTTGACTCAGACAAATGCTCACATGCACTTATGTGT
ATTTGTTTTGAATAAAACTGTAGTACATGCTTGTTCCATGTTCTGGAATT
TGCAGATAATTGTCTTAACTGTGAGGTTCGGTAGTTGCTTGGTTTGGGAT
ATTTACTTCTAATAGAATGCTCTGAACAATTAGGGTGAGTAGTTTATCTA
TTCAACTCCTGCCGCGATGGAGCAATATTTATATGCTGGAAAAATATTTA
TATGAAACACACAACAGATGCATGAATCATGTCTGGTAGTGGTTGACCCC
TTGTAAGTTAATTCGTTTGTTTGTTCCATTATCGTGATTGTAATTTGATA
GTTCAGTGTTATGACTGTAACCAGTAGTTTTTGCTGGTATCCACCTTAGC
AGTGATTGTACAGCTAATGCTGATTATTCTAACCATCAGATTATATGGTA
ATAGTCTAATAGAGTAAGCACTCCTTACTGGTTCTATGTATACAGCCTAT
TAGACCAATTTTAGAACAGTTTATAGTTATTCCATTAAAGTATTATAGTT
TGATGACAACATGGCAGTCCAATATTAATATGAGCATACCTTTATTCATT
CTTCTGCACATGCTACATTGAATGTACTTCCTCTGTCCCAAATTAGATGT
CGCAAATTTTTCTAGATTCACATGTATCTATACACTAAAACGCGTCTAGA
TACATGAGAATCTAGACAAATCTACGACATCTAATTCGGGACAGAGGGAG
TAGTACTTTGTTCTTATGCTTTGTGCAGTGATTTATGGCTACTTATTTTT
ATGCAGGAAGAAAATGCAGAAAACATTTCAAATTGGGAGCAAAAAGGTAT
GCATACTTCGATCATATGAGGTGTAGTGGGATTAATACTGTTATTGCTGT
TTTAAACTCAAAGTGCATCTTGAGCTCTACTGCAGCATTCCTAGAGAATT
CGTCTTCTTTTTATTGTCGTGTTTATAATATTTTGCATTATCTATCGATT
TCAGAAGTTTCTTGTAAGAAGCGAAAGTCGCAGAGCTTTAGAGATGAGGA
TCACTACATAAGTTCAGTACCTCAAAATCAAGTAGGCGGTTTGAAGAGAA
ATATCCTTCACATTTTGTACTGCTAGGGAATATTTATTAATTTATTTATC
AAATTGCAGTTGCTTGATGTATCTCGTATAATATTGATTTAATTATTACT
TTCCTCCTTCAGCATTCGGAAGCTGGGTTATCAGTGACAGGAAATGAAGG
ATTTGTTCAAGATAGGTATGCTTTGTACGCTTCCTGATATGTAATTGACT
GTATTTGTCTGATGTGGAATTGTGCCATTATACTATCATTCACTATAGCA
AATTATCAGTACATCTACTGGGAGTTGTACTGCTGTAGGTAGCAGGTATA
AGAAAACCTGATTTTGAACCCAAAGTAGCATGGCTGGTTCCTGGTCAACT
CCTGTTTGCTTTTCTCTTAATTTATTTGTATTCTGTAATCATAGTTACAT
CAATTTTTGTTAAATTAGCACGATAGCACATCACATCTTGTGTTCTGTAT
GGAACATACTGATCTACCCAGTAGGACAGATAACCGGCAGCTCACCACAG
GTTCTATTACCCCTGGTCTTGATTACAGGTCAGATGTTGAACGAACTGGT
CATGTGTTGAATATTAAGTACAGAAACACTTGTGGTGTACTCCTGTTCCA
CAATATAAGCCTTTTTAGCAAGATAAAACAGTATGCTAAGAAGGGGTTTT
AGCTTGCTAAGAAGGCTTATATTGTGGAACAGAGGGAGTATCTTTTAATC
ATGTCCTCTCTCCAGCATGAGTAGGGTCTGCTGTTTTCAATTCTAAGAAG
TTTTGGCACATGCCTCCGTTGCACAATAATTTGTCATATCCAAGTGCCCT
CATTATCCGTGAAATGGGTCTGCAGTCTTATCACCATGCTGTGTTGAACT
AAGATTAATGATGCCATGCAGATTGGACGCTGCTGTCCTAGATTTAGTTG
ATGATGAAACTTCTGGAATGCAAGCCCAGAAAACTCGATATCACTGGATG
AAGGTATAACTTTTCGTAGCAACATATCAATCTGCAATATGCATAGCACA
TTTGGTCATGGTGTTTTTTATTTATTTTTGCAGAACAAATTTGTCAAGCT
GAATAACGGGGATCGTGTCACTGCTTCAGGGAAGGTAGATCTTGTGCATA
CAGTGTATTTCTATCATGTTTAGAGGACGAAATGCTACAGTTGCTAGATT
TGAATACATTGTGATTGCCGATTTAATTGCATTTAGATGTGTAGCTCATT
CTTTTCCCTTTTGGTTTGGCAGACTTAAATATAACCTGTTCAGTTGTAAT
TCTCCTGGATGTTTGGTGCTGTTTGTCTCTGTCAAATTGATCCGAACTAT
TATAAGTAGTATATACACTAAGAAACATATGTTCCTACGCCAGAATTGGT
ATTGCAATGGTCTAATCTGAACCACGTGGAATTAGACTATTATGACAACA
TGGAATTTCGTTCTGCAACAAGAGGGTTTTAGTCCGCAGCTGAACACTAT
GATGTGATATCTTAGTAGATTCTTGTACTATAAAAACTGTAACTACGATT
GTTACACATGGCTCCTATCTAAATGGTATTAACATGTTGATAATGTGCAG
TTAAAAATTACATTGCACATGATACATATTTCTTTGAGCTTAGTTACTAA
TAACGGGAATGTTGTTTCCAAAAAGCCAACGTTTACTCCAAGACAATACA
CTGAGGAAGGTTGAATTCGTTACTGCTTGTCTTTTACTCTCTCTGTTCCA
AATTATAAGATGTTTTAGCATTTTTCTGAAGCACGTGTATCTGACGCCTT
TTAGTGTGTAGGTTCGGAGCAAAATGAGTGAACCTACACATTAAAAGGCG
TCTAGATACATCTGTTCAGAAAAAGGCTAAAAATCTAATATTTTGATACG
GAGATAGTACTTAGCATATAATGTTCAGTACATGTACAAAGGCTTGTCTA
ATATGGTGCTCTAGTTTATACCTATCTGGTTGTTTCTGTAGAGATGTCTT
ACCTAATCTATCTAGTTTTTTACTTAGCATCTAATGTTCAGTACAGGTAC
AAAGGCTTGTCTAATATGGTGCTCTAATTTATACATACTTGGTTGTTTTT
GTAGAGATGTCTCACCTAATCATTGTATAGTCTAGGCAAGCAGTTGGCTT
GATTTTTAACTTACTGTTTCTGTGATTGTGATTAGATTAAGACGGAAACC
AGTGCAAAGCTAAAGGCAAGCAAAGATATTTATAAGAAATGGCAGCAGAA
ATCACATAGAGCAATCAGTTCTGGTGGAAAAGATGGTAACTTTGAAGAAG
GGGGCACATATATGCCAGGTAATACATTCTGTCTGTCCTCATGCAGTTAC
ATTTTTTATTTTGATTTGAGGTCAACTTTTACAAAGTTCATTGCAGTTCA
TCAATATGTTACTCCCTCCGATCCATAATATAAGTGTCGCTGATTTAGAA
GCTCTATTGATTGTTGGGCTTATCATCAATAGAGCTTTATCTGAGCGTCT
ATTAACTGGAATTTTGTTTAAGCCGTTCTATCCGGGCAGTTGTTTTCTGA
CAATACATTTCTGCTAGTCTCAGCTTTACAGTTTGGCATGCTAACACATC
ATATGTTTCGTAAAAAAGAAGTCGATTGAAGCTGTGCTAGTGTTCGTGCA
ATCAGTGAGTTTATACTTAACAGTATAAGCCTTGATGGCACGTGCTAATA
CTAGTTTCTCATGTTCTGTATCCTCTTGAATTATCCCTTGTCATATTCTC
GCTCGTCTTAAAGTCTCTCGTCATTCTCTCTTCTGTTGTCTTAGCTTGGT
TTGTTAACTGTTAAATTAGGTCTGCAGCAGTTCCAACTTAAATACCATCC
AGGCCCTATGTAAGAGCAACTCCAGCAGACGCTGGAAAACCACCCCTGCG
CGCTAAAAGCTGTCTTTTTTCGGCGCGAGAGCCCGCGTCACGTTCTCCAA
CAGACGCTCTATCTTTCCGCCCGCCGGGTTGCGCGCGCTTCTTTTGACGC
TCTGCTCAGCGCGTGCTCGTTAAATCGAGCGCCGCACGTTTAGCAAATTT
AGCGCGTATGTTTTTAGTGCCTCTGCCAGAGGAGATTCGCGCACGGCGCG
TGAAACCCGGATCGTGCGCGCTGCATACGTATTTTACAGCGGCAAAATTT
GCAGCCTCTGTTGGAGTTCCTCTAAACACTGCCTGATGCTATGGCCTTCT
ATTTCCAGGTGGCTATCAAAGAGGAGACAGAAGACATGCTGCAGCTGGCC
GCGGGCGTCGGTCTATACCAAATGCCAATGTGCCATCTGAGATAAGAAAT
CCCCAACAGATGCAGAAGGGCAGGCAGCAAAAAGCAATGCAAAATATGCG
CATGAAGGAGAAATCTGCAAAAGACAGTAAATTTCCCAACAAGTTCCAGA
AAAACAGGAGGCCTGGTGGATCTGCAAGAGATGGTAAATTCGAAAACAGT
AAATTCCAGAAGAACCGAAGACCAGAAGGGAAAGGGAGCGGAAAAGGGAA
TGGCAAAGGGTTTGGTAAAGCGAAAGGAAAAGGCAAACCCAAAGGGAAGG
GTACCAGGTGATTGTCTGTCCAAGTAGATTTGCTGCACCCATCTACAGGC
TGTATCAAAGGAACTATTTGACAACCAACACGAAAGTGCGCGGCCAAGAG
CGTTATTTTCTCATATGTCACACACCTGTGCTTGCTCCAGACCTGTTCCT
TAGTTGACTAAAGTTTTATTTTTCTATTATAATTCTTTTTGATAGTTTAT
GGGAGAAAGAACCATGATCTTACCAGAAATGTAACCAGTTTTGTTACTCA
TGCTACCCTACTCTTGTTGAAATTATGAAAAAGCTCAACTGTTTATTTGA
CA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.