Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA019713

[Submit comment/correction]

Sequence
AA019713
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019713
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGTAACAACTGTTGTATGTATGGGTAACAGTGGGATATGATCCCTTG
ATAACCTCAAAAATATGCATGGATAACATTGGACAGGATCTGTTGATAAC
AGAAGTAAAGTGTTCTGTGCTAATTTTTTTAATCATGTGTATTTTGAGCA
AAATGCATGATAGTGTGTGTGTTTTGACATGGATAACTAGTGTTATGTTG
GTATGATAATATCATGGTCTAATGGGTATTTTGAACATTTTGGCTGATAA
CAACAGATCTATGCATGGGTTACAACTGTTGTATGTATGGGTAACAGTGG
GATATGATCCCTTGATAACCTCAAAAATATGCATGGGTAACATTGGACAG
GATCTGTTGATAACAGAAGTACTAAAGTGTTATTAGCTAAAAAAATTAAT
CATGTGTATTTTGATCAAAATGCATGATAATGTTTGTGTATTGACATGGA
TAACTAGTGTTATGTTGGTATGATAACATCATGGTCTAATGGGGATTCTA
AACATTATTGCTTGATAACAACAGATCTATGCATGGGTTACAACTGTTGT
ATGTATGGGTAACAGTGGGATATGATCCCTTGATAACCTCAAAAATATGC
ATGGGTAACATTGGACAGGATCTGTTGATAACAGAAGTACTAAAGTGTTA
TTAGCTAAAAAAATTAATCATGTGTATTTTGATCAAAATGCATGATAATA
TTTGTGTATTGACATGGATAACTAGTGTTATGTTGGTATGATAACATCAT
GGTCTAATGAGGATTCTAAACATTATTGCTTGATAACAACAGATATAGCC
ATGGGTAATAAATGATGTATCTATGGGTAACAGTGGTATATGATCCCTTG
ATAACATCAAAAAATGTGCATGAGTAACATTGGACAGGATATGTTGATAA
CAGCAGTTGTAAACTGTTATGTGGTAAAAAATTATTCATTTCTATTTTTG
AGCAAAATGCATGATAATGTGTGTGTTTTGACATGGATAACTAGTGTTAT
GTTGGTATGATAACATTAGCTTATTATCATGGGTAATTTGTGTTCTGTTT
GCATGATAATATTAGGTTATTATGATTGATAACTTATGTACTGATGGTAT
TGTTTTATTTTTTTCTATGAATTCTAGTGTATCATTATGGTTTAGTTTTG
TATTTATTTTTTCATTTTAAATTGTTTTTAGTTGCCACGATGCCAAGGAA
ACGGAAGGCTGCTGATAATGTTGTTGAGGGTGAAAAACAACCTGCCCGTA
AACGTAACCGGGCATCTCCTTCTGCCGTGACCGGTTTACTGGATTTTCTA
TCGAATGATCATAAGGCAGCAATTGAATCAATGGAGTTTGATAGTTTGTT
AGATATCAAGTGTTCATCACTGCACGACGCAATTATGACTTGGTTTGCTA
GTTTATATGACAATCATACACGTGAATTTGTTATGCCGGGTCGAGGAAGG
ATACCCCTCAACAAGGATAGTGTATTCAGATGTTTGGGTTTGCCGCTTGG
TGAAAAGCCGGTTCCTTATTATGCTGATGCGGAAATTCATGGTGCTCTTT
CCCCTGCTCTTTTTCCTGATGATTCTGGCACGCCTTTGAGAACTCGAGTT
TTCGAAATTTTGAAGGATATGACTTCATCTGGAGATGAGTTCAAGCAAGT
ATATGTGATGTACATTGTGTCTACACTTTTATCACCCACCACCCGGAACC
GTGTTTGCCACAAGTGCTACCCTATCATGGTAAGTTTTGGGTGTAATGTC
TGTTCATTTTCAATATATGAGTTTGGCTGATAACTTATATGTTTTTGTGT
TGATAACTTTCTGTTTGTTTGTGATGATAACTTGTGTGTTTACATTTTTT
TATGTTTCTATGGTGATGTGTAATATATGTGCAAGTTTTGATGTTATGTT
GATAGTTTCTTTTTGATTCTATAATTTCAACACAACATTGGAAATGTGTC
CAAGTTCCAGTGGTGCAAGTTTGTTGCTGACCAGCTGCATGAGGAGCTTT
CTAGTGGTAGTCATACGCAGGCTTGCCTTTTTCTGTTGCAGGTACACGTT
GCTGTTTTTATATTGTGTGAATACTACTTTCTATATTGAAATTTGTTTTA
TGTTTTAGTTGGTGTATTTATTGTATTCCTTGTCTGTTTTTTAATTTGTT
TTCTTTGCAGCTGCTTTATGTTGACTCACTAGATGTTAGTCGTTTGGATA
TTGATTTGCCGGAAGGGCGTTATGCTGTGAACATATGGTCAAGAGAGTTA
ATTGATGAAGTGTTGATTGCTGATCTGCAGAATGATGGGAATGCATATGG
AAATCTTGAGGTGTGTAATATATTTTGTAGCATTTGTGTTTTTATGTTGT
TGATAACTTTTTATGTTTAACTGTTGGTAACATGTTGTATGTCTGTTTGA
TTACATTGAGTATAAATAGTGGGTAACTTATGTGTTTATTGGATGGTAAC
ATGTAGGTTATCATGTTATTAAGTTGGGTAATCTGTAGAAAACTGGTTGA
TCACATTTGCTAATTCTGTATTTGTTTCTTTGTGCAGTTGAAGCCTCAGT
ATGGCATGAGCTTTGGTCTTTTTGGTGGCGTGCAAGGGTTTAACAAATGG
TTTGACACTTGTGCAAACCCTAGTTGTTCAAATGAGGTGATATTTTTATC
ATTTTGAAATTGTACTTATATTTTTATTGTCATGTTACTTTTGTTTGCTT
CTTGTTTTGGTAATGTTCTTGTTGTTTCCTTTCTTTTTATTTGTGCAGCA
AAAGTCGCGGATAGCAAATCTTGTTGGCAGTTTTGCATCCGGTATTTTTG
GGTTAATGAGTAACCTTGTGCAAGGCTTGACGGCGGTGCAAGGCAATGCT
GGTGCTGAAATGGCAAAACAGTTTACTGCCCAGTTTGGTGGTCAACTTGC
AACGCAGCCCATTGGAGGAATATTCATGGGTGGAGCTAGCTCAGGTGGTG
CCCGTGGTGCTACCTCAAGTGGTGTCCGTGGAGCTAGGCTTACTTGTTCT
ATCACTCGTGGAAGGAATGTTCCACGCACTAATGAAGTCTTGTCTCCTAT
TCTTCCTAGTGATAATACAATTCTAAGGGATTCAGACAGCAGCAGTTCTG
ACAGCAGTGGAGATGATGATGCTGAACGGTTTGTCCGTGCTGACAGGAAG
GGTAAGGGTGTTGTTGGTGGTCGTGCTGGTGGTTCTTCCAATCTCCAGCT
ATCTTTGACTTTCTCGGATTCTAATTAAGAGCACAATAATAGTCCAGGAT
CAAGATCACCTGATGATCGTCATATGTCACCACCGGAAGCTAGGTCACCT
GTTGTAGATCTGTGTCACCACCGGAAGCTAGGTCACCTATTGTAGATCCT
GTGTCACCTGTAAACCGGGTGACTGATACTCCTATTGTGGAAAAAAAAAC
TATTCGTGTGTATGAAAGGTCTAGGAAGAAGAAGTCACGTCCGGTTGAGG
ATGTTGATAATGTGATCAATTCGTGTACTATTGAAGATATTGATAATGAG
ATCAAGTCTCTTGTCTACAGAGATTTGGGCCTTACTCCTGCCATGATGTG
GGCTGCTGTTTCAGATAGGTATGAGTGGGCATAATTATTTATCTCATTCA
TTGGATAACTTTACTACCTTAGTGTTGATAACTGTATCATTTTCATATGT
AACTTGTTTTAGTTAATGTGGGTAACCTTTATTTTTTATGTTGATAACTG
TATATTGATAACTGTATCGTTTGTTATCCGATAACTTTTTTATGTTTATT
ATGATAACTGTATCACTTTTCATCTGATAACTTCTTTATGTTTATACTAA
TAAATGTAGCATTTCTCTCATGATAACTTCTTTATGTTATTGTTGATAAC
TGTAGCATTTCTCACATGATAACTTTTTTATGTTAGTGTTTATAACTGTA
GCATTTATCACTGGATAACTATAGTATATTTCATCTGATAACTTGTTTAT
GTTCATGTTGGTAACTTTTCTGTTTTCTGTTTATTATGTTCTGATTTTTT
GTTTTTTGTTGGCAATTATTTATTACAGCAAGAAATTACCGAAGAAGGCA
TCGGTGCCTGCTACAAGGTCTTCACCACGGTTGGCAAAACAGCGTTCTGC
AGATGAAGGCACATCTGTTATAGATGTTGATGCATCCTCTCCTATTCCTT
CGCCTAGTCGTGTTGAAGGACATTCTAATGTTGTTGCAACTCCTGATGTT
GTGGATGCGCCTGTTTTGAATGTTGAAGAGGTTATATCTGGTGGAGAAAC
ATGTGGCAATGGTGGTGCTTCCAAAGACGTTGTTGTGACGAGTGCACCTG
CTACAGTTGTAGTAGGATTATCTGTTGATGTGGCAATGGATGTATCTGAA
CCAGTCTCGAGAGCTGTAGTGATTATGCATACCATTGATCAGCCTGTTAG
CAGCAACTTTGTAAATATCATGGCAAACGAGACGGATAACATCACGGAAG
TTGCTGATGCCACTAGAGATGCCCCTCATGTTGATGCCAATGTTGATGAT
GCCCCTCAAGTTGATGCCAATGTTGATGCAGGTGCAAGTGGTTTTGTTTG
TCCTAATGGTGTTGTTCTTGTTCCTGCATCATCGCTGTTCACCAACATTG
CAGCAGGTTCTACTTCGGTTGATGTTGCTGCAAGTCCTGCTGTTTGCTCG
CTTGAAGATCCATCAACCCAAGGTGAGAGTGAAAAGGATCCTTCTGTCTT
GGATGATAGTACCCAAGAAGATGTACAACCTGTTTTATCTACTCCTTTGG
TTCCTGCGTCTAGTCTTTTCGACCCCCTTATTAGGAGGCAGTCTAGTGTG
CTCAAGACATCTGCTGGTCCTTAGAGTGGTGATGGAATTTTTGAAGCTGA
AGTCACTGTTATAAAGAAAGCAAAATTGGTTGCTCGTGATGGAAAGCTGA
GTCTTGCTACTGGGATACCATTGCATGTTTATAGGGATGTTGTGTCGTAT
TCTGTGCCTGATGCGGATCCTCTTGTTTCTCCTATTGTTGGTCCCCGTGT
AGAGCCTGCTCGTACTGTTAGTGTCTCTGTGCAGCCTGCTGCTACTGCTA
GTGCACCTGCGCAGTCTGCGCAGCCTGCTCCTGCTCAGCCTGATCTTCGT
ATTGTTGCACAAGGTGATTCTAGTGTTGTCCCTGTTTCTCATCACATTTC
TGCTGATCCCGGTGATTTATTCCATGTTTTTTAAGCAGAAGATGTTCTTC
CTTTGTCTTGGGCACCTTCTCCCAGCACTGGTACACACTTTCACCCTGAT
AACTTTATATATATGCCCTGGATCACCTTTATATATTAGTGCTGATAAAT
GTGTCTTATTTATGTTGGTAACCTAAATTGTTTTTTGTTTTTCAAAGTTT
TAAAATGCTTGCAACTTTATTATATATTTGTCTTATATGATTTTTTTGTA
ATGTAAAACTTTATTCTCTTAATTATGATTTATTTCATAGTGTATGATGT
GTCTTTATCATTTTGTGCATTTTTGGTTTGTACTGATAACTTTATTTATA
TGCCCTTGATCACTTTTATATACCAGTGATGATAACTTTAGCTTATTTAT
GTTGGTAACCTACACTGTTTTTATGCTGATTACTTTTAGTAACAAATTAT
ATGATATTAACAATTTTTTGTTTTGTCCCTTTTTCTTCTTGTCTTTCTTT
TGGGACATATTCTATGCAGTTGTTAACTTATTGAACTTACCGAAAACGGG
TGGTGATAAAAATGAGGGTGCAGACAGATGTAGTTAAATGTCCCTTTTGG
ATAAGAAAATTGAAGATCATCGTTGCGATGGCTGTTTTGGGGCTTAGGTT
TCAAACTTGAAAATCATGATTCAGTTTCATGGCTATTTGGATCTGTTTTA
TGACAGTCGTAGTTAAAATTAGGTTTCAACTTATAGAAACTTTTATTTTG
TGATATGTCGTTGATGGAACAATTTGTGCTGTAATTTTTATGACTCTATG
TTTGTGTGTTGTAATTAAACTACCTTTTATTATTTTATATATGTTATGTT
TTTTATTTTTTTCTTTATGGTGATAAACATGTGGTTTTCTTTCTTTTTCC
ACGTGGGTTCTACCATTTCTATCCTTTTTCATTTGGACATTTCCTTTGTC
CGTTCTTTATTCTTTTTGTAGTGTATCAACAAAAAGTTGATTGTAATTGC
AAAAAGGCAGTAAATGATGAAAATGTAGTTATTTCTCTTGATGATCTGTT
GGATGAAAAGATTGGTTATCAAGCTGTTCGGAGTTTTACGAAAGATACCA
AACAGTTAAACCAGACTAGTTGTTCCGTTCCAGGTATCTAAACAAAATTG
TTTAGTTACTATTTATGTATTTGAATGTATATTTTTTATGAGTTGTACTA
ATTTTTTTTTGTTATAGTTGTTCCTGATTATTCTACTCCTGGTATCAGTT
CTGCTCTTCCAGTTGCTGTTGCTGGTAGTCTTACACCTGCGACGCGGCTG
CGTACTGTTAGACTTATTCATCCTGCCAAGTATCTTCTTCCTCCGTTCTC
CTATATTAAGACAACTGCAGAATAAGATACATTGTATAAAAAGATTATCA
TACACACGCGTGATGCGAATAAGTCAAAGATTAAAAAGTATGTACATGTT
TTTTTTATAATATTCAATCCTTTTTAGTATTGTCTGTTGGTAACGTTTAA
ATGCTACCATTGGTCACTTCTAATGTTTCATGCTTGATAACTTGACTTTA
TATGTTATCTGGTTGATAAGTTGTAGTATTACTGGTGGGTCACTTATAGT
ATTTTAGTGGATAAATCTTAGTTTAAAAGTGGATAACTTGGATTTTTTCT
TTGTTGTTAGTTGTATACTAACCTGTATTACTACTTGTGTATCATTTTAT
TCTTCTAGTTGCTGAACTTTATGGTTTTCATTGTGGATCATTTTTAATTT
TTAGGGTTGATAACTTTACCTTTTTATTTGTACCTTGATGATAAGTTGTA
CTAATACTGTTTGGTCAGTACTAGTTTTGTTTGGTAACTCTTTTATCGTT
ATTTCATTGGATAAGTTGAACTTTTTTTTGTAATGGTTTGATAACTTGTA
TTACTACAGGTTGATTACTTGCACTGTTTGTTGGTGATAACTACTGGTTT
TCATAGTGGATAACTTGTATTCTAATCATTAATTTTTTTGCAGCACATCA
ATTTGTAACATTGATCCAATGTGGGTGACAACTAGTGATTTTGCTGAAAG
TGTGATGCCATATGGCGAGCTTTCTAACAATATGTGTGATCTTGCTATTT
CTGCAATGTAAGATAATTGTCCATCCAACAAGATAATTTTTCCTTATATT
GTTACTAAATATCTGTTGAAGGGAAGATTCACTCCAAATCTTGTTCGGAG
GTCGATCAGGAGAGATGCTAACTATAAACTGAGCCACAAACATATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.