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GrainGenes Sequence Report: AA034549

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Sequence
AA034549
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA034549
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGACCAACACTCCCAGCAGCTGATGAGCTAGAGAGAGAGAGAGCGTAGA
AGGAAGGAAAACCCATCGGAGCCGGAACAGGGCAAAGAGGAAAGGAGGCA
GCTTTAAAAAAGAGTCAAACCACGCCACTTTCTCTCTCTACCTCCCCAAT
CCCCCCACCAATCGCCGTCACTGCCCCCCTCCATCCTCGCCCCTCCTCCT
CCGCGCTCGCTCGTGCTCCCCCCAGCGCTCGGCTAGGGTTCCGGTGTCGG
ATTGGGAAACCCTAGCTCCTCCGCGCATTTTTTCTCGGGGGAAATTGCCC
GCGGATTCCCGAGCCCCGGCCGCCAAAACCCTAGCTTTGCGGCTGGGATC
GGTGATTCCTGGCTGTGCGCGCCCGGATCCCGTCGAATCCGCGGGGAGCC
GCCCCTGATCCGGTTCTAGGGTTTCGCGTGGGAGCGGGGAACCCGGGCGT
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TGTTTCGTCCGTGCAAATCTAGTTACTTCTTCAAACTTGTTTGGTCAGTG
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AATATCCGAGTAGCATGTGCATGTCACAGTCTTCCAGAGTATCAAGACCT
TATCATTAGTTAGATATGTCATTACAGTAATACTTCAATCTGCATGGTTG
GAAGACTTAACTGCTCCTCTTGTTTGTTTTATGGACAAATGAATAACCTT
CGATCTTTGCAAATAATTTAATTCGATTGGAATAACAAATCCATGCCCCC
CTGCCCCCCTAAAAAGACGTGTCTTCTGTAACTTTTCGCTAATGCCATAA
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AAAATACACTGGTGCGAAAATGGCAAAATCACTTAGTTGTTGCCATGTCC
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TGACCAGTAATAAATTGTAACCTGTGCTTACTAATCCTACTTTTTTCAGG
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TAACAACAAGTATGTATAAACTTCTGATCCTAAAGCAGTTCACCGAAAGA
GCCAGATTATGTTTATTAATTTACATGTCCACCTCACACAGTCACACTGA
TTCTGTTATATGAACACATTTCCATTGTTCCTTTTGGCAACATATACTAG
TCCTGTTGTCCTATGATAATCTCAGTTGATCTCATGCAGTATTTCTGTAC
ACTATGGCTCTTTTATAGGCTTGGACCACCTGACTTCTATCCTCAAACAC
CAAACTGTCCTGAAGAGACATTAACCAAAGAATACGTACAGTCTGGGTAT
AAAGAAACTGTTGATGGAATTGAGGTGTGTTTTGGAATAAACTTGTGTAC
GATGCATTAGGGCCACCCCCTACTTCCTTGAATATTATCATGACTGCAGA
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TCTCGTACTTCTGCAAGCCAGATATTGTTGTAAAATGCAAGGAGGTAAGA
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CATTTATGTTTTTTTTGTGGGCGCATGCTATATAACTAATTATTGTTTAA
TTTTTAGGATATGATTTGTCAGTCCTAACTACTCGTGTTCTACTTCGTGT
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ATTGGCACACCTAGGCCTAGGTGTTACTCGTTGATTTACCTTACTATTTC
TGACCCTGGATAGATGACAGTCTAACTGTAAAACATGAATTATATTTTGT
CCATCTGTTCTCTGTTTGTTATCCCTGCAAACAAACTGCTATTTTGGAGT
ATGGATTGTGTACTGTCTAGTTAATCTCCATCAATAGTAGGAATGCTTTT
TGGGGCTAACAGATCATCAACACATACACATAGTCACAAAAACTTCACTC
TGTCGCTTGGTTTGGATCGTTTGCTTCTGATCTCCTTGGGTGCTGGGAGG
AAGGTGAGGTGGCGTCGATCACCCAGCCAGGGTTAGGGGGTCACCTAGAC
GGGTTAGGTGGGAGGCTAGGCTGCTGCCTTTTGGAATGCTACACTTTGGG
TCATTCATGTTTCATCATAAATGCAAGCAGGTATGCTAAATATGAAGTGT
TTAAACTGTTAGACCACACAATTTGTACATCTGTAAGGGAGGGAGTTGAG
GTGGCGTCGAGCACCCAGTCAGGGTTAGGGGGTCACCTAGGCTGGTTAGG
CGGGAGGCCAGGCTGCTCCCTTTTGGAATGCTACTCTTTGGGACATTCAT
GTTTTCATCATAAAGGCAAGTGAGTATGCTAAATATGAAGTGTTTAAACT
GTTAGACCACACAATTTGTGCATCTGGAAGCCATGAATTTTAACCACAAT
GGGTTGTCTTCCTTTAATATGAGTTGAATTGGAGATCCTATGGAGTTCAC
TTTGCTGATCCGTAATGTTTCAAGGATGTGACTTTAACGCGAAGCGCTCA
GGGAAGGATTTTAGATGTGTTTGTGTTTTTTAGGGTTTGGTTACTAAACC
TTTCCGCTGGTGAACAATATGTGGAACCATAAAATTACATCTTTAATTTC
TTTGGTTACATCATTTTGCTTTCTTCCCTTCTTTGTTTGTCTGCGTATGG
CATGGAGAGACTATGGCTTCTTCACATTTTGTTGTTGTCCATTGTTTAAT
GAAGGCACTAAAGAAGCGGTTGAGGGCTATTAATGAATCTCGTGCTCAGA
AGAGAAAGGTATCACGGCATTGCTCTCTATTTGGCTTATTTGCTTCAGTG
TGGATGCCTGTAAAACTTTGATCTCTCTTATATCTCCTGAGATGTCAAGC
AGACCGGTTATTTTCCTATTTTTATAGGCTGGCCAAGTTTATGGAGTTCC
TCTTTCTGGATCACTGTTGATAAAACCTGGAGTTTATCCGGAGCAAAGGT
CATGTAATGAGGACTCCCGCAGGAAATGGACTGAGGTAACCGATTAACCT
TCCATTTGTTCTTAATACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGACTTGGGTTT
GTCTAGATTCGGATGTGTCTAGACGCGTTTTAGTATGTAGATACATGCGA
ATCTATACAAACCCAAGTCACTTATTTTGGGACGGAGGGAGTATTTTCTT
TTCAATTGGACACTGGCAGAAGTTTTGTATTTTTTATTTGCTTTTGTCAA
ATGCTTTATCTCTTAACTTTTTTTGCATGATAGCTAGCTATTTTCTTTAG
TTTAGTACTCCGTCCGATCCAAATTAATGGACTCAGATTGTCTAGATTCG
GATGTATCTAGCGAATACTAGATACATCCGAATCTAGACAAATCTGTGTC
CATTAATTTGGACCGGAGGGAGTATTTTTCTGTGGAACTGTGGGTTTTGC
ATTGCAGTTAATGATGAACTATCTTCCTTTACTTCGGAGTTGCTTTTACT
TCAAAGCCTATATTTTTTTTAAATTATGTTTATTTGGGTTCAGGGGATAT
CTGTATATATCTTTTTGATACAAAACTGTAAGGAAGACCCCTATGGTATA
GATAGGAATCCAAATTCGTGCCCGTAAAGAGTTCAACCCAGGTGGTGGGG
TTGTAAATCTACTTACCAATACCGTGAGCTAGGGATCTCGATTTGTGGTT
CTTACTGGCACCGATTTTACTCTTATTATTTATGCTCACTTTAACTTAAT
ATTCTTGTATGTTTAATGTGTGTCATTACTCTGCAGGCCCTTGCCCAGCC
AAACAAGCGGTTGCGTTTATTATCTGAGCATGTTCCTCATGGTTATCGGA
GGAAATCTCTTTTTGATGTTCTCACTCGATGTAATGTCCCATTACTAAGG
GCAACATGGTTCGTGAAGGTTACATACCTCAATCAGGTTTGCAATGTCTT
CAGATCCTATCTCATGCTTGCTACTAAACGCCATACTACATAATTGTAAC
AAAGTGTATTATATCATAGCCACAGGTCCGACCAACATCCAGCAGTATTT
CAGCAGGTCCTTCTGATAATCAGCGATCTAACCAGTGGACAAAGGATGTC
GTTGAATACTTACAACAGCTACTAGACGAATTTTGTTTAAAAGAGACACC
TCTGTCTTTTAAGGAACAGCCATCACCAGGGCTTATTTCTGGGGCAACCC
AGGTAAAAATGAAAATAGAAGCATCCTCAGTTGGTGGAGACACTGAAGAG
CCTGTGTTGCACTTCAAATGGTGGTATATGGTCCGTCTTGTCCAATGGCA
TCTCACAGAAGAATTGCTAATTCCCTCGGTACTTATTGAATGGTTATGTT
GCCAACTTCAGGTACCTTTGTTGCATTGAAAGACTGACTCATTATATTTT
AGGATGTTTCAGTTGATCAGTTCCCTTGAATTTTTTTCTTGTTAATGACT
TGTTTCTACCCTTCATCCAGGAGAGAGATTCAATTGAGGCCTTGGAGCTT
CTTTTGCCTGTTGTACTTGGTTTGATTGAGACCATCACTCTCTCACAAAC
ATACGTGCGTATGTTCGTTGAAATTATGGTTAGACGTCTGAGTGATGCTT
CTGTTGTTGATAACCCGAAAAGGTCATCTATCTCTTCTGTTATAGCTGAG
TTGCTGCGGTACATGATAATTGCAGTGCCAGATACTTTTGTTTCTTTCGA
CTGCTTTCCTTTTCCTTCGTTTGTGGCCCCAGATGTTTATGGTAGAGGTG
CTTTACTGAAGATAACTGCCGGTGGTGAAATTTCTAGTTCTAAGAGGCCG
GATGTGTACCGGTACCTGTCCTGCGGTTATGCAGTTTGTTCAATTCAGAG
ACGTGCATCGGATCTTTCGACTCTTGCCAATCCTAACCTTCAAGCACGTG
GTGCAGCGAAAGTGGTACAGGCTTTGGACAAGGCTCTTGTCACTGGAAAT
TTGACAATGGCGTATTCTGCACTCTTTAATGATCTATCTGATGCACTAAT
GGAAGAAAGGTGGATTAAAGAAGTCAGCCCTTGCTTGCAGTCTTCTCTAA
TGTGGATTGGAACTGTTGAGTTATCCCTAATCTGTTCTGTCTTTTTTCTT
TGTGAATGGGCAACATGTGATTATCGTGATTGTCGTACATCTCCCAGTCT
GAATGTGAAATTTACAGGAAGAAGGGATTTATCTCAGATACATGTGGCAG
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AAAAGTAGTAGTCGCATTGCAATGAATAATATTGGAAAAGGTTCTTTGCT
GAGTGATGCTTCTTTAGCAGCAACTACAGTGAATGATTCTTCTGGATTGA
GAAGTAATGCAAAGAATGAGGAGAAGAAGGAAAGGAAGGATATGTTTGAA
AGTCCTGGTCCGCTGCATGATATTATTGTGTGTTGGCTGGATCAGCATGA
GGTTAGCAGTGCTGCAGGCTTTAAACGCGTGGATGTTCTCATCATAGAGC
TTATTCGCTGCGGTCTGTTTTATCCCCAAGCTTATGTAAGGCAACTAATT
ATTAGCGGAGTAACCGATAAGAATGGTACATCACTAGACACTGAAAGGAA
AAGGAGGCACCACAGAATTTTAAAGCAGCTTCCTGGGTCGTCCTTATTTG
ATATTCTTGAGGAAGATGTTGAGGAGCAACAATTGCATGAGATGATGTCA
ACATATTCTAGTGAGCGACGCCTTGTGCTTTCTGAACTTTCAAGTGGTCA
GTCATTCGATGCAAATAACAGGGGGGAATATACTACAAGTTCCTGCTTTC
GGAAGCAGAGTGATATTTCCATTGCATCAGGAGGTTCAAATCATAGCAGT
GTGCCAGAACAAGTAGAAGATGTGAAAGTTCTGGTGTCGAGCCTGTTGTC
TTTTATATATCCTCACTCAGTGGAATCTGAACATTGTGAAACCAAAATGA
ACTTTCAAGGATCATCAACTTCAACACTCACACAACTGGATACTGGAGAA
GTACAAAATGGCTGCGAGGATTGTATGAGGACCAAGGGACAGAAATTGGA
TGAGAGAGCCTCTCCTTTCCAGGCGTTCCCGTTGATTCAATCAGATGAGG
AAGATGTTTGGTGGGCAAGAAAAGGGACAGAGCTACATGAATCTTTTAAG
GCTGAACCTGCACTGAAGTCCATTAAACAAACATCTAGAGGTAGGGCAAA
AGTGGTTCGCAAAACACAGAATCTTGCACAGCTTGCGACTTCTAGGACTG
ATGGCAGTCAGGGGGAGGCATCTACTAGTCATCTTTGCGAGAGCAAGCTG
AGCTGTCCCCACCATAAACCTAGCATTGATGGTGACAGCGGTAAAGATTC
TGATCACATGAGGATGATAAATCTGGCTGAAGTTGGCAAGTCGTTGAAGA
AACTTAGATTGCTTGAAAGGCGCTCCATCTCTGTGTGGTTGTTGAAATCA
GTAAGGCAACTTGTCGAAGGAAATGAAATAACAGCTTGTAAAGCGAGCAA
TTCCATAAGTTCCTTTTCTTCTCAGCCTGCTGACAAAACTGTGTCTAAAT
GGAGGCTAGGCGATGAAGAACTAATGTCAATTCTCTATATACTGGACACA
TGCTGTGATTTAGTCTCTGGTGCAAGGTTCCTTGTATGGTTGCTAGCAAA
AATTCGTGGAGGAATGGCTACGCTAGGTCAAGTAGGGAGAAGTGCTACAC
ATATGAAGAACAGAGATAACCAAGTTTGTCAGGTTGGTGAGGCACTTGTG
TTCTCATCCTTGCTTAGGTATGTTGCTCCTAATGTTGATTCCATCAATCT
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ATGAAATTTTAGTCATATTAGATTGTGGTGACTTCACGTGTGTTTTGCCT
TTCTTATCCAGTTCTTACATCGAAAGGCTTACAATAATGAGCAATATTTG
TGTGATCACTGTAGTCTGTCGTCTTATATATCAACCATTTATCTCTGCCA
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ATGTTCACTCGTGGGCTATCTTGGATGAACTTTTTGAAGCAAATTTTAAG
TTAAGCCGTTGTTTTTAGCAGTACAAAGTCCTCCAGACTACCATCATTTT
ATTTTTGCATTACTTGGCGTAAAATCAGTAGTGACCTGTGATGACCTTAT
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AGTTTCTCTGAAGGCCTTACTTTGTAACCCTTGCAGGTACGAGAACATAC
TTCTTGCAACTGATCTCTTGCCTGAAGTTCTCAATGCTTCAACCAGCAGA
CATTTTGTCTTAGCAACTGCAAGGCATCCTGCATCAGCAGCTTTTCCTTA
TACCCGATATTTTTTGAGGAAGTACAGAGATGTGGCTAGCGTGGTTAGGT
GGGAGAAGAATTTTAGGACCGCATGTGACCAGCGACTGCTAGCTGAGCTT
GATAATGGGCGGTCAATCGATGGTGATTTGGTTTCTTCTTCAGGAGTTTC
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GTTCAAGAATTGTTCCAAACATGAAGGAAATAGTGCAGCGACAAACTGAA
GAAATTCAACGCAATTTGAAGGAGAAGAAAATTCCTGCAGCATCCAAGAG
TCCCTCTTTTGAGAAGGAAGACAGTTATCAAATTGCACATGACACTGTTT
TGGGCTTAGTAGAATGTATCAGACAAAATGGGGGAGCAAGTCCAGATGGG
GATCCTTCAGCAGTAGCTTCTGCTGTTTCTGCAGTTGTTGTCAATGCCGG
GCATCTCATAGCTAAACATTTGGATTTTGCAGGGGGTAACTATAATGGAG
TTTCTTCGATTGGTAATTCATTAAGCTTTGTCCGGCACACTTTACACATC
CACATAACTTCTCTTTGCTTACTGAAAGAAGCTTTGGGGGATCGCTTCAG
TCGTGTATTTGAAGTAGCTCTGGCTGTTGAAGCATCGTCAGCTGTTACAG
CAGCCTTTGCTCCTCCTAAGATTCAGCGCAATCAGTTTCAACCATCTTCT
GAAGCCCATGATGCCTATGGAAATCATACAAATGAACTTCTAAGTACCTC
AGGGAAAGGCTTTGTTGGGAGAGCTGGGAAAGTTGCCGCTGCTATTTCTG
CACTTGTTGTGGGAGCTGTTGTTCATGGAGCTGTTAGTCTTGAGCGGATG
ATTGCTGTCCTGAAAATAAAAGATGGGTTGGACATTCTGCAGGTCCTAAG
AGGTTTGAGAAATAGCACTAATGGTGTGTCCCGATCTACTGGAACTTTTA
AGATGGATAATTCAATAGAGGTTTTGGTTCATTGGTTCAGGATTCTATTG
GGGAACTGCAGAACTGTTTACGATGGGCTTATTGCAGATATTCTTGGTGA
GTCCTATGTACTTGCACTCTCGAGGTTGCAGCAGAAGCTTCCTTTGAGTG
TGGTTTTCCCTCCAGCCTATTCAATTTTTGCAATGGTCCGTTGGAGACAG
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ATTTATACCTCTCCGTGCCCGTCTTTTTTTGAACGCTCTCGTCGATTGTA
GAACACCAGCAGTTATTCAGGTGGATGGTTCAGAACCTGGTGAGGCAAAA
GAAAATGAGTTGAAACTATCGGAGAAGCTTATTCAAGTACTTGATACCCT
CCAACCTGCAAAGTTCCATTGGCAATGGGTTGAGTTGAGGCTTCTTTTAG
ATGAACAAGCTCTTGCAGAAAAAGTTGGTAAAGCTGAAAAAATGAAGATA
CCAACACCGATAGTGCCAGAAATTATTGATGGACTTCGGTCCCTGTCACC
TCATTCTGAGAGCTTTGCCCTGTCTGATAGCGAGAAAGGGTTTACTGAAA
TCATTCTGTCGAGATTAGTTGCCAGACCTGATGCTGCTCCACTCTACTCA
GAAGTTGTCCACCTTCTTGGGAAGCTACAAGAGTCACTTGTTGTGGATAT
CAAATGGATCCTTCAAGGGCAAGATGCCCTTTTGGGACGCAAGTCCACTA
GACAGCAGCTTGTTGCACTTGCTCAACGAAAAGCAGTTTCTACAAAGCCA
CAGGTTTGGAAACCATGGGGATGGTCTAGCTTGCTTAGTGATGTATTGGC
TAACAGAACTACCAAGAGGAAATTGGAAGTCCCTCCAATCGAGGAAGGAG
AAGTCGTGGATGACGCCGATACCAAAAGGCCAAGCAAAAGTACTCCCCAT
ATTGTGGATAGAAGCATTGAAAGCACGCGATCTATTAATAAATATGTAAC
TGAGAAAGCCCTTGCTGAATTAATGTTGCCATGCATAGACAGAAGTACTG
CTGAATTCCGCGGTATATTTGCTGGGGAATTGATCAAACAGATGGGAAGT
GTCAGCGAACACATCAAAGCAATATCACGAAATGGTACCAGACATGCTGG
TTTACTTTCTTCAGGAAATGAAGTTTCATCGAACAAATCCAGTGGTCGTA
AAGGAATTAGAGGTGGAAGTCCAAGTATTGGCAGGCGAGGCACGGTTGGT
AATGATCCAACCCCCCCTTCAGCATCTGCCCTACAGGCAACAGTGTGGCT
GCGCCTACAATTTATCATAAGGTTGCTTCCAGTAATCTTGGCAGATAGGT
GAGGTTAAATCGAAAAGCAATATCATTTTGTTTGAACTTACTTTTGCTCA
GCTGGTTTCTGATATTAGTTTTCAGTTATTTGTTTATTACGCATATTTGT
TGTCACAGATTGTACTTGACTCCTCTAGGATTCCTGATATTAGTTTTCAG
TTATTGCTTTGTTACACATATTTGTTGTCATAGGTTGCAGTTGACTCCAG
ATACTCTAGCTGAGCATGTGATTCTCTGCTTCACATAGCTGAGAATGTGG
ACATGTTATCTTTCATTGGTGTTGCACAAGTCTTGAAAGTTGGTCCTAGC
ATCCTGCTTTCCTTGTGACATTTGTTTCATGTGATTCATGTAGCATGCTT
GAATAGTGTGACACTTATTACATGTAGCATGCTTGAATAGTGTGACACTT
ATTACATGTAGCTGGCTTGAATAGTGTGGACGATTCCTTCTCTCTTTCCT
TTAAGGCATTGGTTGCTTCTTTTGAATAGTGCTGAGGCATTGGTTGCTTC
TTTTGGTACTTTAAGGCATTGCTGTGCAACTAGTGATGGTTTCTTTTTCC
TACTAATAATCACTTCTGTCTATCAAAATTGTAGGAACATGAGGCAGACA
CTTGCTTCTACGATACTATGCTTGCTTGCAGCGCGCATAATCTATGAAGA
TGCAGATTCGCCCGTTCCTCCTGCCAGTTTAGTTACCCTAAGACGGGAAG
TGGACTCTTTGCTGGAACCTCCCTTAGATGTCCTGCTTGATCGCCCAAGC
GAGAGTCTTTTTGAGAGGCTTTTATGTGTTCTCCATGCACTGCTTGGGAA
CTCCAAACCAAGTTGGCTGAAGACAAAGCCAGTTTCCAAGCCAACTGTTA
GAGCTCCGCGAGATATTACTGCATTTGACAGTGAAGCGGCTGTGGGCTTG
CAGGTCTGTTCAATGCTTAAATTTTATAAACACCGTTACTTGCCTTTTGG
AAGCACATTACTTTTTTGCACTTCCTGATTTTTTTACTAGACTTCTTGAA
TGATCAAGTGGTATTTTTTCTCCCACTTTTGACTTCCCTACTGTAATTTC
AACTTCCTTTTGTAGTCCACATTGGACCATATGGAGTTACCTGGGACAAT
CAGGCGAAGGATTCAAGCTGCGCTGCCGATCCTTCCACCATCCCGCCATC
CGTCTATACAGTGCCAACCTCCTCAGCTGTCGATGGCTGCATTATCACCG
CTCCAGAGCAGCAGTTCATCTACCGCAGGCCCTCAACAGAAGAACAGCTC
TCTCAGCTGGGTCCCCACCAACATCTCGAGCAGGAGCAAGGCAGCGCTGC
CTTCCCAGGACCCCGAGATGGAGGTAGACCCCTGGACCTTGCTCGAAGAC
GGCACCAGCTGCCCCTCTGCCTCATCAGGAGGCAATGGCGCCAGCGGCCT
TGCCGCAGACCACGCCAATCTCAAGGCGTGCAGCTGGCTCAAGGGTGCGG
TCAGGGTGCGGAGGACGGAGCTGACCTACATTGGATCTCTGGACGACGAC
AGCTGACATAATGTCGGCGAGGGCGTACAGTCTAGTTTTAATCAGATGGA
ATTCTTTTGTGTACAACAGACAGGGTGGAAACCGTGGCCTTAGGGGGCGG
CCTCTGTGTAGAATACCGACCGACCAACCAACCTTGTTGCCCCTGTTCTT
GTTTTGTTCCTAGGGGCTACCTCTAGCAGGAGCGACAGTGTACATAGTGG
GAACATTAGTCCGCTCCTCGGGCCATGGGCCCCGTGTAGCTTATTCCAGA
TTTAGGAACAGATGATGATGATGCAACTAGCTGATGGCTCATATATTCTT
TGGTCTAATTGTAGTGCATGATGTTTGCCCTGTTGCTGCTGTTGCTCGTT
TTTTTACCGTGTTTTGGCCAATTGGCATGTTGATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.