Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA046664

[Submit comment/correction]

Sequence
AA046664
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046664
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AATCAAGCCATTGACTCTAGCTCAAAGAAAATCCAACCATTAGATCCAGA
ATGTCCATGCCAAAAACCCAATCCGGTAATTAAAGCCTAAAACTGTCGCA
TCAGCGAACTCTTCTTCCGCGGAAGAGCAAAGTGTCGCTCTCCATTTCCG
ACCATGAAAACTACGACCAAGATGGGCAAAGATGCCCGGAGAAGACGGCA
AGCTCGAGCGAGGCAGCGGCTTAGAACCGGTCATCCTCGTCCTCCCATGC
GGCTCGCCCCCGACCTCTCTAATTTAACCCCACTAGCCCTTCCCGATTTT
CCCTGAGCCCCCCTTAACCTCCCCTCCTGCGATTCCACTCGCATCCTTCG
TTTCAGGAGGAGAAGGTCCAAGGGGGGATCGTTCCATTGCGCCTGATCCA
ATTTTTTCTTCGTGGTTGCTTTTGCCATTTCTTGGTTCTTGAGGTCAGAT
AGAGCCCGGTTCCTGCTCCTCTCCCTGATAGGTGTTACCCCCTTGCTTGA
CTTCTTGGTCGGGTCCCGGCTGGTGGTGCGTTCTTGATTGACTTGGAAAA
TGATCAAGTGGGGGATCAGCAGCGGCACGCCCGCAGATTCGTACTACGAG
GTCCGCTCGGATTGCACGGCCGATGTGCCCAAGAGCAAGTTCAAGATCAA
GGTTTGCTTTTCTTTTCCTTCTATTGCATTGTGTGTTAGTTACTTTGGTG
GCTGTTGGGCAACCATCTGTAATATAATGTTGTGGTTCAAGACAAAATGG
GATTTTCATGGAGTTCTAATATGTACAATATAGTATCAATGAGGTCAAGG
TAAATCCGTAAATGGAGACGACACCCACTCTCGACTCTCGAGTAAGAACA
TTATTCGAGTGTAGATATGGAGAATCTATGGGTCGATTAGTGCAATAATA
ATACTAAAAATATATTTTGCCTGTAAATAATAATTTATTTTTAGATTGTT
AATATGTTATAAACAGCATGTTGAACTAAATTTGTAAAAAATTACCAAAT
TGTAATACATACAGTCAGGAAATTGGTTACTGAGCGAAGTACCGTGGTTA
CCGGCTTTTAACGTTTTAACACAGACAAAATCAATCTAAATTTTGGTGAA
ACTTACGAAATATGAAGGAGAAACAAACAAACAAACCAACAATTTAACAT
TGGCTAGTAGTTTCAGTGAAATCTTTGTCCAAACAATCTGAAAGGTACGA
GTTTGTGGAATCCAAACGATCTGAACTCTTTGTCCAGCTCCAGTGGACCA
CAAATTTAGCTAGATCCATGCAAATTCAGTCATAATTGCACCCTAACTCT
AATAAATTCTGCAAATTCAACACCAGTTGCTCATTAATGAGGCTACTTGA
TAATACTTCGTAATCATTTTTTTAGTAGATTCGATGTGAATAGTTGATGT
TAATGGCTGGTCGACTTCTTGTAATATTTCTTATCACAATTCATGTATTT
GTGATTTCCATGATTCTTCTAAACTGTTAGCCAATATACATTTCTAACCA
TGGCCGGTACCTGTCATGTGTTTTGTAGATTTCACAGTTCTGATGAATGT
ACTTTATTTAATGCTAAGAGCTAATTCATTGTGTATTCTACAATTCGATA
ACCTAATTTTTTACTGTTACAAAAAAGATTGGAGGTGCGTCAATGGTCCT
TTGCATCGACATGCAATGTACAATGGGCATATGTGTCTTCACATACATGA
CTACCACATTTGATAAATTTTACACTCTGTCGGAATACAATTTTGTGCTT
ATACCATGAAACTTGAGGTAATTGAAAGATTTGAAAATTTAGGCCACTAG
AAATTAGCCAAAATGATTATTTTCATGATTTATTTGTATTGTAACCACAA
ATTTATGAATTAACATGTATTTTTATGTTTATGGCTGTGATTAGTCTATT
ACATACATATCAATGTTTACATCAGCGATAAACCATTATGTCATATTGCT
AGGATGCTTGTCAGAAGTATCCCTTTTTTTGTTTTCCCAGCATAGCACAT
AACAAATGAACTAATTTGAACCATTTAATTGTGGTCATATCTGTTTTGTA
GCTTACTTTCTACCACTGTAGTAACTTGGTCAACTTAAAGTAATGAATAT
GTTCAGTACATTTGTTCTTTGGAATACATCCATTCTACTTTAGATGGAAC
GAATGCAATTTTTGAAAAAATCTAAGAGAAAGGAAGTTGGAGCAGGGTTA
ATTGCCCTTGTAGAAAGGAAGTTGATTAGGCTTTTCATGGTAATTTGTGC
GGTCTATCTAACTTTTTGATTAGGCTACATTTTGAGGACTTGTAAGAATT
AAGGCCATATGCATCTTTGATGCGGAGGCCGGGGCCCAGGGTAACGAAGT
TTCCATTTACTATTTTGTTTTTTGAAAACTCATTTTTTATATTCTTATAT
GCATGTTATACTCAATTTTACTAACTTTGAAGTGGTTAGTTGTAAATCAG
GCCATCAATTTGCTATAAATTGTGTTTTCTGTTTTCCAGTTCTTTGAAGT
GCACTAAGGAGCTTACCTATTATGATCTGCAATAGTGTTGATGTCATTCC
TCTTTCTTATGTACAAAGTACATTCCTTTCTTGTTCTGAGCAACTTAATA
TTTTCCATTTGTTCCAGGCTGGCAAAACACTAAGTGTTCGGAAATGGCAG
GCTGCATTTAACCCTGATGGCTGTCTTGACATTGCCTCGGTCCTAAGCCG
GATACAAAAAGGAGTAAGATTCCTAGAAACTGGAGTTTTTTCAGTTTCCA
AATATGCCTCTTGTTCTAGAGTTGTTTCCTGTATGTATTGTGCTTGTGCA
AGATTAATATTCTAAAGATCCTAAATGGTGTATTGTTCTTTTAGGGTGTT
CACCCGACAGTCAGGGGAGAGGTCTGGGAATTCTTACTTGGCTGTTTTGA
TCCCAGGAGTACCTTTGATGAGAGAGAAGAGATCAGGCAAATAAGAAGGT
ACTTGCCTTCGTAAGAACATCTGGTTTGCAATTTCTCTACATGTCACTAC
GATCAAGAGTGGTGTCAACTATATAGAGTTGTCCGCTCAAATTGTCAGTC
TCTTCTGATCCAACATTTTCACCAAGATCTTTCACGTGCAAACATTCATA
TTAGACCATAATTTTCATTTTTTTTCTCTAATACATAGTACAATGCATCA
AATCTCAAGTACTACTTTTATTTTTATCATATTTTCTTGCAACTCTCACT
TTATTCCTTCTATCACACACTACAAGTTGGATTGTCAGAAGATAGTTTTT
TTTTTCGAGAGTACGCCAATGGCATACCATATTTTTATAGAAGGCAGCAA
CAAATTTACAAGATATCAAGGTCACTTTGCGAACAAAGGCCTCGGCCACC
CATCACACACGCATAACTCTAACTCTACCTCTAAAATCTAAAGCCTACTC
TCGCGGCATGATTAACCTCTCTCCTCTCGCCGCTAACATCCAACTCTGAA
ACTCCTCGTGGATACGCTCAAGCAGTTGCGGTGTGCTACACTTCTCTCTT
AGATTACCGAATGCTTGCGCATTGCGTTGTTTCCACAACATCCACGCAGT
GAGAATCACCATTGTGTCGAACTTGCGCCTGTCCAAGCTTTCAATAGTCT
CTCTCGCCTCCAACCACCAGGACTCCAGATTCCGCCCCTGTTGCGGCTGC
ATGATCTCCAGGCCTGCTTGTTGCAAACATCCCATCCAGACCTATCTCAC
ATATACACACTGAATCAGGATGTGGTGCACTGTGTCTTCCTCTTGTATGC
AAGTGTGGCACTCCGAAGATTGTTCCTGTAGGCCATGCCTATTGCGCCTG
TCCGATGTCCACAACCGGTATCTCGTGGCCAGCCAGCAGAAGATTTTATA
ATTCAGGGGCGCATGGGATCTCCAGATGGGGGTTGCGATGCTAGATCTCT
CTTGTCCGTGCCACAGCAACTTATACGTCTCCTAGATCTCTCTTGTCAGA
AGATAGTTTAAACAAAAAGTAAGCATGCAGTTCATTCTTATTTACATCAG
TCACACTGTTGTAAATTTTGTTGTCCCTACCTAATATACTTTGTCCTGAA
AAAGGACATCACTTTCCAAACACAGTCATTATAAACCTAGATAATAAGCA
AAATGAGGCAATTACGGTATCGTCAGAAGCATGTCTGTTTCTCTTACCCA
TTTGGGTTGGTGGACACTGTTGGGTCCCTACTTCCCATAAACGGTAACCA
TGCGGCGGCCATTGTAATATGCAAGCATTACACTTCTGTTTCCGATGATA
TCTCTAATAATTTTCTTTTATGATTTTCAGCAATAGGTAACTGTAAATAA
ACATGATCCACTTTATCTGATGTGTTTGTACCTGATGAATTATGCAGACT
ACAATATGCTAGATGGAAGGAAGAATGCCAAGAGATGGATTCTCATGTTG
GTAGTGGTAAAGTTATCACAGCACCACTAATCACCGAGGATGGAAGAGCT
ATTAAAGATCCTTTAGTTTTACTTGAGGCTACTTCCAACCAAAGTACTTC
AGACGGCACTTCAACTAGCAGCAACAATGGAATTGATGTTGATGATTCTG
CAGAGATTATTACCGATAAGCAAATTATTGACTGGAAGCTTACATTACAT
CAAATTGGTACAGTTTAACTCTACGTTCTGTTTCTCTATTTTGACTCTTT
TCACCTCATTTCTCATGAAATTTGAAATGATAATAGGACTTGACGTGCTA
CGTACTGACCGTACCATGGTATTTTATGAGAACAAGGAAAATCTTTCCAA
GTTATGGGATATTTTATCTGTGTATGCCTGGATTGACAAAGATGTTGGTT
ACTGTCAAGGTGGGCTACATATGACTCGCAGAAGAAACTTATTTATCTTC
CAGATAAGCTTACAACGTAGCTTTTATGTCTCACAGGGATGAGCGATTTA
TGCTCACCAATGATAGTGTTACTGAATGATGAAGCAGATGCGTTTTGGTG
CTTTGAGAAATTGATGCGTAGATTGGTATGCCTTGCCTTCCATGATTTTT
CTCATGATATCTTTGTATTAATTATAGCATTCGTTCTTCTGAAAATTACC
TACAATTGCTTTCTTTTATCATTGACATCCTTCTGACTATCTGGTGTTTG
ATATTTAAAGCGAGGAAATTTCAGATGCACCGATCAATCAGTTGGGGTGG
CTAACCAACTTCAACACCTTGCGTCTATTATTCAGGTGCTGGACCCAAAG
CTACATGACCACCTAGGTATAAATTTAAAGACACAATCATTTTGTTCATC
AATCAATCTTCTTTTGTCCAATTTCCCCACAGCTTTGTAACGTTGTCTGA
CTCCTGAACACAGAAACACTTGGTGGAGGTGACTATCTTTTTGCATTCCG
TATGTTCATGGTACTATTTCGACGTGAAGTCTCATTTGGGGACTCCTTGT
ACCTCTGGGAGGTATGAAGCTACCCTAACAATAGAATACGATCAATATTG
CCAGAACCAGTTTGACATCTCTTTCTACTAATTTATGTTTGTTATATTTT
TTTATAAGTCATAGTAATTATTCAATGGGAGATACCTAGTGGGAAGTTTT
TCTGGGATAAATCACACAATCCTGTTGGTTTTGGCAATAAATCAGCATGA
CAATTCTGTTCTCTTTTTCAAATTATAACTTCCAATATAGAATGAGTTGA
CAAAAACAAAAGAGAGAATTGTTGGGAATAGTAAACTTTGTCCTTTTCAC
TTTTTTGTTTCATTTATTATCTTCGGAGTTTTTTCATTTTCATTACACTC
GACAGATATTGAATTAGATGTTCAATAGTACACGTTGGTTTAGTCAATAT
ACAAGTGCACTGTCTACAACTTGTTTTGGAAACTCCATTCTTATTTGGTT
CTTAAGGTTTGTATGCGTCCACTGCAAGGTCATCTCTCCTTTACCAAAAG
TACTTTATTTAAATATGCGCTCCATTATTTATTACACACGTACCAACTTA
TTGGAGACTTATAGGGTGGTTTGTGTGCTTGCATGAAACTATTTCTCAAA
AAGAAAGAAACTATTTATTTGGTATTTTCAAACATGCGGTAATATTAATA
TCGAAATGAATTTATGTTTGTTGATTCTGATTCTCTTATCTGTTTTTTAA
AACCAATCAACAGATGATGTGGGCTCTGGAATACGATCCCGATATCTTCT
TTGCAGCATGTGAAGAAGCAAGCGGTCCAAAAAGAAAAGTATCCAAGTCA
AAATTAAGAGGAGTACGTCATTTTGCCACTTGGGATAAGGACAAGGATAA
GGATACAAAGGATGCCCCTGAGGAAACTGATGGCCCAGTTCCCATTTCAG
TTTTCATGGTTGCATGTGTGCTCAAGGAAAAGAGAGAAACGCTATTACAA
GAAGCTAGAGGACTGGATGATCTTATTAGGGTGGGGACCACATCCTGACT
TTTCTTTCTTTTTGAAATGCCCATATATGCATATGTGTATTGTGTAGGCT
CATATGCGTATATGCATCTGCAACTTACCACATCGTGCATGTGTTTCCTT
TCAGATATTGAATGACGTAAATGGGAATTTAGATGCAAAAAGTGCTTGTG
CTGGAGCTCTGAAACTTCACAAGAAATATCTCAAAAAGGTTAGTAGCTTA
CTCATCTCACTTTCCTTAGCAACATAATGAAAAGGTTTAGGGCATATAAT
TAGATAAACTACTAATTTCAAGATGCCTGCTTCATAACTACTCCAACTGA
ACATTGTGCCTTTTGTTCATGTTACAGGTACAGGCAAAGAAAACCTAAAA
ATGTACCGGAATATACGACTTCCACCGAGGGATACTTGAATGTACACATA
CGCGACCATAGCACAGAAATGGTGAGTGAAGGTTCTCACAGGTGGTCATC
ATCGAATGTTGGCCACGGATACATGATAAATGGAACCTCTGTATGTAATG
ATATCACATTTTCTGTATCCCCGATAAGTTCATTTGCTTGTACAGAGATA
TGGCGGTGTGGGTATAGCCTCCCTTGCATACATATTAATTTCAATTCAAG
TTGAAATGTTCTGCATGTTGAGATTCGCCTGGCGAGAATGTTGTAGCCAC
AAAACTCTGTTTCTGTCTCAAAATCAATGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.