Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA044073

[Submit comment/correction]

Sequence	AA044073
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA044073
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGGTAGTACGGTTTCCCTACGCCCCCACATGCCAGCCTCGCGGCTCATC CGCCGTTCTGCTTTTCCTTCCCGCTTGCCCGCCCAAAAGAAATCCAAAAG GTTTTCCCCCAAAAAAACACGCACCCCGCCGGCGTCGTCGCCAAGCAGGC AGGCAGGCATGGCGGAGGAGCAGATGGAGGAGGCGGCGTCGTCGTCCGCG GCGGCGGCTTCCGGCACGCCGTTCCAGCTCCAGTTCGACAAGCCCATCCC CTTCCAGGTCTCGTCTCCCTTCCTTCATTCTCTCACTAGCCGGAACTTCC ACGCACGCACGTCGGTGCTCAGCCGGTCGATTCAATCCCGCGCTCAAGCT TCTACGTCGCGTTATGTGCTCGATGTGACGCAAATCAACGGTTGAGCCTG GCCGCGAGAGGGCGCGGGTGGATGGGGCAGGGTCGTCAAGGGGTAGCCGT CCCCTGCCCATGCGTGCCAACCGTTTGCTGAAATTCCTAGCAGGGTTCGG CCGGAACGAACCTAGTGGCTTCCTGCTGTCATTCCGAGCGGTTGTTGCTG CTGAATTTCACTGTTCAACTATATGTGTTGCGTTCAGTTATTCCATTTTA TGCTGTTTGCCATTGATTCATCTTAATATGATCTATTAGCAATTAACTTG CCCATGGTTTGCTATTTTTTAGATAAAATTGGCAGAGTGGAATCCAGAGA AGGATCTGCTTGCTATGGTTACTGACGACTCCAAGGTCCTCCTCCACCGC TTCAATTGGCAACGGCTATGGACGATATCCCCTGGTTGCTACTCTCCCAC CCCTTGGTGCTCATAAGACAAATGATGAAACATCTATAGCATCAGTCTTT TTTAGCTGAGAATAATAATAACAATAGTTGTTGATATTTCCTCATGTCTG CTATGTTCAAAGAAGACAAACTCCTACGGATCGAAATCGTACAAAATTCC TATAGAAACCTTCTAACCAGAGGGGCCCTTAAACTCGAACATGTTCGTTC TCAAGCTCAAAGGTAGCGGACACTAAATTGTTTCTTATTTTTCAGGGAAG TGCATCACATCTATTTGCTGGAGCCCTGATGGTAAAGTAGTAGCGCTTGG TACAGAAGATGGTTTGGTTCTATTGCATGATGTTGAGGTGCGTATGCTGA AAGTAATGAGTAGATATTATTAGTGCCTTCTTTTTTTTTTGTTCCTGGAC ATTTTTTCATACTTCATGCAAACTTGATTGATGGATGGTCCCTCTTTATG ATTTGTTGATGGCTCTGGTCTCGTTTTGACCTTCATCTTTGATGATTTTT ATTTATGGAACTATTAAGAGATCAGTGGGAGCACATGCTCTCAAGGACCT CTAACACAACTATGTGCATACATATGGCCATCCAAATCTTCTTCAGAAAA AGTGTCTCGGCTATATAATGAAGTGGTTAATTGACGCTAAAACCAGACAT GTTGACACAACACATTTTGAATTGCTATTATTTCTATTGAGCACCATTTC TAATTTGTGACCTACTGCAGCTTCGTCATAACTGAGTTTGCGATATCATT TTTTTTTTCCTTTTTATCATTGTGTTAGTAGTTATTGTAAAACTCTTTAT ATGCTTTCTGACAGCCATAATGTAAGTCAATGACCTATTGTGTGTTTTGA CTCCTGTGCATTTTGCCTTTTTTTGGTTAATCTCCAAATGACCCCGAATG CTATCACAGCTTACTTGTTACTTCTATTTACTTTACAACTCTGTGCATGT ATAACTGAAGTGAGTGCTAATTGCAGAATGGCAAGATGTTACGAACTATT AAATCTCACGATGTTGCTGTGGTATGTTTGAATTGGACAGAAGATGAACC TCCATCAAGGGTATATTATTTTCCTTTTCATTTTATTCAAGATATTACTT GTCAAATATGGTATAGCTTGCATTTTATTGTAATATACTCTATGCTAGCC AGTGAAACTTGCAACTAGAGATGATGAACTCATGCATGCATTTTGCACTA TTGAAAATAGTGTAGGATTTCAGTGAAATGTTCTTTACTAGAGCCCTCTG CTAATAACTGCAGACTGACAAGGATGACCTGTTATCTTATGAAGACCGCA CAACCCGTTTCTTTCCTCCCGCTCCTGTGATGCCTAGGGTAGGTGGGCTG AATTCAGGAGATACTGGTCTTGCGGATGAGAATGAAGAGGCCATTCAGGC ATTTTCAAGTGCTTTCTGTCAACGTTTTAATATTCTGTCCAGTGGTGATA AAGATGGCTGCATTTGCTTCAGTATTTTTGGAATATTTCCAGTTGGAAAG ATAGTAAGTAAACACCATGACTGAGTGCTACTCTACATTTAATGTCAATA GAATCAGTTATGCATGCTTTCGTATTATTCTGAAGGTTGTTCTTATCATA TCTTTGACATTTCAGAACATAAATAAGGTTCCAATCCATGTACAATCCTC ACAAAAAAGAACCAGTTACCGACTCCAGGATGCTTCCATAAGCAAGGTCA CTAATTCCTGACTTCTTAGATTCATATGCACGTGTCAGTCTTCCGGATAT GATATTCTGAGCAATCATTATTCTCCATATCAGGTCTCTTTATCAAGAAA CCTCCATGAGTTGGTTCTTCTGTGCTCCGGAGAGCTGATTAACACTGACA ACCTTTCTAGCAGTAAAGATATTTCTGTTGGGTTACATTGTCTGCACCTG GACACTTCTATCTTTTCCAACAGGTAATGGCATACCAGCACCATTGCCTT TTAATGGCCTATGTCCTTGTTCAGGAACCATCATTTTGTTATGGTCCTGT ACAAAATAAAAGGAGATCCACAGAAGTTCCTAGAATAACGAATTCTGACA AAATGGGCTTATTCACTCATCTTAAAAGCTTACTATTTTCACTGTTCAGG TGCAAATATCTTAGGCTTTTGTTATTTCTCTATAATATAGCAGCAGTGTT TTATTACTAAAGTTTGTAAGGATTTAGACTGCTGCACTGTTCCTACTAAA ATTGATCAAATAAAGATTTTCTTGTTCTGTTTCTGATATCACCAATCAAT GTTGTGAAGGAAAAATGAGCTACATCAGGTGTCACAACAAGCGTCAAGTA TTCAGGATCTGGTCGAAGTTGTCCGTGCCTCCATATCTATGATGTCCAAA CAATGGTCGAATGCTATGAACTTATTTCATGAGAAATTTAGTGCCTTGCC TTCTCTCATAACTGCCAATGGTATGATTGATTTCTGTTGAAGCCATAACC ATAAAAAAATCACATACCTTTTTTCTTCCTTGTTGGTGAAAGTTTTTGAC TGTTCACAGGGATGGAATCTAGCTCTGAGGATGAGTTTTTGAGCCTTTTG TTTGGGACACGTACAAGTCCAGCGCTACACCAATTTCTAGTCACCTCCCT TGGTGAAGCGGTATTTGTTTCTGCTGCCACAACTTGCATACCTTATTTTC TTAAATAACCTGTCTAAATTTGTCATTTCGTATGTGGAAGGGTCTCAAAA GGATAGGTAAGGCTATTGACAGTTCTGGAAAAGAACTTCGTATTGTTGTC AGTGAGCATCTTCAGGTAAGCTACTACATACTGATGCCACATCAATATAT ATTTGTACTGTTCTCTGTGTTTCTGGTTTATTTCTAGTTGATACTAGAGT TTATAGGGCAGCAGGCAGATTCACACCTTTCTGGTACAATCAGTAAAGTG GCTGTTGTACTGGTAATGTTTTACTAGCTAGGTGACTCAGTGATTAAAAA AATAGTGACTCAAATCAGGAAGGGCTGTTAGTATGTTGGAATAACATAAC TATATTGCTTTGCGGAATGTTGGAAGGGCTCTTAGTATGTTGGAATAACA TAACTATATTGCTTTGCGGAATGGTGATGAAGTCATACTGTTCTCTAATT GGAGGCCTGGCCATCTCATTTGACCAGACTAAACATGTGCTATACTTGTA ACCTATTTCTAGTTCCTGTTATTAAAATTGAGTTGCTTGCTTATTTGTTT TTATTTTAGCCTGCAGTCGAAATTATTTCATTCAGACTTGCAGAACTGAG AGGCCTTGCAAGATGGCGTTCACGATTTCAGAACATTGGGTTAGATGAAA AGCTTATGGATGGTGTAAGTGAGAGGGTAGGGATGCTGGTTGTGCAAGTC GAGCGCTTTTCAAGGGTTGCAGCTACAGTTCTTTATCTGGTAATCTTTTT TTTTTTCATGTTGCATGTTTTTACTGTTATCAAATTTCGTTGAAAATGAG ACTTTTGCCCTCTTAAGCTGAAGCTTCTTCCTGAACAAGTGGGGATATCA TTTTCCTATATGTTTTCGTATGTTCAGTTATGATTACTTGATTAGTGTAC ATGCTGTACCTTTGGGAGTTTATCATGCAGTAGCTTTCATTGATTTATGG GCTTCCCAGTTTCAAAATTTCTTCAGCTTGGTATTGAAGTGTGTTAAGAT ATTATTAAGTGAACCAACCGAAGTGTGTTAAGATATTATTGACTTCCATT GATTTATCATGTACTCCCCCCGTTCAGAAATATAAGACGTTTTAGCTTTG TGAATCGAATGTATCTAGACGTCTTTTAGTGTATAGGTTCGTAGAGGTTC GGAGTGAATCTATACACTAAAAGGTGTCTAAATTCATTCATTTCACAAAG CTAAAATGTCTTATGTTTCTAAACGGAATTGATTTATCATGTACTCCCTC CGTTCGGAAATGTAAGACGTTTTAGCTTTGTGAATCGAATGTATCTAGAC GTCTTTTAGTGTATAGGTTCGTAGAAGTTCGGAGTGAATCTATACACTAA AAGGCGTCTAGATTCTTTCATTTCACAAAGCTAAAATGTTTATATTTCTA AACGGAGGGAGTAGTAACTCTCATTGATTTATTGACTTTCCAGTTTCAAA ATTTCTTCAGCTGGGTATTGAAGTGTGTTAAGATATTATTAAGTGAACCA ACTGATCAAGTACCACCCGCAAACAGGTTTATGTCTTTTCTTCTATTGTT CTCTCCACTCTCATATCATGAATCAGCACTTTGTTATTAACTACCAGGGA ATCATCTATTGTAGTGAACTTGTGGTGATTTTTCTGAAGTTTCTTCTTGA TAAGGATCCAATCAGACAGTTACTTGAAACAGATCAGATATTTGAATGGG ATATGTAAGTAGCATGTGAGTTGTTGATTTATGTTTCCTGTTAATTTGTT GGTCTTTAGTACCGTGTGTATAGATTTGAAGATTTATAGTACCTATTCCC AAGTTGTTATTTACTTGCCTATAAACATAACCTGGTCATATCTGGACACG GATAGGTTGTACCATTACACTATGGAAGTTTTCGTAGATGCACTCTCAGA AGGAAGTAGTCTTGAAATGTATATTTTTGTGACATTTCTTGTATACCATG TGTCTTGGTGTTGCTAACTGCACTACCTAAAAAGAAATATCATTCCTGCA TTTATATGTATACCCCTTTACTCTAGAAATCTTTGGCATTGGTTTCATAG GTTTGAATATTTATGGTACCTAGTCCCATGTTGTGATAATGTGTTGCTAT ATCCTTGAATTGTGTTCAACATGCTTTTTTTTCAGAGATACTGCAAGACA TGTTGAGCAGCTAGTAGTTTTTGGAGGATTTACAGACACCCAATTTTTGG AAAGGAGTTTGGCCAAACAATTTAGCGAGTTGGAAGAAAGGTAAATCATT TTGTTGCTTAAGATTACTTGCCAGTACATGTGCTAGATTGCTTGAGATTG ACGGTTCGTGTTTCAACTCAATGTACTGTCAGTCAAGTCTTTGTGCATTC ACTTTCTACGGACAGAACAGCTTTAAATATGTTCCTTGTTTAAAATTAAC TAATCCTTCCCTTCTGTGAACCATTTTTTATGCTATTGCTAACAACTCTT TATCCCATTTTTTAGCTTGAAGGAGGCTTTCTTGATGCCATTCACCACCA TCTCTTCACAAATACATTGTCAAGGACTGTTTCCTCTTTATCCTGTTACA TCGTCTGATGCGTTGTCATCAACCTGCACTGCATCATCAATTTCGTTCTA TAAGGTTTATGTTCTCTTTGGTAATTTCTTCCTAACGCATTAGTAACATG GTCCTGAAGTGAGCAAACTCATTGTTTATATCAATGTTTATCTGTAATCT ATTGTATGCATGCTTTGCAATGGGTCAATGATCTGTTGCTCTTTGGAGTC TTAATTGATTGTTCAAACTAGCAGGATGAAGATTCTCAGCATAGCGCGTC TTCATATAGCTTGACTGACTACACGTGCTTCAAGATACCTGATGGATCGT TAAATCTAAGAAATTGCATTGGTGTGATAAAGGACTTTTGCAACTCAAGT AGTACCTTCAGCACACCAGCACTTTCAGGTTTTCTGCTGCGTATACCTGA CGAATATGAGTGTGTTGATCTGTCTCTTTACAAGGTATCACCTGTTGCAA CTATTGAGGCAATACTTCGTTTTTGTGAAGTACTTTGCATTTCTTACAAA AGAAACGGTTACTCGCAGGACAACCAAGTGGTTTTACTACTTAGTGGAAA GTCCAGTTCTGAAAGTTCTGGAAAATCTTTGATGATTATGCTGCAGATGG AGAACTTTTCTTTTTCACAGCTCTCAAGAACATTCCCTGCAAATTGTTAC AGTCTCCAGGAATTGGTGGTACGAATTTTCTCAACTGAGAACAGTATGGA AGAAACCTACTATAAATATTACTGCAAAAATTAAACTAGTTGCATTAGTA GTTAATCATTGCAACAAGATAAACAACAATGTACTGGATCTTCAAATTGG TGTATTGGCAAGAACCTATTTTCTATTATGTTATTCATTATTTGATTATA AGGATACACATAGCGTTGGTAAATCTTGATCGTGTTATTAAACCAAACAT GCTTGTTGAAGTTGACCTACGTTTACTAGCAAATAGTAATTTCTTGCCAT GAACATGTATAGGCACTGGAACTCCAATTGGACACAGACTATGGGAAAGT TCGTAGCATCCCTCACCCTTTGTCTACTCCGCTGGCAGTCAGTGGTAGGT TGAGCATTTATTTCCACTCTTGAATTGTATTTGCTATGAATATCACATAA CCAGTAATGGCTGGAGCTCGTTTTCCCTTGATGTTTGCAGCCTCAAGAGG AGTGGGTTGTGTCTTTTCGTCACGGAGGCATGCTCTGGTCTATATCCTTG ATGAGGATGAGGACGAGAACGAGGATGAAGATGCTGAGATGGAGTGACCA TTGTACG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.