Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA029554

[Submit comment/correction]

Sequence
AA029554
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA029554
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAACTTGTTTGGCTCCGCTCAGAGCTGCCGGCATAATCATTCCACCAGTT
AACCCGCTCACAGCTAAAGAGTGGGGGAAACTAGAACCCTACCGGTCGCC
CCGTCCTCCCATGGCGGCGCCGCCGGGGATCCTCGAGGTGCGGTGTGCCG
GGTGCAGTGAGACTCTGGAGGTGGAGCATGGACTCACGGAATTTGCCTGC
CCCGACTGTGGCATGGCCCAATCGCTCCCGCCGGAGCTCATGCCGCCGCG
CCCTCGCCGCGCGCTCCCGCTCCCCGGCCGAGTCGCCCCCTACGCCGCTC
CCGTCGCTCCTGCTAGAGTATCCTGCGGCGGATGCGGATCCGTGCTCAGC
CTGCCGCATGGCCCCGGGCGTTTTGCCTGCCCGCTCTGCGGCGCCGAGCT
CGCGACCTCCCCACTTGCCGCCGTTCCAGTCGTGACCACACCCGCGGCCG
TCCCAATATCCTCCACTCGGCTGCCGAATAACCCAGAGGTACTACTTACA
GTCGTTTGCGCCTCAGGGATTCCATTACCATGCATTGTTGCGTCATGAAA
TGGCATAGTTAGTGCCACTGGGAGGCCACATCAGTGGAATACACAGATAT
CGTAATTGTTGCTAGGATGCTAATTTGGCGTTGCCACTGGAATGCCTAAT
GTCTGTGTCGTGGTTATATAGATATTGCACATATGTGACTTCTCTAATAA
TTCTTGACAGTGTTCCCGCTGAAAAAAACTCGACAGTGAGGTTAAATCAG
GTCAGGAATTTCGGGCTTGGATGTTTGGCTTTACTGTTCGGTAGTTTGGT
TTAGTAAAGAGTGGTTAATATAGGGTCATTGGGTCCTCACTTTAGTCTTA
GCAGTCTGCATTTTCTCTTGTTTGGCTAGAAATAGAAGTAGAAGGTTAAG
GATTACCTGAGAAGTTGAGAATGTTTGGTCCTTTTAGATCAAAAACTATG
TTCCTGGTTTTCACTGAAACATAACCCAATATTTGATTTTTCTAATTCCC
ATGAATTGGAATGCGAGCAGTATTTGGTTAGATCGATCAAACAAAGAGCT
TAAGATAGCTCAAGATTGGTGCTAATTGGCGATTTTTAGCGAGTCACAAG
AAAAACTTATATTTGCTGAAATCACCATCATGGTTATGGAATATGGGATT
TAGCTTTAAAACTTGACAACCTCATTAGTTGGGATATTTCTTGTTCAGTT
TTTCTTTCTAAAAACCTATGTTTATGAGTCGCTGGCTGGCTGAGGTACTG
ACTTGCTCACGAGTTGCAATGAGAAGAGGTGTCTTTGCTCAGTGTTTGCT
GCCAGCGGAAGCATGTGGCTAGGTTCTATTTTCCCCCTCACACCAGTTAT
ACCAAGATCCTTAGTGTGGTGCCAAGTACCAACTTGTTGACCGTCAGAGT
AACTCATAATATTACTACCTCCGACCATATAAAAAGTGTTACTTTTACTG
TCGTGCAACTTGAACCATTAGTTTTATTAAGATATGTTTGTGAAAGCTAC
AAAATATCAAGATTATGAGCAGTAAAATGTTTCTTGGATCCATGGAGCCA
TAAGTCCACTCAGTATCGTCCTTGGATGCTTCATTGGGATTTGTGCCCAT
TATCAACATGTATTTATGATAAATTTATACAATTGCCATGGGGCTAACCA
ATTATTGTTAAGATGTTGTTCACAAAGAATTGTCTGCACTTACCATGGTG
ACACTTTGTGTGAGCAGAGGGGGTATATCATACACTGTATACATTGTTCA
ATTTTTCCTCTTTGTTGACCCATAATGTGCGGCAGGTGCAGCATGGGCCT
TTGAATCAATCAGCTCGTGCAGGAATTGTTGAAAAGCCCATTCATTCAGA
GCAGACGCATGGACAACATCCAAAGCAATATTTTAGAGAGGAGCCCTTCA
ACTCAGTCAGAGCTAACTCGAGGACACAAACTGATGCAGTAGGGAGGCTA
CAAAATGAGCATCTTAATCCTTCAGTCCATAGGGAGAAGTCGCGTACTGA
ACCAGTCCAAACAACTATCACCATACCTGAAAAGAAGAAATATAGATTTG
TATTTGGTCCAAAATCTTGGCAAGAAGAAAACGTACAGGAAGAGCGGCTT
AACCAGGTTGTCCGCGCATCACAGGCACAAGTAATACCCACAAAGCCTTC
AGTTCATGCAAACCAGACAGAAGGAGGGTTTCCCTATGACAAGATTTCAA
TGCACAACAAGCAGGCAGCTAAACATGTGGCTGCTCCTAGTGCTATGGAG
CATGAGCAGATAACTTCTCAGCGTCAAGTCCATGAGCAGCAAGAAGGTGG
AATTTCTAGTGACACAGTTCAGCCTAACTGCAAATCGCAGGCACAAGTTT
TGTCCACAAAGTCTTCAATTCATGCAAACCAGACAGAACGAGGGTTTCCC
GTTGACATGATTTCAGTGCACAACAAGCAAGCAACTGAACATGTGACTGC
TCCTAGTGCTATGGAACATGAGCAGATAACTTCTCGGCATCAAGTTATCG
ATGACCAGCGAGCAGGTGAAGTTCCTAGTGACACAGTTCAGGTGGAGCAG
GAAAAGGTAGATTCTGCCTGCAAACCATCAAGCAAAAATAAAAATAGCAC
CAAGAATACTAAAGGTAATCATAAGAGGAAAAACAAAAATTTGAGGAATT
CTCCAAATGAGTGGTCTCATCTTAGGCGCAGTAAGCGGCTATCAAAGGGG
TCACCAGACTTTATTGATGCTGAGCCTATCCAGAAGTTAGATGCTTCCCC
ACATCAAAATCATTCAGAAGCTCCACAGATTGAGAGTACCATTGATGATC
CTCCACTAGACTTTATTGATACTGAGCCTATCCAGAAGTTAGATGCTTCC
CCACATCAAAATCATTCAGAAGCTCCACATATTGAGAGTACCATTGCTGA
TCCTGCTTCTAGTTCACCGACTCGATACCAATGTCCTCAAGCTGGCTCAG
TTGATCTAGATAACATCGATGTGACTCCAGCACTTGCTCATGGTGCGCTA
CAAGCTGAGCATTTTCCACACTGCTACAGCCAAACTTACTATCCAGAGAC
TGGGTGGGCGCTTCCTAATCCCAGCTCTAATTCATGGCATGAGCATGAGA
TTCCGCAAACGAGCTTTAATGGGATTGACCAGCTTGCTAAAAGTGATGAT
GAAGTATGTTTAAATCCATCTGAGAATCAAAATCATATGGATGGACAAGT
GGCAGAAGCAGCTTGCAATAGCAAGAACTACTCAGAGCAGGTACAAGTCA
AGCCTCACAGCAAGAAATTTGCAGAGCATGTCATGCAGACGAACTTGGCT
GCTTCATGCAGCCGCCTTGCTGCCATGCTGGCAGTTCCTGCTGCCACTAC
TTTGCCCACCATCGCCTCACTTTCTTCACTTGAAAGTCAGTCCCTCTCTC
CAACCTATTTAGTCATCTCCATTGAGAGCTGTGTATCACTAACATGTGCC
TCCAACTCCTGCAGAGCTACCACTTCAGTGCGTCAGTCCAACAACGCCGC
AACACCAACCAATAACCACCATTTACTCCCAGGTCCTCTCCTTACCCCTT
CTTTACTGAACTTTGTTTTCAATGCAAGGTCAGAAGTGTTATATGCTGTC
CAGTGTTCGTCTGACAGCGTCTCACCTTTATTCTACTGTTCAAATGTGTT
CCTGCCAATGTCTTGATAGGATGGGCTTTACATTTACGATTTGAAATTGA
CACATTTGAAGAATTTCCGCTGCAGGTTTTTAAACTTGTAATGCTGGCTT
GAATTTTTTTTGTTGGTTAAGAAGTGTTGACATGGGATTCATCTGTAATT
TAGCTTTCCTCTGTTGTAGTGTTAATCTTTTCATGCTAGATTAATTGCAT
TACAAATGGAATCCCTTCAATTGTTAATGGATTTTCTAGCGGAAAGACCC
AAAGGACGTTACTTTTGCAAGAGGTGTTCTTTTTTTCCGAGAAACTAAGT
GTTTCTCTTTTTCGCGGAGATCTTCATGATTTTGATTTTGTCTGATATCG
GGCAATTTCAGGATGCACAATGTGATGATATGCAATCAGGATCTCTTAGT
AAGTCGTCAAAAAAGCGAAGAGGGCGTCGCCCTGCTGTGCTAATGGAACC
ACGCAAGGAAGCTGATAGGCCTGTGTTGACTCCCAATGGTACAGAGTAAG
TATCTCCTTTTATGTTTATGGATAGTCGACCGATACATACTAATCTTCAT
GTGCGTGTTCTCTAACCCGCAGCTGGAGTGTGCACCCACCATACCCACCA
TATCCTAAGGTAACAACTATCCTCTCCCTTCTTATCAAGCAGTACTATCC
TGGGACCTGTATTTCAGTGGATAGCGATGGAAGATCTTGTGAGGTTGTGG
TTCACTATTGGCACCAAATTCCTCCAGATGTAAGGGCTACCGTGTTGGAT
GAATTCCTTGTGAGTAACTTATCAGGATATCTCAGTCTATCTTTTGCTCA
CAGGGAGATTTGTAAATGGTGACTGCTTGTGCTTTTGAATACTGCAGAAA
CGCTACAAGTGGTCCCCTGGCCAGGAAGAGGAGTGCCAAAAGATCTTTGA
GCGCAAAGCAATAAGACAGTTAGTTAACCTCTTTTGCTATGAGAAGCAAA
GGGTTAGAGAGGAGTTGGCAGCAAAGAAGTCCAAAAAATCTTTGAGAGTT
GGTAGGGCCAGTGGAGAAATGGCATTAGAAAAGGGAGATGGTAGAGAAGA
TTCAGAGGTACGACGGGGAGATGAGTCTGTTGTGTTGTTCGAGCATGATG
ATCCACGGAATTGGAAACCATTTGTCCCTGACTGGATGCAACCGGTATGG
TGGGAAATGTTGTGTGACCATTGGTCCAAAGACGAATTTATGAAGGTTTC
TTACCAAAAAAGAAAGAATCGGAATGCAGGAAGCCACCCCTGTGATGCTG
CAGGCTCACGAAGTACAACAACACATCAGCAGGTAATAATTAAGAATGCA
ATTTTTGGTCGTTTGATGTTTTCAGAATGTATTGATGATTCTGTTGTTCT
GCTTGTCAGGATATGACATATCAGGATACTGAGGAGGCCAGTGATACTCC
GCTAGGTCCCCATCCTGTGCAGGAGCAGGTAGGGAGCTCAAAGCGTGGGA
GGCACTATGGTACTCCTGTTGTCAGCAAGAAGGCCCAGACTGATTCGTCG
TCAAAATCCTCCCCTGATTGTTTGAACAAGCAGGGACAACAACCGAGATT
CACAGAGGAACAGGTGCGGCAGATGATTAATCAAGCTCTACAAGGACTAA
ATGAGACTTGGGAGAAGAAGTTTCTGTCCTTGGAGCAAAACTTGCGCAAC
ATGTCATCATCACGTGTTGCTCCTGCTGTAAGCTAAAAACAGCTGACTGT
TTCACTCATTCAACAGGGGTTGATATATATGTATTTGTCATTTCTGTCAT
ATCCAGTTTCAGGGTGCTAAGGGATCAGCTGTGTCCGTTGCACGGGACAA
GCGGAGCCTGCTTGCACGGCAGGTAATAATAAAATTTACGTCCTGTCTTT
GTGTATGTGAAGGAAGAAAGTGGCTTCCCATCGGTGAAAAAGGAATCACG
GTGTGCTTTTTGTGCAAACCAGGCTTATAGTCTATACATGTGCATACTCG
CTAGCAAGGTGACACCTGTTTATGTTTATCCTTTGCGGCAGTAGAATTTA
CATATATAGAGAAGATGTGGTCCTTAATCTGTGCTTCTCATGGTCTTAAG
TTGGTTGGCGGTTGGTGATCTGTAATTTTATGTGGCCAGATAATTAAACA
AACTGCAGAAAATGGTAAACATTGCAGCAATAATTAAAAAAAAAAAAGAA
ACCACGGTGAGCAACCTTTTGGTTTTGGGTGGTAACTGGCCATTGTCTAA
AATCAGTAAACCAGTAGTAGGCTATTTCCAATGTTTCACTGCATCCTTGT
CAAACTCTTCCGTTGGATTCGTGCTTACAGAAGATTCCACATCCAGACCT
AATTCTGTTTCAAAATAAAACAAAATAGAAATAGTGTCTGCAGCTTGGTC
GACTGAGAAATACTAAATCTGATATTTGCTTCAGTTTCGCCATTGAATCG
TCGGTGACTGGGTGCAACTACTGTTGCCTTGTGCTTAGCTGTTGTGTGTT
CAGAGGACATGATTTTATTTTCTGTTGCCACGATGGCCGCTGAAAAGTTT
GAATTGTAGCTGGCATGACCTCGAGTCATTTTGCGTTGGTCTTTATAGTG
TTGATGCGTGCCATTCTTGCTGCTGAACTCAGCCTAGAGGCCACTGACTC
GGTTTCACTTCTGATGCTCTCCAGGATACATTAGACCACGCGGAGGGAGA
TAAAGACCCCGCTGCCGGAGACGACGTCGACGGCGAAAACCAGGATGAGC
ACTGGAGCTGACCCAACGCGAGCTTGTCGCGGCTCATATTTCTCAGTAGG
GAGCAAGTAGCTCTGCATGTAGTTCAAGGTGTAAATTCCGTGCAATTTTC
TTGACCCAAGCTCAGTGCAATTTCGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.