Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA023801

[Submit comment/correction]

Sequence	AA023801
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA023801
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTTCATGCTGATAGCAGAGGTGAATGCAGACAGGCAGGCTGTTTTCCCGG CCCAGCCCACCACAGTGTGGTCTTTCTTCTTTCTTCATTCTTCTCCTCCC TTCCCCTCTTCCTCTCTATCTCCACCGGCCACGACTCGCGACCTCGTCGG CGCCTCCCCCCTCAGGCGCCGCTGCCGCTGCCGCTTCCACCGAAGAAGCT AGATCTGATCCCCTCAGGTGACATCTCTCGCTCCCGTACGGCGTTAGAGG AACTTTTTTTCCCCTATGCATCCGTGGTACGCTGCCCAGATCTTCGCCGT TTCTGGGGCTGCGCCAGATTGGGGAAGGATTTAGGGGTTCCGGTTGGGGA TTGCGGGTTTCTGTTGATTGTGGTGCAGTTATTCTCATTGTGATACTTTT GTGGCTTGTTGCTTGGATCCTCGTTCGCGCTCTCTGTGAGTCGTGGTTGT GCCGGACTCGTTTGGACCGGTTGGTTACTAATCTCGATCGTAGATGGCTC GGTCGCCCACGATGGAATTTCCTCTCTTATTGTTTTGCACCGAGCAATCA CGAATTGTGCAATCGTGGTCTCGAATCAGGTGGTACTCGAATACACAAAC TTCTCGTTTTGAGAGTTTTTCTGAACATGTGGTCATTAATATGCTGTTAG AAACACGAAAAGCTGAAACAAGAGAAACAGTAAGAGACAAAATTGTTGAT AGTGTTTTTGGATGTTGGGGAGGTCATATTGATGCAAACGAGTTGCTTTG ATCCACTAGCACAGTCACAGAAGCTATCTGTCCTCAGCCTTGGTTATAGA TCTGGTTGATATGGGTAAAGAAGTTACTTTTTGGAGCCTTTAGAGTATTG ACAGGACGGGATTGTTCGCCCCTGAAACCATTCGTAGACAATAAATGGTG TATTTGTTTGACATTGGAGAAAATTACTAACAAACACTGATTTTTATGCA AACTAAAGTGTGGCAGATGCGCAAATCCCCTCGCGAAGGGATCACACCTG TCTTGTCTGTTTGGGTCAAGTGAAGCATATGTTGGTGTAATGACATACAT TAGCGTTAATTTCATAAGTTATGTGCATTAAATGTTTGACCTCTTAAATT TGGTCTTCTCTTTGATGATCACGTTCAACATGAAATTACTCCCTTTTCAA AGAAAATATTTGCAGTCATTGAAATATTTGTTGATTTCATCAAAAGTACT CACCAAATGTGATGTTTCTTTACAATTTTTATTTGTATTAACATAGTACC CCCTCTCCTTTATTTGTATTAACACCTGAAAATGGGAGGAAATCTGGTTG ATGCAAGTGAAACTCCCCCTATCCTTTTCTAACTTGCTCTTCGCTTTTAT TATGCAGCAAAGTCTGTATTATAGGACCTCTCTCTATCTTTCTTCACACA AGCGTAGTACGATATTCAGTTATAATGGTAACATTGTCCTAATGTTCTCT CTTACATTACAGTTGTGGAAATCCTTGATAAGCCTGATGGCTATGGTCGA TGAGCCTCTGTATCCAATTGCTGTACTGATAGATGAGCTAAAAAATGAAG AAATCCCATTGCGTCTGAACTCCATCAGAAAACTGTCCACAATTGCAAGG GCACTTGGGGAAGAAAGAACCAGGAAGGAACTGATTCCTTTTCTCAGCGA AAACAATGATGATGAAGATGAGGTGCTTCTTGCAATGGCTGAAGAATTGG GTGTGTTCATTCCTTATGTTGGGGGTGTAGACCATGCTCATGTTTTGCTT CCACCGTTGGAGACATTGTCTACGGTAGAGGAAACTTGTGTCCGAGACAA AGCAGTTGAGTCGCTGTGCCGTATTGGTGCACAGATGAAGGAAAGGGACA TTGTTGACTATTTTATTCCAGTAGTAAAGGTAAATAAATACTCTCCTGAT TGTTGGTCCAATTGTTGTAAAATTTATCAAGAATGCTGCCAACATAAGTA CATAACTAGTTAGTATCTTTGTTTCTTGTGGGTAAACTCTCTCATCCTCG GAATTAAATTTTCTCTAAGATATATATTTGCAGTTTTGCATGATATTTCA CTTATTGTCTGCGGTTTAACTAAGTACATTCGTGTAATATTGTTCTATAC AGTGGCACTCCAGCACCTTATGATTGCTTACCTGAAAGACTGCTGTGCTT AATTTAGATGAATATAGCAATGCATTTTTATTTTCTGCCGCTATCTTTAT GTCTGTTCAACTAACTAGTCTTTATTCATTTCAGAGGCTAGCATCTGGTG AGTGGTTTACGGCTAGAGTATCATCCTGTGGGCTTTTCCATATAGCCTAC CCAAGTGCCACTGATCCGTTGAAAACAGAACTGAGGACCATTTATGGCCA ATTATGCCAAGATGACATGCCTATGGTCAGAAGGGCAGCTGCATCAAATC TTGGGAAGTTTGCTGCCACAGTTGAACAGAGCCATTTAAAGATAGAGATA ATCTCAATATTTGATGATTTGACCCAAGATGGTACTTTTACATATTTAAT GTATTATTTATTATCTAGAGATCCTTGCACTAATGGTTCAAAACTGGAAT AAAACTAAATTTCAATATCAAACACTTATTCTGCTGTGTTGCCTAAGTGA AATCATGTAGTCAATTCCTAATTTGTTTTTTCTGTCATTGAGATGATGTC ATGTTGTTGGTTTGGATTTTCAATTGCTTTTGTGTGATACACCAAAACTC ATCAGTACTTGTAGCTGCTTAAAGGAACTTTACAATCTACCAATTTAGAT GGTATCCATTTTCTTTTATTGATTGAACTAAGTATGACTGTTATAATTGT TCGAATGTTGTGTCCACTTTACATCTTGGCTTCGAGCTTGATCCTTGATG AGATATGTCTTTGATCTAGTATTAAATAAATAAGTATCTTGCTTCTTGGT GCTTACATGTGGCTTATCTAACTTCGTTGTAGTTACTAATTTCGCACACT TTTTCATTGTACCATAAAGTAGTTTGCCTAGTTGTGTGGTAGCTTATGTT TCAAGTTCTTAAATTTTGCCTTTTTATTGTTCACAATTTTAACCAGGATC ATGGTAGTCTTGTATGCCTCTATATTGGCTCATCTCTTTCCACTGTGCCT ATCTATGTATTCATTGTTTTTCTTCTCACGAGGTCAATTCTGATTTTTGT AATGAAGCCTTGAACAGAAATTAACTGACTCTACATTACCTTCTTCAGTA TGAACATGATACCAATTTCTCTATGCTTGAATTCTTAAAATCCAGAAGCC GTTTTTTATGCTTGAATGCCCAAAAAGGTCAATAAATAAGCCCTAAAATT GGACTCCTGACTTCTGCTGTGCAACATTTTATACAAGACTGAACCAACTG AAACATCTATTACATATTTTCATATGCACATTCTGCTCCTTATGAACATT TAGTCTAACAGTATTGCTGACCTTCATTGGCAGATCAAGATTCAGTACGT TTATTGGCAGTTGAAGGCTGTGCCGCCCTTGGAAAATTGTTGGAACCCCA AGATTGTGTAGCACATATACTTCCTGTCATTGTCAATTTCTCTCAGGTAC AGTACCCCCGTTTCACAAGTCTTAATAAGTTATTGGTATATATTTTTATG ATTGCTAAGGTTCATGTTAGTCAAAATTTCTTTTATTAATTTTGTTGTTG TGAAGTATGGTTGTGCCACTACTTAATACTTTATGCATATTCCTTTGATA GGATAAATCTTGGCGTGTCCGTTATATGGTTGCCAATCAATTGTACGAGC TCTGTGAGGCTGTTGGCCCTGAGCCCACAAGGTTAGTGCTCTCTTTTTCA TTGGCTGTAGCACACTTGGCTTTTTCATACCCATTATGGGTACTGCGACG TACATAGGCCAAGTTATTGTGTGCATATGATACATAAAATTTGAGCCTTA TTTGATTGATGTGTTTGTATATTTGTTAATAGAACGGACCTTGTGCCTGC ATATGTTCGCCTTCTTCGTGATAATGAAGCTGAAGTACGGATTGCAGCTG CTGGAAAAGTTACTAAGTTCTGCAGGATATTAAGTCCACAACTTGCAATT CAGCACATCCTTCCATGTGTTAAGGTGGGGTCAGCGGAGTAACTGAAGAT CATCTGTCTTTTGCTACTATTTGATCAACAAACTAACTCATGGGAAATTG CATTTGCAGGAGTTATCATCGGATTCATCTCAGCATGTTCGCTCAGCTTT GGCTTCAGTCATTATGGGAATGGCTCCTGTTTTGGGGAAGGTGCAAGCAA ATGATGCAACCATGTTTTTTCTTGAATTGCCTCTACATATGATATATGAA TGAGCGTATTTTGGTTTGAAGAGCTCCAGTCCTATGATTATTTCATAAAG TATATGTTTCCATTACCATATAATTGTCACTGTACCGCAGGTCCACCATT ATTTTTCTCATTAAATGTTGGTATTCATAATTTGTACTGAACAATAAGTG AGATTTCAGCAATGTGCCGAGAGGTTTCTGTGAGATTTTTGGATGTTTTC AAGTGATTTTTATTTGTGTTCCATATTCACTGATCTATTTCCTGGATTCC CAGTAACCTTTAGATATTTTGAGATGATATGTTGGGCCAGCATGCAACTT TATTTCCTAACCTTGTATGTCAGTAGAAGTCCAATTTATTCATTTCATAT ACCTGTGTGATATTGCAATTATTTGTTGCTTATAGCTCAGCACCCTCGGT AACCTTATCAGCTTCTGTTCTGATTTCCTGCAGGATGCTACCATTGAACA ACTTCTTCCTATTTTTCTTTCTTTGCTCAAGGATGAATTTCCTGATGTTC GACTCAACATAATCAGCAAACTTGATCAAGTTAATCAGGTTAGTTCCATT GTTTGTTGTTAGAGTCAGTTTGACTTTTCTTTGAAGTCCTCAATTTCAAC TACTCCCTCTGTCCTGAAAAGGATGTCGCAGATTTGTCTAAATTCGTATG TATCTAGACACTATTTAGTATAAGATACATCCATATTTAGAAAAATTTAC GACATCCTTTTCAGGACGGGGGAAGTATATGTTAGCTGTTTTTGTAAGTT CTGCAGGCTTCAATCCCTTTTTTTTTTGCTTTACCACAAGTATAAATGGG ATTGATTGGACACTTCATAAGAAATACGAGGGTGTTGTGCAAAATATAAC TAGTTGAGTAGGATAGCTCAGTGTTTCCCCACTTGCTCGGGGCCCTTACG TATGCCTCTCTTCCTGAAAATATTTCATTCTATTTCGTGCCAAAGTTTTC TGTGCATACCCCTCCCTTTATCTGTATCCAAAGCTATTTATGGACTAAAG TTGACATGCAACTTCCAAAGGTAATTAGTGCCATAACAAAGATGGGTAGT GCAGTTTTTTTACCCGTCTCTTGGATGAACTGTAATTTTCTAGAGGGAGT AGAGTCTGGCAGCTATATCTCCCCCGTCAAGTTTGTTTCTCCTATTGACC GATCTATCATGTGTTAGTTCCAAATTAACTGACAGTGTTATGATCTTTCA GGTCATTGGAATTGACTTGCTGTCACAATCTCTATTGCCCGCCATTGTAG AACTAGCAGAGGATAGGCACTGGAGGGTTCGGCTTGCAATAATTGAGTAC ATCCCTCTGTTGGCCAGTCAGTTAGGTGTTGGTTTTTTCGATGATAAGCT GGGGGCACTTTGCATGCAATGGTTGGAAGATAAGGTATGTGGTATTCTGA TTACTACTGTGAAGTTATTTCCTTTGGAAAAACAAATCAGTGCATTCATG TGATTTTGGCGTATCAAATCTCAAACATATTATTCCAGCCTTGAAGTTTG TGTAAGAACTCTGATAATTAGCACTTTCATGTTATTTACCCACACTACAA TCCTACCTCTATGTTTAGTTGGCTTGCATATTTTCTCTGGTTAAGGTTTG TATACATAATGAACACAATATTGCCACTGTTCTGTTCAGATAGGATTATG CCTAGAAAATTGGCAGCTAACTGTTCATTAGATCTGAGGTTTGGACTTCA CAAAGTTGCTACAGTCTTACATAATGAACAAATTACCTCCAAGATCAAGG AGGAGGCGGCGGCTTGGGTCCTGGCAGGGGCAAAAGGCCTTAGAGACATA GTGCCAACGACATGGGATGTACACTAAAACCATCTGTTCAGTGCGTGCGT GTGTCGGTTTAACCTCTTAGGAGGCTTGTAACAAACTCTACCTTTTCAAT ATAATGAAACACAAAGAGCTTTTTGCATTTTCTCAAAAAATAAATAAATC TGGCATGACAATTTCACAAGAACTGGTCACATCAACGTTGTCATTTCATA TTACCTAATGTTTCATAAATATATTCGCGTTGGTTTGCATAGGCTTCAGC TAAAGAGAAGTTTGGGTGCTCTTTAATTGGAACAACTTTTCTGCAAGTTA CTGTACAATTTTGTTGTAGGATTTGCATTAGTTTAGTAATAGAACTTGCA TCTGTCAAGAGGATTTCCAAAATTCTTAAAAAAATGTTGCTGCTATGCAA AGCATGTTAACCAGAGTTTGAATTTCAGGTGTTCTCTATCAGAGAAGCTG CCGCGAACAACTTGAAGCGCCTGGCTGAGGAGTTTGGTCCAGAGTGGGCA ATGCAGCATATAATTCCTCAGGTTTTTTATCTACTATCTAAATACTAGAC ATTACTTTAGCATGTACTAAAGCCAATGCACCACAACCAAGCAGGGTGTT TGTGGGGCTTTATAGTTAGGTCAACAATTTTGATCATTGCATATTGAAAA TCAATACTAACCATTCTTGCAATCTTGCACTACTTGTGTCATTTTGTTTT CGACACTAGCCTAGAAGATGTTACTTTCTGTCGAGTAATCAAATGAAGTT GCTCTTTTGGTGAATCGAACCCACAGTTCTTAAACTTATGCTGTGCAGTC AACTTACAAATAAACTTGTATTTTATACATCCACTAAAGTACAAGTAACT TATTTTGGTTGAGAACTCCCCCACCGTGATGCAACCTGTCCACTTGGCAT ACTGACATGGTAAGAGACCTGCATATGTCATGGAAAAAAATCCTACAGAT GATTAGGTCTCCTCTTATATCTCCATGATCTCTGCTTCAACTCGTCTGAG CACTACCGCCACCTTCACCTTGTAGAAGTCCTGTATCTGTATTGCTTGGA CCCATTTATACCTAACAAGAACCTAATGTAGTAGTATGTACAAACTCTTC TTGCTCGGGTGACATGTAAATCTGAATGGTTTTAGCATAACAGGGTGTTG GTTTAGTTTTTCGTTTTGGGTTTGATTAGTTCGGTTGGAAATGGCCGAGT CCGTCGGACAGTTTGGGTCAGTTTCGGTTCGTGATGCAAACAGTTGGGTT TGGTTGGTTATGGGCCTGAAGGGTTACGGGTGAAACTGACCTAGACTTTA GGTTAAGACCCGGTTTTTCAGATGGATCAAACAGTTTTCTTTAACTACAG CGCCTAGCACGGAAGCAGCAGTTGTATTTGGTTTGTGTTAAGACTTATGA GCTCCCTGCTTGTCACGTGCATCAGCTCTGCTGCCATAAAGATCGACTAG TTTGTTGGAGAAACGAGCTAGCTTTGTGCTGCTTGTCGTAGGCCACTAGG GTGTAACTAGCTAGCTATCTAGCAGAGCTAGCTTTGCTACTATGTGCGCG TCAATTTGCTGTGGCTAACAGCACCAGCCAGGAAACAGAAATACTTTGCC TCGAGTTGATCAGCAAGAATGGCAGAGCGAGACCTGCGACAACAGTTTCA ACCAAAAACTAAGAAATGGGGTTAACCCATACTTTAGTAAGTGGTTTGTT TTGATCAGCAAGAATGGCAGAGCGAGACCTGCGACAACAGTTTCAACCAA AAACTAAGAAATGGGGTTAACCCATACTGTAGTAAGTGGTTTGTTTTGGT TTGGGTGGACGATGCGTTCAGTTTGGTTTAGTTTTAGTTATGCTGGGTGG CCGGGAGTGTGGTTTAGTTGTGGTTCTTAACTCCACGTTGATTGGGTATG GTTCAGTTGTGGTTTACTTATAGGACCATTGCTAGACTTAGTGACATGCA ATTTCTACTAGTCTTGAAAGCTTATACACGCTCCATTGTGTAGGTGTTGG AGAAGATAAACAACCCACATTATCTGTATCGCATGACCATCCTGCTAGCT ATCTCACTGCTAGCCCCTGTCATGGGTGCGGAAATAACATGTCAGAAGCT GCTCCCGGTGGTCATTAATTCCTCGAAGGACAGGTGACTGACAGATACCA TACTGACAAAGCTCATCTCTTCATGGCTTTGCTGAGACGCTGACATATTT ATATTTTTTCAGAGTGCCGAACATCAAGTTCAATGTTGCGAAAGTTCTGC AGTCACTCGTACCGATCCTTGATCAAGCTGTAAGCTGCTCAGTTTCTTTC ACATGCTCCTACTTTTTTAGTCTTTGTTCAGTATGGGTAATTGGGGAATA TCATGAATGCCAACTTTGCAGGTTGTTGAGAAGACTTTGAAGCCTTGCCT TGTCGAGCTGAGCGAGGACCCTGACGTGGATGTAAGATACTATGCAAACC AGGCCCTTCTGGCATGTGATCAAATCATGATGTCAAGCTAACTGGATACT ATCCAGTGTTTAGAATCTATTCTTCATTGTCCAGTTTTGGTGTACATGTA GTGGAGACTTCCGTCTAACCCCAGCAACCTACCTATGTTTCGATGCTGAT AAAGGATGGTTTCGTACCCATTTCTTTGTTGTTAATGTTGTAATGGAGCA TCGCAGAACACGTTGTTACTATAGTGTTTACATGGTAGTTTGGACTTGGT TCCTGTCATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.