Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA021445

[Submit comment/correction]

Sequence	AA021445
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA021445
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCGGATTTTGCGGGAGATAAAGACGACCGAAAGTCCACGACAGGGTAT GTCTTTACTCTCGCAGGAGGTGCTATTTCGTGGAGAAACGCCAAACAGTC GATAGTTGCATCATCTACGATGTATGCAGAATTTATAGCATGTTATGAGG CCATGGGACAGGCGTTATGGTTAAAGAAATTTTTGCCCGACTTGAAAGTG GTTGACTACATCAGCAGGCCACTAAAGATGTACTGTGACAACGAGCCCGC AGTATTCTATGCTCACAACAACAAGTCGAGTAATGCTACAAAGTCTATAG ATATAAAGTATTATGTTGTGAAATACAAAGTCCATGATCAAACTATAAGA CTTGAGTATATAAGGACAAATGATATGCTTGCGGATCCGCTAACGAAAGG CTTACCACCCAATGTGTTCAAGGAACACATAGCCGGCATGGGTTTAATGG GAAGCCTATGATTCCTGGACTACAGAGGCCCTAAAGTAACAGGATTTGTT TCAAAATAGAAAGGTATATAATGGCTGTCTGATTCTATCGGCAATTGAGC TAAGACGATGAAACATGCTCTATGTATCGATCTGTGATGAAATAAGTAAA GTACAAAGTTAAAAGTAAAGTCGAGGTCTAGGGGGAGAATGTTAGATAGA TCTCAACGTGACTGGGCCCAACGGCCCAGCACGCCCCTATCCGCGTCCTG ATCGGGGGCGCCCCAACCCTATCTGGTTGGTGGGCCCCTGTCGCCGCGCT ATATAAAGTGGTGGGGAGCTGGCAGCGCACGGTACGAGGTTCACCGCTGT GCCAACACCCCACCTACATCCCTACCGATCTAGGGTTAGCGCGAGCCGAC GGGAAGCACCGCCACCACCGCACACCCACGCCGTCGCCTCCCTTTCTCCC CATGGCCAAGGACAACGGGTCCAGCTCCGGGACTAGTTCCGGCATCCCTC TGGCTCATGTCTGTCGAGCCAGGGAGCAGGTAGTTGCCCTCTCGGATCTC TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC TCTCTCTCTCTCTCTCGATCTAGATCTAGATCTAGAAAGGCAAGATACAT GCTACTGGTAAATCTACACTAGTCTTATTACAAAGTTAGATTAACATATT CTTCTAGGTTTGCAGCAGCTGTGGTACGCATGTGCTGGTTCCAGTATCAC AATTCCTCAAGTAGGGGAAACTGTATTCTACTTTCCCCAAGGACATCTGG AGCAGGTAGATTGTCTTCAATTTTTTTCTCTGGATTTGAGCATTGAGTGT GTAGATAGGTATATGACATCTTTTGTTCTGACAAAACAGACTGGGGGCAC CTCCATGCATTTGCATGGTGTTCCCTCACATATTCTATGCCGTGTACTGA ATGTGGAGCTAAAGGTGATCGGTAGTTTATCTCAGTTATTTCTTCCATAG TTCCTGCCTCTGATGTTTAGTGACACAGCATATTGCTTTGGTCCTTTGTG CAGTCAGAAAATGATTTTGTCTATGCTCGTCTGGTTCTACTACCTGAGCT CAATGTAAGTGTCTTATATTTCATCTGGTCTTCCGCTCTCTTACCGTAGC CTTGAATTCTTGATGTTGCTGTTTAGCACGGCTTTAAGGTGATCGATAGC AACGGTCTGCCTTCATCAACACCAAGCCTTCCGGCACCTTATTTCTGTAA GAAATTAAGAGTTGCTGACAGAATGGCTCATGCTTGGTTTTCTATACCAA GGAAGCACGCTGAAAAATTCCTTCCGCCACTGCTTGGTGCCTAACCACTT GCAGAATTGCACCTTAACTTTACCTAACATTGCAAAGTTACGCTTAATTA TTCGTTGTTTGTTGATGTAGGACATGACCAAGATGGCACCAATGCAGGAG CTTGTTGCGGAGGATCTTTCTGGGATGAAGTGGCGCTTCCAGCACAGATT AGGTGCCTGCTACTCAATATCAGAACTTGCCCATCATACCATGCAAGGAA GATGCAGAAATTATTTATCTTACTCCCTCCGATCAAAATTACTTGTCATA GATTTATGCAAAATATAGCCTAAAATCTGTCTAGGTTCGACAAGTAATTT GGATTGGAGAGGGAGTATTAAAAACTTTGTATAGAATATAGTCACAATAC AATAACAATTTGCCAAAATTGAGTTACCTTTGCCTTTTAGCTCCGCCCTT TCTCCATCCCAAGATATTGAAGCTTTTCTTGTTAATTTATATTTTTCACT GAACTGTAACAATGGTTGATGTGTTTTTGTCATCAATGGGACCAAGGAGG CATCTCCTTCAAACTGCAGAGTATGCAACTTCCAAAAATCTTATTGCAGG GGATGTTATAGTCATTTTGAGGTTTGTTCAATGACCCCATTTGTTTTTCC CGCTAAGGTTCCACCTACAACAAACACTAGGCAAGCACAGCTTGGCTTAT CAAAATGGGCACGAAGAACAAAAAAAATTCTATTGCGCTATCTGGTACTT TTGCGCTGATCAATTTGCATTTCATGTAAAGAGTAACAATCGACCTTTTG AATACAATGTAGAGGAGAAGATGGACAGCTACGTGTTGGGGTTAGACGAT GTATGAGAAATCTTGGGAATATGCCTTCGTCAGAAATAACTAATGATGAA GGACACAAAACAGGCCTTGGTATTCTTCCAAGTATAAGTCATGCTATCAC CGCAAGGTCCAAATTCACTGTCATATACGGACCTAGGTATGTTCCCTCTA CTGAACTTCTTGCTTTGTGGATCATGTTGTCAGTGGTTTCACCTGATGCA CCCCTTCTGGTGTAAGTGCATAGTAACTTCTGACTAATCAGAACAGAAGC TTGTCATTTCGATGATGTGTTACTAAAATGTCAGTTGGCAAAAATTCTTG CAGGAATGGTACAGGGAAATTTGTTGTGCCATATGATCGATATGTTGAGT CTGAAAAGATTTGTTCCTTAGGGGCAAGATTTAGAATGATATTCAGGGAA GCTGCCACGGAGCACAGGTATAGTCATGTTAATAACTTAATACCCCCGCC CCCCCAAAAAAAGGTCTCATCTTATTTTTATTTTGTAAACCCAAATAATA TGAAATTTCAATGCATATTATGTGGACATACGTTGTCCCACAGCTGTGTT ACTTTCAATTTATAGTTTTAAGAGTTACGATTACGATCAAACTCTAATTC ATTCTTAAACTAAGAAATGTAATCAGATAATATTGCAGCTGCTTAGACTG TGAATTCAGATTCTTATTAGATCCGACACAATTCACCACCTTTCTTGTAT TGGAGCAATTCTTTCAACGTTTACAAAATGCTTTAGCGTACTGTTATTGC AGAGTTTCTGGTATTATATCAGGAATTGAAGATTTTGATGCAACATGGCC TGATTCAAAGTGGAGATGTCTAAAGGTAGTTGATAACCAGCATTAATCAC GACCCTTGCTGATAAGGTGCCAAGTGGGATCCCGCCAAAGTCCCACTTGT AGTTCATTTGCCAAATTCTAGTTCAATTTTTTTGCTTAAAATTTGAACTA GAATTCAACAAATGAACTAGAAGTGGGACTTTGGCGGGATCCCACTTGCA TTCCTACATAATGACTACTAATCCTTGTTTGGCTAATGGGTTTTTTATTA AAAATTCAGGTGAAATGGAACAAGGACTCTTCGATATCAATTCCAGATAG AGTTTCTCCATGGGAAATAGAGCCACAGAACAGATCTTCCAATGCCATAG TTCTGTATTTGCCAACGAAGAAACCTTGTGGTGGAAGAGGTTTATTTAGA GAGGATTCAAGGCAGAAAGCAACAGCATTGGAAACACATGACCCTTCTTG TGTTGATCCGGAAGCATGTCTTAACAGTGCAAAACAGATTCTCCAGTTGT GTCAGGATGGATCCTTGACGCATACATCTTCCTCCCTTGCAGAGAACAGG ATATACCTCTCTTCTGTTGATGCCCTCATCTGTCTCTCAGCAGTTTCCTC TTCTGGTTGCTTCTCTTCTGTTGATGATCTTCACATGCAAGCAAAATTAG CTCTTGACATTGCAATGTCATATCTTGCAAGAACATTCCGTGGCCTCAAA TTGTGGAACACCAACCATTTTAAGGACCTTGATAGCCTACCTAGCACCAT TACTAAGTTATACAGTCCATCAGCCTTAGATAGCCTCTGTCTCTCCTCAA CAAGTAGTGAGCCAGATTCGTCGAGCTCTCGTAGCACTGGTGCTTCAAGC AGGGACATTGAGTTGTTGCCTGCAGAAGACTGTTCAACGTTGCACAGGGT CATGTCTTGCTTGGATGAAAAGAAGCTTGATTTGATCAACCAAAAATCCA TCGATTCTGTACGAAGTATAGCCAGCCGAATGATCCAAGCTGGGTTCACA GAAAGATTAAGGGCGACATTCACTGATTTATCACAAGAGCTGATTAGGTG GGCTGCTGGCAACACCAGTGACTACTGTTTTATGAATAATATTTGTGTTT GTTAAGTAGCTTCAATATCATCTCGCAATGGAAACAACCCGGTGCACTAC CTCATCCAGGCATCCAAACTCCATTTTATTATAGCATCTAAAGCATATTC GAACATAACTGCCTAATTCAATACTACATCCCTTTGACCGTTTCGCTTAC ACTTGCTATAATACATGCAGTCTACATTGTAAACTTTTGCCAGTAACATA TATGTGAGTACTTAGTTTTGAGACATGAAATTTACATCAGTCGATCTTCC ATGAGAAGCACTTCAATTATCTTTATAATTTTAATAATTTTGGCTAGCAT GTACTTCAATCATAAGAGCTTATAAAGTAATGTTCAAAAGCTTATCATGT CGATAGTCCAAACAACAAGTAAAAGAGAATAGAGGGATTATTATTCCACT ATGATGATTTTTCCCATTCACTTCAGTTCTAGAATATAGGCCATCTTTGC AAGCCTTCATTTAGTAACCTGGTCTATTTGGAATGTTTTTCATGAAGCAG GGATTTCCACTTTTTTGACTCTAACTGGATTTTCCAATGCCATTCACGGG TCGATGAAGGTGACTCATGTGTTGGTGAAAGTATGAGACTACATTATTGG AATTTGGCATCACGATTCATCACAAGGGTTCTTGTTGAGATGCGACGGCA GCTAAATGAAGCTGATTTCGGTGCCTTTGACGAGCTCAAGGGAGACTACT TTGCAAAGATTGTGGAGCAGCCAGTTTCAAAGTTACTGAACGTTGCTTCT ACGTCCGCTGCTCTTAGCAAACTGTTGGAGGAGATCCCTCAGGGACTGGT TGAATGCGTGCAGTCTGTGTTCCCCAGAATCATTCATGGGCTTGATACAT ACAGCACACTCTCGGATGTTGTTCCAACTCTGTTGGAGTTAGTATCGCCG GAATCTAGAGAATCCATCTCTAGAGAGTCTGATACAATTCATAAGAAGGT GGAGGAGGTGGTGAACATAATGCTTGCCATTCTTACAGATGCGATGTCAG CAAGCTGTCTGCCAGAAACTGAAGACACTGGTATTCACCCTGTGACAAAA GCTGTTGCACAAGGCATAGGATCATTGTTACAACACAGAGTCTCGCTGAA TTTAATCCTTGCTCACAATTGTTGCCGGGTGCATGAAGGTGTCCCAGCCA TAGAATCTTTTGATAGCCTGATATCAAGCTTGATTGTGCATTTTGAATCT GTGCTGAAAAGGAGCTGCAAGGGACTGCTGCCGAAAAAGTCACAACAGTA CATTTTCTTGCTGAACAACATGCAATTCATTCTCAACCAGTTCAAGAGCT CAGTGATTGAGGAGCCTACCGGACACCGTGACTGGGCCATCGAGCATCAC AGAACAATTGAGCATTACGTGGAAGAATACATTGAGACCTCCTGGGCACC TGTGTCCTCTCATCTGGCAGATAAGGATGGAATTGGAAAACGTCTTCGTT TCTGGAGACATTCATGTGCGCAGCAGTTCACCGCAGCCTTCCGTTCTGTT TATGCTGATCAGAGGCACTGGAAGGTGCCTGATCCTCATCTTCGCCAAAC GCTGAGGGATAACATATCAAGGAAACTTATCCCTGAATTGTTGGATTATT AGGCATAATTTCCACGATTAATTTCAGAATATAAATCATGACAAAACCAG CTACTAGCTCATGTAACTCGAACATACTAGATGTACTAAACAACAGGATG ATCGGAAACAAACAGCAGCCTAACATGTACTCGCAGAACATGATGAATAA CCAAACAGGATCACGTAGCACGTACCGTTCGGTTGTCGTAGTAGAAACTT TGGGGAAGAGTGATCGCAGCAGATGGCGATGAAGACGGCGGTAGGCAGCA CCGCCGACTTGGATGGAAGACGACCCGTGATGAAGAACTCGAGCAGTCGC GCAGAGCGCTTCCCAAAAACCTTATTCGCCCTCTCCCGTACAGGATCACA AGGGCGAGTGGTTCCGGAGACCTGCTCTCCCGTCCGCCGGTGCACGCCGG CAAGCGGGATGGAGTAGACTACGGTGACGGCGCAAGTAGGTGACAAAACC CTAGATTGGTTTTTCGGTGGTGTTGTGGCGGTAGCCGCGCAGGAATTCAT ATAAAGCGGCTCAGGAAACCCTAACGGAGGCGAACGTGGGCCGAGTCCAC GTTACGCACGTTCGGGTCGGTTACAGTAGCCCACGATCCCCCACAATCCG GGAGCGACCCAAATAAGCAACCCTTAACAGTAGTCCTTTATTGTACTTGA TGCACTTTCTTGTTTCTCTGTCTGGATGGAGCATCATGGCTTCAACAACT AGTGCTATCTCTCTAATCTCTTCAATGTAACTTTCCGAATTTCCAGTCAA ATGTGATGAGCATTAATCTTTTTTTTGTTTGGGATAAACTTTGCATAATT GAGTACTCGAATATATGGGTATCCCTTTGTTAGGGGGTTTGTGAACAGAT GTATGTACACATTTTTTTAGTGCATGATATACTTCGAATATACACACTAA AATATATCTTTATAAAGACTAAAACATTTTATATTTTAAAACGGAGGAAG TACAAGCTAAGTGGGCCACATGCACTCACTGCCTTGTTACATAGTGCTCA CAAGACATAAATGAATGTTGAGAAGTAGTCCACCAATCTGGTGGACTCGA TTAGTACCGTCTCAAATGTGTTCAAGGTTTTCTATTTTTGCAGGACATCC AAGATATTCTTAATCTATTATGCCGGAGGTGCCAGGAATTAATAGTGTTC TCTAAAAGCGTTGCTTAATGCATATGAATATGTGAAGCTTTTTTTGGACT TTGCTAGTATTTGGTTTACAGGAGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.