Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA005843

[Submit comment/correction]

Sequence
AA005843
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005843
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCCACAACCGACCACGGCCGTACCGCCGTTCCCCGTCGCCGTGGTCACG
CTGCTCCGCTTCCGCCGCCGAACGCTCGAATCCGCTCTTTCCCTAGAGGT
CGCCACCGGCGCGGAGCTCTCCTACCACACCCAGTCTAGCGCTCTTCTCG
CCCCCGGGTGGAGGGCACCGGGTCTAATTTGTAAGCCCTAACTTTACCTC
TTTGCACTGATTATTCCTATCAATTTGTCACCGATTATCGAAGGCTTGGT
CGGTTAGTCGCGAATTTTGGAAAAAAAATCTCAGCAGAAAACTTGCAAAA
TTGTTTCTCCCTCAAGGGGAAGGTTGTATATGCCTCTCCTAAGTACATTC
TAGGAATGCATGCCTGCATTTGTGCATTCTAGACACCTTTCATTCTGATT
TAATCACTTAATTCTCCAAAGACTTGGAAGATGTGGTTTCAAAGTTGGCT
GAAATGAATTGAAGAAGTTTGTTTTCATGGGTGAGTTTTAACCCCCCCCC
CCCCCCCCCTACAAAGTTGGCTGAAATAAATTGAAGAAGTTTGTTTTCAT
GGGTGAGTTTTAACCTAATATCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCACC
ACCACAACACACACACAAATATAGACGACTGTCTTGCTATAAAAAGATAA
ATTACATTGGCACAATCCTTGCTTTACCCCGCGTGTTATTTAAGGCACTA
GTTATATGCATTATCCTGAGGTTTCATTGGTGTGTCTCTTGTAGTTATTT
CTCGCAAGCACAATTTTGTGACTGTTAACTCATTTGGTTATCGTCACCTA
ATGACTGATGAATGACAGGCAATCCTACTATTTTTCTAAGCTACCCTTGC
TTCATATATAATGGAAGTTGATGATGATGGTCAAACAATTCCTTAGGGAA
GGATCACCGTCTGGGACCTCGTCAAGCCTCACCTCAGAGGCAGAATGCGA
GGAAACTAGCTTCCGAAATCAACCAAGCACTGAGGTCCATGGTAATAAAA
ACAGAGGTGACTCTGCGCCTCCGCAGAAAAGAATCTCAGCTAGAGATATG
TGCAAAGAAAATGTTCCAGAAAGCACTCCTACCCTGTTGTATTGTGAGAG
TGGAGAAGGTTATGTTAATGGATTGGGAAAGGTGCCCTTACAGACCGAAG
CTTCTTTCTCTCCATCAGTACTGAATTCTCATCCTCTCTTGGTTGAAGCT
AGCGAGGAAGATGCAATCTCCAGGCGGACACAGGCAAGATGCTCTCTGAC
AAATTACGCACTCGAGGAATTAGAGACCTTTCTCCAGGAATCTGATGATG
AATGTGACTTGCGGAATGTTGATGAGGAAGAGGAATATCGCACGTTTCTT
GCATCTCTCTTATCTGGTGGATGCGATGACACACAGGCTTGCCATGATGG
TACTGCTGTAGTGGAGGGATTTACTGATGAGCAACTTGGTCAATTGCATA
TGATGATATATGCACATGCTCAGCTCATGATCCAAACCTTCTCTCTATCC
GTTCTCGACCCATGTAAACAGTCTGTGGCTGCTGATGTTAAAAAAATGAT
AGTTGAGTTGGTTGGCTACCGTGAACAAGCATTGGCTAGGAGTTTCCGTC
GTCAATTCTGTTTCCAAAGGCAGCATCTGCGGCCAGTACTTCATGCTTTG
ACTGAGAGCTCACAATGCCAATGGATTCCATTAATCAGGAATCCTGTTAT
GTCCATCCTTGATGTCTCGCCACTTCATTTGGCCCTCCGTTATTTAAGGG
ATGTTGCAGCCTGTAAGTCTGCAAAAATGGACGTGATCAATTTTGAATAT
ACTGTTCTTTATTTTGTTTGCCATCGCTTAAGCATCTTTCTTTTTTACTT
AATTGACAGCTGTTGTGAAGCACAGAAAAAGCCTTGTGGATGGCACCGAA
GAGAAGATCCGCTCTAGGAAAGAACCTCTTTTTCCTTCACCGGGACTTAG
CACTGGCAAAGATGCTAACAATGTTTCTGAAGACAGATCCAACAATGTGT
CCACAGCATCACCAGCTTCATCTGGGCAGTTACATCCCAAGAAAACTTTA
GCTGCTACCCTTGTTGACAGTACTAAAAATGAGACAGTTGCTCTTGTTCC
ATTTGACATTGCAAGATTGGCGCAGAGATTTTATCCACTTTTCAATTTTT
TCCTATTTCCTCGCAAGCCGCCTTCTGCAGCTAAGGTCCAGAGAGTGCTT
TTCACTGATGCAGAGGACGGGTATGATTTACATCTTCACCAACGTTTTAA
ATTCCCGCATTGTAGTTTTCTTTTCTGTCAATTCGAATATATCCCTTAAT
TTCAGTCAGAGTGCATTGCCATGTTATCGTAAAAATGTAAGATTTAACAG
AAGCTGAGTGTAAAAGTTTTTTGTTGTAGTCTGTTGAAGTTGTACTGTTC
TCTTTCCTGTTCTACTGGCATTATTTATGTAGTTTGTGTCTGGCCTTACT
AAGCTGTCTGTTCATCTTCATATTTAACTTTTCTCTTAAGGTCTCCTCCT
TTTGGGTGGTTGATCATGAGTTTGCTATGCTTTTGTTCTACTTGCTTAAC
ATGATGTCATATATAATTCCTTTTTTATCGTAAAAATGTAAGATTTAACA
GAAGCTGAGTGTAAAAGTTTTTTGTTGTAGTCTGTTGAAGTTGTACTGTT
CTCTTTCCTGTTCTACTGGCATTATTTATGTAGTTTGTGTCTGGCCTTAC
CAAGCTGTCTGTTCATCTTCATATTTAACTTTTTTCTTAAGGTCTCCTTT
TGGGTGGTTAATCGTGAGTTTGCTATGCTTTTGTTCTACTTGCTTAACAT
GATGTCATATATAATTCCTTTTCAAGTGCATGATTAAATAATATTTGAAC
AAATGTGCTATAATTTATTTTCGTGGTTATTTTAATCTTAGTCTCTGTTC
TGCCTGCAGATTATTAGCTCTAGGGATTATGGAATATAATAATGACTGGG
GCGAACTACAAAAGCGTTTTCTTCCTTGCAAATCAACACATCAGGTAATA
TATGGTTGCGTTGTTTATTTGTTTGAAAACTGTACTTCTACTTCAAGCCT
GAATATTTTCTTTATGTTTTGAATTATCCACACTTTTCTATGATTTAGTA
GACGTGCCAACTTAGTGTTTTCGCTCCTTTTTTGGTGCCCATGGTGCTTG
CGTCTCTCCTTACAACTGACTTCATCTGACTATCTGAAAATATGAAGAAA
TGGAATTCATTGCAAACAGTTTATTGTATTGACATGTCCGTGAGAGTTTT
AACACTGCTTGCACTACTGGTGGCCTAATTTGGTATCTACTCTCAGTAAC
TGATACATCAGGTTGCTTGATTCAAATAAAGATTATGAACTTCTTGGATG
ATCAGTGTCAACAAAGCCACTGCCTGCATTTTGTTGTGCTTTTGTTTTTG
TTATACAAACAAGTAAGCTTGGACCAGTCTTGATCCTCTAACCTCAGCTT
ACAACCATAATTCCAGGCCTTCTGGGCAGATTCCTATTTTGAGAATGCCT
ACTGCCTACGTTTAGCCTCTTGACCCAAGTTGTCTTTGTTGTATGTTTTA
TGCTCATCCAATAACATAACTTTTTGTATTTTAGATATTCGTGAGACAAA
AGAACCGCACCACATGCAATGCTCCTGATAATCCAGTTAAGGTATAAGTG
TAACCTTTCCATTTACTGGTAACATATGATGCTTTATTAATTCTTCTAAG
CCTTTAAGAAAATGCTCAATGTCTTAACTGATTATAACATAGTAAGGTGT
CAATTGATGCCATCTTGTTCTGGAACTGATCTATGAATCCTCTGCAGAGA
CTTTTTTCTATAATGATATTTTAAGCAGTGAAGTTCCTGCAGAAGTGTTA
GCACTGTTTTGAATTGCCAATGTTTGAGCCTTTTATTTTATTACTTTAAG
TACCCTTTTGCATGTTTTATATGCCAACGGTAAAGGAAGGCTAATGGAGT
TCCCGTGGGAAACTGTAAAAGCCAATTTCCATGATATGGACTATATCAAA
TTTGCTTGTTATTATAATAAGAAATAAACTGGGGAAATGATTTTTACCAG
CTATTATTTTTAAAAGGGCAGAAAATGCAAAATTTACAGTGCCTTTGTGA
GGCACTCTATGATTTTACCTCTTATGACTGGAAGCTTCAAAGAGCACTCC
TACGTGTTGTAAAAGAGTAGGTCATCATGCCCTGTACCAAAAACTAATAC
TGCTTTGTTACTGAGATTTTCGAATCCTCCTATTGTACTGGTTGTGATGT
TGATCTCCTTGACTCTCATTTTTCCAAAAATCAACATACTACTAAGCATA
TTTTGTTTCAAATAATGCAGGAAGTGCGCCGTATGAAGACTTCTCCATTG
AGTACAGAGGAAATACAGCGTATCGAAGAGGTGGTTATATTTGTGTCTGC
AGCCTATTTTTTGTTCCCTCTTGGATTGGTATTTACTTACCTTCTCCATC
TTCTGTATGAGTGACGCAGGGGCTCAAGATATTCAAAAATGATTGGACAT
CTGTTTGGAAGTTTGTTGTGCCACATAGGGATCCTGCACATCTCCAGCTT
CAGTGGAGAGTTGCTACTGGTGTCCAGCGATCTTACAGTAAAAGTGATGC
CGGGAAAGAAAGGAGGAGACTAAATGGAGCGAAGAGGAGAAAATTAAAAG
CTTCAGTGCCTGATTCACGAGTAAATCATGGGCAGGAGGTTAGTGTGTTT
CTGAACTTGCAAGATACCCATAAAACATTTGAATGTCTGTGCATGTACAG
TTGTGTCATTGAGCACACTTTACAATGCTTTCGTGACAGGCTGATAACGA
TGCTTCTGAGGGTGTTGAAAATGATGATGATTCGTTTGTCAATGACGCAT
CTTTAGCAGACGCAGAGAATAGGAGCATCAACGTGACACAGGCAGGCACA
TCAGATAATGCAGCGAATGATCTGTTTCCTGTGCCTCCTCCAACCTTTAC
AGAATGTGTTTATACGCAGCTAAACATTTTCCCCGGTCGTAGTACTAGCG
ATATGTCACAGCAACATGGGATTTGTAATGGAAATGTGATAGAGGATGGT
GCTGAGCAAGATTTTCTGATGCATCCTTTGCTTTTTCAGCATCCTCGAGA
AGTGCTTTCATCATATAGCCATCCGAGTGAAAATCTTATTCGTCATACAA
GGAATTATGACATTTTCCCTTTTGAGAAAGTTCAAGTTGAGAAAAGTAAT
AAGCAGAGTACAGATGGCATGGAAGGAGCTCCTGCAAATGCTGACACTAT
TTTCCATCCTCTACTGCAAAGAACTGTAGATGAAATGCTTGAGGAAGTAC
CAGAAAAGGACTGCCATCAGTTTGCTAATCAATCTGACTGTGGCATGAGG
GAACCTCCAGTGGATGACCAGTCAACAGTTAGGGAAACATCCACGAACCC
TTGTGTGAGGGAGAACAGTACTGATTTACAAGCATCAACAAGGACTTGTG
AGAGGGAGAACAACATTGACGTGGACATTCCTTTGTGTTACTCAACGGAT
TTCAGGAATGCAAAGGATTTTAGAAGTACTGTTAGTAAATCTAGCTGTCA
GACAGAAGTGTCTATGAGCTAGTGCTTCAATTCTAGAGCCTGGCAATGCT
TGTTGTCGTCGTGACATTGAACAGCCAAGCAAAGAAGAAATGCGCGGCAT
TGTAATGGAACGAGAAGAATTAAGTGATTCCGAGGAAGATAGCGAGCATG
TGGAGTTTGAATGTGAGGAAATAGATGATTCTGAAGAGGAGCAAGTTCAG
GATGCAGAACCCTGTTTGACTAAAAATAAGGTAATGATTGGCGTTACATC
TGGTACCATTATCAATTCATAACATTCATGAATCTGGTGTAGCACTGTAC
TGTGATTTTTCACTCTTCTGCTATCCTATGATTAAATGTCAAAAATGTTC
GTTGCACTGTGCTGCTTATGTTTCAGGATGCTTGTCTAGTACAATTGGTA
TTTATATGCTGGGCTGATACTCACATACTGTACTAATAGAATGATCAACC
GACCGCTGATGGGTGATGAAACTTAAGTATCTTACCGATCTGGATGTGTT
CAAACCTTATCTCTGCATGTTGCCTTTTTCTCTTTCAATTTTGTTGACAC
CAATAGATGTTTCATTGTGCAGGGAACTGCAAAGTCAGGTGTTTGTTCAG
AGTTTCAAGAAAGCAATGACCATTGTCAGATCCAACAAGGATTAGAACAG
GTGGTTAAACAGGGTGCGAGTTCAACACATAAATCACATGGGCCTTCTAG
TGCAAGGTCAGGCAGAGCAAAGTTAAAGCCGGAGCGCGCAGAGCCCACAG
GAACTAGGAGGAGCCTACGGTTATCTTCTCTTCGAACAGGTACCAAGCCA
GGCCAAAACCAGAAGAACTAGAGGGCAGCAGGAAGAGGCAGGTGTTGAAT
ACCAAGTCCGGTGATTCAGGAAGGTCTAGAAAGAGCCTTGCCCTGAGTTA
AAGGTCTTTCAAGCGTTCCTTTCATTTTGCACTGAATATCTATTATGTTT
GCCTTAGCCAGATGATGCAATGGCTCACTGCAAATTCGTAGTCGCTTGCA
CTGCTGGGCTGATTACTGAGCCATTGATGCATCCCTTGCTGGAGACAGGC
CTGTCAAGTACCCTTAGTGTAGATCACTTGAACAGGGCAACAGGAACCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.