Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA005035

[Submit comment/correction]

Sequence	AA005035
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA005035
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATCTCCGGTGGGTCCCACCTGTAATGGTCAGACAAGCAGTGTCAGCATCT GTCATGGGATCGGGAGGCTAGTGGAGAGCGATTAGCCAAGGCTTTTAAAA AAAGGGGAGAAGGAAATAACCAGGAAACAATAGTAACGTGGAGAAAAGAA TAGCGAACTCGGGGCGGGGGATCGGAACCCTAGGCGACGCCGGCGGCGAT GGCGGCAGCGCCGGAGACGTACATCGGGAGCGTGATAAGCCTCACGTCCA AGAGCGAGATCCGGTACGAGGGCGTCTTGTACACCATCAACACCGAGGAG TCCAGCATCGGGCTCAGGAACGGTGGGTTCCCCATACACCCCTTCCCTTC CCTTGTTAGCCTTCGCCGATTTCTGGTGGAGAGTACTCAGTGATACGGTT AAATTGTAGATTTTGCCTTTTCTTTTCTATCCTGTTCAAATTCGTGTTGC CCGTGGTGCGGAATTCTGAATCCCTTTCTGCAGGATTTATGTCGGAGTTA GGGATTTTAGTTTGATTCTTACAGTCTTTCAATTGCTGAACAACGGTGCG CTCTGAATCATCTGCTGGTGAATTATTAGATGGTGTTGCGCGATGCGAGT TTACATTTACAAAGTTGGCGATTAGCTGAAGATCTGTCGCTGTTTGTTTG TGCTTGTACTAGCTAAATTCCGTTATCTTCCCTGTACTAGTAACATGACA ATTCGAGCTCTGTAGCCCAGGATGACTTCAGTGTGGGTGGAGAATTGTTC GTAGCGACTAGCGAGCCAGTGGTGTGGTGGTGCACATTATACTTTTCAAA AGTCTTCTGTTTTGTTGTCCATCTGGAGTAACCAAACTGCAACTAGTATC ACATGGAAATTAACGGCTATTCGCCAAATCACGTGGGGGCTTGTATTGTT GTACAGCTGAATGGGCCTTGGAACCTTTGCCATGTCCGGAGTGTGGAATA ATGCATGTTCAGAGGCCCCATTGCGTCTGTCGCTTTATAGAACAGCCAAT TGGCGCACACCAGTTTAAGTATTAATTATGGACAAACAAGCAAAGGTTTT AATAGTTGGCGACAGTTACCGCTTCCAAAACATTTCCTTATTGGGGATGG TTCTCCAGCTTAAGCTCTTTAGCGCGCGACAAACTCTTAACTACCATGCA TCTATTAAGTAGGGCCGGAACAAGCAAAGTTTCTCTTTCAGGCATAGTTT CTACTTCCTGATATCTTCTGCCATAATGAGGATATGCACATATTAGGAGT GAACAAATTTTATCCGCCGATAAGTGGAATCCCCAAATCGACGCTGTAAT AAACTTCGATGTCTGAACAATATTTTGTCCCTGTATAAATAATAGCCTGG TCCCTGGTAGACACCAAGTTTAGAGTAATTCTTTCGATCTGGCATGTTAA CCTTTTCTTACTATGTTATTCCGTGGTTTACCACGTTGCAGTTTGTTCAT TTGGAAGCGAAGGTCGTAAGAAGGATGGCCAACAGATTCCTGCTAGCGAC AAGATATATGAATATATACTCTTTCGAGGAACTGATATAAAGGTAATGGT GGTAAATCAGATGAAGTATTACATATTCTTGTCATATCTGTTGTTATAAT TGAACAGGTCATCATATTATATTCAGTACCAGTATAGTTTGTAGCTATAT CCGTAAGTTCTTATTGATAATCCAGTGTTTTGTGGTTTCGTTTGTGAAGT TTTGGAAATGTTTTGTATGCGCGACGTGCTTCTCAGATCATGTTGCAAAA CTTTGCTAGGAAGAAATTTACTATTTTGGACTCCCATGTTTGGCACGACC AAAATGTGAAGTGGATTAATTAGGGTTTAGTGCTTGCTGTGTGATTTTAA AATTAAATTTTACCATTGAGGATATTTTTGGGATGATAGATGCTAATAAG CAAGCTTGCCAAGATTGGGTCCTAAGAAACTTCACTTTCATGCTGGCTGG GTTGGGTTCGTAGGATTATTGTTGGTTAACTTGAAAACTGTTGTTCTAGA GATCACGCGATCTAGATGATTACTTTATATGCTTTACTGATTTTGCATCC TACCTGGAACGAGGATCAGAGTCCAAACATGATCATCATCAGACAGTAAA ATTTGTAAGATGCTCGGTTAAACATACAATCTTGTTCATAAGCATTTTAT AAACATATATAATACCTGGTAGAGATCTGGACAAGGACAAATTCATGCAA TACGGATCCCTCTTAATTGATGTACTGTTTTATCACTAATGTACCAGTAT GACATGCTGGTTGTCTTTTAATTTTCTTCATAGCTGTGCCTTAACTTTAG TTGCTTTACTTCAGGATTTACAAGTCAAATCCTCTCCACCAGCTCAGCCT GCTTCTTTGCACAATGATCCAGCTATTATTCAGGTAACTGTTATTTCCCG GTGAACCATTGTTAAAAATTTAGGCAACTATTATTATGTTTCTGTTTGAG AACTTGTTAGATTACTTAGATATAGTAAGGGAGGTCTCTGTCTTTGCTCA CTGTTATTATTCTGTCTGCAGTCACATTATCCTCGACCCAGTTCAACATC TACAAGCTTGCCTCCTGCTGCAAGCACAACGGCAGTAGCTGACCCTACGT CACAAAATGGTCAGTCAGGAATTCAGATGGCACCTGCATTTCAAGGGAGT TTGCCTCCTACCTCAGTAACCTCACAGAATGCTCAGTCAGGAATTCAGAT GCCACCACCATTTCAAGGGAAGTTACCTCCTACCTCACAAAATGTGCAGT CAGGTGTTCAGATGCCACCACCATTTCAAGGGAATTTGCCTCCTACCTCA CAAAATGTGCAGCCAGGAATTCAGATGCATGTGCAGTCAGGTATTCAGAT GCCGCCACCGTTTCAAGGGAATTTGCCGCCTACATCACAAAATTTGCAGC CAGGAATTCAGATGCCACCACCATTTCCAGGGAATTTGCCCCCTAGCTCG CAAAATGGTCAGTCCGGAATTCAGATGCCAGCACCATTTCAAGGGAATTT GCCTCCTACCTCACAAAATGTTCAGTCCGGGATTCAGATGCCACCTCCAT TTCAAGGGAATTTGCCTCCTACCTCACAGAATGTCCAGTCGGGGATTCAG ATGCCACCTCCATTTCAAGGGAATCCATTTCAACCTCCACCTAGCTTACC TTCATGGAATTCGTCACCTATGCCATCATCTTTAAATGGAAGTGGCCTTG CAATGCCACCAATGTACTGGCCTGGATATTACACCCCACCAACTGGGTTT GCTCATTTGCAGCAACCACCCTTTCTACGCCCCCCACATGGATTGGCAGT TCCACAGGCCTTGCAGCAGTCTCTGCAATATCCTGGACTCAATGCATCTT TGCCAGCTGGGTTTCCAAGCATGCCGGACTTTCCTTCTTTACTGCAACCT AGTAATAATCAAAGCCAAACTTTAGGTGTATCTGCAGTCCCTCCCTCATC AAGTGCATCTGCAACTGAAACACAAGTGAGCCAGCTACCAACTAAGCCGT CAGCTGTTCCTGCTTCTGTATTCTCTGTGGGTTTAACTCCCCCATCTGTC AGTCCTTCCACTTCCATTATTGAACCCAGCATCTCCCTGTCCCAAGGCAT GCCTTCTATAGTGAACAATAAGCCGGTTGTTCTACCTGACTCTAGCGTGG CTTCTGTCAGCAGTGACAAGCTTGACAGTGTACCTGTTTCTGTCCCAGCT TATCAACCTTCCCAGCCACCATCCGCTAACATGGCATCTAGTGCAATCAC TGTTGCGGAATCAATTGCACTGGTCTCTCCTGGACAACTTCTGCCAACTA ATTCCTCGACTTCATCACAGACTATGCAAACTACTCCTGTGGCTGCACCT TCTAAACCTCCCTCTGTGGTTTCATCCTCTCAGACTGCCTCTACAGTTTC ATCCTCACAACCCACTTCCTCTGTAGCTTCACGCCCGCAGGTTGCATCTG CTACTGTTCTGTCATCACGGCAGCTGGAGCCGAGGAATGAAAATAAAGAA GCTAAGCAGACTGAACAGAAGGCTAAACAACATGTGGTTGTTCCATCTGA AAATAAGGAGCCTCTATTGCCAGCACCAAAGCCCATTCTTCAGAAGGTAG TATTTTTGTGCCGAGAAGGATACTTTCTGTACTTGTTTCTTGTACATTGT GATTAGTCCTTTTTTGATTAGTTTTATGTTTCAGCCTGCGGGAGCTTCGT CATATGCTCAGTACAATAATAGAGAACGAGGCCGTGGAAGAGGTCGAGGA AGAGCAAATATGGTACGTACATTACATTTGATGAAGGCTCTAATGTCTTA TAGTTTCTCAAATCTGGGAATGATTGGTTCTTCATAAGAAGTTACTGCTT TAGTGCCAAGTTACCAACCATATTTGGAACCATTAGATGTCCATCTTTTC TGGAACTTGTAAACAACAAGGGTGATATGGTATGCAATATTTATTGAATA GTTTATTTGTAATAATATTTCTACTGTTAGTTACATTATTGGTATTCACC AAAGCGGTATTGACAACAGCCTTGCTGTTCATTTGATTGTAGCAACAAGC AGCTAAATAATGCTACTTGCTAGAAACTGTGACATTTTTCAATCTTATTT TGTTTCATGAGTAGTTGGAATTCCTGTTAAAAAATGGTACAGTAGAATGG ATCTGTCAAGTTTTCCCTCTAGTATTTGAGCAATGCCAAAATTATGGAAT AAGGATGATTTTGGTTACTGGAAGCATTTTCTTCAATGTTTTGCAAAAAA ATGTACTCCCTCTGTTCTGGTTGGAATGGCCGGAGGACCAAATCGTGGAG ACCTAGGTGATGCAATATTGACACTGGTAATTGACAGCACAAAAAAAGCA GGTGCGATGCAGGAGTTCGTTTAGCTGGGCAATTGTGGGGAGAGGAAACT GTGGGCTGCAAGGCAGAGACGAGGAGGAATAATGGTGGGAGGGGTGTGAG GAACCAAACAATTGCTCGAGAGAGAAATTTTGAGGGGTGGGCCCTGATTT CTAGGGAGTCGTCTGGCCTTCCAAAACCGAATAACTTGGATTTGATGTTC GGCCTTTGCTGTAATATTATATATTAGTCATTTTTCTTTGGAAGTATAGT GAATAAAAGTTAGCTATTTCTTTTCCAGGCAACACAGTTGACATTAGCTA TTAGTCAAGTAAAATCGATGCAATTTGTTGACAAACGTCAAATCAATAAT ATTAATCAAGTTTTATGGTCTTGCGACCAGCTAACTTAACAATCAAGTGC ACATGAATCTACTGCTTTGGATTAATGCATTATTAGATACTATGATCTAT GCACTGTTCTTTAAAATAGTGGTACATTGTCTTACTAATTTTCCCTCGCA GCAATCACGTCCTGTAGCCAAGTTTGCAGAGGATTTCGATTTCATGGCTA TGAATGAGAAATTCAACAAAGATGAAGTATGGGACCATCTTGGTAAAAGC AATGGACAGTTTAGTGATGATCCAAATGAGTATGAAGATAATGTTCTGGA AGACGATGTGGTGTCTCCTGGAAAGCCGGAGGTTAAGGTATGCAATTTCG ATGGGTTGCTTCTTGTGATTCATTAATGTCTTTCCTGATGCTGATTAGCC TCTTTTGTGAAGCCTGTTTATGTCAAAGACGACTTCTTCGATTCACTCTC AAGCAACACAGTTGATAATGGAACTAGAAATGGAAGAGTTAAATTCTCCG AGCAGAGGAAAATAGACACAGAGGTAATGCCATTGCATCTCTAACCTTAT TATACTGCTTGTCATTCATTGCTTATGGTAAGAAACTGTCTGTAGACCTT CGGTGATTCTGCAAGGCATCGACCTATGGGCATGCGGGGTGGAGGAAGGG GCGGCCCCCGTGGTGGCGGTCCTCGTGGTCGTGGTGGCTACTATGGAAGA GGGTATGGACATACAGCGAGGGGACGTGGCTACTCTTACCCAAACCATCA GTCTTGAACTCTTGGTAAAGAAAACGGTGGATTTGTTTTCATCATGCGCA ATCAGGTAAGTGATGATGGGCAAGGTTATATGAACACTGTAACTGCATTG CGGCCGTTGGAGGCAGATGGTGATCCTTATCTTCCAGCCTGTCTGATGAG GAACTGAATGATCTAGCAGTTGATTTGATAAATTAAGGATTGTTGCATTT CGCTGACTGCAGATTGGAGCACCCGTGGTTATAATATCTCTCTACTTCCC TGATGGTCTTATTTTTACTGTACGGAGGTATGAACTAGATTTCTCCAGGA TGGAGTGGGCGCTGATGTGCAGACTCATTGTGGCACTGGGATTGGTTATA TATCAGCGGATTTGCTATGGAGTTTGCAAAGCGCCATGTACAAGTGTCAA ACATAGAAACCGGGTCCTCCAATTTCATTGTATGCTATATTTAACTTGTC CTTGTAACTTGCGGTGCTATTTGAAGAATTTTACTGTCCACTTTTTTGGA TATGTACAAGTATTACATCGAAAGCTTTGACAATTCGCCATGACATTTCA TTGAAGATGCAGATACTGGGTTTCTATCTGTTTCAGGGCTATTTTGTTAC TC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.