Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA003491

[Submit comment/correction]

Sequence
AA003491
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA003491
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTGTAGTTTTACGTCATTTTCTCCTCTCTCTCTCGCCACCGCCGCGCA
CCACCGGGAACGCTTCTTCCGCATCAGATCGGCCGCGCTCTCTTTCCTCT
CCTCCATCATCCGTCCCCCAGCCCGCCTCGGCACGCCACAGATCTGCCGC
CGCGCCAGGGCTCTCGCCGACGAGAGAGAGATGAACGTAGTGAAGGCGGC
GCAGCTCTCGGGTCGGGCGCTGGAGCTGGTGGTGATGCACCCACTCGTGC
TGCTCAGCATCGTCGACCACTACAACCGCGTCGCCCGCGACACCCGGAAG
CGCGTCGTTGGCGTGCTCCTCGGTACCTCCTCCCGCGGCACCGTCGACGT
CACCAACTCTTACGCTGGTAATCGAACCGAACCCCGTCCCTGGCCTACTA
GGGTTTGCGCCGTTCTTGTTCGCTCGCCGGTCTCTAGAGGATCTGCCCCT
CTGACGGACCCAGGGTTTAGCGGATTCGGCCTTGCGTGTCGATGTAGTTC
GATGTATCTATCGGCGTCAATTGCTCTAACGCTATTAGATCTTTAAAAGC
TGTCACGGTGGTACATGGACGGATCCAGGAATTTAACTTCGGATGTACAA
ATTTCAAGCAACACAAAACATAAAAATGAAAAAAATGAAAATGGTACTCC
CTTTGGCCTGAATTATTAGCCGCGGGCGCTGTGTTAATTTAATTTTACAA
AAAATATCCCTAATTTAAATTCGGTTGCTAATAAGTCCAAATCAAACCAT
CGTCTTCCCCGCGTCGGGGCTGGCCACGCGTCACTGTTGTCCGCAACTCC
TCGATGGGAGGTAGTCCATAGCCACTCTGCTCGCACTTGGAGAGCTCCCG
TGGAGGGCGTCGCTGGCCGGACGCTTCTCTTTCCCCTGCCCAGGCCGTCC
TCGTGGGCGACCTCATAGATCTCGGCCCTGACGGCGCCTCCATCATCAAG
CACGACCACCGTCGGCCGTCGAGCTTCGGGCTCCTCTTCCACAACTCCCG
CTCCGCCGCCAATACGGGTGCGGTCCAACACAGGAGCTCCGTCACTAGCA
GCGTTCAGAGTACGCGGTCCTGCTGGAGCGACGTAGGGACGAGCTCGACG
AGGGACGCACACATCACTCAGGGACGACGCGGATGTGTATTGGTGCCTCG
CAGGGACGACGTGAAGGTGCTGGAGCACCGCAGGGACGAGCTAGACATGG
ATTGCCATGGAGAGGCGGTGAGGCTGCGCCGGAGCGGCGCTAGACTGAGG
GAGGACGAGCCGTGTCGGGAAGATTTTAGTTTGAATTTTGAATATGCAGG
CCAAATTTGAGAAGTTTTGAACGAACTAGGTATTTTGGCAAAATAGACCT
TGTACTATGTATGCGACATGTATTACAGGCCAGAAAGTACCAAAGGGTGA
TACACATGAATATATACATGAATTTTTTTTACAAAATTTTGGGTGTACAT
CTGTACACCCATGACCCATGGGAGCTCCTTCTATGCGGTGGTAGTTTGCT
GAATTTGTAATAATTCGTGGTGGCGCGTGATTTTGCAGTGCCGTTTGAGG
AGGAGGACAAGGATCCGAGGATCTGGTTCCTCGACCATAATTACCACGAG
TCTATGTTTTCCATGTTCAAGAGGATCAACGGTATGCTATTGTAAAATTC
TCAGATATTCATGTATTGTTCACAATTACCGATGAGCTGATGTTTCTGTT
GTACTGATGAGCTGAATGCAGCCAAGGAGCATGTTGTTGGCTGGTACAGC
ACTGGTCCAAAGCTAAAGGAGAACGACTTGGATGTTCATGCGTTGTTTAA
CAAGTATGATATGATTCTGCGCTATAACCATATGCCCCGCGATAGTTTAG
AAGCTCTGTTTTCTGTTTATACACAATTTTACTTGATACGAGTACTCACA
ACTTGTAGTGTGTTAGAATGCAAGCATAAACTTACTCCCTCCGTTTTAAA
ATATAAGATGTTTTAGATTTATGAACAAAATGTATTTAAACTTTTTTAGT
GTGTAGATTCACTCCAAACCTGAGTGAACCAAAGCTAAAACATCTTATAT
TTTGAAACGGAGGAAGTACAATTTATATGCACTGTCCAATATTACAGTGC
AAGCATGAACTCGTTGAGAGGCTAGCTTTCTTGATGAAGTGTTAATGTCC
ATCCATAATCTAGTTCCGTTGGGCTGTCTGTTTCTTCTTGACCTGTTTTG
CTCTTTAGTTTCCTGTAAACTGAATCTGATACTTGGTTTGGTGGTTTCAT
TTCTTGGAATGGAACCGGGGAATAAATCCCTGTTGATCTAAAAAAAAATC
CATAATCTAGTTTTATTTCACTTGCTGTTTGATTTCATACTGTTAATGAA
GCATGCGTCTGGTTAAGTAATTTCACATGTGTACAGAAGTTTGCTTGATG
AGTTAATCGCAAAGCTCACAAAAAATACATAGCTGCTAATTATTATTCCC
TTAAATTTATCTGCTAGACAGACAATGGAGAGGTTATGAATATGATGACC
TTATATAGGGTGTGGAATTATTGGCGATCTTAGGTGTTACAAAGAACAGT
CAGCCTATTGATATTTACATTGAACTGATCAGCTACCATGAGATTTCTCA
CTGCTTACTCCATTAGTAAATCAATCAAATGAAACAATAAACTTGTATAC
TGGAACTTACACATGAGTTCAGTGAGCTGGGTACATGCTTCGATGGTAAA
GAACAGTGTCAACAACTCTAGCATACAAACATTCTTACTGTTCAATACCC
TTCGTGTATCATTTGTTGGGGGGTGTTGATTGCGTAGATTGAGTTTGCTG
ATGGAAGTATCATTGTGTTTTGAGTAAAATCTGTGGCAGGTATCTAAACT
TGGCACTTTTTTCGATATGGTCACTGACCTTAGGAATACGCGATTTACGG
TCACTAAATACGAGGCTTGTCTTGTTACGGTCACCGGCTTCTATACATCG
GTGTATTTTGCCGATGTGGCGGGCTTTGACCCCCACATGTCAGGCCACAT
GGGGTGCAGCGGTGAATTTTTCTTTTGCAAAAAGCCCCCTAAATTAAAAA
AATAGCCTCAATCTCTCACCCTCAACCCACAGCAGCTCACTTCCAGCGCG
CCGCCGTTCCCCTAGCCACTGCACACACACTAATTAGGCCTAAACGCACA
CGCAGTTAATGACAAAGCTAATTAAGCTACAAGCTAGTTAACGGTGAAAA
TTTTCATCACGACTTGTCAGGCAAGCGGCAATGCTTACCGTGGTTTGAGT
CATTCAATGGAAGAAGTTTCTGATGATACTGTTGTTGCTGCAGTGTCGCT
CATCGATTTAGCTGGAGCAGATCTCATAATATTCAGAGAATTTCGACGAA
CATGAGACAGTAATGGGAAAAAATCTGATGGATATATATCATGCACTGAA
AATATGAACACAGATCGAATAGCATAATGCCATAATCTCAATAACCGATA
TATAGAAGTATATGACAGTACTATGGAAAGAACCAAGCGAACAAGAACTA
GTAGGTAACCACCGAAAATATCTAACAAGATCTACGGCGAAAATATGCAT
ATGTTACTCCAGTGCTAGCAGTAACTAGTAGGTAACCACCGAAAATATCT
AACAAGATCTTCGGCGACGTACAGCAGCATCGCCCAACCAATAGAATTGA
GAGACAAATCCCCGAATGCACCAACCAATCAAATCGAATCAACGGCGGAG
GGAATCAGAACCAGACTTTGCAGTCCACGGGCTTGAAGGCGGGCGCGGAG
GTGGCGGCGGAGGTGGCGGCGGGGGCGGGAAGGAGAGCGGGCAGGAGATG
GAGGGTGGCGCGTGGGCTGGAGGTGGAGGCGTGGCTCGCGGGCAGGAGAT
GTAGGGCGGCGCTGGTCATCGGCGCCAGAGCCAGGCGCGGGGAGAAGAGG
AAGACAACCTTATCTCTGGCAATTTTACACTTGAGCCCTATTTATTTTTG
TTATTGTAAAAATAGTTTCCTGTATGTGCGGTAGGCTGGCAGATGGGGTC
TACTACCGGTGCCACATCAGCAAATATATCCCGGTACAGAGTCCAGTACA
AAAGGCAGTGAAAGCCCCGTATTTAGTGACCGTAAATCTTGTATTCCTAA
GGTTGGTGACCATATCAAAAATTGATGCCAAGTTCAGATACCTGTCATGG
ATTTTACTCTCGTGTTTTCCCCCTCTAAACATTTTTTGTTATTATTAGTC
CTAGGATGCATGTCTTGTATTCTCTATGGTTCTTACTCTTCGTGCAGTTA
ATTTTGATTCTTACTTTACATTGTGCAGCTATGTTCCTAATCCTGTCCTG
GTCATTATCGATGTTCAACCCAAGGAATTGGAATACCCACAAAAGCATAC
TATGCTGTGAGGTAGGCGCGGCACATGATCTAAGAAGCTGGAGATTTATG
CTTGCTTATTCAGCTAAACTAATGTATTCGGTTGTCCTGTGCAGAATGCT
ACTCAGAAAAGTCAAAAGGTGTTTGTCCATGTCCCTTCAGAAATTGCTGC
TCATGAAGTCGAGGAGATTGGTAAGACTTGTTTGTTTGAATTGTACAAGA
ATGTGTTGCAGTTACAAGTTATAGATTCAGTTGTTCAGTCATGGTCTTTT
TGATAGCTAGTTCACTTTGAGAAAGAAATATAATTATGCTTGAGAGGTTT
TTGAGTTCACTTCTGAATCTTAGCTGATGCATGATTTATGCTCTCTTCAG
GAGTTGAGCATCTTCTGAGGGATGTGAAAGACACAACAATAAGCACACTT
GCAACACAGGTAATAGTTCATAAGAATTAAGACAGGAGGGTTGTACAATT
TATAGCTTTCTGTATGTATACCATGACCCTAATTTTTCATCTGCCAATGA
AGGTCAGCAGCAAGCTTGCAGCCTTGAAAGGACTCGACACGCGGCTTGGG
GAGATCCAGGGCTATTTAGATCTTGTAATTGAAGGGAAGCTCCCACTGAA
TCATGAGATTTTGTACCACTTGCAGGTTTGGCTTTCGCTCACTATATTTT
ACTAGTTAGTGTACACAGGCAACACACACCTCGATTAATTATGACAAATC
GCAATGCAACATATATATCATGCCATGCAAATTGCAATGAACTTGTGATT
CACTCAAAAAAGACACCGAATATTGGCTTTTAATTCCGCGCCTCTAGGAC
GGTTTCTACTACCAGCTACAAAGGGATTTTGAATAGATCAGGCTTGTAAT
CTTCCTTGATAAGAACTTCCACCAACTAGTAAGCGATCTGTACAATCGCT
CAATAACCTATATTGTAGCATCCTAACATCTCTTCTTTCCTTCCGAAGAA
TCACAGAGCCTCTTGTTCATTGATGCTCGTAGCTATAATGATCTAGGCAA
CTCCCACATCCGTCCCTTTCTTTCTTCCTCGTCACCTTGCAGAGCGGATC
TAAATGTGCTAGCACTAAAACCGATGATTCAAAACTCATGGTCATGGGCA
CCTCAGTCCACCTCGTCACCTTGCATGGAAGAATATCTCTGATGTGAGCA
CATTCACGGCAAGACCGGTACTGGATGGCCCGTGAAAGAGACCATAAAGA
GGAAATCCCTTAAACATGTGGTAGGCTTTGACCCACCTAGGTGTCCATGC
GCTGCACCTGGCAATCTCTGCCACCATGTCTCCCCTGGGTCAGGATGGGA
ATGGGCCGGTCTTGACCCGGCCCAAAAGTTTGAGGCCGATGGGTCACGTG
GGTTGGCCCTAAATTAAAATTGGGTCGGTGGAGCCGGCCCCTTGATCGGC
CGGGTTGACCAATATCTGCCACAACGGTGAGGTGTCCTGCTCGCGGTCCA
GCTTGTTTTGCTAGATGTCACGCTCCTTTTAGTCCGCTGGAGTTGTCGCC
CAGCATAGTCGAGACAACTCTGGTTGTTGGTTCGGTGCTAGTTTCAAACT
AAGTTGTGTCCAAATGAATACTTGAACGATCCAAGTTATTATTAGTTTAA
CGTTAGCTGCTAGCTAGTGCTTCCAGCCTAAGATCAACTACTGTCACTAA
GCTAAATTTATTTGCCAGTTCAGTGCATTTGTGCATAAAACTATCCACCA
CAAAATTTATTATCGGTCTTGTCATCCTTTTTCTATTTTCTTTATAAACA
GATAAGAAAAAGTGATATTCCGGTTTAATTTGGGTCGTCCTCGGATACCT
ATTGGGCCAGCGAGGCCACCATATTTTATTAAAATGGGTCGACCTGTGGC
CTCCCAAAATGGCCTTGAGGCCACAGGTCTAGGTCCAAGGCCAGGTCCAG
GTCGACCCATTCCCATCCCGACCCCTGGGCGTCCACGCACCGCCCTGCCG
CAAGTGTGGAGGGCGAGGGCGGCGGCACCGGCACCGTGTGTGCGTCCCCT
ACCGCGGAGGAAGGGTGGGCGATAGTTTCTGTGTCACCGGCTTCAGGAAA
GATGGGTGGCTGCTTGTGCGACCCTGCAGAGGACCTAGGCGACGGCATCT
GCCTCGATTCATGAGTGACGACCTAGGCACTCACATAACCCATGGGGAGG
TGGTGGCGGCCATCCACACCCTGCGAGGGGGACGATGGGGGGGGATTGTT
ATTTTTCGTTGGGGCTTATTTTAGATTGATCGTGAGATTCTCAAGTGTGA
TGAGTCGAGCTCAACATTGGAGCCATTTAGACTGTTTGATGATCAGTATT
GGATGACTGAAATTAATTGTATTCCAGCAAGTTTGTGCCTTTATAAGGTG
TAGAGATAGAGATAACATTAAATTCACAAGCAATGGCAGACTTCCACCAA
TAGAATGACCAGTGAATAGCAGTGCTGCAGATTTACCACAATTTCTCAAA
TGCGATTTGACACATGGCAGCATTTGCTAAACGTACAGGGAAAGAAAAGT
GCTCCCTCTGTTTGGAAATAAGTGACTTTCATTTGTCTAGATTTGAATGT
ATCTAGACGCATTTTAGCATTAGATACATGCGAATCTAGACAAATTCAAG
TCACTTATTTCCGGACAGAGGGAGTACAACTGTAGAAGACTTGATAATGT
CGTCGATGGAGGTCATGCTAGTGCACATAAGACCCCTAATGATCAATCCA
TATAATATTCCATGCCTTGCCACATTTGGTAATGCTTGGTCTTTTATCCA
GTGCCCAGATATGCCAACAATTTAAAATTCATCTCAAGTTCTGCTATCAA
AGCAATTTAGCATTTTTCACTCATGGAGTCAATGACCTATTCGTTTTGAA
ATTTTGTTGCAGGATGTGTTTAATCTGGTTCCCAATGTCAATGTAAATGA
GCTTATTAAAGCCTTTGCAGGTAACCACACATGTTCTGCCATACATTGCT
GACTTAGTTTTTTCATTGCGTTTCCTGGGTTTTATATCCGCAGCAACTTT
ATTATCAATCTTTTCCTACAGTGAAAATAAATGATATGATGCTGGTTATA
TACCTGTCTTCTCTTATCCGAAGTGTCATCGTACTCCATAACTTGATCAA
CAACAAGGTAACTTTTTTTTGAACCTGGAGAGGCCCAGAGGAGCCTAGAT
ACTGTCATTCATAAAAGCGGTGTCGCTACAGGTTACATAAGGGTCCTTGG
AAAAGTAAGCAAGGGCAACATGGACCCAGGAGAATGAAAAAAGAACCCTA
TAACATTTTTTTCCGAGAAAATGCATAGTCATTGCGTTTCTTTTCATTGA
AAAGAAAGAGTTTGGGTTACAAGGCTCCTAAGAGGTCCATTACAAGCCTC
CTCAGAACCCTACAACAAATTAGGAAAACGCAACAGTCCTCGGCTATATG
AAATATTAGCTCCTTGTTCTTTTCCCAAACTTTTTGGTAAATTTCTAGAA
CTTTTTTTTTGCGACTACAGATGCTAAACAAGGAACACGAGAAGGCCGAG
GATTTGAAGTCAGCCACTATACTTGCTGTGGCTGGGAGCTGAAAGCTTTG
TTTGCCTCACTTGGGGGATATCGATCTTTGACCCAGGGCATGGCAACGAA
ATTGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.