Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA001508

[Submit comment/correction]

Sequence	AA001508
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA001508
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGTCACTCGCTGAGCGACTCACGGACGGCGAACAGCCGAACGCGACCTAG CGAGTAGCGACCGCCTCCGGTCAGTTCGCCGGCTGGCTGGCCGACTCGTC CCGCCGGCGGCGAGGCGCGACGCTTTTCTGTACCCCAAATGCGGTGGCAA GAGGGATGGTTGTCCGTCCGTGGGGTTCGTTCGGCGGCGGCGCGTTCCAC CAAGCCGCGGGCGAAGGCCGGGTCAGATTTTCTCCGGTGGTGGCCCGCCG GGCGCTGATTTTCTCTCTGCTTTGAATTCTCGGTTCTCTCTTTTCCACGG GGGTGGGGGTGGGTGAGTACTCCTTCAGTCCTTCTCGTGTCGCCTTCTAT ACCAAACTTCCTTCCAATTTCCTAGCTCGCCCTCCTCCTGGTCGTCGTCT CTTGCCCCCCCCCCCCCCGCCTCACCCCGCCCAACAGCCACAGCTTCGTG TTCGATCGGCAAAATCAAGGGTTCCTCTTGGTGCAGATTTCTGATCCTAC CTATCTGAGTGTCAGGTACTCCCTGTCTCACTCGCAAGTTTTACTAGCTA CAGTATATGCGTATGCTGCTTTTGGTTTGCAATCATGGATGGATGTATCT GTTCGTTTAGATTCAAGTGACAAGGGCTCGCTGGGCTTCTGGTTTGCTCA CAATTAGCTGAAACTTTCAAAAACATTTTGGTTCCCCTGTTCACGCTTTT TTTTTTTCATTTTTGTGAGGTGCTCTTATTCCTCCCTCTTTTTGTTTTCT CTCTTTAGGTAATTTCCCATCTTTTTTTCTTTATCAGCGATAGTAGGATG TTTCTCCGATTTACTGAAATATGACAATATAGCCATCTTGTCTAATGGTC TTGAAGATTAAGGTGGTTTTACAATGATATGTCAAAGCTCAGACGGTTGC ATACTTGCATGGACCGCCGTGAGAGATAGCTTAGTGGGCGTGTGTTTTCG GTTTTAGTTATTTATTTGCTCCTATTTAATGAAAAAGCCATTCAGCCAAG CTCTTGTACATTGTTCTGTTTCTCGGTTTGTTTTTGTTTCTGTTTGACTG TAAGACCTTTGGTGTCTTCTTGTAATACAAAATATCAAAATGATGCGCAC TTAGAGCGTCTCCACTCGGGGTCCCTAAAGCCCCTCTAAAGGGGGGAAGG GGGGGGGGGGGGGGGGGTTGCTATATGTAGGCGCGCCGGCCATAACCATT GCAGATCTACATCTACACCATGACCACATCCCTCTCCCGCTATATCTAGG ACGGCAGCCAGAGGTAAAACGGCCTCGTCGGCGCCATTCTTCACACAACC CGCCCGCATTCTTTACCATCGAAACCGTAGCCGATTCCCCGCTGTCGATG GAGCATTTTCTAGAAGATGGCCCAGCCGTCAACGGCTATGCGCGGCGGTG CCTACACGTCCAGGAGGCGCAAGCGCTTTGGGAGGCCCGGTACCTAGTCC CTCCGGACACTCGGTTGCCGAGGGGATGGGCGCTCAGCGCTGGCAGTCTG CCGGTACCTCCGGTGCGGTCGGCGAGGCCCTATCAGCGGCCATCTTCGTC CCCTTCTGGACCGGCCTCACGCCGGAGGAGAGGGACGACCCCCAATGGCA TCCCGACAACCACGACGTGTGGACGATCTTCTTTGAACAGCAGCGCTTGG GCTGCATGATCGCCTATGATGGCGCCGGCCCGCTGCCACCAATCAACACT TTCGACGGCCGGAGGCGGTGGTGGAGCGTAGCAGGGCGCACACTTGACTA GGTGCTCGATTACATCGCCGCCGGGAGCAACCCGCGTCTGGATTAAAAGT CCCTAGGCTTGCACTTGGCTCCGGAATCGACCTCCTCCTTGCCCATCTAG TAGTTCCGTCTTTTTTTCTCTTGTTTGTTCAAATATGTGTAAACTTGTTT GAACTATATGTAAAATCGATGTTAATTTCGTATTTGGCAATTATTTCAAA TGTTCAATTTTTTGTATGGGGGGCACGGGCGAAAAAACGGCCACACCGAA CGCCGTATGGGGGGACGAGTGGAGATGCTCTTACGTGCTTGTTCGGGAAA AAAGTTATATGTGCAAAGCTTTATCACATTCTCTGAAAAAAAAACAATGA TGCAAAGCTGGTATGCTTTAACAGAAAGAAGGTGTCTCTTGCCTTCTGCA TTAAAAAATCTCATACTTAATGGAGACTGTCAAAAATGTATTCACAATAT GAATGATCTTATTGAGTGTCAATAGCTTGAGCGCATTTCAGAACGTGTTC TGGCCATGAAGATCAGCTTCTGTCCAACATATCTATCTTCTAGTCTCTCC GTTCAGGAATATAAGACATTTTAATTTTGTGAAATGAATGTATCTAGACG TCTTTTAGTGTATAGGTTGAATGTATCTAGACGCCTTTTAGTGTATAGGT TCACTCCGAACCTATACACTAAAAAACGTCTAGATACATTCGATTCACAA AGCTAAAACGTCTTATATTTCTGAATGGAGGGAGTATATACTTGGTCCTG AGTTGTAGACAAGTTTTTGAACAATCTATAGATTGCTGAAATGTATACTT TGCAATCATTAATCTGATCACCACTTTAAACATTGAAATGTTATGTCGTA CAGGTCAGGAATATTCCTTGATTACATGGCTACAGTGTCAGCAGCCACTG CTGTAGGTTGGGTTCTTTCTCCTGTTATTAGAAGGATGGTTTCTCTGGTG CAGTCCTATATGTCAAGCCAGTATAATTGGAAATCTGGGATAGTATCTGA TCTCAAGAATTTGGAGGCCACTTTAATGGATATACTCATTGTAGTTGGTG CAGCTGAAAGGCAACATGTAGTGGACACAAATCAGATACTATTATTGCAG CAAATGAAGGATGCAGTCTCTGATGCAGAAGATGTCTTGGATGAGTTTGA TTATATGCTTTTAAAAGAAAAGGTTGAGCAGAGAGGACTGCTCAGACGCG CAGCCTCATCTTCTCTCTCTATTGGTAAACGTTTGGTCAACATTGACAAG TTCCGGTCAAATTTGCGGAAGGTCCTGACAAGCTTGGAAAGGGTTAGATC TTCTGCAGAGATGATTATCCGAGTGATGGCACTGGAGAGGTCTAACACCA TTCAGTCTCTTGAATGTGTCCCTGCAAGAACAACAGGGCCAGTTTTGCAT GAAGATGCAATTTTTGGTCGAGAAAAGGAGATTGATGAGGTAGTGGGTCT GCTGGTGAATCAATTTTATGAATGTTCAGCAAACTATGAACAAAGATTTA GGACGGAGGTTCACACTATTGTTGGTGTTGGTGGCATTGGCAAGACTACA CTAGCTCAACTTATCTATAATGATGAGAAAATAGCTGATACTTTTGACCT CAGAATGTGGGTTTGTGTTTCCAATAATTTTGACAAAGTTAGACTTATCA AAGAGATTATAGCATGCACAACTGATGGTGGGAATGCTAATCTGGATAAT TTTAATTTCGGTATGCTCCAGGAAGAACTTAAAAAGAGACTTTCTCACAA AAGGTTCCTTTTGGTGTTGGATGATGTGTGGTATGATGAGAAATATGGAG AACACGTCAACAAACAAATGTGGAAGGAACTAATAGCCCCCATCAAAGAA CCAAGACCAGTAGACAGGAAGGATCCATTGAGAATAAAGGAAGGAGGTCA GATTCTAGTGACAACCCGAACAGAATTGGTGGCGAAAATGCTGGAGTCTA GAAGCTCATTCCTTTTACAGGGTCTTGGGAAAGATGATAGCTGGTTGTTG TTCAAACAGTGTGCATTTGGTAGGAAGAACCCTGAAGATTTTCCGGACTT GAAAGCAGTGGGGGAACAAATTGTTCAGAAACTTAAAGGCTCAGCTCTAG CATTAAAGGTTATTGGTGGACACTTAAATGGAAAATATAATGATGTGGAG TGGAAGCATGTTCTACACAAAAACGTATTCAATTCAGACGATATCTTGTC GATCTTGCACTTAAGCTATGAGAGTTTGCCAGAACACCTTCAACAGTGCT TTGCATATTGTAGTTTATTCCCAAAAGATTATCGCATTGATCCAAATAAA TTGATCTGGATGTGGATAGCACAGGGCTTTGTCCATCGAGAAGCAAATAC CACTAGAAGCCTGGAAGATATTGGAAGGGGCTATTTCAATGATTTGTTAG CACGGTCATTTTTCCAAGTGCTCCGCTGTGGAGATCTAACATATTACATT ATGCATGATTCATTGAATGACCTGGCGCTTCATGTGTCTCATGGGGAGTG CTTTAGAATTGACCATGGCGATGTTGGGGTGCTACCTCATTATATCAGGC ATTTGTCTGTTTGTGCTGAACAACTGGGAGATCTTGTGAACTATGATGGT CTTGGAAGACTGCGTACACTTATAATTCTGAAAAAATCTTGGTTCTGTTC CAAAGTCTCTCTGAGTCATGATATACTTAACAAGCTGAAGAGTGTGCGGG TGCTTGATGTAAGTGGCTGCTGCTTCGAAAGTTTGCCGAAATCTATCAAT GATCTGATGCACCTGCGCTATCTAGCCATCAGACGCACTTTCCACCCACT GCCTACAACAATCTCTAGACTTAACCATCTACAGGCCTTGTGTGTACACT ATCATTCATGTTATGGTTCTAGGATATCGTTTTCAAATAAGAGAAAACAG CTGAAATATTCAAGAGGGGAAGTGAACGCTACTAGAGGTCATTTCAGTCT TCCTGAAAGCATTAGCAGGCTTATTAACTTGGTGCATGTCGATGTAGAGA AGGTTTACACTCTAATGTTATTGGGCATGCACCAGCTTCCTTTTGTCGAT GGGTCAGGAGAATTCCTTGTTGACAAAGAAGAGCAAAGTTTGGTCCAACT GCAGGATCTCAACAAGATACGGGGAGAGCTTGCTATCAGATTGCTGGAGA ATGTAAAAAATAGGGAGGAGGCTGCTAAGTCTCATCTAGAATTAAAGGAG CACATATCTAAGTTGGAGCTAGAATGGGGATCATGTGATGGTGCTCATGA TATGGACAACGGCTTTGAGGTGCTTGATGTATTAAAGCCGCACCACAATC TTGATGAGCTAACTATCAGTGGGTACCCAGGTGTCAAGTCTCCTTCTTGG CTGGAGTCTGATTGGCTGAGAAGATTGAAATTGATCTGTCTACGAGATTG CAATAGATGGGAGGTCCTTCCACCTTTAGGGGATCTCCCACTACTCAAAA CTCTAGAAATACGGAGAATGGAAGAACTAAAAGCACTCGGTCAGGAGTTC TTTAGCCGTGGTGGATTTCCTTCTTTGGAGAGATTGCTACTTGAGCGCTT ACCCAAATTGGAGAGGTGTCTTGTGGACAATCATCAAGTTCTACAGAATC TCAGATATCTCGCGATTGCTGGCTGTCCACGGCTTCGAGCATATCCCACC CATCCTTATACACTCAGACATATAGCTGTCCTTGACAAGGAAAGTATCAC TCTTAAGGTTCAAATGGATAGTTTTGATCTATCAAGATCGTTTTGTTTCA TGGTATCAAGCTCCTTCCATGTCTTGCATGCTCATCACCTAGAGTTTGTA GAAGATATGGAGATCTATGTCAACCATGTGGTACAAACATCAAGGAGAAT ATTTAGCAAACTAAAATTACTCAAACAGTTGAAAATTTATGGCATCGAGC GTGCTAATACCTGCTCCGTAATTGCTACATTGTGGGATGAGAATGGGGAC ACTGTGCTCCCCTCATCACTTAGATTGCTTGACTTGCGAAAGTGCTATCT GCAACCATCTTCTTTATCCAAACTGCTGAATAATCTCTCATCTCTTGATA CACTAAGACTAGCAGATTGTGACACTGTTGAGATACCTAGTCTACCGCTA AGCCTGCACCACTTGAGGATGCTGAAACGTTTGGACATTTATAATTGTGA TTGGATATCATCCATTGAGGGATCAGAAGCATTGTTGTGCCTTGAAGAGA TGAAGATAATTCGATGTTATGACCTGGAATCTGTACCATACCTAGATGAG ATGCCTTGTCTTCTGAAACTACATTTATGCGGGTGCCCTCAAGTCATGCA ACTGTCTAAAGCAGGTCACCAGACAGCACTGAAAGAGCTGCTTGTGGGGT CTTGCGATGGACTATCATCTCTGCAAATGTTGTGTGACCTTGTTTCCCTT GTGACACTGACAGTTATTGATTGCTCTGATTTATTGTGGCTTCCTGATAT GGATGGATTTTATTCACTTCGGAATATCAGGGTTTCTCGGTGTCCTCGGC TGATGTCACTGCCACGCAGTGGTCTTCCTGTATCGATTGAAACATTTTCC CTGTCTGGATGCCATCAAGCGCTGGAGGAGCAGTTTCAGCGGAAGGAAGG TCCAGATTGGAACAAGTTTGTGGCTCTTCCAGGATGCAAGTGGCTGACCT TTGGATAGTACAACGGGAGAAGGAAAAAAAATTATGGGATTTTTAATTTC AGACCGGTTGGAGTAGTTGTCAAACCGGTGGGCTATCCGATATTGCATGC ATGCAGTAAAACTATACAGGTAGCTCTCTTCCTAATTATTGCATGCATGC AGTAAAACTAAAATTGTTGACATCATCGGCATTAAATGAAGCAATTCAAA AATTTAAAATGTTTTATACTGCATTCGTCTGATTTAGAAACAGTTTTCAC CGTTAGGCGGGTCACGATAAGACCTTCGAAAATAGATCTCATGTCTAAGG CAGGCCACCAGACAGCACTGAAAGAGCTGCTTGTGATGTCTTGTGATGGA CTATCATCTCTGCAAACGTTGTGTGACCTTGTTTCCCTTGAGACGCTGTC TGTTACTGATTGCTCTGATTTATTGTGGCTTCCTGATATGGATGGCTTTT ATTCGCTTCGGTATCTCAGGATTGCTCGGTGTCCCCAGCTGATGTCACTG CCACGCAGTGGTCTTCCTGTATCACTTGAAAAAATTTCCCTGTCTGGATG CCATCAAGCGTTGGAGGAGCAGTTTCAGCGGAAGGAAGGTCCAGATTGGA ACAAGTTTGCGGCTCTTCCAGGATGCAAGTGGATGACCTTTGGATAGTGC TTTTTTTTATAAACAAATATAGAGAACATTGGATACTATATAATCTTAGA TAGAGTCACCTATCATTTGTCATGTTTTACCTCAGCAGTGCAAGTGCATG TAAACTTGTGGTTGTCATGGATGTTGGACATAAACTTCTCTTTATATGAA CTTGCTATGATAAACCTAGCTGTTCAAGCTGGGAGCTAAGTGAAATCATG CAAACCATTTTGGTTTGACCGACCTATC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.