Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA017492

[Submit comment/correction]

Sequence	AA017492
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA017492
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGACCCACTAAAGGAGCTTCACAATATCTCGGGTGCACGGAGGAATCCAT CCTACTTCCCGCAAATCATCCATTCCGTTTCCAACAAGCCCTCCCATATA AATAATGCGCTCCCTCCCTTTCTGGCCCAAATAGAATACCGCCGCTCACC CGACCAAACGATTCAAAACCCCATTCCGCACCGTAAATCTGCATCGCGTC TTAGAAACCCTAACCCTAGTCCCCGCCCCAGCTCCGATGGCGAAGCCGGT GAAGTACGACGACGAAGAGGAGGTCTCTTCCTCCGGCGAGGAGCAAGAGG ACCAGTCCGACGGCAGTGGCTCCGAATCTGTCGAGGAGGGGGGAGAGGAG GACGAGGCCCCGGCCGGCGAGGCGGATGGGGATGGGGAGGAAGGGGTGGA TGAGGAAGAGATCGAGGCCGTCACAACCGGCGACGGCAGTGACGAAGAGG ATGACGGCGGTGCTGCGGCGGGCGGGGAAGAAGATGAGGAGTTGCAGTCC ACCGAGGACGACGAAGCCGCTCTGGTGGAGGACGGCGACGAGGTGAGCGA GGGGCTAGGGTTTGGGTTCTCGATTTAGAGGGTACCCATGATTAAATTTT TGAGTGGGGCTGGTTTTGGCTTGTTTCCTAACTAAGAGATTGCAGTTTTT TTACAATTTGCAGAGTCCAGTGTGATCTGTAAATTTTAGCTAGGTATACC TTAGTTTTGTTGATAGTTATCTGCATCCGGCTTCACTGATTTAGAGACGC TCCCTGCTAAGTAATAACAATACAATATACTGCCACTTCAATAATGTAAG ACTTTTTAGATAGGCTAATTACCCTATAGCCTATCTAAAACGTCTTATAT TCTGAAACGGAGGTAGTTTGTAGAAATTGCTATGTTACTGATGAATACCG TAGATGTGGACTTAAAAGAAGCAATGCCTTACAACACATTAATGGCTGTC TGGATGCTTGCAGTCTTTGTATTCTTGTGCAAATTAAGAAGCATGACAAG GTGGTTTCATTTTTATGTGTGAGCTGTATCAGTTTATTTATTTGGTAATA TTTGCATTATTTGCGGCTAAACCGTTTCAACTGTAGGCTGAAGACCCTGC TGGAAATCCAGTGGTAGGGAAGCGTGAGCGAGCCAGGCTCAGAGAACTCC AGAAATTAAAGAAACAGAAAATCCAAGAGATATTAGATAGCCAGAATGCT GCCATTGATGCTGACATGGTATGTTTCTCCTTTTGTGCAATCTCCTGAAT ACAAATGCCCATGTGCAATTTATTTACCATTATGTGTGCATTTAATACAT TATGTGATTTCTCTTACATTCATTATTTGGTGTATATTGCATCATTGTCA TGGTTTTGATCACAGAACACTAAAGGAAAAGGGCGATTGAAGTACCTGCT GCAGCAGACAGAAATATTTGCCCACTTTGCAAAAGGCAGCCAATCTAAAG AGAAGAAGTTACGTGGAAGGTAATTCATTGTTACGTTAGTGCCACTATAA TACTTTACTATGACCAGTAGAAACTGCAGCTACCTGTTCGCTGATCTAAT TTGAAGCATCAATAAAAATTGTAAAAAACTGCTCTTACGTGGGCTTTTCA CTGCATACAAAGAGTAGTGTTAAGAGAGCAGTATCACCATGGATTAAATG TCGCTCGACAAGTCGCGACTTGTTGCACGACAAGTCTATGTGTCGCAAAT CGACTTACGACACGTTGAAGCGACACGACAACTTGAACTTATCGATCGAC AAGTTGACTTGTCGGCGACAAACCACGACTTGTCTCTGTCAACTAGTCGA GCGACAAGTTGAGACCAGGAATTTTTTTTGAGGATGGGATATAATGTTGC CCGTGAAACCCTATGCCCCCAGAAATAGGTTGTGAGCTCCCTCCCCCATC CGTCTCTCCTCTGGTTCCCCTCCCCTGGCGATTTCTCTCATATGGCCGCC GCCGGCTCGCCAGTGCCGCCGCCGCCTCTCCCCTGCTCTCCCACTCCCTA CCTGGGTCGTGAGCACCTCCCAAGGCTACACCACCACCAGTCCATCGTCG GCAGCAGCGGAAGCAGGTAACTTTTCTCCCTATTGAGGGCTGAAATCTGA TGGAAGGAGACCTAGAAATCTGATGGAAGGGGCCCTAGAAATCTGATTGT CAATGATCCAGAATTGAGGGTTGAACTGGAAGAAGAAATGAATGACAGTG ACATGGAGAGCGATGATGATGGCAATGATGACAAAGGATACAGATCAAGA CTTTGGAGTAGACTAGTTACTTAGTATTTTTTTTTAGTAGCTACAGCTTG ACACCCCATCGACAAGTCTAGTAGTTGTCAAGACTTGTCACGACAAGTCA ATGTGTCGCCACCCCAGCGACAAGCTGCGACACGTCGACACTTAATTCTT GAGTATCACCCCTAATAATACCCATGTGAGTTGATGACCATCGTCATGCA TAATTATCTGACACTGAAACGTATTGGTTGGTCATGCTTTCAACTTTAAG TAGTTGTAACTTGATTCATCATGATAATGAATGATGAATATACAGAACAA TTATGTAAGATAGAGCAATTTGACTGGATAAGTATGCTGATGCATCTGGT TGGCCTTTTTTGTCTGGTTAATACTTAATAGCGTGAAACTTCCAGGGGTG TGCTATTTTTCTTTTCCGTCCATTTACTTTTCTTTGCAGTCATTTAATAT AATTTCTAGCTTTGTGGTTGACTTAACTGCAAGTACATCAGTTAATTGAA GCAGCTTATTTTATTTTGCTGTAAATTAGCAGTAGCTTTTAGCCTAATAT TGTGAGCAACTCCTGCTATTCTGTGTGCCCTGAGTTTACTCCATTTACTT CTAGATTCCTCTCTCTTTGTTCTGTTTGTTGCTAAGGTGGTTCACACTGC AGGGGTCGTCATGAGTCAAAGATGACGGAAGAGGAGGAAGATGAAGAGTA CCTCAAAGAGGAGGAAGATGCACTTGCTGGTTCAGGCGGAACACGTTTGC TTACGCAGCCATCATGTGAGCCTTTCCTTGTTGATCATTGGTACCTGTTT TATGAGACACTTTCCTTGATCTTGATAACCTAAAAAAAACTACTTTCTGT TGGCTACACGGATTTCCTTCCGTAAAATGACAAGATGGAATATGACATAA ATTTATACACATAACTGAATAGTTTACTATGGTAATGGACCAACCATATC ATGTACTCCCTCTGTCTGGAAATAAGTGGTGAATGTAGACAAATCCAAGT CACTTATTTCAAGACGGAGGGAGTAGTTGTTCATCAGTGACATTTTTTTC CTAACCAAGCAAACATATATACGATGACTTACATAAATTGGAAATCAGTA GTGCAGCTATTTGAGCAAATTTCATGGGAATTTTTTCACATTTGCCACAC TTTTTATCTGAAATTTGCATATTTGCCACATGACCACCACATGTCAGTGA CACAGAAAATGGCAAATATGCAAAGTGAAAAGAAAAGTGTGGCAAATGTG CAAATCCCCCCAATTTCATGGAACCCCTTGTACCTTAGACCAAACCAAAC AAAGTTAAACTTCCAAGTAACCTTTCTGTAGCATGCCAAATCGCCAACTA GAACTTTAAAGCTTGTGGATGACGTGGCAAAGTTGTGGGATAGCATAGCC CCTTTAGATCCCCTTGGGGCCATGCTTCCAGGACAAGACTTTATTTGACT TGTGGCAAGCTATGCCTTCACCATAACAGGCTGGTTTGGTTAGTGACTTT ACCATAATTTTGTTTAAAGTGTGTAAGTGAATGCATGCCATGATTTGAAA AAAGAGAATATCTTACTATTTTATTTTCTGATAGGTTGATCAAATTATCT GTAGTTCTAGATCTGAGTTCCATTACGCTTAATCTTTATTCTATGCTGAT TTCCAACTAAATGTGAACTGTTTATGCTTCTGTTTTATTTATGGAAACAT ATGTTGCTCTTTTCCATTTACCCAAGAATAGAATAGACTAAATCTTGGCT GGTTACTATAAAAATCAGCTAATGAAACAGTAGTCCTTTTTAATAGAATT ACATCTTTGATTATCGTCTAGCATATGTCAACTTTCAGACTGCTGTGTTC TTATTATGTTTGCTTTGCAGGCATAAATGGGAAAATGCGAGATTACCAAC TAGCTGGGCTTAATTGGCTCATAAGACTGTATGAGAATGGTATTAACGGG ATATTGGCAGATGAGATGGTATGTTTGATGTGGTAACCACACAATAAGCA CTTACAACAACCCTTTAGTATTTTATTCCATCAGTAAGGTGGTAATGTTC AATGCAAGTTACCAACTTTATCCTTGGCTCCGCATTTCTTTACTCAGGGT CTAGGGAAAACTCTTCAAACTATTTCACTGATGGGTTATCTGCACGAATT CAGAGGAATAACTGGTCCTCACATGGTTGTTGCGCCAAAGTCCACTCTTG GTAACTGGATGAAGGAAATAGCTCGTTTTTGTCCCATTTTGCGTGCTGTG AAATTCTTGGGCAATCCAGAAGAGAGGGTTAGTCTTGCATCCCTGTTTCT GAATCATTATTATTTCTTCAGCTGGCATGTTACTTACAGTACTGTTTGGT CAGAATCATATAAGGGAGAAACTACTACAGCCAGGAAAATTTGATGTATG TGTAACCAGTTTTGAAATGGCAATCAAAGAAAAAACCGCATTGAGGCGTT TCAGCTGGCGCTACATTATTATAGATGAAGCTCATCGGATAAAAAATGAG AACTCTCTTCTGTCGAAGACCATGAGGCTTTTTAGCACCAACTATCGTCT ACTCATCACGGGCACTCCACTCCAGGTAGGTTATGTTGGGCATTGCTGTT TCCTTGTATTATATATACAGCACCTGTTAAAATCGCTCAACACGTTGATT TATATTATATTCCTTATCTTATTTTCAGTTTCATCACTTACTAAAGTTTT ATATTGCAGAACAATCTCCATGAGCTTTGGTCTCTACTCAATTTCTTGCT GCCTGAGATATTTAGTTCTGCAGAGACCTTTGATGAGTGGTTCCAAATTT CTGGTGAAAATGATCAACAGGAGGTTGTCCAGCAGCTTCATAAGGTATGG ATAACACTTGCAAAATGAGTGTAAGTATGTTTGAATTAACATATACTCCC TCCATTTCAAAATATAAGATGTTTAAGCCTTTTTCTAGAACGCATGCATC TAGACGCCTTGGAGTGTGTAGGTTCGGAGCAAAATGAGTGAACCTACATA CCAAAAGGCGTCTAAATACATGCGTTTCAGAAAAATGCTAAAACATCTTA TATTTTGGAATCAGAGGGAGTAATTGTGTTTGCAATTTTTTAAGGTTCTT CGACCATTTCTTCTTCGGAGGCTTAAATCTGATGTCGAAAAGGGTTTACC TCCAAAGAAAGAAACTATCCTTAAAGTTGGGATGTCTCAGATGCAAAAGC AGTACTATCGAGCTCTGCTTCAGAAAGATTTGGAAGTTATTAATGCTGGT GGTGAACGCAAAAGATTGCTTAACATAGCTATGCAGTTACGCAAGTGCTG CAACCATCCATATTTATTCCAAGGGGCAGAACCGGGTCCACCTTACACAA CTGGTGATCATCTTGTTGAGAATGCTGGTATGCTCCTCATTCTGGCCATT TTGTTGTCGCAATTTTATAAGTCTTCTTGGTTGCTTATTAACTATTTTGA TATTTACTGTAGGAAAAATGGTTCTGTTAGATAAATTGCTGCCCAAATTG AAGGATCGTGACTCCAGAGTGCTTATTTTCTCACAGGTGGTTATTTATCT TTTACTACCTATGTTTTGGTAGTTCAACTGGGAACGCACAGCTTTTAAAT GGCAGCCTAGCCATAGCATATTATGAAGTTTCATGGGCATACATGGGTTA CTGAACATGTGCACCTTGTTACAGTTCATTAATTTCCCGCAAAATACATT GCTTTGTTTGACATATCACTATCCTGCAGATGACCAGGCTTCTGGATATC TTGGAAGATTATCTTATGTACAGAGGGTATCAATATTGCCGAATAGATGG AAATACAGGTGGAGAAGATCGCGATGCATCTATTGACGCATTTAACAAGC CAGGAAGCGAGAAGTTTGTTTTCTTGCTATCAACCAGGGCTGGTGGCCTT GGTATCAACCTTGCCACTGCTGATGTTGTGGTTCTTTATGATAGTGATTG GTATGCTGTTTTCTTAGAATGCAAATTGTAAACTTAGAAGTTGAATCTTA TGTCTTTTATGTTGCAATGTATCTGCAGGAATCCACAAGCTGATCTTCAA GCTCAAGACCGTGCACATAGGATAGGTCAAAAGAAAGAAGTTCAAGTTTT CCGATTTTGCACGGAGGTTTGTTAATTTGAAGTTAAGAATATCAAAATAC TGCTTTTGGTAGGTCTGTCTTTCTAAAGTGAAACTAAATTGCAGTACACC ATCGAGGAAAAAGTAATTGAGAGAGCGTACAAGAAGCTTGCATTGGATGC TTTGGTCATTCAACAAGGGCGATTGTCAGAGCAGAAATGTTGTTTTTTTT TTCCTGTTTGTTATTGATATATTTTGAATTATTTTCTGCTGTAGTAGAAT GTGGAATTGTCTGACCTTATCGTTTCTATGCAGCTGTCAATAAGGATGAT TTGTTGCAGATGGTGAGGTTTGGTGCGGAAATGGTGTTCAGTTCCAAGGA TAGCACAATAACAGATGAGGATATTGACAGAATTATAGCTAAAGGAGAAG AGACAACAGCAGAGCTTGATGCAAAAATGAAAAAATTCACAGAGGACGCC ATTAAGTTTAAAATGGATGACAGTACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCATTTTCTCCTCCACAGCTGCTG AATTGTATGATTTTGATGATGATAAGGTAATGATCTGTCCACTTGGTCAT GTGCTTGAAATTTTGTTTAGTGTATTATCCAGTACGTACTAACTCTTTGT CTACTATTACTTAAGGAGGAAAACAAGGCTGATTTCAAGAAAATTGTTGG TGACAATTGGATTGAGCCACCCAGGAGAGAGAGGAAGAGGAAGTATGTGA CTTCTTTTTGGGTGTGCTACATTTTTTTCATTGTTATCTGTAATTTACCT TTGACTTGTTCTTGTAGTTACTCTGAGTCTGAATACTTTAAGCAAGCACT TCGCCAAGGAGCACCAGCAAAACCTAGGGAACCACGGATTCCAAGAATGC CCCATTTGTACGTCCTTTTAGTGTTACTGTCCACTTTTTTCTCTAATAAA TTTGATGCTGCTTGTTCCTTGGTATTCCCTGCTAACTGTTTGTGTTAATG TTTTAGGCATGATTTCCAGTTCTTTAACAATCAAAGGCTAAATGAACTGT ATGAAAAGGAAGTCCGATACCTCATGGTAATTTCTCAGCTAGATGTTGAG GAACATCTTAAGCATGCTTTAGTCTTTTATGCTTCATTTGACAATCTCTT TACACTTCACTATTGCCCCACTACAGTCCCTTGTTTTTCAGTTGTCATTG ATAATTGGTGCCTAACTTAATATTTACAATGTAGCAAGCCAACCAAAAGA AAGATACCATTGATGGCGAAGATGAAGGTACTGCTAACTCTTGCTTCTCT AAGTTGTATTACAGCATCTAGTAAGATTGTGCTGACGACACATTCTTCTG CAACACTCAGGTCAGTTGGACCCTTTGACTGAGGAGGAGCAGGAGGAGAA GGAGCGGTTATTGGAAGAGGTTGGATGATAATGCGATCATCTCTAATCTT TCTCTTAACATTCTTGTTTACTATGATGCAAATTTCAGGGTTTTGCAACA TGGTCAAGGAGAGACTTCAACACTTTTATTCGTTCATGTGAGAAATATGG TCGCAATGACATAAAGAGTATATCCTCTGAAATGGAAGGAAAGACAGAAG AAGAGGTTCAGCGATATGCTAAAGTTTTCAAGGAGAGATACAATGAACTG AGTGGTAAGTCACTGAGTCAATTTATTAGACATGATTGACATAGGGTTAT ACTGTACTACATAAATTCTCATCATGCAACTTGTCTCAGCTAGCAACTGA CTGCTTGTTGGGTGAATGATGAATTGCAAATAAATGTCTGTCTTGACTAA TTTGTGGCTTGTCCTTTCTAATCAGATTATGATAGAATTATTAAAAACAT TGAAAGGGGTGAGGGAAGGATAAGCCGCAAGGATGAGATTATGAGAGCCA TTGGAAAGAAGTTGGACCGCTACAAGAACCCATGGTTAGAGTTGAAAATC CAATATGGACAAAATAAAGGGAAGTTCTACAATGAGGAATGTGACCGTTT TATGGTATGCCCTCTCCCTTTTGATGCACACTGCTTCACGTTTGTGATAT GGTTAACAACCAGTTGTTATATTTCAGCTCTGCATGGTGCACAAACTTGG TTATGGTAATTGGGATGAACTTAAAGCTGCCTTCCGCATGTCACCCTTGT TCCGATTTGATTGGTTTGTGAAGTCCAGAACTACGCAAGAGTTGGCTAGG CGATGTGACACCCTTATCCGTCTAGTTGAGAAAGAGAATCAGGAATATGA CGAGCAAGAAAGGCAGGCACGGAAAGACAAAAGGCTTACTAAGGTACTTC TTGAACATTACTCAAAGTCTGTCTTTACATTTTCCAAGTATTAGAATCAG CATTATATATAACCTTATGTTAATTTTGTTTTTTATTACGATGCTTGAAC TAATGGTTTATGCTTATACTAACTGTGGTGACTTTACCTTGCTGACCTGG TCTTGTATATATCTTTTGCCACTCAGAACATGACTCCGACTAAGCGAGCT GCATTAAGGGTTTCAGACGGTGAGACAACTCCGGTGACTTCATCCAAGAG GCGACGTCAGTCCCTTATAGAAGATTATGTGGGCTCGGTATGTCAAGTAT TCCCCCACTCTGCTATTGCTCCCCCACCCCACTACTCACACACAGGGAGC TGAAAACCTGTTAAAGAGATGTATTCTTCTGCTAACTAGTTCTTAACAAT GTTGCAGGGAAGGCCTAAGCGTGGGTGATCTGACGCCTGCCTTCAGGAGA TTTAGAGAGGTCTAAATGTTTCTGATGCTGCTTCTAATGCGCCAAGCTTC AAGCTTGATATATGCTCAATTAATTGTAGTACTAGGTTAAGTTACAACTT ATCTAAGTTGTATGTAATGTCTCCTGGTGCCATGTGGTCACCTGCACTGC CTTTGGATCAGTTTGAATGTTGCCCTGTCCTTTTGGTACAGAAGTCTTTG TACTAATTATTATCAGTTCCTTAGGTCCAGCGTTTGAGATTCCGAGTGGC ATCACCTTGATGTTCTTATACTTTCTATAGTATCTACTCCCTCCGTTTCA AAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGAAAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.