Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA045890

[Submit comment/correction]

Sequence	AA045890
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA045890
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAGCTCCAGATCTGCAGCCAAACCCGACCGACGCGCCCGAACAAACAA ACGCGCACCGCACCACACTGGTGGGTGGTCCCGTCACTTGAAAAGCAGCG GTGCAACTGAACGTCCGCAACGACTCCCGTGTCCAAATCCCGTTCCCGTT CCTATACTCGCCTCCTGGATTCCAATTTCCACGAGTCCGCCTCCAATTTC CTCGCAACAGCAGCTCGGCTCCCCAGCCCCCCGAGATCTCCCCGACCAGC CTCGAGATCCCTGTGCCATGTCGTCCGCAGCCATGGACACCATGGACGAG CTCGTCCAGCTCTCCGAGTCCATGCGCCAGGCCGCCTCCCTCCTCGCCGA CGACGACCCCTCCGACGAGTCCACCCCGCGCCGCCCCTCCACCTTCCTCA ACGCCGTCGCGCTCGGCAACGTCGTAAGTCCCTTCGCCCCGAGCTCCAAA CCCTCGCCCGCCCCGCCCGCCCGCGCCTGATCTGACTCGATCCTGTTTGT TCCGTGCAGGGGTCCGGCAAGTCGGCCGTGCTCAACAGCCTCATCGGCCA CCCCGTGCTGGTGAGTTCCTCTTGTTTAGCCCGCTGTCTTCTGCTGCTTC AGCATTCGTTTGTGTGAGCCGCGGTTGGTGTGGTGCAGCCGACGGGGGAG AACGGCGCGACGCGGGCGCCGATAGTCGTCGACCTGCAGAGGGATCCGGG GCTCAGCACCAAGTCCATCGTCATACAGATCGACAGCAAGTCGCAGCAGG TTTCCGCGAGTGAGTGAGATCTTCCCTTAGCCTAGTCAGATCTGACAATG GGCGCGGTTGGTCGGTGTGCTGAGTTTGGTAACTCATTTCCGGTTGTGCT GGCGTGCAGGTGCGCTCCGGCATTCGCTGCAGGATAGGCTTGGCAAGGCC AAGGGACCCGGGAGAAGCCGCACTGATGAGATTTACCTCAAGCTGCGGAC AAGTACAGGTTTGTTGCTGGACTGCACATTTTCACCCTGGTAGTTTCGGC AATGTTTGAGCAAGTTACTAAACTGTTTCCCTAGTTAGTTGTTGCACATT GACAGCTTGGATTTTTGTGCTGCGTAAAGCTGAAATGGTAAGATTGTGAA ACGTGTATCAAGAGCGTGTTCTAGTATGGTGATTACAAATTTCCCAAATG CGCGTGCCCTTGATTTTCCAACGACGCAGTTAAACTCATTTGGAAATACC AGCTCAGTACCTGATAGCTTTACTACATGCTGTACATTAGTTCCTTCTTT TTCCCTTTGCAAATGATTTCTCACTACATCTCTCTTTGTTTTTCCAGCTC CTCCACTAAAATTGATTGATTTACCTGGGATAGACCAGCGGGTTATTGAT GATTCAACAGTGAGTACTGCTCTGTGCTCACTCAGTATTCTTACCTTTAC TCCTATAGTACTAAACAATTCCTGTTCAGAATATTCATGGTCATCATGAT TAAGATATGACTGTGCATTATTTTAACCAATATGAACTGGAATAATATCT AACGCGTAGGAATGCGGCAAAAAGCAGACAAGTAACGCCATGTCATGCAC TTGAACTGAGAATCACTTACCGCGTGGCATAGCTATACTACTACATTCCC CCACCCTACCCCCACTCTACACGGAAGAGAAACACCAAAACTTAATCTTA TGTATCACCAAAACTTAATCTTATGTATCATGTTTTCCATCACCTCATGT TATATAACATACTGTTCAAATTTCAGATTAATGAGTTTGCTGGGCACAAT GATGCTATATTGATTGTTGTGATACCAGCAATCCAAGCCGCTGAGGTTGC ATCATCTCGAGCCCTACGACTAGCGAGGGATATTGATCCAGATGGTCTGT CATTTGAATCTGATCATACATCCTCTGCAACAGCATATTCACTCTCTTTT TAGAAACTGATGTTTCTTCTTGTCCTTGTTGTAGGAACCCGAACAATAGG AGTCTTGAGTAAAATTGATCAAGCTGCAGCAGATGCAAAAACAGTTGCAT GTGTTCAGGCCATTTTGTCTAATAAGGGTCCACGTGCAGCTGCCGAAATT GAATGGGTTGCTTTAATAGGGCAATCTGTTGCAATTGCTTCAGCTCAATC AGGGTCAGTTGGGTCCGAGAATTCACTGGAAACAGCTTGGCGAGCTGAGG CGGAAAGCCTTAAATCCATCTTAACCAGTGCTCCTCAAAACAAGCTTGGC AGAATTGCTCTTGTAGATACCATTGCTAAGCAGATACGTAAACGGATGAA AGTGCGGCTACCTACCTTGCTATCTGGGTAAGCATTGTGAACTATATGTT GAGGCATCTACTTGTCTAGAAAATATTAAAGTTATACCATCTTTCATACT CCCTACCAAAATTTGCTATGACTACTGAACTATTCTGTTAATCATCAATT CAGTTGATCATAAGTGCGCCCTGAACATGGATATTTCTTGTCTCATGTCC TTCTTTCATGCAAAAATAAGCTGATTCTGATTTCTGGTGTTTGATTTTGC AAATATCTGCACCATTGCTCTATTTCTCAGGCTTCAGGGCAAGTCTCAGG CAGTGAAAGATGAACTTTCAAAGCTGGGAGAGCAGATGGTACAAAGTGCA GAAGGAACCAGGGCTGTTGCTTTGGAGCTGTGCCGAGAGTTTGAAGATAA GTTTCTTGCTCATGTTACCTCTGGTGAGGTTAGTGATAAGCTTGAGTTAT GGTTTTTGTCTATACCTAATTTAATACTTGCCAAATGAACTGATTACAAT ATCATTGTACTGTTCTCTATCAAAAGGGGTCTGGTTGGAAAATTGTTGCA AGTTTTGAGGGCAAGTTTCCAGATAGGATCAAACAGCTTCCATTGGACAG ACATTTTGACCTGAACAATGTCAAAAGGGTAAATTTTAAAAGCTCTTCAA AATATACTAGAGTGGACTATTGTTTTGGCCTACGATGAAACATCATTCTC TCCATATGTTCTAGATTGTCTTAGAAGCTGATGGTTATCAGCCATATTTG ATATCTCCGGAGAAAGGTTTAAAATCTTTGATTAAAGGAGTACTTGAAAT GGCAAAGGAGCCGTCGCGGCTATGTGTTGAAGAGGTATGTCTTGACTTAT GCCTTTGGATGAACAACAATAAGAACAATGTAATTCTTCTGATGAGTTAC TTGTAGAATGCTTATATTTATTATTATGCTGTATCTGTAAAATACTGCTT GGGCGAATATGCAACTAGCGGTGTAGCTTATCAATCATTATGTTTGTTAA TAAACTAGGTATTAGAACTATCAAAAAGGCTTGGGCTCAGACAAACTATC TGTCATTACCTAGGCCTATAATTCGGCTCGAGCTTGGCTCAAGTATGTAC ACATGTGCTATACATATTCAAGCCTTATCAAGCTGAGCTCAAGCATATAG TATATATTCATATATGTGTGTCTAGAGTTACATTGTTGAGGCTAGCTCCA AGCTTGAATTCGAATGTAGGCTCACTCGAGCTCAATCTAGTAGATCTATT CTGCGTTGGTAGATATTGTCTATGTAGCTTCTGATCTATCAGTTTTTTTA CTAGGTACATCGTGTACTGTTAGACATCGTGAATGCTACTGCAAATGGCA CGCCAGGGCTTGGAAGATATCCTCCATTCAAACGCGAGGTGCCACTTTGT TCTATAGCAACATACTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGG TTTGTGAAGAAAATGAATCTAGACTTCTTTTAGTGTGTAGATTCATCCCA AAGTTGAGTGAACATACATACTAAAACAAGTCTAGATTCATTTTCTTCAC AAACCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTACCTTTTAATGTT CGCATATACGATTCTTGTTCACTTAATTTCTGAGCACAACATTCCACCAT TTCTTTTTTGCAAGATCATTGAAATTGCAACCAATGCACTGGATACATTC AAAAATGACGCGAAAAAGATGGTGGTTGCGCTTGTTGATATGGAGCGTGC GTTTGTCCCCCCGCAACATTTCATCCGTTTAGTACAAAGAAGGTAATGTT AGATGGGGCCTTACTGAATGTCTTGACAGTTGGTTTCATTTTATTTGATC AGCTTTGGTGTAACTTTGGCAGGTAATCTGCTACTTTTTTTTCTGTACTT GGTAACTTTATTAGTTTTCACTAGATAATAAGCTAATGTTGAACCGTATT AGTGACACAATAGAATAACATCATCAACCTAAATTAGACTGCTGAAGCTT TTTCCTTACTAATGAAGTATACCCACTTCTTTTTTTACTTTAAGAAAATT AATCGTAACGATTTGTCACACCATGGGCAATCTACAAGTTAAATTGCCCT TTCTGAGTTTTCATGATCATATTCAAGTATTCCCATTTTCTTCTTTTGAC TTGGCATGGTATTCTCAGAATGGAAAGGCAGCGTCGTGAGGACGAGGTGA AAACTAAATCATCTAAGAAAGCACAAGATGCTGAGAAATCCATGATGAAC AAGGTATGATTTATGCATCTTTGCTTGCACGAATCTGCTACAAAACTTTA CGTAGATTGACCACCATATACTTGTTTTGGTCTGGCTATTCATATATTAG TTGCATTTCATATTAGGATTCAAGCGCACAAACAGGATCTGACCAATCTG GTGGTAGTCTGAAATCGTCGAAAGACAAATCCAATCAGCAAGATAAAGAT ACAAAAGAGGGACCTAATCTGCAGGTTGCTGGTCCTGGCGGCGAAATAAC TGCAGGTATAATACTGTGCCTTAGGTTGACTCAACTTCATCTTTTCTCAG AGCAATTTGGTACTAGCACTTTTGTTTCTCGCTCTGATTATATAACAGAA AATCCTGCAGATTTATTTGATGTAGCTACCATGCCATTTTTACCCAGTAA AATGTAATGTGGGTTTCGCAAGAATTAGCCGCTTGTTAACTCTTATGCTG ACTACCATAATCTTCATTTTGTATTATACAGTCCATGCATACAGATGTAA TAAGTAGCTGGACATGGTTTTGATGTAAATTTTTGGTTTGATTTATTGAT AGACAAGTATATGTTTTCTTCTCTCTTTAGGTTACCTATTGAAAAAGAGT GCAAAAAACAATGAATGGAGCAGAAGGTGGTTTGTCCTAAATGAGAAGAG TGGAAAGGTTAATCAATCTGAATCCAATCTTCCAATAGTATCCTTGACAT TTGTTGCTGTTCTTTTAACATTTGAGGGGGTATGTGTCATTTACCGTAAC CTTTCTCTGTCCAGCTCGGATACACCAAGAAACAAGAGGAGAGGCATTTT CGAGGTGTCATTGTCTTAGAGGTGTGCTTTTTCTATATTTTACTCTGTTT GTTTTATTCTACTTGATGATGAGTAATCTATGACGCACTACTTCACATTC ATGGTTATAAACAGTAAAATGATTTTTCAAATCATCGTGGATGATTCCAA TTTGTTTTGAACTTATCTTAAATAAAAAGATATTTGAACTCATAAACATC ATGCATGGAACTATGGCTGTCATATAAACTATTCTAGTAACAGTCTGTTG CGTGATTCAGGAATGTAACATGGAAGAGATAGAGGAGGAAGAGATTTCTA AGAATTCTAAGGATTCAAAGAAGGCGAATGGGCCAGAGAAAGGCCCAAGT CTTGTATTTAAGATCACTAACAGGGTTGCCTACAAAACTGTGCTGAAAGG TTGGTGCCTCTAAACCAACAATCCCGAGGTTTACTCTGGTTCTATCGCTA TTAATGCTTATTCCATGTTGCAGCTCATAGTGCCGTTATATTGAAGGCTG AGAGCATGGCTGATAAGATTGAGTGGATGAAGAAGATAAGAGGTATAATT CAGAGCAAAGGTGGGTCTGTCAAGGGTTCAAATACTCCCGAGGGTGGTTC CATAAGACAAAGCCATTCAGATGGATCCCTTGTAAGCTCCATGCTATGCC TGACTTGTGTCCTTATAGATTTATTCGCTGTGAAGCTTTTAGAACTTCTG TTTAGAGTTCGTTGCCTCAGCCTATTTCTATGAAAAATGTCTGTTTTGTG CTCATGCTGCTTACGAGTAAGCATGTTTATCATTTGAATGTGTGATGTAT CAAACAGAATTTCACTTCTTTTTGTTGCTTTGTTCTACTATTCTACTGAC ACGATATCATGCCTTTTCTCTGAAGGATACAATGGCCCGGAGGCCTGCTG ATCCCGAAGAAGAACTCCGATGGATGTCTCAAGAAGTTCGTGGTTATGTT GAGGCTGTTTTGAACAGTTTGGCAGCGAATGTTCCAAAGGTATATTTGTA GCCTCAGTCAATTATTTTAGCACTCTCATATGGGGTGTTCATTATCTTAT GTATGATCAATTGATCAGGCTATTGTACTTTGCCAAGTGGAGAAAGCAAA GGAAGATATGCTAAACCAGCTGTACAGCTCAATAAGGTTGGATGAATATT CTCTGTTTGTTCTGAAATACATCCTTATTCTGTGTCCAGTTGTCCATTTC ATTAGTTTCCTGTTTCTTTTACCCAATTCACTGAAAAGTGGACAACCTGG GTGGAAAAACTGCAATTAACGGAATGTTTTGTGTAATCCTACCTAAACCC TAGTTTTACTTGCAGTTATGGCCTTATGGGTCCTCGTCAACGGGTAGGTC CATTTGGAATAGCTTCATTATTTTAGTTTCCTTCTGCTTGGGTTATATTT GATGGATGTGTACTGGGAAAATGCCACGACTAAAAAGTTCCATACTGTTT ACAAACTGATATCCACGACCTTTCACAGTTGCACAGCTACACCTAATATG CACACACTCAAGTACATGCAGCATAGCAACTTTTTGTTAGTTCATCATTT TTGTGACTTGATAGTCTGCCCTTTTTACTTAAATGTTGCTTACATTTCCT TTGAAGTAAGCTTAATCATGTGATTCATACTTTGCTCTGCTTGTAGGTGA ATAGCTGCTAACTTCTTTCCTACAAAACTTTTCAGATGACATTGTGATTT TTCTTATTTTCTTTTTCTTTGACTAATTACATTCTGGTTTGTGACATATA CGAACTAGAAACAAGTGATGGCCCTGGGCTAGGCCCTTCTGTACATTCCC TCGCCCCCCACATCTTGTATATATTTTCTCTTTAATAAAATAAGTGATGG CCATGATACCCCTCCCACCTACCTACCCAAAATACTATCATGCACCTCAA ACATTATTCATTTCTCACCGCAAACTTGTAGAAAAGTTGAAAGTAGGTTC ATGGTCGCGCTATTTAAGTACATATAAGATGTTTTGGTAGGCTATTTATG TTTTGACAGGCTAAAATAGCCTACCAAAACATCTTATATTTTGAAACAGA GGTAATATCTTTTTAGAATGTGTTGCAGTGTTGTTAACTTCCTCACAATT TTCACTTTTAGTTCACAAAGTAATGCAAAGATTGAAGAACTTCTCCAAGA GGACCACAATGCTAAACGTAGACGGGAAAAGGCTCAAAAACAATCATCCC TTCTGTCAACACTTACTCGTCAGCTCAGCATCCATGATAACAGAGCTGCA GTTGCATCATATTCCGATGATACTTCTGGCCCAGGTAAGCTGACTTTCAA ATATCTGCTTCATGCTACAAATTTACTAGTTTTAGCTGCTTGTGAGTTTT CTTCAGTTCTTAGCTAGTTTTGTTTGTGTTACTAAATAGAGTGTAACCTA GTACCAAGCACAAACACGAGAGCACCCAAACCCACACGCAGAGTAATTTG ATGGTTAATTGCTGTTCCAGTTGCTCATTAGCATACATAGCCAATGGACA TGTTACTATGATGGCCATGCCTAATATGTTGGGTCTAAATCAGTATTCTG ATGGTTGTGTACTCGTGTGGCTTTGTCCATATTTTCACTTCTACATGGAC AAACACACCGGAAGTCCCATGCTTAATGATCCAGTTGCAGAGTGTGTGCA GCTACACCGTCAAGCTGGGTCATACCGGTTTGGCCTGAAAAGACCAATAT GACCGAAACATCAGTTGAAGTGTCGCAGCCAACCGAAACCGCAATATCGT CCGATGTGAACGACATTTAGTACCTACTAATGACTATAGAAGTCGAGCCT TAAAATTTCTCTCTGAGTAATTCATCCGTATTGGTTACTTGTATCAAGCA AATTATCTATATAATATTCTTAATTTGTTTGTAGTTTATGGCATTTTGCT GATTAGCTGATGGTTGTCCATTTCACTGTCACCTGGACAAACACTATTTG AAGGCTACTTACAATGCTTGATAATTCTAAACCTTTTGTGGTACTAACTT TGCAGGAATGAGTATGTCCTTAGTGTCTGTGTACATCTTTCACTTGTTTT GCAAAGCCAGTGTTGTCAGCTCAAAACTTCAGACCTGTTCTATTTGCAAA CAAATTTGGAGTGCTACAGCATAACAGACTTCACACTAGATTTGTTATAT GGAGGTTGGGCTGGGTCAGAGATGACATGGCATACATCTTTGCCCAAAAC TTTGGAAGGGCAATGTGCTTGCGTTAGATTCAGGGGCTTGCAGTCACCAT TTGCAAGTATCCTAGTTTCTAGTGGTTAAACACTCTTGCACCAGTTTGAA AATACTTAATTGTGTATTATTTTGTATGAATAACGTCTACCAACCGAGCA AGATATAATATTTAGAATTCACGCGTAGAATTTCTAGATTGTCCAGCATT CCACTTGAAAACATGTCATCTTTCCCAGCACTGGGATTAAGGAGGTCACG AAACCAAGAGTACTACAGGGGTTTGACCATACTTACCCCATGGTATTAAT GTCTTTGATAATTCTAGACCTTGGAGTATAAGGTACTCCCTCCGGTCCAT ATTAATGGCCACTGGGATGAAGGAGGTCACGAAACCAAGAGTACTACAGG GGTTTGACCATACTTACCCCATGGTATTAATGTCTTTGATAATTCTAGAC CTTGGAGTATAAGGTACTCCCTCCGGTCCATATTAATGGCCTAAACTTTA TCTAGATTCGTATGTATCTAGTTAAGTATCTAGAGTAGATGCATTCGTAT CTGGACAAAGTTGAAGCCATTAATATGGATCGGAGGGAGTAGTGCGTTTA CTCATAAATCGGATATGGTGAAACTAAATGCGGACAAAGGAGAAAATGTG CCATTAAATCTGAATGTACCTTACATTTTGAAATGTGATTACAGAAATCA TGAACCTTACTGAGAAGTTAGTGCTTTTCAGTGCAAGCAATGGACACCCT ATGATGTAATGGCGGGTGATGCAGTTTTGTTAATTAGTTCTGCTTTCCTG ATGCACAAATCAAACTATTGATCTTGACAAAATAAAATATCACTTGCAGA GAGTACCCCACAGAGCCCTGGCCAGCCAGGTGAGGACTGGAGGTCTGCCT TCAATTCTGCAGCAAATGGCTCTGTTGACCGATCCAGTTCACACAATGAA TCAAGATCGAGAAGTGCTGACAGTCGTGGTCGGCGGTATGAAAATGGGGA CGCAAATGGTGCCAATTCAGGCAGCCGACGCACACCAAATCGGTTGCCAC CGGCACCACCGAAATACTAAGCGTGTTGATGGACATCTATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.