Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA041852

[Submit comment/correction]

Sequence	AA041852
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA041852
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGACACCTGAAGGCGTCGAGGGAAGCGACAAAGCCGGCGCCGGCCGCTTC CGCTACAAAGCCCCACGCTATACCAACCCCCACTCCCCGCCATCGCTCTC CCACTCCGGCCGGCACCCACCACACACCGCAAACGCCCGCGTCACTGATC AACTCTGATCACCACCTCCACACCCTCCCCGCCGCATTGCATCGATCGCA TGCTGCCCTCCCTCGCCCAGCCCCTCCTGCTGCCCCGCCTCGCCTCCCCG ACGACCGCCGCCCCTCGCGCGCCCATCGTCGCCCCGCGCAGCGCCTCCTT CCCCTCCACAACGCCAGGACGGTTCGCGTCCCCGCTCCGCGCGGTCGTCT CCCAGCCGGGGGTCAAGGAGATGGCGCCGGCGCCGGCGGGGGAGCAGGAT GCGAGGCCGCTCCGGGTCGGGCTCGTCTGCGGCGGGCCCTCCGCCGAGCG GGGCATCTCGCTCAACTCCGCGCGGTCCGTCCTCGACCACATCCAGGTGA GCCTCCGTGTCGAACTATGAGCGGGCGAGGCGAGCTTGCTCTCACTGTGT TGCGGAACCGGAGTCGGGGTTGGGCTGGCCTGCGCTGAGTGATACTACTC CGAGTAGTGTCTTTCTAAGGTTTGACCAAGTCTGAGGTTCGGCGGCCACT CTCTGTCTTCTTCTGACAGAAAAATAACTGACGATGCAGGGGGAGGATTT GCTGGTGAGCTGCTACTACATCGACTGCGGCATGAACGCGTTCGGGATAT CGCCCGCGCAGGTGAGCCGATGTCGCGCCCAAATTCTCTTGCTTCTGAAC ATCAACATTCAGTTACTCGCTGCCGCTTCCTAGCTGAATATTCAGTTATT TACACATGCATATCGGAGCACTCTATTTCACTAATTGTAAAATGACAGTC TGCCGTCATCTTCTGCTCCGCAGCTATATTCCAACACCCCTTCCGACTTT GATTTCAAGCTGGAAAGGTGAGCTCAATGCTAAGGTCATTTATTCTGCTT ATTACCTGTAGTCCCACTCCCTAACTGAATTCAGTTTACAATTCTACTTG TACAGTCTAGCACAAGAGTTCCACTCCCTAACTGAATTCGCGGAGCATCT TTCTGCCAATGTCGACATTGTCTTCCCGGTGATACATGGGAAATTTGGTG AAGATGGTGGTATTCAGGTTAGTAGTTTAGAGGAAAAGTTTTTAAATATG CTGGTGCATACTTGTGGATTCTTAGTTTGACTGGGCATTGCACTAACATA TAGTACTGATGACTGTCTCTTAGTTGTTTACATATAATTCCATATTGCTC TTGATTTCTGTTGATGACAGGAATCATTAGACATTAAGACCTTCCAAAAC AGTAGTATATCTGCAGTATAGAACTTAATATCAATTCACCAATATTTGCA ACGGTTGATGGAAATTTACATGTCTGATATTTTACATGTTATTTCAAATA TTCAGGAGCTTTTGGAGAAAACAAATGTCCCATTTGTTGGAACGGCCTCT AATGAATGTCGCCGTGCTTTTGACAAGGTATGCTCTACATACCGTGACAT GGCACCACATAGCCCATCAGCTTTTTTTTTGTTCGCATAAATAGTTGGGT TTAGGGTTTCATGTCTCATTGGGTTGCCTTTATTGTGCTTTCATCATCTC CCAGTGCCTTATCGGTACTTGGAGGAGTCACCCTCAAGTTGAAAAAAACT TTCCATTCCATTAAATAAGTGGAGTTCATGAATTTCTATGTGCTGAGCAG CTTTACTCTATCATCAATCTTATATAAAGGTCTCCATGGAAATGTCTTCT GTGTCCATCAAATATCAAAACCCTTTTGTATATTCAGTTAATATGAACCA ATGCAATTATCCAAGTGACCTGATTTGTTGAATCCTTAATATGGCTGCAG CACAATGCATCGCTCGAGCTCAACACGAAAGGTTTCTTAACAGTACCAAA CTTTCTAGTAGAGGTAAGTTTCTTTGTTACCGTGTTGTGTACTTATGTAT TCCCTTTATCTCTGTTAACAGTATACTCTATCTTTTTATAAAATATTGTT ATAAGGCACACAAGGATGAGTGTACTTATGTACACCCTTGAATGTTGTAA TCATTCATAACTCTGTTCATGTGTTCCTTATTTGAGAAAATAAGGGCACT GAATCTTAAAGAACGTTTGGGAGAAAATGTATTTCAGTTTGTCTCTTGCA AAAGCACAACAGTGGTTATGAAAGACAAAAATATCCCTAAAAAACAGAAA AAAAAAGTCCTATTACAATCCAGAAAATATAAGGCTTGGTCAATGCTTGT TACAAAATCTATGATTTGACTGGTGCTCAATGATTCTTGAAATTTGCAAT AAATATTTGTTTAGGAGGTTATGTGGTTACTAATTCTGATGCTCTTCTGT TGGGGCTGTGACCATGTGTCCTGCATGTGTCACCTATGGGCAATGATGAA GTAGAAGGATACGTTGGACAAGTCAAAATTGGAGGAATGGTTCAGAAACA CCAATTTGAATAAAGAAAATGGCAAAGTGGTGGTAAGTAAGGATGCTTTA CTTGAAAATGTATTGCCAGGATTGTCTTGTTTAGAATGTACCTTCTGATG TTCTTACACAGGTCAAACCTACGAGGGCTGGATCAAGTATAGGTGTAGTT GTCGCTTATGGTGCTAATGAGGCAGCTGAGAAAGCAGAGGGAATAATTTC GGAGGTACCTGGTACTTAGTACTTACTGCTATGTTTCATAAAAGATAAAA GAAATTGTCCATAATTTGATATCTTTGATGTCCAACAGGGAATTGATGAT AAGGTTATAATAGAAGTTTTCCTTGAAGGGGGCTGTGAATTTACAGCCAT TGTTATTGATGTTGGGAACAGTGAGCCTGTCGTTCTGCTTCCAACAGAAG TATGATTTATATCATATATTTTTCCTAACTCCTTTTTCCTGTGGTTCTTA CATGCTCAACAGAAGGCTGGTTACTTCAAATTCAGAATTTTATAATTTTA TTCTTTTTTCAACAGCCTTATTGTTATGTACAAATAACTGCAATGTCCAA GAAATAAATGATTTAAATGTTACCAAAAGGGCTGGAATCGGTACTCCATA TATTCATTAGAAAAATCAGTGGCTTCTGATCATATGTCAATTCGTAACAA AATCCTACTTGGTAGATAACAGAGTACTTTCTTTGGATTTTTAACAAATG GGAGATTTAAAAATATATTTTTAATACTTTATGTGGTCCTATCTCCTATG AGGGTAGACATAAGCGGTTGTTACTTATGGAGATAGGTTGATTACTGGAA ACTCTCTGGGTTATGCAGAAAGACTGAACAAGTTTCTTTTATCTCCTTTT CTGCAGGTTGAGCTTCAATCATTTAGTAACAGTGATATTGAGGAGGATAC AATATTTAACTATCGTAGGAAGTACCTTCCAACTCAACAGGTATTTGAAA TATAGATCACTTACTACTATCTAAGTGATTAGTTAGTACACATTGCAAAG GGGTAGATATTTTCTGTTGATCTATGTAACATTAGTCCGACAAAATGAGA CAATACTTTTTCCATAAGTTCCTGTCAGGTGATAACAGGTACTCCAAATG ACTGGGCCGTATACATGCACATGGGGTGGATGTTTCTATTGATATGTGTA ACTTGGTTTTGCCGATGTATTGAATATTCATCCATTCACAGGTTGCTTAT CATACACCTCCACGTTTCCCGGCAGAGGTGATTGATTGCATAAGAAAAGG GGTATCTCTTTTATTTCAACATTTTGGCCTGCGTGACTTTGCCAGGATAG ATGGTTGGTTTTTACCAACGCCCGCTACTTCTCTACTCTCATCTGAAAAC GGTGGTAAATTTGGAAATACAGAGTATGGTACTGTCCTTTTCACTGATAT TAACTTGGTAAGCATCTTTACAGCAATTTCCTTATGCTTCGTTTGCGCCA TGTGGCTTGTGATTTCTAATGTGTGTCATCTTCCGTTATCCTATCTTAAC AGATAAGTGGAATGGAGCAAACCAGTTTTTTATTTCAACAAGCTTCAAAG GTATCGCTGCTAATACTTTGTACTATGTCCATACTTATATTGCAATTTCT ATTTATATAAATTAGAAAGCAATTCAACTAGAATACATTATCTGTTTTTT AATGTTCACCTTTTCTTACTGCTGCACGGCACTGAGGATATTTATATTTT GCAAATAATATGTAGTATAAAATACTAGTATTAAAGCTTTTCAGTAGCCA TCTATCATCATGCAAGTAATGCAAGTAAGTGCTGCACAACTACATGCGTG CGTATTACAAAGCTTGATTTTGCCACTAACTTCAGAACAAAATAACACTT TTCAGGTTGGATTCTCTCACTCTCGAATCCTCCGTACAATTGTTCAGCAT GCTTGCTCGCGATTTCCTTCCCTTGTTCCAAGAAATAATGCATGGACTGC TTTGTTCAGAGAAATGCAATCAGCAAAACAAGCAGAGGTAATCCAAAATG GTACATGCAAGCAGAAGGCTTTCGTGATATTTGGTGGCGATACTTCGGAG CGACAAGTATCTCTTATGAGTGGCACAAATGTGTGGCTTAATTTGCAAGG GTTTGATGATGTAAGATCTCAAGCTTTTTCATAGTTAATCACCTAATCCT TAATCACACTGGTGTATTTATTCTTGATGCTTTCATGCATGTATTTTGGT CATGTCCAGTCTCTGTTTTAACCATTGTGTCTTGAGCTGTATGATATGCC ATGCTTCTGTGTTCCATTTTCATCCTCTGATGGTTTCTTAATTTCTCTTT TGGTGCCTTTAGCTTGATGTGACACCATGCTTGCTTACACCTGCAAATGG ATATTCTTCTTCCCACAACAATGATTTCAGCGAAAGTTCACGTGATGTTT GGACACTGCCGTAAGTGTCTATTCTCCTAATTGGATTATATTCATACGAA TACACCATATTCTTTGATTTTGTAAAACAAATCAACTTCATACAGTATGA TCCCAAAGTTTGTGAACTACTGAGAAATTGAGAAACATCCAAGAGAGAAC CATGGGATGCAATAGGCACTGGTATTCACAGTTGTGAGATTTCAACTTGG TGGTGGGATACATCAACTTCCCAACCCAACTGAGGCTAGATGGAGTATTT ACCTTTAAATGGAAATATATAAATTAATTGCATTAAATGATATTTCTAGA GTTGATTTCTCATTGCATGTAATCACGATATTTTTTGTAAAATTATAATG ATGCCGGTCATCTTTTTTTTGTGTCTAAACTGAAATTTATATAGGACTGA TATATTTGTATAATTATGGGCATTTAAGATCCAAGGTTGGACTTTAATAG AACAGCATGAAATTTGGTTTCATCATATTTCTACTCCCTCCTTCCATAAT TCTTGTAGTGATTGTAGTTCAAGTTTGAGCTAAAACCACGACAAGAATTA TGGAATAGAAGGAGTAGCTTTTATAGTTCACTGACTTATTCGCTACTTAC TGTGTGACAGGTATTCTTTAGTGTTACGACATACCACTGAAGAAGTTTGT GCTGCATGTTTTGAGGCAATTGAACCAGAGCGGGTTGAAATAACATCTCG CTTACGTGGTCAAGTTATGAAAGAACTTGAACAAGGATTAAGAAAAAAAG ATTGGTTTGCGGGATTTGACATCGCTGATGAACAACCTACTAAATACTCT TTGGAACAGTGGATCAACCATGTTAAAGAAGCTAAAGCTGTAGTGTTCAT AGCAGGTATTTTTTTTAACTTAAACATTTTATGTAGCTGAACCTTTAGCG TCCTAGGCACAATAATGCCATTCTTTTCGTATATCCATGTACTCATTAAC TTGATGGTGCATATACATGATTAACTACTGCTACATGAAAATGTGTTATG GAAATTCTGATGGTATTCCTGGAATTTTTTGGAAGAGTATTTCTTGATTT AATGAACTCCGTTTAACACTTCTACTTTCTCTGATCACAATAAAAACAAA CACAAGTGCCAAAGTCACAATGAAAGTACAGATTCATAGGCTTAAACGTA ATCAGAAGCTGACTCTCACTTGAGTGTGGCAATAGTTATGCATGCATTTA TCATCTATGGTTTGATTTGTTTTGGTATTTGATGTCCAATATATTACATG TAGTTCATGGTGGTATTGGAGAGGATGGTACCATTCAATCGCTGTTGGAA TCTGCAGGAGTTCCTTACACAGGTTCATTTGCAGTTTCTAGTATACATGT ATGTTTCCAACTCCAATATAAAAACTATGGTAATATCAAATTTCCCATTA TGCAGGGCCAGGACCAATAGCTTCTAGAACATGCATGGACAAAGTTGCAA CTTCACTTGCCGTTGATCATGTATGAGCCTTTCAGATCTTCTATTTTATT AATTCCACGATCATTTTAAAAAGAAATTCAGTATGAAAATATATGAACAA TGGTTTCTTACTGAATAATTTGTTAGAGGTGTACTCATGCAGTCATGCTA TGATTGTAATCTTGTAAGATGGTTGATGAGTTTTCTGTTACTTGTATAGT TGGCTAGTTATGGAATTCACACAATACCAAAGGATGTACGAGCATCAGAA GAGCTAGTACAGACATCTCATGTTGATATCTGGAATGAACTGAAAGCAAA ACTACAAACTGAAACAGTATGTGTGAAACCTGCTCGTGATGGATGCTCAA CTGGTGTGGCAAGATTGTGGTGAGCATTTTCTAATCTCAAAATCTCCTGT ATTTTTTTTTTGTTATTGAACGTGAGTACTATATACTGGACTGTCATATG CATTATTTCTTTAAGAAATTATCGATTATCAGCTGTCCAGAGGACCTAGA AGTCTATACAAATGCGTTGAGGAGAAAGCTGCAGCGCCTGCCTGCTAACT GTCTATCTAGGGTACCATAAACTCTGTTTGTTAACTCATTAATCCAGCAA GACTTGATGTTGAGATGCATGTTTTACATTGATCTATATTTTCTAGGCAC ATGGAGTTATTGAGATGCCGGTCCCTCCTCCAGAGTCATTGATATTTGAG CCATATATTGAAACCGACGAAATTATCATTTCAAATGAATCAAGGGATGA CAGTTCCCGGCATCTGGTTTGGAAGGGAGAAAAGGAATGGCTTGAAATAA CTGTTGGTGTAGTTGGCAAACGTGGGGAGATGCATTCATTAAACCCAAGC ATCACGGTCAAAGAAAGTGGTGATATTTTATCTCTTGAAGAGAAATTTCA AGGTAATTAGTCCAGAACAAGTCTTTGAAAGTTTACATTCGTTGGTTCCC GATCATTTCTTTTTAGCTTGCAAAAAAGATATATTGTCCTGAGAACAGCT TAGCAATGTTCGTTGCCATACGCTGGTAGTTTCTAGTGAGGGAGCCATAA GTGAGCTAGGCTCGGTTAGTCAAACAGATTGTCACATTATCTATGTTTTT AAACGAATGAAAATAATCCTTTTCAGTACCGTGGCTTGCCGGTGTATTTT CAGCCTTTGTGTCACTGTGTGCATAGCTAACAAGATTTAATTTTATTTCC AGGTGGAACTGGAATCAACCTGACGCCACCTCCAGCAACAATTATGAGGT ATTATTTCTACACCGGAATTTGTGTTCCCTTCTTTGCTGTGTATTATGAC CCAATACTCTGCATCTTCTGTATTGTCAGTGAGGCTGCGCTTCAGAAGTG CAAAAGTTGTATCGAGACGATGGCAAACACACTGGGGCTGGAAGGGTTTT CACGCATCGACGCATTCGTGAACGTGCGCAGCGGAGAGGTAACCTCCCTC TCTGATACTTGTGCTTCTAGTAAGTGAAGAAGAAATTACCTGTGGTAGCT AACCACTGTCCCTGCATTTTGGTCCTGAAGGTGCTGTTGATAGAGGTGAA CACTGTACCTGGGATGACGCCGTCCACGGTTCTGATTCACCAAGTAGGCC TCTCTACCCCGATTACTCCAGAAACTTCATGTGTTTAAACTACGCAATTC CCTGTGGCTAGCTAAATTAACCTGTGTAACCCTTGTTGGAAATGCAGGCA CTCACGGAAGAACCGCCCATCTACCCCCACAAGTTCTTCAGAACACTCCT TGATCTGGCGTTTGAAAGGGCAAACTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.