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GrainGenes Sequence Report: AA008650

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Sequence
AA008650
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008650
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTAGTCCAGAAGTTTCCATCCCCCCTCTCCTCTCGTTTTCCCGTTTGTTC
TCTTCTCTCCCATTCCTCCCCGGCTCCCCGTCGCCGACCAGACCGCCGCC
TCCTCCTCTTCCGCCACCTCCTCACCAACGCAACCCACTAGGCCATACCC
CTGTCCGCGCCGTGGGCGCGAGGAGGAAGCAAGCCCATCGCCACCCGGCG
CTGCCACCACTGTAGCAGCAGCAGCGGACGCCGGAGATTCGGAGCTGCGT
GCGGTGCTCACGCGTGGGCGGGATGGACGACGGCGACAGTGCCGCCCGGA
GCGCAGACAAGGTCGACGCTCCCCCGGGCGACGACGGGAGCTCCACGCCG
CTCCCCGAGACGGTGAGGATCTCCTCGATTATGCAAGCACCGCGTCTTTG
TTTTGAAATTATACGCTGTTTAGGCTTCTTTCGCGTGATTGTAAGCCTTT
ATGGTGCGGTGTGGTGCGGAATTGAGCGATTCGGGCCCAGGAATGCAGAA
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CACCTTGTGAAACTATTCCCTCTGTCCCATAATATAAGACTAGGAAACAT
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GCGCAACCATGGTCTGCTTCACGGTTGGGTGTGCTGCTTTAGCTAGGCCA
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TTTGATCTAATTGACCAGATTGCGTGGATAATTGGATTATTGGGTTCACT
TGGTCTCTCCTTTTATATAATAAAAAAGGGTGTAAAGGATGGTAGAAATT
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TGGACCCGATCATTGGTTGAACTGGGAAAAACGTTACTCGTGACTCTAGT
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ATCATGCATCATGCAAGTCAGGCAGCCCACCGTCCCCTTTAATTACCCAC
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TTTAGGCAACCATCTGCTATATATGTTTCCCGAATTGGCTTGCTGATATC
AGACAATTTGGGAACGTATAAAAACCGGTTGGGCAGTGGTCAAGGGAGCA
GGGTGGGGCTAAACCTGCCTGGTACCAGAATCTTACGCACTTATGTCTGC
TATTTATTCGACGTGACGGTATAAGCAAACTAGGGCCTCATATGTCGTTG
GTTCAGCAGGCTTGGACGCATATTTGTACTGGCCCATGGCACAATGGCAG
CAATGTATGAGCCCGCCAGCCGATCGTGTATGCTATGCTAAAGAGTCAAG
CCGGTCATGCTGGAGTCCCATTTTCTCAAGTTCCTATATGGCACAGAAAC
AGCGCCCGTCTGTTGTTCTGTTTCAAACCGGTACACGTGGCAGGAACCTG
TTATATGCGATTTAGTGGGAGGACAAAGCCGTCTAAAGAAGTGTTGGACA
AAAACGGACGAAGAGAGAAACGCTTCTGATTTTATCATTAGGTATAGATG
TTATTACAACCAATATACTCCTAGATTGGTTTTAATAACATCTCCTATTA
TGGGACAGAGGGAGTATTATACTAGGTAACTGCACCAACGGTTGAGAGTT
TGTGCAGGTAAAAGTTATTGATGTTTTTTCTCCTGGCATGGGATGAGCCT
TTGTTTGTCTGCTGTGCAAGCTCACCGAGTTATCTGAAAACCTGAACCTA
ACTCCTTTTAGTCTTAGATGTTAGAGCTTTTTGCATATATATGTTTATGA
AGGCTACACTCTATTTGACATTGTGTGGGGCATGCAGATTGCAGTAAGAA
CATAAGATGTACTAATGTACTAGATGATTTATTTGCATATTTAGCAACAA
TAGAACATCTGAAAATCTTGTACAACATGACGCAACATACATACACCATG
TCTGAAAATTTCACATCTAAATCCGACTCACAGCTCAAGAAGTAATTTTT
TTTGACAAAACCGACTATGGAAAGTACTGGTATGATACTATTTACTTTAC
ATTTGAATTTGTTACACTTCATGGTTTGATTTGCATTTTTTCTTTCCTAA
GATATGAAAGGCATTTAGATGTGAAATTTTAAGACATGGTAGATGTGCAT
ATTGACTATGTCCTGTTTTTTCTTTCAAAATATTTTACGACCTTTAGATA
TTCCTTTTCGACGACCTAGTGCACTAGTAAACCTTAAGGTGCTAGTGCAC
CCTATATATCCCTGACGTTGTGTTATATTCAGTTCTAGCAGTAATGGTAG
TAGGAATATCTGGTTTTCAAGATGGTGTGTTGGTGATCGCGTGAGAATGC
TATATTATGTTCTGTTTGTAATGTTATATTCAGTCCTAGCAGTAATGGCT
GCAAGGGAGCCATATATGCTCTTTTGGTGATCGTATGACTTATATGCTTT
TTCATTGAGTTGGAACAGATCCAGATTGGCAATTCACCTACCTACAAACT
TGACAGAAAGCTTGGAAAGGGAGGATTTGGGCAAGTATATGTTGGTCGCC
GTATTTCCTCTCCTAGTCTTAGTGAGAGAACACCTGGTGCAAATGCTTTG
GAGGTCAATTTGTCTTTTTGGATGCCTTTTTTGTATTTTAATAGTTGAGA
CTATCATAGTTTTGTTTATATTCATGCTTTTGTTTCTATCAGGTTGCCAT
AAAATTTGAACACCGAACAAGCAAAGGCTGCAATTATGGAGCCCCGTACG
AGTGGCAAGTTTACAAGTAAGTGTTCTAGTTTTTCTTGCTTCTGCAACTT
GTTTCACATTGTACAATTAACTTCATGGCCTTGTTTTTCACTTTTTTGTA
CAATTGTCATTGCAAGTGGCATTTGTACAATGGATATTAACTTTGTTTCT
GCAAAACATCCACCTGGCAGCACTCTTAGCGGGATTCATGGTGTGCCAAG
AGTACACTACAAAGGGAAGCAAGCAGAGTATTATATCATGGTAATGAAGA
ATGTCTCTTTGCCTCCCTTTTGTAAGTGAATATAAGTGCATATACAGTTT
GTAGTTTATTTCTGTTTTCAGCATAGTGCTCCCCCTCTCCGTCAGTCCCT
CGTGCAGCATGCACATTCGCTAGCTTGCTTATTTTTCTTCTTCACTCGCC
ACCTTTATGACAAAATCGTGTATGAAGTTGTCCTTTTCTTTGTGCTGCCG
GCCGAATAATATGCAGTTCTAGGTGCTGCCTCTGTATAACAGGTATTTGT
ATCATGGGTGCAGTGGAACTTTTTTTCTTCATCAGTAAAACACATAGACT
ATCCTTGGTCATCTCTCATGGGTGCTTCTGCCCTGTGACTGATGAGACCA
ATGATGAAAGTTGTTCTTCCCATGGAGTATATACTCTGTACTGTAGGCAT
ACAAAGTCCGAAATTTGCTGTCCTTTTTCTGGTATGCTGGTGGGTCTATG
GAAGTAAAGTTCTGGAAACGACTCAGAGAACAGAACACAGGAAAATATTT
TTGTTACCAAAATAAGAGGTAGTAATTTTTATTAGAAGTATTTAACGTTT
GTCATTTAATTACTTACAAAATTTATAATAAATAAAATTGTATTCATAGT
CTTGTTGCTGATGACCATACTTGCTTAACACCACTTCACGCTGCATGTAG
TCACTGCATATCGTTGTTGGGATGGTCCATGCATGTTTATTCCATTTAAC
TGCATAAAATACCTATTGAATATGTAGATTACTTTGATGAAAACATAATT
TTTGGTAATCATTTTTGACTATGTGTTTAAAATTATTTAATAAATACTGC
TTTCTCCATTCCAAATTAAGTGGTACTCTACCTTTGTTAAAAGTCAAACT
TCTCTAAGTTTGACCAAGTCTACAGAAAAATGTGCTATATCTACGCCATC
AAATATATAGTATCCAAATATACTTTATGATGAATCTAATGAAACTAATT
TGGTTTTATAATTAAGTTTGACTTAGGACAAAGCTAGCACTTCAATTAAC
TTGAAATGGAGGGACTAGAAACACGTTGAGATTTCAGTTCATATAAATTT
GCAAATTATTAGCCTTTCATTTTTTCCGAAGCACTCTGTTTTTCTGCATA
TAGTCGTTCACTGTTGCTTCTAACAATATGTTCTATGATAAATCAATGAA
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ACTTAAAGTAGTACTTAGGACAAAGCTAGAACTTCCCTTAACTTTGAATG
GAGGGAGTAGAAACACGGTAATATTTCAGTTCATATAGATTTGTAAATTT
TTGGCCTCTCATTTTTTCTGAAGCACACTGTTTTTCTGCATATAGTCGTT
CAGGCTTTCACTGTTGGTTTTATCAATATATTTTTTGTATAAATGAATGA
AATTAATTTTGTGTTGTAAATGTTGATATATTTGTCTATAGATATAGACT
TACTCTAACTTAAAAGAAGTTTGACTTAGGGAAAAGCTGGAACTTAAATT
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TGGAGGGAGTAAAAACATGTTAAGTTTTCTGTTAGTATGATTTTGCAAAT
TAATTGCCTTTCATTGTTTCTGAAGCACACTATTTTTTCTGCATATAGCT
GTTCACTGTTGGTTTTAACTTTACTTTCCACCATGGTTTTAACTTTACTT
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CCTGTGGGATGTATGGAATAATAATTCCCACTCGTAAGTATCTACTTATT
TTCCTATCTATGTATTCTTGATGTACATCTCTGGGTTGCCCAGTTAATTT
AAGTTACGTCTTTGTGTTACAGGATGTCTGTTGAAATGGTTGCTTGTATT
GCTATAGAAGCCATTTCCATACTGGAGAAGATGCACTCAAAAGGGTATTT
AACATTCTTATCTTGGCAATGGAGCTTAGCTTTTTATTTGCGCTTGAATA
TGAAAACATGGAGTAACAACTCTTGTTTATGATAGGTATGTCCATGGCGA
TGTAAAACCTGAGAATTTTCTGCTTGGACCCCCAGGCACACTGCAAGAGA
AGAAGCTTTTTCTTGTTGACCTTGGGTTAGGTAATTTTATTCACTATTCT
TTTGATAAGGACATCCCAGTCTCTACTGGGAATTTGATATGTTGTCTCTC
TCTGCTTGACATTACTTTCTCTCCGCAGCCACTAAATGGAAAGACACTGG
TACAGGAGAGCTAGTTGAATATGATCAGCGGCCTGATGTCTTCAGGTTTG
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ACTGACATTCTCTTGTTATACTTGACTTGTTTTCCCTAATAGAGGAACCG
TCCGGTATGCTAGTGTGCATGCTCACTTGGGAAGAACTGGAAGCAGGAGA
GATGACCTTGAATCTCTTGCCTACACACTTGTTTTTCTTCTGCGTGGTCG
CCTTCCTTGGCAAGGATACCAGGTGAAGTTTAGTTGGAGTGTGAAATTGT
CATTTTACATCTCAGTTGTTTTCCTTACTGGAGACTTTTGTGTAATAACT
GTAGGGAGAAAATAAAGGTTTCCTTGTTTGCAAGAAAAAGATGGCTACAT
CTCCAGAATCTTTGTGTTGCTTTTGCCCGCAACCTTTCCGACAGCTTCTT
GAGTATGTTGTGAACTTGAAGTTTGATGAAGAACCAAATTATGCAAAGTG
CATCTCTCTTTTTGATGGCATTGTTGGCCCAAATCCAGACATCAGACCAA
TTAACACTGATGGTGCTCAGAAGGTAATATATTCCTTTGCCATTGTTGCT
TCTCACTAACTCACAAGGTGTTATGACTTACAACCATGCCCAGATGCTGA
AACCATGTAACTGTTTAACATTAGATTGGTCCTAGCCAAATGTTTTTGCG
GGAACTGCTTGGGAGGCATTGCTTAATGTTCATTGGGGGAATGGGACTCC
ATATTCATCAGCCATGCAACATAAGCTAGCATACTAATAGTTCGTTGAAT
TTCTACCAGCTTATATATCAGGTTGGTCAGAAGAGAGGTCGCCTCATGAT
GGAGGAAGATGAAGATGACCAACCCAAGAAGAAGATCAGGATGGGAATGC
CTGCAACACAATGGGTTAGTGTATATAATGCAAGGCGGCCTATGAAGCAG
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ATTATAACCACACTTCTTGTACAGGTACCACTATAATGTTGCAGATGGTA
GGTTAGCACAACATATTTCGAAGGGAAATGAGGATGGCTTGTTTATAAGC
TCAGTTGCCTCTTGTTCAAATCTGTGGGCTCTAATAATGGATGCTGGCAC
CGGTTTTAATTATCAAGTATATGAACTTTCTCCATATTTTCTTCACAAGG
TAAGTAGTCATCCTAGCCTATTGTTGCATTGCAGATTTTCCATTCTCTTT
TGTTTGCACTGGAGCATATCAATTAAGCAATTGATTTCTCTATTTTTCCC
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TAGAGGTAATAGCATCGTGATGCCTGCTCAAGAACGTTACTTTCACCCAT
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TCCTGGGCCTACCTGGTCTAATTGGCCTGCTCTGCTGTGTGTGTGTGTGT
GTCGAGATGCCCTAGGGCTCCCCCTGACCCCTCCCTCTGCCTCCTCATTC
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TTATGTGTTGCTATTCGCAATCACCGAGCCTTAATTTCTTGTGAAATCGT
TATCTCGATACAGGTGCCATGGTTGTCATGCTGCCTTCTGTTGGAGCAGT
CTTGGTAGGGCTAGAAAGCTTGGCATCATATTAGCAGGGGTTAGCGGCTT
GCTTGAACATGCTATTCTATGTGACAACAAGTAGAGACTTGCCGGGGATC
ACTTAATTGTCGGATATAGTGGGGATTGTGGTGGTTATTCCATGCTAGAG
CGGGAGTTTCTTAATAGGGAACATGTGTATAATTATTTTAGTATTGCATT
GTGTTGTCTTGATTTTCACTCGTTTGGCTGCCGATTCACTGCTTGGACCA
CTGGTCCTGCTTTAATAGCTTTCCCTGGTACTATGATTTCTCAGAGATAT
TGCTGCTTCTCCCAGATAGTATAGGATCAATCTATTCATCATTAGTGTGA
TTAAGCATTAGCAGATGATACTTATTCTGAATATCTGTGTTGTTGCGCTT
GCATATGTTCAAAGTCTGCAACTAACTTTGAGCCTCCACCTCCAGGAACA
CAATATGCCCAGCAGTCCTACAAAGTAAGCGACTCGTTCCCCTTCAAGTG
GATAAACAAGAAGTGGAAGGAGGGTTTTTATGTCACAGCTATGGCAACTG
CAGGAAGTCGGTGGGCAGTAGTCATGTCTCGGAATGCGGGCTTCGTAGAT
CAGGTATGTCTATCTCTTCCTTCTACTCCCTCTGTCCTGAATTAGATGTC
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GTTTGGTGCCTGTGTTTTTAACATTTTCGGTCGTAGGTTGTGGAGCTTGA
CTTTTTGTATCCAAGTGAGGGAGTCCATCGGCGTTGGGATAATGGTTATC
GCATCACTGCGACTGCTGCTACATGGGACCAGACAGCGCTTATCTTGAGC
ATCCCCAGAAAAAAACCTGCTGATGAAACACAGGAAACCCTAAGAACATC
CGCCTTCCCCAGCCAGCATGTGAAGGTGATTTATTCTCTCCCCCCTTTTC
TGGCATCTGTGTGTTACCCGTTTTTGGCCAACTATTGATTAATTTTCTTG
CAGGAGAAATGGGCAAAAAATCTCTACTTAGCCTCCATTTGTTATGGAAG
AACGGTATCATAAGGTCCGTTCTGTGTTGCTTGTTTGTAGAGTTCATTAT
CGACTGCCTGGTTTATGATTAGATGGTGGAGTTTTGAAGGGCAGTGATAT
TCCTAATCCCTAATTTATAGTTAACAGAGTTCATAGATCATAGATGGCAA
AGCCTGCTGTTTTTATAGGTTATAAGAGTGCATGTTGTGCTGCTGTGTTG
TATTCTTATTCTCTTTGTCCATAGAATGCGAAAATTGGTGTGTTGTAAGT
TGTAACATTGCTTACCAATCATGCATATAGTTTAAATTAGTTATGTAACC
CTTGGGGTTCCTATAAAATTGTACAAACTTCCAGTTGTGCCTGGGTGTTG
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TCATGTGATGTCTTATAGGCCTTAGCTGTGTTTGACTTGGACCATTCTTA
GATGGACCTGGCAAGTGGCAACTATGATTTTCTTGAGAGTGTATGCTGAT
GTATGCCATTCTACATTCTTCACTTGTGCCTTCATGTACTTCAGCAACCA
GTGTAAATCCTAGTTGATCGTTTGAGTCTGTGTGTGCAGATAACCAGGGG
CGGACTCAAAATTTCAAATTCCTTTACTATTTGTTTATATTTGGAAGAAA
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GTGTGCGTACCAGCTAAACTTTTCTAATATTTTGCTCCTGTATTCTGATG
TGGGCTCGGTTTCACCGTAGAACCACAGTTGTACTACTCCAAAGGTCAAA
ACAGGGAGCAAATGAGAGTCCGAGGAAAGACTGACCGAACAAGGAGCAAA
CACGACTGACTGAATGCAAACTGTTGATCCTTTGTTCTTTGATACATTTG
CTGAAGCTCTTGAGGCTTTGCTACCTTTACATGATGTTTCACCTCACCTT
TAATCGAATACTTTCTGTAACTGAAATATACATGAGCGCATGACAGAAAG
GTCTTTCTCTGAAATCCCGATGGTGGTGTTTGTAGCGAGTTGCTGCGGTT
GAAGCCATTTCTATGTCTTGGGCGTGACTTTGATGGGCATTCCTCGCTTC
AGCCGCACTGTGGGGAAGTTGACGACCGTGTCCTCCTCTGCCACCCACCT
GCATTCATAAAAAGTGAGTACCAAAGCCAGGATTTCTCTTCATAGTAGTA
GGATATTAGGAAGCACATTTGCATACCTGAAGCTGGTTACGAGGTGATGC
AGAAAGATGGAAGCTTCAAGCCTGGCCAGGTCGATCCCTGGGCATAGCCT
CTGCCCTCCACCGAAGGGAGTGAAGCCACTGCTGCACGCCATGATGTCCC
TCTCCTATACGGACGCTTGATGCATGTGTTAGATCTCTACTGTCACCTTA
GTTAACAATTTGTGTGTTGCATGTAAGGGAATTATTATCACCTTCCATCT
CCACGGATTGAAGGCGTATGGGTCGTCGTAGATGTGGCCGTCGAGATGGA
CGGAGCGGAAGTAGAGGAAGACACACCACCCCTTGGGAATGAGGAGCTGC
CCCTTCACCTCGACGTCCTTCACCGCCTTGCGCATGATCCCGTTTATGAT
GTTGCCAATCCGCAGCGTCTCCGTGATCAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.