Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA022219

[Submit comment/correction]

Sequence	AA022219
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA022219
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGAAAATATCCCCCACATTCCCACGTCCCTCTCCGTCTCCGTCAGCCACC ACGACATTTTCCGCTCCGGTCCCCGGACTCCGCCGTATCCCCGCAGCCGC CCCTCCCGCTCCCGCACCGTCCGCGCGCTCCGCGCAAATTCCCAAATCCC CAGGGGCTCGCGCGCCCGCCTCCTCTCCTGGTCCTGCCCCACGCTCGTCC TTCCTTCTCCTCCTCGCGATCCCATCTCCTCGCCTCGCGTCGGCCGGCGG CGGGCGGCGGACCCTAGGGCGAAGCCGCCGGCGAGCGGTCAGGTTTCCCG AGGCGGCAGGCAGCTCCCTTGAGGGGAATCTCGAGCTCGCGGAAAACCCT AGGTGCAGCGGCGGGCGGCTATCCATGGACGTGGACGCGCGGATGGCGAC GGAGTCGGACTCCGACTCCGACGCCATCGCCATCGCGACGGTGCAGACTG GCGGCTCCGGGAGCGGGAGCGAGACCCCCTCCGTGTCGCCGCCTCCCGAG CCAGCTGGAGCTCCGGCGGCGGCGGCGGGACCGCGGCCGGCCCCGGGGTA CACGGTGGTGGAGGCAGCGATGGACAAGAAGGAGGATGGGCCGGGGTGCC GCTGTGGGCACACGCTCACGGCGGTGCCGGCCGTCGGGGAGGAGGGCTCC CCCGGGTACATAGGCCAGCGCCTGATCCTCTTCGGTGGGGCCACCGCGCT CGAGGGCAACTCCGCCACGCCGCCCTCGTCGGCTGGGAGCGCCGGGATCC GTACGCCCATTTCTTCTACCTCAGCTTGCTCTTGTGCTTCAAATGGGTTT GCTTGATGCTGTAGGGTGCTGCTTTCTAGCTTGTTTTGCTGTGGAAGCCA TAAGTTTGAAGATAACTGAAACAGCAGGAAATGGTTTAGTTGGTGATCTT GCTTCGGAGTGGAAGTAGGGAAAAAGACCTGATTTTGGGAGTGAGGGGGG GTCCTTTTTGGGGTTAGAAACTAGGCCGGATTGCGAACTTAGTGTTCCAG TCTCATTAAAAGGTGGAATTCAGGGTACTGGCTGCTCGGTGCTGTTGCTG GTTTAGGTGGGATTGTGTTAATTAGGTGCTACCATGTTTGGATAGTAATA ATGAGTTGGACATTAAGGCGTTAGATTGCTGTGTAATTCTGCGCTCATGC TTTTACTTGTAACCTAAATATAGTACGCTTATATATCGTTTTAGGTGCCA AACTTGGTATACGAATGTGAGTTCTTGAAAACAGTTAGATTCTAGATCAC ATTCAGATTCAAGTCTTTGTAATGCCCACCTTAGTTGTGGTGTGTTGTTG GAATTGTGATAACGTGTTAGGAATATACTATGGAAAATATTTCTATGGGA CCTGGTCCACAGATTTAGTGGTGTCGACCAACTTCAGCAAATACATGTGT CCAAAGCAGTGAGAAAAACAAGATTAGCAACCGTTTTCTAGATCTAAATT GTCACGTGTCAATCATGCGAGTTGGTCCACTTGTAGACCAGGTCCCATAG AATTATTTTCCGCATACTATGGCCTCAAACCGAAAATGTTGATTTGAACT TTTGATGTGGCCTTACTGTATGAGGTATGATAAAGTATCAAGTGAATTGC TCAAAAACCACACATAGAGGTGCTGGGGACCTTAGTTGGTTGAAAAGGAG ACTTGGTTTCCATAATTCCCTTACTTGAAATTGTCAAACTTGGTGTCCCA AACTTGATTTGCTTATCGACCTCCTTGATTGCAGGTCTTGCTGGTGCCAC TGCAGATGTTCACTGTTATGATGTGTTATCAAATAAGTGGACCAGGTAAC AGTGTTTTTTATTAGTGTTTTTTAATCAGTGTTTATCCTAGTTCTTTCCC CAAGTTCTACAGATCCCATGGGCTTCTGGATAGATTTGTGTTTATCTTAG TATAATTATTCGTTCTGATTATACAAAACAATATATTTTCAGGCTTACTC CACTTGGTGAGCCTCCTTCACCAAGAGCTGCCCATGTAGCGACTGCTGTT GGAACCATGGTGGTCATTCAGGTACTTTAAGCTTCTTTTTTTTTGCTTTA GATTAGTAGGTGCATCATTGCTTTCCAGGTCAGTGCCAATAGAAAACTAA TTATAATTTCCTCTTCTCATTGTTTGCTGCAATGCAGGGTGGAATAGGCC CTGCTGGTTTATCTGCAGAGGACCTTCATGTTCTGGATCTTACACAACAA CGTCCGCGATGGCACAGGTGTTTTTCATCTACTATAATTTAAGTTCATAA TTTACTTTTGTTACTATATGTGCTGAGGGTCTAAGCCTTCTATGTAGAGT GGTGGTTCAAGGGCCTGGTCCTGGTCCACGATATGGACATGTCATGGCTT TGGTTGGGCAGCGGTTCTTGTTGACAATTGGTGGAAATGATGGTAGACTA TTTTTTATGTGTTTATCTGGCCTAGAATTGTAGCTACTTACAGATTGTTC TGTTCTAATTGTTCCAAATTTCAATACTAACAACACATACTTATTTCAGG AAAGCGTCCTCTGGCAGATGTTTGGGCCCTTGATACCGCAGCAAAGCCAT ATGAATGGAGGAAACTTGAACCAGAAGGCGAAGGACCACCGCCCTGCATG TAAGTGAATGCCTTTTTCCTTCTAAATGCGGTAAAATCAATGAGATCTTG CAGTAGTTATTGGCAAGTTGTTGCTGTAGTGCTGTACATTAGTGAGCTAA CTTTTGGTGCATGCTACCGTGCCTCTATTAATTATAATCAAAGCTCTCAA TAGCTCTTCGTATGTACAAATACATTTAATTTAGCAGTACAGTGCTTTAT ATTGCTCTGCCAAATATGGAAAACCTTGGTAAATATATAGCTCATTGCAA TTGTTATGTTTTCCATAGCAGTTGCCAGGCAAAAGTTGTTGCAGGTTTGT TAAGTCTTCTTATCTGAGAAACATCACAATTCTGATTAGAACCTTTTGCT ACGTGCTGTTCTTCACAGTAGTCTTTTGCTGCAATGAAAGCCTTACATTT GAGTAGCTGCAAGATCCATCTTTATATCTTACTGAAAGTAGACCAGGCTC TTAGTTCTTATATCCTTACCCTGACTGTAGTCTTATATAATGTTGTTGCT TAGGTATGCAACTGCAAGTGCCCGCTCAGATGGTCTTCTTTTGCTTTGTG GTGGGAGGGACACTAATAGTGTGGTAAGTGACATACTAGTTTTGGCAGTT AGTTCTTCAGGAGTTTGGAGCATAATTTATGAATTACCTATTGGGTATAT TTAGCTATAAGACCATTTTCTGAATTTTCTTGTAACAGAAATATATGGTA CATATTTCCCTGACTGTAGCTTATAGATTCAAACCTGCCATAAGTAACAA CAAGGGCTCATGTACTTTTCTTGTGTAAGCGATAGTCAGAAGCACTTCAT GCTTGCACAAAGTCACCAGTGACCAGTGGTGCATTCTTTTATATACATGT ACTTCTTTGCAGCATAGGATTAGACGATTAATGTGTCCGCTGGTCATGAT GTGCACATTTTAGTCAATTTATTTGCAAAATCATGTCCTTTCAAGAAACC TGGATCGGGCTGAAGAGTCCTGCAGGTGGGATGTAAACTGAATCTAAAAC AACCTTATTTTCCCCTTGGTTGGGGGGGGGGGGGGGAGGGATTCCTTAAA AAACAATCTTATCATGGTCCTTTTAAGATTACAGTATTTAACCTATTTTA GAGGCAGCGGAATCTGTTTCTCAGGTCTTGTACAATTGTGCTCGAGCATA CTCTTCACATCTAATGTTATACTTTTCTTGGTTATAAAATTATCAGCCCC TCTCAAGTGCGTATGGTCTTGCAAAGCATAGGGATGGGCGCTGGGAGTGG GCAATTGCCCCTGGCGTCTCTCCATCACCCAGATATCAACATGCAGCTGT AAGCTGCCCATCTGCCCTTTTTGTTTAATTTTGAGAATGATCCCACTTTA TTGTTGGTGCAATGCAATATTACTATTTTATTTTCATGCTATAGGTTTTT GTCAACGCACGACTTCATGTCTCAGGAGGGGCTCTTGGAGGCGGTCGCAT GGTAGAAGACTTGTCTAGTGTGGCAGGTTCTATTTTCAGAACCTGAAGTT ACTATCATTTTGTTTACATATTATTTTTTGTGTGAATTCAAATTCATTAA AATTCAGAAAAGTATCCCTTCCAGTGGAACTTAAGAAAATTAATCTCAAT TTATTTGGTGATAATTGGCAGAAAGTTCATTTTAGAATTAAGAGCAAATT AATTTCTTGGATCATTTTACCCCGCTGAACTGTTGACCGTTATGTTGTTC CCCTGTTGATTGCTGTGGCCTTTTCTTATTAATGGTTCTCACTATTTATT CATCACGGAAAGATACATGCTGTTACTGGTTATATGTGCAACACACATAT TCCTTTTATGGAAGTAGAGTTCTGTTCAAATACTTGATAGTTTCAGCACT GACCACATGGTTTAGATATGTGAATGCGTTAATATTTCCAATTCTTATTT TCTGTGCCATTCTGTCTTTCTTAGTGTTGGACACTGCTGCTGGAGTTTGG TGTGACACAAAATCAGTAGTTACAACTCCAAGGACAGGAAGATATAGTGC AGATGCAGCAGGTGGTGAGGCTTCTGGAGAGCTTACACGAAGGTGCAGGC ATGCAGCAGCTGCAGTTGGTGATATGATATTCATTTATGGAGGTTTACGA GGAGGTAAACATCTCAGTTACTTAGCCTCTTCTTACTCCTGACGTCAAGT ATCATATATGAATTTTGTTCTGTTGTCCTGCGAGCCCCCTGGTCCTATAA GTCCCGTTGAGTCATGTAAGCACTTAGTAGTGCTCTTTCGCATCATGATA TCTTCATGTGGGATATCAAACTCTCATGGTCGGTTGATGTTATAAGCAAT TCAGCCATATGATTGGGCTATTCACTAAATATTCATGTCATTCCGATGTT CATCTATTGATGCATCTTTTCTTGTTAAACCACTGCGATGTTCCTTCTAA GCCTTTTCCTTGTTCGGAAAACATTAGGAATGTCGAGTATTAGGCGATTG CCACATACTTAATTAGATTTGACTATGCTTGCATATCTTTTTTTCCTCTC TCAAAATAGGTGGGCAAGGTGTTCAAGGTTCAAGCTTAATGCATCCCTTG TTTACATTAATTTGATTAAAATTTCCTATTCTGGGTGTAAATTACCTTGC GTTAACTACTTAACTCTTAACTTTTGGCATACACATTTATTCTTCAGAGT TGGCATCTGGGTTAGCAAAGTCAAAAGACTGCTAATTCGAACCAAATTAC AACACCTATTTGGTCACTTGGGAAGTATAATTTCATCGTGGCATATTTTT CATCATGTTATTAAAAAACCTAGACCTGTGTGTTTCTTAAGAATTGATAG TTCTGGTTTTGACTGATTGGAATTTGGCAGAAGCTGGTATGGACAAACTT TCCAAATCCTTCTCAGAAGTGATCACTGCATTTCAATAACAGTGCAGTGT AGCATCTTATAATTTATCTGTGCTTTTTTTTATTTGTTCGCTTTTATTGA TTTTGTTTGCAGAGTAGCTGGGAACAATAGTTATTTATTTCCTTTTGTCT CGAACTACACAGGTTCATTATTTTTCCTTTTATTGATGCTAAGTTTCGTA CGTAATTGCTACCACAGGTGTGCTGCTGGACGACCTTCTTGCTGCCGAAG ATCTTGCTGCTGCTGAGACAACAAGTGCAGCTAACCATGCAGCTGCAGCT GCCGCTAACATGCAAGCTGGAGGGGCACCTGGTAGGTTTGCTTACAATGA TGAACAAACAGGACAAACAACTGGAGAGACAACTGCTGATGGAGCTGTGG TTCTTGGAACCCCAGTTGCTCCTCCTGTTAATGGGGATGTGTATACTGAT ATCAGCCCTGAGAATGCTGTGATCCAGGGACATAGGTTTGCATCGTCTCT GTCATAGACTTGTGCTCACCATTTTTCTTCATGGTCTGCTGATCTCCATA CTGAGATATGTGTTTCAAACTCTTTTTTTGTTGTTGCATAGGAGATCGAG TAAAGGTGTCGATTATTTGGTTGAAGCATCTGCTGCAGAGGCTGAGGCAA TCAGTGCTACTTTAGCTGCTGTAAAAGCCAGGCAAGTTAATGGTGAGATG GAGCATTCACCTGACAGAGAGCAGTCTCCAGATGCCACACCAAGTGGGAA GCAACATTCAAGCCTCATCAAACCAGATGTTGCTCTTGCAAACAATGCAA CACCACCTCCCGGTGTTCGGTTACACCATAGAGCAGTGAGTAGAAAATAC AACTAGTCTGAGTTTTTGTTCTTATTAATTCTATGTCCTTCAGATTGTTT TTATTTCCTTTGTGGATTATTCCTCAACCGAGAGATTATTTGTCTTCTGA ACAGTTTAGCTCAAGTTGCTTGGTGGGTATGGTTGACAACATTTTTCTTT GTTGTGTTTTGTAGGTCGTGGTAGCAGCAGAAACAGGAGGTGCCTTAGGT GGCATGGTTAGGCAGCTGTCGATTGATCAATTTGAAAATGAAGGAAGAAG GGTTATCTATGGCACTCCCGAGAATGCAACTGCGGCAAGAAAATTACTGG ATCGGCAAATGTCTATTAATAGTGTGCCCAAAAAGGTATTCTACTTTGCA CAAAAAGTTATCTGTGAGAAGGGCATGCTAGAATATACTTTGTTGTAGAT TTGTAGAATCTGTATGACAAAAGGTTATATAGTACACCCTCCCTTTTTGT AAGAGAGCTGCTGGTGTATATGTTGAACTTCTTTAGAGGAAATTTTCCTT TCTATTCTTCCTTTAAGGTTCTCTTTTTGGGTTAATTAACCAGGTAATTG CATCTCTCTTGAAACCTCGTGGTTGGAAGCCCCCTGTGCGAAGGCAATTC TTCTTGGACTGTAATGAGATTGCAGATCTATGTGATAGTGCTGAAAGAAT ATTTTCAAGTGAACCAAGCGTCATAAAGCTTAAAGCTCCCATTAAGATAT TTGGTGATTTGCATGGTCAATTTGGTGATCTTATGCGCTTATTTGATGAA TATGGTTCTCCCTCAACAGCAGGAGACATCGCGTGAGTATTTTTTGTTCT TTTTCGTCAGCACCGTGATTCTGTTTTTCCTATCCTTTCCTATTTTTTAT TTGTTGTATGTCTTGGACACCATAACTACAAGAACACTTAATTAAAGGAC TGCTAGAACGCTTGATGTCAAGTTGGTTATAGTTAAATGTGCACATCTTG ATTTGTGCATGAAGCTTTTTTGAATCTGAAAATGTTCTAATCTCATATGT ATCTTTCTGAAATCTCAGTTACATTGATTACCTCTTCTTGGGAGATTACG TCGATCGTGGTCAACATAGTTTGGAGACTATTGCTCTTCTCCTTGCCCTG AAGGTAGTAAAGATCAAACTGTCATCATACCATTAGTTTTTATTTATTCC AAATTGTAATGCGAAGCTCGCTGTACAACTCAGGTTGAATATCCTCAAAA TGTACATTTGATTCGTGGGAATCACGAGGCAGCAGATATTAATGCTCTGT TTGGGTTCCGAATAGAGTGCATAGAGCGAATGGTAATGGTTCTTTTCATA TTGCATTTCTTATTTGGCAATATTTGTATCTTGTACTTAAATTGCCGTTC TTTGGTTTGGAAATTAGGGTGAGCGAGATGGAATCTGGACCTGGCATCGT GTGAATAGGTTATTTAATTGGCTTCCTTTGGCTGCCCTAATAGAGAAGAA AATAATCTGCATGCATGGTGGTATCGGACGCTCCATTAACCACATAGAGC AAATTGAGAATCTTCAGAGACCAATTACTATGGAAGCAGGCTCAGTTGTT CTAATGGATCTTCTATGGTCAGCAATTGAACAGCTTTTTTTATCACCCTA TTATTGCAAGGTCCTCATTTAACATTTTATATGCTTAAAGGTCGGATCCA ACTGAGAATGACAGTGTCGAAGGACTCAGACCAAATGCTCGGGGCCCAGG TCTTGTCACCTTCGGGGTAAATTTCACCTGTGTTTTAATTCAATCTTTTT CTCCATGTTGGTTCCTCTGGTTTATGAAAGTAACATGCACTGTTGCAACA GCCTGACCGTGTTATGGAGTTCTGCAACAACAATGACCTACAGTTGATTG TGCGAGCACATGAGTGTGTGATGGATGGCTTTGAGCGTTTCGCTCAGGGT CACTTGATCACTCTTTTCTCGGCAACAAACTACTGTGGTATGGACATATT AATCTTGCATAGTTTATTCCAATTATCTCTTACAGTTGGATTGGCCCCAT TGCTCATATGGTACGTGCACAGGTACGGCAAACAACGCAGGTGCGATCTT AGTTCTTGGAAGGGATCTTGTCGTTGTCCCGAAACTCATCCATCCGTTGC CACCTGCCATGACATCACCTGAGACTTCCCCTGAGCATATCGAGGACACA TGGATGCAGGTAGGCTGCTTTATCAATAGATACTGATGTATTTGCACGAC GTCAAAATGCTGTCTGTCCACTTCTAACTCCCGTGTGTAAAAATCAGGAA CTAAATGCCAACAGGCCACCAACCCCAACCAGGGGCCGCCCTCAAGCAGC CAATAATGACCGAGGCTCCCTTGCATGGATATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.