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GrainGenes Sequence Report: AA021411

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Sequence
AA021411
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA021411
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAAAAAGAAGAGTTCAATCTGATTGGTTTGATGAGTTCGGAAGCTGGCT
TGAATATAGTGAAGAGAAGGACAAAGCATATTGTTTTTGTTGTTTCTTGT
TTAGGGACCGTGGCAGCAAGAAGGAAGATGGATATGAGGCATTTGTTCTG
AATGGTTGGGATACCTGGAACGTGAAGGCAAGGCTAAAATATCATGTTGG
TGATTTGGATAGTGTCCACAATCAAGTAATGAAAAAATGTATTGATTTGC
TAAAGAGAGACTAACACATTGATGTTGCTATTAACATTCAAACTGAAGCA
ACCAAGAAGGCTTATTTTACTCGACTGAATGCCTCAATTGGCATAGCTAG
GTTGTTGCTCAAGCAAGGATTACCTTTTCGAGGCCACGATGAGTAGAAGA
ACTCCCACAATAAAGGTAATTTTTTGGAGGTTCGTGACTTCTTAGCCGAG
CATGATCCAGTTTTAGGAAAGGCTACGGGAAAAGATGCTGCAAGGAATGC
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GGCTCTAAGGTATGTTGATAGTTCTGGAGATTCTAAAGAAAGTTTTGTTA
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CATCTACTTCAGTTGGTTGTTGTGGCTGTGGTAAGAAAGCATAAAGAAGT
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GCCTCTATATAATACTAGCTTGTTGGTTAATAGATGATTGTGGTTTCCCT
ATCATGAACATTGAGATGTTATTAACAATAAGATCATATCGTTAGGAGAA
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CCTTCGACCATGAGATCATGCATATCACCTTTACCGGATGGATGCTTTGA
TGACATCAAACACCACACCGTAACTGGGTGGCTATAAAGGTGGCATTGAG
TGTTCGGAAAGTATTGGTTGAAACACATGGATCAAGAGTGGGATTTGTCC
ATCCATATGACGGATAGATATACTCTAGGCCCTCTCGGTGAAATGTCATC
CAATTAGCTTGCAAGCATGTGACTGGCTCACAAGGGATCACATATCACGG
GAACGAGAAAAGAGTACTTATCGGTAATGAGGTTGAACTAGGTATGCAGA
GATACCGACGATCATAACCTCGGATAAGTAAAGTATCGTGAGACAAAGGG
AAATTGGTATCGTATGTAAGTGGTTCATTCGATCACAAAGTAATCATAGA
AATATGTGGGATCCATATGAATTTCCAGATTCCTCTATTGGTTATTGTTC
GGAGAAGTGTCTCGATCATGTCCGCATAATTCACGAACCGTAGGGAGACA
CACTTAAGGATTCGACGTTGTTTGAGTAGTTATGGTATGATGAGAAAGAG
ACCGAATGTTGTTCGGAGTCTTGGATGGGATCCGGGATATCACGAGGAGA
TCCGGAATGGTCCAGAGAATAAGATTCATATAAGGAAAGTCTCGTTTCGG
AGTTAGGGAATGATTCCGGTGTTTTCATCGGGAATTTTCTAGAAGGTTCC
GGAATGTCCGGCACTCCGGAGGGGAAGGGGTACATGAATGTGTCATTGCA
AGTTGGAATGATTGCATCATGTACTAAGTGTCTTCGCTGTCCAAAATAAA
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GGGAATCCCTCCTCCAACCGGCGGCGCACCACCCAAGCCGAGTTGGGGAG
GGACTCCCCTCCCTCCCCTTGGCCGGCTGACCCCTCCACCTATATAAGGA
GGGGCAGGGCTCCCTCCTAGACACACAACTTCTACTCCTCTAAACCCTAG
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CTAAACCCTAGCCGCCGGCTTGTCCCCTCCTTGGTGTCTCTAAACCCTAG
AACACCGAGGGACTCTCTCATACTCCATCATACTCGCTCCGGCTTAAGGC
GAAGCCCTGAGAGATCTCCCCTCTACTTCCGGTACCACGCCGTTGTGCTG
CCAGAATCGCGAGGAGAGTGCTACAACCTCCGCTGCCTGCTGGAACAAGG
GAGAGGAAGGTCTTCGTCGAGTACCGAACGTGTGACCGACTGCGGGAGCG
CTGCCGGAACGCAGCGCCGGAAGGATCGTCTATGCAATCTTGAGATCGGG
AAGAGTACGACTACATCACCCACGAGAATCCGCTCTCGTTAAACACTTTG
GAATCTTCGAGGGTGAGTTATTCCATAGACTCGTTGCTACAATCTAGTAG
ATAGATCTTGGCTTGTTTTTTTGTATGCGGTAGAAATTCTTTGTTTTCCA
TGCTACGAAACCCTACAGTGGTATCAGAGCCGTGTCTATATGTAGATCTG
TTGCACGAGTAGAACACAATGGTCATTGTGGGCGTTGATGCTTTTATTGT
CGATTGCTTCTTGTGTACTTTGCATATTGCGGTATGTTGGGATGAAGCGG
CCCGGGCTAACCTTACATGACATCGTTCAGGAGACTTGCTCCACGCTTGA
CATGCAACTTGTATTGCATAAGTGGCTTTGCGGGTGCCTGTTTCTCCTAG
CATAGTTAAGATCCAATTTACAACGGGTGATTAACAATACTAGTATCAAT
GTTATGGTTCTTGTTCGTAAGTTAGAACAACACTTATTGAAAGCCCCAAA
CCACGTAAAACATGCAAAGAAAGTAGAGGCGTCTAACTTTGTTTTGCAGG
GGTGTGCTGTGATGTGATATGGCCATGATTGTGATTATATTTGATGTATG
CAATTTCCTTATTGTAAGTTGGCAACCGGCAGGAGCCATATGGTTGTCTT
TAATTTATGTTAAGAGGACCGTGCTATTCAAAGTTATTGTAAGTGATTCA
AGCCGTGGAATTGAAACCATGGAGAAGACCATTGGAGAAGCGTCATTGAC
CTTGATGCAATGCCGGTGATGATGGAGATCATGTTCGTGCTAGAAGATGG
AGATCGGAAGCACAAAGAAGAAAGGCCATATCATATCACATATTATGAAT
TGCATGTGATGTTAATCCTTTATGCATCTTGTATTGCTTAGCAGACGACG
GTAGCATTATAAGATGATCCCTCATGCACATGAATTTCAAGTCATAAAGT
GTTCACCCTCAGTTAGCACCGTTGCTAAAGCTTGTTGTTTCGAAGCACCA
CGTGATGATTGGGTGTGTTAGATTCCGCAAGTGTATACAACGTGAGCAAG
CCAGATTTGCTCATGCGAAAACTAAGGTTTGATCTTGACGAGCCTAGCAT
GTACAGACATGGTCTCGGAACACAGATCACCGAAAGGTAAAGCATGAATC
ATATAGTAGATATGATGAACATGTCGATTGTTCGCCATTGAATCTATATC
AACTCTCGTGATGATCGGTGTTGATGTGGTGGATTTGGTTCGTGTGATCA
CTAAAACAATGTGAGGGATATTGTTTTGAGTGGGAGTTCACCTAGATTAA
TTTTATTATTAATTTGAACTCAATTTGTCATAAACTTAGTCTAAACTATT
GCAAATATGTTGTAGATCAATGGCAGCCCCTACCATCAATTTTAATGCGT
TCCTAGAGAAATAAAAGTTTAAAAACAATGGAAGCAACTTCGCGGATTGG
TTCCGCAATTTGAGGATTGTCCTCACAGCTGGTAATTTGACCTATGTGCT
GGATGCACCGCTGGGTGACTCACCTGTAGCTGATGCTGCCGATGAAGTAA
AGAACGTTTACCTCACTCGGAAGACTCAGTACTCCACAGTTTAGTGTGCT
ATCTTGTATGGTTTAGAATCGGAGCTTCAGAAAAGGTTTGAGAATTCAGA
CCCATATGATATTGTCGAGGATCTCAAATTGATCTTTGAGTCTCATGCGG
CAATTGAAAGCTATGAGGCTTCTGAAAAGTTCTTTAACTACAAGATGGAA
GAGGGCAGCTCCGTCAGTGAGCATGTGCTTAAGATGTCTGGGCACGCAAA
CAAACTTCAAAGCTTGGGTATTGTGATTCCTAATGCTTTGGGGATTTACC
GTGTCCTCCAATCACTACCACCAAGTTACAAGAACTTTGTGATGAACTAC
AACATGCAAAACATGAACAAGACGTTGCCAGACTCTTTGCCATGTTGAAA
TCTGCAGAAGTGGAGATCAAGAAAGAGAACCAAGTGTTGTTGGTCAATAA
GACCACCAAATTCAAGAAAGGCAAGTCTAAGCAGAAGGGACACTTCAAGA
AGGGTGGTAAGAAAGTTACCATGCCGACGAAGAAGACCAAGGCTGGACCT
AAGCCTTATACTGAGTGCTTGTACTGCAAGGGAGAAGGTCACTGGAAGCG
GAATTGCCCAAAGTACTTGGCGGATTTGAAGAACGGCAACATCAAGAAGA
AAGGTATATCTGATATACATGTTATTGATGTGTATCTCACTAGTACTCGT
AGTAGTGCCTGGGTATTTGATACTGGTTCGGTTGCTCATATTTGTAACTC
GAAACAGGTGCTGCAGAATAAACGGAAGCTAGCGAAGAATGAGGTGACGA
TGCGCGTAGGAAACGGATCAAAGGTTGATGTGATCGCGGTCGGCACGCTA
CCCCTTCATCTACCATCAGGATTAGTTTTATACTTCAGTAATTGTTATTT
GGTGCCTGCGTTGAGCATGAACATTATATCGGGATCTTGTTTATTGCGAG
ACGGTTACTTGTTTAAGTCCGAGAATAATGGTTGTTCGATTTATATGAGT
AATATGTTTTATGCACATGCACCTTGATAGATGGTCTATTCTTATTGAAT
CTCGATAGTGGAAAAAGACATATCAACAACATTGAGGCTAAACGTTTGAA
ATAATCAACGATAATTCGACCTATATGTGGCACTGTCGTCTTGGTCACAT
TGGAGTGAAACGTATGAAGAAACTCCATTCCGATGGACTTCTTGAATCAC
TTGATTTTGAATCACTTGATAGATGCGAAGCATGTCTGATGGGTAAAATG
ACTAAGACTCCATTTTCTGGTATGATGGAGCGAGCTACGGACTTATTGGA
AATCATACATACCGATGTGTGTGGTCCAATGAGTGTAGCGTCGCGCGGTG
GTTATCGTTATGTTCTTACCTTCACGGATGACTTGAGTAGATACGGGTAT
ATCTATTTCATGAAACATAAGTCCGAAACTTTCGAGAAGTTTTAGGAATT
TCAAAGTGAGGTAGAGAATCAACGTAACAAGAAGATTAAATTTCTACGTT
CTGATCGTGGAGGTGAATATCTAAGTTACGAGTTTGGCGAGCATTTGAAG
AAACGCGGAATACTTTCACAGTTGACACCACCGGAAACACCCACAGCGTA
ATGGTGTGTCCGAACGTCGTAATCGAACTCTCTTAGATATGGTTCGTTCT
ATGATGTCACTTACAGATTTACCTCTATCATTTTGGGGTTATGCATTAGA
AATAGCCGCATTCACTTTAAATAGGGCACCGTCTAAATCCGTTGAAACGA
CACCGTATGAATTATGGTTTGGGAAGAAACCTAAATTGTCGTTCCTTAAA
GTTTGGGGTTGCGAAGCCTATGTAAAGAAGTTACAGCCGGACAAGCTTGA
ACCCAAAGCGGAAAAATGCGTCTTCATAGGATACCCAAAGGAAACTATTG
GGTATACCTTCTATCATAGATCCGAAGGCAAAATCTTCGTTGCCAAGAAT
GGATCCTTTCTAGAGAAGGAATTTCTCTCGAAAGAAGTGACTGGAAGGAA
AGTAGAACTCGACGAGGTTGTCGAACCTTCTCTCGAAATTGTGAGTAGCG
CAACACCGGAAGAAGTTCCTGTGGTGCCTGCACCAATTAGAGAGGAAGCT
AATGATGATGATCATGAAACTTCGGTTGAAGTTGCTACAGAGCCTCGGAG
GTCAACGAGAACTCGTACCACTCCAGATTTGTATGATCCCGTTATGAGTG
TCATGTTGGTTGACAAACCGATGACCCTGAGACATATGAGGGAAGCGATG
ATGAGCCCAGATTCCAATAAATGGCAAGAAGCCATGAAATCCGAGATTGG
ATCCATGTACGAAAACCAAGTGTGGACTTTGGTGGACTTACCGGATGGCC
GGAAGGCTTCGAGAACAAATGGATTTTCAAGAAGAGAAAACAGATGCCGA
TGGTAATGTTACTGTCTATAAAGCTCGACTTGTCGCAAAAGGGTTTCGAC
AAATTCAAGGAGTTGACTACGATGAGACTTTCTCACCAGTAGCGAAGCTA
AAGTCTGTGAGGATTATGTTAGCAATCGCTGCATATTATGATTATGAGAT
ATGGCAGATGGATGTCAAAACAGCATTCCTCAATGGAGACATTGATGAAG
AGTTGTATATGATGCAACCCAAAGGTTTTGTCGATCCTAAAGATGCTAAC
AAGGTATGCAAACTTCAACGGTCCATCTATGGATTGAAGCAAGCATCCCG
AAGTTGGAATCACCGTTTTGATAAGGTAATCAAAAGTTTTGGTTTTATAC
AAACTTATGGAGAAGCTTGTATTTACAAGAAAGTGAGTGGGAGCTCTGTA
GCATTCTTGATACTATATGTAGATGACATATTGTTGATTGGGAATGATGT
AGACCTTCTTAATAGTGTCAAGGAATATTTGAATAATTGTTTTTCAATGA
AGGATCTTGGCGAAGCAGCTTATATATTAGGCATAAAGATTTATAGAGAT
AGATCGAAACGCCAAATATCATTGTCACAAAGTACATATTTGGACAAAGT
TCTAAAGAGGTTTGGAATGGAAGATAGCAAGAAAGGGTTCTTGCCCATGT
TGCCCAATACGACCTTGAGTAAAACTCAAAGTTCGACATCGACAGAAGAT
AGAGAAAGGATGAGTAAGACTCCCTATGCCTCAGCCATAGGATCTCTAAT
GTATGCCATGCTATGTACTAGACCCGACATTGCATATGCTGTTAGTTTAA
CTAGCAAATATCAAAGTGATCCAGGAGTGGATCATTGGACAGCGGCCAAA
AACATCCTTAAGTACTTAAGAAGAACTAAGGATATGGTTCTTTCTTATGG
AGGTGATGAACAAATCGTTGTTAATGGTTACACCGATACTAGTTGGAACA
CCGACCCGGATGATTCTAAATCACAATCTGGATACGTATTTATTTTGAAT
GGTGCAGCAGTTAGCTGGAGGAGTGCAAAGCAAAGCGTTGTGGCGAAATC
TTCAACTGAATCGGAATACATGGCTGCTTCGGAGGCTTCACAAGAAGCAA
TATGGATGAAAGAGTTCATTACAGAGCTGGGTGTGGTTCCTAGTGCGCTG
GACCCAATGTCTATCTACTGTGATAACATGGGCGCCATAGCCAATGTGCA
AGAACCAAGGTCACACAAGAAGATGAAGCATATCAAGCTACGTTTCACGC
TATTCGAGAACATAGAACATACAAGATGGGGATTAAAGATTGCAAAGTCA
CACACGATCTGAATGTGGCGGATCCGTTGACTAAACCTCTCCCGAGGGCA
AAACCTGACCAGCACCAAACTGCCATGGTGTTCAGTATATTACCATGTAA
TCTAGATTAGATGACTCTAGTGCAAGTGGGAGACTGTTGGAGATATGCCC
TATAGGCAATAATAAATGTAGTTATTATTATACTTTGTGTTTATGATAAA
TGTTTACATTCATGCTATAATAGTATTAACAAGGAAACATTGATACTTGT
GTGATTTGTAAACTAAAATAAGAGTCCCTAGTAAAGCCTCTATATAATAC
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TTATTAACAACAAGATCCATATCGTTAGGAGAATGATATGGTGACATGCT
CCTATAGATAAGCGTAGCATAAAGATCAAGTCATTTCAATAGTTCAATTG
CTACTGCTTTCTGATACATAGTAACCTAATTCCTTCGACCATGAGATCAT
GCATATCACATTTACCGGATGGATGCTTTGATGACATCAAACACCACACC
GTAACTGGGTGGCTATAAAGGTGGCATTGAGTGTTCGGAAAAGTATTGGT
TGAAACACATGGATCAAGAGTGGGATTTGTCCATCCATATGACGGATAGA
TATACTCTGGGCCCTCTCGGTGAAATGTTCATCCATTATCTTGCAAGCAT
GTGACTTGGCTCACAAGGGATCACACGGGAACGGGAAGAGAAAAGAGTAC
TTATCGGTAACGAGGTTGAACTAGGTATGCAGAGATACCGACGATCATAA
CCTCGGATAAGTAAAGTATCGTGAGACAAAGGGAAATTGGTATCGTATGT
AAGTGGTTCCTTCGATCGCAAAGTAATCGTAGAGAATATGTGGGAGCCAT
ATGAATTTCCAGATTCCTCTATTGGTTATTGTTCGGAGAAGTGTCTCGAT
CATGTCCGCATAATTCACGAACCGTAGGGAGACACACTTAAGGATTCGAC
GTTGTTTAGTAGTTATGGTATGATGAGAAAGAGACCGAATGTTGTTCGGA
GTCTCGGATGGGATCCGGGAATTCACGAGGAGATCCGGAATGGTCCAGAG
AAGATTCATATAAGGAAAGTCTCGTTTCGGAGTTGGGGAATGATTCCGGT
GTTTTCATCGGGAATGTTCTAGAAGGTTCCGGAATGTCCGGCACTCCGGA
GGGGAAGGGTACATGAATGTGTCATTGCAAGTTGGAATGATTGCATCATG
TACTAAGTGTCTTCGCTTGTCCAAAATAAGGGTTTATTCAAATCCTAAAT
GAAAAGTCAAACGGCTAGTTTGAAAGTCAAACGGCTAGTTGAAGTCAAAC
GGCAAGTTTTGAAAGAGGAGGAGTGGGAAACCGAGTTGGGGAGGGAATCC
CTCCTCCAACCGGCGGCGCACCACCCAAGCCGAGTTGGGGAGGACTCCCC
TCCCTCCCCTTGGCCGCCGGCCGGCCCCTCCACCTATATAAGGAGGGGCA
GGGCTCCCTCCTAGACACACCAACTTCTTACTCCTCTAAACCCTAGCCCC
AAGCCGCCGCCGCCTCCAAGCCGCCGCCGGCCCCTAGGGCATCAACTCGC
CGTCGCTAGCTAAACCCTAGCCGCCGGCTTGTCCCCTCCTGGTGTCTCTA
ACCCCTAGAACACCGAGGGACTCTCTCATACTCCACCATACTCGCTCCGG
CTTACGGCGAAGCCCTGCGAGATCTTCCCCTCTACTTCCGGTACCACGCC
CGTTTGCTGCCGGAATCGCGAGGAGAGTGATACAACCTCCGCTGCCTGCT
GGAACAAGGGATAGGAAGGTCTTCGTCGAGTACCGAACGTGTGACCGACT
GCGGGAGCGCTGCCGGAACGCAGCGCCGGAAGGATCGTCTATGCGATCTT
GAGATCGGGAAGAGTACGACTACATCACCCACGAGAATCCGCTCTCATTA
AACACTTTGGAATCTTCGAGGGTGAGTTATTCCATCGACTCGTTGCTACA
ATCTAGTAGATAGATCTTGGATTGTTTGTTTGTATGCGGGAGAAAATTTT
TGTTTTCCATGCTACGAAACCCTACAGGTGGATCGGCCAAGCGAAGGGAT
ATGATTAGAGATATCAATCTTGAAGAAATGAGCAAAGCTTTAGGGTGTGT
ACAGCTTACAACTGGTACAGGGCTGAATCAAGAGCAATGCCTTCAAAGAC
CTGGAGACACTCGTTGGGGTTCTCATGCCAAGACACTTAAAAGTTTGGTG
GATCTATTTCGATCAGTCATTAAAGTTCTAGAATATGTGGGAGAAGAAGA
CACTGATAGAACAAATATATACCTTGCAAATGGTATGTTAGCGTACCTTC
AGTCCTTTGACTTTGTGTTCTATGCATCTCATGTTGACTACTCTTACAAC
TACAAACACATTGTCATTAGCATTGTAGCGGAAGGATCAAGACATGGTAA
ATGCCATGAAATGTGTGAAGTCAACTAGAACTATTTTGAATGAACTTAGA
GAAAATGGATGGGAATCCCTGCTGGTTGAAGTTCATGGTTTTTGTGAGAG
ACATGATATTGAAGAGTTAGATATGGAAGTAGCCTATGTTAATCCAAAAA
AGAGAAGGCCGGCCGGGTAACTGGAATTACCAACAAACATCACTATCAAG
TCGATTGCTTCAATGATGTTTTTGATTGGCTAGTTCAAGAGCTTGATGGT
AGATTCAATGAAACATCCTCCAATTTGCTTGTTTGGTCAGCGGCTTTGAG
TCCAAGAGACTCATTTCGTGATTTTAATTTGGAGAGTTTGATAATTTGGC
TAAACTATATCCTCAAGATTTTGATTCTGGAGAGTTGAGGGATCTTGATA
AGGATCTACGCCTCTATATTGCTAATGTACGCACAGATGATAGCTTTTCC
AACATAGCAACAATTATTGAGCTCTCTAAAAAATGGTGGAGACAAGGAGG
CATATTATGTATCCTTTGTTTTATCGGTTGTTGAAATTAGTGATTATGTT
GCCAGTTGCTACTGCTACAGTTGAGAGATGCTTTTCAGCCATGAAACTAG
TAAAAACATTTTTGCGCAATCGCCCACAATGATTATAGCTTGAGTGATGA
TGTTATTTGTTATGTGGAGAAAGAGGAGATGAAGAAAGTCACCAATGATC
AAGTGGTTAAGTATTTCATGGCTTTGAAGAATCGATTGTACTAAAACATA
AGAAGGTAATATGAAAACTTTATCTACTTTAGCACTATAATTATGGTCAT
TCAATTATTCCACTTGACAGCTAGACCTACTTTTTATTTTGCAGCTTTTT
GAGCCTTCCGTGCTTGACGACATATTTTGCAATTCAAAAATGCAAGGCAT
CTTTTGCAAGTAACTTTTTCTTTTGTTGCATCCTTATATAAAGAATTTTG
ATATTTTTATTACATGATTCTCTGTATTGTACACCATCTCTTCTTACGTC
GTATTATTTATTTCAAAGATATAAATCATGCATTTATATAGTACACTATT
GCTCGAAAATTTTATACAATAGTAAGATGGTGCATCAGGGTGACTCGAGC
TCCAGCTCCGCCCCTGCACGCCATCTTGGCTCGCCGCCCTGCGCGCTCAC
TGGTCGCGCTCTGTCCTGCTCGTTGCCTCGGCCCTGCTCACCGCACGACC
TGGCTCGCCGCCCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.