Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA006213

[Submit comment/correction]

Sequence
AA006213
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006213
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTGCCGTCGCGGCGACCTCTCTGCCCTTTCCCGCGCCGTGCCGCCGCCG
CATTTCCGCCCCAAAGCCCCCACAAAACCCTGCAGAAAACTTAACTCCTG
ACTCCCCTCTTCCCCTTCCCCTCCATGCTCCGCACCACCGCCGCGATGCT
CCCATCCGCCTCCTCCCTCCGCTCTCTCCTCCGCCTCTCCCGCCGCGCCC
CTCTCCACCGCCTCCGCCCGCTCCCTAGCCCCCCGCTGCTCCTCCCGCAC
CTCCGCCTCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCCACATCCGGCGG
CAACGGATGGGAAGACCTCCTTGGCCCACTGGAGGCCGTCTCTTCGGCCT
CCGCCGCCGCCGCCTCCGACCCTGAAACCCCCGCCGACTCCGAGGGCTCC
TGGGGTGTGTTCGACCCCGTCGCCGGCCGTATCGTCATGCAGGCGCAGCC
GTCCCCTCCTCCATCCAGCTCCGACGGGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGTGA
AGCAGAAGGGGAAACCGATTGGTTGGAAGGGCGAGCGCAGGTGGGCAGAT
GTGGCCACCGCGAGAAGGGCCGCGGGGAAGGCCGGCAAGGCGGCGAGGGC
CACTTATGTCTGCAGCAACTGCGGGGACGGGTTCTCGCAGTGGTGGGGCA
CGTGCCGGAGCTGCAAGGCGGTGGGGACCCTGACGAAGTACCTCCCGGGG
GCTGACTCCGCGGACGACCAGGGCTCGCACCACGCCGGCCGGTCGTGGAT
TCCGCAGAAGAGCAAGGAGATGGTGCCCAAGAGCCTCGGGGAAGTGACCA
AGGGGTTTGACCAGGAGGGCTGGCGCATACCGCTGTAACATTTCTCACTC
TCGGTCCAAATTTGGAGAAATGCTGGCTTCATTCCTTTTTCTTCTCCAAA
CTGTGTGTGGATGGATGATGCTAAGATGTTCAGATTGTTGAATGTTCTGT
GTGAACATGGCAATTGGCTTTAGGATAGCACTCTCCATGAAATGCAATTG
CTTGGTGGCTCGCTGAATATTTTCCCCATTGTTAGCTGATGATGTATATG
ATTTTTTCTTACTGGCATTTGCAGGCCAGGGAGCTTCGGGAATGAAGTTG
CTCGGGTGCTTGGAGGTGGCGTTGTTCCTGGTAAAACACCACTCTAACTT
CGTTGCTACTGGTTGAATGGGAACCTGGTGTTGGAGCTTATAAATTGATT
TGTCTAATTCAAAACCATTACACCATCTTGCAGTTCGTATGCGGAAATAA
CTACTAGTTTCTGATATCATTATGTATATTTTCTTGTTTTTTAATACTTC
AGGTATCTCTCCCAAAAAGCATATCAACAGTTGATGTAAACTTAGCTTTC
GCAAGCTTAATGCCTACCCAATAATAATAATATAACTACCTTACGAGAGG
CACATTTGATTGTAGATCGCCAGATGTGAAACCCAGACAAAGAAAATTAC
CATACCTTTAGTTTGTGACCCTGGGCCTACGAAGTTCGCTTGTTTAACCC
TGGGCTTACTAAATTCACCTCCCATATCGTGCCATTCCATTTACGAGCTA
TATTGAGTTGTTCACCATGTTTGAGAAAAAGCGCATCTATGACCCGGAAC
CTACTAAGCTCGTTTCCCATCTCCGCCATTGCAATTTTGTGTTTCGTTGA
GTTGTTGACCTTGTTCAACAAAAAGCGCATCTGATGTGTTGCATGAACCT
TTTCTGTACTTCACGGCATCAATGCATTACATACTGTTTTTCATGGATTG
CCTTCACACATGTAGTTTTGCAGGCTCCTTGGTTTTAGTAGGTGGGGATC
CAGGTGTTGGCAAAAGTTCGTTGATGTTACAGGTAAATGTACACATCTGG
TTATTCATTGCTAATTTGGCGTGCCTTCTCTTCTTGCGTTTCAACCCACT
AAGACCACTACATTCAGTTATTTACTTATGCTTTGGGATTTAAAAATTTA
TCAACTTTAATTACTTACATTTTGAGTACTGGAGACTTGGAGTTCGGAAT
TTTCTGCACCTAATTCCTTAACTTGGAATCTGATAACATTCTTCTATGTA
GCTTGCTTCTATTGTATCTGACGGTTCCGAGGACCATGGGTCTTCTCCTG
TTGTATATGTGTCCGGTGAGGAGGTTGGTTATAGACTTGTCCTATCTCCA
TCATTTGCACCTTTCTTAACTGTTTTGTGTTCTTGTTGACGGAAACTTCT
AAAGACTATTCAATATAACACTTATGATAGCGTTCTATTTTTGATATTCT
CAAACTGATAGTTATTTCCTGAAACATATCTTTAATTAAAAAACTGTAAC
TTTGCCCGCAGAGCATTGAGCAAATTGCAAATAGGGCTGACCGGATGAGT
ATCAGGTCTAAAGATTTGTACCTATACTCTAGTACAGATATTGAGGTAAC
ATTATTTTGCTGCATCATTTACATATTCATTTTCTTGGATTTATCGGCCT
TTGTTTTAAGGAAGCACAAATATACTACGCCAGTTGTACTGTTTAGTTTG
AAGAACTGAGCCAGTAGTTATATTTGACTAATGTCCTTGAGTGTTATAGA
GCACTGGACCCTCCTTGTCACTTATACAGAGCTTCCACACCACCTAATAA
AGCTACTGAGTACTGATGGAGTAGGTACTTGAATTTTACTCCATACTTAG
TTACTCATAGATCTGGAAGTTATCATTGTACGGTTGCATTGTATGACTAA
ATGGTATATATGTGCGTGGTCCAAGTTTTCACCAGGTATCCAAAATAAAC
TGCTTAAGAACCATATACTTAAATAGAGATTGACAATGTTGGTTTTCTTG
TAGAACGCGCATTCTGCCAGCAATCTAAAACTGTGCTTTCATGGATGATA
GATCACTAACTAAAAGCATAATAGAAACATTATTAGTTGGACATAAGATA
TTTCATATCGTGATTTGAGAATTTTTTTTGGAAACCCAGCAGAAGACGTG
CCTATTCATTAAGAAGAGAATACATATGTATACACAAGGGATGGCATGTT
TTTTGGGTGGAAGCACGTCCGAAAACCCTCTACTGCATGCTGATTACTCA
GCCTGTTACCCTCCTGTCACCTCACAAATGTGCTAAAGAGCTAGATAGGC
AACCTCAAGATATGTTATCTGCAATCTGTTGAAAATGTTTCTGTTTCTTT
TCTTACACACGTTCCATATGACACTGATGAAACAGCCACTCCTGGATTTT
GCCTTGCGTGTGGGCATGTTGCAGATCATGTTACGCCACCAAGAGTCCAC
AGAGTTATGCAAATGTGCCGTGATTTAAGATTCTTTTACCAGCTAATCAA
ATCAAATAATCTATATCTTGGCCAAAATCCAAGATAAAGTGATAAACTAC
CGATGTTTCTCTTCTTGTTCCGCAGGATATTTTGGACAAAATCCAGCCAT
TGTCTCCAAGGGCTCTTATTGTTGATTCAATTCAGACAGTTTATCTAACA
GCATTTGCTGGAAGTGCTGGGAATCAAGTGCAGGTGTTTCAATCAATACT
TTCTCGAATGTTGAGGCATGCTTTGAGTACTTCTTACTAAATCATATAAG
CCTGGGTTCATGCCGGGTGCATTTATAATAGTTTTTCCTAATCATTTGAC
TCTCCAAATGTCCAACTCAACTAAGTTAACTTCATGAATACATAAAGCTG
ATCCTTGAGGAGAACTTGACTATTTCTCTGAATTAAGTATTGGATCTGGA
TTATAGTTTAATCTTGTGAACTAGAGTACAAATGCATATCAAATGTTCTT
TAAGTTAAGTTCTGATACTGAACATTATGTTATTATTCTTACAAATGCTC
ATTTGTTTCTTCGCTTGATGAAAATATGCCCTATTTTTTGCGGAGCATAG
GTCAAGGAATGCACATCTGCCTTGTTAAGTTTTGCAAAATTGACGAACAT
CCCTGTTTTCTTGGTAAGTTACACACAGCGAGAAGTTTATCATTTGTCCT
TCATAAATTGCGATTATATTTCCTTGATTATGTTCTCTCTCTTTCTCTTT
TACTAGATTGGACATGTCACAAAAACTGGGGATATTGCTGGCCCTCGTAT
TCTAGAGCACATAGTGGATGTTGTTTTATATATGGAGGTTGGTAAAATAC
TGCTTCCTAGCACATGTTTTGCCTATAACGTGGTAATATTTAGCAGGACT
TTATCAATTATACTAGTACCTGTGTATGCTGCCTGAGGATGCCTTGTTTG
TTGCAATATTTGCGTGAGAATGTCTTTTTTTTGGTAAATAATCTTCAAGT
TCACACTTACTGTTAAGAAGTTACTAAATACAGTAACAGGTTTTTAATAG
TCTACCATAACCTTCCTTTGTCCACACCAATAACACATGAGTGAGGTTTG
ATGATTTCAACCTCCCATTTTCAAAGTTGACCTAGCGCGACAAATCAAGA
AAACCAACTTTTGTATCAACATTTCATTGTCACTTGAACACATTGTTCTA
GAATCTTGGATCTTCTTTATTTATTTGAAATAGATAGGGATCCTCTGCAG
TGGTGTAGAAAATCACCGTAACTGCAATCACAGTGAATTTTCTTCACAGA
CGCAGGCATGGTTTTTAAGACGTTAAGGCGTCATAAGGCGATGTAGGGGC
GCTCTGACGCCTAGGCGGGCGCTTTGGACGCCTATGCGCCTAAAGCGCCC
ATTTTTTCAAGGCGGAGAGGGGCACCTGGACGCATAAGCGTTGCCTAGGC
GACGCCTTTAAAACCATGGATGCAGGGACTGGTTCTGAAATGGGATATCC
TTGTTAAATTTTGTATACTGCTGTAACATTATAAATACATTGAGCTGTGC
TCCGAATTTGTTTCCTTTGTTGACTAGGAGTTGTGCTGCTACATGAAATT
GTTTTTGCCCCCTATACATTTGCCCCCTGTAGACCGTGGGAGATAAACAT
GTAAGAAGAGATACAGAAAGACGTTTTGTAACATCCCTACTTGTAATATC
TACTTATAGAGGCAATTTGCTACCTATTGTTGATTCAAGCCGTATAAACC
CATTTCAGTTTGCCTTCCTAGTCAAACATGGGCCTGTGTGTACAAAACCC
GTTTCAGAATTCTCGTGTTGAATTTCTTGGGCTGTGTGCTGACTAGGATG
GAAATGACTTTTTGAAGTTTCAGATCAGTGTCATTGCTCTTTATCTGTTA
TGATCCCCCGTTTCCATATGACTTGGATGAAAATGGCTTTTTGAAGTCAT
TTTTTGTATCTTGCTTATACTGTTTCCCTTTTGTCTGATCGTGGTTTGTC
CGTTCAAAGATTTCCACATTAGAACGGTGTCTCCTATTCTTGGATCATCT
TCTATTTGCTGTGCATTTCACTGCAAACAAACATCAAGATTCTTCATCTA
TTGTCACTGCCCCCTTCATATAGAATGTTTGAAGTCATATAGGCTTTTCA
GAAAAGCAATACTATTGTTTATAACTAAGGCAAAAAACATGTAAACTTCT
AAAACCATGCAACTTCACTCTTTTTATGCAAGTTCACATGCAAGCCTGAC
AAGGTTGATGCTCTTCTTTCAGGGAGAAAGATGCTTATCTCATCGACTGT
TACGGTCAGTGAAGAATCGTTTTGGTTCAACAGACGAGGTATACAGTATA
CCCCTGTGTTCCTGTCAAATATAATGCATTTCTTAGTTTATAAAAAACAT
CTGTGTCGGACTTACCTGTCCTGTTAGTGCTAAGGATTTTCTCCTTAGTT
GCCTGTCAGCTTCTGACGTGATATTCCAATTCAGGGTGGCTAGTAATATT
ATATCTGCAGTAGATTATACCATGATTATTGAGTTTCTTTCTGTGAAATT
CTCTCCAGCCTATGCAGCAAGGATCCTACAGTGATATTAGTTTCCTCTGC
AGCAATGATCCTACAGTGATTTGCTACAGTTTTTTATTTGCAAATCACTT
ACGCAACACAACATTTCATTCGAAATACCAACTTTCTGCTTGTTCGAGCA
TCGTTGCTTAAGCCATAACATCGTCGTACTGGAATTAGTAAAGATGCATC
CTACTAACTAGATTCCACCTGCATAGCACACCAGCCACAAACTGTTCCTG
AAGCATATGTATGCTACTTATGCCTTCTCTTTGTCAGCTTGGTGTATTTG
AAATGTCAGAATCTGGTCTGCAAGCTGTTCTGAATCCCAGTGAGATGTTC
TTAACTGAACATGCATCTGATTCTGAAATACTGGCTGGGCTTGCTGTAGC
TGTTGTTTTGGATGGGTCCAGGACCTTCGCTATTGAAGTTCAGGTACTAC
ATTTGACGACCATTCTTTAGTTTGTTCTCTTAGTGTAATGTTGTGTTGAG
CTTACTTTTCTCAAAGTGGAACTTTACCAATAAAATTCATCTTCCATTGC
AGTGAGGGTTTTTGGTATAGAATGTAATTCCAGTAAGAGAAGTTAAGAAA
GTACTATGTTATGCTGTTATGAACTAGATTCACTGTTGTGGTAAAGCTTG
TACCAATCTGTTAAATAGGGCCCATGGTACTGTGCTTTGTTCATAACCTT
TTCATCACTTCACTCTATGTTGGACCTTATAAAGACCATTCATAATCTTG
GGCACGCTGGTTAGTGCAGCAGAGTTTATACCTGGAATGTTAAAAGTTCT
AAACATACGTTCACCTTTCTTTTGCACATTTTAGACTGCACTGGAAGAAT
TACGTGTATTTCTCTGTGAGATGTGATTTGTATCCCTTTTTTCAGGCACT
GTGTGTTCCTAGTTCTCGTACTCGAGGACAAGTTGTTGGCATACCAGTAA
GCAGGGCTGATGTGATAATATCTGTAAGTATCGAATCGTTTCTGTAATAC
TTCCAACCAATAAAGCATGCTGCCACTCAAGCATTTGCTATGCTGTATAA
TGAAATCTATGGATATAAGACCTGATGTGTAATGTTAAGTTTATTCTACC
TGTATTTTGGTGTTATAGCAGCACGAAAATACATCTAATGACAACTAATC
TCTTTTCTTAATCCTGCAGGTTCTTATGAAGCAAGCAGGTCTCAAACTTC
AGGATAATGTAAGCTCCTGCAGCTTCTGTTTTCATAGCTCTTTCTAGTTG
CATGCAGGTTACAGTATTAATTCAGAGACACAGTCAGTAAGCTGGCGTCA
GTTTAGTTCTGGCTAGTTGCTTGGTTGACCTTTCAGGAGACCTAATTTAC
TGATTTGCACCAATACTCCTCCAAGCCACATATGTGCCCTGGAATGTAGG
GGCATCGAAACAAATGCTGGCATGCTCTAATGTATATTTAGTGACTATTA
ATCTATTATTACATGGATGGCAGTGGCCTAACTGTAGTAAGTGTGCAAGG
ATTTGAGTCGATTTTAACTATAAACCACTCATTTAGATGCTTTGTTGCCA
TCTTTGCTCCACATTCTGCTTTTGGTATGACTGTCTGTTTGCGTTGCAGG
TTATTTTTCTGAATGTGGTTAGTGGCTTCGAGTTGACAGAGACCGCAGGA
GATTTGGCAATAGCAGCTTCTATTTGTAGCAGGTAATTCATTTTGTGGTT
TATGCATGGGTGTTCATAACTACTCGATACAGTTTCAGTTAGCATAAGTA
CTACCATTTTCGAGTGCGTCGTTTTGGATACATACGGATGTGTTCTACAT
CTGTATTTTTTTCTTAAACAATACATTATAGTTTGGGCTGCAAAAAAGAT
TCAAAATTGTGGGCCCCCAAAGGCAAAAAAAACTCGATTTTGCACCCCAC
ATCTGTGTTCTTTTGTGTATGTCACACCTGAGAAAATATGTTGACGAAAA
TTGGTAGGCACATACTAGACATGTTTTGTATATTTTGCCAGAGTTTTGTG
AGTTTTCAGAATGTAGTTTATTAATTGGATCTGAAATTATTATTTGCTAG
ACCTCCCTCTTTAAATACATCTCTGCCATGGACCCTGTTTTAGGTTATGA
TGCAAATTTTCTTTGGGTACTATTTATGTTGCTAATTAAGATTTGCTGAA
TAAACTTTTAATAAATATCACAGATTTAAGAGAAGTGTAGAGGTTCATTT
TTGTATATATTTCCATATCTGTTATTTAAGTTTACCCATTTTGTCCTTCC
TGCAGTTTCTTGGAATTTCCTATCCCAAATGATATTGCGTTTATTGGAGA
GATCGGCCTTGGTGGTGAACTTAGAACTGTAAGTTTATGTGTGTTTCTGT
TTTGTGCGACCACTTATCAGTTGAGAATTTTCTTTATTGGTACTTGTGGC
TTAAAGGAAAGTGCTTGTGTTTGAGAAGGAAAATTTACATTCGGAAGAAA
AAACATGTGAATCTGGAAACAGGATCACCTAGCTCTTTTCCCTGTGACCT
ATTTGGATGTTTTTCTGCTATTAATATTTGCTTCAGAACAGTGCTTAGGA
ATTATACCTCTGACCATTTTATGGAAGCAACTCTCCCCAGCCAGTAAATA
AATATTACTATCGCCCGTAAAATTTGCAGAGCTATGGATCAGGTTCATAA
GGGAAGTATGGGCCCACTAACCATGTCTTCCAACCACTACAGTGCCCTGA
TCCAGAAAACAACTTAGCTAGCAAGTTTTCCTATTTTTTAATAATATTAT
GATATGATATGTTTCTGCTGAAGAATTTGAAACAGCAAGCTGTTGGGTAG
CATTGACTTATAGGTTTTTATTTATTATGTAAATGCATGTTAGAATGGCT
AACCTTTTGCTATCCCTGATTTGTACGCACGTGGCAAGAGTGCAAATCAT
GCTCATGTAGTCCATATGATTTCTTAGGCCAGGCAGCTTGTACCATGAGC
TTACTTAAATGAATAATGTTTTCTAAAATGTAGATGCACAAAAAATAACA
TTACTGTCATGATTTTGGAATTTTTGATATATATAGTTCTTTAAGATGTA
CACCCTATGTTCCTAAATGTAAGACGTTTTGGGAGTTCAATAGGAACAGA
GGTAGCACTTCGCTAGGCATATCACAAATACTCTCTCCATTCCACAATAT
AAGCCTTCTGACCACCCAGAGGGAGTAACTGCTAATGGACTTCTGACCAC
CCAGCTCATACTAGTGTTGCTAGGAGTGTCAAGTGGCTGTGCATAGACGA
AAAACTCGGTTTTGGAAGAATAATTTGCAATGTATATGGAAAACAATAAT
GTGCATTAGTTTTATCACATAACAAGGCCTGCGAAACATAACTTGGCATG
CATTACTATCAGGAGTACAGCATATCAAGGAGCAACCCCCTATTCCTTGT
AGTCTGCACCATATGCTCAAATTTCTACAGAATAGGGAGAATAAGGTGTC
ACAAGGAAATATGCGTTGTCTATCCATTTTATTTTTTTGATCAGGATTTC
ATGTTGATCTGTTTTGCCTGATCTCCCAGGGTTAAAGGGTTTTCAGCCTA
CTCCGAACTAAAAAGTGTTGTATTAATGTCAATTTCATATTTCATCTTTG
AAGGTGCCAAGGATGGATAAGCGGGTAATGGCTATCGCGAAGTTGGGATA
CAGGAAATGCGTTGTTCCCAAGACTTCGGAGAAGCTGCTGAAACCGCTTA
ATCTCGATGGTATCCAGATCTTGCCCTGCAACAACCTGAAGGAGTTCATA
AATACCGTGTTCAGGCCTGAAGGATGATATGCTCCAATCCATCCTGGTGG
GCTTCTCTGCTTGCAATTAGCTGGCTAACTGTAGGTGTTCAGCGTGCGTA
GGTTCATTTGTCAATATATCTCGGATAGTTCGGTTGATGTGCTGATTTGA
TTTGCTACAACGTTTCACGATGAGAGCCGTCTTGTGCCGGTCCCTTTAGC
TAGAGACCGAGGTTGAGCGCGCATTCATCTGAAGAAAAGGTTGGTCGTGC
ATTTTTGGTGGACCCTTAAATTTGGTCACGATTGGATTGCATCATTGCGT
GAGCGCATGATCTTGCTAGGAAAATAGTTACTGTATGCTCCAATCGGATG
GTTCAGATAGGGCTGCGCATAGTCTTTTTTTCAGATCCCGTGAGATATTT
TCCGTGGAGCCAGGCTGAGTAGAAACACGGCTTGGGCCAAAGTTCTGTCC
TGTATTTGGTTACCCGCTCTTTTATTGTTAGGGAAGCTGGGAGAAACTCC
CTCGGTGTAAATTCACAGCTGAATTTTGATCGCCAACGAATTTCCGACAG
CTTCGAGTTTGCCTTGGCAATCGACGCAACGCAATATCGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.