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GrainGenes Sequence Report: AA005203

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Sequence
AA005203
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005203
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAGGTCGTGGCCTCATGGGCGGTGGCCGGTTTCCTTTCCACACGCGTTCT
ACTTTTCCCCTCGCATCCCTTCCTCCGCGAGAGATCGTGGGCGCCGCCAC
CGCCATGGTCACCACCTTGGCATGCTTCGCTCCGCCGCCGCCGTCGTCGC
CAAGGACCGAGAGGTAGCAGAGCAGCTTCCCCTTCGTTACCCGCATCGAA
CGTGCCACAGAGGGAGGAGCCGGAGCAGCCCAGGACTGCTTTCCGTCGGC
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TCTCGATGTGGAATTGGTGGGAGACTTTACAAATAACTAGAAAAACAAAT
TGAAGTGTAACCACAGGGGTGGTTCTAGATATGAAGCTGAAGTACGACTT
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AAGATCCCTTTGTGCCATGGAGTTCATTATTGCATGAAGATAATACATAA
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TGCCTCTTCGCTTGATCGGGATTTTCTGACCATCTCAGATTTGGTCTGAA
CGACAGGTGCTACTGCATTTCTTTTTGTGCAGGCTTTCTATTTTGATCAA
GCTGTTTTATGGTAGTCTAAGAAGTTTGCAAGTGTGAATGAATATACATA
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AATAAAATTAGCGTTATTAACATTTAGTAATTTGTAAATAAAGGAGACAG
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AAAAGAATGAACTCAAGGTGTGCCACTTATGACCCGTGTAGGCCATTCCG
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TAACACAACAAAGTTCTGGTTTATTATTATTCTATATATTTGATAAATTG
ATAACGCATATAAGAATCTTACAAGTTCTATCTCATGTGGTTGCGATCAT
ACTTAGAGCTCCAATAGTTATGACATTACTAATATTTGTCTATTGTGTGA
TTATAATAGCATTCATTTTCCGAGCTTGGGTTGTTAATTTGTTTCCTCTA
AAAAATGTGGAAGTCAATTTCAGAATACTGAAAGTTTGCATGCCCTATGT
TTATTACTTCACAAACAGGTTAATCTTAAGAAGAACCACAACTTTGAGAA
ATATCCCATGTATCTTCACAACAAGTAGGTATGATTAGCTCTCACATCCA
CGATGGCAGAAATTTTATAGGTTTTAGCCTATTTTTTTGGTATTACATCA
TGTGTTGTGTCAGTAAGTTATGTTATATGAGGCATGGTCTAATCAATTAG
GTAGTCATACATGTGTTGAGGTTACAGATTTTAAGCCATCCAGTTTGTAA
CGATAGTGAATTCCGTATGCTTCATAGGAATAACTTCACAGGTCAAATAT
GTAACCTCACTCTGAAATTTATTTGCACGTATTTAAGAGAAAATATATCA
GGAGAAACATCTATGTCTTAGAGCTGGAGTCAAAATTACTAAAGTGTACC
GTCTAAAATGTATAATCTTACTCCACAACTCGGCAGCCGATTAAGGTTAA
TCTTTTTTTATTTATGTGCATACATATATCCATTAATTATATGATTATTG
TCTACGATATATCAGAAAGTTAAGTGTTTAGTAATGTAAATCACATAGTG
TTTTTATAGAAAAGTATATCATGTAGTGTTGTGTTGCCATCTTGGCTTAG
TAGATGAATTTACTTATTTTGATTTTCATGAACATATGTGTGAATTAAGT
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GGCGTGGCAATATTCCTTGATGACCATCCATGTGCAGTCATACTCATATA
TGCGGTATTTCTTGGGCTTTCTCCTTTCTCATAGTTTCTGCCTTAAAGAA
ATTGAATAATCAAGAACTCTATTGCTCTCTTATTTTGTTCCTTTCTAGAA
TAGCTGTATGAAACTTCAAGTGAGTGAACTCTTTTCTGTTTATAATCCTC
CGCAGTGTTGCTTGCTACTTCGTTTCAAAATAACGACCTAGGATGTTCAT
TGTTATAACCTTTGTTTAGTTCCATGTGACCTCTTCTGGAGGCGTTTGTA
CTCTGACTCTTCTACCTTTTCAATGGAATGAAACGCAACAGACAACAGTC
TCTTCCCGTTTCGTGGAAAAAAAGTGTTTTGGTTTTAGTTCCATGATACT
TATTTTGGAAACGGAGGGTTTACTTTGGTGACAAAAGCAAGTTATGCTTT
TTTTTGAATCTAAAGCAAGTTATGCTTGGTAACCTGTTTGCATGATCTAT
TTTATTATTCACCGAATCTTCATTTCATAATTGTGATTACTTATTGTGTG
CTATTTTTTCATATAAGATCTCAGGTTTAGAGTAGACATACAGGAAACCA
GGCCATCAGCACACGTGGTGATAAGAAACAAAAAAAAGAATGTGCACCGT
GAAAGCGAACATGAGTCACATACGATCAAGTTTTGCAATGCATCTCACTA
AGACTCATGTAGGATAGTTACTTAGCTACCAGTGCACAATATAGGTGCAT
CTAAATGACAATGTAGTATTTTGTTATAAACTAAAAGGACTGGGCATGCC
CTCTCAGAATTGACATGTTGTGTTCTGTCTCAGTTATGGGTTTGTCCGTG
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TAATAGACCATATCTTAGTTATGGCTGTTAACAGAGTGAATGTTTTGGTT
TTCTAGAACCGTAGCCCTAAACCCTAGCACTAAACCCTGATGTACTAAAT
TCCTTTCTAACAACATTGAACTCCATCTTTGTTGTGTCCTAAATTTTGCT
GTCAAATTAGCTATGATCATACCGATGCTTGCTGATTATTGTTGTTGCTA
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GTTAACTCAAAATATCTAGATGATCTAATTGCATGGTTCACCCATCCGAT
TAGCATAGTTAATCGAAATAACCACATGACGCCACAATACAAGTAAAAAA
TTCAAACAAAGTTGAAATGTTTATCGTCGTCAAATGCATTGTGACACCGC
CATGTAGGTGGCGAGGCGAAGTCGCATGTCCGTCTAGTAGTTTATAAGCG
TGGTGATGAGCGAGCGTGCTGAGGGCACTTGCGATGCGTTGTGTTGTTCT
TATGCCTCTGCTTGTGGGCCTCCGTTGCTTTGTCTCGGCGGGTTTAGTTT
GTTGGTGCGGTGTGCACTGTGCACTGCTGGCAGGGACCCGGTGGATGGGC
GGTGACAGAGCGACTTGGCATGCCTTCCAACAAATTCTCGACCCGGAGAA
TCACGAACTCGTTCAGCGCTGAATAGTTATCTCAACCGTTGCCTGTAGTT
GGAGATTCGCACGCGATGTTGACCGTCCCCCCGTTGCAGCGCCGTATATG
CTCGTATTACCCCGTCAAACCATCAGGAGTTGTCGATTCCGCATTCGCAT
TTGCCGGCTCTTCTCTTATCCCCCGCTGCTCGCCACCTCTTTGAATCTCG
TCGGGGAGACTCTCTGGTGCGCCATTCCTCTCGCTGGTTTCTCCTTCGAC
CTCACTCAGTTCGAGATCAGTAGATTCCGAGCCGCTCTGGGGGCTCCCCC
GACTTGAATCTTCCATGGATGGCGCAGTCGAGTATTCGTTGGCGCATTGC
AAAGGATCCATCGCTGGCATCTCCATGCTGTATGAGCACAATGAAAGGCG
CAAAAGATTGGGGAGAAAATTAGACCTCGAACGGAAACAGAACGGCCTGG
CAATGCGTCGAGAACATACCTTAGCAACAGATCGGTGAAGCTTGGGAGAT
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GCCAGGCGTGTGTCGGGAGGCATGTAGTGGAACCCGCGAATGGCCCACCG
AATCCTATTGGTATCAAGCACCGTATATCGCAGGAGTGCGGCGTATCGAA
CGAAATCATCGGTCAAACCTGTCAGCCCGGTGGGACCGCATTGCGAATCT
AGAAGCACATTCGAACGGCTGGGATAGCTATTCCGCGCTGAAAGCTTTCG
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CCTTCCCAAGGTCCCGGGCGAAGCCCTACCCGTCCCCTCTCTCCTTGAGG
CTACCGCCTTTTGCTCACCGTCCGTGCCGCTTCCTCGCCTTATCTGTGCC
GCTCTCTCCAGCGGAGGCACCAGCCTCGCCGTCATGCCCGAGCCACGGCG
CCGCTGCCATGTCCTTTCAGGACGTCGCGCATGCAGTGACGACAGTAGCA
GGTGCTCGGTTTTTTTTGCTTTACCTCCAAATTGAGTCGAAACCATCCCT
GTTTGGGGACTTCGTCTTACAACATGGTAGCCTATTTAATCGATTCAGCA
TCTCCCATTCTATCCGATTCTGGCTAATTATTCCTTTTTATCTTGGTGGG
GGCGCAGATCTGCTCCATCCTGCTGCAGAATCGGTAGGGGAAGACACACA
CAACCAAGTCCTCGCTGCCTCCCCCCTCTTTCTCTGCTCGCTGGCCTTCC
TAGACGGCAGCGTGCGCCCCCTTCACGACCTCTGTGTCGAGCTTCCGGTC
GCAGACACCAAAAAAGAGCACAAGCAACGGGGTCAGCAGTGGCAGTCGCA
ACAACGACGCCAACTTGCCAGCAACAACAAGGCGCGCGACCATGGCAACC
TGCACACTCAGTCGGCGGGATAGTTGGCCGTGGGATCCTAGGGGAGCCGT
CTCGGCGTCTAATCTACGGTGATGCCCCAGGATACGAGGGGGCGGTAGAG
GGAGGCCTTCAAGCGCCACCATTGCCACCATCATATGCGTCCGCCTCTCG
TGCTTTCACGTACTGCAGAAGCACCTGCTACTCTCTCTTATGAGGTTGGT
GCGCACCAAATGTTTGATGATATGTTTGTGAAGATTTGTTTTATGGGATA
AATAATGCTCCGTAAATCCTTCAAAATTTAGAGGTGTATCAGTTCAACAT
AGAGTAGATTCCATGGATCATCCCCACCAGCGAGATTGATGCGTGACCAT
GATTATGTTCTTATTATGTTGCCGTAATTTCAGAATATTGTTGTCCTTCT
AGGTACACCAGTTGCTGCACCGCGAGGATGGAGAGATGAAGGTCCGAGAT
TGGTGTGATCGCGGTGGTCATGGTCGCTGCTCCACTGCGACTAAGCGGAT
TTCTGCACGCGGCTAGCCACAAATATCATGAAGTAAAATTGTCATGGTTC
TTGGGTCCGGGTTGATTTAGAACGGATTGATTTTTTTATGTAGGATTGGT
CTATTCAGTCCACGTGTAGGTTAGATTTTCTTGAAGAAGTTATTTTGTTC
AAATATGATGTGATAATGCTAGCTAGACCAATTAGTTCGAATTTGGTAGA
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AAGTAGACATGGACACATGTGAGGTTCTCACCATCTAATCCTTGCAGGCT
GGCACTTCTCTTGGAGTAGAATTAAATGGAAATCAGTAGCAAAACATGAG
TTGCACAATTGGTAATGTCATCTTAGAATCAGGCTTTGTTTGTATATTTC
AATGTAGCCCCATGATTATATTTCCTGCTATCCGTGGGTTGTGATGATAA
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TCCTGACATCTCTGTTTACATTCGTCATGTTAGCAATAGAAAAGGTGGTT
TGTGACTATATGGAAATTTGTGAGAAATAATAGGTTTATCATGTAGCAAT
GTACAATATTATAGAAAAATTTATATCTTGCCTTGCCTTTAAGTGAATGT
TAGTTTTAGGATACACATATACTATCTACGTTTTACTAAAAATATTGTTG
ATGCGTTTTTATTTTGAAGGTCCAAGATTGGTGTGACCGCGGTGATCATG
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GTGATAATGCTAGCTAGACGAATTAGCTCAGATTTGGTACAACCAAATTT
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AACTTAGCTATCTTGAGGTTCTTATATGCAGCCTCCTAGAAGAAGCCAAC
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TGAAGACTGCCCCAAGCAGAAAATCATTGACACATGCTACAGTTCATATA
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ATGCTGTTGGAGCCATACAGGAAGCTTCTGTTGTAGAAGTTCGCTGAGAT
GCTTGAGGTACCTTTTTTTCCTGGCCTTGTGATGTTATGATCAAAGAACT
TATATTACTTCATCATTTGCTAATGACTTCCACAAACATCTCATATTTAT
TTGGGAGTCAACATTAATCTAGGATCTGTACCTATTATGGACAAAGCAAG
GTTCTAATTTCTAGTGGCCTCATGTTCAACACTTTGATGGTATAACATGA
TATGTCTATTAAGATATAGCAGAAGAGAATCTTTTGGTTTGATTGGGTCG
TACTATCACCTGACATTGTTTGCTAGCTTTATCCAAGTGTGCATCATTGT
ACATTGATGCTTTGTAATTCAAAGTAAGTAAATTCACCTTCAGCTTCTAC
TAGGAGAGCTCAAACTGAATTACGCCCTTATAATTGTGATACAGAGTAGC
TTCATATTTTAGTGTTAATGTTTGGAAAATCCTTACCATATTGATGAATC
AACTGTTCATTTTAGACTTATAAGTGGCCTGTATGATACGTCTCGCGAGA
CCTTCAGAGCTCCACATGGCTTGTGGCCGTAGACAACCTTGACTGCATGT
TCCTGTGCTGATGATAAACCCGCCAGATACAGGACATGGTTAGCACACTA
CTATAGATTGATACTTAGCAATGTTTTTTGAGCAAAGCCTACTGCTATTC
ACGTGACATGCTTCCTTCGGGCTTGCACAAGATCATTATGACCCATTGAT
ATCATGCTAAATGTCCAAAATTTGGTTTAGTTAGTTAGAATTTTGCGAGT
TCTGCCATGCTGTTTGGTGAAATCAGTCAAGGATGGGTAGAATATCAGTA
GTGATGCTGTCCCAAAGTGGGGGCGGCAAATATTGGGAAAAGATGAGCTA
TGCCAAAAATGGCATGTACAAGGGTTTCCTGCATGTGCAAGCTATCTGGC
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CGGCGCCGACGGCTTTGATGAGAATTGGGAGAAACGACTCCAGTTGTGGG
CCCTCAAGGACAACGTCCTCCACATGGTGGTGGTGGAGGTGACCATAAAG
TCCGTACGCTCCTCTGCAGCCGCACCACAGTGCACGGAGAAGCATTGCAT
CCCCGTTATTATGTTCTCCATAGCCAGGTACATGGACAATTTCTTCCGCG
AGAAGACGTATGCTTTGATCCTGTTGTTCCTGATGACGATGCACCTGAAA
GACGAGGTGCGCAGCTCTGATTACCAACTACAGGCCTCCATGGGTGCAGA
AGTACACACTGGTACTGGGTAAGTTCTCCAACTACGATGTGATCAACTTT
GATGAGGACGCCAACATGTACTACTTATTGCAGGGTTATCTTGGCCTATA
CTGCGACCTCATCATTTATTCATATGAAATGTGTTAAATGTTTGAGGTTT
TGGGTAATTACTTATACTATTAAACCATTATGAGCTTTCGGAGTAATTAC
TTAATACTCTTGCTTCTCTTTTCATGCAATTCCATCTAAATCCATCTTTT
TCTCAACTGGTTGCTCTGATGGCTATGAGTGTGATTGAATTAGCTACTCG
ATCTACTCCTTAGTTTTGTTGAACGAATTATGTGCATACTTTTTTGCCTA
GTGTAATGGTTGATACTTACCATCATAATTTTGGCTCAAGCTAGCAAATG
GATTAAAATTAGTTATGTTTTCTATAGGAAATATATGACAGTAAACACTA
GAATTTTTATGTTGGTAATCATATGGTCCTATCTATGATTGATAGACTAA
TTGTCAAGGTGTAATGAAGGTACATGCATTTTGTTTCCTTTTTGCAGCTA
AAATAAAGACTACTTCACTACTTTGGATTGTTATTTTAAAGTCAAAGAAA
TCATTTTATGGTTCCCCTTTTGTATGAAGGCACAACGCTCCGTCTATGTC
TATCAAAACAAGCAGGAATGCGCTACACCTGTCTCGCCCTGGGACTACGT
CATACAGGCGGCGCGGCGAAGCGCGCTCTTCGTCTAGTCTTTATGCATTA
TGATCAAATCGGATGAACCTGATCAACTATGGATTTTCCCCAGGATATGG
GTCAAACCCAATGTGAATAAATTTCATACTTTACAATCTTACTTGACCCT
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GCAAGTAGCATGTCATACATTTCAATAATCCTACACTTCTAGAGGCCAAA
GAAATCTCTCTTGTTTTGAATATGGAGAGGCGCCAATCTCATCTTGGTTA
GCCATGTCTCATAGCTTGCTTGTGACAATTAAACGCCAGGACAACTTTTG
ACTAGCAAGTGGTAGAATAGCATTTGGCTACTTTGTCATTACGCATCTCA
AATACATGTGACACTTGCAAGTCTACAAACTTATATATAATGTACTCCCT
CTGTTTTAAAATATAAGATGTATTAGCTTTGTGAAATAAATATATCTAGT
ATATTTTTAGTTTGTAGGCTCACTCATGTTTGGAGTGAATCTACACAATA
AAAAAAGTCTACATACTTTTTTTCACAAACCTAAAATATCTTATATTTTA
AAACAAAGGGAGTACATTCTTGCATTTTTCTCAAGGTGGGTCAAACCATC
CAGATGTTCTATAACATATCCATATGATTGCTTCTATTAAACATTCTTAG
TAGCCAACATGCATGCTAGTCTCTATTTATAAGTCTTCGAGTAAGATTTA
TTTTAAAAACCTAGAGGAGGATGAGTTGGACTTCGTCGACTGGTGGCTCA
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CATCTTCAAAAACATCTCTCCGGATAACGGAGGCTTGAACCTGGGCTGAT
GCTGGGGCAAAGGGACTACGTGCCCTGATACATGTCATCTAGATTTAGGG
TGTCGAGTGGGTTGAGTTGTACAAGGGGTTCGCTTGTTTTCGATCATGTA
AATTTGTGTACAGAATTTTTTTTCTATCAATGAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.