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GrainGenes Sequence Report: AA000600

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Sequence
AA000600
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA000600
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTAGCACCTCTCTACCTGGAGTCCACCTCACCTAATCTGGTTTCATCGGA
GAGAAGAAGCGGCAGTCCTCCCCCTCCCTCTCCTGACTCCCGAGAGTCTG
TCTCTTACTGCATTTCTCCACCACCACCACCACGACGGCTGGCGCCGCCG
CCTCGCCGGCCCGCTCGATGGAGGAGCCCGGTCCCAGCCCGGACGACGCC
GTACTCTTCTTCGGGGTCTCCCTCGTGCTCGGCATCGCCTCCCGCCACCT
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TTGGGTGGGGGAGAAACTCTCTCTGTTTATTCTTAAGAAGAAACAATAAA
AACTCATGTTTATTTGATCCGGTTAGTAATTGAAAAGGTTAATTCTGCCC
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GTTATCAAATTGCTCCATGTACAGTTACAATATATTTTGGACTCTATTCA
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CCTACTTGACTTTCATGAATTTCCTCAGAGGCGTGTAACAGATTCTATGT
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AGTGTATATCAGAGGGTTCTTGTTCAAATCAAAAGAATATTACTTTTTTG
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GCATTCCAGCTTTTTAGACCTATTGACCGTGTGCTATTAAACTGAAGTTG
TCATCCTTAAATCTTGATGAGCTGTCAATTTTTTATTAGGACAAATTTAT
ATAAGTATTCATGATTGAAGCTTATCATTGCTTGGGCTTCATTTCATGAC
TTACTTTTTCTCTCATGTCTGCTGCAATACTGATTTCAGCCACAACTAAA
TATAACTTTCCGTTTATGAGGGTTCTTGTTCAAATCAAAAGAATATTACT
ATTTGTATTTCTGATTCTTACATCGAGTAACCGATTACATGTCGTGAAAA
AGAACTATGCCTTCCCTGAAAATCTTGAGAATCAGGATTTTAGATTTTTT
GATTTACCAAGAGATGGTTCAGTTTTCATTCATAACCTAGTTCAGTCAGT
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TATTTCTGTTACTAATATTGTTCGTTATCAGGCGCAAGATGCATTGGAGG
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TTCACTTTCTTATTTGCATATTCCTTACTATCTTTGCTCCAATGTTAACT
TTGTCATACCGGCAGGTTCTATGCTGCTTTTGCAAAAACTGCCTTTAAGG
GTGACAGCCAGCAAAGTTTACATCATTTCTGGTAAGTTCAAGCAATATAT
GTCAGTTTCTGCTGTCAGCAATGATTCTCAACAAATGATCAACCTTAGTA
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TTTGTGATGCTCCATTTCCGTGAGCATTTCCTGAAATTCAGTATGTTTAC
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TTGTAACAGACATTGTCGTCCTGTTGTTGAACCCCAGTTTGTATAAAATT
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GCTTATATTGGAGTCTCTAAATTCCAAAGTAATTTGCATGAAAAATAAAA
AATGGCATTCATAGCTTATCATTTTGCTGATGCCGACATCATCCATGCAG
TGTAAATGTGTAATTGCGTTCTTATCTCTGTCTTTTCATATGAAATTTGG
TTATAGAAAGTACATTGTGATATCTGTCAGTTCACAATAAATTAGGCATT
ATTATGAATTCTCATATAAGCCATCATCTAAGGGAATTATTGATTCTGTT
GGAGTGTCTTTCTTATGGTAACTTGTATGAGGGCCTAAGTGCAAACATGT
GGTAACAAAGATGTGTACTCTCCTATTTGGAGACACATGATTTCCACAAT
TCACATTAGATTGTTTTACATTTTATGAGATGTGTATATTTATGTATGAA
CTTCCTGTCTGATTGCTGTCTTGTATCCAGGGAAATGATTGCTTACATTG
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CATGTCACAGAGAATAGTTTTTGTTGTTTCTGTTTTTTGCCTGGCTAAAC
CCGACCATGCTTGCTTTTGTTTTGTACAATTAATGTTTAACACATGGATA
CTGTTATAATTTCATACATCTGAATTCCCTTCAGTGGGGTTGTTATTGCA
GATGGTGTACTACAAGATAATATCCATTTTGAGAGACATGGTATGAATTT
TCATTTGTCTATATCTACTATTCATTTTTAACAAAAAAAAGTGCTATATA
AGCATTTCTACTGGTCTGTTACAACCTTTATGTTTGTTTTCCTGCTGTAA
TGTGTGAAGTTTTTTCACCAAAGCCTTTGGTCCCAAGCAAACCAGAGTTT
AACCATTGATCATGGTATTGCAGAAAGAAAACTAGAATCATATATACTTG
GAATTTGGGCTTTCAAGTCATGTGCACTTCGTTGAGTACTTCAGCTTCTG
CACTAGGGGACAAAATAAAGTTGGTGGGATGTGTTCACTCCGTGAAATCG
TATTTATGCGATTTAAGGATGCATAACGCCGTAAAGCAGACCTTTATTAC
ACGAATAAAGCTAGACCTTTGACCTTAGAACACCAACAGGTCGGAGTCTA
AAGATTGCTTTTAAAAGCAAAAGTAGTCGCATAAGTCATTCTGCGTGAAA
TTTGGATTTTGTTCTAGAAATTCATTCAAGAATTATAGAAGAGAAACCAT
TATTATTTTTTATGAGTATACATAGATCAGTTCACATATGCACTTAGATC
AGGCACTGTTAACATGATTACATCCAATCTGATCTACTTAACATCATTAC
AGTTTACCTCAGGATGTGGTCTGACATTTTTCTTCATTATAGTCGCGAGT
AGTCAACACAGTCGTTGGACCAAATCCTCGTACAACACACTCCATTGAGC
TGCTGATATATTTTTACTGCCACATGGTTCATCTGCTGACTGCTGAGTAA
TGTATTATCTCTTAGGATTTAGGGTGCTCCCTTGATCCCACCCTTCAGAA
AACGGTGTAGATAGTCATGGGATGAATCAAATTAGTTAGATAATGATACA
ATTTAGCGTCCTATGGAGAAGCAAAGAAGATAAGTTCTGCGAATGGTAGC
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CTCAGGGTTGGGCGTGCCTGATATATTCTCCCGTTCTATATTATGAGCTT
GGTTCTAACCAACCTTTGTGTCGTGCGTATAATCCCCTTATCTCTTGCTA
TTTTAGGCGCTTCATGGGGGTTCCTTCTTCTGCTCTATGTGTTTGTGCAA
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TGCGAGGGGCTGTTGCTCTATCACTCTCTCTGTCTGTTAAAGTAAGTTAT
TTTTCTTGTGTCAATGCCATCGACTCTCATTCATTTGTTGTGGCCATTAT
GTGCACATTTTATTGAGTCATTGGCTACATGTTTTCATGAGATATTACTG
AAATAGTTTTGCTAGCGTGCTAGTGATGGAGTTCAACGTTATCTGAAGCC
AGAAGTCGGAACAATGGTATGCTCTTTCCTTTTTCCTGAAAAATTCTGAA
AGATTTAATTTGATCTTTCCTAATCTTATAAATCTTTTGCAGTTTGTGTT
CTTTACTGGTGGCATCGTGTTTCTGACATTGATTGTGAATGGTTCTACCA
CACAATTTTTGTTGCATTTACTTGGTCTGGGAAAACTTTCAGCAACGAAG
GTTAGCTTGACAAATTATCATCTGTGATTTTTTATCTTGGGATTAAGGGT
TTTACTTAAATGTTCATTTGCATGCTTTAGTAACCTTTTGATCTCTGACT
ACATCCTCTTTCCCTTAGAGTGATGAGTGAACTGGCTCAAATAAGGTGTT
AAATGCTGTAAATATTTTGTTCCATTCTCTGAACTCAAGAATATAGGGAT
GAATCGGTTAATCTTACGTAAATAATGAGGACGGGATTATTACCACCCCT
CACACATTATTAGGAAGACAACAAGATACACATGTTTATGCACCGCAAAA
AATACAATTTAATCTGCTCTGCTGGGGTCATATCCAGGTTGGCACAAAGA
TACCACTGTTCTCAGGATGTTGGTTCTCTCCGTCCTTTTCTTGACAGTGT
ATCTAATTATTGACCTGAAGTTTCTCAGAATATCTAGTCTCCATTTGTGA
TCTTTACATCAATTATGAGAAAATAAATAATATTTTCTCTTTTGGTTGAA
CCCCCTTGACTCCTTGTAGCTTCAAAAGTTGTTCAGAGAGTCTTTCATTA
TTCGAATTTGAACCCCGTATCTAGACAAATTTGAGTCCTTTATTTTGGAT
CGGAGGGAGTACTACTGAGAAACATCAGTAGTTTTGGTTTCACATGTGAT
TGATGAATTTGAAGTAGCATATTTGTACTTCTTCATGCTCCAGTTTCTAA
CCTGATTTCCTGCAACTACAGCTTCGTGTATTGAAGTATACAAGATATGA
AATGCTAAACAAGGCATTAGAGGCTTTTGGTGATCTCAGGGATGATGAGG
AACTTGGGCCTGCTGATTGGATTACTGTGAAGAAATATATCACATGTTTG
AATAACCTGGAAGATGAACAAGCACATCCTCACGATGTTCCTGACAAAGA
TGAAAGTGTGCATACCATGAATTTGAGGGATACTCGAGTGCGCTTTTTGA
ATGGTATGCATGCAATCTAATTACATGATAATGTGCTGATGAAATTCGAT
GCCTCAGCCAAATTGGGTTTGTTAAGGAGGTACATACATACATTTATAAA
AGAGTAAAATGCAATATGGCCTCTGGGTTCTAAAACGTTTGGCTGTGGAA
ATAGTTTCGTGAATTCTCCAAGCCTATAGGCCACTGAACTAGTTAAGTGG
TCCCAGTGTAAAGTAGGGTAGACAGTAAAATTACTGCTATGACTGCACGC
TCATTTACTCTTGAAACAAATATTTTTCTGGATTCATTTAAAATGGTTAT
TTACTGTAAATACTTTTGTCAGGTGTACAAGCCGCTTATTGGGGAATGCT
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GGTTTGCGGTCCAATGTTCATTTCCCAAATTACTATAGGTTCCTTCATAT
GAGCAGGTTGCCACGAAGGCTTGTTACGTACTTCACAGTAGAAAGATTGG
AGTTAGGATGTTACATATGTGCTGCATTTCTTCGTGCTCATAGAATTGCA
AGGAGACAACTACATGATTTTCTTGGTAATATCCTTAACAGACTTTTTCA
ATGTTGTCACGTGCTAGTTTTATACCATTTATTTGCCTATAAAGTCCAGG
AAAATGAAAATCATGTCTTAATAGTTTGTTTCTATATGAGAAGTGCTATG
TGTGAGAACATATTCTTGGTAGAGGTATTGTTGTAGTTCATAAGTGGGAA
GAGACTGTGGTACTTATCTTAAGAACGGTTTGCTTTCCTGTAGAATCAGT
CAGTTATCGCATTCAGTCCTAAAACTGGCGAGGTCTTGATGGTGTGATAT
ACGGATATATTATTCACTGCACAACTACTTGGTATATAGCAAGCTCTGAT
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TCTTTTTTAATACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGACTCACATTTGGCTA
GATTTGGATGAATCTAGCCACTATTTAGTATATAGGTTCATCCAAATTTT
GACAAATCCAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTATTTTATTTGCTT
CTTTTTACACTGTTTTTTGGATGGTGGAGACTAAAGATCCTAATCCACTT
CACTAGTTTTATTTTTTCTTATAAGTTTTGATTCTTCAGGTGATAGTGAG
ATCGCAAGAATTGTCATCGATGAAAGTACTGCTGCGGGGGAGGAAGCTAA
AAAGTTTCTGGAAGATGTTCGTGTTACATTCCCTCAGGTGGTGGTTACAA
TGTGCTTCTTACTCTCATTTGAGTTAAATTATTATGGATTCACTAGCCTT
GCGAAGTCTTGATAAATTTTGTTAAACTAGCAATTTTCTCTGCAAAACTT
GAGGAGAAAAGCACATTCCTAAAGTGAGACTAGTTTGGCTTCATGCGTGC
CCCCTTGACCGGCTCCCTTGATCTACAGTTTTGCATTTTGGGCTTCTTTT
CTTAGCCTTCATAGGTTTGTTTTAGATTTTCCGCTTTCCAATTGTTGCCT
TTTGTTCTGTGCTTTTCTTTATTTTGCTGTAAGACCATCGCCCTCTTCGT
AACTTCTAATATACAAAATAGAGCACTTATGTGTGGGTTCAAGAAAAAGA
GGAAGGACTGGTTTGGCTTTTAGACATACATGTTTTTGCATGGCCTTGAA
AGGCCGAATGGTTGTAAATGGCTAGGTTTATAGTTTGGAATGGAGGAAGA
GGGTTTTGGTAGTAATTTTCTTAGGAGTTGTCTTTTTTCCTGCGAAATTC
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GAAAAGCATTTCCTCGGTGATCCTGGTAGTTCTCTGTTGGATCTTTGATA
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GCTGTGCGGCCTGCCGCCGTCGCCATATGCGGCATATCGTTGTGCTGTCC
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GGGAGATTCTGCTCTGCTTGATCGGAGCCATATTTGTACCGATCGCGACT
TGTGTCGGCAGAAGAAAATACTCCTAGAAGAGATGTGGACTGGCTGTGCG
AATTCGAGAGCACATGCCGCCGTCAGTCACCGTGCCGCGTCTGGCAACGA
CGGCAGGCCCCACAGCGACGTGATTACGTCATTTGCCGTCAACGCTGACC
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TCTTTTTTGGCAATTCACTGGGGCAGGTGGTCTTTTTGTCAAAAATCCGT
TCACTATTATGTTATCTAGATTTTTTTTGCTGGGGACACCGTTGTCTAGA
TCCTGAAGCTGTTCGACACTTTTCAGGTGCTTCGTGCATTAAAGACTCGA
CAAGTGACATATGCAGTATTGACACACCTGAGCGACTATATTCAAGACCT
CGGGAAGACTGGGTTGCTCGAAGAAAAGGAAATGGACCATCTCGATGATG
CTTTGCAGGTATTTGGAATATAATAACATTTCTTGTTGGGAGTGAAAGTA
AATTAATCTCTGGTTTGAGCTCACAAAGTGCAATATGCTAACCCTGGTAA
GTTAATTCACTTGGCAGACAGACTTGAAGAAGCTTAAGAGGAATCCACCA
CTGGTGAAAATGCCAAGAGTTAGCGAACTTTTAAATACTCATCCTTTAGT
TGGTGCACTGCCTGCTGCTGTTCGTGATACTTTGTTAAGTAATACAAAAG
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CGAGATCACTTTATGTTTGAAGTATATACTATATACTTTCCTACTCTGGC
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GCTGGGTCTATATGAGGCATTAATTGGAAAGCCTTATATTTGTGACATTA
TTACAGAATCGGTGGTGCATTGTTTCTTCATTGAAGCTGAAAAAATAGAG
CAATTGCGCCTGTCTGATCCTTCCATTGAGGATTTTTTGTGGCAGGTATC
CTCTCGTAATGCTGCCTATCTATGTGCTCAGTAACTTCTTTAACTCTTAG
ACATTTCCTGCAAATGCATAATCCCTTTTTTGTTTCCTTTATTATGTGAG
GGAAGTGAAGCAGATTTTTTCTGTGGTTCTCAATGCGGTTAAAGTCCTGC
AGGTTACTGACTGAGAAACCTGTAACGGGAGGGTTGATGTGTAGCATTTG
TTTTACCAAGTTTATATTAGAGCTCCTTCTGTCTTTGACCTAACCTTTTT
GGAGCGGAAAAACTGAATGAAAGATTCAAATTTAAAAAATTGAGAAAGAA
AGGAAGCGTGGCCTGTTCATGGAACCCAGTCTGAGGACTCAGACTGTGAT
GTGTTTACTGCACTAGTCGAAGATCATTACATCTGTACATGATTAGTTAA
ATAGAGTCTTACATTACACTAAGTAATTGTAAATTGAAATTACGGCTGAA
CTCTTTCAAAGCGAGCCTTACAGGTTTAACACATTGAATTCTGGCAGAAG
GTAGCATAAAAATAACCAAACCCGTTGTGGTACACCATAGCCTGCGTGTA
TGTATTTTGTTCCCATCGTTAACTCCAAAGGTGGCATACAGTGGCGGATC
CAGAGCACTGATGGAGCCTGGGCAAGGCCTATGCACAGCGACCGCGGCCA
GCGTTCCCCACCGAACACCAGCGCTAAGCACTCTGATTACACTGCTGCTT
AATGGAGAGTTGCTGGACTAGCCCAGGCAGCCCCTCGGGGTTGCCGGGTG
CTGGCTCCACCCCTGGTGGCATATAAGGAATATGTGACCAGATCTTCATC
TTCATTTAACAAATTATCAACACAGATGTACTCAACAAGGATTGTGAAAT
GACATCTTTATTTAGTTTGATTGCTCACGGCTGTTTCTTATTTGCTAATA
CAAATAATACTAAACAGGGTTAGAAAGCAGTGATATTAACTTGAAAAGAA
GTAAAGTAAGTATCATCAGGCCAATCATATGTATATTCGTAGGTTCTATG
TACCTATACTCGCTAGATATTGCCCATCAGTTTCATCCATAATCAGTTCT
CTTGGTTCTGCATGTAACCGCACATTTCCAAAACAACTTGAAGACTTAGG
TGTAATCAAGATTAGACTACAACGCGCCATCTACAATGACTCATACTGAC
GGTGCATTTCCTGTGAGGGCCTCCTCACTTTATCAACAGTCATGCACACT
ATTGACTTGTAACACTCAAGCAGCTGCTCGAATGTATATAGGCTTACAAC
AATCATCGAAACTTTCTTGGGCTTTTGCTTCTCTTCACCCAGATCTAATT
GTAATTTGCTTCGGCTTTACCTTCGCTTCGCCCAAATCATTATCAAGCAT
TATTAGAAACATTGAATCTCCAATGTGGGACAAACCCATCACTACTGCTC
CATTAGGTCTGGTGTAACAATGTTGCCTTTTGACACATAATTAGTACTCT
GACAGCCATTAACTATTCATGCATGGAAATTACAGGAAAGCGCTCTTGTT
ATTGCGAGGATTCTTCTCCCTCAGATATTTGAGAAAATGGCAATGCATGA
GATGAGGGTTCTCGTTTCTGAAAGGTCCAGTATGAACATCTATATTAAGG
GGGAAGACATTGAACTTGGGCATAATTACGTGGGCATCTTACTGGAAGGA
TTTCTGAAGATGAACAACCAAACTTTGATCACACCTCCAGCCGTGCTGCT
GCCATCAAACACTGATTTGTATTTATTTGGCCTGCAGTCTTCAGGTTGTC
TACATTTTCTTCAATCGAGCAGCCAATCTTTTTGTTACATATAATAATTG
ATGACTCAAGTGCTCTCTTGTTTTACAGCCATGAACCATATAGACTACTG
CTATACTGCACCCAGTTATCAGGTGGAAGCTAGAGCGAGGGTTATCTTAT
TTGAAATAAGGAGGCCAGAGGCAGAGAGTGATCTGCAAAGAAGTGCATCG
TTGCTGTCTCCAACCCTTGGACCATCACGAACACAGAGCAAAGAGCATGT
CGGTTTGCTAAGGTGGCCGGAGAGTTTCCGGAGATCTAGAGGGCCTGGAA
ATCCAAGCTTAGCTGAAATCAGAAACCAGTCGTGTAGCTTCTCTGCTAGA
GCCCTGCAAGTCAGCATGTACGGCAGCATGGTACGTATGAGTCTCTTCTA
TTTTATCAATCTCATAGTTGGTTCTTGTTTACATCGATGTAAGTTTCTAT
GTGATCAACTCAAACTAAATAAAGGGATCAACTCATCCACAGATGGAGGA
CACGCACCCTGCTCAGCGGCGACAGAGGCTTCCTCCCGTGGAAGCAAACC
ATAAGCACAGCGCATCCTATCCCAAGGTGCCCTCGAGGGCATCGTCCAAC
ACACGGCCTCTACTCTCCGTACAGTCTGAGGGTTCCAATCTGATGAACAG
AAAGTCTGCTCCTGCTCCTGCTGCTCCTACTTCTGCCCTCGCCCCTTTTC
CGCCCCTGGCACCAGTCCGGCAACGCAGGGCAATAGTGGAAGATGACAAC
TCGAGCGATGAGTCTGTGGGGGAAGAGGTTATTGTCAGAGTGGATTCTCC
CAGCATGCTCTCTTTCCATCCGTCGTCACAAGGCAACTGACGGACGCAGG
CTGTACCGACATTTCGCTCTCGTTGCATAATATAGTTGTTGTGACCAATA
GGCAATAGCACCACGCTGTATGTGTATATCGCTATGTGTTTAAAATGTAC
AATAGGTTCAATAAGAAAATCAACCGAGATCGTTTGATTCTTCGAAGAAA
TGTACTGTATATTTCTTTTACTCTTGGCTTCTGAGGTTGAACCTTCAGGC
CGCTTGTGCCGCTATTCAATAGAGTTCCTGTATGTCATATTTTTAAAAGA
ATCTCGTTACCTTTAATCTTGACCTAATTTTAGTTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.