Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA019948

[Submit comment/correction]

Sequence
AA019948
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019948
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTCGAGGCGCGCACGCAATTCCGTGCAGGCCGGCCAATTGAATGTCAAA
TTTTCGCCTAAATAGTAGGGGGATAAAAAGAAGGGAAAGCCATAGTAGCC
GTCGTCTGCTTCCCCTCTCCCCGTCCTCCTCCTCCCGCGATGGCGACGCT
AATCTCGGAGCTGCTCCGGCCGGTGGACCCGGCGCTGGCGCTGGACGAGG
CGGCGCTGCTGCGGTACGCGGCCGCGCACGTCCAGGGGTTCCCCGCGCCG
GCGCCGGCGCTGTCCCTCACGCTGTTCGGCCACGGCCAGTCCAACCCCAC
CTACTGCCTCCAGGCCTCCTCCGCCACGGAGACCAGGCGCTACGTGCTTC
GGAAGAAGCCCGCGGGGACCATCCTCCAGTCCGCCCACGCCGTCGAGCGC
GAGTTCCAGGTCCAGATCCTCCTCCGGTTCCCCGCTCAATCCTGTTTTAT
GCAGACTCTCTGTAGCCGATGTCCAGTTCACCTATACAATTAGCTCGAAT
TAGCGTTGTTTAACCGGGGGTTATGTGGTTGTCACGACAGTGCTACAGTG
GAATTAGCGTTTACTTCCGAACTCAGTGGTAGACAATCTACTTTTCGTGC
TTATTTAGAAGTATCTTGAACCTTCTAGCTTCTGTTTAATCATGGAACTC
AGTGTAGTTATCACTGATCAAACTAGTTATGGTATTTTATCTTTCAACTA
CGTGGTGAAAGAGGGTTTAAATTATATGTTGATGATATCAAATGCTTCAT
ATGTGCTCTTGTTTCGTTTTAACAAGTGACGCTAGCTTACTCACTGAGTT
GTTTTTGATATGGAAGCAGGTTCTCAAGGCTTTAGGCGTTTACACGGATG
TCCCTGTCCCTAAGGTGTTCTGCCTTTGCACTGATGCCAGCGTGATCGGA
ACCCCTTTCTACATAATGGAGTACCTGGAAGGAGTCTTATATCTTGATAG
CAATTTACCGGTATGCTGTTCATTGCGTGTTCTTGGTATTGCCAGTTCTT
TGAGTTCGCTGACCGGTTCATCAACTCCACTTGGTATTGGTGCTGATTCC
GTGCAGAATTTGGACAATATCTTCCTATCAACAGACTTTCTTCTAGCTTA
TGATTGTGGATTGCAGTTGTAGCACATATGCAATGTATGAGAACCTCTTA
AAATTGGATTGATATAACTAGCAACCTTAGTCGTTGATTGATTAGGTTCA
GACTCTAGAAGAGAATGGCACTTTTCAAACCCCTCCTTCCTCTACAACAT
TTAGAGGTTTTCTAGGAACTGAGATCAGAGTTCCCATAATCCTATCTTAT
GAAAGGAATGCATCAAGTTGGCAACGTTTATATTCATATATCAAATTGAC
AATTTTATGCATGATAATTTGGTGATTTTGTTGCTCTTCTTTATGCAGGG
AATATCCCCAGCCAGAAGGAAGAGTATATACTTTGCTGCTGCCAAAACTT
TGGCTGATGTACACAAAGTAGATGTGTCTGCAGTTGGATTGCAGAAGTAC
GGGAGAAGAGACAATTATTGCAAAAGACAAGTAGGTCTTATCTAGACAGT
GACCAATACTTAAATTCACATTGATCTAACCAGCTGAGTCCGTGAAGTGC
GTTGCGCTGATTAAGACTCTGCTTGCAAATGTGCTCTATTTTTCACAAAC
ACTTGCTATGTGGGCTGTGTTTCCCTAGCTGTTACAACTTGATCACCTGA
GTTCAGGAATTAAAATGAATTCTTACTGTCATGTTCTGAATATTGATAAC
CGTGATTTTTCATTTGAAGATGAAGATAGTTACTGTTTCCTGGTTCAGGT
AGAAAGATGGGAAAGGCAGTATCTTCAGTCAACTGGCGAAGGGAAGCCTG
CTCGTTATCAGAAGATGCTTGATCTAATTCATTGGTTGAAGGAAAATGTA
CCCAAAGAAGATTCATCGACAGGATTGGGTACTGGCCTTGTTCACGGTGA
TTATCGTATTGATAACCTTGTATTTCATCCAACAGAGGTTTGTTTGGCAT
CACCACATGTTTATGCAACCCCCTAATAACTACTTTACATAGTTTAAATC
CTCTGTCTGATGATCTCTTATGTTTCTCTACAGGATCGAGTAATCGGTGT
ACTTGATTGGGAACTATCTACTTTGGGGAATCAGATGAGTGATGTTGCTT
ACAACTGCATGGTATGAAATATGGAATAAGTTTTCTTCGAAAAAATGTGA
AATACTTCCGTATACATAATATCGTTACCCATCATTGACCTATTTACAAC
ACGATTTCTTCTGTGATTTGCTTGTTTTCTAAAGAACAGTTCCAGCTCTT
CAGATGTTATGTGTTAGATTAACTATGATCACTTGGTATTATGTCACTTT
GCTAACCATGATTTATCTAATGTTATCTTGATTATTTTTTATCCTTGCAG
ACCTATATTATTGATTCAACGCCCACTGAAAATATTTCCTTTGGAGGACT
TATGCGTCCTGTCATTTCAGATGGCATTCCTCAACTGGAAGAGTACCTAT
CTGTATACTGCTCTATGTCTGTAAGCATCCTATTGTTTGCATTTTGACAC
TGGCTGGATAAATACACCCCTCTTACTCACTGATTATTATCCCTTTCTTT
ACAACTTTCCTCAGGCAAGACCCTGGCCTGCAACAAATTGGAAGTTCTAT
ATTGCCTTTTCACTGTTTCGAGGGGCATCTATCTATGCAGGAGTATATCA
CAGATGGACTATGGTACTCGTCTTTAACTCTGGAAGTATGTGTCTGTTTT
CTATTCTAATTTATTTGAGCTGTCACGCAGGGTAATGCTTCAGGTGGCGA
GCGTGCTAAATTTGCTGGCAAGGCTGGTAATGTTATGGTTGACTGTGCCT
GGGATTACATAAATAGAGAAAATGTCCTGCCAGAACGACCTGCTACAGGT
AATCATATTTCATAGCATCCTGCCTCATCGTTTCGTGTGCTTTGTGGACA
AGCTTGCTCTTTACGATTTCTTAAACCTGGTTGCTGTTTCCAACTAAATT
ACTTTGCATAGAGAATTAGAGACGTAAAATGCGGCTATGATCCTTTATTC
CTTTTTAGGGACAATCCTTTATTCTTGTAAAGTCTAATGAACTTAAATTT
TGTTAACTGTCCGGACTTTTCCTATAATTGTTAGTTACGGATTTCTCGAG
AGCTTCAAGGCAAGAGTTCCACACTGAGCAGGAAGGTTCAACTTTGACAA
ATGGTCAAGGCAGATTTGTTCCTAGTGAAAAAGTTATGCTGCTACGGGAA
AAAATAATGAAGTTTATGAAAGATCATATATACCCCAAGGAGGATGAGTT
ATACAAGCATGCACAATCAGCCTCACGGTGGACAATTCATCCAGAAGAAG
AAAATTTGAAAGCATTAGCAAAACAGCAGGGACTGTGGAACTTGTTTATT
CCGGTACTTTCTGTTTCCTTTTGACACCTTTAACATTTATCTGATCCATA
AAAAAATTAAGAACCCTGTTTTTTACTTCACTAATGTAAGGTGCACTTAT
TTTATATTGGGTTCTGTGCTGAGTAAAATGGTTGGCTGCAGCTTGATAGT
GCAGCTAGAGCAAGAGAACTACTACTTGAGGACCGATCTCATATTTCTCC
TGGAAGTTCAGATGATCTTTTGCTAGGTGCGGGTCTCACAAATCTAGAGT
ATGGATATTTATGCGAGATTATGGGTCGCTCAGTTTGGGCTCCACAAATA
TTTAACTGCGGTGCACCTGATACGGGTAATATGGAGGTAAGACAGAATTT
TATGTTCATTTATAGGCATCATTTTCACAATCTATCACTAGGCAAGCATA
TCTTGAGAAAATACTTGTTTTTAAAATATCTCCCTGTATAGCATCTGCAG
ATTATTGACGTAGCAGCTATCCTCTTGATTCTGCAGTTTTATGTATATCG
TTAAGTCGGATATGTTATTTTGTTTCCCAGCATAGAGCAATGGAAGATGG
CATATGATCCATTTTTAGTATGCCAATCGTTTTTTAGAAGGTTCTTACAG
CATATGTCATGTTTGAATGCTTTGTTGGTGCTAGTAATTTTGTATGCGAG
AATTTATGATATAAAAATCTCATTATAGGTCTTGCTGAGATATGGTACTA
AGGAGCAACAAAAGCAGTGGCTTGTTCCTTTACTGGAAGGGAAAATTCGT
TCAGGATTTGCAATGACAGAACCACAAGTTGCATCTTCGGATGCAACAAA
TATAGAATGTGCAATATCAAGGTAATGAAGTCCATAAAATATATATAGGC
AACAAGCATGTTATTGTTGTTCCTTTAGGCTGTTGATATTTCATTACATG
TGTTCACTACAGGCTCTCGTATCTCTCTTCAGTTACAAGCTATTACCTTG
TTAAGGGCTATCACATAGTTGCGAACGACATGTTAAGGAGATCCTAGTTC
CTACATTAGCCAGCATTTTATTTTGTATATTTATTTTCTCATCTCAAAAG
TATTTCAGTTTACTAGCCAAAAAATAATATAGTACACTGCTCGAAACCTC
CAAATTCTGGCGTATTGCCAGGAAAGCAATTATATCCTCATGGCATACGT
TTTCTGCCCCCCTCTTTTGATAGATTATACATATGATATTCCTTCCTTTA
ATCTGAGATTTCTGTGTTGCTGATTATCTGTGATATTTTCCCCATGGCAG
GCAGGGAGATTTCTATGTGATAAATGGCAAGAAATGGTGGACCAGTGGGG
CTATGGACCCAAGGTGCAAAATCCTGATATTAATGGTAACTATAACATTT
ATTCGTGAAATCGGTGATATGGGTGATGTATATTTTCCATTTAATGTAAA
AGTGTTTGCTTCATGCAGGGAAAAACAGATTTTTCTGCACCTAAACATAA
GCAGCAGTCGATGATTTTAGTGGATATCAACACTCCTGGAGTGCAGATAA
GGAGACCCCTGCTAGTCTTTGGATTCGATGACGCACCACATGGACATGCA
GAGATTACTTTTGATAACGTGCGTGTTCCGGCCACAAATATCCTCCTAGG
GGAAGGACGGGGTTTTGAGATTGCTCAAGTAAGCAATACTCTTCTGTTGC
CACTAATAATTTTGTTATAATATGTGAATTCTTTGTCATATTTAAGATAC
TTGGCAGGGAAGACTAGGTCCAGGAAGACTACATCATTGCATGAGACTAA
TAGGAGCAGCAGAACGTGGCATGAACATGATGGTTGAGAGGGCATTAAGT
AGGACGGTATTTGGAAAGAGGATTGCACAGCATGGGTCATTTCAATCAGA
CCTTGCAAAGGTATGGTCTCTTTGACCGCTTGCATGATTCATTTAACCGT
TTAGGTGGTTCATTTAAACAGAAGTGTCTATTTCACAGAAGCTAGGTGCC
ATGTGAGTTAGTTATCAGCTCGTTGTTCCTTTTGTTTAGGGACATTTCAG
TTTCTGAACTCCATCGTTTCTTTCCTCGCATCTTTTCTTGTGTGTGTTCT
ACTAACATGGAGGTGTTCTCCAGTGTCGAATAGAACTGGAACAAACTAGG
CTTTTGGTGCTTGAAGCAGCGGACCAACTCGACCGGCATGGGAACAAGAA
AGCCCGTGGAATCCTCGCAATGGCCAAGGTAAACAACCAAGGTTCAGCAA
TTTGGCACTTTCTTTTTATCACACTAGCAACCTCCAAATCGAGTGAATCT
GGCCCTCATGTAGGTTGCAGCTCCAAACATGGCCCTCAAAGTGCTCGACA
TGGCAATGCAAGTCCATGGCGCTGCTGGCGTCTCATCCGACACAGCCCTA
TCTCATCTATGGGCAACCGCTAGGACACTGCGGATCGCGGACGGCCCCGA
TGAAGTCCATCTCGGCACGATCGCGAAGCTGGAGCTGCAAAGGGCAAGGC
TGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.