Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039762

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039762
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039762
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AGAGAGGAGGAGGAGATCGAGGGCTACAACCCAGTGGCATATGGCGGCGT CATCGACGAGGCCTCCTTCAACCGCATGGCCACGGTGATCATGCAGTGGA GCACGCCTGAGGATGATGACCACCGCAAGCGGCAGCAGGAAAACACGAAG CTCAACGACCTCTTCCTCGAACAGGGGCTCGCCAGCGAGCGCGAGCTCCA CCAGAAGCAGCTGGAGTTGGAGCTCCAGTGCACGCTGTAGGCAGAAAAGT TTGTTGACCTTGTCGACGATGACAACGAGTGAAGTCCGTCACCGATACCC GCCACACTCCGAGGCTCAGTGTTGTTGCCTATGATCAACTTATTTTTGAT TAATTTATGTCCAAGCTCAATGTTGTTGCCTATGATCATCTTATTTACAT AAATTCTACAATCATGCTACCCGCCTTGGGTATATTTAGTATGAGAAAAA TATTATGCATATGCTTTGCCACCTGCTAAGATGTCAGACTGCTCTTTCTA GTGGAGGGACTGCCTCAAACTTCTTCCTAAATTTAAGCAGATTGCCTCCT GCTTTATGAAGAATGGAACCACAGTTTTGCTTTGGCTAAACAATTGGGAG CAACAAAGTTTTCAAAACACTTTCCCACACCTTGCATTTTTTACATTTCC CGTCCGCAAGCCATACAACATGAGTCCCTCATTGACTTGTTACCTCTCTC TTTGGTTGCTTTTGAGGAATTCTAGGACTTTGAATAGATTGTTCTATGTA GAGAAGATAATGATGATCCAGATGTTTGGTCTTGTAAATGAGGAGCAGAC TTTTTGGTAGCACAAGCTTATTCTTTGTTTAAAACTTTAGAGAAACCTAC GATTGCTTTCAAATCGATTGCTTTCAAATGGCTTTGGGAGAGCCGTTGTT AGAAAATACCTAAGGTTTCCTTTCGGTTACTTCTACAAGACCATCTTAAT ACACGATAAATGCTGGATAAAAGTATATTCTTTCTGCTAAACTATTCATG GATTATGTGCAATGAGCATATTATGGAATCACGAAATGACCTCTTCTTCC AATGCTAGTTTCCTAAGGCCTGTTGGCAATATGTTTGCCCTGAGTGGACT ATTTCTCCTTTGAGCTCCCATCTAGATTGCCTTCTCATGTTAAAACAACA GTTGGCAACCTTTCTTCATGGAAATTGTAGTGCTCATTGCTTGGACGATT TGTCGCATCGGAAATGTCTTCATCTTCAAAACCACTACTCCTAGCCTCTA TCGAGCTAAAGATGTCTTCAAGTATGATTTAAAATGGAACAAATTCAGAT TAAAGAGGAAAGCTTATGCCTCTTTTATCCCCTGGATAGAAAGTTTTCTG AAAATATGTAATTTTATAAATATTAGCTTTAGTCGTAGCTCTAGGCTTGA TTTTTCCTTTGTCTGAACTCTCTTTAAACCCAAAAAATATATAAAAAATA TAGTAGCGAGGCTACTATGGTTTGTCAAAAAAAATGTATAATTTGGCATA GCAATGTTGGAAATTGCCAGTTTCTGCATTAATTCTTTGCATTTATCATC CTGCCAAGCCAGTCACGGGACCAACCGGAGTTATGTCAAGGTAATATCTA CAAGAAAACCTTCTTCGCTTTTCATTTTTTCTTTTCTTTTGCTTCATTTC ATTTCTTTTCTAGGAGGGCTTTTTTCTTAAGCTCACATCTCATTGTCGCC GAGGTGAGCGCAGAAAGAGGTCCGTTTCCCGGCCCACCGCCCACCAGCCC AAAGTGGTGCCGTGCCCTCTCTCTTCATTCTCTCCTTCTCCCGACTCCCG AGTCCCGACCCACTCCATATTTCCACGGCGTCTAGACAATTTTACCGGCG ACGCCTCGCGACCTTCTCCCCCCTCGGCTCATCGCCCCCTTTCGGCACCG GCACCCCTACAGAATCTCGATCTGATCCCGTGAGGTGACATCCCTCGCTC CCGTCTGCCCCGCCCTTTCCGCGCCCTGATACTAGATCTGTGGTCCGAGT TGTGGTCGGCCCGCTCCCGTAGGAGCATCCGCTCCACGATCCCGTCGCGT GTCTGAGCTCCCGTAGGATTTCGATTTCCGCCTTCCGGCGTTACACGATG CTTTTCCGGTTTATCCTTAGTTCCACTGCCCTGCCAGGGCCGGGTTGCGC TGGTTTCGGCGTGATTGGGGTCGGATTTAGGGGTTCAGCCTGGTTTTGGG ATGATTTGGGAGAGCTATTGGCTCCCGGATGGGTAGCATATTGTGTATGT CCACTTACAGTGATACGTTCGTTGCTGGGCTACACTCTTTCGGTTCGATT TATTTCTTAGATGGTGCAGATGTAACTCGCTCTCTTCCTTTTCCTTACTA AGGAGTTTGCTTAATTACATGATCCTGTACTTGATCAGGAGGTTATAGAG CACACATACAGTTTTTTCCCCAGCTTCTGGTCTTCAATACTTTAATATGT TGTTAGATCAGTGATGAAAATGCAAAATTGGTTCATATGAGTTGCTTCCA TCCACTGGTGCAACCAGCGGAAGCTATATGTTCTCACCGTTGGTTGTAGA TCTGTTTGATAGGAAAATAAGTTACCTTTTGCAGCCTTGTGAGCGCTGAT GGGATTGTGATTGCTCACCCCCAGAACCATTCATAGACAATATATGGCAT CTTTGTTTCACATTTGGAGAAAATCAACTGGTAACTATGTATTAGGCAAC GGATATTTTGTCTGTCTCAGTTGAGTTAAGCGTATGTTACTTTTAATGTT TGACCTCTTAGATTAGTTATGCTATTTCGGAACCAAGGTAATAATGGGTT CACATATGTAACCTCTTTAGGGGAGATATAGTTGACCTCATTGGAACATC ACTCTGCCTTTCTAACTTGTTCTTGCCTTTGATCATGCACCAAATTTTGT ATTTAAGGGCAGGCATCACATTGTCCTAATGTTCTGTCTTGTTTTACAGT TGTAGACATAATTGATTAGCCTGATGGCTATGGTCGATGAGCCTCTTTAT CCAATTGCCGTGCTGATAGATGAGCTTAAAAATGAAGATATTCAATTGCG CCTGAACTCCATCAGAAGACTTTCCACAATTGCACGGGCACTTGGGGAAG AAAGAACCAGGAAGGAACTGATACCTTTTCTCAGCGAAAACAATGATGAT GAAGATGAGGTGCTTCTCGCAATGGCTGAAGAACTGGGTGTTTTTATTCC TTATGTTGGGGGTGTAGAACACGCTCATGTTCTGCTCCCACCATTGGAGA CGTTGTCCACGGTGGAGGAGACTTGTGTCCGAGACAAAGCAGTTGAGTCA TTGTGCCGTATTGGTGCACAGATGAAGGAAAATGACATTGTTGACTTCTT CATCCAAGTCGTGAAGGTAATGCATCTATACAAAGTGAAGCATCCTTTTG TTATCAAGTGTGCTGCCTGTATTGTGCATCTTGTTTATTTTCTGCCGGTA TCTTTATGTCTTTTTAAGCAGTCTTTACTATTTTCAGAGGCTAGCGTCTG GTGAGTGGTTTACAGCTCGAGTATCATCCTGTGGTCTGTTCCATATAGCC TATCCAAGTGCCACTGATCCGTTGAAAACAGAACTGAGGACCATTTATGG TCAGTTATGCCAAGATGATATGCCCATGGTCAGAAGGGCGGCTGCATCAA ATCTTGGGAAGTTTGCTGCCACAATTGAACAGAGCCATTTGAAAACAGAA ATCATGTCGATCTTTGATGATTTGACCCAAGATGGTACTTTCTTATACAT CTTTGATGAACTATTTTAATGAAATAGTTATCTATTGATTAATGCAAAGT GTTATGTGTATGTTAAAAAAGTGGAATAAAACATATGTAATTGCTTATTT TCTCCATAAAGCAATTATTTTGTTGCCTAGGTGATTGTGTCCGAAAGAAT GTAGTCTCTTTCTTAATCTGTGCTGGGGATGATTGTCGAATTGTTGGTGT GGATTGACAGACCGGTCAAATTAACCAGTCACATAACTGAACTTTAGAAG ATAACCTGGGGTACAACTGTTAACATGGAGAAAATCCTTTGTCCGTGAAA GATATTTTTCTATTGATTGAATTAAATAATCCCTCCGTCCTGAATTAGAT GTCGCAGATTTGTCTAGATTTGAATGTATCTAGATATGTTTTAGTGTATA GATACATGCGAATCTAGACAAATCTATGACATCCTTTTCTGGACGGAGGG AGTATAATGGTTATAAACATAAGAATTTTGTGCCACTATATATTGGCTTG GAGCTTATGTGAGAGGTGTCTTATATTTAAATATGAGATAAACAAGTTTT CTTGCTCCTTGATGCTTACTTGTGTAGTTCAGTCTGTTACATCTGGCTTA TCTCTATCTTTATTGCAGTTTCAAATTTGACATAATTTTTGGCAAGAGAT CATTCGTTTACACTTGAATTTACAAAAAGATCAATACATGAGACCTAAAC TGGTCTACTTGAATTTTCTTGTCCAACATTTTATACAAAACTGAACCTAT TGAGATCTTGATTACATTATTGGCCTTCATTGACAGATCAAGATTCAGTA CGCTTATTGGCAGTTGAAGGCTGTGCCGCTCTTGGAAAATTGTTGGAACC GCAAGATTGTGTTGCACATATCCTTCCAGTCATTGTCAATTTCTCCCAGG TATATCTCCGATATTTCTACCTAGTCTTTGTAGGTTATTGGAATATATGT CTATGGTTACTAGTTACTACATGTTTATGGTTATTATTGCTTCTTTAATT CAACTATTCTTGTTTTCAAGTGCATTATCATGGTTGCACTACTACTAATA CTCCTTCCGTAACTCCTATAGGATAAGTCTTGGCGTGTCCGTTATATGGT TGCCAATCAATTATATGAGCTCTGCGAGGCTGTTGGCCCTGAGCCTACAA GGTTAGCTTTTTTCATCTATTCTGACATACTTGAATTTTCCATATCTGTA ACGTACTTCGATATACATGCGGCAAGTTGTTATTCATATGTATATACATA GTTTTTAACCTGATTGATTCATGTGTTAATATGTTTGGTAATAGAGCGGA CCTGGTACCTGCATATGTTCGCCTCCTTCGTGATAATGAGGCTGAAGTGC GGATTGCAGCTGCCGGAAAAGTTACAAAGTTCTGTAGGATATTAAGTCCA CAGCTTGCAATACAGCACATTCTTCCGTGCGTTAAGGTGAGAGGAAGGCA GCTACTAAATCATTTGTATTTGACTGCTGTTTTTTGTTTACAGATTAACA CATGCCAATTGCATCTGCAGGAATTATCATCGGATTCGTCTCAGCATGTT CGCTCAGCTTTGGCTTCAGTCATTATGGGAATGGCCCCTGTTCTGGGAAA GGTGCGAGCAATGATGCAGCAATAATTTTATTGAATCGACTTTTCAGTTT TTGCTAACATGTTTATAGACAAATTAATGTGCTTTACATTTGAATGTATA TCTATTTCATGTCTTCAGCCCTATGAATATTAAATACTTCATAAAATATA CTTGTCATTGTACTCTTTTGTGATCCACCATTATTTTGTTCACATGATAG TTGGTATTCATAATTTAAACTGAAACTGTAATGAGAAATAGTGCATAATT ACTTTCATATTCTGGGGAAGGTGCGAGCAATGATGCAGCAATGGTTTCAT TAAATTATCTTTCACGCTGTGTTTGGTTGCATAGAATTGAGGCGTGGAAT CGAATTGGACCAACATTCCAAATCCAAGATGGAAATGAATTGGCTTCTAA TTCAATTCTGTTGTTTGGATGTGTTTGGAAATTGCGGTTGGAAATTCCAA AATTCCGATAGCCCCGTTCCCCAACCCCTGTTCGATCTAGGCGGGGAGGT CGCGGGCGGAGGGCTGTGGGCGAGCGGGGAAGTCGCGGGCGGAGCTGGGC CGGGGAGGTAGCGGGCGGAGGGCGGAGCTTTGGCGGGGAGGTCGCGGGGA GAGGGAGGATAGGGAGGTAGAGGGCGGAGGGCGGGCGGGGATGTCACGGG CGGAGCTGGGCCGAGGAGGTAGCGGGCGGGGAGGTAGCGGGCGAAGGGCG GAGCTTGGCCGGGGAGGTCGCGGGCGGAGGGCGGAGCTCGGGCGGGGAGG TCGCGGATGGAGCTAGGCCGGGGAGGTCTCGGGCGGAGGGCGGGCGGGGA AGGGGAGCGAGCGAGCGAGGACGAAGCGGTACGCGCGGTCTCTCGCGTTT CTGAGCCTTTCCGAGCTCCCACCCTCGGAATCTTTTCGAGTGAAACGGTA TGCGCACGCGGGGTGGCTCGGAATTGGACTCCGGTTTCCACACCTCAATT CTAAGGCAGTCCAAACAGCTGAATTGGCATATTTGATCCGAATTCCAATT CCATACCTCAATTCTATGCAACCAAACACAGTGTCAGTGTTTGCTAACAT GTTTACAGACAAGTTAATGTGCTTTACATTTGAATGAATATCTATTTCAT GTCTTTAGCCCTATGAATATTAAATACTACATAAAATATACTTGTCATTG TACTCTTGTGATCCCCCATTATTTTGTCCATACAATAGTTGGTATTCATA ATTTAAACTGAAACTGTAATGAGAAACAGTGCATAATTACTTTCATATTC GAATTGTTCGCTTGGACTTCTCGGTATATCAGCTTAAACAATGAGAGGGA GGTTTCCTTGAGAAATTTGAATGTTTTGAGTTTTTAGTTTGTGCGTTCCA TCTTCACTGGTCCATTTGCCAGTTACCTGTACATGTGTTGCGATGATATG TTGGACCCAACATGCAACTGTATTTCTTTCGCTTTATAATCTGTTATCCC TGGTCGCTACAAATCCAACATATTTATTTTGCATACCTGTGTGATAATGT AATTATTTGTTGCTTATAGCTTCTGCTCTTCACATAATTACTATTCAATT CAACATCCTTGGGATCTGACCGTCGTCTGTGGTTTTCTGCAGGATGCTAC CATTGAACAACTTCTTCCTATTTTTCTTTCTTTGCTGAAGGATGAATTTC CTGACGTGCGGCTCAACATAATCAGCAAGCTTGATCAAGTTAATCAGGTC AGTGTGACTTGTTGGAGTTTGTTTGCCTTCTCCTACAATTCGTTGCTGGT TCTTTTGTGAACTTTTTTTTAGGGTTCCAGCATGATCTTCTTTCTTTCCT TTCACCACCAGTGTTAGTCAGATGGATGACGATTTTGCTTACCACAAATA TGAGGGCCATATGCAAAAAGTTGACTACTTTATAAGTAGATGTCTCCTGT TGGCCCACTTGCTGTAGGCCCTTACCTTTGAGCACTACTCGTCTAAACAC CTACTTGAATATAATGAATTCGCGAATCGGACTTTATTCCTAAATACAGG CTATTCGAACTTTTTAACATACCTTTAAGCCAATCCCCCCCCTCCCCAAA CCCCTCCCTTTGCATGTTATTTATCAGTATGGGCTGAACCTGAAGTAAAG CTCAAGTCTCAACATTAATTATGTATAAGTGGCATAATAAAGATGAATAA TGCAGTCCTTTTACATACATCTTGGTTGAAGTGTAATGTTCTAAAACATC ATCCATCAATATTTGTTTCCCACGCTGACTGATATAATATGTTTTCTTTG CCCATTTCACATTTTCTGATGCTGTTATGATCTTTCAGGTTATTGGAATT GACTTGCTGTCACAATCTCTATTGCCAGCCATTGTAGAACTTGCAGAGGA TCGGCACTGGAGGGTTCGGCTTGCAATAATTGAGTACATCCCTCTGTTGG CCAGTCAGTTAGGTGTTGGGTTTTTTGATGACAAGCTGGGGGCACTTTGC ATGCAATGGTTGGAAGATAAGGTATATGCTATTCTGATTACTAAGTGGCA TGTTTCGTTCGAGGTTAAATTTTCAACATCTAAGCCTAGGTGATGTATGG CTTCCAATAAAACTGTTGCCAACAGAATTGAAGCCACAAGTATGGGAAAA GTTGGCAAAATATTTTATGAGTTTATGACACATGACCGTATAACTAATGA AGTACTGTAGCTGTGGCAAAAATTAAACACATGACAAAGAAACTGTGGTG CTTGTATCGTTAGGTGTGGCAACTGCCCCTTAGTTTATTTGGAAAACCAA AGGAGTACACGGATGGGATTTTGGCTTATCATCTCAAACATTTTCTCCCA GCACATAGAAACCTGATAACTAGCAGCTTTCAAGTTACATGTATTTCCCC CTATTTACCAGGACTAGAATGAACTCTATGTTAAGCTTTAGTGAAAACCC AATGGCTTCTATGCTTAGTTTGCCTTTGTATTCTCTAAGGTTAAGGTTGA TATATACATATAATACTATACAAAAGGCAGCCACTGCCCTATGATTGGGG AAATGGCTAACCGGAGTTTGAGTTTCAGGTTTTCTCCATCAGAGAAGCTG CTGCGAACAACTTGAAGCGCCTGGCAGAGGAGTTTGGTCCAGAGTGGGCA ATGCAACACATAATCCCTCAGGTTCGGTAAATTCAGCCCTTTTTTTTGAA AGAAGTAAATTCAGTCCTTAATGTGCATGCTTTGGTCAACTAGGTACAAC AACTCGTAACTTGTACATCCAGAAGTAAGAACTTGTACAAGTAGTTCATT TTAGTCTAGAACTGCCAGGGTGGCATAGCCTGTCCACTTGGCATATTGAT GTGATAAGAGGCCCACATGTTGTAATTAACCCTGCTATGGAAATTGCTTG CCTTGGAGATGCCATAGTGGGTGGCCTTTACATACTGCGTAGTAGCACCA GGAAGGTGCGTACGATCTTGGTCTCAAACTTTGGGGATGTAGGAAATAGG GTTGATGAAACACATATGTGATGCACCAATAAGGTTCCACCGTTGGTTGC GGTAGCAATAGGAAATACTAGCTGATATTTTGAACTGGTCCATGAGTTCA ATCGGTTAAAAGAGAAATATTAATATTTAACTAAATTATGAAGGTGTGCC CCCCTACACCCCCAGCTGTGTGAGCACATTGTACCATTGTGGACCATCTT GGACTTGTATGTAGCTATGTTGGTTGATGCAACCGCTGTGGATGTGCAAT TCCTGAAGCTATGTTGGTTGATGACCAGAAGAAGTTGAGACACGATATGA CTTGCTAAATGTTAATTAAGTTTGACGGTGGTGGAGTGTACATAATGAAA CAAGTCATTGTAGCAAGAGAGGGCTCTGTTCTTACAAATGCTATATTGCC TGAAGCCTTGAACTCGTTGTGCCTAACTAGAATTTAGTTGAGTGGTAGTT TGTACACAATTTTCCTTCCTGTAGTGGCATGTAATTTCTGCTAGTTTTTA ACGCTTACATGTTCCATTTTGTAGGTATTGGAGAAGATAAACAACCCACA TTATCTGTATCGCATGACCATCCTGCAAGCTATATCATTGCTTGCGCCTG TCATGGGTGCAGAAATAACATGTCAAAAGCTTCTCCCCGTCGTAATTAAT TCGTCGAAGGACAGGTGAGTAACAAATAACAAATCGACAAGACTTCTCTT TTAAGCTTTCACTGACACAATTCTGAATTTTCAGAGTGCCGAACATCAAG TTCAATGTTGCAAAAGTTTTGCAGTCGCTTATACCTATCCTTGATCAATC TGTGAGTTCCCAGAGTTTCTTCCACATGGTCCTGGTTTTTTTTTTGATAT AGTTCAGTTCAGTCATGGGTTATTGGGGAACATCATGAATACTAACTTTG CAGGTCGTCGAGAAGACTGTGAAACCATGCCTTGTCGAGCTCAGCGAGGA CCCTGATGTGGACGTAAGATACTATGCAAACCAGGCCCTTCAGGCGTGTG ATCAAATCATGATGTCAAGCTAACTAGCTACTATCGAGTGTTTAGAAGAT AATTCTTCTTAGTCGAGCTTCGGAGTACATGTAATTTATCCTCTAGAGTG GGAACTTCCTTCTAGCCCCAGTAACCGACTTATGGTTCTGTTCCCATTTT ATTGTTCTTATTGTTGTAATTGAGCAAGACAGCACCCACGTGGTTTACAT GGCAGTTTGAACATGGTTTCTGTCAATTTGGATGTAGTGTGCCTGATGTC ATTTTTATTGAATTGTAATTGCTGTTTGTTGATTTTGCCTGCCTCCTTGA ATATTGCAAAGTTAATATATTGGCAGTTGTATTGTTAGTTCTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.