Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA043535

[Submit comment/correction]

Sequence
AA043535
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043535
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAGAGAGAAGGTCATCTTGGTCACTCCGAGGACGAGTCTCAGCCACACGA
AACCATCGAGGACCTTTTCGTAAAAAAAACACCCTCCTGCAGTTGCAGTT
TATACCACTATAAAGTACAGGAGCCGCGTGCCGGCCCGAAGAGAGAAAAA
TTATAAAAATAAAAATAAAACTCTCTCGTCTCTCTCGCGCTCGTTTCACA
CCACTCCTCCCCACTACACCGTTCCTCAATCCCCTCCGTCCCGCCGCACC
AATTCCGCGGCCGGCCGTCGCGTCGTCGATCCATGCCCCTCGCTTCCTCC
TCCTGGATGGTCCCCGCCGCCTCGACCCGCGGCTCTCTCGCCTACACGCC
GAACCCGTCCGGAGCCGCCTAGCTCCGTCCGGCGGGAGAAGAGAAGATCC
ATTTTTGACCGTCCTCGTCCAGGTTAGTGCGCCTCGCTTTCTCCGGTTCC
TCACTTGACGCGGTAACTTCCTATTGATCGATGCGGCCGGTCTCGGGAGG
TAACCCGGTCGTGATCCTGAGATGCTTCGCTTTTACCGCTTTCGTTTTAC
ACTTTCTGTTTTTGCTGATTGCCTTCTGTTGCTGCCTTTGCTGATAATCC
ACCAACTGGTGATGATGCTCTGTTTTGCCTGTATCTGTGCGTACGTCTGA
ATTAATCGAAGCGAGGAGGCTGCAATCCCGTGCTAAATTGGTTGGCAGTG
ATAGCTTGTTGCAGCAAAAAGTAGCGTCTTTTTTCCTCCTTTTTACTTTA
ATTTCTGCTTGGAAATGATCTGTCCTGGGCCTTGAACAGAAAGGAACGAA
GCTGCAGTCTTGCAAGCTAAGGTTTCTGCAGTTTGGTTCATGATCGTTGA
GTCTGCCTTTTGGGCACAACACGATGTGTCTGTTGTTTACTCGCTTTTCT
GATTGGGCGAGGCTTGCTGGATTAGTATTATTAGTCCTGCAACTTTTCCA
CCATTTCGAACCATGCAGGAAAACAGTCTTGACTAGATACAGCTATCCAT
GTTTATCATTAATGGTTTAGATTTAGTTTGGCGGAAAACAGCAGGGACGG
CCCTACTCTAGCAGTTTATAATGAATACTTGAGCTGTTCGTAGGTAGCTG
ACTCTCTGAAGTCTGAACGACCTTTCCAGCGTAATCTACAGTTAAGCCGC
AATCTAGTATTCTAAGGCTGCTTAAAAAGAGCCTGATTGGACTGTGAGGC
CGTTGCAGCTATCTGTATGGTGGGAGTAATAATACTGGGTTGTTCGATCA
GTGCGCAACAAACCAGAAAAGGCTTCCATCTTGCTTGTTGTTAGGTCGTT
GATCTGGTTGCTTAGATTGATAAGATGATGTGCTAATATGTAATAATGCG
GCAGCGGTCCCCGGAGGATCGCGTAATGATTTGTTTGTTTTCTGCAATGT
GTCCTTATCGCTGCTATAGTATGCCACACATTAACGTGATGACTCGAATC
ATTCATTTATATCAAGTCTCACCAGTGCTTGACACTGTTGGGACCGCGCA
AAATTAGGTCTCTATCAGGCATTTCTATTCTTCTTTTAGTGTTAATTCCC
TAATGCTAAAATCACTGCATCTGCTTGGTACGGCAGTGCTTTTGACAGAG
AATTCTGAGTCCCAACGGATGATCATGTGTGAGAGAGATCAAAGTTTCCA
CTGGGCTTACGACCTTTTCCGTGACCCTTTTGCTTCTACCGGGTACTACC
CACATCCTAATGGCTACGCTGATGGAAACTACTGTGACCACCATTATCCT
AGAGGTAGTCCTGTGGAATGTGTTGCAAGTATTTTGTGCAAAAGCCATGA
AAAAGAAAGAGACAGTGTTCCTCATGTATATATTTTTGGTTCTGCAGATG
CATCACATCCAGACGAGACACATTTGCATTCTTCTGCACTTACGTATGAT
ATGTACAACCCGTCGGTAGACATGTACCATCATGGTAGTGAAAATAATCC
ATCGTCTGATTCAGCGTTTACCTTCCACACTTTTGCTTCCCCCCTTAACG
TTTGTCGTGTGTTTCAGGAAATGTTGGTGGGCAGGAGCATGAGGCAGTCT
ACGTAGATCCGTCTAGTTCCTCCTCATACCCTGAAAGTGACGACTGTTTC
GAAATGGAGGAAGAAGTAGGGAAGAGATTGTTCCCCATGGTCCCAGTTCC
CGTGAGTCTATCAATCCTTTAAGTCAGGCTAAGAATTATCATTGTTTTGC
TAGTTTGGTTTGTCTCATTTGGAACCAGAATACATGAATATTTTCTTCTA
AGGAAGTTTGGAACTGAAGTAACTACTAAGCAATGGCCACCTTAGGTCAC
AGCTTTAAGCGACCACAACATAGGAACCTCGACAAATTACCTGCATACGT
GTTTAACTAAATTTTATCTGTCAGTTGTTTAACTGACCGTAAATATCATT
TGCTTCAATAGACAACATGATAGAAAATTATCCAAAAGTATTTAAATACA
TTAAAAGGTGAATTAAATTCAATATTCAATAATCCGTGTCAGTTCATGTC
TTGTAAAATCTGGCAACATTCCACTGAAAACTGTGCCTACCAGGTTCAAT
TTATAGAACTTTGCTTATAAAGGTGTGATTACTGCCTTGTAACCGTCATG
GGAGCACCTTGTCACTCATACCTCAACATCTAACAAAAAACAAGTCACAA
CTGATATCTGCACAATTAATCCTAGATTATACTTTTATTTTTCAGATACC
TCCATTATTTAGAAGGAAATAAACCACTGCAAATATCTGCTGCATTTATT
ATTAGCTTTTATTCCATTACATTTGCAAGCCAGATTAATAATTTGTTTCT
GCCTTATCCAGCATGTCCCTAAAATTAATGGGCAAATTCCATCATTCGAT
GAAGCCACCATGGACCATGAAAGGCTGTCAGACAGGTCCGCCTTTAATTC
CAGCTTTATGTTATATGCAAGTCTCATGCTTCATGGGATTCTGTTTGTTA
GTAAATGCTGTGGAAGCACTGAATTTTACGATGGATCGAAATTACTATAA
TAAGTCTGATAATGTTTCTTCTTATATTTTTGAAGTGTAAGAGTGTCCAG
GTGTAGTTCAGTATTTTTACATGTGTATTGTTGTAGGTTGAGGCTGTATG
AACTAGTTGAGCACAAGGTAAAAGGTGATGGTAACTGTCAGGTTAGTACT
CAGCACCATCCTCAACCTGAATACATGATTTTATTCTGTGGAAAGCAGCA
GTAGCTAGTTCACTGAGTTATTCCATTGTTACTGGCTGTTAAATACATGG
TACACTAGGCTATTGATGCTAATCTGATGTTCTCAACTCCACAGTTCCGT
GCGCTATCAGATCAGCTTTACCAAACTCCTGACCATCATGAGTTTGTGAG
GGAGCAAATAATTAGTCAGGTAATCAACAGTATTAATGTTTGTTTCATGA
TCCTTAGTCTTATTCTTTATTTATTTTTTCACTCCCTTCGTTTATCTGAT
AATAATCCTCTTCCAGCTTAAAAGTAACCGCGATGCCTATGATGGATATG
TCCCCATGGCATATGATGAGTATTTGGACAAAGTATCGCGGTACGCTCCG
CAGTTAGAGAACCATTCATGACAAATATACAAATTAGGTGCATGCCAGTG
CTTTCCTAACTAACGTTTTAGTGCATAAACCAACAGAAACGGTGAATGGG
GTGACCACGTGACTTTACAGGCAGCTGCTGACAAGGTGCTTATTATTACC
CCTCTGCATACTGTCTTACTTATGGTATAGCATATCACAGCTGGCAAGGG
TTGTACTTTTTAAAGGTCATTCTAACGCCAGTTGACAATCTGATGCAGTA
CGGAGTGAAAATTTTCGTCATGACCTCGTTCAAGGATACATGCTACATTG
AGATCCAGCCTAAGGTTGTGAAGTCCAACAAAGGTATACTTATATTTTGT
TTCCACTTGCAAGTGTGTGGTCTTGGTCATGCTTCAATTGGTACTTAACT
TTAGATCCACTGTTGTTGTCCTGATTGCAGTGGTACTGTTGAGCTTTTGG
GCGGAGGTTCACTACAATTCGATATCCCCGCAGAACGGTGAGTAGCATGC
CTGCCTGCTATAGGAATACATGCAATGTGTGTCCGGTCCTCGTCGCCAAT
GTATGCAACCAACATTTCACGTCGACACCGCAGTCTGCCTGATTACAATA
GTTCCTGAAAGCCTGTCTTTCGTGATGGTTTGTGAACAGACGCTCCGAGG
TTGCATACGGCAAAGAAGAGGAGATGGTGGCAGTTCTCACAGCACAACCA
TTGATGATGCTTTTTTTTCCTCAGCCTCGGCACGTCGGCGTGCAGAGCTT
CTTTTTCTTTCTTCATCAAGATGACCCGGAGGCCCTCTCCTGGGAGGGGT
CATTGCCCTGATGATGTCCTGTCAGTCCGTCTGATACAAAGGGGAAGGCA
TTACTGAGATTATATAGATACATGGAAGAAATAAACATGCAATATGTCCC
GTATATAGTTTGGGTTGCAGGCTGCATTACATGTTTGTATTTACAAAATT
TTGCCGGAATGAGGCTACAATTAATCATTGATTCATAATACAATGTTATG
ATGATAATGATCATAATAACACTCTCTCTCTCCCTCTCTTTGTCTCATCC
ATGTATTTATCCCTGTGAGATGCCTTTTTTCCCTTCTTGTATCATGGATG
ATGTACCTTTTCTATTGGCAACATAAAACTTATTGAGTATACGAGCGATT
CTCCGGTGGAGATAAAAAGCCATACATGGATTAAGAAGGAAGAAACTTAT
TCCGCATGTTATCGATCTTAAGCCTGATGTAGTTAAGTCTGGAGCTATTT
TGTTTTGGACTTCTGTAACCTTTTGTCATGTTTTCTCTTTGCAATTAGAA
TGTTTTACTACTCTCTCCGGTGAGAGAGAAATGGCCTCAACTATATCTAG
ATTGGGAGTACTAATATGGAATGCCTAGGCCAGAATTGGATTCTCTGTTT
ATGCTAACTCCAGGAGGTGAAACTTCACCTTATCTTAATATATTGGTTCA
GGCATGGAGCAAGAAGTTCACTGCAACACATTGAAAACATTTTTGTTGAA
TCTGCGAGTTTTAAGTTGTTTCTGAGATATTCTCTGTCCTGACAATACCT
GTGAATCATTATCCAGGCAAGTAAAAAAAAAATGAAGATTAGGGCACTAT
AGTACCGCAACACTGGATTGGTTCCAAATGAGAGACTGTGCATGCTTGCA
TTGGCTTTGCACTGAGAAGTTCGGACAGATTGTACCCAACAGAAGATAAC
CGCCGTCGGGAGAGATGGATGCGCCGGCGACGCATCAACTTCTCCCGCAG
CCATCCGTCTGGCTCCAGCGCCGGCCGGGATCCTCGCGGATCCATGGCTG
CCAAGGCCGTCGGAGGCAGGGGGTGGCCGGGATTGGGCAACTTGCAGGCG
TCTCCGTCGCCGTTCAAGGAGGGGGAGGAATGGGCGCACGGAGCGGCCTT
CCAGCGCCTGGCGGCCACAGCAGAGGACGTCGCCCGCCGGCTCTGCCTTA
TGCTGTACGTAGGCAACGCCCCCAGGCACCACGGCTGACGCTACGCCTCG
GTGAGTTCCACAAGCATATGCAGAATTTCAGGCTCCCATCGCCATTACTT
TGTCACTGTCCATCCCTGATATTTCATTTAGTGATGAATCTCACAACTCG
CCCTGAAATTGCTTCCCACATTTGGGCACAGGGGTAATATTGTAGTACTA
CTGAAATACATATACTAATTGCATATGCAGAGGTATGAAAAACTCGTAGC
GGCATGTTCCCAACTTGGTTTTTTATGATGGCATTTCTCCAACTGTGGTG
AAAATTGCAGTGGCATGAATCCAACTAAAGCCAGGACCAACAATGACCAA
TACAGACGGGATTACCAGTTCCACATACAAATCACGAGAACCGGTAGGCC
GCACACAGGCTAAGCAAACAGGGCCAGCTACAGAACTAAAACCACACCTA
GACAGGAATAGATCACCATTTACTAAGCCAATCAAGCTTGACACAAATTT
AGGGGGCTGGCCTGGATGTCTCGGCTGGTGAACTTGTTTCAGCAAAAGGC
CTTGCGTTATATACGGTCCTGACGACTTCCTCGCCATGTCCCATCTTAAC
ATGGGCATCCCTTATCCCGCGAATCGCGGTCGAAGCGTCTCTCATGCACA
TTCTATCTGCCGGATTATGCTCGCAGCATGATAGCGAGACCTTCATGATA
GACAATATGGCATCGCTTACATGTCCCATTGCGTTGCTTCCTTCCCACGA
GCTGCTCGCCATGGCTTCTTCGATGGACAGCAGGACCGGATCAACGATCT
GCATCAGCGTCCCTGCAAATGCATTCCTCTCCACATGCTTCTGCAAGGTC
AGCCCGTCTCTGAACATGTCGTGGGTGGGCACCATCCCTGTGAACAGCTC
GAGGATGACGATTCCAAAGCTGTATACGTCTCCACATGGAGAGACCTGGC
CACCTTGGCCATATTCTGTGTTTCATAGACCAAAAATTAGTGATTTTGCA
TGCAAAATTAATGTCATGGAGTATGTAATGTTAGAGGAAAAATTAAGGTA
CCTGGAGCAACGTATCCAATTGTTCCTCTTATGCCAATCGAACTCTTTGA
ATCAACCGGTTGCTCTGTGGCTGGTTCAGGAAGAATCTTCGCGAGGCCAA
AGTCCCCAACGTGAGCGACTAGATCCTCGTCAAGAAGAATGTTGCTTGGC
TTCAAGTCACAGTGAACTATTGGCGGTTCACAGTTGTTGTGCAGATAATC
TAGTGCATCAGCGATATCAACTGCAATATTCAATCTCTGCGCCAGTGTCA
AACCTTGCAGTTCCTGTGATGCCCGTACATCCAGATTTAACCACCTATCT
AGGCTCCCATTAGTCATGAACTCAAACACGATGGCTTTGAAGTCATTTTG
GTTTGAATCTGAGCTTGAGCAGCAAGTTATGAAACTAATCAAGTTACGAT
GGCGAATCTTACTAAGTGCTTCACACTCCGCCAGAAAGGTTTTTGAGGAA
CCAGACTGTTGAAGATCAAAAACCTTCACTGCTACTATTGTCATAATATT
TTTGAGCACCAAACCACACTTGTACACTGATCCATACCTTCCTTTACCAA
TCAGATTTCCTGTGGCAAAACCGCTCGTTCCTTGGACCAATTCAGCATAA
GAGACTCTAGGATAACGGTCACCCATCAGTTGAAATCCTCTAATGGTTGT
AGGTCGAGCTCTTGATTTCTTTTTCATTGTGAAGAAAAGAAGCATCAAAC
TCATGCAAAGAATTATGACAACAACAATTGGGGTAGCTACCGTGATAATG
AAATGGTGTTTCCTCAAGCTGTGTCCCTTGGATTCTTCTGGGCATGGGGG
AAAATGCAGCTCCGAGATACCACCACAAAGCCCTAAATTGCCACCACACG
AAAACCCTGATGCATTACTGAACACGCCCTGTGATGGAACTTTGCCATCT
AGATGGTTGAATGACAGGTCAAGCCTGTATAATGATGCCATGTTTTCCAT
GCTTTCAGGGATATGACCAGAAAGGTTGTTGTGTCCGAGATATAACTCTC
CAATGCCACCCATTAGCCCCAGCTCTTGAGGAATCACACCAGAGAGTGTG
TTCTTTGTAAGATTTAGCAACATCAGGCCTCGGATTTTGCTGATAGATGA
GGGGATGCTACTACTGAAGTTATTATGGTCCAACCTGAGTTCTGTCAAGC
TTTGGCAGTTGCTGAGTTCATTGGGTAGGGGCCCCGATAAGTTGTTCCTT
GATACATATAGGTATGCAAGGTTTGTCAGGCCGCCAACTTCTGAGGGAAG
TGGACCGACAAAATAATTGTCAGAGAAATCTAGCAAGAATGACAAGGATG
ATAGGTTAAAGATTTCCTTAGGCAATGGACCTGTGAACCTATTGTATGAA
AAGTCTATTGTAGTTATCTCCTGGAATCTCCCTAGGGTTGTTGGAAGAGG
CCCCTCAAACTTGTTGCCGGTTGCCGGAAGAATTACTAGCCGTGTCAAGT
TCCCGAGGGAGGATGGCAAGGACCCTGTCAATAGATTATTTTCGAAATAC
AAGGCTTGTAGAAAATTTAGCCTCCCGATGCCGTCGGGCAAGGCACCAGT
AAACCGATTATTGGAGAGGTCCAGTTGATTTAGCCCGACGAGGTTGCTTA
TGCCAAATGGTATATTTCCAGAAATCTGATTGTATCCAACATCTAGTTCT
TTGAGTTGTGCTGATAGGTTGGCAATAGAGCTTGGCAGCACACCACCTAA
ATTGTTGAAATAGAGGTCTAGTGTACCAAGACTTGTGCAGTTTGTAAAGA
GCGTCATGAACTCCCAGTCCTGAGCAGTAGCTGCCGTTAGCTGATTCACT
TCTAGACTGAGGTAGTCTGGGCATAGCAATCCAATCTCTCGAGGCAATAT
ACCAGTGAGGTTATTGGATGACATGTCTAGGCCATACATACCAGTTGCAT
TGACAAGAGAAGCTGGAAGGCTTCCTGTAAGGTGGTTCTTTCCCAGTAAT
AGATACCGGAGATTTGGGATGTGATCCCCCAAGTTTGAGGGAAGTTTACC
ATGAAACTCATTCAACGCTACACTGAAGACAATTAGAGAGGAAAAGTTAA
ATAAAATAGCAGGGATGATGCCAGAGAGGTGGTTTTGACCCAGTTGAAGC
ATGGTGAGACTAGTGATCGTGCCAATGCCCTCAGGGATGGAACCTTGGAG
TTGGTTTGTGGTGAAATCGATATTTTGCAGTGCTGAGAGGTTGGCAAGTG
ATAGCGGGATGGTTCCAGTGAAGTTGTTGTTCCATAGGCTTATGACCTTG
AGACTTGACAATCCTCCGAGCCAAGGGGGGATTTCTCCAGTGAACTGGTT
TGCCCCAAGGTAGATGTTTTCAAGATGTGTGCAGTTCTTCAAGTCAGTGT
GTACATTACCATGAAGTGAGTTGTTGGACAAGCGAAGATGATGTAAACGG
GATAGACGACCAATTGATGAAGGTATTTCGCCTTGCAAATTGTTCAAGCT
GAGGTCTAGAGTTTTTAAGAATGTGAGGTTCCCAATGGAAGGTGCGATTG
TGCCACCAAGGCCCTCGGAGGTGAGGTTAAGCACCGTAACCCTGTGCTTA
TGCTTAATGCTGCAACCCACACCTGGCCACTGGCAGAATTGAGTACTTGT
GTTCCATGCATCTAGGACACCACCCCGCTGGTTGCTTATGCTTGCCTTGA
ATGCCAACAAGGCTTCCACATCAGTCCAATTGCTGAATGGTCTCGCTGAT
GCTGACTGGAGTAGTACGTACGGCAAAAGAAGCAACAGAAGAGCAGGGAA
CATCGATCCCACTGGTAAGCAGAGAGAAGAAATTCGTAAGGTTTATGCCA
CATTCTATACCGAAATCAATGAACATATTGTATGCTTACTAGTCTACCAA
AGCTTCACTAGTTTACTGAGAAAGATACCGAAGTTAGGATGGTATCTACT
CTGAATATGTAAGGTCCCATAGCTTCATTTTTTGGTTATGTCTTGGTTGG
AAACATCTAATCTGGATATATATATGGTTTTAGTGCAGAAATTTGCTGAC
AGAATATTCTAGAGGCCGTCTGTACATCATCATGTGCCTGATTTCCTCGC
TAGGAAGAAGTCCATTTTTGTCCACCGTACCGGAGCAACATCCAACAGGT
GAAATAACATATTTATCCAAGCACAACAGGTAGAAAATTTGGGCTTGTTC
CTAACTAATCGTATTGCTGCCGTGGCGATAGTTTGCAAAACCGATACTAC
TTACTTTAATCCATTTTTGTTCATGTTGCTTTCTTATATATTTACCTCTC
CGTGATGTTGTTTCGTATATTTTTCAACTCCTTTTTTTTTGTCCCCTACC
TCCCTCCATACCTTTCTCACTTAATTTTTCATCTGCTCCTTTTTTTGTTT
TGTTTTGGTGATTAGGTGCACTAAAAAGAAATGTACACCATGTTCAACCA
GCGCCCCCACTGCAAACATACAGAATTTCGCAAACTGACATACCAATTAA
GGGAGATATGGATTAGATACCTTTTGTATTTCCTGCCGCGGACTTGCGAA
GAGAAGTTCCTGCCTGCCAGTGTGCGCCTCTTTAGCCTGATGCTCTAGTG
CGCGAAATGAGCTAGGATGCAGCTTTGTACCTTGAGTGAAGGCCTTAAAA
ATGGCGGAGGCCGAGGACATGAAAAAGCAAGAAAGCATCCTCTCCTTGAC
TCGCCGGGTCAAGAAGGGCGAGGTGCCATGCCCTTGCACAGTGCTGTCTC
CATCACCATAATAGTAGTGACCGGCAAGGTAAAGTTGTGAGGAAAGATGG
TGGGAAATGGTGGTGGACACTGGTCAAGGAAAGCTCCCTCATGCCAGCGT
CGCAGGGCAAGACCAGGAGGAGCCTCGGCGGGGTTCAACTGGCCTGGGTC
TTCTTGTCCACTGTGCTGCGTACTGCAGCTCTTCTTGTCCACTAATTACG
ATTCCCCTCGTTGTCAAATCAAAGAGCACTTGGATCTTTGTGATAGCGCC
AACCGCCATGTTTTCTCCAGAAACGATGTAAAAATACACCGACAACTTTG
CACTATACGGTTTGAAGATGGTGTAGTCAGGTATATATAACTGCAGAGTT
CGTCATAAAGAGTTTAAGTCATTCAATTTCTTTCGGCGGGCGTGCGTATG
TATGTATGTGTAAGGAAAGATTTTGGAAAACTAACTGGATATATTATTTC
CGCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.