Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA042929

[Submit comment/correction]

Sequence	AA042929
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA042929
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTAGGTAGCTCGTGTCTCGTTAAGTTAAGCCCAAACTGTGTGCGGGTCTG CGAGTACGCGCCAATCCGCTTCCCGGAACTACGACCTACTCTCGCCGCAA ACCGCAGCTGTCCCCTCCCAGGGCCCCAGTTCCCTAGGGTTCCTAGGCCG TACGACCGTCGCCATTTGCTTACATGGCCTCATCGGTCGCCGCCGCGCGC CTCGCCGGCGGGGTATCTCGCCCGGCGTCTAGGGATGCAACCGCCCGGGG CCTTTCGTCAAGGAGCCTGAGTCTGCCCTCGCCTCGCCGGCGTCAGGGCA GCATCCGGTGCTGCGTGGTTCGCCATCCCGGCGGCGGCAGCGGCGTGGAC GCGGGGGAGGAGTTCGTGGGGTTCTTCCGCGAGGCGTGGCCGTACATCCG GGGCCACCGCGGGAGCACCTTCGTGGTCGTCGTCTCCAGCGAGGTCGTGT CAGGGCCGCACTTGGACCGCATTCTGCAGGTGCTGCATGGCTGATTGTTT AAGTTGAGTTGAGTTGGTGATTTTTGGATTTGTTCCAGTTCTTTGTTCAT ACTGTATAAAGTAGTACATGCCACCTGTCCTGCTTTACTGTCCTTGGGGC TCCAATAGTGAATTTGTCCTTTTCTATATAGCATTGAGTTTGTTTCACTT GCACTTAGTAATTGTCCAGACAGCAAAATCAGAAATTATCCAAACAAAGT AATTAAATTATAATAGCCATTGTGATCAGTGATATGCCCGCCATGGTTTC ACAATAAAGCACTCTGCGTTTTTTATACATATCAAAATAGTCATAGACCA GAAAGAGACTGTAAGAATGGTTCATTGGAGTTTATTAATTGATACTCCTA TAAGAATTGGGGAATAGAAAGAAGAGTAAGGCACTGAGATGGTGCAAGTC TTGCAACCAAAATGGCAAGGAAAAAATAACTAAGCTAAAACCAAACCAAA GCAAAGCCAGAACAAAGAGAACCTATGAGAAAGAACTGTACAGCTATGGG ACACATTACTGGAAATAGAATGAAGAGTAACTTTTTTTTGGTAGGTAGGA GATAATAACACTTATTATTGGACTTCTTTAATGGGATAAGAATTGGGGGA TACGAAGAGTAAACTTCATGTTTTTGATAACTAGGAGGATTGAGGTTATG AATGTGATTCAAGACTGTAAATCATGTCAGCATTAGCACATTATTGAGAA AAAGGAGTAGAGAACATCGACTTTCCTGTGAGGAATCTGGAAAATGTTGC ATTCATGTGGCCAAGGCTTGAGTCTTTTTATGTGATAGATTTATCTTCTT TCATGGTCATCAAATTTCACAGGGTTATGGATTCCTAGTTATCAAATGCA TTGCGTTTTGCATTTTTGAAGGGAAACATTACATTTCTATCACATGCAGG ATATTTCACTTCTTCATGGTCTCGGGGTTAACTTTGTTCTTGTTCCGGGG ACACATGTTCAGATTGATAAGCTCTTATCAGAAAGAGGTCAGTTCTGCAC GCACAGCTCAAAACACATCCTTGTTGCCGTACTTGCCATTCATTCTTCGT CTATCACTCTTAAAATTGGCTATTCATTGACACAGCACTGGAAAATGATT CGTATTGCTCATGTGGATTTATTTATTTTGCAAAGATTGCGACACAAGTT GTATAATATAATTTTTGTAAGTACAACTTAATCTGCGAAGCACATGATCA GGCTGGATGACTAGAAATAGAGCAGAACCCATTTTGCTACTGCACACTGA TACCTTGTCAGTGAACAGCATCTCATTAGGAAGTCTAGCATTTAGTTCGT CAATGTCTGCCTCACTCTCGTAAAATCTTCCATGGAATTATATCCGAATG TGATTTGCGGATGAACTCTGAAACCAGGACTAGCCTGACAATTGTTGTGG GTTAAATACATGAAAACATAAAGTTATTAGTTCTTTGATAGGTTACAATG ATGTGGAGAATGATTCTTTTCTGCACTATTGTGTTGTCCTTAGCTTATGC TAATTTTGGCAGACATTATTCTTCTTGCAACTTATTTCTAATATTTTTCT GGTAGTGCAACTGCTCATCTTATGAATTTCTGTAGGAAGGAAGGCTAAAT ATGTCGGTCAGTACCGAGTTACTGATTCCGATTCATTAGAGGCTGCAATG GAGGCAGCTGGCAGAATAAGGTTAACAATAGAGGCAAAGCTCTCTCCTGG TCCTCCAATGTTAAATCTCCGTAGACATGGTGTCATTGGACATTCACATG GTCTTGTCGATAATGTCGCAAGTGGCAACTTCCTTGGTGCTAAGGTGAAA TTTAACCGAGCTTCCTAAAAAATAAGTAGTCCTCACCATATTATCTTGTA ACTTGGAAGTATTGTGTAACATGTGCTCGGCGCAAATTTTATGCTTGTAA ATAGCTCCCTATGAGAGTAAACCATAGGTTTTTCCTTCCACTTGTTACTT CAGAATAGGGATGTACTGTGCAGTCTTTAATTAGAAGATTCATTTTTGGA CCCTGAACTTTGCTAAAACCTCAAAACCTTACTTTTTGAGCTATGGTTTA ACTGGAGATAATCAGTTTATGTAAGTTTGGAAATTCAGATAGATAAATAA TATGAACTGGAAACTAAGAATAAAGTCTGTTGTCCTCGCATAATTTATAC AGTAGTTCTGATTAATAACTGATACTTTCTTTAGCATCTATTAATTGAAG TTTGTAAAATTGTTTAGTTCCATGATAATGCAATACCAAAGTACTGATAA CTTGGTATATTTCAATAATGTTCTCTATACATGCATTTCAAGATACAGGG ATTTCCTTATTGATTTCAAAGAATATTTTAATTATTCCTGTGTCCAAAGC ACTCATTTCACCTTTCCAACTATTTTACATTTCATTTGCTTCATGTTCAC TCTTAAATTCTGGATGCAGAGCCTTAAATTCTAACCCCTCTGTCCCATAT ATTGGTTGTAATAACATCTTATATTATGGGACGGAGTAACATTTAACCAC CAGGTATATCTGTCCAAATGACGAAGTGTCAAAACTCAAAAATAGAAAAC TTGCTCTTGTATTAAAAGCTGGTCCATGCTGACAGTAATTCCATGTTCAA GGCACCGAGTTACTTGCAACACACAAACAACTGGCCTGATACAAATTCGT GGTTAAGAACTAGTTTTTCACGTTGTTGTAAATAGTAAATACCCTTCAAT TGTCATTCTGGTGAAGTTGGAATATTGTCAAAGGCGTGGATCTCCACTCT TAGCCCATTATAGAGATAATTATAGTACAATACTTAGTCAGTAAGGATAT CTATTTATTTGGGGAAGAGGTCAGTTTAGATAGGAAGAAAACGTATGGTT TGTTAGGAATGTTGGGGTTCTATTCTTAGGCATCAAGTTGACCCTTCCCC GTCCAATGAGTAAGGATAAACTAGTAGAGATCTAATCCCTGTCCCCAAAC TTTTTTCCCTTTCATCCCCTGCACCATGGCCGGTGAACCCTTCCTCCTTA GACTACTGCCCCCAATCTTGTCACATTGTGAGGTGTTAGGACCGATACCA ATCTTAGCATGTGACAATTTGCTCCTATAAACCGATGTGCTTAAAACAAT GTGAAGAACTCTAGGGTCAGGAGTCATGATCTGGAATTGGTAGGCATATG TTCCCGACTTGTAACTTTATGGTCCTGGTTATACCTTCGCACATAAAATG TTAGATATTGGAGAACAACTGTAATACTGGGAACACTACATGTCTATTTC TGATAGTGTGCATGTGTGTGCCTGCATGGTGTTTCTCCACTTCATATTGT CTATGTTTCAGTGAACTTCACTTGGCTGGAGGTCCTGTAATACTAAATTT TTGCAACTACTTTTGACAGAGAAGGGGGGTAGTTAATGGTGTTGATTACG GATTCACTGGTGAAGTCAAGAAAATAGATGTTCCACGGATAAAAGAAAGG CTTGATAGTGATAGCATAGTTGTTGTGAGCAATATGGGATACTCGAGCTC AGGAGAAGTCTTAAACTGCAAGTATGTAGTTTTTCCTATCTGTTGCCCAT TTTCATGATATATTAACGATTACATGCTTACTCCCTCCGTCCGTGAATAA GTGTACATTTAGCTTTTGTCTTAAGTCAAACTTTATTTAATTTGACCAAC TTTATAGAAAAATGTAGCAATGTATGTGACACCAAATTAGTATATCACGA AACCACATTTGAAGATGGATCTAGTGATATTAATTTAGCATCATAAATGA TGCTGTTTTTTTCTAGGAAGTTGGTCAAACTTAAGGAAGTTTGACTTAGG ACAAAAGTTGAATTTACACTTATTCGTGGACGGAGGGAGTATGTTGTTAT TTCCCACCGCTAAGTTAGGAATATATAATATAGAAAATGTGTGTGAATGC CCTTTCTTATTTAAGCTTCTAAAGTTATACAAAATAATGTTGTTGTTTGT AATTTGTATATATTGTTGTTAGCCTACTAAACAAAATTGGTTTATTTTGT TCACAAACATTCAGCACTTATGAAGTTGCCACCGCTTGTGCTTTGGCCAT AGAGGCAGATAAACTTATCTGCGTTGTGGATGGTCAGATATTTGATGAGC ATGGGCGAGTCATTCATTTCATGTCTCTTGAGGAAGCTGACATGTTGATC AGAAAGCGTGCTAAGTTAAGTGATATTGCTGCAAATTATGTCAAGGTTGT GGATGAGGAAGACCATGAACCATCTTTGAACGGAAGGGGTTATCTTAATG GTTATGCTCCTTCTTTTCAAAATGGTTTGGGCTTTAACAACGGGAATGGT ATTTATTCTGGCGAGCAAGGGTTTGCTATTGGTGGTGAAGAGCGATTAAG CAGGTCGAATGGCTACCTTTCTGAATTGGCTGCAGCAGCATATGTGTGCC ATGTAAGTGTTATACCTTCCATATGGCGTCCTTCTGTTAAATTCTGTAGT TCTGGTTCTAGATTACTAGCTTTACACAGAGCATACTATGAACATCTAAT TTTTTGGAAATTGCATGGTCTGTGAAGCAGCATAATTGTTTTCTGAATTT GCTAGCTCATGTCAAGCTTCTTGATCAATATAGTTGTGGATACAGTATTA TAGTGTCATGCTGCTATGTACCTAAGCCTTGGATCCGCATGTTTCTGAGG TAGCTGTAGCAGTTCTGATGAAGCAATAGTCATATTGCCTGAAGTGTTCT CAGGTCTGAAAAGACTGGTACACTGAACCACATATCAAGCCCTTTATCTC GTGTATGTATATTCTAGTTGTGCTAGATATGTATAACCCTGCTCAGAACT ACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAGCAAATGT ATCTAGACTACTTTTAGTATGTAGGTTCACTCAGGTTTGGAGTGAATCTA GACACTAAAAGAAGTCTAAATACATTTTCTTCACAAACCTAAAACATCTT ATATTTTGAAACAGAGGGAGTACATTACAGTAGTATACAATGTATGTGGA GATGACCTGCATATAATTATGTTAGAGCTTGAGTGCAGTTTGAGCAGGTG ACATGTCCTAAGACACTTGCATTTTCTCTTCCAATAAAACGAACAATATT TCTGCTAATCATGAAATACTGCAACCATATTCTCTATAGAGTGTAAGCTT GAAAGTTTCATGACAGTTTATATTACTTAGACGTGACTGCATTTGTTTCT TCCGTATGTCAGGGTGGCGTTCAAAGAGTGCATATCATCGACGGAACAGT TGATGGATCACTGCTGTTAGAATTGTTTACAAGAGATGGCGCAGGGACAA TGATAGCAAGGTATCCTGAAGGTCCTTTCTTGAAATTTTTAATTATAAAA AATATATGTTAATACACAAGGCAACGCTTCAAGGCTTGCTTTATCCTCCT ATTGAGTATCCACTTAAATGCATTTCCTTAACTGATTAATATCTTGCTGT TTCAGTTTAATACTCCTTCCAACCCAAATTACTTGTTGTGGATTTAGGCA AAATGTTGCCTAAATCTGCCTATATTCAATGAGCCTGCGACAAGTAATTT GGGTCAGAGAGAGTACTTTTGCATATACTGTACTTACAAACATATCTACA ATTTTTGTGCTAATGTGGATTGCTTACTAAGAAAAGAATAAACGATACCG TGTACCATGCCAAGACACTACAGCTTCTATATTACTATCTACATCGGCAC ATAAGTAATTTTTTGTAGATTTTGTTTTATAATGTTAGCGTTGCTCCATA ATGTATGTCAAGGCTGAAGATATATCATTGTTTTGAACTCTACATGTAGT TCCCTAACGGATATATTCACCATGGTATTGTCAATAAATGAATGCCTTTT GGAATCTAATAGCTTCTTCAAAATATTACTATGAAATAATGGTATATATA CCCTATCGCATGTTTTCAGGGATGTTTATGAAGGAACAAGGATGGCTACG GAGGAAGATCTTCATGGTATAAGAAAACTCATTCACCCACTAGAGGAATC TGGTGTTTTAGTGCGAAGAACAGATAAAGAGGTATGCTAAAACTTTGAAT AATATATATTGAGTGCCTTTTAAGTGTCAAGCCAATTGGTCTTTTTGCTT CTATTTAGGATTTTCTTCGTGCTTAGTAACACTAAAAATGAATGTCTTGT TTCCCACTTCTCCTCAGCTTCTTGAAGCTCTGTATGCATTCTATGTTGTT GAAAGAGATGGTTCAATCATTGCATGTGCTGCTCTTTTTCCGTTCCCCGA GGACGAATCTGGTGAAGTTGCTGCAATTGCTGTATCTGAAGAATGCCGAG GGAGAGGTCTAGGCGACAAGTTGCTTGGTATGTTCACTGCCTATTTGGTG TTCTGAAAGTAACTATCTAATCTTGCCCAGTAAAAAAATCAAAGCCAATA TCTTAATAACAATATAATTTTATAAACATACGAATTCACTAATATCACTT AGCATCTGGTGGTGTCGAGCTGTGTCAGAGCTAGTGTACCTTGCTTTCTG TCCCAGTGCATATCTGTGATCTGATTTTCACCATTCCAAGTGTTTTTACG TTAATTTGATTAATATTTGAATACACGGTTTTGAGGGATGCATGTGTCTG ATTCTCCATGCAAACCAGGGTTTTGTTTTATTGGGACAAAACTGAAAATG CCACAGCTGACTTTGGAGCATTGGTTGTTTTCGGATAGTGGAGCGTCACG AGCAAGAGATTCCCATGACCTCGCCGTTGGCTGGAGGTCGCCGGAGATAG TTGGTGGAGGCGCCATAGGACTTGATTGCTTTTTATTTCCTAGTCCTAGG GTGTTTTTTGTAAGAGGGAGGCCCTGTTCTGTTTTATCTAGTTTTGCTAG GGTGCTTTTCGCCAAGGGCCTCTCTGCAATTTGTACCTGCCACGTGTTTC ATCAAGCAGCTTCTGGGGTCTTCTAGGCCCAGTTATTGTTCAAAAAAAAG TTGGCTGCTTTGTCACATGCACACACAGAAACTAATAGGTTAAATAAATA AGTAAAGAAGAAACAACCAATGAAAAAATTAGTGGTAATGAGGGGGTTCC TTGAGAACTACCTAGCCCACTACTAACCATCTGATGTTAAGAGCAAAAAA TCAGAATGCTATTTGTTAGTACTCCTCAATGTACCAGTTAATACTTGCTC CCTTAACGTGACCTCAAGGTCGTCCTGTAACTTAAACCTTCTCTTTTTAA TTAATGAAAAAAGGAAAGCCTTTTTGCCTTGTTAAAGAAACCTCCTCTCT TTTGTACTCCCTCTGTTTTAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAGGA GATGTATCTAGACTACTTTTAGTGTGTAGGTTCACTCCAAACTTGAGTGA ACCTACACACTAAAAGAAGTCTAGATACATTTTTTTCACAAACCTAAAAC GGAGGGAGTATTAAAAGAGCTCTCACATGCTGTTATTAGTTTCTACTAGA AAGGATAATACACATCTTCATTTACTTCTGGTTATGGTTCTTCAGATTAC GTTGAGAAAGAGGCATTATCCCGTGGCCTTAGGAACCTATTCTTGCTCAC TACACGTACGGCTGATTGGTATGTACATATATCCTTCTCTTGTCTCGTTA TGTGAATGGTCTGATAGCTTATTATTTCATGATTGATCTTAGTGTAGACA TTGAGTTATCACTTGATCTAGTTCAAATATTACGGATTGCTGGTGATACT CAATTAGTATTAGTCTCTTTTAAATCCAAGTTTCATAGAGGAAAACGGTT GCGGCCTGAGTAAAGCGAATATCTGTAAGTTGGTCTGTGTTGGGTGTAGA GTTTGTCTCAAATCTAGTTGACAATTTGACATGTTGCTTTTTCATTAGGT CATATGTTTGCGGTGCTTAGTTTTGAAATGATGCAGGTTTGTGCGGCGTG GCTTCTCAGAGTGCTCGATCGAATCTATTCCTGAGCGGAGGAGAAAACGT ATCAATCTGTCACGTGGATCGAAATACTACATAAAACAGCTCCAGCTCCA GACAAAGCATGCTGGTGTCACAGCCAACAATTTTGTTGGCAGATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.