Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA007709

[Submit comment/correction]

Sequence	AA007709
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA007709
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCTGTTTCAAACCCTCTTCCTCACTCGCTCGCTTCCCCCAAAATCCCCT CACACAGTTTTCCCGTTCAGCCCACCGAAAGCTAGGGTTTCCCAGTCTGA ATCTCATCGATGATGCCGGCCAGCGCCGCGGCGGTCGCCGTCGAAGGGGA GGAGAAGGCGGCGGAGGCGGGGGGCGGGGAGCTGCTGTACTGCGGCACGA CGCGCTTCGACGTCATGGGCAAACAGGTGAAGGGCGGGATGCAGGGCAGA GGCAACCTGGTGTCCCCGACGCGGCTGCGCCCTCTCATGGGCGTGGACAT CCGCTTCGTCGCCACCGGATGCGGTGAGCTCCTCCGCCGCCGCGTCTAAG ATTGCCGCGTGATGCCCTGGTTTATTTCTTCATTTATTAAGGGGGCGTGG GAACCCGGGCAAACTTGTGCGCGGAAATGCTCGAAGCCCTGGATGTCCTA CGGAGTGAAGTTTGCTAATGGATTCATGTACTTTTCCCAGCGGCCTGCCA CTGTGCTGCTTTGGGTGCCGACGGCCGTTTCTTCACATGGGGTCGAAATG AGGTACTAGTATGAGTGGATGGCTAGTTTCTTTCAAGGTTTCTTACTTAA CGCCATGGTTTCTAGCAGAAGGGGCAGCTAGGCCATGGGGACACTCTCCT GCGTAATCTTCCTACCGTTGTTTCTGAACTATCAAAGTAAGAAAATCATC TGCAATACTGCTGAGCATGTTTCTTGCATCTTAACTGTTCAAATAGGTGT GTATGGTGCTGCTGAATTCATGAATATATACCATCCAATCTACTCCCTCC ATCTCGAAATAGATGTCGCAAATTTGTCAAAATTTGAATGAATCTATATA CTCCCTCCGACCCAAATTATTTTACTCAAATTTATCAAGATATAGATGTA TCTAATACTAAATCATGTCTAGATACAATCGAATCTAGACAAATCTAAGT CAACTAATTTGGGTCGGAGGGAGTACTAAATAGTGTCTAAATTCATTCAA AATTTGAAAAATCTAAGACATCTATTTTGAGACGGAGGGAGTAGTTGAAT TGACTGATCCAAAGGTCGACTGTTCTTGACACGTTTCTAAATGCTAATTA GCAGTAGTCGATTCCGCGCAGATACAACATAATTACAGCAAGTGTTGGAA GAAATCATACAGTGGTCGTAACTGACGATGGGAAGTCCTTCGCATTTGGT GACAACAAACTTGGGCAATTAGGGACGGGTTCACTAAGGAAAGGTTTGGT ATCCTTCCCTTTTCATTTTTTATGATTGATATGACATAAGTACTATTGCA CCACATACAATTGTTGTGTGGAAGTATCATTCTGGGCTTGGATAAATTGT GGCTACATCTGCTTGGAGCATTTTTTTTTTTGACAATTTCAGTGTGTTAT TTGCTTGATTAGCCAATTAGTACTATATAATCTACATATTGTGTATGTAT GCTGTTTACTTATTCTTGAATCAATGTTAATATATAGCAGAGATTTCAAA TTGATAGATTTACATTTCTTTACCTGTTTGGGTGATAACCAGTAAACATA TTTATGCCATATATTTGAGCATACTGAACTTTTCATTGTTCCGGACGCTG GAATAGTTCTGACAATGCTATGGGAATATGGCCATGTGGTATTTTCCCAT TTGGTTCTTACACTGATGTTATTTGTTGTCCCTGACTCCCTAATTTTCTG CAGGAACTGAGGTGTCGCCAGCCCCCTGTCTTGTTACTGAAGCATCTAGT GCTGTTTGTGGTGCTGAATTTACTGTCTGGCTGTCATCAGTTGAGGGATC TTCAATACTGTATGACCATGCTGAAACTATGAAACTTACAGATTAGCAAC CTATTCCGTCTTTCAGAATAACAATGATCATCTTTTCATGATAACCTCTT TTGATTAGTATATGCTTTAGCTTTAGTTGGTAGTTTTGTTCTCGTGCGTC GTTTTTTGAAGCAATATTTTATTCTTCGGTGCTATTCAGCACAGCAGGTC TTCCCCAGTACGGCCAACTTGGTCATGGAAGCGACAATGAGGTTGATTGC TCCTTTGTAATACAGCACACCTACTGAGTTTGCTATCATCAATGTTTGTG ACTTGATTTCTGTTATTACAGTATAATACCAAAGTTTCATCGGTAAAGCT ATCATATAATCCTCAGCCTCGCCCCAAAGCAATAGCTACATTATCTGGGA AAACTGTTGTCAAAGTTGCATGTGGAACAAACCATACAGGTTCTTTTCCT TTCTTTCCTTTTCTTGGTTAATGTGTGTCTTCAATCTTCAGGATTAAGAC TGATCTTAACAACTTTGCTATACTTGGATGTTGCAGTTGCTGTTGACTCA AGTGGCTTTGTTTACACGTATGTTCCTTCTCCACCATTTGCTTGACAATG TTAAATCCAGATAGTTATGACTTACTACTAGTGTCTCTATATAATTTTTT CTACACACATAAATATAATTGCTTTAGTCCCATATATAATTCTATTCTCT CATATAGTTTATTTTTTTGTTCTACAAGATGGGGTTTTGGTGGATATGGA AGGTAACCTATTCTTTTCATGTATCTCACCATGATGATGATGTATCCTAC ATTGTTCATCCGTCCACTTTCTTTTTAGCGTAGGTTGGGCCACAATGAAC AGAAGGATGAGTGGCAACCTCGCCTTGTTGAAATATTTACAAAGAACAAT ATCCTGGGTCCCAATGATGTTATCTCAGCTGGTTCTGCAAGTTCTGCATG TACTGCTGGTGGTATGATTCATATATATCTGATTCACATGTTATTTTGTC ATGCATCCTGGGATAAAATTACTATAGGAGTTTATTGCTTGGGCTATATC ACAAAATACACTATAATAAGCCAGTTCTGAGAATATAGTTTGGCCGAGGA TCATACATGGATCAAGTAGCTATTGTGCGGAATTTACCTTGTACCTTAAG CTGGTACTTAGTTATGTTTGTGTTGCATGTCTTGTTGAGATGATTACACA ATTCAAACATTTAAATGAAATGACATAGAAAGATTTAATTAGTAATGGAA CTTAGCCTGTTGCACGCCAAACCTCTCAAGCCTGGCAAACATTATTGTAG TATCAAATGTTGGCATTTTTTCCGTGTTTGCATACATATGTGGACATGCC TGTAAAACCATATCATTCAGCTAACATATATGAAAGTTGTTAGAGTTTTT AAGTCTATGGTCTTGTGCGATTAATTACTTGAAAATCTGACCTGAAAACT TGGGTACTTTCTGATAATATTGCTCTTTAATTATTTCATTTAAAGGAAAA TATCGTGTGAACATTCACTCACTTTCATTTTTCCATCATACTGCCTACAC ATAATTTGCTATACAAGAGCCACTTTAATCATTGAAGTGGGTGCTATAGA CAGAGGGTCTAGAGTGATATGTGCTTTTAGATATGTAAATCAAATACTTC AGCAGGTTTCAGTTTATTTGATTACAGAAGGAGGCTTACGGCATGGTTCT TGAATAATCATATTTCATGTGCTTGGGTCTACACTCTGCAATTAATCTAG TAGTCCCTAGCTTTTATTCTGCTAGTTAGACTTAAATCTCATATCACATG CGAGTAGAGAATAGTATTGTTATCATACCTTGTACTCTGTCAATCAAACT GGTGTTGAACTGTTGACTGTTCTTCAATATATAGAACTACAATATTTTTA GTTGTTGGTCTTTTGGTTTGATTGTTAGGTCGTGGGCAGCTTTACATGTG GGGAAAGCTGAAGAATTCGGGCGATGAGTGGATGTATCCAAAGCCAGTTA TAGATTTAAGGTTCCTTTCAAACCATGAAATACCATAGTGATGAACAGTG CCATAGATAGCTATGCTCTGTAGTGTAGCTTTTCTCATAATCAGCGTACT GTTGAAATATTATTATCCTTGTTTATTTTTTTATTAATGACTTCTTTGCT TCAGCGGTTGGAACATCCGTTGTATGGCTTCTGGTAGCATGCATCATGCT GTTGGCGCAGATGACTCTTGCATAAGCTGGGGTCATTCTGAATATGGAGA GCTTGGTTATGGTCCTACGCAAAAGTAAATCTATTTAAAATGCTAATACT ATGTGAAATACAAGTCCTGCAACCTTCGAGATTTTAACCATGAACTTTTC TTAATGCTTATTGTTGCGCATTATAATGTAACACAGGTCATCTGTAAATC CTAAAAAGGTTGACATTCTTGAAGGAATGCATGTTACAAGGTAATTTCAA TAAATCAACATGTGAATCTAGTCGCATCCTCTGTTCGTGATATTATCGAA ATTAAGTCCAGAACACTTTTGCAGTGTGGGTTGTGGAGTTGGGATGTCTC TGATCGTTGTGGATAGGGCAAATGTTGGTGATAAGATTGACCAGGTAACT AAATTGGTTTCATGCAGGAACTGTTTACCTGCTTAAAGTTACTTCGATGT TACTTAAGGTAATTTATTTTACTATATTATTTGTGATGCTAAAGATAAAC AGAAGAAACATGTTGTATGAAAGCAGCTTGACGTGGGGTCATGTGATGTT AAAATTGAGGTATGTCTATTAACATGAAATACCTCCTAAACAACCGAATG AAAGCATATTAATGTTAGTAAAAGAGCCAGGTGATCAATCATGGACACAT GCTAATGACGAGGAATTAATTTTCTAAAGGTTACAGTGAAACAAAAATGT CTTGAAAATGTTGATTCATAAATGTTTTTAGGAAAATGTTGATTCAAAAA TACCTCCCTTGAACTCATCCTCTTTTTTTTGGTTATCAGTTGCCATGTCC TCTACTGCTTAGATTGATAATAACATGTTTCAACACCCACAAACTGTGAT TAGTTTACTTACCAGTATCTTCTTTTTATGGGAACGGTAGGGGAGGACTC TACTGAAGAGACTACTTACTACCTCATACTCCATTACCTAGTCACACGGT CTAATATATGCATTATTGTCTCCCAGCTGGATAATTTTGATGGGGATTCT GATGCTTTGTTTCAAGGTGTGCATTTCTCCTATTAATTTTAGTTTTTTAG AATGAGACATTATTAAACATTCATTTGTCTGCAAACATGGAAATATATTT GGTAAATATCATTGCAGTTTTGCTTTATCTTTTACAAAAGGAACTATTAT CCTTGCTCAAGGTATTGAAACCAGGTAACTGTTACTTGCTTTTTTAGAGA ACACAAAAAGCCTCTTCTTCCCTCCGCGTCGCTACAACAAAGAAGAACAA GATACAAATACGAGTCAACAACATGCAGCCCACGAAACAGGTACTTTCCA GGTCACTTCCCCTTATATTAATTGTAGGTAATCATCCATGTAACCAGTTT TCCTGTTTAAGTTCTGAATTTATATATTTATATTCATAGTTTCATACATC ATCAAAACAAATATATGATGCATCTGTCTCGAACTCATGATGCAATATAG GATTAAATAGTTATTTACAAAGCAATTGTGAACAAATGCTAGAAGGATGA AAGAGAAGTCATAGCATGGAGATTTATGATGAAATTCAGAAGTTGTAAAT TGCAAATGGAAGCAGCAACTAACATGAATGATCAAACCTTGAAATTGATA TCACAAATTTTATGATTGTTAGTGTGTACTACCGAGAACCAAGAATTATA AATTAGCAAGCGTGTTTGTAATCGGCATGTATTGCAATCTGCACCAGCCT TCTAGATGGAATCTTGGCTGATTGTATGGCTTAAAACAGTCATATAAGTG GTAACTCTGTTCAAACTTGTTAAGTCTGTTTACCATGCCGGAAAGGTTAC CATGAAGACTAGCCCATCACCCCCCCCCCTGTGGCTGGCCCGAGTTTAAT CTAGTGAAGGATTCAAAAAATCACTGGGGCCAGGAGAAAACGAAAATAGT GAGTAGGTTGTTGATCATTGTTAGTTTTGGTCTGTTCTTGATAGAATTAT CTAGGAAGCAGTGACCGCCACAGATTCAGGTTGATTGGTTTTGAATTCAG GTACCTCCTAATGTTCATCCTAATGCTTTCGTAACGGAGAACATATCGAT TAATTGAGCTGGTCGTTTGCTGCATTTTGGTCTTTAAAGTTCTTTCTTCT GTTGCCACTATATCAAGCACCAAAGGTTAAGATGAATGAAATCTTGCATG TCATTCACTCGAATAACTTGTCACCTGTGCCTTGTTATCCAGCCCCATTA AACTACAGTTTTGGCAACTAATCACATATCTCATGCTGTTCTCTATCAGA CTAGAAAACAAAAACAATATTAGTGTGGAAAAGTAGTCAAGGGTGCAGCA GCACTATCCTTTGTCGCACTGAATATACTAGGCGCTGTTTAGCATATAGC TTCCTGATCATTTTGGTCCATCCAAGTGCTTCTTCATCCCAAACTTGTGC TGGACGTCTTTCACGTATAATATGTATGCACTGCTGGTAAACGACAATCA TGTAATTTTTAAATGCCAAATTTTCAAGCAAACTCTACTGATAGTGCACC TAAGATGTTGATTCGGTGCTTTTCTCCATGAGCGTGAATCAATCCGTAAA TGGTAAAAACTGAACTGAGTTTGTTTACATAGGAACTGTGTTGACGGCTA AAAAATGCCTACCATTTTTCTTTACCCTTCACATTTCTGCTTGTTCCGCA TCTAAGCATGGATGGTTTTGAACCGTTTTCACTGCAGGAGAAGAGACCCC GAAGAAGGTGACCAAGAAGGCAACTCCCACCGCCAACGCAGGGTCCAACA AGCGCAAGACAACCGTCGACGATCCGAAACCAGAAAGCGGAGAAGTATCC AAGGAGGTGGAGGGTAGCCACGGGCCGTCTACCGGTAGTGGTAGAGGTAG GGCAGCCAGGACTGCAACTCCGGAGGCAGTGCCGTCCGGAAGGGGAAGAG GCAGAGGCCGCCCCAAGAAGGGGACCGAGAGCCCTGTCACCGCTCCTCTA AAATTCAAAAGCTCAGGAAGAGGCGGGAAGCGTGGGAGGCCTCGAAAGTG ATCAGCGGATGAATCTCGGGTCTCGGCGAAGTCTTTTTGGTCAGATCAGC TGGCAGCAATAGTGGTTGTTACTCTTTGACGCTCCCATGCCAAGTACTAC GACTACGAGCCTTAGGGCCTAATTATGCCATATTACAATATGGTTTTGAA CTAGTAATCTTATGGACATGACAAGGGCTAGAATTGTTACCATCCTGCAA ATTCTGGATGTAAGCTATGAACACTGGGCACAGGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.