Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA007239

[Submit comment/correction]

Sequence	AA007239
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA007239
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGGGCTCCTAGTCCCAGAGCTCACTCTATTCCTGCTCCTCTGCATTGC CGCCACCAGTTGCAGGTACGCTCCCTCCGTGCTGCTCTTATTTTTCAAGC TACTTGTACACGTATATATGTATGTATGTTTCGATGTGTTATAGTGATGC CGGAAGCTAATTACTTTCTTTTAATCTTGAGAGTGATGTTCTAATTCTGT TTCTACTCTTGTACACATGAATTTGTACGCGCACTTATTCATAATGTACT ATTAGTAGTATGTATTGATGGCGATTCTGAACCCCCTTTCCTTTGGAAGG AGAAAGCATCTCTCTTGCGAGCTGATTTGGGATTGAGGCCTGAGGTCATC GATTTCTATACTCTTGCGGTATGTTTAGTTTCCTTACTTTAATTTTTCTT TTGTAAAGTTTCATTAGTGAACTGTCCTGGAGCTACAAAACCTACGAGTT GTTTTTCTTTTAAACTAGCACATTGGCCCACGCATTTGGCATAGTTATGT TTTTGGAAAATAAATTCACAAAATCATAGATATTTATCGTATATCACTAC ATGCTTATATAACCATATTATATGACTGGAAGTACTTAATATACCCTTCA ATGCATGGTTGGATGGTAATAATACTGGTGTGCATGGTGTTTCTGTTTGA GAACGTTGCTTTGGAGGAAAATTGTGTTGTTTGGATATTGTTAAAAGAGG TATTTCAGTTGAAGACCAGTTGGGCGATTCTTACTGATGTTTTCTAGGAA CGAGCAGTTGGTTATCACTTTTTCCTTTTTAATTAATTGGTTGTGTGCAT TCTTGAACTTCCCTTTGATTAATCCAATGTATAATTTGTAAATACATCTA AAATATACAACATTATAGAAATGACAACTAAATAGTTTTTAGAGTATAAA ACTTAGAGTACAAAACATAGACCACCTCGAAATTATTTGTCTCTATTTTA TGCGTTATACTCTAAGTAGTAGCATGCTTGTCTCGGCGCACCCATTCATG TATATATAATTAGTTTTTATAGCTTGATCAACTTTTTTCCATGCAATGTC CTTGTATACATAGCCGGAAAAAATGACCTAATCGACAACAAAATTGCATA TATACTGAACCCAAATATTTTTGTAACATATCAGTTTTCTATAGCACAAT ACTTTTCTTTATGGTGTGTCCCTTTACAAACAGACAAATGGCCTAATTTA GTGTTCATGTCTATAGCGAGTCAACTGGTGTCATTGTCAATCGCAAAGCT CTATAAGTGAGTCATGAGGACGTAGTGTAATTATGTGTATATAGATGTTG GTCATGTGCTTGTGTGTATGACTAAATGTACGAAGTTTTATCCATTAATA GGGGTCCTCAAATATGTATTATTTGTGGGTACATGTTAGCAGAAAATTAG GAGATGTCTTCATATTTTTCTTATCATTTGTTCCTCTGTAATTGAGCGAA ACACATAGATAATATTAAATTAGAAAATTAGTACAGATATTGTGAACTAT GTGGACTCGCCCTGACATCTAGCTCTCTAAGATAGTGCAATGCAAACATG ATCTATTATACTTATGAACTCATAGTTATGGTGCATATGCACGCAATTTT CTGTGTGTGGATACCTTTTATATTGAATAATAAAGTAAAATATTGGCTAA CCATAATTTTTTTTCTTGAGACCTTGTCATATTCATGGAGTCAAATATTT CACTATTGCAATCAGCATGAAGGCCATGGAATTTATGTTTTTTTAGAAAC AATATACTATTTCATCATACTTCTAATTCAATGAATTTACTAGGTTGTGT TCATTTTTTGATTGTGGGAAATTTTGTATTCCCTCTACCCGGAAAAGGAT GTCACGGATTTGGCTAGATACGCATGTATATTTATCTCATGACATTCATG TATAAATCTACATGACATGCGAAGCTAGACCATTCTGTATTTAACTTGTG ACGGATTGAGTATTGTTAGTCTGTAACAATTTTTTGTCTCTTTATCTAAA ACAGCAGACCATTTCCTTACGCCTCTAATTCCATGGATTTTGCTTGATGG TGTTTGTACACGCGAATACTAAACAAATCTGCTGCATTTAATTCATGACA GATTGAGTATAGTTTGTAACAAAATTTTCTCTGTTTAACTAAAACAATAG ACCATTTCCTTCCGCCTCTAATTACATGGATTTTGCTTGATCGCATTTGT TATTTTATTGCGGGAACAAGTTTACTTCTGTTGAAAGCTAAAAGTACAAA CCGTAGCACTTGCTGATGTCATCGGGATGTCATGATATCTTAGATGGACT ATACTACGAATTCTATTTTGTGCATCTAGCCGGATATATGCTACAAGGAA TCGTCTTAGGCCCAGTTATTTAATGCACAAAATCGATCGTCTTTAGTTTT TATGGATGGATTTTTTTTTTAATTTGGTTAGCCCGTCTCAAATTTATTTT TCTGGCTCATCTTGTGCGGACATACATTATATCAAACCCATGACCGTGCC AAACCAATTTGCATGGTTACATAAGTATTAACTTGATGTCAAATCTTAGC CATATATTTTAAATCTAACTATCACAATAAACTTGAGTGATATGGCTTAA CGTGGTGGCTCTACTAGACATCTGTATATATTGCTTTTACTATATAATAG TTAGATGGTTAGCCCGTCTCAAATTTATTGTTTCTAGCTCATCTTGTGCG GACATGTTTGGTACATTATATCTAACTCATAACAGTGTCAAACCAATTTG CATGGTTGTGTAACTATTAACTTGTTGTCAAATCTTAGTCATATATTTTA AATTTAACTATCACAATAAATTTGAGTGATGTGGATTAACATGGTGGCAC TATTAGACATTTGTATATTGCTTTTAGTATATAATAGACTAGAAAACTCA TGAGCTACCCTTTTTGTTACGCCACAAACTTGAAATCTCAGAATCCACAT GTTTACGAAAAATAGATTTCTTAAGAGGAAAAGGCAGTCTGCTTTTCATC AACAAGTTTCATGTTGGGGATCATAGTAGAAGCATAACACAAGTAGCAAC AGTAGAGCACAATAAGTTACAATAGCAACTAGCAAGCCAACAAAAGGAAA TAGCAGTTAACCAAAATTCAGGAACACGAAAATTGAAAATCCACATCTTT AGGGTGAATCCCCTGCTCTCACCCGATCGCTGCGGGGGGTTGAACCCCTA GCCCCGTTGTAGTAACTATTTGGTTGTTTAATCCCTGGCCTTAAACAACT ATAGGACAAGCATCTGATAATCTAACAAATGTAGAAACATCGCTAAGAAT TCAATATATACTAGCAATATAAAAGTTCAATATGATCAATCAAATTGTGC AAATATAGCAGCGGCATTAAGACATTTAGCAAATATACACAACCTTTTAT TAAAAATCCATCAATACAAAAGTAATAGCACTAGTATTTAGCATTCAAAC TGTTTAGGAAGGGAAAACATCATCTCCTCGATGATCAAACAAAGGAGAAT CAATGAAACAATAACTTAGGAATGTGACTTTATGGTGGCACAGGTACAAG GTTGATATAGAAAAATTTGTGATGTGGCCTCACAGACAGATCACTAAGAA CACTTGATTTTGTTAACCCATGAAACTTTCTCCTTTAGTGAGGGAACAAA TTGTGTAGGTTTAGTTACACATTCAATTTGGTCAGCCTCGGTGAATTTGG CATCCATAGTAAAAGATAATGTCCAAATATTTAACAAAGACGGATAAAAC TCCTCTATAAGCACTACCTAGATTTGAGAAGCTTACACAGTACATTTCTG TAAAGGAACATGCTTACTATCATTTTTTGAAAAGCATGTATTATTATCAC TGCTTATGGAAAATGCCAAAGGACTATAGGACACCACAACATTTGTTGTA ATGTAATATGGAATCAGTTATAATAACCCAATAAAAATTAAGTGCAGTTT TAGTACCCCCAAAAAAGATCTTTCAGCTACTAACTCGATAGAATATCTCC TTTTACAAAGGCACCGTCCTTCACATAAGAAATTCAGAACTAAAGAGTTT GGGAACTAAGGTAACTAACAGCATGGACAGTATCATTCAATTATCAGTCA TTTGTTCTGGACAAGTATGTTCTACATAATTGGTGTACAAAGAATTAGAC CAACGGTTGGTCTAGCCAAATTTCACAAAACAGGAGTCCAAAATTTTTCA TTAGATCACTAAAAAGGAGACAACTTTTTCCCTGAATTATATTGAATACA TGTTGATTTGCTAGCAAATTTGCTCCGAGCATATCTACCCGCCTTGCTAG CTCAAGTAGGTAGACATGTTCAGATGCCCCCTCCAGAAATTTACTCTTGA ATAGTATGTTACTTACTAGTCAGTGCCGTCCCTGCCTTGGTAGAGTTTAT TTACTTCCAAATTATGCATATATGGAATTCTCTCATTGAAATCAGGTGCA CAAAAGAAAGACCAAACCTAGCCTTCCCAGTACTATAGGCACATTGTTTT TTTGTGCCGATAAGTGAATCTTCTTTTGTGCCAAATTATGATAGAGTTTT TTTTATGTACTATTCGTTTGATCAGAATGAATCTGATTTGGCTAAATCAC CTCCCGACTCACCACTTTTAAAATCTTGAAGTAGTGAACTAGATGTGTTG CGGATACAAGGTAGAGTTGAGCTCCTTATGATTAGCATAGGAAGTGTCTT TACGAGACCTTTGGGTTTGCAGGAGATCTGTCGCTTATCAATAGTGTGTT GCCACTCGAAACTTACGATTTCAAGCAGTTGCAGAGTTTGGCTTCTTTTT CTTTCCTTGGTGTACCTTTATATTGTCTTCCGTTTTCTAAGTATATCAAA TTAGCTCACCCTTCTAAAAACAAGAAAAGAAACAAATATTGATCTAATAT ATCTAGCCATTCTTAGTTTCTCTCTGTATTTTACTAGTAGTGACTCATTT ACTGTACTTTTATATTTTACTATAATTAGAATATTTACTACTTCTCACTT ATATGCATAGAAGGAGTGACACACAGCATATATGGCTCCTCAGTGGTTCA AGTACTTGAAGCAGGAAATGTCTTCCTCAACACCTACTTCCAGTTCTTCC AACAAGAATCACCAGAGCTCCCAGGCAAGGGTATTAGCACAGGCAATACC TACTTCCAGTTCTTCTAGCAGGAATCGCCAGAGCTCTAGGGCAAGTGTAT TAGCACAGACAACCCTTGATGCTGAACTCAATGATGAATATGAAGAATCT AGTGACTCCTTTGACTACTCCAAGCTTGTTGAAGCCCAGCTGACCACTCC ACCTATACATCAAGGGCGGTCGGAGAAGGTTACAGCCTACTTGCAGCAAA TTCAGAAAGGAAAGATAATTCAACCTTTTGGATGCTTATTGGTCCTTGAT GAGAAGAGCTTCAATGTCATCGCGTTCAGTGAGAACGCGCCGGAAATGCT TTCACCGGTCAGCAGCGACGATGCAGTACCAAGTGTTGATGATCCCTCGG GGCTAGGCATTGGCACAAATGTACGGTCTCTATTCACTGAAAAGGGTGCC ACGGTGCTGCATAAAGCACTAGGGTCTGATGATATTTCTCTGCTGGATCC TATACTAGTTCAGTGCAAGACCTCGGGCGAGCCTTTCTATGCCATTGTTC GTCAAGCAACTGGTTGTTTGGTGGTAGACTTTGAGCCTGTAAAGCTAACA GAATTTTCTAGCACTGCTGCTCATGCTTTGCAGTGTTACAAGCTTGCTGC CAAGGCAATCTCCAAGATCCGGTCACTTCAGGTGGAAGCATGGAAGTGCT TATGTAATACTGTGGTTAAGGAACTCTTTGACCTTATTGGGTATGATAGG GTTATGGCTTACAAGTTTCACGAAGATGGCCATGGCGAGGTCGTTGCCGA GATCACAAGGCCTGGTCTTGAGCTTCTCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.