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GrainGenes Sequence Report: AA033726

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Sequence
AA033726
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA033726
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTAATTCAAACAGTGCTAAAAGCAAACGGGGGCAGGGGAAAGCAGAGCGG
GGCGAAGACTCGGCGAGCGCTCTAGATCCAGGCAGGACTGCACGAGTTGT
GGCCTTCGAAGGCGTCTCCACGGGGCGTCCCTGCCCATGGAGGGTTCTTG
TCTTCGTCGGCCATGTCCGGCAGTAGACTGAAGTAATTTGGCGAAGGTCG
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TTTTTATGTTTTTGTTATGACTATTCTGATTTTGTATATAGGTGAAAGAC
ATTTCTGAAACTTGTTACGCTATAGATAACAGTATTCCTGATGAAAAATT
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AGTGTGACTAGTGCTCAACTAGTTAATAATACTACAGTAATTAAGTTCTT
GTATTCATTCAATAATATACTGTTTTTAACTGATGGCGATTGTATAAGAA
CTAATAATTTATTGTTTTTTCATTTATGGTCACAAATTATTATTATGAAT
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TAATATATGGTGTTGTATAATAACATATTCATATAAACTTGTTTATGTGT
TTTTTTCATTGTTGTTATAGAAAATCTAATGGATCTCAATATGAAATGCA
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AGTTTCAATAATAAAAGCATTGAGGTAAACAACATTGGATCTCCTCATTT
GGATGACAAAATTATTCAGCATGTAAGAATAATATTTTTTTGTACAGTTA
GTGTATTTAAGACTTAGAATAAATAATTAGACCTTTTATTTTCTTCTCTT
TCCAAAATGAATAGCAGGAACATTCAGAGGGTAGACTTCAAGTTGGCACT
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AACATTTTTGTTTTTGTTGTTGTTTTAAAAAAAAATTATAATAGTTGAAC
AACATGCTAGAGATGAAGTTAAACAAACAGATTCTATAAAGAGGAGTGCA
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ATCTTTCAGGATAATGGAATGTGTGGACGATAATGGGAAGGAGATTGAAG
AGCCTGAATTTTATCGTCCAGTAGAGATGGATGACTTTACATATAATGAA
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AATTTCTGTTTTTACAATCTTTTGTTTCATATGAGATTATTTTTAATTTT
TCAGTTAGCAATTTTGAAGTGCACAGAGGAAGAGAATAAAATTTATACAA
AAGAAGCACTGAGTACAAATCCAATCACGAATTAAAGCCCCATCAGGAGA
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TAAATTGTTTTTTCAGACAAATTTTCTAAATATGTATTACACTGAATTTT
TCATTTTCTTATATATGTATCATGTGCAAGACATTGTTCAAACAGAATCT
GAAATAAGCATTCATTGTGCTCAAAAGGAACCAAGCAAACCTAGTCTCAC
AAATTCTCTAGCAAGACAATTTGGGCCGCAGAATAATTTTGTAGATCTTG
TAAGTTTTGAATTTTTGTCTCTGCTATTTTTGAAACAACAATACTTTCAT
TTTTGGCCTACAACGAACAGAAGAATTTTTTTTGAATTATTTTTGATCAT
TTTACTCAATGAGTTCTTTATTAATTTCCATTGACTGATTATTATTCCCA
ATTGTCTTCGAATATAAATATTGCAAGCCAAGACCATGTTAATCTGAGAG
ATTCAAGCGGCAATGATCACAAAATAATTGTAAGTTATATTTTCAGTTCT
ATAACTTAATTGTATAGTAAATTATATTCTAAAACCTATACATGTTCTTC
AATTTTTATTTCACAGGACTGTGGCAAAGCATTAATTGTAGGGCGAAGAC
TTTTTTAAGGTAGAAGCAAAGATTATTATGATTCGAATTCAAAGATCAAG
ACACCAACAAAGCAATTATTGATCAACCTTGAGAATGTAAGTTTTAACAT
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ATAGTTCAGCTGCATACCAATCAGTTTATAATGCAATAATTAATTATAAC
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TTGTCTCTTGGAAACTCAACCTCATGTCATGGGAAAGAAAATTGCTTACC
TAAGATAATTCCACAAAGGAGCAAATATTTTTGCTCTCCATATGATGTGA
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TTTTTTTGGTGATGCCTTTTGTTTTGTATATCTATTATGTTTATTAATTT
GTTTTTTACAACACAGTGACTAGGCTATCAACATGGATAACATCAAAGTT
CGAATGTTACAATTAGGTAGCTCTTTGAAATTAAATGGTTGGCTAGAGGC
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GATATACAAAGAAACATTTCTTCTTCAATACAATATCAGTAAGACTGAGT
TTTAAATTGTTTTATACCTATTTTTATTAATCATAAGTATAGTAGAACAT
AAATTAATTTTTGTTTCCCATATTCTTTGCTTAAACAGGATTATTTCCTT
GAAAAATGGAAAAATGAAGAAGCAAAGGTTATCTAGAACAAAAGAGCATT
AGATTCTTTGTATTGGGCAAATAAAGCACATCCATTACACATGTCAGATG
GGGTATTTCTCTATCTAACTTTTTTATGTCTTCATTTTATTTATGTTCTT
CATTTTATTTCTGTTCTTAATTTCTTCATCAGGGAAAGGAAATAATATAA
CCATTTTATTTCTGTTCTTCATTTCTTCTATTAATTATTGATTTTTTTGC
TGTGTTTTTTCAGTTATATTTTCCCACCATAGAGAGCGGGCATTGGTTTG
TTTTCTTGGTTGATATCAAGTATCATAACTTCATTTTTCTAGACTCGTAC
TTTGGTGAAGATAGTTCTTATCACAAGAAAATAGCAACCAAGATGGTAAT
GGCAATTACCATCTTAAATTTGTGTTCACGTTCATTTCTTCTATAATTGT
TTTCAATATAAAATTTTGTTTTGCTAATTTTAAATTTGTTTTCATGTTCA
TTTTAGAGAGGCAATTTTCGATATATATAACATGAAATATTTTGTATTTT
TTCATGACAGATAAATAACTTTCAAAAGACATGGTATGAGGCTGGTCTAA
AACAAATGAACTTTGAGATATATGGCAGAGCCTACCCAATTGTACCAAAA
CAAACAACACCGTATGTATAAGAATTTCCATAAATACATTGTTATATATT
TTTAAATTTTCATACTCCATCTTTGTTGTTCAGTCCCAATTTTTTTATTT
TGAGTTTAATCTTTCTTTTGGCTGCTCCTTCCATGCACAAATGATTGTGG
CATATTCTGTATGAAGTACATGGAACTTTTGGTTCCAAGGAATCAGTCAC
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GCATTCACTTAATGAGAATTTACCTTGTTTTATAACTATGTCCCCTTCTA
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ATTGTAATTGTCAAGTAACACTTGGAACAAAATTTTAAAGTTGTGTTCTG
GTATTTATATCTGGATTTTTGACAATTAGAATAGATTTTTTTTTGTTTTT
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TTTTGTCTTACTATCTTCTCATATTTTATTTGCTATATTTTCTTGTACTA
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GTATGTCCACTGTTTTCGTATTTCTCCTTCTTACTGGATCTTACTACCAC
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TGATGATTTCCTTGTTGTTGATCCATCGGTTGCTTGCTTCTTGGACCATC
TGCTACACACACAAAAGAACATATCCAAATTTAGATACATAGCTGTTTTT
AACAGTAGTTATAATTTTGAAAACAATATTAATAATTTTTGGGAAGAATA
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TTTCGGTAGATGCTTATTAGTGCATGTAGCGATGTTGTGTTGATCTGAGC
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TTTTTGTAGCAGATTGTTTTCCTTTATCTTTAATTCTTTGTTCCTCCGCA
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TTATCAAATTTGCAACATATGCACACAAAATCTTGTGTTGCAATGTTGAC
AGAGACAAGATATCTTCTAGGTCTGATCTCTTGCATTTGAAGCATAGGTG
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TTATCTGATATCTTTTGATACTCACCCAAGAAGCTAATTACACTATAAGT
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AGCCCAAAATATACATTCAACCTTGTTACCCTGTCCAAGTTTAAATTCAT
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TTCATCATGTCATTCCTACTGTCCTCTTGCCTTATTGCATTCATAACATT
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GATATGTTAGTATTGCCATTATTTTCCTAGTTGCCAATTTGACAGATGTG
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TAGGTACTTTCTTTCATCTGGTGGACACAACTCATGATTGTGATGCAGCT
CTATGTTTGTAACATGCCATTTATTTTCTTTAAAAGTAATCACCATATTT
GCTTTGCAACCAGTGATCGCAATAACATTCCTTCTTCTTCTTTTTCTTCT
TGTATTTTCAGGTGGTGGTTTTCCAGTCCTCTCATAAAGCCTTTGCTGCT
TTTGCAATTTTCTCTTTTCCAAAACATCTGCACCAACTACATTGCCAAAC
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GCCCTTGTAGTTTCCAGCTTTCTTCACAGAAAAACCACATATCATAGCAT
ACTCATTGTAGAATTTGTATGCTTGTTCTTCAGTGTCAAAAATCATGCTC
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TTCCATTTCTGCTGCTGCATAAATATCAGCTGCCTCTTCTGCATTTGTGT
TATTATCTGAATTCTGATTATTTTTGTCAACCGCCTCATCAGTTTGTTGT
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ATTTGCATAAGTACAAAATAAATGTTTTTGAATTTAGCTTGTCGTACTGT
ACCTCAAAACCCATAGGTTCTACCATTGTGCTCAAACCATTGGTATGCAA
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TAATATTGTTTGTGTCCTTATTTTTTTGCAAAATACCTGAGTTAATGATG
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GATAACTGAATCTTTATTTTTTCATAATTATTTAATTATCATATATCAGT
AAAAAATATTCAACATAACTATTTTTTGTTTTGTACTTGCAGGTGTGTCA
TCTTGTTGGCAAGAACTGTCATTATTGTATTCAAAGGGGAAAGGCATCAT
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GTTTCTATAGAAATAGGTGTTATAATATTTTTGTGAACTATGTAATGCGT
GCTATATACATTACTATGGTTGTAATAGATATAGGGATGCCAGGGGTTTT
AGTAACTTCCAATCCTGCATTTATTATTGGACCTCCATGTGTGGTTTTGG
TAATTAATGACAATCTTTATGGACTAATATGTGTATTAAGTTGCACTTGT
AGGATTTGTCCATTGGCATCGCTTGGAGCTTGTGTTGGCTTCAAGGTCGA
TGAAATGAGAAGAAGATATGTTGTGCAAGCTCAAAATGCGCCATCTATAG
AAGATCTCATGTTTGATGCTTGCCATCCTCGGTGATCATGGATCGATGAT
GTGGAATCAAGAAATACGTTCCATCTTGAGAAGGGCAAGATCGTCTACAT
CGAGCTCAAGTGGAATGCTCAAGGCAAAGGTATAATCTTGATAGGTTTTC
CCTTTTGCCGGTCTCATGTTGTGTGTGGGAGACCGGGTTTAGGATAGATA
ACCGTGAGTAACTCGATCATATCATTCGGAGAGAGCTCAAACCTTTGCAT
ATTTGCATCATCGTATTTGGTTGTTATTTGGTCTTATCCATGTGAGGATA
TAGAGCTTGTGGTAATCTCCATAACAAGCTCTTGTTCATCAAAATTGGAT
CTCTCTTTTATATCTTGTTGCGATTTTGATCTATGCGGTTTTCTGGTATC
TCACCAAGTGAGGTATCTCACATTATATTAATTGATACACTCTCACTTGG
TGATAATCAATATTTCTAATTTTTATTGGGAAGCCCTTGTCGTCCTCTAT
CCAACGCAATTGGAATTGGGTCAATCGGAGCTTTCAGTCAAAAGTTATGA
CCGTTTGAATATTCGCCGATTTTATTCTAAAAAGAAAAAGGAATTTTGTT
TTCTAGGCCGAGCGGTAGTACCGCCCGGGCGGGCCGGTACTACCTTATCT
GCTGACCAGTCCGGTTGCTGGGTCCGGCACTATGGGACTGGCCCAGTAGT
ATCGCCCGGGTGGGCCGGTACTACCGGCCGGCCCAGGTAGGTCTGCCCTG
CCTCCCAGCCCACTTCCTTGCCAGATCTGCTAGCCACCGCACCTTCTCCT
GTCCAGCTGCCCTGCTCGTTTGCTTGCTGGGCCCGCTGCCGCCGCCGCCC
GATTTGCTCGCAAGCGCTCGCTCGCGTTGGGCCCGCTCCCGCTCGCCTCG
CGTTGACCGCGCGCCGCTGGCTCCCGCTTGCTTCGCGCGCTCTGCCGCTG
GGCCCAACTGCTGTCGTGCGTGCTGAATCCTGCGTGCGTTGACCCACTCG
TTCCTGGCCGTTGTTCCGCTTGCCTCGCGCGCATCGCTCGCTCGATTCGC
TCACTTGCTGCGCTGCCTCGTGCTGGCACTGGCCCAGCTGCTCGCATGCG
CTGCTCCCATCTGCCACCTTCCCCACGTACGTACTGCTTGCTGCTGCTGC
TTTTTCTCCCTAGCTCGCATGTTGTTGTGCTGGTGTGTTGCGAGCGGTAG
TACTGGTCAAAACCGGTACTATCGGCAGACCAAAAATAGCCCCAAATCTA
TTATAAGCTTTGTCCACACTTGCTCTAGATCTTGAAGCTTGTCTAATCTT
TTCCCTTCGATGATTCTTGCCCATATTTGAGTGAAAGAGAGAGAGGAGAT
CTAGACCCACGTTTTGACCTAACCGATTTATCTCTTTGTGAGTGCATCTT
TGGGGATCTAGTTTTTGGGGGATTTTGTGTCTCTCTTTGATTCCTCCTCT
TTTGTTCCCCCGATAGCTTTAATAGCTTTGTTGGAACTTGAGAGTGAGGG
ATTTGAGTACCTTTGTGTTCTCCTCGGAGGATTTGGTTTGTGTTACTCAT
TGGAGCTTGTCCCTCTTGGGTTCTTGGAACCCTAGACGGTTTTGTGGCCT
TGGTGGCATTGTGGCCTTGGTGGCGTTTGTTGGGATCATCCAATTAAGTT
GTGGAGAAGTGCCCCAACTTTGTGAGAGGTTCCGGTTGCCACCGACAAGT
GCATCGATAGTGGAAGCGTGGATCGATCCCATTGGAGTGAGATTCACCAG
AGAATAAGGGAGGCCTTTTGTGGCGTTGGTGGTTTGATAGCACCCCCTCT
CCAAACGAGACGTACTCCATGTTGGGAGGAACTCGGTAAAATATCGTCGT
CCCCGCGTGCCTTGGTTATTTCTATACCCGAGCTCTTTACTTATGCACTT
TACATTGTGATAGCCTTCGTGCTTGAAGTAATCTATATCTTGCTATCACA
TTGTTGATTGTATTGCTTAGCATAAGTTGTTTGTGCACATAGGTGAACCT
TAGGTGCTCTAGGTTGTGCTTAACAAAGTAAACACTAGTTTTATTCCGCC
TTTGTTGAGCCACTTTAGGAAAAGTTTTAATCGCCTATTCACCCCCCTCT
AGGCGACATCTGTATCCTTTCAGACAGTACTAGGAAGTCATTCTACATTC
AGTTTTGCACAAACTTCAGAGATCACGTGGTAATTTTATTGTTATTTATG
TTTTTTGTATGATTTATTTTATTTCTTTTTGCAAGCAATTCTTGCTGGCA
CCAGTCCAAACTATTTGTCTGTGTTAAAATTTGTTCAAATTCTATTTATC
TAATCTCTTCTTTTTTCACATAGAACGTGCCATGTTTCGCAAGGAGGAGT
TTAACTCAGCTACAAACAATTATCTGTATGTGGAGACAAAAGAAAAAGAT
CGGTTTGTATCTGTGTTGGATAAGCATAAACACAAGACAAGAATTCATGG
TGGGGACTATCAGGATTTCCTACTTAACTACAATATGGATAGAGGAGATA
GAATCAAGCTTGACATGAATAACAAGCCTCCATATCTTTTAATATATCCA
CCGGACAAGTATGGGAATGCCAAGGAAAGGGTGCTAGGTACAGTTTTTAT
GTCTTTTATATCTTGTACTATGTTGTCCAAATTTATTTTTGTACTTCAGA
TTCAATTTATACAGTAGTAACAATTTTTTTATTTGTTGTTTGACTTTTGT
TTGTACTTACAAAAACACATATAAGAGTTTGTGTTCAAAGATACAGCTAG
AGCAATTGTGTATTCAAAAAACTTCAATCCAACAGCTTCTGAGATTGCAA
GGATGAACATTGCTGCAGTCAATCATGGAATAGGTGTTGGCGCTGTTTAC
GTGCACACTATAACTAAGTCAGACATAGCTCAAAACATGATGGTAATTTA
AATCTTCAACCAATTTTTCATATCTGGTCCACAAATTATCAATACTAACT
AATTTGCCTTGGTTTTTTTTCTTAGCACATTCCCAAGATCATCACATCAC
TTCTTAAAATCCCAAGAAGTGGCAAAGCACGTCTTGTAATGGCTGAAAAT
AAAGTTGTTACGCAAGCAGAATACTTCAAATCAACAGATGGGAGGCTTCG
TTTCAAAAAGGGATGGACTGAATTTGCTGTCAAGTGCAAGCTGGGAACTG
GAGTTAGAGTTCTGATCATGTTTGACATGGTTGCAAAAAAATTGGTTGTG
TACTTCGATGTTGTGCGCTACTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.