Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA030428

[Submit comment/correction]

Sequence
AA030428
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA030428
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCCGTGGCCGCCGCCGTGGTTGTGGAGGCTATGCTCGCGGTGGCGGG
CCTTGTCCCTGTGCAGCTCCATCTTGGCAGCGGCGTCCTTGGCCTTCCTT
TTCCTCTCCACCATTTATCCATTCTACTATAAATTATTATTTCCTGGTGT
CCTCTTCCATCAATTTTGTTGGTTCGATCCGAATTACGGTGTCTCGTTTT
GAAATTTTGATAAACCTAAAAGGAATTCAGTTGTTCATGTTCAATTTCTT
GTACAAACTCTTTTTATTTATATTAATTCGCTGCATTCAAAATACACCTG
TAACTCTTTGTTTAATTTCAGGACGGGGAGACGAAGTCAGCCATATGATG
TCTTTTGACTCGTTCCTGCCGCACCTTTGGTGACAAGAACTCTCGATGCA
TCCGATGTATACATATACATGCCCAGGTGCACTTCAGACTGCTACTGGAG
CAATCACTGAAGCTCCAGTGTTATGTTTTTCTTTCTTTTTTGGAGGGAAT
CAATGGAGGGCGATCTTCCCACCTGAACTTTTCTCCAGTGCTCTCAGTGA
ATTGGGAAATAGAGATCGCTGAGTATCAGTAAATCCTCCAAGACACTTCT
TCTATTCTAGGAGAACTGGACCCCTTCATTATTTCAGGTGAGTTTTGTTA
ACATATTTTCAAGAGTGTGTATTCTAGGATCCTCTTTCAGTTCTTCTACT
TCAAGCTTAATGGATGCTACAAAAACAAGGCGAATGTTTTTCTTTTGACA
GCCTAGATGAACGCTTATCTGTTCCAGGACTCTGAATAGCTGAGGCCGGC
TAATGGCCAATACCCAATAACTAGCCAAAATAACTTGTCCACGCCTGTGT
TGGGAGCTGTAATCGAGTAGGTTCCCAAAGGCATAGTTAAGTTCTTCGCT
GAACAAGCTTTAACTATGCATGATTTTGTTTCTTCACAGCAGATCCTGCT
TTTGTTAAGCATCATCTAGCAAAACTACACCTATTCCCTATCATCTCCCC
CCTCTTTCTTTATCTGTGGAGTTGGAATCCTATAAGTGATGAAGGAAAAA
ACTCGTGAGATTTACGGTACCTTATACTACAACTACCAGATGAAGGTTGT
TTTACGGTACCTTTTGCAACTTGGAAAATTAAAGATAAAATATCCTTTAG
GTCATCTCTGTAACGTAAAAATCTTGGAGAAATCTTGAAAGACTAGAATC
CCATAAGATTTTTTTTTTAATGTATCCCACTGAAACAAAGAGAATGATCT
TGTGTAATCTCATGATTTTTCATGTAATGGCTAAATCCTACGGTTTTTGG
AAGGATTCTAACATGAGTTTGGACCTCATGGAAATCCATTTGTGTCTTCC
ATGGATCTTCTCTCTCTCTTCAAATTGGCGTTTAGCATTAAGGTATCCAT
ATTTGCATATTCTAGTGTTTTTGCTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTT
TTGTTTTGTAGGGATCGGATCTAGCATAGCTTAAAGCGCATTATAAACAA
TGCAGTCTTGACAGTGCCAAAGGCCTGCATGCCATATGCTTGTAGTTGGC
TTATTGCTTCTGGTCACTGGGGCTGTCGCTATTGCTTTCATTCTGCCCCT
ATCTTGTACTGTTGAACTTTCATTCTTCTTTTTAATAATAATACATGCAA
TTCACATGGTTTGAAAAAATAATATGTTTTCCCTTATTTCTCGCGTTTTT
ACATTTGTTTCAAAGAAAGGCAGCTAACCGTGTGAAATTTCATTCGGATT
CTAATTCAAAATATTTGTCCGCAGTTTAAGTATAACAGTGCATACCCATT
GAATTTCTCTGTAACAAAGCTGTCGATTTAGTTAACATCTTCATGTTTTC
TTATTGTGCAGCCAATCAATATGCAAGTGTTCTTGCATCTTGGCCTCGGC
TTTGTACTGCTTGCAGCACAATGCACACCTGGAGCTGCGGTTCCTAGTTC
ACAGTGCCGAAGGCAGTGTGGTACTGTTGAGATACCGTATCCGTTCGGCA
TTGATCCAAACTGCTCACTCGCAGAAGGCTTCGACCTCAGTTGCGAGGTC
CAAGATGGCATCTCCAGGCCATTCAATGGTGACTTTGAGGTGCTCAGCAT
TTCCTTGACTCAGGGCACGATGCGGGTACTCAATTACATTGTGGCCCACT
GCTACAACACCTCTACAGAGAGAATGGAGTTTATGGGCCATTTCAATGGG
TACGCAAGTCGACCTTCCTCTCCGTATCGGCTCTCCGATGTCCAAAACAG
GTTCACGGTCATTGGATGCAACGCCCTCTACTTGATCGCTGAGAGCAATG
GCAAGGGTTACCAGGGCATGGGCGTCTCAACATGTCAAAACTTCTCAGAC
TTAGTAGACGGGTCATGCTCGGGCATAGGATGCTCCCAGACTATGATACC
GAAGATGATGTACAACTATGGCCTAAGCTCCTCTAGTTCGTACAACACAA
GCCAAATCTGGGAGTTCAACAGATGCAGCTACGCCGTCCTAATGGAGGCA
GAATCATTCAAATTCAGCACCCTGTACATAAGCACCACTAAGTTCAATGA
CTCGAATGATGGGCGGGTACCCATGGTCCTTGACTGGGCTATAAGAGATC
AGAAGTGTGATGTCGTCGCACAGAACAAGACAGGCACATATGCATGCCTT
AGCAGCAACAGTGTGTGCGTCGATTCCGTCAATGATAATGGATACATGTG
CAACTGCTCCCAGGGGTACAAAGGCAACCCTTATCTTCCAGATGGCTGCC
GAGGTGCTAACTACTAGCTTCGAACCGAATGCAGATACACAGAAATGCCA
ATCAAACTCAACACTGATTGTAGAAGGTTCCTTGTTTGTTAGAGATTCTA
ATATTTAATTTTGCTTTCCTCACTGCAGATGTTGATGAATGCATTGACAG
CCCATGCCCTTTAGGCGGCGTTTGCCACAATACGGTTGGGGGATACCGAT
GTTCTTGTCGAGCTGGAAGAAAATTGGAAAGCAATGTGTGCAACCTTGAT
ATCGGCTTAATAATAGGTAACACAGGAAAACAGTGAGTTAAATCAGTACT
TGTTATCGCATTATTGTGCAATGTCAAAATATAAAATAATAAATTGAAAC
CAATAGTGTATCTCTTGCAGGCATATATTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCATGGTTGTCCAATTTGATGTCATTGTGCAGGAGTTACAATGGGATT
ATTTGCTTTAATGGTTATCATTATGATCATTGTTTTCTGGGGACAGATGA
TAATCCAAATGAGAAAATTGAACAAAGTTAGGCAGGACTATTTTCATCAG
AATGGAGGCTTGCTTTTGTTTGATAGGATGAAATCAGAGAAAGGTCTTGC
TTTCACAGTATTTTCAGAAGCTGAACTCATACAGTCTACTGACAACTTTG
ACAATAGCAGAATACTTGGAAAAGGAGGTCATGGAACCGTCTATAAAGGA
ATGATAAAGAACAACATGCCGGTTGCAATTAAGAGATGTGCATTAGTTGA
CGAAAGGCATAAGAAGGAATTTGGCCAGGAGATGCTCATTTTGTCCCAAA
TCAATCACAAGAACATAGTTAAGCTCTTGGGTTGTTGCCTTGAGGTGGAA
GTTCCAATTCTAGTCTATGAGTTTGTCCCAAATGGTACGCTCTTTGAGCT
TATCCATGGCAAGAACCAAGCATTGCAAGTATCATTTAGCACTCTCTTAA
GGATTGCTCATGAAGCAGCCGATGGACTCAGCTTCCTACATTCATACGCA
TCTCCCCCAATAATTCATGGTGATGTGAAAACCTCGAACATCCTTCTTGA
TGAAAACTACATGGCGAAAGTGTCAGACTTTGGAGCCTCCATACTAGCCC
CATCTGACGAAGAGCAGTTTGTCACATTGGTTAAGGGTACTTGTGGTTAC
CTTGATCCTGAATACATGCAAACATGCCATTTAACAGAAAAAAGCGACGT
GTACAGCTTCGGAGTTATCCTTTTAGAGATCCTCACAGGTCAGTTGCCAC
TGAAACTGGAGGGGTCTGAGAAGCAGAGAAGCTTATCGTTGATTTTCCTA
TCTGCTATGAAGGAGAACGATCTTGATGCAGTGTTGGTGAGCCACGTGAA
AGGACAAGAGAGCATGGAGCTGTTGAGAGGACTCGCGGACCTTGCTAAAA
GTTGTCTAGATATGTGTGGTGACAACAGGCCATCGATGAAAGAGGTCGCG
GACGAGCTTAATAGACTAAGGAAACTTTCTATGCATCCTTGGACACGGTT
CCATGTGCAGACAGATGCAGAAACCCTTCTTGTAGGTGAATCTACCGATG
GTTATCAAAAAGAATTAAGTGGGTATCCTATGGGCAAGAGTGAGAACCAT
CCCATAAACCAAACGAGTTCGTATTTTGCAAGGTGATTTAAAATACCTAT
AGTGATCTGTCAAAGAGAAATAGAAACGTTTCTTCTTGAACTCATTACCA
TGTCTTTTGTATTTTGAGGTTTGCATTGCTGCTAGTTGATTCGACATCGT
GTACTCTTTGTAATATGGACTCGTCTATCTCTTACAAATTGTAAATTGCA
AATCGTCTTTTATTCCATTCGATGTGATGTTAAATGATTGGTTCCCTTTG
AGGAATTTGTTTATTAAGAAGATTCTGAGATGTTTCTTTCGGTGATCGAT
AGGCAGCCAAGGAGAACTCTGTACACATCACTTTATTCTTTCGGTGATCA
AGGTAACCATGAGCACCCTTAACTATTGTTACAAACTGCTCTTTGTCGGA
TGGGGCTAGTATGGAGGCTCCAGTTTGACACTTTGGCCATGTAGTTGTCA
TCAAACGGGATATAATCTAGTATATCTCCTTCTCTCCCTCATAGTTGTCC
AATCTAGTTGTCCACCAGATGTGGAATAAGCCCAGAAACCAAGTCCCTCT
CCTTGCAGAATGGTATCATCTGCATATTCCATCATGATCATTGTCTTAGG
GGACAAATGATTATACAAAAGAGAAAATTGGACAAAGTTAGACAGGACTA
TTTTCAGTAACATGGAGGCTTGCTTAGGATGAAATCAGAGGAAAGGTCTT
TGCGTTCACAGTGTTTTTGGGAGGTGAACTTATACATGTGAGTGACAACT
TCGACAGTAGCAGAATACTTGGAAAAGGAAGCCATGGAACCATCTATCTC
TACTATCTAAAAAGAATATCGTGGTTCCGTTTTCTGCCACTCCATCACAC
CGTTTCGTCCGACTCCCTCGCGTATCGCTTCGTCCTCTCTCACGCTTTCT
CGTGCAAAAGAACCACTCGGATCGATCGCGTCTAAAAGAAACCGCTTGCA
TGGATTACGGAAGAAAAAACGCCCGCGTCACGGCACCTCTACACCAGCCG
CCAACTCCATCACGGCCACCGCGTCTCCACACATGCCGCTCTCCACGCCC
AGGCCTCTATCCTCTGGATCCACTGTTGACTGGACTGGATGTATTTCTCG
CCAAGCTCGTCGCCGTCCCTGACACGACGACTACCAGGGAAGACTACGTG
CGCTAATGGGAAGGAGATTGTCGACGGATCTGAGCGTCATCCATTCCCTC
GCCGTGGGCCGCTATCATCGGGAGCGGCTGCCTCCACCGGCTTCCGCCTT
CACGAGGTTGGCACCCATACTTCCTCACAAACCCCCCTCCCTCTTCGTCC
CCAGCGCCATCTTGGTGGCTCCGCCATAGCCCAGCGACATTCGGGATGGG
AGCTCGCTTGACTGCCGTGTCGCTCTTGATAGCCCAGAGGTTCTTTGCTA
TATGGATCCATGCCTACACATGATCAGTGCCCAATTTCTGTCGCCAAGTC
TAGGCATTACTGCTGATATTCTTTGATATTCAGATTTTTTTTAGATGACT
GGTAGTAGCATCCATTGCTAAATGATGCTTCATCTGCTAATCGTCCAGGT
GTATGTTGCATCTATGGTAATCATGGTTTAATGAGTTATCTTTGGTGAAT
TATGTACCATCGAAAAAGAATACAGACAAAAAAGAATATTTGGTGACTTT
TTAGCTTTCTTCCTCACATCTCCAACGCTCGCAAGATAAAATTGAAGCTA
ATTGAATCGGTTCTCAAAACATATATATTCTTTGCAGCTGTAGGGAAGAT
CATGAGCACACCAAGTTATTGCTGTCCTTGCGTCACACCTGACAAAATCA
GGTTCTTATCACTCTTATGACTAAATAATCTTCCAAAATAATTTTTGTGA
TGCCAGTTGTTGCTGTTCTGAAAATGTTACAAGTGCTTGGCAGTTTCAAT
AACGTTGGTCGCAAAATTGTTTACCTTACGAAATCCTCAAATCACATAAG
TCTTTTCCGCCACTTTTCTGATGGTTCATCAAATATGGACTTCTTCAGTC
AATATGCTGATGCTAACAGATACAATATGCTACTTTTCTTTCCGATTGAA
ATCTGAGTTATTATATAGTTTTCTATTATTGTGTTATTGTCTTTCTTAAG
TATCTATAAATGCGCACTCTGAAATATACTCTAACTACTATTGATGCCTT
GTTGTGGTCCATTAGGTGCATACACAATTTGAATTAGTGCACTCACACAT
AAATTTCAGTGTAGTACCAAGTGCTAACTCGATTACCTTGGCCACCATGA
GTTATGTAGTTGTCTCTCCGGGTGCAAGAACTTCTAACATTTGTGTTTTC
ATTTTTACAAAGAACATATGCTGCCAAGTTCAGTTTTCCGTTTTCAAATG
AAATAAAAAGCTCTTATTTACACGGTTAAAATATTTTCTTCGGTGATCTC
ATGGTACCGCATAATGTCTTTACTTGATAAAAGATGACCAGATAGTATGG
AATTCAGTACAAGTTTGATGATCTGGGGGTGATGATGTATTAAATTATTA
ATAATTATATGACTACTACAGTTCATACAGCATACCGGCACAATGCCATT
GTGATTGATTTTGATTTACGGATCCGAATTTAAGGTTAATTGTGATTTCA
TGGACATATCTCTACTACCTAAAAAAGATATGGCGTTCCGTCGTCGCCAA
TACGTCGCCAGCCTCTGGTGATATGCTTGGTCCTCCTGCCCCATGCCTTC
CGCCTTTGTCTCCACCACATCGGCAAGTTTGTCACCTTCCTCCCTTGCCT
GCCTGAATCGTCTCAGTGAACATGTCAGCTTGTTCTATTGTTTGACTGCT
GCTAGGAAGATGGTAATGTGTCGTCTAGGACACAGGTGTTGGACGCATTT
AGGGAATGACATTTGAGTTTTTACCATTGTTGCCGAGAGGTTCAGGCTGC
CCATGCCCAGTTCTTTTTTCTTTCTAAATTTTGTTTTCTATGTGTGCAGA
GGTATGTGGCCCTGAAGGCGCAGAAGAGATGAGAGTGAGATCAACATCCT
GAAGCAAATTGCCGACCCTGATGACTCTTGCGTGTTGTCAAGCTTCTTGG
CCACTTCAAGCACTCAGGTTCTTGGAATGTCACTGCAGTTTATGTCATTA
GAAGAAGCAGAAGTGTCATTGGTACCAAAGACCTTCACTCTACCAGTAAG
AGATTTCCAAAATTTGGAGGGGTATGACATGTTTTGAAATATTGTTGGAT
ATTAGGAGAATAGCGAGAGAGTATCTCAAAATTAATGTGTGCTGTTTCAT
TTTCGTGATGCAGAATCTTTCAACTTATGGATGCCTGCAGAGAAGTTCTT
GTCGTTTTTGTTCAAGAGGTATTTGCAAGACAATACTGATCATGCAAGAA
AATATGGCGGGGACAGGCTTGGCCTTGCGATTTGCAAGTAGTTGGTATGT
TTTCTTTCAGTTCCAGTTACTGATTCATCTAGAAGACATAGTTAAGATAG
TAGTTGGTATATTTTCTTTCAATTCCAGTTACTAATCTATAGTTCTATAC
TAAAAAGGTGAACATTATCATTCCTAAGGCCCACCCGTTAAGCGTACCCA
GTCATATCGGTACAATCCAATTTAATTAGATCGAATGGCCTAAATTATTT
TAATGTAATGCCATGGGTTCACTTAGTGATTATTATCGTTGGACGATACT
CATTCTGCACAGGAAAATTCCGTGACCCATGCACCGTCCACGAATTGGAA
AAGAAACATAACTGCCCCTTCCGCCCATGACCACGGATCAGTTCTGCACC
AGAACAGATTGCCATGTACTTTTCCTTAACACACGACACCGCCCCTCCAT
GTATCACTGCAGTTCCAAGCGCCACCTCCTACTCACCGGACAGCGACGCC
ACCTCACCCGAGCACCCGCCGTCCGACACACTTCATCCGTTCCCCTCACA
CAGCCGATGACGCCTACTCCCCTACAGCCGCCTAGAACTCTTTTGCTCCA
CCGATCCCTGGGATCCCTCTCCCCCAACATTTGATAAACAATCCTGATAA
CGATGACCATGATTATATCCTGATATTCTAGGATATTAGCTTAATTAATT
CCATCATATTGTCCATTCATCATTTTTCTATACAATTTTTAGGATTCTAA
TCATATGCAAAGGATGCCCATGGTTATACCTTGAGATTTTAGGAGGTCGG
CTTAATTATCTCCGTACAAGTTCTGCTTTCAGATTTAAATACTGCATTCA
CATCGTTTGTTGAAGTATCCATTTTCATATTTGTTCATTTATCATTTTTA
TATATGATATCAGATTGTAATCCTATTCATCTTCTGAACAAATTTCCAAG
GATCATGATAATTCACTTCGTTTAGACCCAAGAGTTAACAAGACTCCTTA
CTTTCGAGTAAAAAGAAATGTAACATAGAAGCCATATAAAATTTAATACA
GCAGAATCATCTACCACTCAGATCAGGAGAAGGCACTAAGGACACTCCTG
AATATTAATCACCGTTTGAGTTAGATTGCCTTCATACACCTTCAGGACAT
GATTATGTCTTATCTTGGGGAAGCAAATCTATCTGGATAACAGGAGGAGA
AAGTAACTATGCTTCTCTAGGATATTGGATCTATGGTCCTGTAGTTGACT
ATTTGTGGCTATCATGAGGCAGAACAATGTGAAGTCTCAGACTCTTGTTC
TTGTAAATTATTGTACTTTTAGTTAAGTTTATCAGTCATAATCCATTAAA
TATTTGAACTTATAGTTTTATATGAATATTTTGTTCTGTTCTATATTTGG
GATGATCTCTTTAATAATGATTCTATGATTATGACATGGTTAATTAATTA
TATGCACTATGCATCTTTGAGAGGCTAAATTCTAAATACCCACATTGATA
TGAAAAAATATGTATTTTATGTGTAGTTATTTCAGTTTAGTAAAATAAAA
ACAATTATATTTCAACTATTAAAATATATACATTTGACATTGTAGCATCT
AGCCTCTAACCCTGAAATTATAGACAGTTTTCAATTGGTTGAAAAACAAA
TGCAGTTGTTGAAGTTTTCCATAAGTTCAGTCGTTCAAAGCATATCGTCA
CACTTCAGCACCTAGGCAAGAACAATAAGTGGCATCCTATATTTTATAAT
GTAGGATATTTGATGAAAAATTTCTCATTAACGGTCTCTATTTTGCACGT
CAGTGTATCTACTTTGTATCTGAAAGAAGACCATCTTCAATAAGTATGCT
ACCGAGTATCTCCAATTGGATAGCGGACTTGGACACTCCTAAGGACAGAT
GAGCAAGACATGGGAAGTCGACTCGCAGCCAAGGACTTGTGGCGCATAGA
CGATCAGGCAAGGTTGGCATGAGTTTGTCCATGACAACAATCTGCAAGTC
CCAAGATATCTGATTGTTCCAGATGATGAAGAATGAGATGACACTTACAA
TGCTCTTGGGCTGAATTGTCTAAAGCCGATCAGTGGGGTTGTCAAGACAT
TAGATTCGGCAAATTGGGGATTGATGTATTTCAGTTGAGAAATGATATAT
TGAAGATGGCACGGTAGACTATTAGAGGTCTGGGGATCATGTGTCAGAAA
TTATAAAGCTACTTTCTATGAGAACTGGGACACACGCACTACAACTTGGC
TGATTAGTAATATTGTATTGTCATTAGTCTTATTGTTTCCATATATATCC
TTGTTTAGATTGTAGATTCAAATAAATTGAACATTTGTTTTCATCTTCTT
TCTTTGCAGGCATGAAGCTGAAGCATGCTACTGCAGCGAGCTGCTGCTAG
ATGATGATTAGATCTTATATAGTAGAGACTCGTGAGTCTTATCCTACTTT
GAGGCAGAAATTTGTTTTCTAAAATATTACTTTCTTTTATTATATGGGAA
TCACATGAAATACATCATATTTCATTTTAGTTTACCTGAAACAATTGTGT
GTAATTAATGAGTTGTCTGTCGGGACACTTCTGTATTATGTATTCGAAAA
GAGAAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.