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GrainGenes Sequence Report: AA027367

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Sequence
AA027367
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA027367
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGACAGATAAAAGATATTTCCCTTGTCTGGCCTCTTGTCGCCGGCGACTC
GCTGCCATTGTCACACCGCCGTCCCGCTACTTGCGACCCCACCCTGGAGC
TCCCTCCCCTAGACTGTTCTGCCCTGTCCCGTCTCCCTCCCGTCACTGGA
GACCTCCGCGCACGTCCTTGTCCAGCCTCCCGTCGACGGCGACTGGCCGC
CATGGCCACACCACCGTCCTGCCGCTCGCGACACCACTCTGACACTCCCT
CGCCCGGAAGATTCTTCCCTTTCCCTGGTTCCCCTAGCTGTCCAGTCGCC
AGCGGCCTCCATGCCTATCCCGGTACAAATCAGGTACAACTCTTGTACAG
CCTCTAAGTCTCCGTTGCAATTAACAGACTATGTAGGTTCCAATAAATTT
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ACATGTTGTACTGATAGGATTTTAACAATCAACAACAATGGCTACTACTG
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AAGGGTGCCTTCTTTCAGCTTGGGCCAAGGGCACTTTCTGGTTGGGTCCC
TTGGGAACTTCCTGACGTTGACTAACGATGCCCAGAGCATCAACCTGTAG
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TTATTATTTTTTGGCTCCTGCTGGTACCATGTACAATAACTTTACAAGCT
TGGTGTGCTATTACTTATGTATCAGATCTAAATGGTAGTAGAGACTAGAG
ATGTATAATTGCTATTGATCTTTTAGCATGACACCCCGTGTACATGTTAT
ACTGACAGGCTTAGTTCAACAATCAACTACTGCTGCTTGGCAACTTAAGA
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GTGAGAGTCTCAGATCATAGTGTCAGAGTAGTAACACAATCGCAAAAGTA
CCTTGCACTCATTGTCAATGACGCTTGTTGCAGATCAGCGGTGCCACCCA
AGCAACGTCAGATTTAGGTGAACCGCGACTGGGCCAACTGTTCTATTATA
GGTAGTTTGTTCTTTTTATGTACTTCTTTACATTTAGGATTTATGAACAT
GTTAATATGATTATGTGGATCTGACAAGGGATTATTTTTGCTGTGTACTT
ATCTTTTTTATTTCATGTCTGAGATTAACCTATAAATAATTTTAGCAACT
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ACATCCACACTTTCTCAACTGCAAAGCGCGCCCACTGTTACAGGTACTCT
TTACAATCATGTATATCAATTACTGCGAAAATGTTTATAATGCAACTAAA
CCACCCTATTTTACCTTGGAGACACTGCTTGGAACAAGGAAAATGGGGTC
CTTGTTAATAGCGACGCATTCCAGAGGCAATCACTTTGTATTCCATCTCA
AGGGCAAGAAATCCTCATAGCTGGTATTAAGGCGGCTAAATCCCTAACAA
AGTGAATGAAACTATGTTAATAATTCATATCTAATGTATCTATATGCATC
ATGTAGAAACTGCTGACATAAAAAATAGCTATACTGATGGACCTATTGAG
ACATTGTCTATAGATCCAAAGGAGCAGAGGAGGCAACGAGACAGGGAACG
GTATGCAAAGATGGATAGCATGAAAAAAGAAGAATTACTGAAAAGGCACC
GTGAATCCCATCAAAAACAAAAATCATTAGCATGGAACAAGGAGAACGAG
GCTCCAGCTGAAGACAGTGAATGGCTAAGAAGGAATGACAACTACCAGAG
GCAGTCAATTCATGTGCCATTTCAAGGGCAAGAAATCATCCTAGCTGGTA
ATATGGCAACTCATTCTTGCTTAAGATGAATGCATTAATCATCATAAATA
ATTAATACCACATTAGCTAATTGCATAAAGTTGTTTTGCTATATATAAAT
GAAAATAACTATGTTAGTAATTCATACCCATTGGAGCTATTAATGTGATT
GTTTGTTCTACGTAGATTTAGTTGACATGAACAATTGCAGTAATGATGGA
CCCACGTCATCGTCCCTCATTCGACCACAATCCATCGTAGATAGTATAGA
GCATGAGAGGGAGCGAAAAAGGGAACAATATGCACAAATGAATACCGAAA
AGAAAAATGAACTACTAGCAAGAAAGCGTGAAGCCTATCAACGGAAGAAA
TCACTAGAAGGTAAGGGTTCCACATTTTACAAGACAAAATCTATCATTTT
TTTTATGATACATCCACTCTTCTTAGCATTATCATGTAATTTTCTAGAGC
AAATTGAAACAAAGCGTGCAAGGGATAGGCTCCATTATGCTGATATGACT
CCTAAGCAAAAGCGTTCAAAGAAGGCTCTCCGCGAGTTGCGATGCAATAG
CCTGAGTAAAGAATCCATAGCCATGGAGAACCCATGTTGGACCCCTAAGG
TTATTCATACCCCTGCTCCTCAAGGCTCCATACCCACAAGTGATTGGTAT
ATTCCTGAGTTGAACGGAACCCCTATTTATATCCAGTCTGCTTCGGAGCA
AATGTCAGGGGAGGTGACCCCTAACATGGATGTTCGTAATATATCATGGA
GAAAGCATGTAACACCTGGAGAAAGGCATACATTGCTAGGTCTTCGAAAT
GAATCATTCTATGCAAATAGTAAGAAGCATGTGACTGCACCGGCAGATGA
AAGCCTATCAATGACCATGGAAGGCGTCAATGGTTCTAAACAGCCAACAC
AATCGGTCGTCATTAACAATGGTAATGTTCTTATCCTCATTGGTCTATAT
TGCTCTAATTTAAGTCATTAGCAGTTCAAATGATCATACTTTCATGTTGT
ATCTACAGAAACTACCGCTCCCACGCCCGAGATTGTTCAAATACAACAAA
CACTCTCACAAGCCAATGTTGATTGTAATTGTTTTGATCATACTCATTCC
TTATTATTATATTTGAAATATTTGCTCATAAATAATTATTGTATGACAGG
TGAGGACGAGGGTGTCATACTGGACGAAGACTCTGAAGACGAGGAAGGTT
ACGTGTTCGCTGGACAAGGTAACTTGCTCATGTTCCACGTCATCTCATGT
ATATATTGCACGTATCTTTTGGAATCATGCTGGTAACTACCATTTCAGAA
GAGGAGATGGATGAGGATGTTGAAATAGATGAGGTTGATGATGACTCTGC
TTTAATTTCAACCGCCCCTGATCCATACGACATGGTGTACAAGACAATCC
CAGCCGAGACACACATGCTAAAGGCCGCTGTGGACTGCAAATATTGTGGT
GCAAAGAGGTTCGAGCATGAGTCCCAAGGGTTCTGTTGTCGTAATGGGAA
GATCAAGCTAACTAATGCAGATACACCACTCGAGCTCATGAGGCTTTGGA
CGAGTGAAGACCTTGATGCTCGGCATTTTCGTGACAACATCAGGTTTTTC
AACGGGCATTTCTCGTTTACCTCACTATATTTTCACCTGGATGAGAATAC
CACTAACACATCAAAGCACCCTATCTACACTTTCCGTGCCCATGGCCAAA
TGTACCAAAACTTACGGTCATTTGGCAAACAAGATGGTTTGGAGCGCAGT
CACCTGGAGCTTTACTTCTTTGATGATGACCCAAGTTTAGAGCACAGATA
TCGTATGTGTCGCAAAGAGAAGTGCCTGAAAGACAAAGAAGTAATCACAC
ACCTCGTCAACATACTTCGTGACAACCCATACTCTGAACACCTCCGGAGT
ATGGGACAGGTTGAAGATGTTGATGACTATCATATCACACTAAACCTTGA
CCAAAGGATGGATCAAAGAAGATATAATGCACCTTCTACTTCAGAAGTAG
CCGCTGTTTGGGTGGAGGGTAGCGACCGCCGAAGACATTTCGAGAATAGT
GTCATCCTGCAAGGGAAGAACAGAGATATATTTGGTATAAAGTCCTATCA
TGGATGCTATGACGCACTATCCTACCCTCTATTCTTCCCTAGAGGCGAAC
TTGGGTGGCATACCGATATCCCCAAGGAAAAGGTTCGCTATGAAACTGTG
ATGGCAGCTCGTGCAGCTCGTTTAGCTCGTCGTAATAGCGATGAGTCCTC
CCAATGCCCACCTGGTGATAACGATGATGATGATAGTGATGAAAATGGCG
ATGATGCGGGTTAATGTTCAAATTAGTTGTTTCATGTGCAGTCCATGCTA
TGCAGTAGGATCTCTCCTTCCCGACATCATTCATTTTAAATTCATTGTGC
AGGTTCCGGAGGTAGACTATGTGTGTCTGTGCGGGACTACTACTGCTACA
AATTCCAGATGCGTCCTGGGATATTCAACCCGATCCTCTATGGCAAGCGT
CTTTTTCAGCAGTTTGCGATCGACACATATATCAAGATCGAGAACTCCCG
ATTGGACTATATATGGAATCATCAAGACACGATAAGGGCGGACCTGTACC
AAGGCTTAGTGGACAGTTTGCATGCCGGTGAGGGTAGGGCGGACGCTATT
GGAAAGCGTACTGTGTTGTCTACGTCATTTATTGGTGGTCCACGAGACAA
GAGGCGCCGCTACATGGATGCTATGGCCTTGGTGATAAAGTATGGCAAGC
CAGATATCTTCCTTACAATGACATGCAACCCCAAATAGGAAGAGATCAAG
CGTGAGCTCTACCCAGGGCAAACACCTCAGGATTGCCCAGACCTTGTTGT
GCGTGTTTTTAGGGCGAAGCTGGAGGAACTCAAGCATAAGCTGCTTAAGA
AGGACATCCTCGGCAAGGTTAGGGCATATGTCTATGTGGTGGAGTTCCAA
AAGAGGGGCCTTCCACATGCACACTTCTTGCTCATCATGGAGGGTCGATA
CAAGCTCACATGCCCTGAGCAGTATGACCGTCTCATCTCAGCCGAGCTCC
CAAACAAGAAGAAGTACCCAGAACTATACAAGATGGTCGTGAAGCATATG
ATGCATGGCCCATGTGGTGCTTTGAACCGTGATTGCCCATGCACGAAGGG
TCGTCCTTCTTGCAAGAATCACTATCCTCGACCTCACAATGAGGCTACCT
TACAGGGCAAGGACTCCTACCCTCTATACAGAAGACGTAAATATGGTTGT
AGAGTAATGGTTCGAAAGGAATGACTAGATAATAGGTGGGTCGTCCCATA
CAACCCTTACCTTTTGCGTCACTTCAACTGTCACATTAATGTTGAGGCAT
GCGGTAGCATAAAGGCCGTTAAGTACCTATTTAAGTACATATATAAGGGA
CATGACCGAGCTTCTATTTCGATGAGCGAGGCTGACATGACAAATAGCAA
CGGAGACATAGATGAGATCAAACTATATAGAGATGCGAGGTGGGTGACTC
CTCTAGAAGCCTTGTGGAGGATATACGGCTTTAAGTTGAGTGAGAACTCG
CCACCTGTGATGCAGCTGCAGCTCCATCTGCCAAACATGCACATGGTTTC
ATTCAAACAGGGCCAAGATATCCGACGAGTAGTTAACCGTGAAGGTGTTG
AGAAGTCAATGCTTACAGAGTACTTTGAGGCAAACAGATTACACGAGGAA
GCTCGTTGTATCTTGTATAGGGACTTCCCTGAATGGTATAGTTGGCAGAA
AGGAAAGAAGAATGGCGAGAATAAATACTGGAAGAGAAGGTCACTAAAAA
CGGATGGTACACCTTCCTGAATACAAGTTGGAAGAATTGTGTGAGCTCAT
CCAGCGGAGGGGGAACGCTATTATCTGCGAGTCCTTCTAAACCATGTCAC
CGGGGCCACCTCCTACGATGACTTGAAGACGGTTAATGGTGAAAACCTAC
CATCCTTTCGCGAAGCTGCAGAGAGAAGGGGTTTGATCGAAGGGGACAAC
ACATTAGATGACTCCCTTACTGAATCTACATTGTATGAGATGCCATCATC
TCTACGAAGGCTCTTTGCGACAATATTGGTATTCTGCGAGCCTAGCGATG
TGCGCGGGCTCTGGGATAAGCACTTCATTGCAATGTCAGAAGACTATCGC
CGCAACGAACCATCAGATGTTGTAGTTGAGCAAAAGGTTCTCATAGATAT
CAGGAATATGCTACAATCAATGGGCAAGGAAATAAAGTCATTTCCTCTTC
CTGATATTGATGAAGAATTTGACAGTGCCACCGGCGTGGCAAGGGAGATC
TTTGAGGAGTCTAGCATCGAGCCCAATGACGAGGACAAAAACCTATCAGA
CTCACTTAATAAGGATCAGAGGGCCGCATATGATGAAATCATGTCTGCTG
TTGATGGCAATGAGGGTGGTGTGTTCTTTGTGGATGGACCTGGAGGCACT
GGGAAGACTTTTCTATACAGAGCACTGCTCGCAACGGTTCGTGGGCAGAA
AAAGATTGTTGTAGCAACAGCTACATCGGGTGTTGCAGCTTCGATAATGC
CTGGAGGAAGAACAACACATTCACGATTCAAGATACCATTGAACATTGAT
GACGGTGGGCTTTGTACCTTCACTAAACAAAGCGGTACTGCCAAGCTACT
GCAGTCCACTTCTCTCATTATTTGGGATGAGGCTTCCATGACAAAGAGAC
TGGCAGTAGAGGCATTGGATAACAGTATGCGAGATATATTGAGCCGACAA
GACCTACCATTTGGTGGAAATACGGTTGTGTTTGGTGGAGATTTCAGACA
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CGCTACGATAGGTCTTACCTTTGGGATTGCATGCGTCACCTAAAGCTGGT
ACGCAATATGAGGGCACATAGTGACCCATGGTTTGCGGACTACCTATTGC
GCATCGGTGATGGTAAGGAGGATACCAATGGTGATGGTGGCGTCCGTCTT
CCAGACGAGATATGTGTGCCTGTACCGGGAAAAAGAGCATTGACCTTGAT
ACACTAATAGACAATGTGTTTCCCAGTCTTGGTGCTAACATGGAAGACCC
AAACTACATCACCTCTAGAGCAATTTTGTCGACACGAAACGACTGTGTGG
ATAGGATTAATATGAAGATGATCAATCCATTCCAAGGAGATGAGATGGTG
TATCGTAGCTTTGATTCTGCGGTGGACGACCCTCATAACTACTACCCATC
TGATTTCCTTAACACGCTCACGCCTAATGGTCTGCCCCCGCATTTGTTGA
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TGTCATCGATGCAGAAATTATGTTGGGCCAACATGCTGGAAAGAGGATCT
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CAGTTCAAGAGGAAGCAGTTTCCTATCAGGCTCAGCTTTTCCATGACGGT
TAACAAGGCACAAGGGCAGACTATCCCGAATGCTGGTATCTACTTGCCAG
AGCCGGTGTTCTCTCACGGACAGTTGTATGTAGCGCTATCTAGATCCACC
GCTAGAAAGAACGTCAAGATTCTTGTCATCTCGGATGGTGGTAACAAGAA
CAATAACCCAAATGATAGCAAAAAGAAGAGTTCAAATTACAACAAGAGCA
AGAGCTCAAATTGTCCTGTTGGTACGTTCACGAAGAATATCGTCTATAGA
GAGATCCATACATCATAAGGTGAGATATTTGGCACCTAAAATTTCAATAA
TCATACTTTTATCTTTCCTTCAAATCTAACTTATTTATGTGCATATCAAT
TCCATTATTGTGTTAATCATGTGTTATTCAGGGAAACCAAATTAGTTATA
TTCATGTGTTAGGTAGAAATGACTCAACCAGATGAACCTGGTTATAATCT
AGCTGAAGATCCATAGGCCAATTACATAAATACAAAATGGTCTCGTTTTT
GTTTTTTACATATATTTGCATGGAGGATAGATTTGATGCCTTACTTCAAC
GATTAATACAGTTCAAAATACCAAGCATACTTGTTTCCAACCCAGTTCTA
CTGCCACGAAATTCAAAACTATTTTGTCACACCAGACCAGCTTATAGGGT
CATAATAAATGAGTCCAGTTTATGAGAGAAAATCTAAACCATACAGGTGA
TTTGATAGAGAAATTGTACATATTGGAAATTTGTAACATTTGGTATAGAA
GAAATAAGACATAACATTTGGTATAGAAGAAATAAGACACGAGAGCCTCA
CCCATGTTGACTGTGTAAGCTAAAACAAATGAAGTATTCTAATATTATTA
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CCTTCTGTGGCTTCAGTTTCCTTCAAATGGTGTAAGTCATAATATAATTC
TGCGTCCAATAATGTTGATATGCATATGTATTTCTATTTGTATGGTCAAA
AGATATGCGATGTAATGATTGTTGTTCTTTAAATTATCTGTATTAAGGAA
GTGAATCAGACTAAGCATTTTTTATTCATTTAAAGAACCTACATACAAGA
TATGAAAAGGATAAATGTGTTATATAGCATCAGCTTGTACAAGGTGTGTC
AAACTTTGTCAACACCAAGTTCATCAGAATCAGTAAATGAGAAAACTGAC
TGCTCCAGTTCACAATTTAAATGGTTAGTTGATATGATTGTGACATAAAG
AGTGCAGTTGTAGTGTAAGCTTGCAATTGATGAGATATATGTTTTCTCAA
AGGATGATGTAGCTAGCAGCATTTGGTTCTTGGTTATACAACCTGGAGCT
TGAATCATGATATTCATCTATACTCAATTAATTCATTGCCCCATTCTATA
TCTGTTTAAGCAAGAACGATTCTATTACTAATTGTTTATATAGTTGAAAG
CTTATGATATGAAATTTTGTGCAGAGCATTGAACATCATAGTCATACTTT
AGCCCTAGATATCTGCTGGTTTTCAGCTAGATGATGACAACTCTAAACAT
GTTGTTTTTTTTCTTCATGGAATATGATGACGTACTGTTTGGCTAGAAAT
TTGAATCTACCAGTAAGTGATACGGTTGAATTATGGGTATTTTTATACTA
ATAGATGTGTTCTCTTTTTCTTTCAGGGATCAAAGCATGTGTACAAAAGA
TACTTGCACCTATTTTTCCTGAAGCATCAAGCAAGTTTCTTAGTCTATCT
TCTTAGGAATCTTCGGAATCAAATTTCAACATACATCAATCAAACCTTTT
GTGGAAGCCATATCATTAAAACATGAAAGAAGCATTTAGGCTACTCTCTG
TTGGGTCTATATAAGTGAACAGAGTGTTTGGCGGTCCTACCAGTGGTTGT
ATACTTGAAAATATTTGATTCATAACATCTGAGAGGTTCTACATTCTTGT
AGGTCTAAGAAATGACATGCTACTTAGGTTTGAGTTAGATGCAAACAAGG
ACCATTATTTCCCTGGTTCCAGCATTTGAGAGGTTCTACATTCTTGCGGG
TCTTAAGAAATTTCATGCTACTTAGGTTTGAGTTAGATGCAAAGAAGGAC
CATTATTTTTCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.