Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA021579

[Submit comment/correction]

Sequence
AA021579
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA021579
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGTCATCCTTGCACTGTAGAAACACTACAGTTACTGCACATCTACATTAC
TTTTCCTTTTTTTTTTCTCGGTCAGTTCCTACCGCTCAATAACCCAATGC
CTTTCTCTCTCCCTCATCCATGTCGTCTCTGATTGAGAGCTCTACCAGCG
TCGTCCTCATCCAAAGCCGCCGGCTACCTCGACCGCTTCTCCGCCCAAGT
TCTCCCTCTCTCCATCTCCCCCTAGAAAAGCTCAATACGAGCACAACGTC
CTGAGATCGCCGGCGACAGTCTCCCAGGCGCTCCCGCCCATGTCCCTGTC
GGCTGCCCTCCCTGCGCCCCAAACCCCGCTGCCTACTCTGCTCCTGGAAT
GTCGCCATCTTCCTCCCTAGGCTCCGTCGCCGCAGCGCCATGGGTCCGCA
CCACCACTCAGCGCCGCCACAAGCCGCCCAATCCCCAAGTCAGCAGCGCC
CCTCCACTGCTTCTGGCGACTTGTACCGGTGGACTCCAAGGAGGAGGAAC
TCCAGCCGGAGATGAAGATGGATGGGAAGGAATTGGGGATGAGAGAATAG
GTGGATACAGAGGAGGTCAGGAGGACGGCAGTGCCGAGTGGGGCGGGCAA
CATGACCACGAGGTGTACGACGGCAACGGTCGGGCCGTCTCGATGGAGTT
TGTGTTTCTGGTTGTAGGGTAAGGACTGGATCCATGCCAGATCCATATCC
CCAATTTTGATGAGCCTCTTTTACAAATTTTATTTGTTTCTTCTCAAACT
GTAGGGCAATAAGGCAGGGAAGGAAGAAACGCCTCCTCTGGCTCCGCGAC
GGCGTCGTCGCCTTACTGTGTGTTGTTACTGTTGTTCCGCCTGTTGGCAG
CAGGCCTATTGGTCCTATTTGCTCTTCTGCACTGTGCGTGTAAGGCAGGG
TACGTCTCCATCCAGTGGTCGGTCCGTCTTCTAATCTTTCATCTCTGCCT
GTTTTTTCTTCTGTGATGCTTGATTCTTTGGATCGGCCTAGGGTTTCTGT
TGTTGTATGTGCATCTGCTGTGGCTTCGTCGGACAATACTCTGGACGCTG
CCTTGCCTTTCTCGGATGTTGTTTCCTGTTGTTCTGCTCCCTAACAGATG
AGATACAAATGATTTTCTTTGTTTGGTGTTTGGTTAATTACTAGCCTGCT
GTCGTCTGGATTTTTAACATGCCTGAATAGGCTGTCATATTTGAACTCTG
AATTAGCATCCAATTTTATAAACTAAAGTATTGTTTCATTTTTCTCTCGC
TGCAGATTTCTACTCTCCTGAAGCTGGTTCGCTTCATGCTAGCTATGCTA
ATATTGTGCTATTGTATTAATTCTATTGATCCACTTTTAAAAAAAATATT
GCTTGCTTTCTTTGTTCTGTAGAGTATAAACATCCAAGTAGTATCATTTT
AATATTTCTTGCATTTTTGTTTTGCATAGTATCAACGTAATTAGCCAAGT
AGTATCAAATAAACAACTTCTTTTGTTCTTGGATAGTCATGTATAAAAGG
TCTCGGTCAACTTTGTTTGTCCGAAAAGTGTACAAGAGTACATCATTTGT
TTATTATGGTTCAGTTTCTTAGTGTAATTTTTGTACGAGTAAGTTGTGGA
TTTCTTAGGGCCGTATTCACAAAGAGTATTGTGACACCTGTGCTTGGCAT
ATCTGGAATTGGTGGCACCATGGAAATTTATGGTGCATCTGATGTAGTTG
TATAAAAGTGAGCTTCGCATTGTTTTTTTCATCCAATACACACTTGCTGT
TGCTATTGCTTTAGGCTAGATTCTACAGCAGCTGAAGTGTGTATCATTTA
GATCTACTTGAAATACCACGCCATATGTTCAGTTGAGTTTTATAGCTTTC
TTGATGTTGTGTTCATTGGTTGCTGGATGTTTTATCTCTGGTCTTTATTC
AGCTATATTTATGGTCTCAATTGGAGCTATTCTTCAGGTTGCGATCCTGT
TCTGGTTACTTCTTCTATACAGGTTTGGTTTCATGGTTCCTTATTTAAGG
TGCTATTTTACTACCTATTATCATTACTATATTGTCTGACTGCTTTCTTG
CATGCTTGCTTTAGATTTGTACACTGGGGAAAAATGTTTATTTCTTTAGC
CTATACATTTACTCTAGGAGAATATGTTTGATTCCGGGCGTCCGCAGGCT
ATGGTTACTTCTTGCTTTCTAAGATACAATATACTATTGGTGCCGAGCTA
AGCTTAAATTTCATTTTATGTATAGTACGTATATACTTAAATCAGCTTTT
CTGTACATTTTTGTGCATAGATCTGCTAGCGCTCCAAGTTAGGTTGGTGA
ATGAGATTAGAAATTTATCTAGCCTAGCTAAGAATCCATAGACAAGGTTT
CAAGCACTGCAGTGTTAGGCGATTGTGTGTTTAGTTGGATGTCGGGCTTC
ATGTCACAAGCTTCACGATACAAAAGCACCACTATGGCTCCACCCATTTA
TATGCTCTAAAAGAAATGCTAAACGTAAAGTATGCTTGGTACAAATGGTT
TTGGGGTACAGTAAGTAGATGATATGTTTAGTGTCTGCTGTTCAGAATTG
TACTCTCAGCTCACTGCGTTAGACTAATTTAATAAGCTGAATAATGTACT
ATTTAACATTTTGAAAAAAAAAATAGGAGGATTTGTTTTAACCGTTATCC
ACTTTGGTGTATCTACTTTGGTGTATCTGCAAATTACAAGTGAGTTGACA
ACGAAAATATTAAGTTTGCTTCTAAGCTGAGGAGCTTGCAGATTTGTCCT
CGCAGGTTCACGTATATCCTTTCCCTTCTTATCTCTCAGTTGTACCTTTT
TTAACCATCTATTGACAAATGAATTGAATTATTCACACCCATTCTGGTTA
CGGTAAATTTATCGTGGAGATTCATACATAGTGTGCAGCTGATCACGCCA
CCCTGTGTTTTTTCTGATGCATGGTTGATCCTTCTATTTTCCTATACACA
TAGGTTACTAGCTTATTTTATTATATTCGTAGACACATGTGGTAAGGACG
GTACGGATTTGTACGACATCCATCCATGTGGAAAAGATTTAGGTAAAGTC
ACTTCGCTGCCTTAATTTCTAGATGACTCGACATACTATTTCCATCGTTA
TGTATTTATGGATTTGTCATTGTGGTACCATAGTAATCAGGATAGTTAAG
TCCATCCATTTTTTTGAAGGTGAGAGGTTCATTGTGACTTCCAGAGTTAT
CAGTATGAAAACTCCCCGTCATAGTTTGAGCCGTGGAGGCCTGCATATAC
CTTTGGAGAGTGGTTTTGCTGCTGAGTTAAAGAAAAGTGTAAAGAGGAAA
CAGTCAAACACTACTTACTAATAAATATACATGTGTTCTCAACCGCGAGT
CAGCATGGTGTTTGGAAAGTTCTACTTTAAAGCACCTATAAAATCATGAC
CATTTTGTTATGGTTTCTTGCAATATTTATACTGAAGTCATTTTCTGCAG
GTCAACATTAAGCAATTGTTGTGGCTTAGAAGATTGAGTTAAGTATTGGG
AATTCTATAAAATTGAAATGATTACAGATGGCATGATGTTGGCTCCACCG
CATTCCATTGGCTCCACCGCATTCCAAGCATATGGGCACACATATAGGCC
TCCTTTGATTCTCGGGATTTCTAAAGGATTGGTATCCTACGAGTAGTGTT
CCTTCCGCAGTCGTTTGATTCAAGGGATTGTAACCTAAAGGAATAATTCC
CATAGAAAACATACAGTGTATTTTCACAGAACAATTTGCATGAGGTCTGA
CCTCATGGTTAGAATCCTTTACTATAATCAAACATATGTGAGATTTCCTG
TATTCGTAGAAATCAGTTGGGCAGAACATTCGAATCATTTGCCTTTCCTA
TTCCTTTGGATTTCCTATCTTATGAATCAAACCAGGCCATATACTTCATT
GGCTGCGTTTTCTGAGCCATCATATTTTTCACTTTTCTAAGGCCCCGTTT
ACTTCTCAGGGATTTGCAGGGTTTGGAGGGGATTTTCCCGGCCCATCCCA
TGATCCCGAAATATCCCGGACAGCCCGTTTACTTGTAATTCCGAGTATTA
TCCCGGCCTATCCCTGAAATTCCACCCCGAATCGCTTCCAACTCGTGTAT
TCTAGCACGCGAGCCCACCCTCGTGTATCGTCGAGGAAAGAAGCCACAGC
TCGTTCGCGTCGAGGACGGATGCGGCGGCACGGACCAGAGGCGACAACGC
AAAGGGCTACAGGGGGACGCCGCCGACGGACACCTCCTGCGGCTACGGCT
ACGGCAATCCCTTCTCACCGGTGAGTCTCTCCCCCGCCTCTTCCCCTCTC
TGCACTCCCTAGGGTTTCTCGGTCGCCGCCGCCGTCCACCTCCCGCCGGA
CGCGAGAGAGATGGCTTCCATGGCACTTCATTGTTCTTTGGTTTGCTTCC
TCTTGCTCCCCTATTTGTCGTTGGGGGCAGAAAATGGGCCTCCAGATCTA
AATTGCCATGGCACGCAGGTCCTATCCATGTTAGCACGCAGATCCTATCC
ATGTTAGCACGCAGGTCCGATCAGATTGACTATACACGAGGATTACTTCG
TTCATAAATTCCTTTGTTCCTTGGTGAGAATCACTACTTAGCCTCTTGAT
GGCTACTTCTTGGCTACCTAACACTCCCTAGGAAATTATAAGAGAAAACA
CAAATTCAGTTTTTTCATAAGAACATATTAATTCTAGAAAGAAGTCCATA
TAACCCCCCTAACTATCGGGTTTGGGATGCTAACCCCCCGTAACTATCAA
CTGGGTCATTTAACCCCCCTAACTATTCAAAACCGGACAGATTGCCCCCT
TGGACACGGAAAGCTGTTTTGATAGCGGTTTAGGAAATGGTGTACAGTGT
TTTAGGCCACTTTGCCGGCGGTTTGGCCACATAGGATACTCTAAATAGCC
TCCATGACTTCCTCATTCCCCTCTACCCCGTCGCCTCCCGTCGTCCTTTC
CCCCATCCCCATTTGCGCCTCCTCCTCCATCCCAACAAAATCTGCCCGTC
TGCGCCTCCTGTGAAACGGACGGCAGCATAGCATCTTCTTGAAACCGTGC
AGGTCCGATAACCACCTTGACACATGAGGAGGTGCTACCAGAAAGCGCGG
AGGTTCATTCGATTGAGCGCACCGCTCCCGCCAAGAGCCTAGAATTCGAT
CATATTGGTGACGCACCAAAGTACAGCTCCGCCACACCACAAAATATTGC
ACGCATCTTCGCCTCCTTGCCAAGCAATGAGGCCAGTGAATCTGAACCCG
AGGGCAGAGTTTGATGTGTAGGAAAGGGAGATGAATCGCTATAGGATTTC
GGGTACTCATTGCCGCACTGTCTACAGGGCTCACCCGTGCACATGGCTCT
CCACCCGTCCTGATGGTTGCCCGTCAAAAACCTGGACTGCAGCGTCGTGA
GCGGTCGCAGATAGTCGACGAACGGCTCGGTCAGTGAAGCCCGCACCATC
GTGCAGCTGAGCGTAGTCGAGTTCGTGTAGTTCGTCGGCTGACCTCCGCG
TGTGAAGTAGTTGATTCGGCGCAGCCAGAGCCAGCGTGACTGAAGAACAT
CAAGCTCGTCGCGACAGGCACCGGCCTCCTCCACGATAAGGACAGGGACA
GATCGTCGGCGCTTCCATCCGTGGTGTCCATGTCAAGCAAGGACTTGACG
GGTTTGTAAATGCGGCCGGAGGTGCGTGCGAGATCGATTGATATGTAGCA
TCAAGTTCATCTAGGACAGCAGGTTCCTCGCTACCGGTGGCAAGGACCGC
ATGCGCATCTGGCAGGTCGTTAATGCTGACGCCTCATCCTCATCGCCCGT
GACCAAGTGCGGACCATGTGCATCTCCACAGTGGCCAAACCGCTGGTGAC
GTGGCCTAAAACACTGTCCACCGTGTCCTAAACCGCTATCAAAACAGCTT
TCAGTGTCCGAGGGGGGTAATCCGTCCGGTTTTGGATAGTTAGGGGGGTT
AAGTGACCTAGTTGATAGTTAAGGGGGGTTAGCGTCCCAAACCCGATAGT
TAGAGGGGTCATGTGGACTTCTTTCTTAATTCTACTAATTTTGGAAGGAA
AAAATAGGAGTTGGATGAATGGTCGAGCTACCTTGTAAACTTTACCAAAA
TCTCCCTGTCCAATCATACATTCTTCAGAGAAATTATGTGTTGCCAGCGC
AATTTCCTCAAAACTTACAAATGGAAATTCATGATCATGGGAAGAGTTTC
CTCCCCAAGTTCGTAAGTGGTACTCATACCAATCTTCTTGTATCTTCTCA
AATTTCTGTTCTTAACTGCTGCCAAAGTGTTGTAATGATTTATTCTCTAA
TGACTATATCATAGACATAAAACAAATGAGTCTGTTTGACCGCTAGAACT
ATTGGTGTCCATTTACTATGTTCTCTATGAACTGAGAAAACCAGAGCAAA
TATCGAAGAATATAGCACTATGTCACCACTGAAAAGGACATGCTTGATAA
GAACCCCACATATAAAATGGGATACCCTCCCTTTTCCTCCATGTTTATAT
AGCAGGATAACCATTGCGATGGTCAAAACTCTGCACCAACGTGGTAACAT
CGACTGCAGTGCGGTTATAAGAAGTCCACGTGCTAGCTAAACAGTTGTTA
AACTCATCTAAGGGTATATTTACACCAGTTTTGCTTGTTCAGAGGGTTTT
TAGGATTTGTTAGCCCAAAGGAACATTACACAATAGTAGAGGAAATGCAA
GCGCAGGGGATAAAATGTACCTTTGATTATGAACCTGCATCTATTTCGGT
CCATGGCTGCATCTATTCTTAGCATATATATATGGCCGCAGTGTGCAATA
TGTACTCAGTTGTTAGTCACATAATAAATTGCTGCAGGTTTTGCTTGTGC
TGAATCTGGTAGTAGTGATCTGTTGCTTGTGCGCTTGTGGTGGTAAATAG
ATGCAGATGTGTGATCTGTTACTTGTACACACGTTCAAAGATTATCCGAC
AACACTCAACATGCTCATATGACTAAGAAATATGGAACTTAAAAGTAGCT
CTATCGTTACATTGGGCAGAGAAATAAAGTTGCCATGAGTAAGGCACTGG
GCAACACCATTAGTACATTACACATGGTTGCCGTGGTAAATGAACTTTTC
TTTTTTAAGGTAGTATCTCTGAAACTGAGAGTACATCTACCTACCTACTT
GTCTAATTTGATTAATACTCACTGTACCAATATTATCCAATATAGAATTA
CAAATTGACTGCTGCTGAACGTAAATTATATATTCGACAAATGCTTGTAT
GGCTCCAATTGATGTGTGTTCACTGTACCAAGATGGTGTTGTATATTAGT
ATGCTTGTTACTGCCCCATACTCACTGTACCAAGATGGTGGTGTGTCTAA
TCTGTTCAACATTGTATATTACCAAGAAATCATTGCATTGGATTATATTA
AGCTGATTTCTTGATACAAGAGAGCTAGCTAGAGTCGGCCTGGTGTTCTC
TACGTGTTCTGGCAGCAAATAAAATTTAATTTACATTACTTTACTTTTTG
TGATGTTGACTACTCAGCACATGAAGTTCTATATCTCTGCCTTTTCATGT
GAACCTCCTATTTCGACACTTGAGAACTCTCTATATTAATCATTCATGAA
TAAAGCCAGTGATCCATACTTGTAGTTTGGGTGTTCTTTTCAGCTAGGGA
CTTGTGGAAGTTTATACTACATCACTTATGTTTGTTTCTGTCACTGTTGT
GTAATAATTTGCTAATGCTGGCAAAGATAGCTAGCTCTAGATTTTTCTCT
TCATTTTGTAGTCTGTAGTATGTCTCTGATCTAGCTGGGCAAACTTTGTT
GTGTGCTAGCTGGGCAAACTTCTTGAGACAAGAGAGCTAGCTAGAGTCTG
GTCTGGTGTTCTCTATGTGTATATTGTGCTTAATGTCTACTTGATAACTT
GCTAGCACTTTAGTTTGTGTATTTCGGTTTCCCTAGTTGGTGTGAGAAAA
GAAAGATCTAATGCATGAGTTATTAGTTAGTAGTCTATTCCGGAAACAGA
CCATGATGTCAAGTGAGTTGATTAATAGATCATGTGCTAGTCTGTATCTA
TGTAGATAACATGGAAAGAAAAACTATATCTGCTCGATGCTTCATGTTTG
CATGCCCAGGAAATCGTGTGTTAAATCGTGTATTCAGACTGTGATATCTA
AATTCCAGAGAACTAGATGCATCTTCCTTTTCTTCTATAATCTGTTCTTC
CCCATTTACTTTTAGTATGCAACCTTCTAGCAATTTCTATTCACATATAC
TGTTTTTCCATGTTTTTATTATGTAACCTTCTAGTAGAGATGATGTTTCC
TGTTTATTTTGCTAGTGTTGAACCATTTATTTTTTTGGTGATATAATAGG
GTGTCGATGAAAGCATCTGGCAGAGCTGGACAAGAAAATGATCGCATCAG
CTATATTTGGAATGGGCATGCAAAATATCATTGTGGAAATAATTAGGCAA
TTATTTGAGCTTCGGTCTGTCGAGAGCACATATTTAAACTTGTATTCATG
AAGTCTATGAAGAGATGTTAACGCTCCTTGCAAAGATTCGATTTTTACTT
GAGTGACTTGTCAATTAACATGTTATAGGTGTAAAGTTATTCTTTTTATC
ACTTGATCTCAATTCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.