Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA003322

[Submit comment/correction]

Sequence
AA003322
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA003322
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACGCCCGTCCGCTCGCAGCGCAGTCGAAAACAAAACCCGGCCGTCTCCC
TCCTCCCCCGCGGCGTATCTAGGGTTTTTTCCCTCTCCCCTCCGCTCGCC
CCACACGCGCTTCCTTCCAGAAGCTTCTAGATACTTCCAGTCGGAGGACG
AGCTCCCGCCCTCGCGTCAGCCATGGCGTCCACCAAGGTCCAGCGTATCA
TGACCCAGCCCATCGTACGCTCCCCTATCCCCTCGTCATCTGCTCTTTCT
TTCTCTACATGGCTTTTTTCCTGACGTTTTTGTTTCCTCTGTTCCCTCTG
CTGCTGCGATGGCGGGCGAATGGTTGGTGTGCGACGGCAGAATCTCATCT
TCCGGTTCCTCCAGAGCGTAAGTGTTTGGTTGGGGAAAATTAACAATTCG
TGTTCGTCTTTCTCGGGTTACTTACAGTTGGCTTGGACTGATTTTTTTTT
CTAATTTGGTGCAGAAAGCGCGCATCCAGATCTGGCTGTTCGAGCAGAAG
GATATGCGTATTGAGGGTCGTATCATTGTAAGTTCCTCGACCGATTTCTT
GCTCAAATTGGCAGAATTGCCTGCGTGTGTGTATATTAGGAGTAATGTAA
CTGCGTATAACATGTATTTTTAAGGAACCAAAATGTAGTACTTACCTAAG
AGCAACTCTAGCAGACACCGTATCCGCCGAACCATAAAAAGGCGTTTAAG
GGTCTTGTTTTTGCTCGGTTTTACTCGGGTTTGCTCGTGGCCAGAACAGA
AACCACAAATCCGAACCATAAAAACTTGAATTTTGAACATTCGCGGGAGA
TTTCATATGTTCATACGTACATAGCCATGATCGTAGGTACAAAAGGCACA
AATTAGACTAAATTAAAGGGGGATCTGCCGTCGCCGCAGCTAAACCCTAA
CCCGCACGCAAAATCGGGCTCGCTGGAGCCTCATGGAGTGGTGGCGACAC
TTCCGTCGGCAGATTCAGAGCTCGTCGTCGAAGAGGCCGAGGTCGGAGAG
GCCGGAGGTGGTGTCGGAGACGAGGTCGACGTACTTGTCGTCCTGCGCCG
CCCGCGGGAGGTCGCCTTGGAGCTTCTTCGCGCGGGCTTCGCGGTCACGG
GCGAGCCCCTGCTCGAGCAAGATGTTGTCGATGTCCTCGTCGTGACGAGC
TCGAGCGGCGTCTACCTCGGCCTTGGCGACACTCCGCTGCTGGATGACCT
CCATCAAACGCTCGAAGGAGGCCTCGTCGGTGGCGTAGTCGGCGCTGGTG
ACGACGCGGCCTTCCGGGAGCTGCTCCTCCTCTTCCTCCTTCACTGGCGG
CAGAGGAGTTCGCGGTGCGCGCGAGGAGCTCCCCTCCCCCCACATGCGGC
GGTCGAACTCCTTCGTCTCGCGGTGGAGAAGCACGATCGGCACCGGCGTG
CGGTGCTTCTTGTAGTGGAGGGTGGCACCGACGGTGCTCCTCCTCCTGGG
CGGGGGTGGGGCCACGGTAGCGCGAGGAGGAAGGCGGTGTACGGCCGCAG
CGGAGTCCACAACGGTCCATCGGCGACTACCGGTGGTGGATCTAGTGCGG
GGGGCGAGGAATTTCTCGCCGGAGCTCGGCGATTTGAGCGGCGGTGTGAG
CAAATGCGCGGCGGAGGCGTGGAGGGGGCGGTGGCGGAAAGAGGGGCTTG
ATATCCACAAAATGCCCTCGGAACCAGAATTATATAGTTCGAGGGGGTGG
ATTTATTGGCCCCCGTAAAAAATTTCTGGGTCGGGCTCCGTTTGTGTTGT
CTGCTCGGGCCAAAAAAATGGCTCGGCTTGTAAACCCGCCGGAATTATAT
GGGTCCCGTGGTTTTCTGGTTTCTGCTAGGGATGCTCTAAGCAAGAGGGG
ATAAGCTGATTAAATGTCTAAAAATAATGAATAACTGGTAACTTAGCAGG
ACACATCTCTTTGTCTTATTAAGACAACATGAAAGTATGTTGGCATACTT
CTGAAGAATTGTCAGACACATGAAAATCTGCATGCTCTACTGCAGTCAAG
TGCTAAGACATAATATGCACTCTTGAAGCGTCTGAAATTGAAGCTAGATA
GATGCTCTTAGATGGCTCAGTTCTCATGCCTTTGTAATATACTCCCTCTG
TTCACTAATATAAGAGTAACATTTAGAATTAGTCTTGCTTTTCTTAATCC
TATGAGACAAGAGCAGGTATGCTGCTGCTGCATCTGTGAGACTGTGAGCT
CTTGTGGCCGTTTTCTCCCAATAATTACGGTTTCTACACAAACCTCTTGT
GTGTGTCAGAGGGACTTAATCTAGTTTGAAACCTTACTTTTTCAGTGTAT
TCTCCATATCAAGCTTGTAAGTTGTATCACTGAAACCAGCCTCAGTCTTG
ACCTATAAATCAAGGAACAAGTCGTTATTCAGTTCTTCTGTTGTAATAGC
ACACTCTGTTTGTTCAGTCAGAACTTGACCGTATTATCTATCAGACACCG
GAATATGCTACTCCCTCCAATCCAAATTAATTATCTGAGATTTTTTAAAT
CTCTCTAGGTTCAGTGAGCCTGCGACAACTATAATTTGGAAAAGAGGTAG
TAGAAGATATTTTGTAGATGTGTTCCCATAGGGATCATCGGCTTTGTGTT
TGGAGTATTTAAGATCTGCATTGTAATATTTTGGTAATTTGACTGCGATA
TAATTTTACTTTGAGAATATTTTCCTGTCACTGTAACCTGCTGCTAGCTA
AACATTTGTTTTTAGAATGTTCATGTCCTGATTTTTAGATCATTCAGGTG
TTTTGGATCACCCTCAAGACACTCGAGGGCCCTAAAAATGCATAACATCA
ATGGTTGCGGGGCAACTATGTACATTCCAGAGCCCAAAAAATCCCACGCT
TCTAGAACCTACAACATAGGTTACTGCCTACTGCTTAGTCTAGCCTTCAG
TTTTTTCCTTCTCGGGGCCTGGTTTATTGATAAGTAATTAGGACCTTGTA
AATTGGGGAACTAGTTACTGTGTGGTGCCCTTGTGCTGCTTTAGTTGTGC
ATGCATTTATTTCCATCTTAGATTTGCATATATTTGTACGATCAATAGGG
TTTACAATTTCCCTAAAGATGTTATTATTCGTAGTTTCTCAAACTTTTGC
TTGGGGCCCTGCCAAATAAAATACTACTCCTAAGTAACGATTTCAATGAA
ATGAAATTGGTGCCATGGTGGCATTGACACGATCTAACAGACGCCATTAT
ATCTGCTGCAGGACAAAGTAACAGATTTTTACTTGTTAGTAAGTATCAGT
TGTGTTCATCTGTAGGATAGCCTTTTTAATTCATTTGAATGAGTTGTGTA
CATGTGTGCTTTATTTGGGTCCTGTTAAGTAATGCTGAGTTTTTACACTG
GTTGTGTATTCTGCAGGGCTTTGATGAGTACATGAACTTGGTCCTCGAGG
ATGCTGAGGAGATCAACATTAAGAAGAACACCAGGAAGTCGTTGGGTTAG
TACATTTGCAACCTAGCTTTATTGCTACAGCACTAGGAATAACAATATTC
CATTAGGCTTATCAAATTTCTTTGTTGGAAATTGTCAGGAAGAATACTCT
TGAAAGGAGACAACATAACTCTGATGATGAACACGTAAGTTCCATTGTAT
CCACGTTTTGCTCTCATAATATCAAGACAAAGTCCTCTAAATTTTGCAAT
ACCCTGTTTTTTCAGTGGAAAGTGAAGCATCTCTCCCTAGTATGGCTGCC
ATTCTCGTTCCTGTGTTGAGCACCATGCGATACTTTGTACTCCATCCAGG
CTGGTATGCATGTAGCTTGACATTTTGGTCGCTGAGGATATGTAACTGTC
TACCTATGAACTCAGTAATCCATTCTGTGAACCCTGAGCATGATGTTTGA
GATATCGTGCTTATCGCTTGTGTTTAAGATTAACGCGAACAGACTGCCAT
GTTGACTTGTTTGTTGGCTTCAGTTATCAGCATATGTTCTATAATTATAT
GTATACTATGATGTAACCGGCTGAACATATTGACCATGTATTTGTATTGG
CTGCGTTATTTGTAGCACTGCTGGCATGGGGGATTGCCTTTGACAATTGC
AAGTGTGCTAAGCAGCAGCGGCTGCAACCACTTGAGATCGAGCAGAAAGT
AGAAAAGAAGGTTCTACATCTACATGTCTTATATGGTAGTTGAGAAATCA
ATTGGATAGGGAGCTGATTTTAAATTCAAAGACTACTTGTCACGAAATAT
CATTCCAGCTACACTTGCAAGTTTCATGTTCATCATAGAGATATAAGAAC
AACGCAAGCTCATTCCATTACAGACATGGATCCTTTTAGCTTGTGATCAT
GAGATGAAAACGTACATGCAAGGATCAAAAGAAGAACCACCTGTTCTTGG
CCTTGTTCTTCTTGCTCATCATCTCCTTTTCCTTCCTCTTCTTATCCATC
TTCAATTCCAGACTAACCTCTTCATCGTCCTCCTTGCTACTGGCGCTGCT
CTTGTCTATTTCTTCCTTCTCCTCGGTGCTGGGCGTGGGTGTGACACCAC
CGCCGGCCGTGGCAACGTCGAGCCGCGCGGTGTCCATTGCCCACCGCATC
ACCTTATCAACCTCGTCCTCCGACTCATCTCCCAAATCCTCCAGGCGCAC
CTTGGTCTCCTCCGGGCCAGCTGCCACGCCCTTCAGCGCCGCAAACCGCG
CTTCTATCTCGTCGACCCCGACGGCGGCAGGGGCGGAGGCTGCATCGGGC
CGCTTCGGTGCCGGCGGGCGGGACCTGAGAGCGTCGAAGCGGCGGGCTAG
GTCATCGTCCAGTGAACCGGGCGCGGGGTCGAGTGCGAGATGGTTCGAGG
CGGCGGAGGACGACGACGAGGCGAGGTGGGAGTTGGCCTGGATCTTGAGC
AACACGGCATCCTGCGCCGCTCGGAGGAGCGCCTCCACCTCCGCCTCGTC
GCCCGTCGGCTTCCGGCCGCCGCTCATCGTGGTGGGTTCCGTGTGTAAAT
ATTCCCTTCCTCGCCTCCGCTTTTTTTTAAGGGTTTCTCGCCTCCTCCTA
CAGCTCCACTGGCTATACTGCTTTGCTTTGGTAATTAGATCGGCCTATGT
AATTCCAGCCTAGCCCACTCATAGGCCCATCAATTAGTTCGTTGATTAAT
TTATGCTACATTTTCTCCGCTTTTTTTTGGCTCACTCAACCATTCCTCCC
CACCTTTAAGCCCGCAATGGCGGAACCCTAAGCTTCCCACCTCGCGCAGC
GAGCATGGACAAGCCGGCGTCGGCCCCCGGCGGCTGCCTCGAGGTCCGCC
TCTTCTACGTGCGTCTCTCACCTCGCATCTCCGGAGACGCCGCCCCGCCC
AGCCTCGCGCTGGCCCTCCACCCCGCCGGCGGCGAGGCCTCCCCCTCTTC
CCTTCCTCTCCGCCTCGACCGCCGCGACCCCGCCTCCGGCGAGGCCACCT
ACGTATCCACCGCGGCCGCACGCTTCCCCCCGCCCGCAGTCGCCTTCGAG
GTTGCGGACCAACATGGCGCCGTCCTCCTCCGAGGATCTCTTCGACGCTG
CTCTGCCTCCAAAGCCGATTCACCCGCCTGGGTGATCGACTGCGTCCCCT
CCGTTGGATCGGCTGCCTCAGCTTCAGCCTTTGAGGTATATGTTGCCGGG
TGCTGTGCAGGGGAGCCGGCCGTCCTCACGCATGCCGTGCGGCTTGCCAC
CCCGGAAGAAGCTGCCAGCGGATTGGTTTGCAGGCGATCAGCTACTTTGA
CAGTGAGTCGATCAAAATTCGAGAACCTTACTTGTTGCATCTTACTGATT
AATACTTCCTCCGTTTGGAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAATGAGA
TGTATCTAGACACCTTTTAGTGTCTAGATTCATTTGAACCTATACACTAA
AAGATGTCTAGATACATCTCCTTCACAAACCTAAAACATATTATATTTCT
AAACGGAGGGAGTATGAGCTACAGAGTATATGAACAACTGTAGCAACGAA
AAAGGGAGCCTACCGTGGTATATATGCCTAGACTGCATAATGTGCTTTGT
GCTAGTGTACTTGCTTTAACTATTGATTGGTGTTGGGTGATGAGCAAAAA
CTTGTATGGCCCCATATAGTATGTGTACACTTCTCATCCAGTTAGTGCGA
CGTATGTAGTAGTGCTCTTATTTACATAAAAGGCAATGTATGTAGTAGTG
CTCTTATTTACATAAAAGGCAATGTACTGCCTGAAAAACCGCTTTAGCAC
CCGATCTCCATGAAGCCCTTATATATTTTTTTTTAATTTTTATTTGAAAA
CTTGATTTCGAAGTTTCAAAAAATTCTAAAAAAAATACCTGGATGTAGTC
AACTATGTACACCAAGAGCGTGCACATTTTTTAATGTGAAATACTTTGTG
TTTTAGGCTCAGCAAAAAAGAAAAAATTTACTACTTCCTCTGATCCATAA
TAAGTGTCGCAGTTTTGAAATGACATTAGTTTAAAATGGCGACACTTATT
ATGGATCAGAGGTAGTAGAAGATTCGAAAGTTGCATTGTTATGCTCTTAG
ATATGCATTTTTTGTCATTTTTTCCAACAATAGAACATAAGGTATTTCAT
ATTGAAAGTTTACACACGGTTAGAATAAATCATTAGCTACACTGTGGTAT
TTTTTTTAGAGTTAATAACACCCCCAATACACTAACTTGCCCTGGACGTG
CAGTTTCATACACAAACTTGCAAATTGTGGTAAAAGGGTACACAAACTTG
AGTGTCGGGTGATGGAATGGACCACTTAGTCATATATTCAGTTACGAAGT
ATCCTAATGCATAGAGCTTCTCGTGTACATGTTCAGTAAAGTTCCCACCG
GTTTCTTTCTTCTCCTTCTGAGTTCGGTTCAGTTCAGATGATAAGTGCAC
ATAGGATTTCATCATATGAGAAGCAGAGTCACTAACTGTATACTATGTTT
GAATCTAACGCAAACCGATCAGTAGCTCGTGAAATCTGCAGTGTACAAAC
AGATGAGTACACACTTCAGGAGCTGCATAGAGAGAGAAAAACTGCAGTTA
GATGTCTAAATTCTGAAACAAATGAAAGTAAGGAAATTCTCTGCCGAGGC
TGGAGTTGTTGCCAAACCTGCAGGGGACTCACTTCTTTGGTGCAAGCTGA
AAAGAATACACATGAAGAAGATTAGAGCTACGGATACATACCAAAGAGAT
GAGAACACGGAGAGAATTAGAACATGCCAAGAATTTCAATTTGTGGTGAT
GCCTGAGAGCGAGGCTGCAGCCAAAATACTAGCCCGTCTACTCGCTCCCA
GTCATTCGGCCACACGAGAGGACTGGAGTGAACAGGGGAGGCCACATCGC
GAGCAGCCTTAGCACGAGGCGGTGACGGGCAGCGTAGACCTTTCTAATGT
AGGGCGAACCCATGCCATCCTCGGCAATGTTCACGACCGCCACGCAGGCG
GAGGTACAACAACGTTGTCTTCCGGTAGTCTCGGGCGGCGGTCGTTGCCC
GGCCACCCTTGGTCGACGGCTGGGCAGCCATTGGAGACACCGCCAAACAA
CTCTTGTTTGAACCGGACGCCTTACGCATGTCGTTTTTCTGGGTCAAATC
ACCCCTACCACGCGCCCGTTCTCTGCCGTCGAAGACCACCGCAGGACCAA
ATCACCGCCGTAGGAGGGTTAGCTCGAAGGAATCGATCTGGAAATTTCTT
GTTAATTTGAACAGACGAACTTCGCTGTAGTTTCAATGAACCGTATCAGC
GAAACTGTCAGGCGTAGAACTCTGAATCTTAACCTGCCTATCGTCACACG
TTAAGATCTTAACCTGCCTATGTCAGGCTAACTGGACCAAAAACGAATCC
GCATAAGAAGTTGATGTACCTCCGTACCACAGATTGCAACTTTGTGTATG
AAATTGCACATAAAAGACAAGTTAATGTACCTAGGATGTTATTAACTCTT
TTTTTTATTCTTTTTGAAGCTTTAAATTTTACTCTTTTTTTCAATTCTAA
AAAACAAGCTCCATGGAGATCGTCTGCCAAATTGACGCACTCATATATTG
TCCAGCTTTAAATTAATAAAGCCTGATTAGTTCGTTGGGATTACAGTTAG
TTGGAGTTGCCAACTTACGCAATATACATTTAGTAGTGCTCTATATAATT
TGGGGCATAGCCTAGCCGCATTGTCATTTTATCAAGTACCTGACTACGTG
GCGGCGCCGCATCTTAGCTAGCCTCGTGCGGCGGCTGCTTTGCCCATGCA
GAAGCAATGTCTCCTGTGGCTTGGTCCGTGCAGTAAGTGAATTGATGGAC
CTTGGTGGGCCAAAAGTGTGAGATCCCATCGTAAACACATCAAGATTTAT
AGTTCCGTCGTGTTTTCTCTCAAGAAAAAAAGCTCCCCATTAACTGCGAG
GTTAATTACTCTTAATTGCCAGAATAGGTTATGTCCTACTAGTTGGCATA
TTATCGTAGGTAAATTAGGAGTAACTGCCAGATTAATGAGGACAAATTGC
CAGATTAATTAGGAGCTGTCCCCAGATTAGTACTCATGGTCAGATTAATT
AGAAGCAATTGCCCGGTTACTTAGGAGCAATTGCCAGATTAATTAGGAGC
TGTCCCCATTCTTTGCCGGAGCTTGATCTTGCCAGCCGCCGGCCACTCAA
TCCTCTACCACTAAATAGAACGATGTCGCCCATCACCAGCACGTCCCTCT
CCTTCCTCCCACATCAGATCAACGGTGGCCCGCGCTTGTCGGCAGCAGCC
TGGTGAAGATCTCCGCGTGTCGTGCTCGATGGTGGTGGTCAGTGGCCGAG
AGAAGCCCTCCGCGCGTCTCGCTCGTTGGCGGCGGCATGGCAAAGCCCTC
CTATCGTCGAAGATCTCTGCGCGTTGCGCTCGTCAGCGGCGGAGGCGCGC
CTGTCAAGCTTGTAGCCACCGGCTTGGCGAAGCCCTCTGCGCGCCGCGCT
CGTCGCCGGTAGGCAAAGCCCTCGCAGCGTCGCGCCGTGTTGGTGGGGAA
CTGAGCTGCTTTCCAAGGTGATTTGAGAGAGAGAGAATGAGTGGATGGTA
GGAAACCCGTGAAGGGATGACTGGTCGCACCGTGCGATGACGTTTCGCGA
ATCGTTACGCATGGCCGCATGAAAGAGCGAGGCTGCGGCGCCTTTCAGTA
GATTTTCCCTTTTATCAAATGTAGTAGTGTGTCGTTATCGTAATTGCTAT
TCTAAGGCAGTGTGTTTGTGGTTGCAAACTTGCGCTGCTTTCCAGTGAAC
ATTGCTGGTCAATTGTACTAGCGCTGTTTAGAAATCTGTTTTGTTGGTGT
AATCCTGAAAACAAGAAGCCGTAACTTTCTGTGCTTAATTCGTTATGGCT
GGTATTCTGGTAATAGTACTTTGACTTCAGTATGATTTAATGATGTATGA
TGTGATAATATTTTTTTTAAGAAATAATAAATATATTGTATGTGGATGGA
AATCCTAGTATGTGTAGTCTAATTTTTCCTGCTTGGATATTATGAAGTAT
GTCTTAGATCATACGCGTAGATCTCAACTTAGGAAGAGTATATCAAGTGG
CATGTGTTATCTTCAGTAGCTTGCTTTCCATGTGTATGCTTCATCCCCTT
CAAAATTAGATCAAGTAGGTGTTGTTATATGATGAGATATAAGCTAATGA
GAAAACCAGACCCATGTCACATGTGAATAAGGGTTTGAAACTTGAAAGCA
TAGAGAATTACTTAGTTTAGGTGTACTTTCCAGTTCTCTCTTAGTAATTC
TGCCTAGCATTTTCCTTTGATGATTCATCTCAGATAATATATAGATTAGA
GCACGAGATCTGTCACAGTTATTAGGTACCATGGGTTTTTGTTTGTATCT
TGTTTCAGATAATCTGATTGTATTTAAGGTTCTGATACAGTGGGAAATTA
TGGGTAAAGTTGGACTATTACAACAAACATTCACTGTCCTGTCTATTCCT
TATGTTATCGTGAGGTCCTTGCTTTGTCACTGTCCATCTTCCTTCAATTG
AAACAGCGTGCTTGGGGCAAGCGTGCTTGGGGCAAGTCCTAGTACAATGT
TTATTAAACGCCCCAGTTTCAGTTAATTAATTTTAGATATGGATCCCGTT
GGCAGGGTATGGGTGATGACGATGACATGAACATAGGAACCAGGCCATAC
CCCGAAGGTTGGTACTCTGAGGACGAGGATGGGCAACTTACATGGTTCAA
CGCTGGCGTTAGAGTTGGCGTCGGGATTGGCCTGGGAGTCTGTGTTGGAG
TTGGCATAGGTGTTGGGCTCCTCATGAGCTCCTACCAAGCAACGGCCAGG
AACTTGAAGAGGCGGTTCTTCTGACACCATCATGACAGAGGCACCCGACC
TCGGGTGGCCAGTACAGATGGTCCATCCGTCAATGTTCAAAGTAAATCGT
TGTATAGTTAATGGCTGTTCGTTGTTGATTTGTCTTGTGTACATCATCAT
CACTCTCACATGTGTATAAAACTGTGAAGGTGTTCCCTGGACTTGTGAAA
ATGTCAGAGATGTTCTCAACATGGAGTAGCTGCAATAATGCAACCTTTTG
TACACCTACAAATGTAACAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.