Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA000364

[Submit comment/correction]

Sequence	AA000364
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA000364
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCTCGCCACCACTCCCTCCCTCCCCCTGCGGTTGGTTAATTCCCACCCCA ACCCATTCGCCGCCTCCCTCGCTCCTCCCGCACCCCCGATTCCGCCACCG CCGGCGAGAGAGCGAGCGAGCGCGGCCAAACCCTCCCCCGGAACTCTCCT TGGAGCGAGTGCGAGCATGGTGGGCGGGGTGTGCGGCAACGACAACTGGA TCAACAGCTACCTGGACGCCATCCTCGACGCGGGGAAAGCCGCCTCGAGC GGGGGTGGCGGCGGAGGCGGAGGGGGAGACCGCCCCTCGCTCCTCCTCCG CGAGCGCGGCCACTTCTCCCCGGCCCGGTACTTCGTCGAGGAGGTCATCA CCGGCTACGACGAGACCGACCTCTACAAGACGTGGTCCCGCGTACGTGCT CGATACTGTACCCCGCCTCTCTCCGCGTGCAAATCTGGTCGAATCTGTTC CGCGCCGTTCTGGTGGATTCGCGGAGCTCGTGTTGATCGATCCGTGCGCG TGCGTGTGTGTGTGTGCCGGTGCAGGCGAACGCGATGCGGAGCCCGCAGG AGAGGAACACGCGGCTGGAGAACATGACCTGGAGGATCTGGAACCTCGCC AGGAAGAAGAAGGAGGTGTGCCTTTTCGCTTTCGGTTCGTTTCTTTCTTT CTTTCCCTTCGGGCTGCTGGCTCTACGTTTTTTTTTTTGGTGCGGTGGGT ATGTGTGTACGTGTAAGCTGGGATTAAGGGAAGTTCTGCTCCGGGTTAGA TTAGTTAGTGAAGAAAGAACTGAAGGCTGGCTTGATATTGGTACCAGGCT CTTTTCGACAGAATGGGTTGGTTGAATGAATGCTCATTGATCTGTCAGTC CTTCTCAATGATCTCAACTACTCACAAGTACCATTCGTTCCTACAATATT AGGTAGATTCTTGCCTCCTCTGATTACGAGTTATGCTGGGACATAAGTAC CTCGCAGCCGTGAAATTGTGCTTACAGTAGTGTCCAAATGCAGTCTTAGT TCTGCTTACACTAGTGACAGAGCAACTAGATAACAAATGCAGCGTAAGAG ATGGTCGAAGGCTAGATTTAGTTGGATAGATCGAGCAACATGTGTGTTGC ACCACTTCTGGAATAATGGAAAACATAAGTGGTGCTGATGTTGGAATATT TTTTCCCTTTGGCTAAATACGCAATAACCCTGTATCCAAGGTGTTCCTAG AGTGTGGCTCAGGTGCTGCCCTGCAGTTCATTCAGAAATTGGCCTTTTTC TAAATGGAGAAGGATATGTATAGAACTGCACTATATATCGCGGTTTGGGA GTTTTATCAGATCCGTTAGGTTGCTTTTGGTACTGAGATACTGATAGCCT TGCATATTTGTCAAAAGAGAATTTCTCCATAGCTCCAATTTTTCTTCTTT GGTTTACACATGAATCCTACAGTTTGCAGTTTCTTTTGAAGCCCCACATA TGTTCACATCCACATTTAGTTCTTTTCCATACCTTCCCTGTTCCTGACCA GGAAGCAGATTCCTGGAGCTCCATTGACACCTGCAAACCGAGCATCCCAT CTTTCCTGAATTTCCTCTCAAGCACTGTTAGCAATTTGCATTTGCTTCCT CTTAAACTTGTCAGATGACAAAGCACTTGTATGATAGTAATATTGTTATC TAGAGGAACCAGCTAAAATCAAAATGAGGTGGACTGCTCAATCAGCAAGG ATATCCATGCAGAGGCAAGTGAGGATGCAACTGATTTATGGAAAAACTAC ATGTATGTAAAGCTGTGTATACAATCTGCATGAAAAATGTGACTGACTGA TGCATGCTGCTGCCGTCAGTCACTCTTTCATACATTTTTAGTACACAGCG TGTTCATATACCAAGCAGTTTTTCTCGTTGAAATTGTAATTTACAACAAT TTGTTTTTTTGCTAGGCTGACCAGAAATTATCACTACAGGGTTGGATTTA AAATGTTGCAACATGCTAAGAAAATATAATTGGCCTATTGGGGTTTCACA AAATCAAGGCATCATAATTTTACTTATTAAATCCTTGCAGGCTGTTCCCT TACCTTTGCTAGGTCCATGAGATATATATTGTTGGTTTTATCTTGACTTC TGTAATGAAAAATAAATGGGCTTTTGCCCCTTGTTCGAAAAATCTTATTC ATGATATAATTATATTTTTTGCTTGCATCGAGCATTCGATGTCTCTCTTA TCCCTAATCCGATCCACGTTTGTCATAATTTTTTCTGTGCCAGATTTTCA CACTCTTCTTCAATAGTTACATTCTTACTCACATTTGTAGTTCATCTTTC TGTCTTTCATATCCCTTCTTTATTACCTAATTCTTCTGGTACTCAGGCTG AGGAAGCCAACCGTTTGTTAAAACGTCGCCTAGAGACAGAGAAGCCACGG CCTGATGCTGCTGCAGAAATGTCTGAAGATCTCTTTGAAGGAGAAAAGGG AGAGGATGCTGGTGATGCATCTGTTGCCTATGGTGACAGCTCGGCTTCAA ACACACCTAGGATCAGTTCCATCGACAAACTATACATAGTGTTGATCAGG TATGGACCAGTTTCCTTAACTTCATGTAGTATTTTATAGGCAAATCGTGC AAAAGGAAAGTACTTCCTCTGTTCCAAATTATAAGACGTTTTGGTAATGT TAAATTAGCCTACTACAACGTCTTATAATTTGGAATGGAGGTAGTACATG CTGATCACCGTTTAATTTGCAGGTGATTAATTCGTTATGCTTTGAGCTAT TATTCGTATCTGATGCAAATAAACTCACAGTTAATAGGAAGATCTCTATC CTATTACATGTATTCTGTATACGATCATGGATCAAGACTTACTGTATTAG GCCATTCTTTAGCAATGGATGATGAATAATGATGTAAAAACATCACCATT CACAGATTTAGCCTACTTACTGTTAATAAAACCAATAAACTAAGAATTGC CTGTATCACCTCCTGCAGTCTTGCTTTTATTTCCTACTTTGATGCAATGA TGCAATTTGCAGGTTTGCCAGTATTATTTGTTAAATATGAATTGCCTGTT TAATTCCTTTGTGATGTATTATACTGCAGCCTTCATGGCCTGGTCCGTGG TGAGAACATGGAACTTGGCCGGGATTCAGACACTAGTGGACAGGTACTGT TGCTGCAAATACTTAAGTACAAGTGCATTTCGTTCTTCAGCATGAATATC TCGACCTTATCCTTTAGTTAATTGGGGGTAGCTATTACTTTCATGTGTCC TTGTAAATATGCCCAGCAACAAAAAGAATCATATAATGATACATATTCCT TTGCTCTAATGTGTCGATTGATAGGTCAAATATGTCGTGGAACTTGCTAA AGCATTGAGTTCATGCCCTGGAGTATACCGTGTTGATCTGTTGACAAGGC AAATATTAGCACCGAATTATGATCGTGGATATGGTGAACCATCAGAGACA CTGTTACCAACAAGCTTCAAGAATTTTAAACATGAAAGAGGAGAGAACAG TGGTGCATATATCATCAGAATACCATTTGGACCAAAAGACAAGTATCTAG CTAAAGAACATCTCTGGCCTTATGTTCAAGAATTTGTTGATGGTGCACTC AGTCATATAGTGCACATGTCAAAAACCATAGGTGAAGAAATCGGCTGTGG GCATCCCATGTGGCCTTCTGTGATTCATGGCCATTATGCCAGTGCAGGAG TTGCTGCTGCTCTACTATCTGGAGCACTTAATGTTCACATGGTATTTACA GGCCATTTTCTTGGGAGAGATAAGTTAGAAGGGCTTCTCAAGCAAGGGAA ACAGACAAGGGAAGAAATAAATATGACATACAAAATAATGCGCCGAATTG AGGCAGAGGAGTTGTCTCTTGATGCGTCTGAAATAGTTATTGCAAGTACT AGGCAAGAGATAGAAGAACAATGGAACTTGTATGATGGTTTTGAGGTCAT GCTGGCAAGGAAACTTCGTGCAAGAGTCAAGCGTGGTGCAAACTGCTATG GCCGTTACATGCCTCGTATGGTTGTGAGTATACTGTATACACTGTGTCTC CCATTGTTATTTTTGTTACCATAATAATCACCTGTAGAATTATTGTTCAA GGAATTGTGGTGGATTTTTTCATAGTTTGTTAGTTATCAACTGAGCATCA TCCGTCATTGCTGCAGTATTCCAATATCCACTAACTTTGTATTTGTTGCT CTGCAGATAATTCCTCCCGGTGTTGAATTTGGCCATATGATTCAGGATTT TGATATGAATGGTGAGGAAGATAGCCCATCCCCAGCCTCTGAAGATCCAC CTATTTGGTCTGAGGTGGCAAAATGTTCTTTAGATTTGTGTACTTAATAT TTCACTAACTACATAAACTTTTGATTAACTTACTACTTCAGTTATTATTT TATGTTTATCCTGCATTTTTAAGTCTACGCCCTCATAATTTGCATATGAT GACAGATAATGCGGTTTTTTACAAATCCTAGGAAACCATTGATTCTGGCT GTTGCTCGTCCTTACCCAGAAAAGAATATTACAACACTTGTGAAGGCTTT TGGTGAATGCCGACCATTGAGGGAGCTTGCTAACCTAGTAAGATGTGTGA ATGCATCGAGTACAGTAGCTGCTAATTAGTATGATTTTATTACACTTAAT TTCATACTAACTTTTGATCTTGCATTCCAGACACTGATTATGGGTAACCG TGAGGCTATTTCCAAAATGAGTAATATGAGTGCAGCTGTTTTGACATCAG TACTTACACTGATTGATGAATATGATCTGTATGGTCAAGTGGCATACCCA AAGCATCACAAACACTCGGAAGTTCTTGATATTTATCGTTTAGCAGCGAG AACAAAGGTACGTTGTTTCTGAACATAGGAAACAGTTGGTGCAATTCTAT TTTTTCGAGAACATAACAGCTGGTGCCATCCTTTCCCTTGTTTTAGATAC CTAGCTCCTGAAGTGTTTATATGTTTACTTCTTCATCTATTTTGATCTAT TTCTGGTTGGTAAAAGCGCACTATTTAAGTAAATTAAATTGTTCAAATGG CTGAAGGTATTAATACCAGAAATCATGGGAAGTTAAATGTTTACAGCATC GATTTTATTATATTAGGTAGATTTGACAAATTCTACTTTAGTACCCACAT TCTGTACTATTTGTGTTGATACCGATTGTCCATTTAACATATGCAGGGTG CTTTTGTAAATGTAGCCTACTTTGAACAATTCGGTGTCACCTTGATAGAG GTAATAATCATTGAAATTTAAATTCACTTTTGTGGTTGCTACCATTTCTG CATTCTAATTACCTCCAATATGTTATTCGTGGGAGCAGGCTGCCATGCAT GGTTTACCTGTAATTGCAACAAAAAATGGAGCTCCTGTTGAAATTCACCA GGTTCGTGCATCAACATTAACTTGGTTTTACAAGGAAAATCATATCAACT CATGGCTGGTATGAATATTCCCTGGCTCATTTCCAATGAATGCTGATGCA GGTGCTGAATAACGGTCTTCTTGTTGATCCCCATGATCAGAATGCAATTG CTGATGCACTCTATAAACTTCTTTCTGAAAAACAACTTTGGTCAAGATGT CGAGAGAATGGGCTGAAAAATATACACCAGTTTTCTTGGCCTGAACATTG CAAGAATTACTTGTCAAGGATATTAACTCTTAGCCCAAGATATCCTGCTT TTGCGAGCAATGAAGACCAGATTGAGGCTCCTATCAGGGGAAGAAAGTAT ATTGTTGTTATTGCTGTAGACTCTGCCAGTAAGAAAGATCTGGCCTGTAT AATCAGAAATTCTATCGAGGCTACACGGACAGAAACTTCGTCAGGTTCAA CGGGTTTTGTGTTGTCGACATCCCTGACAATATCAGAGATTCATTCTCTA TTAATATCCGCAGGGATGGTTCCCACTGATTTTGATGCTTTCATATGCAA TAGTGGGAGTGATTTATTTTACCCTTCACGGACTGGTGATTCACCAAGAA CTTCCCGTGTCACATTTGCATTAGACCGTAATTACCAGTCTCACATTGAG TATCATTGGGGAGGAGAAGGTTTAAGAAAGTATCTAGTGAAGTGGGCTTC TTCAGTAGTAGAAAGGAGAGGCAGAATGGAAAAGCAAGTTATTTTTGAAG ATTCAGAACACTCATCGACATGTTGCCTTGCATTTAGAGTGGTGAATCCA AATTATGTATGCCCTTTCTTTCAAATATCTTCTGGCATTTCGTGGAATTT TGCTTGCGTATCCATTGCTTGGACTCTTCAAGTGCATTTTGTTTTATGCT ACTCCTTTATGCAAAGGTTTTCTAATTATCGCTTGGCATGTCGTTTTGCA GTTACCTCCTTTAAAGGAGCTTCAGAAGTTGATGAGAGTCCAGTCACTAC GCTGTCACGCTCTTTATAACCATAGTGCTACCAGGCTATCTGTAATTCCA ATTCATGCATCGCGGTCTCAGGCTATAAGGTTTTTCTCGATTTTCTTGCT TCATGCATTTACCATTTCCAAAACTTCATCTGTACACTAACTGCAGCATT GTTGTGTGTGAAGCAGTTTTTACAAATCTTAACTCAAAATGTGGATGTGG TTTTAACTTCAATTTCTTGTCATCAAATAATTTTCCATAGAATATTAGAC GTATCGGTTTAGGAAAATGTTTTACTCCATTCCTTTGGGAATTCCAGCTA GAGCAGGATCCCTGCTAGAGCAGTGCCATAAATTCCTAAATGATATGTAA CTTCAAAGTAAGGAAATCTAGTGCCATAGAGTATTGTTAAGATTTGAGTT AGATTATCCTTGGCCTGCTTTTTTTAAGAATATGGAATGGCCAATGGATG CTGCTTGGGCCAAAATTTTGCTGCCTCCTAAAAAGATCAGCAACAAACAG TAGATAGCAACTGTTTTTTTAGTGCTCAAGGGCTTAGCGAATTGCCTTTT GCAATTCCATATGCACCTAGTGATCTACATGCTTGCGGTCCTATTAAGGA GTTGTTTGATTCATAGGAACTAATCCTATATAGGAATTAATCCTGTAGGA GCTCGGTAGTGCAATTTTGCAGGAAATATTGCATGAAGTCCGACCTCAGG GAAAAAAAATTCTTCATTGCAATCCTGTGTCCATAGGATTCACTTGGGCT GGGCACTCTAATCCTATCTATTTCCTTTTCCTTTGGTTTTCCTACCCTAT GAATCGAAGGAGGCCTAACATTTATTTCTGTTCTTGTAGGTACTTATCTG TTCGTTGGGGCATTGAGTTGCCAAATGTTGCGATTCTTGTCGGCGAAACC GGTGACTCAGACTATGAAGAACTGTTTGGTGGTCTTCACAAGACGGTCGT CCTGAAGGGCGAATTCAATACCCCCGCGAACAGAATCCACACGGTCAGGC GGTACCCTTTACAAGATGTTATCGCGCTTGACTGCTCCAACATCGTCGGA GTCGAGGGCTGCAGCACTGATTGCATGAGGTCTACTCTGGAAAATCTTGG TATACCGACAAAATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.