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GrainGenes Sequence Report: AA020217

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Sequence
AA020217
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020217
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAAAAAGATAGTCACTCACAAGCACAAGTCACACCAGTCCTCTCGCCGC
ACCGCCGCTTCCCACCGCCCGCCGCTGCTCATCCTCCCCACACCCCGGCC
CCTCGCCACGCTGCGCTGCCGCTTGCTTCGCCGTCGCCTTGAGTCTCCAC
TCTCGGCGACTTCCACCCAAATCCCCTCACATATTCCCCGAACCAAACCC
TCGGCCGCCGCTACGATGCTGCTCCGCTCCGGGCGGCGCCTCCCGACCCT
GGAAGAAGCAGCACGGGAGACCGTGCCGAGAAGGAGACGCAGGGCGCGGT
CGGATCTGTTCGCTGGCTTGCCGGAAGAGATCCTGCTCGACATCCTGGTC
CGCCTCCCGGCCAAGTCCGTGCTCCGCTGCCGCGCCGTCTGCCAGCTGTG
GCGCCGCCTCGCCTCCGACCCCGCGTTCCTCCTCGACCACCACCGCCGCC
AGCCGGTGCTCCCCCTAGTCAAGTCCCGCGATGACAGCCCCAACCCCCGC
CTCGAAATCTTCGACCTCAGGGCCGCCGAGCTCCGGCCATTCTTCGGGTT
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CGTGTGGTCAATCTTGTTGGCCTCTTCCGGCACCAACCTTCAGGGGAGTA
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GGCAAGTTGGTGGCCAACTTCAAGTGTGATGATGAACTACCGGCGGTTCT
TCCTCATAGGCTGAAAGAGAGTCTTATCCAGCATACATTTTTCAAGAAGA
AGGCAAACTGATTTGGATCGACTCTTCGCAAGTTCTCATTTTCTGCCATG
TTAATGTTAGTAAGTTCTGTTTGCTCACTTCTGAATTCTAATTATATCTG
AGAGTTTAACTAGATATGATACATTCAGTAAGCTATACCATTATATACAT
ATTCTTTTCATGTAGATCTGTTTATAACATAGCATTCTTAATGGGAACAA
TGTCGGGTTCTCCCTACGAGACTAGTCAGTTCTCATCAGCAAGCAGATAA
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CTGGTCAGTAGTTCAGTACAAGGAGAACAGCACGTGAAGTTGTACCATGT
TTTCTGAAACCAACCCCGCAATCTACTCATAGCAAGCTCATAGTTGCTTT
ATGTTTTTGTTTCTCTCTATTCTTTAGCTTAGTAACTAAGTCCATTGTTA
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GTCCCTGCCGGCTGACCCTGCAGGTACCGTCATGGCATTGTCATCGGGCT
TGGGTCAGATATTGAAGGGCCCCTTTATTAGGCCCAAGGACCACATGGGT
TCACACTTGGGTTAGGGCCTTTCAGTCTTGGACAATTGGTATGACGGTGC
CTTAACGTTTTTTACCCAGGAAATGTTGGCACTGGATAAGAGATACTTCT
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CATGTCAGCAACAAAACTATTTCATATTTTGTGTAATTTGTTGCAGATTT
GGCACCAAATTATTTTTCTTCAGATGGATGACATACATTTGTTCCTGACT
AGAGATACATTTTTTTCAGAACCAAACAACTATACCTTTTTTCTTTTGCG
CATTCAGAATTTCTGTTAGTTTTATTTGTATACATTTTCTGGTGTTCGAA
ATTGACCTTGTGTTGTATGCTAAATAGTAGATGAAGCCCTTGCTGAACTG
TTGCTGATCTATTCTTGTGGGGAACACTTAGATAACAGGGTGCACTATTA
TAACTAGGTTGCCTCATTTGTTTTTAGATACTTTATTGATAATTGAATAC
ATTATGGGTTAGTGTTGTTGGGAACAAAATATATTGATTTCTACAATTGG
TAATGTAGCCTGAGTGAATTTTTTCTTCCACTGTATGCATATATCGGTTA
AGCATACCCCTGCGTAGATTTATGATTCCATGGATAGAAATTCAACGTTA
AGTGCCAATTCATTGATCTGTTTAACGTATTGTCTCTTACTCTGGCTCTG
TCTGCTCCTTTCAGGTAATGGCAGAGCACTAAAATCGTTGCCTGGCGTTT
AGGAGTTCTCTGCAAGAGTGGGAAGATCAATCTCTGTGTTCACCTATAAT
GGTTATCAATTATGGGAAAAGTTTAGGCACTGCCATGTGACATTCCTGTT
ATGTTATTAACCTGTTATATGTTGTATCAACTTATGTTATTAGTTTCATG
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AGTTGGGGTGATTTAGAGAGGGTATAAAAAGTGAGTTCTGGTAGAACAGA
AGGGAGAGATGAGATGGTTCTCTTCTGTCATGTTGGGTTCTCTCAGATGA
ACATGCTTCTTTATATTTCCTTTGGTCCAGTGGTCCAGCCCTTCTGGGAG
TTGATGTTTTAAGATTGGTTACTGTAAAATTCTGAATACAAGCTAGGTTG
AGTAGTGAATGCATGCCTGCTGGTTCAAGAGAGGCTGAGCTGATATTAGA
TGTATACACATATCAAGAAGTTGGCTCATATAAGAGAAATTGGTGATGTT
TTGTTATCTTGACGGAATGGATTACATCTGATCCAGTACATTCTGAAAGA
TCGCATTGTTCCAATTTACACTAAAAGTACAGCACTGATTACGCTAATTG
TGCTTATGCATGACGCGACGGTATCTTTGTTTTTTTTCAGATTGAAACAA
GACTGAGTGTCTGAATGTCGCAAGAGAAACAGACTGCTATCAATCTACGA
ATGATGTAAATCCACAGTCCAACCTGTAAGTATCTTCTAGTACTCATTGG
ATGGCTGACAAAAAAAAAGTCTTGGTTTTACAAATTATTTTTGTTCAAGT
TTTGTCTGATCGTTCTTCACTAGTACTACCTCCGTTTGGGATTATAAGTC
CCGCACGGATAACTAGGTTGCCAATTTGAACAACAAAATATACATATTAT
AGCATAAAAATTATACCACTAGATACCTTAGAGGTTATATTTTCTAATGG
TATAATTTTTATGATATATAAGTTATATTATGTTGGTCAAATTAACAATC
TAGGTATGCGTGTAGGACCTATAATCCTGAACAGAGGGAGTAAGTTGGAG
TAAAGGTCGCCATAAAGGTTGAGTTTGAATTTTGACAGTCGTAGGCAATT
CCTCACTTACTCCAGCATGTGCATGCGGCCATGCACCGTGCTTGCAGTGA
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GCTTCCACCGAGCCCTTTATCTCCCCAAGAAACGCACACCCTACGGATAT
TAGTATACCCCTGTTCACTAGATCGTAGGGGACCTCTGTTCACTTGCTCT
CCCACTGCACCTGTGGAATCTGAAAGGAGGCGAGTCCTCTTGATCTTGCT
CGATCCTTTTCACGATAGGCAGATAGTGATGCACTGTTCTCGTTGTTAAT
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AATTGTGCTGGACGACCTGCCAGAGTCGATACTCGTTGAAGAGATACTTG
TGCGGTTGTCGTCCAAGGATGTCCTCCGCTGCCGTGCTGTCCAGAAGTCG
TGGCGTTGTGCCACCTCCACAGACGATTTCATGCTCGCGCACCACCGCCG
TCAGCCTTCTCTCCCTATCATCAACATCTCTCCACAGGTTCCAGAGTGTG
GGTGCACCCAATGCTACCACAAAGAGAACGGCGCAATCAATGACAGGTAT
GTCGTGTTTAGTGTTGCTGGTCACAAGCTCTGGCCCATCCTCCGAGCCGA
CCCCATACCTAATGTCCACGGCGCCTGTCATGGCTTCCTAGTCATCTCCA
ACACCGACGGCAATGAGCAAGCCTTCTATGTGTGCAACCCAATCACTCGC
CAGTGCGCTCCTCTGCCTCAGCTTCCGCGGAACGGTCTTGGCAACTTCGT
AGCGGGCTTCTACCAGCACCACCCATCTGAAGAATACCGGCTGTTGTATC
GGATCTTTTCTGGACAACGGTTTCTTTACTACATCCTCACGGTGGGATTC
TCTGAGCCAAGATGCATCTATGAAGGAAATATGCCGGCCCCTTCTCGAAA
ACAACGGAGGAAATTTGCTTCACACATCTTCAGCTTCGTTACGGTCTGTT
TGTTTACCAGGCTTTACTTCTGGGCTTTCCATCTTCATCCTGCGGTGCAC
CGGTTCGTCACCGTGGCAGCCTGCACTGGGAGGTGGGGAGGCACTATAAG
GCCATCAGGGACATAATGGTGTTCGACACGGTGGCTGAGACGTTTCGGTG
GATGCACCGTCCAGCCTCGTTGGGCCTTTCAGCATGGTTGCTAGAGATGG
ACGGTGCCCTTGCTTTGTCCAGCACCGTCGAATGTCATCCTTTTAGATTT
TTCAGTGATGCAGGACTATGAGGCCGAGGTATGGACCTTCAAGTTCCAGA
TTAACTTGTCAGTGGTGGCAGCACCGCTGCAGCTTGACCCCAAGCTGCTG
CTGGAGCCTGGTTCATCGGTTGAATATAACTATCGCAGGGTGGTTCTGGT
CAACGATCATAAACTGTTGATCCAGCTTCCCGGGTGTCTGTTGTTGCATT
GTGACGTTGATGGAAGATTCATTGGAAGTGTGGAACTCAAAGATGCTGAA
TACTTGGGGATTACTTCCGGTTTCGTGGGATGTCTCAGAAATGATGAACT
GTGGCTTACCCCCCATTTGCTCCAAGAGAGTATTTTCCCCCTTCCATCCT
TCGAGATTCGACAAGAAGATGAGCCAAATCCGTTTATCATAGCCTGCTAG
GGCTGTTATTCCCACGGGGCTCATGTGCTGTTTTCTATGTTTTTGGTGAT
GTTTGTACTGAACAATTTTCATGTTTGCAGTACCATTTCTCTTTTTATCA
TCATGTGGTGCTTATTAACTACTTTTATGTTCTAGAGTATGAACTATGGA
TAATTCATCTATGTATACAGGTAACTTCAAAATGGTAATGCTGCATGTTC
ACCTTATCACTAAGCTCGGCAATAGCATAAACTTGTGAAGCAATTAGCAA
GATGTAGTTTTTTGTATTTATGAATACAGGGCAATTTACTATTGAGGATG
GTAGTATGATTATTGTTCTAACATCAGGTAACAGACTGAAACAGTGATTA
ACAGAAGTTTAGTGATGTGAACAAAGAAAGTGCTTAGGGAGAAGGAGAAC
AATGAATAAGCATTATAATTATTACTATCTTGTAGTCCTTTAGATGGTTT
TTATCAAACAAATCTCTTAATTTTGGGGAAAAAGAAAACCTTCAGAAGTA
AACTATGCATTCCAAAGTTTTTTTTTTTTTTGGAAATGAGTTGATTTGTA
GTCCACAACAAATGCTAGAAATCAACATGCAACTAAAAGGAAGTAGACCA
ACAAGAGAAACCGGTTTTTTATTTGTGAAAACCATTGCTGAGAGTCATGA
AAAGCGTATGTTTTTTAAGAAACTATACTACAAATATGTTTTAAATTTAA
TATTTAGTTCAAAAGAAAATATGCAATGACAATCCTTCTAAATTAAACCA
GTGCAGAACGTTTTAAGGAAATTTAAAAATCAAGAATATTCCGATAATTT
TAGTGAAAAATGAGTACTTCAGAAAAAAAAAGAACATCAAAAGGCTGACA
ATATTTTTCTTTTTGAAGATTGGTGATATTCTCATGGGCCTGGGCCTTGC
CTGGTGACCTGGTCACCACTCACCACCCCGCCGCAGCTTGCTTCGCCGCC
GTCGACCCAAACCCCGCAAACATTCCCCAAACCAAACCCTCGCCGCCGCG
ATGCTGCTCCGCTCCGGGCGGCGCCTCTCAACCCTGGAAGAAGCAGCACG
GGCGACCGTGCCAGGAAGAAGACGCAGGGCACGGCCGGATCTATTCGCCG
GCTTGCCGGAAGAGATCCTGCTTGACATCCTGGCCCGCCTCCCGGCCAAG
TCCGTGCTCCGCTGCCGCGCCGTCTGCCGGCTATGGCGCCGCCTCGCCTC
GGATCCCGCGTTCCTCCTCGACCACCACCGCCGCCAGCCAGCCGGTGCTC
CCCCTAATTGAGTCTAGCGGAAAATCTACCCGCAGCCACCGCATAAATGC
CGTCCACCTCCGGTCCGCGAAGCTCGGCCCCTTTTTACAGTTCCCAGACA
GCGGCTTCTTCAATGTCGAATCATCTTGCGATGGCCTGCTGATCGACAAG
TACGGCATCTACAACCCGGCCACACGGCAGTGGGCTGCCCTCCACCAGAG
CGGGAGGCGTATCAGCAATCTCGTCAGCCTGTTCCGGCACCAGCCATCAG
GAGAGTACCGTGTCCTGTATTGGGGAAACTCAGACGGCCCTCCTTCCGCC
GTGTACTGTCTGAACGAGTACCGCGTCCTCACCGTGGGAACCAGCAAGCC
GAGGCGCGTCGACTGCTCCTTGACACCGGTGGAAATGGAGGTGATAAGCG
GGATGGGACCACGCATCTTTGGCGCGCCAGTCTCGCTCAACGGCGACCTG
TACGTGCACTGGAGGAAACGGTCGGGTGACCCTACCACAAGATACTGCTG
TTCGATACAGTGGCCGAGTCGTTCCGGCACATGCGCCCGCCGGCCGTGAA
CCCCCGCCATGTCATGCACTTGTTTGACATGGGCGGCACGCTCGCTGCGT
CCACCAGCAAGGATGGCATGACAGGGTTGAGCATCTTCACGCTTCTGGAT
CGCGAGCAAGACATCTGGGCTTTCCAGTACCGGATAACACTGCCAGCCAT
GGATATCAGGCGTTTCCAGGAGCAAGGGGATTGGTGGGCGAAGGTCGTGT
CCGATGAGGGAGACGTGCTCGTCTCCTGCTATGGACAGCTGTTGCAGTGT
GACAAAAGGGGCAATCTGGTAGCCAACTTCAAGTATGATGATGACCTACC
GGTGGTACTTCCTCATAGGCTGAAAGAGAGTCTTGTCCAGCACACGTTTT
TCAACAAGACACAGAACTGATTCGCGTCGACTCTTGAGCTCTGATTTCGT
ACCAAGTACGTTCTGTTTGCTTACTTCTAAATTCCTATGTTTCTGAAACC
AACTCCACAGACTACTACATGTTTTTGTTCCTCTCTGCTCTTCAGCTTAA
GAACTAAAGAAAGCCATTACTGTCATTTGGAATTAAGCAAGAAACTTATC
AATGTTCCCCAATGTGTGTCGTGTCCCTGCCAGCTGACCCTGTGGTGCGA
GTGCTGTTACTGCATTGTCTTGGGGTTGGGTCAGGCATCCAAGGGCACCT
CGATTAGTCCCAAGGACCACATGGATTGATTTTCGTACAAGTGTACATAA
TGTGGAAGAACATAGATTTGTTTCTCATGGTGCTAAAATAGTATGTTCTA
TGTTGTACTATTGTGCTATTAAAACTGATCCATTTGAAACTGCACTTCAT
TTGGTGAAGAAAAACAATGAATTCGTATTGCAAACACAACTTCTATCCTC
TCTATCCCTAATATTCCATGATTGACGTCAGGAGGAAATCTGATGTACAT
AGTGTATAATTTGTTTCAGATTTCAGACCAAATTCTTTTCCTTCTGATGG
AAGACATGCATTTTTTTTTCTTACTAGAGATATGTCTCCATTTTTTCAGA
AGCAACAACTATACCTTTTTTTCTTTGTGTATTCAGAATTTCTATTATGT
GCATACATTTAATGCTGTTTGAAGATAACTTTTATGTTAAATAATAGTAG
ATGAAGCTCTCATGGAATTTTGTGTGAAACACTTAAGTAACAGGGTGCAC
TATTATAACTAGGTTACCTCATTTGTTTCAGCTGTTATGCACAAAATATA
TTTTTTTCTATTTTTTTTACAATTGGTACTGCAGTCTCAGTGAAAATTTC
TTCCACTGTATGTGTAGCTCAGTTTAAGCTTATCCTGCACAGATAAGGTC
CAATGGATATAAATTTGACATTAAATTTCAGTTCATTTATTAATCTGGTT
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GAGATACTTCAGTTGTTACCAGGTGTTTAGGAGTTCTCTGCTGCAGTGGG
AAGATCAATCTTTAGGTTCACATATTGTGTTTATCAACTTCTGCGAAAGC
TTAGGCAGTTAGGCACTGCCGTGTGGCATTCCTGTTTCTTTACCCATTGT
GTTCTATATCAACTTATGTTACTGGTTTCATGAGACAACAGTGTTGGCCA
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TTGCAAGGGAGCATTACTACGCCCCTGTTCTTTAGATACATTAAGTTGGT
GCGAATAAGGAGTATCCAGCCATCGGATGCCCTTCTCTTTCGCTTTTGGT
GCTGGTAATTAACTGAAACTTCTTGAATGTTTGCAGTAGTATTTGTCCTG
TATCATCTTCCGTGTCTAAAGCCTCAAGTACGGAGAACCGATCTGTATAC
ATACAATGTCCTTTCCCCTATTGGTTTGCTTCAATTCCTTTTCATGGACC
TGATTTGGAGAGGACAGACGACCAAGAAAATGCAACGGTAAATCAAAAGT
GTTAATGCTGCATGTTTCACCTTTATACCAAGCACAGCGACAACATCAAC
TTAGTACGAAGCAGTCAGCAACATGTCTTGCTTTCTATTTATTATGACTC
CACTACTTTTTACTATTTGAGATGAGCTGATTTGTAGTCTACATTAAAAA
CAGAAGAAATCGACATGCATATCCCATTTTCCTCTCTTAATATCTCTTCT
GTAGGTTCAGGAAATGGTTCCTATGTTTCTCTCTGTAATTTGTTTTTTGT
TTGAGAATTCACGTGTTACTCTTGAGTCAGAGTAGTGAATTTTATTTGTT
GGATTGTTGGATTTTTTTTGAGAGTAGAGAGTAGTGATTGTAGTCTACAC
AAAGGAACCACCTTTTCCAACTATGATTGTTTGCCTACAACTAGTTAAGG
GCCAGTAAGGCGCTTTTCTAGTCCTCTCAGATGAACATGCTTCTTTTATA
TATTTTCACTGGTCCAGCTCCTCTTCCCTCGATGGGCCACCACCAGCAAC
AGTCCACACCCAGCAGAACCATTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.