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GrainGenes Sequence Report: AA020015

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Sequence
AA020015
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020015
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTACCATCTCAGTATCTCACCGCCCCGTTTCCCCCGCCACTACCCTCCTC
CTCCTTGCCTCGACTCGCTTCTGTTCCCGCCGCCTCTCGCCGCCAGTGAT
CTCTTCGCCCTCTCTTTCTCGAAGCAGCGAGCACGTACTCCATATGCCAC
CTCGTCCCTCGAACCTCCCCTAGATCTGGATCGAGAACCACGCCCAATGC
CAATCGCATTTGCGGTTCCATCGCCGGAGCGTCCCAACTTCGTAGCCTCA
CGCCAACAGAGATAACTAGCCCTCAATCTGAAATCTACCCCGCTGCACCG
CGCAGTTCGTCGATCCCTCTGCAATGGGGAGCAGAGGGGCCGGGGGCGGC
GCCGACGAGGAGCCCCCGAAGCCGTCGCAGCAGAGGTACCGCCCCGTGGA
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CCACTGCGCCCAGGTGATTGGATGATGCCCCGTTTCGCGTACGTTCTGTC
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ATGGTCTTCGACGCCGTCCGTCTCCCCCTTCCGGTGATCCTCGAGCAAGT
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TGCAGTGCATGTCATCTAGTTTTATTGGTAGTATGATTTAACGCTAAGTT
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TATTTTGGTTCATGTACTCAGGTATTACAGACCTGATGTTATGAATATTC
ATGTAATGTGTTGTTTGGTTAAAATAATAATTCGTATTTTAATGCATTTA
GTTTCCATTTGAAGTTGTTTGGGTGAAAATTTCTGCTCATAGCTACTAGT
TTCTTGCCATCTGAATTATCTGGTTATGAATTCTTTTTTTGGTTTACTGA
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GTTTTGACTCATTGGTTAATATTTTGGGGCTTAAAAGGTATCATCAGTTG
GATCACTTGTTGCATGGATTTTCTTCATTTTAATCAGCGCTTCAGGTTTT
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TCTATAAGCCTATGCATTCAATTTTTGCGGTGCTCATAGCTGCAGCCATG
TCATAGGTCTGATTGAATCTGAACAGTATGGCAGGAGAACCAGCTCAGGT
ACCTGCTAGTCCTACGGATAGCGAGGATGTTGGTATTACAATCGGACGCC
CGAAGGTTTGTTTCCCTATCCAATTATTCACAATTTCAAGCTTGCTAGTT
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GGTCTCCTCTGACTGGTCCACAGCGGGCACCTCGGAGGGTGTTGACACCC
TTGTGTGGAGAGCCTCTCGCCCAACCATCATCTATCTTAACAAGCAAGCA
GGATGAATAACTACACCCGTGGGAACTGCCAAGAACACCAGTTGAGCCTC
TAGGATCTTGACACAATTTTCCCCTGGAAGAGTATTATAGCAAGATTTAG
AGGACTACTGGGCGTCAGTTGTCTAGCAGTTGTCTGGCACCAGATCAGCG
CATCTGGCTCCACCGTGAGCTGCACGACGTTGATTCAGATCCATTACTGG
ACTTACTGCCATACGGTCAGCAGGCTCAGTACTCCCCTAATGTGAGACAT
CCACCGCCAACTCTTCTCTCACCGTACGGCGTTCCCTGGGCGCCTCGGAA
AGAGCGTCAAGAGTTCTGGCATCTTCCCCCATATGGCTGACCCGCCTTCA
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AAGGGTTGGAATGCCTAGCTCGGTAGACTCATAGTTGCAAGGGTGATCCC
AAGGTACTTGACGGGGAAGGGTGCCAACAGGCACTCCATAACCGCCGCCA
CCCGTAGGGCCAACTTCTCCGAGCAGGCGATAGGGGATACCAAGCAAGGC
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TATTTAATTTTTTATATGTTTGTAAAGCATTATTTTTGCTTGGTAGTTTT
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ACATCTTGGGGATAATCTATTATATTCGTTTTACATGGTATGCACACCTT
TTTATTCTGTGCGTTCTGCAACTTTCTAGTTAGTCTCTGCAACATAGAAA
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CTTTGTGGCAAACATCCTTCATGTAACATTTGCAATGTACTTATTTACTG
TACGATGTTTTGTTCCATAATATAACGTACTTTAGACACATGAGTGCAAA
TCTGATCACCATTGTGGGAATCATTGCCTCAGAGAATTACCCCATTTGAG
GACCTTGATAATACTTTATAATCTTTTATATTACTGTATGAAAGAATTGG
CATTCTGAAGTTCATGGCACTCGCTGTACTGTTACAACTAAACACGAATT
GAATGTAGATTATTGCAGATTGATATTCATATTATTCTGTGTATATCTAA
GACGACTTTGAATTCAATGGGTGAATGGTTATTTTTGGAGATCCCCTCTT
TAATACGAGGGATGTCCTTGTTGATGGGGTGCTCACCTCACAGTAGGTGA
TAAATCATAAATGTGATGATATGACACTTCCTCTGACTGTTTCTCACTCA
ACTTGAGATAAAATATAGGATTAACCATATGTTCGAATGTTACACGCAAA
AACCTTTTGTTTCTCTGTCTTGTAGGATCGTCGGTATGGGAGGCGTATGG
CAGTCCCTTGTTTTATGTGCTTTATGTGGCACATGCACATTTTTAACTGG
AATATCATTAAGCGCGATTGCGACAAACGGGGCAATGAAGGTATGTTAAA
TATTGTAGGAGGTGACATATCCTTGAGTATGGTTCTATTTTGTCATCTAC
TAATGAATGCCTTTGTTTTCTTCTTGTTGTTTATCGAACACGATAGAGAG
GTCGTTGGAGTCTGAGTTAGTATAATAGCAGTATTCTAATAGTCTAGAGT
ATTATAGAAGTGTTAGTATAGTAGTAGTGTCTACTAGAGTCTAGATTATT
CTACTGTATGAGTGAAGATGTAAACCTAAGTTGAGTTATATCTTTAAGAG
GGTGTGGAGGTCCAAGGAACCATCCCATCCAGAAATTTCACACAAAACAT
GGTATCAGAGCACAAGGTGGAGGTGTTGTTGGTTCCTGGAGGTGGCTGAT
GGTGAATCGGCGAGCAGCGGAGCTTTGGTCGTCCGGGGGTGCGAGTGTTG
GCAGAGATCAGCCGTAGCAGAAGATTCACTAGTGGCTTCTGGAGCTCGCG
TGTCTAGAGGTGCCTTGTAGGAGACACGGCAGTGGGGCATGGGTGAGCTG
TAGGTGGGGCTCAGTGGTGGCTCTAGGAAGCAGAAAAAGCTAGACAGATG
GCACGCAGTCCGCATGCAGAGACGAGAACTAGTGGCGCTGTAGCAGGTTG
GAAAAAGCAGCAGCTAGGTGAAGAGGACCTCACAGAATTGAAGCCAGCAA
CGGCTCAGTGGCTTGGCGCAGAGTGAACCCGGCCCTTGTACGTGGTTGAT
TTAGTGTTGCTGGGAGAGGTTCCAGTCAAGGAGGAGGGAGCTGCTGTTGT
CTTGCAGCAGGGAAGAGAGGAGAAAGGATCCCAGGAGGGAGCAGCCATAG
ATATTTTAGTAGCGATTTGCAGGGGAGTAGTAGATTGGAGGCTCATGCAG
CAGTCCAGAAGGTGAGCTGGTGGCAAGTGCAGCGTGGGCGGAGGTGAATC
AGTAGCCAACGGCACAAGTCTGTGACCTGTAGCCTGTAGGTGGAAGAAGC
GGCAAAAGGTAGACGTGTGCTGCCTGAATCGGTAGCGTCGGTGGCTCCAA
GAGCGGCAAGCAGTTGAGAGAGCTGGTGTCGGGTTGTCTCTGCTAAGGAG
AAGCAGAGTTCGTGCAGCAAGACACGTGAGAAAGGGAGAACAAAAGGGCA
TAGAAGTGCTGCAAGAATGGGAGAGAATTGAGATATTGAGCAATTGCTCA
ACAAATAGGATGAACTGTTCAAGGCAAAAAACAAGGACGCATTGATTTTG
ATAGTGAAGGGATCAAGGGAGGTGCTTGAATTCTCAACCAAACACTTGGA
GAAATTGAGAAATCAAATAGGAGTGCAGAAAGAGCCAATCAGTGTGAAAA
CAACTATTGTTGGAAAATTTGTCAATCCCACAAATCAGGCTCCTAACTTA
AACAAAATTTCTCGTTTAAATTGGATACTAGATTTGGGAGCATCGACACA
CGTCACGGGTAGGTGGAGTATGTTTGCATCATATGCTCAATCCATACAAA
CTTATCAACTTGTCAAATGTTTCAGCATGGTGAAATGCATTCTGTCAATT
ACATTGTCTTCTGTCTTATATGCTCCATCATTTCCGGTGAGTTTGGTGCC
TATGAGCTTCTTGGTTGATTATAGTGATTGCTGTATAATCTCCGATCAAT
ACAATTGTATAATTAAGGAGTGGGAGTGGAAGGAGGCATGTGGTCGGTGT
CAGGCATAAGGGACTATGGTACTTCAATAGACATGAAACAATTGATGCAT
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CTCCAACATTGTTGATTGGGCCATATGTCCTTTGATACTATGAGTAAGAT
ATTTCCCTAAGTAATGAAGAACGTGGATAAATGCAAACTTGTGTTTGATG
ATTGTGAGTATGGATAACACGGAAGGACATCCTATGTGAGCCCTGGACTC
CGGAGCACATTCCACTTTGTGTTGATTCACTCCGATGTCTGGACATCTCA
GGTGGTCTTTATTAGTGGGATACAATATTTTATCACCTTCATTGATTGTT
ACACCCGAATGACTTGGATATATCTCATGAAAAAAGAGTGAGGTGCTTAA
TAGTTTCAGGGGCTTCTATGCGTATATCCAAAATTGTTTTAGTACTCCCT
CTGATCCAAATTAATTGACTTGGATTTGTCTAGATTCGGATGTATCTAGA
CATGTTCTAGTACTAGATAAGAGGGTGTTGGATTTGTTGGCATGTAACAA
GATGGCAATGATAGATATCTATCATCCATCTTGAGTGAGAGTGTTGGAGT
CCGAGTTAGTGTAATAGTAATACTTTGATAGAGTACAGAGTATTCTAGGG
AGTGTTAGTATAGTACTGGTGTCCTACTAGAGTCTAGATTATTCTAGTGT
TTGAGTTTATATGTAAGCCTAAGTTTTTTTTATAAGAGGGTGTGGAGGTC
CAAGGGACCAGCCCATCCATAAATTTCCCCCAGAACAACAGACGCAGACA
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GAGGTTGTGGAGGTCCAAGGGACCAGCCCATCCAGAAATTTCCCCCAGAA
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GTAATTTTATAACTGAACTTTCAAATTGAGGAGAATAGATTTATGTTTCA
TATCCTTTGAGGTCCATCTACTATTTGAAAATATGGCTTAAGCTTTCTGT
ATTTCTCAGTCAATTATTTTTAGATCAACAAGCTAGATTGCCCAGCCAAC
TATTTATAACAGTGTGTTGTTTGCATCTCATTTTCCTGAACTACATACCG
GAACACTATAGTACTCATGTAAGTTTCTTTTTATGCCAGGGTGGCGGGCC
ATACTATCTTATTGGCCGCGCGCTAGGTCCAGAAGTTGGAGTTAGTATTG
GACTGTGTTTCTTCCTTGGAAATGCAGTTGCTGGAGCTATGTAAGTCTGC
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TGGCCAAATATTTCACGAATTGTATTGGAGAATTGTTACTACATCTACTA
GGCCAGGAATGCTAGTTCTCTTCTTGTAACTTCAGTTATATACTTATATA
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TTTGGATCTTGGGCAATATTGCACTTTGGGATTGGAACTTTTTATGCTGG
TATGTAATCTCAAGAGAAAAACCGTTTTGCTAATGAAGAGAGCTCAAAGT
TCTATGTGGGACCAAAAGTAGAAATAACAGATAATATTAAAGAAAGGAAA
ATGCCATGTGTTGCTTGTGCAGTTTTGCTTATTGAGATTGCAGGTGTTGC
AATTGCAGCTTTCAATGCCTTATTTATTTCTCTGATGAGTGGTGTGCCTC
TCTCTCCCTCTGCATGACATGCATTATCAGTATGAGATTCTGCGCTATTA
ACACATGATTGCTATTTACAGGTATGTGCTGGGAGCTGTAGAAACCTTTT
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GCCTTAGACAGTGAAGTTGCTCTTTGTTTGTTTCTGAAGGTCCTTTATGC
AGGTCAACTGATTTGCACATTTTGGTTAGGAACACCAGACCTATAGTTTT
CTGCCCATCGCTGCAAATAGCGCATGCCACAATTTATGCTTAAAAATATA
TATTACTATGTGCTTAGATGTTCTTATAGAAGTAATGTATACCAAATTCA
AATACCCAATGCTTCTTTGATACGACAAAACTCTCTCACCTTCTTTTGAA
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TTAAAAACCAGAGAAGGTAACAGTGGTCGATAATACAGTAAGTGGGGGCA
GTGCAACTATATCAACGCCCAGCTTGCATGACCTCCAGATCTACGGTGTC
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GCATTTACATTGGTGTTTTAAATGCTCCAAGCCCCAACACTCCAAGTAAG
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TGCTGGGTTTTTCCCTATCTAGACGGAATCACTGGGTTGAGTATGACTAC
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TTCCAGATCCAAATGGCTCTATATATTGGGATTTTAAGTGCGTCTCTTTT
ACTGCTAATTATTTTACTTAACCGTCTTCCACTTTGTGATGTATAAATAA
TCCCAGATGTATATTTGCTTACTGTATATTTATTATTTACTGTGCACTTG
CTGACCGTTTTCTATTTATCTTCCAGCGCATTGTTAGGTCTCTTTTTCCC
AGCTGTTACAGGAATCATGGCTGGTTCTAACCGCTCTGCTTCACTTAAAG
ACACGCAACGCTCAATCCCATTTGGAACATTGTATGCTACGCTTTTAACT
ACTATGATGTATCTACTGTCCGTGCTTCTTTTCGGAGCCTTGGCTACAAG
AGAAGAGCTTCTAACTGACAGGTCTGAGCTTTCTTGGCATCATATCATCA
ACCTTCTGCTTTTTGGAATTTTTTTTTGAGCTGACTGCTTTTTGGATGTT
GACAATATGTTAGCTATGATGTGTCACCATCGGGCATTGCTAGAGCATCT
CCGATGTGAGATTTAGGAGAGAGGCTGATAGGTTGACAAGCTTAAGATTC
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GCATGAACTAGTACACAAGCACTAAGTATATGATGTAAGACATTCAGGAC
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TGGAACGACGACCCTTCCCATACATGTAACGACGCTCAAGGACACAGCAA
AATGAGCAAGCCTGAGGTAACTACATAAAGATAATCGTTTCAAAGAACTC
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TAGTACTTCACACATGTAAAATTACCTCCTGAAGGCTGAAGCACATCCAT
TGCGTGAACAAGTCATGAGTGTTTCTCTGCATATGGTGGATAGTGCCTGC
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TCTCCCTCTTCAAAGCACCACCCGCATTGAATATTCCCTGTGGTTTCAGC
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AATCACTCATATATAAGCACCTTGCATTTTCAATGCCCTTAGTTTGGGAA
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CTTTTGTCATGAAGACACCTGCATATAATGATGATATATACTCCCTCCGT
CTGGAAATAAGTGACTTGAATTTGTCTAGATTCGAATGTATTTAGACGCA
TTTTAGTGTATAGATACATGCGAATCTAGACAAATGCAAGTCACTTATTT
TCGGACGGAGTGAGTACATACAGTCAAATCCAACCACCCCCTTTTAACAT
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ACTACGGCTACTTCAAACCAATAAGAAAAATACGATGGTCTACACTTAAT
GAGCAAGTAATCAGATTTAACTTTTTGGTGCTGTGACACTGTAATTTTCT
ATTCAACATTTTGTAATGTTTGGCATCTTGCATTGCTATAAGTTGGTAAA
ACTGTTTTTCCTCATGTGGTTAGCTAATCAATTCCCTTAATGCAGGCTCC
TAACAGCTACAGTTGCTTGGCCTGCTCCAGCAGTAATTTACGTTGGTATT
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GTTACTTGTAGCGATAGCTAATGATGACATTCTTCCTGTTCTTAATTATT
TTAAAGCTTATGAAGGATCCGAGCCACATGTGGCAACTCTGTTTACTAGC
TTCATCTGTATTGCTTGTGTTGTGATTGGGAACTTGGATCTAATTACACC
CACTATCACTATGTTTTTCCTTTTGTGCTATGCTGGTGTAAACCTTTCCT
GCTTTCTGCTTGACCTTCTCGATGCTCCAAGTTGGCGTCCTCGATGGAAG
CTTCACCATTGGAGTCTTTCTCTCATCGGTGCATTGCTTTGCATTGGTAT
GCTTCCCCATTTTTATATTTCTATTTATGCCTGCATGTTATCACACTTAT
ACAGAACTGGACATAATAATTTTGTAACAGTGGGTTGATGCAAAATGCTT
ACTAGAAAGTTTTATGCTAGTTTGTCCAAGATTTCTTGTTGTGGTCAGGC
GATATCTTTGATAGCTACCTTTTCAAATTACATGCTTTACAACTCTTGTC
TACCTAGTACATTTTTTTCACCATAACTGAAAAAATTCCATCCTTAGGCT
GTACTACTGAATATATTACAAAGGTGCAGCCCATTAACAAATGATTTCCC
CTCTTAATTTCCAGTTATCATGTTTATGATCTCTTGGGCTTTTACTGTGG
TATCTCTTGCCCTTGCAAGCCTCATCTACTACTATGTCAGCTTAAAAGGA
AAGGCTGGCGACTGGGGGGATGGATTTAAGAGTGCCTACTTTCAGCTGGC
TTTGCGAAGTCTCCGATCGTTGGGAGGTAGTGTTCTTATTATACATGGAA
ATTAAACATTTGTTACCAACACTTGAAACACCACGCTTTATTATTTTACA
ATTCTGTTACAGCAAATCAAGTTCATCCAAAAAATTGGTACCCAATTCCT
CTCATATTCTGCCGTCCTTGGGGTAGGCTTCCTGAAGATGTCCCATGCCA
TCCAAAGCTTGCAGATTTCGCTAATTTCATGAAGAAAAAGGGACGTGGTA
TGTCAATATTTGTCTCCATAATTGATGGTGACTATAATGAATCTGCTGAG
GATGCAAAGGCTGTCTGCCGGCAACTAAGCGCTTATATCGACTTTAAGCG
TTGCGAGGGTGTTGCTGAGATCATCGTAGCACCCTCAATGTCTGATGGTT
TTCGCAGCATTGTTCAGACAATGGGCCTGGGGAACTTAAAGCCAAACATC
GTTGTGATGCGTTACCCTGAAATCTGGCGTCACGAGAATCTGACACAAAT
ACCATCAACATTTGTCAGCATTATAAATGATTGCATTACTGCTAATAAGG
CTGTTGTCACTGTGAAGGGACTTGATGAGTGGCCTAATCAGTACCAGAGA
CAGTACGGGACCATTGACCTATACTGGATCGTGAGAGATGGAGGATTAAT
GCTTCTGCTGTCTCAGCTCCTACTAACCAAAGACAGTTTTGATAGCTGTA
AGATTCAGGTCTTCTGCATAGCTGAAGAGGACACCGAAGCCGAGGAGCTA
AAGTCCGACGTCAAAAAGTTCTTGTACGATCTTAGGATGCAAGCTGATGT
TATCGTTGTTACTATGAGATCATTCGAAGCACATGTGGATGGTTCCAGGA
AGGATGACCCTGATCAAGAAGCTTATACAAGTGCACAAGACAGAATCAGA
GTTTATCTCTCTGAGATGAAGGAGACTGCGCAAAGAGAAGGGCGCCCCCT
AATGGAGGGTGGCAAGCAAGTCGTGGTTAATGAACAGAAGGTGCACAAGT
TCCTGAACACAATGCTAAAGCTGAATGCTACTATCCTTAAGCATTCCAGG
ATGGCTGCTGTGGTGCTAGTGAGCCTCCCCCCGCCACCTATGAACCAGCC
AGCCTACTGCTACATGGAATACATGGATCTGCTAGTAGAGAACGTGCCGC
GGATGTTGATAGTCAGGGGATACAGAAGAGATGTCGTTACCCTTTTCACA
TGACCATTTACCTATTTGGAGATTATAGGTATTACAGAAGAGAACATGCT
GCGGATGTTGATAGCTAGTGTAGCATGATTTTTGAGCAGATGCTGCATGG
ACTCCACTGCCGAGTTCCGTAGTCAGACTTGGAACTTACTCAGAAGTGTG
GGCTTTAGGTGACAGCTCCATGTCTTTACATATCAATACGAGCATGATAG
TAGCTTCATTCTTTTTCGAACTGAAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.