Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA016886

[Submit comment/correction]

Sequence	AA016886
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA016886
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TCAACGCCTCTAATGGCCAGCCGGCGAGCAGCCCGGACAAGCGAGCAGCA ACGGAGCAGGTCTTCTCCGCTAGGTTTTTTCCCTTCTCCTCTATCAGGCC GCTCGTCCTCGTCGGCAGGAGGTGCACGGGCCACCATCGCACCGGCCAGC CCCTCGGTCTCGCTGCACACGCAGGCAAGAAGGAACAGCACGAGCGCCAC GCCATCGGCCCCCTGGTGGTGGTCGGTGTCGCTTCCCCTTCTTCCTCCTC CCTCTATCTCAAAAAACAGAGCCCTCACTGATTTGCATCTCGTTCTAGGG GAGAAACAACGCAAAAGGGGGAGGAGCAGCAGTGGAGGCCTCTGCCTTCC TGGAGGACGAGGACGAGCGGTGGCGCCGGCGTGTACTTCAGCGGACGAGG CCGCGTGGACCCTGATGTTTCAGCAGGCCGCGCCGGTGGAGGATCTTCAG CGGAGGAGGACAAGGGAGCTCAACATGAAGGTCAACCTGGTGAGCCTCTC TTCATTAAATAGTACCATATTTTGAAATCAATTTTGTACTATTTGTTCCT AATTCATTGTAAGGAAACATCTGCAGGCGCTGGCTGGGGAAAAAGGAGGG CTGACTCGCCGGTTCGAGCTCTCACTCTCTTTGGTTGGATGGCGAGGCGA TTTGATGGTGGTGAATATAGTGGAGCTTGGCAGCCCGGCCGTCAGGGACT GTTCGACGGAGAGTATTTGCAGCAGCCTGATAGGTTACGCTGTCTCTCTC ATGTTCATAGAGCCCTGTAGTATTTTCATCTAATATATTTTAATGTTGAT AGTATTTGTAGCCAAGCTACTCCAGTTCAGGAATATCATAAATTTTAGCT ACGCCATCTGTTGTGACTCCCCGTCTGCCTTTTTCTAACATGTTGTTTTC TCTGATACGATGGTAATTTTAGTAAGTAGCAGGAGTTGACTTATTTCTTT GGTGGGCAGGAAAAATTGGATATGCACTCAGTGCTATGATAGCTATGAGA GTTATCTTTGGTGGAGCCAAGCCTGGGATATTCTGTTAGCTGCTGAAGCT CTTAATGGTGTTAAGACAGAGCCCGTTGATGCTTGAAGCATTGCCACTTC TCATGAGTAAGCATTTACACGTGTCATTATTTTCTTGAGCTGCACTATTA GATGATCAGTGCTTAACCATGTGGTAAGAAAATATGTCATGTGTTTTGCC AAATAATTCTATCATATCAAGCAAAATTAAGAGTATGTGTTGGAATATAC TTCGTATAAAGGCGGCTATATAAGGCTATTTGTTCCCGTGGTGTATGGAC TGTCTTTGTGCTGAAAATTATGATTTTCTTCACTTCTCTGGATTAGAGTT CAGTACTTAGATGAATGGTGCAGATGCTTATGATTAGCGTGCAATTTGGA AGGGAGGAACCTTTGTTATCGTGATGCGGAGCATGCTTTAGTTTTATTTT AACTGGAATGCACATTCTGCATCTGATTTTGTTATAATGCGATAAAATAG AGGTTCATGGACAACATCTGGTGTGTGTGGTTGCATCTCTAGATATGGGC CACATCTGCAAGATAACGTTCTAAGGTCAAAATGTTTCATGCTTGGCTAA TGATTTAGATATGCTTTGCTTGCATATAGTTATGAGCGTCAAATCTAAAA GGGATTGAAACTTCAGATGAATGGCTCAACATGCATGGCCCCATTCAGTT TGAGTTATTAAATAGGCTCTCATGTTAAAAAAACATATTGCGTTGGCAAG CTACAACATCTAGATTTATTCAGGATGTTCTTCAGCTGTAACTTTAGAAA AATAGTTGGTTTCCCTTCTTTTGTTCATGAGATATCTTAACACAAAATTT CCTATCTTTTAAATGGCTCCATAATTTTTCCTTTATCAGTTGTACAATTT CTTTTATACATTTTCCTATCCTTTCTCCAAGAAACTAGGTCTTTGTTAAC AAATCTATTCCATAATATTTCGAGATTTTCTCGGTCTTGTGTTTTTTCGT TCTAGATCTATTCTTTATTATACTTTTTTGATTTATTTCTTCTGATTTCT TTTGAGTTTTGTTTGCATCAGGTCCTTGTTCATTTATACTTTCTTTTCAG TTTACTAAATGGGTTTCAATCCATGCTCTTTTCCTTTTCACCAGCTTGAT ATTCCGTGTGTGCCATTCATGCTCCTCACCGTATTTTATCTTCTATGTAG GAACTCAAAAGTCCTCTTATATTATGTTCTACTAGAACGTATAATATCCT CTCGGCAGATCTGGAAGTTAGATTTTAAAACTGTCGACCATGCTAAGCTA GCTGCAAAGTACTTGGAGTTACAGTTACTGTGTTGATGATTCCTGTGATA ATGACAATGACACCCCAGACTGGTGATATTTAAAACTACTAAAGAGAACA TTCACATCAATTTTTCCTAGATCTATCGGTGTCAATTTATGTTCTTCCAT AGTTTTGCAAAATGAGTTGTGCAAAATGAGTTGTCCAGACTGATAAATTT CCAAAATCAATTTATACTGTTAGTTAAAATATGTTTTCACCAAAGTAGGA GATTTATGGCTTTAATGGTGCCATGCTGTTGTCGGAGGAGCGGCTGGTGG CCTTGCGAGAAGTACATATGATCGTTGATCGAAAACACACCCTTCCTCAA GGACAGAATGATTTTCCGCTTCAACGTTTTCTTTGAATTAAAGGTCGACC TATAATTGAGATTGTCTTCTCTATTTGTTGTAGATGTTTTGTTTAATGAT ATTTCTTTGGATTGCATAGTTGTTTCCCCAAAGACTTCTCTATATGAATC ACTTCTACCAACTGTAAGCTTTGTGATAATTTGTGCTCCAATTAACGCCT GTGCATTTTCCTACAGGAATAAGTGAGAGACTCTTATTCTAAGAAAGTAA TAAGAAGAGAAAGGGGGAAGGAATAGAAAGATCCCAATTTCTACATCCCG CTTCTGCGCGCCTAGACTGTTCAATTTCAAAGAGGAGTGACCTACTTAAA ATGGTAGATTTCATTTGCTTGGAAATAAAAATCCTGATAGGTTGCATCAT ATTGACCACCTGTTATTTCTCCTCTAATACACCATTTGAGGCAGTAAAAA AGTGAGCACGAATGTACTATAGCCTATATTTGTAAAATGATCACTATTCA AAAAGGGACCTGCTTAAAATGGCAGGCTTCATTTGCTTGGAAATAAAAAT CCTGATAGGTTGCATCATATTGAACCCCGGTGTTTTCTCTTCTCTAAGAC ACCATTTGAGGCGGTGAAAAAAGTGAGCATGAATGGACTGTAGCCTATAT TTGTAGAATGATCACTGAAGTTGAAGAGTAGACATTCTACACTGCAGTGT TCTCTTTCCTCTTCAAAATATGTAAATTGCAATGTCCTCGATTTTATTCC GAGGAAGCACAAGGGCATGTTCTGTTTCTTGATTTATTCGCTAATAGATT CACTATCATTTGTACCTTCGTCATAATGAATATCAGGTTTGTTTTATTTT TCTGGCAAGAAGGGTGTGAGTGGCATCTCAGCTCGCTTCTTGTACATCAA TAACCATATTATTATTGGTATCAATGCTTTCTAGGTGGGGCCAACATCTC AACTGGCACCAGAACATCCGTTTTTTCTATCTTGCTCACAGCCATGGAGT TAGGTTTTACTCATGCCACACATTAATTGTTGTGTTTAAATTATGCTTGG TGCCTTTTGTGAAGCTATTTTGTGTCACTTGCATAGTAAGGTTAGTTTAT GTTAACTGGATGCAATCCTTTTCTATTCTACCTTCTGTACTGTTATTGAA TTACCCACTCTTCCATTATTATATGGTTCTTCCAACTAGATTTTCAATGC CTTGATAGAGCTTAGTTGAATTCAAGATTGTATATTTGATTAGCCACTCA TGTATTTTCTGGTTACTATAATTCCTTTTATGTTTCTTTGTATCTTGGCT AGGCAAGATTGATCTTCGCCATCTCCGTGCCATCAGTTATGTTCATGAAT CAACTTAGATACTAAGATGGAAATAACGTGACACGGTAGTTGCAAATGGA TAGCAAGGTTCCAGCCTTTGGTGCATGGTGTTAAGAGGAAGAGAAAGGGA GGCAACCCGGTCCTTACCGAGGTACTAGACAAAATGCACAAGAAAATATT TTCTACATGTTTCTCACACCATTAACTTAGTCAATATGTTTTTTGCTTCT CTATAACACTTTGCTATACTGATATATTCTTGATCAACAGGAAAAGTGAT AGTATATACAGTGACTAATGGTTACATAACACCAGATTATTCAGTTTTGT GATTCTGGTCAAATGCCTCATTCATGGTTATTCATGTTGTCTGTACTCAG GTCCCTTTGAAGTTCCCCTGATTACTCTCTTTCTCCTCGAAGCATGTCCA TTTTTTAGTATCGTGAATGTTTTGTTTCAGGACCTGAAGAGGGGTTTTTG AACTATAGTTCAAATGGAGCTGGTTTAGGTTAGTGTTTAGATTATCATTA CCCTGTAATTTTACTTTCGGATTTGCAGGCTAGGATTGAGTGATATGTTT TCTTATGGTTTGAACAACCTGCCTACACTGGCCTGCTTATTAATACCTCC TTTTTAGAATATTCTAAACTTTTAAAGTATGTGTGTGCTTGCTTTGGTTG CTTGGCTTCTTTTCCCGCATGACAATTATGGTTCCTGTTTGCCTTTTGAA TCTTTTACAATGCAGGACATATTAGCATTTCAATGGGTTTCTGCTACAAG TATAAATATACCCTTCTTATAGATTGGTTAATTCTATAGATTTTGATTAT TTTGTTGCCCCCAAGATGTAGCTCTAAGTTGTAATATTTTCAGATTATCC AATACAAAATATTCATAATAATTTTGTGAAAATAAGGTGATTCTTGGTCA CTTTATTTGTTCATATGCCTGACGAGTTGCATTCTGATGTTGCTTTACTC TTACTCTGTTCATTAAGTTAATATACAATCGCTTTGATATGTCTAGACGG TATTTTGCAAATCTAAATTTGAGCATTCTAATACTGTTGATAGGATTTCC TTCTCTTCAGGCAACCTCTGCTTTGTAAATTTTAAGTTTTTTCATAGATG TTTCCCTAGATTTATTGCACTAGAAAGTACTCTGTTTGATCGTTTGATGG TTTCACATGTAGACACTATTATTCTAAAACGATGCAATGATCTGTTTATA TCCAGTAAAATTTTAATGTATACATTTTCTGACAGAACCTACATGAAGAA CATTGAGATCCCATGAACTGTTGTTTTTGAGGCTATGATGAAGAACATGC ATGTCGGAGAAGCTGAGTTTATGAGCCAGGTGCTCTTCTACACTTCCATG CAGTTTCTCCAATCATCGCCTCATACACACTCGGTATCAGTCTACACTGC AGGCAATCAGGCTTATGGAGAGAACTGAGAAGAAGACACTTACCACTTTC AACCATGTTGATTTGAAGGCAGAGAAGAAGATTAATATAGATATGGTTCA GAAATTGGAAAAGAATAATAAAAGATTCAACAAGTCAAATCAATTGACAG AAACCGCAGTGGAATGTGAAATCCACATAGATAGTGTTCAAGTTTACGCC AATCGCATTGAATGAAGGTATCATTTCTAAGAAGTATGCTCCAGGTTACA AGGCTGTCCATGATAGACATGATGATAAGCTCATTGCCATTCAGGTTGTA GTTGCTGATCTTAACTAGCAAATTGCTGAGACCGTTGCCAAGCTTAAAGC TACATGAACACTTTATGCAGAAGGCAATGCTGAAGTTGGTGAGTCCTCTA GCTCTAAGGATCATCATTCTGATGATTCACACGGAGATGCTGATTTCTAT GACTACGACTCCGATGGATGCCTCAAGTTTTAACCCGTGTAGGCATTGTT ACCTGTACTGACATCACTATGGACTACACCCACATGTTTACTGATCTCAA ATGTCTTCCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.