Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA016785

[Submit comment/correction]

Sequence
AA016785
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA016785
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGGCTCCCGACGACAAGCGCCAGCAGGAGCACCGCCACGGTCTGGT
GTGGTGGATGGCGAGACCGCACGGGCCAAACCCGAGCATATCTGCTAGCT
TAGAAGGTCGGCTCCGGCGCCGCCGTGGCCAGCGATGGCGACGAAGCCCA
TAAGGTACACGTCCACCACCTCTTTACCATTAGATTAGGGTTAGAGTTCG
TCCAATTTGGGAATTAGGGTTAGGGTTCTTGAATAATTGGGGAAATTAGG
GTTAGGGTTCTTCGATTCGATGAACTAGGGTTAGGGTTCGTCAGGAATTG
GGGATTAGGGTTAGGGTTTGCACCAACAACTCAAATCCCCACATAAAAAT
TGCATAAAAGCAACCCTAGCACCTGTTCTTGATCAGATAGAACTTAAACT
TAGTAAATTTAGGGCTAAAACTTAGTAAATTTAGGGCTAAAACATAATAT
TGATCAGATAGAACTTAAACTTAGTAAATTTGCTGTTCTTAAGCAAAAAC
ATGATCTGAACGAAATCTTCAGCAACCAAAACATGATCAAACCAGGAAGG
ACAGCCACACTAAAGCATAATACCTTAACATAGAGAGCTCAATCTTGAAG
CTAGGTGCTCTGATACCACTGTTAGAATCCCTTAGGATCATCTAGCTCAA
GATTAAGCCACAAAAGATGAGATCAGAGGTGTGTACCTTGATCTGGAGGT
CCAGCCATGGCCTCCACTTGATGTGCTTCCACTCATGTTCTAGATTTTCA
GCAGTGGAGTGGTTCTTCCTGTTGCTTTCAGTCCTTGCTTGATCAGTGAG
CAGGGGAGAGAGTGAGAGAGAGAGAAACTGTCTTAGTCATCTTCTCAAAC
CCTAGGGCCCCTTTATATAGGACCTGCACCAGGGAAACCACACACAAAGG
ATGGATGGTCAGGATGCCCCTGATCAGGGCATCCAATGGCTGTAATTAAA
CAACCCCTAAAAGCCATAATCTTGACTTATTTGACTACAGATCACTTATA
TATCCAACACGATTATCTCAAGTTCCAAAATAGGACAAACTTCTCTTTGT
ACGATGTTGTGGCTTGTAAACGTGAACTGAATAGACCATCCCATGAAGTA
GCGAGAATTTGATGGCCGTGTGATGTAAACAAAGCGTTGCTCTGGGAGTA
TGAAGTGATAGGCTTTCTCAAAAAAAGAAAGTCGAAAACCCTTGTGGAAA
TAACCAGGGGCGTGTGACAGCGTTCTTCACTGTCTCAGGAGTCTGGGGAG
TGTATACAAACTCGGGGATTAACAATGAGTGATGAGTCGTCAACCCACCC
CGTTCGGCATATGAGAGGTATATATAGGTGGCGTGTATGTGCTTTGATTC
GTAAAACCTAATCTGCTATGAAGAACCCAAAACAATAAACTCAATCTCCT
TCAGCAATTAAATATCCATTGTGCTCCAGAAGTTTCTTGGACTAAACTTT
AACACACCCCAAGCTTGAGTAAAGCTCGAACATAGTAGCATGTAGCAACA
GGAACTCACTTTGCCATCATAATCAAAAGCTACATCTCCCATTCTACAAT
GAAGCATCATGGCATTTTTCTCCTTCTCCACTAGTGTTGCAGCAAGTGAT
GACCCTCCTTGATTGTGGAATTCATCACGGTACATGTACAGTATGCCTCT
ATGTCTGGTTCTGGTTCCAATATTCCTTCCAAAATGGTAACAATATCGTG
TCTCCTGCCTATTCGAGACATAGTAGGCTGGTTTAGGTACCACCATGGCT
GCTATTGCAGTCTTGTTGCTTCCTGTGCCATGGCTGCAAAGGCCTCTTCC
AATGTAGGCAACTGAGGAACATGCATTAGTGCAGCCCTCCTGCCCTCAAA
TGCAGGATTCAGTCCCTTCAGAAATTTCAGCACCCTCCTGTCCCCATCCA
TTTTTTCGCTGTTGCCACACATTTAGAATGAGGCAGCACCAAGGGGCAAA
GATGGTCCAGATCTGCCCATGCATGCCTCAGCTCTCGCACATATGTCATC
ACTGTTTTGCCATATTGAGTCAGAATGTGTACCGTACCTTCAATCTGAGA
GACCCGCATGACATTTCCCTTGCTTGAATGCATCTTTGAATGGCCTACCT
CAATTAACATGGAAAGCGCTTCCACAAATGATGCAACATGAGATGTCAAG
GAATTCAGCAGCCAAGTGAGTACTAGGGCGTGTTTGGTTGGGCTGATTCT
CGTTTGTCGCATGGCGTGGAAAGAAATAAGCCCGTTCGGCTTGTTGGGTC
GCATGAAATTGTTGTATGGCACGGTTCTTAAAGCAGCCCAAAACTTGGCC
TGCTGGGACGCCGAAATCGGCCGTTTTCACGCAGCCAGGCCCTGGCGAGC
GCCGCATGCCGAGCGCTTGCACGCGTGGGGAAGCACAGGAGATGGGACGT
TTTCGCCTTAACTCCCAGGACACTCCGCTCACCGCCCCACTTCACTCTCC
TCACCCCGATTCGCAACCATGGCCACCGCTCCTCCTCCTCTCCCTCCGTT
CCGTGGCCCCAACATCGGCGAGGTGAGTGCGCATGGGCTATGTGCGGCCG
CTCAACTGGAGAAGCTCGCCGCTGGCGGCAAGGCAGCCCTCGCGAGGGTG
CTCAGGGCTCCCGCACCCTTCTGCGCGCAAGGAAATCGGGCGGCAACAGT
GACGGCCGCGGCGGTGGCAGCGTCTTCTATATCCGTGGAGGAAGCCGCAT
CTGCGGCCAAGCAGGCCGGAAAAGCCCCAGCCAGAGTCAGGGTTACCCTC
GACTCTTTGGATAGGGTTTTTCTGCCTATGCCGGCGGCCCCAACCCCCGC
GCCCGGCGTGTCTTCTCACGCTCCGGCAGCACCTGCTACTGCTCCATCGT
CATCGATGGCGCCCCGCCGATCAGGGTAAGTTCCCGATCTAGTTAGCGGT
TAGGGTTTGGTACTAAATCGACGGTAGTTAGGACTCGATCTAGGTAGTTG
TAGTTTTCAATGAGCGATTTGGGGCTTTTTGCACTACGTAGTAACAAATT
TCATAATGTGCTATCAAATTTTGGGATTTAATGTAGCCGAATCCTCAAAC
TGGGTGTTGTCCTAGGGAAATCCTGGGGCATTGCCCGATTGGGGATACAT
ATCCAATCCTTAAATTGGTTGTTGTCCTGGGGCATTGCCCGATTGGAGAT
ACTAGTCGTTGTAGCAAAACTGTGGGGAAGGGCTGGCACCCCCCACTGGG
TTTTGCCGACGTGCTCCCGACCAACCGCTGGGCACTAAAGCCCGTGGTCA
TCGGCAGGGTGGAGGCGGCTTCGTAGCCGCAAAGCAAGAAGGACCTGCAG
CCAAAGCTTGGCCACAACCCAATCGACGAGGAGCCTCGCCGCTTCATCAT
CCAGCTGGACATTGCTGACCTCCACATGCTGGTGATCCCGCATGTGTTCC
AGCGTGGCCTGAGGACCTAGATCAAGGCCCCGCTGCCGCGTGTCGTGCAG
GTCACAGCCTGCCGCTGGTGCGCCAAGTGGGTGCAGGTGGACTGGTTCGC
TGTCTAGGTTGCGTTCAGGAAGAACTAACCGGAGCTGGTGTACAAGTATG
ACCTGGAATGCGACGATGTCGTGGAGTTCAAGCTCAAGGCCTTCGTCATC
AAGATGACGATCTACAAGGCGGGCTCCTCCAGTGCCAGGCAGTACACCTG
CCCTGACCACGGCTAAACGCCAACGGCCTTCGTATTGTAGCTTGTAAGTT
TGTAAGTAGTAGTAGTAGTTTCTGATGGACAACTCGTGATGGTGAACTGC
TGATGGTTCTTTTGATCAGGGGTTGAAACCCCTGGTGGTGGTTTAGGGCC
ATGGGATGCCCCTGTTGATGGTTTGTTTCATCAGGGGTTAAGCCCCTGGT
GGTTGAGGGGTAGGCGATGCCCCTACTGATGGTTCTTTTGATCAAGGGTG
TAATTTAGAACCCCTTATTGCTGCCTGCATGTGACTGATATTGTGCAGCT
AGTAATGTTGTGTCTCCATATGACTGTTATTATGATCATCTAGCTCGTAA
TGTGTTGTGTGTGCATATGACTGTTGTTGTGATCATGTGTTGTGTGTGTA
CTGGGTGGTAAGATCACCCAATTTGAAATGGGTGATCATAACTCATATGA
TCAGATGCAAAGCACTACACCAAACACCTGTGAAATGCATCAGCATGGAA
AACAGTGTTGAATCTGGGCAACCAAACAACTGGACCAAGTTGCAGGAAAA
CTGAATGCAGAAAGCCAAACAACATGCCCAAGTTGGCCCAAGCCCAATCT
CCCATCATACAGCACCCAGCGGACCAACTAGGGGAAACAGGAAATTTAGG
CCCGAGCAACCAAACACGCCCCTAGTGAATCCGTAGCATTCCATTTCTTC
GACTCCTCTCCCATCTTGTCCTCAGGCTCACTAACATTTCTCAACACATA
CCCTTTCATCAATTTCGTCCTCAGAATTAGCATCCCCCTCCTAGGCCAAC
TCAGGTAATTCCCAACTCCATCCAGCTTGATCTCATCTGGATCTGCCTTC
AACACCACTGCCTTCAACCTTATTTGGATCTGCTGCCACCTGCAGGAGAT
CACACACCACCCCACGTTTGCCCCTCAGATAATCCACTGCAGGAGCACCA
TCATCACCGCCCTGATCTGATACCATGTAAAAGAGAATGGGTGGCTAACC
TCAGGGCAGCAGCCGTTGTGTTCTAGGGTTTCTTACAAACTAGGCTCAGC
TTGTATACAAACTCAGGTTACTTGGTTAATGGACCACATGGGCCAGAATA
GGTAGACATGTTGCAATGTTGGCTGCATCCCATGTACTGTCCAACATTGT
TGTTGCGTGATGCACACTGATTGTTAGCCTGTTTTTGACAAATCATTGTA
ACTGGGATAGCTGCACACCAAATAAATTTCAGCCAACCAGCCAATAGTCA
CACGAGCACTGGTTTTGCATTTCTCAAAACAGTATAAGGACTACCATAGT
CACGTCAATAAAACGAATTGAATTCACAAGCTGAAAGTCATGAGTGTGAT
GGCAGTGATTATTAGGCTATAAAAATCACACATATCGCTTCATTGAATCG
TGTTTGACTTATTTGTATGTTCAGGCTTATGCTACAGAAGTATGCCGGAA
AGAACACGGTCACCTGGCACTATCACTTGTATGATGCTATTTTAAATTTT
TCTGTTACTCCCAAATCCGAACTTTATTGGGCCATGATATAATGTCACTT
ATTGCATCAGATCTCCTCCTCACGTGGAATAGGCCTTATTGTTGGACCAG
CCATTGGTGGTTATCTTGCACAGGTAGTATATTAATATTTGCAGAACACT
AATTTATGTATTGCCATCTAAATCTGTTTTAACATACAATTTTCCATAAT
TATGATCATTTTCTTGAACTCACATGCAAATTTAAAGATTATATACCTTA
TCACAATATGTGGCAAAGTATATTCCCTTATATTTATTTTTTCCTAAAAC
AATGATTAAGGTAAATGATATTCATCATTATTATACTTCCATGCTACATG
GAAACATGCACCAAAACTAGCTGTTATGATTGCTTCAATTTTCTAATGTA
GACATTTGTGATTAAAAAATTGTCAGAGCCTTGTAAGATAAGTTTTCTTG
TGGATTGCAGCCTGCAGATAAATATCCAGACATATTCTCTGTGAACTCCA
TATTTGGGAGGTAACTATTATCTTTGTGAATCCTCCTTAGCATATTCTTT
TTTCCTTCTTTGTGTATCCTTTGATATTTCTTTATTCTCCAAATTCAATT
CTGTTTAAACATGCACTGTTTTAGGTTTCCGTATTTTCTCCCCTGCCTTT
CTATATCACTCCTTGCCGTTGTTGCTTTAGTTGCTTGCTTCTGGCTTCCG
GTGAGTTTTCTGTTCCTAGAAGCATACAATTAATATTTAATTTGTATCAA
AGAAAACATTATATTGGGATAATAAATATAAAAAGTCTCAAACTATTTTT
CCATAGAGTTGCATGCTTCCTGTAGGTTGTAAAATGGTACTAGATATTAA
TGTGCGTCTATAATCTTGTGTTCAGACCAGCAATTGTTGGTGTCATGACG
GAATATTTGGCGAGGATAGCTCGACTACAAATAAAATGAAGAACAATGGG
TATAAATATTCATTTTTAGAAAAAATTCTGATAAGTTGAGATAAATAGGA
CACTAGTTGTATGTACCAATACATATTATGCATCTTGACCTGAAACACAG
CTAGTCAGTTTTATAGGATTTGAAAGCAGACCATTCAAGCTTCTAGAAGT
TTATTAGGACGCAAAGTAAGGGAATCCGGTTTTTGATACTGAAATCATAT
ATCTTTGTGATGATCCACAAGCTATATAAGTATTGAAAATGTTGATAAAC
ATGACATTTTTCTGTTTTTGCTCAACACTAGATACAATTGTAGTACCATA
ATGCATTGATTTGGCACTCAGCCAATAAGTAGAGTTACGCACATAGTCGA
CCAATCATAAGATTAGTGTTAACAATGATGCAGGAAACTTTGCATATACA
TACCGAAGACACAATTTTAGATAATTCAACTGAAGATGTTGAACAGACTA
TTTCTGATACAAATGCTGAACAAAATGGTGGTGGATGTCTCATTTTATTC
ACAAACTGGGCACTGATGTCTGCTATCACTGTATATTGCATTTTCTCTCT
GCAGGACGTGGCATATGCAGAGGTAATGTGTGTGTCGTTTCTTTTTCTAC
CATATATTTCCTTGGTTGTTTCCCATCTCAATATTTTGACTTGCTTACAT
AGCCATTTGTTACTGGATTTCATTCTGGAAAGACATAAGTTGCAGGTTTT
TTCGCTTTGGGCCGTCAGTGACAGAAAGTATGGTGGCCTAAGCTTTTCTT
CTCAAGACGTGGGTAGTGTCCTTTCAATCTCAGGTATTTTACAGAAGACT
CAAGAAATTGTGAATTTATAGCTCACGGCGGATAGATTTATTCGTTGAGG
TTTGAAAATTTTAAACATCATGCAAGTCTCTGAGGTAGGAGATCTAAGGA
AAGCTCTAGCCCCATGTAATATGATAATTCATATGGAAATTATGTTATAA
GGTTACTTGCCACTGCAAATGGAATTTCCCCCCCAATTTTAGCGACCATA
ATGGCGTCTGAAGTTCTGAGGATTTAGAGCAAGTGAGCAGTGGCATATGC
ATATGACACCAGACTTTCTGGATGGGAAATATGCAATATTGAGCGTTCAG
CAGTGGCATTTCATTAAGCCAGACTTTGTAGTGGCGCATATATGATATAA
TATGGATATACATATTTAGTCCTGTTGGTGGCCCGAACTAATAATACGGC
TTTATTTAGTTTGCCATAACTTAAATAATGTGCTCAGTTTGAACAACTAA
CACATACTGGAACCATAATTTGTATGAAATGTCTGATCATGAGAACTCAC
TAGGAACTCAGCGAATCATGTCTCAAGCGTTGTCGTCTGTCTGGTCACAT
GCAATGTTTGGTGTATTGACTTTACTTTTTGTCAGGCCTCCTACTCCTAA
TATATCAAATTTTGATTTATCCATCGGTTGCAAAGTCTATAGACCCCATC
ACGTTAGTCCGCACAGTTGCGGTAAGACTATTTATTGCTTGTTTGATCAG
CTTAGTTATATTGTAACGGTTAAACTCATTAGATATTCTGATGTGCAGCT
ACTGACAGTACCACTTCTTTCGAGCTATCCATTCATGCCTGCATTATCAG
GGTTTATTCTTCAGTTGGCAGTAAATTGTGCCTCTTTTCTGAAGAATTCT
TTCTCAGTGAGTGCAAAGATCTTACATTATTGTTGAGTGGAACACATTTC
AAGTTTGGGCATGCTATTAGTTCATAAATTTTGGAAAATATATTTCGAGT
CTCGTATATTTATCTTGGTGTTGGCTAAGCATAACTGTAAATATTGTTTC
TGAAGACCCTTTCCTTGTTATTAGAGAATAGTAGCAATACAAATACATAC
ATGCTGCTAGTTATTCATATTTTGACAAATAATTTAATTTTTTCTTTGGT
TATTTCCTTATATATGTCAAATCAAGTCGACCATTATTAGTTGCTACAGA
AATTTACTCGCGCTCTTAAAAAATATTTCAGGTAACTACCATGACCGTGT
TCAGCATTTTAATAAATGATGCTGTGGTGAGTTCCTGACATTCTTAATAA
ATGAATAGCTATCTTCCATCCATTACTATGAATTTTGGTAACATCATATT
TTTTTCTTACCTTGGGATCCAAATAATAGAGTCAGGACCTAAGAGCTTCA
GCCAATGGCCTTTCTATAACACTGATGTCCATCTTCAAAACTATCGCTCC
GGCTGTTGCAGGAGTTATGTAAGTATCCATGCTCCTACTAAGTATTACAA
CAACAATAATTTTCTTCGAAAATGATATGTGGGCCAATAAAACTTCAATT
ATCTAAACATATTTCCAGAGCCATCATTGTAGCTGCTCTGCTTCGATCCG
ATATTTTCTAATACAGAGCAGCAATCTCAATTCTCCAAATAGTTGTATTT
GTCTTCTGTGCGTTATTTTGTATTGAATTTTTCATGAATAATTGTACTCC
ACCTTGTCATGCTAATTGCATTTTCCTTGTAGATTCTCCTTATCATGTTA
ATTACATTTTTCCTTGTAGATTTTCATGGGCTCAAAAGCGTCAAACGGCT
CTATTTCTTCCAGGTATTTCATACTATGACTTTTTTGTTACATGTACAAA
ATTTTATATCCTTGAATCCTCATAGCCTTTAAATCCAAGGATTTTTTGGG
GAATAATCGATTGATTAAGATACAGAACTAAATATTTAACATATCTGTTT
AAACGATACATTGAAATTTGGTATAGCTGGAACAGTGTTACAGAGTCAAA
ATGGTAATAGTTTGCTTAAATCCACATATTCGGTTTTGGTCAACCTATGC
TTTTCTAGGAAGATTAAGCTTGCGTCTAACATTGAAAGATGTTCTGCTGT
TACTACGATGTAAATTTCTAAAGCTCTAATTCGTGGCGATACCTGCTGTG
AGTTAATATTGCAGGAGACCACCTGGTGTTCTTCACGCTGAACGTGCTCG
CCATTATTGGTCTTACGTTCACTTTCAGACCGTGCTATACTAGAAGCGGC
AGGACGAAGCATTAGCGTAGTGACACCATGTGTTACGGCCCGTATAAGAA
CCTGGATGTATTTTAATACTGGTACTTTTTTCTTCCCTTAAGCCATGTGT
ATCTGCTGTAGGATGCAGACTACTGTAGTACTGTTATTTCTGTACTCCGG
GGTCACTCTGAGACTGAAAGAACAGATGCCTTTTTTTGGTTCGAGTCCTA
GAAACGAAGTAATAGGACAAATGCAGGATTAGGTATATAATATAGTTGGC
ATAGGAACACATAGCTTTTTCTATGATGTTGGACAGAGGGTTAATGTTAT
TGCAACGATTGACTTCTGCAGTGCTTACCAAATTTTGCAATTTCTTATCC
GCGGAACCAACATCTCATTTTGTATCTGATTGCACGACTGCACGTATTAT
GCTATTTGTGGTTCCAGTGTGAGACTTGATGATTATATTGAGAGCGCATG
TGACGGGTGGGTGGAATAAATATTGGTATAGATGTTTACAGATTATGCTA
TTTGTGGTTCTAGTGTGAGACTTGATGATTAGATGGAGAGCGCTGGGACG
GG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.