Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA041582

[Submit comment/correction]

Sequence	AA041582
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA041582
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AACAAGCAAGCTAAACGGCGGCGAGAGCACGAGCCAACGGCGACGAGAGA GCTGGAGCTCGACGGTTACCAATTCCCACCCCGCCGCCCCGCCCCTCCTC TCCGCATTCCCATTCTGCGTCCTCCCCGATCGAATCCGACGGCCTACCCG CCTGCTCGCCCCCTCACTCCTCCCCAGCCAAAACCGTGGGCGTTCTCGTT CCCTCGCCCCCTTCCAATCCGTAACCCAGCCCTCCAAAACCCTAGCCACC GCACCTCGATCTGATGCTGTGACCGTGACCTCCCCGATTCTCCCCCCTCC TCGCGTCGCCATGGAAGACCCCGCGGCTATTCCCTCCTCTTCCGCCGCGC CCGCCGCGCCCTCCGCGGTCCCGTCCCCTCCTCCCGCGCCGCAGCAGGCA CCTGCCCCCGCTGTTGTGAGAACGGCGGCGGCAGCCCCGGCCCCGGAATC CGCGGCTGGGTCCCGCAGGCAGTTGTTCTCCGTGGAGCTCCGGCCCGGGG AGACCACCATCGTGTCGTGGAAGAAGCTGCAGAAGGAGGCTGGACAAGCG GCGGCCACATCGCCGCAGCCGTTAGCAGTTGTACCAGCAGAGCCTGCAGT CGCTGCACAACTGCCCCCGTCCGGTGTGGTAAGCAGTACTCTTTAGCTGA TGTCGTTGTCTGTCGATCGATTGAGTACCCCAGTTTGTGCTGCTCAGGTT TGCTGTGCGAGTAGATGCAAAATTGCAACTACAAAGATCCGTCGAGGCCT TTATGTTTGATCTGGGAGTGGAGAAGTGTCCTTGTTGAGCTTCTTTACAG GAAATTATCCTTGTAGGGTGAGGGTACAGGGACAATATGTGTAGCTCTCT CTGACCAAATAGTCCAAGGGCGCTGCCCTAGAAGTAAATAGTGCCGCCAT ACTTCAGTGTCATTTCATGCTGTCTTTGTAATTCATGGTAGTTTTTTATG GCATGACCTTATCATCCCTCAGATACTCCTCTTCATCAAGCATTTTGTTT TCGCACAGTATATGCTGGATTGTTCAGAAGTCCTGTATGTATTTTACACT GAGATTATTATATTTGTTCAAATCAGGCACCCACTGCAGAAAACAACCCA GAGGATCCAGCACAGCCAAATCGGTTTAATGCAGTTATTGAGAAAATCGA ACGCCTTTACATGGTAACAAATGGATAGCATTATTTGACACCATATTCGC CATTCACCGAGTTTTGACTTTATATCTGAATTGCCAGGGTAAACATAGCA GCGATGAAGAGGATCTTGATGATGTGCCGGATGATGATCAATATGACACT GATGATTCTTTTATTGATGATGCTGAATTGGTTGGTTGTTCAATTCTTCT TAGTCCTGTGTCATAGATGTGCACCTCACTACTAGTAAACTTCTACAATT TAACTTGCTGTTTATATTTGCGGACTGGTGAAGTCCATATCTGTACTGTA GTGTGCACTCAGTTTTTGCTATCCGTTCTATCTGCCCAAACTCTTGGTTT AATTCTAAGATGAAAAATTTATTTTTGTTAGTTTCATATGACATTGACAT GGCCCCTCAACATTACAGTAATAGTTCATTTTTTGTATAGTGTATGCACA TAATATATGTCTGGAAACGATTGCACTGAATATTCACAGCATATTGAAAA CCCTGTTTCTAGTTACTTACTTACACTGAACTTGTAGAATTTATCCTTCT ATACTTACACTAAAAACCCTGTTTCTTACCTTTTCAGGATGAGTATTTTG AAGTCGATAATTTGAAGACTAAGCACAGTGGTTTTTTTGTTAACAAAGGG ACATTGGAACAGATGTAAGATTCCTCAAAATTCGTTTGATTTAATAGAAA ATTCATGCCATCGCTTCTGTTAATGCTGGTGGATTACATCCATACCGACA AAATATGTTTGGTTTTTAGTATGGCATCTTACTGATGGCACGACGGTCAC CTGTTTGATTGCAGCAACCTTTCACCATGAGTCTAGTAGACCATGTCCTT TTAGCATACTATTCGATTTTATCACAGACACCATATCTGCGAATCTCTTG TGACTAATTTTTTACTTTTTAGCGTAAACCGTACAACTTTGCGCTGTCTG AAATAAAAACACTGCATGTCACAACAGTGGCATGTAATGACAGGCTTATA ATAAACAAAGCTACTGATCAAACTGGAAGCAAAGCACGTTGTGCCGGTTA CAGCCCTAGATGGAACAACACAAATAATAGATGAAAGCACGAGGAAAATA ATATGCACAATTTTTATATAGCAGCATGGATCCTGTGCCAATTTAATCGA ATCAGCTGATCAAATTGGCAGCAACACATTTTTACGTATGCCCATGCGTT ACATATATGTTTGCATGGATGATACATAAACTTTCTTTTGCAGTGAACCT GGTACATCGGCAGATGTCGCGCCAAAGAAAAGGAGAAGCAAAGACCCATC TGGTGATCATATTGAAATTAATCAGGGTGCTACAGGTGATTGTTTGAACA TCAGCAACATGCCTGGGAAAGCTAGCAGTGCTGCACATGCTGGGAAGAAA TCTGCTACTGGTGGAACCGGAGTCCCAAAAAAGAGATCGACTGACTTTGC CACAGGTGCTGATGCTGCAAAACGTACAAAGATATCTTGTAAGGATATGT CATATTCCCCTTAAAAAAGCTAAAATACTTAGAAAAGCATAAAGCTGTAG CATTCCAGCCTACTGATTTTGTTATGACTATGCTTCAGCATACAGGGATA AAGATCCTTCAGCACAACTTGACTTTCAACAAGAAAAGACTTATAGTGGC GAAAATCAAGATTTGACCAACAAAATATACCACAAAGAGAAAGATGGAAC AAGTGACTTTTCTGGCATCACACTGCCTGGTACTACTTGTCCTACACAAG CAATGGTAAGATTTTTATCCTGTTTGCCACACTAGCTAACACATTTGCAT AAAAATTTAACCGTCAAACTGAGGCATGCATGCTAAGTCACATTTTGTTT TGATTTTTCAGCAGCCCATCACTGGCAGAGAGAGTGCAGGTACCAAACCT AAAGGCACCAGGCTTGAGCGAGCCATTCGGGATTTCGAAAAGTTTGTTGC TCAATGTCAGTATTATATCACATTCCCCTTGAGTATCGTGGTAGGCCGTG GATTAGTGCTGAAAGTAAATTCAGATACTTGAAATTTTCCTTGCAGACAA ACCACCAGCTATCGATAGTAATGAGGTTGACCCAAATGGCCAGGCATCAG TTAAACGGCGGTTGCCTCCAGAAGTAAAGGCAAAGCTTTCCAAGGTTGCA AGACTATCGGTATGTAGTAGTACCACAATCCACAATATTTACTTGTGATT CAAGTTCATCCAAAACTATGAATGTTTTGGTTCCATGCGATTACTTAATA CTTATGTACTTGAGTTTTGACTAGGGAAGTTCAGGAAATTTTCAACCTAA TATATCTTAGAAAAATAATGTCATAGACAGAACACACATACACATGCCCC AGATTTTCGTTCTCTGAAGTTATATTTTACAAGGCGCCCTATGATAATGG TACTCATTTAAATTTCTTGTGTTAACCCAATTAGTTTTATCAGTATATGA ATTAGTGTGTCAGTAGGTCATTTTGTAAATGAATTATTATATTAAACTAA ATTGAACTTATTAAACTATGCAAAACCCTTTGATCTGAGCTTCAAATCGG TGCTGACTGAATTTGAATGGCACAGTATTGCCGGCTGTTAACACTATAGT TTTGCAGACAAATCATGGAAAAATCCAAGAACATGAGTTGATGAATCGCC TCATGGGCATAGTTGGACACCTTGTGCAGCGTAGGACATTGAAGGTGAGT TGTGGTTTGCTGGAAGTAAACAAGCATGTCCTTGGCACATGAGTTTTAGG TAGATATGTTGCTTTGTTCAGAAACTAAATTATATTTTGTTTTGAACGCT GTCATAATGTAAAGCAATTTTTTTAAAGATATTGTAATGGAAGTGCTTTT CATGAGGGGTCTATTATTAATTTTCACATGATCATGTAAACAGTTTTGTA TGTGTTAGTCTTTAGTAGTCAAATTTACAAAGTTTTTAGTTAATAAAATT TAAAACATCATATATTTTAGAATATAGGCAGTAATTGCCAATTAAATTTG CTAGTACGTTTCAGTTTGACATTTAATACTTACTATGTTTACCTTTTCAA GCACAGCTGCAATGAACCCTTACTATGTTTACCTTTTATACTTATTTAGC CTTGTGGAAGTTTGTGGTAATCAGAGAAATGAACCATATCTTAGCTCAGA AGATCCTTTCGAACACTACAACTACCACTTATATGAGTGATAAATCTACT ATTTGGATGCATCTGCGGTCTAAAAACTGAGATGTTGCTAGCAGGAATAT CTTATTTTCCATTACTCTGTAGTTTCTATATCATGCTTATGTTGGTATAC TGTGGTGCACTGATCCTGTAGAGTGATAAAATGACTCACTCAAACTACAT GCCCATGGCATTACCACCCTTTGTGCATTGCTTGTTCACATCTCTAACTC ATGTTACTTGTGAACAGAGAAACATGAAAGACCTGGTAGAATCAGGACTC TCTGCTACACAAGAAAAGACCGATAGGTTGCAGCGTGTAAAAATGGAGAT CAATGAAATGGTCAAAGAACGTCTTGTTGCCAAGGCCAAGGTAAAGATAT ATTGTTGTGTACTACCTCCGTTTGGTATTATAGGTCCCGCACGGTTAACT AGGTTGCCAATTTAACCAACAAAATATAAGTAAAATAATATAAAAATTAT ACCATTTGAAACTTTAGATGCTATATTTTCTAATGATATAATTTTTATGT TATATAACTTATATTTTGTTAGACAAATTAGCGACCTAGGTATACGCGTA GGACCTATAATCCCAAACAGAGGAAGTAATAAGTATGAGGCTTCCATTAT CTTATTGATGTTTGCAAATTCATGTTTGTGACTTTTGATGTTAGATGTTC TGTTGCTTATGTGCTACCAGGTCAATGAACAACAGGATGGTTCAGCTGAC TATTTTCAGGCTGTTACTGACGAAGGAAGAGATTTAAAAGGAAAGTTTGC AATGGATAGTGCGCTGGAGGACAGGATATGTGATCTGTATGATCTGTATG TTGAGGTATAAATCTGTAATCATATGATCTTTTTGAACAAAGTGCACTCT TGATGATCATTTTTTGTTAATCTACAAGGATGCCTGTGGGGATTTAGTAC CGAGATTGCCTTCCTAGAGCTTGTCAGATTTACCATTTGGATGCTATTTA AAGTATACATGAGTAAATTGGTTTTATAATGATAATGATGATTAAAAATA ATATGGATATATTTGATTTTGTTTACCCTGTACCATTTTAATAGAGAAAC CCATAAAAGAGTTGCTTTAACCAAAATCGACTTCAGTTAGATCCTAGCTT CCTTCGTCCTTGTTTGGTTTAGCTGACAAATGTCTGTATACGTGCTTGTC AGGATATGGAGGAAGATAAGGGTCCTCAAAGCAGGAAACTATACGTAGAG GTATTAGCTCTGAGCCCCTGAACCTTTAATTTTTTTCTTCATTTTGTATC TAATATGTAGAGATGCCCTGACCTGCAATTTTTTGCTGTTTTATTTTTTA TTTTTTTAGCTTCAAATTCAAAGAATTTAGCGTTATGATTTTACCTGCTT GTAAGATACATCATTGACTACATCCAGTTTTTTTTTGAAACCTGCAAATA TTATTTTCGAGTTTAAAAAAATAAAGGAATCACTGGAACTCGCGAGCAAA TAAAATAAAATGAGAACAGTCCTTCCACTGCTTATCAGCATTTGTGATTT TTCTTCTACTGCTTTCATTTGGGAAGAGCAAGACCAAGTTGGTTTTATAT TTAATATAGCAAACAAATTTAACTTAGGCATCTCACAATGACTAAAACTT AGCTAAATATGTGATGCCCCCTCTGCTTGTTGTTTCAGTTTGCATTGCGG GATGGTATGGTCTAACATTAATCCAAATATGTCAAATAATGCATGTACTC CCTCCGTTTAGAAATATGAGATGATTTAGATTTGTGAAGTAAATGTATCT AGACACCTTTTAGTATGTAGATTCATTTGAACCTACACACTAAAAGGTGT CTAGATACATTAGCTTCACTAACCTAAAACATCTTATATTTCCAAACAGA GGGAGTAACTGCTTTTAGAATAGGCAGTTTTCAGGTGTATGCACTGTCAA TATTTATGTGGATTTTGGAAACTTCATTTGCTAAGTGGATTTCCTATTAT TGTGGTGTGTTTTGAGTAGCAGAGTGAGGTTCTGCTTCTGACAGCACTAT TATTCTAGCGGGTGCCCACTTTAACTCATGCACACCTGGATTTATCTTCA GTATGCTTATACACTTTCATTTTCTGGGTACTAGCTTGCAGAGCTATGGC CACAAGGTTGCATGGATAAATTTGGAATCAAAGATGCCATATCTAGATCG AAGGAGCGCAAGATAAAATTACAGAACCAGCAGAAGGTAATCATTAGTAT TTACTTTAAACTAGCAGGGTCTATATTATTTTATATACTTTCTACGTTAC AAATAGTTTTGTAATAAACATAGTAGATTTCTGAATTTTATTTAATGCCA CACTGTATTGAATTTGATTCATTGATAAGATTTGTTGGAAATTTAATATA CTCTTCATACAATGAATTGTTAGGTACTAGACATGTTAATTTCAAATAAA CTTAAGTGAAAAATCTTCTGCAATTATAGCATAAGGTACAAGGGTTCTAT AATGTGCAATCCACTTAGTTCGAAGAATTTACATAGAGTTGAGTCCAGCT TGAGATGAAATAATCGTTTACTCTATCCTTTTATGTCCCGTCAATATTGT TTTCGCTATCCCTATATTCTCTGTTTCTTTTATTCCCTACAGGCAAACAA GTAAATCGTGCCAACTCAACCACGCGAGGGCACTAGTATTTGTACTCTCT CTTCCCACGGTAGTCCCAGAAATTAATTGTCACTCGACATGGTGCATGGC TATGCCGCCACATAACCGTCGCCTGCTTGTGCCATGGTGCTGACAATATA CACATACCGGAGATGAGATTTCTGTACTATGTTTCTTCTAGCCGCTGCAA GCTGTTTGGGTCTCGTGTCGACTTAAGTTTGGTCTTTCAACAGCAATTTG AATTATAGCTTGCTCTAGATGTTGATGCTTGTGTTATTTTCTTAACAAAA TGTTTGTGTGAATCATGGTCCTAGAGGAAACAAAATAAATTATGTTATCA TATGTGAACTTTAAACTACTCCCTCAATTCCTAAAAACAGGACGTGATTT TTTACAAAGACCAAGGCAACTGCGCACTTACCCTCTTGTCCCTGGCAAAT CCCATGTTGAGCAGTTATTCACAGTTCTATGAATGCCATTATTCTGACGT TCCTTGCTGTGCATGTGCAAGCATTAGCCATTCTGAGCAAGCATGGCCAA TCTGAGCAAAGGCAACTCTACACGGATTGGCATTGGCGATTTCCATCTCC ATGCATGCACGCATGCGTGAGGGTATAATGGCGAGACGAGGTGAGCGGTT CAGAATGCAATTAAGGCTAGCGCGTCATTAAAGGAGCGGGTGCCATGCGG AGGGTTATATTTGGAAGATTAGAGGGGGAAATGGGGTGTGCTCTGTTTTA TGGAAATTTTAGAGAAGTTTCATGTCGTATTTTTTGGAACAGAGGGAGTG GAGGGAGTAATATTTTGGGAATATTGCACCCTCACGCTGGGCAAGCAATT GCTGGACCTCCATGGTTAGCTATTGTATCCAGTGTTACAGATCAACTTAT CACGAATAGGAGGCTGAACCTATCTATGATAAAAGATATCGCAGATGGAT TACCATATTAACCTGTCAGCGACGACTGATCATCACATACGGCGTTATGC CTATCCATCAGCGATAAGTCATACTGACAGTTGTATTTTTTGCCTGCTTT GATAAGCTTCACTGGTGGGATAACCGTCAGAGCTGATGCTTTTTACCCTC TCAACCTGATCCGTGGCAGTGATCGATCATTCATGGTTGTGCCATGCAGA TCAATCCGAGTGTTCGGACTATAAATAGACCATTGGATTTTGACAAAGAT TACATCACGTGAATCATTTATATCTATATATATATCAAAATTTAATTCTT GAGTCTTTCAGATTGTAGATCTTAATGCAAAATATAAATATATACGTCGA TATAACTTTTTTTGTGAACCACGTGAATCATTTATATCTATATATATCAA AATTTAATTCTCGAGTCTTTCAGATTGTATATCTTAATGCGAAATATAAA GATGATATCTGTCCAAGATATAACTTTTTTGATGAACCCCAAACACAGCA CTTCAAAGACGTTACCTGGTTGTTTGCACTGATGGAGCATTATCTTCTCA AAAGCTTTGGAAATGTCCGCAAACGTTCCTTATAAGTATTCTGAACAAAG TACTAACTGAACTGAGACATGTTCGTGTGTGTGTGTAAGTCATCACATAA ATTACTGGATGTTGCTTACATATAGTTCCATCATGTTTGATTTGAGCTTA TCTCTGTGCTGCTTTCACTTGATGAATCACCATCATTTCTTTTCTATTAA TTTTAATATAATGGATATACATAGTTAGAATTAAAAGCTAAAGCTGATGC AGCACAATGATGAGCACCTATGATTGTATGAAACATGCTGTTTCGTGAGT TATATTGAAATTATGAATTGATATTTTTCTGGCAAACTTATTTGTGTGTT GTAGCTAGCCTCATTTGTTATTACTCTTCAAAATAAAGTAAAATACACAG GGTGTCGATCTAGCCTGCTAATTTATGTTGATGTTTCCAGATAAACCAGG TTCGCAACGAGCAGACATTGAAGAGGAAAAGGCTAGCTGTGGCAGAGAAA CTGCCAGCTAGCTACCCTGTTGTAACGCAAAGAACAATGGCCCTGCAAGC TGCACATCCATCCATTATGAACCCTGTTACATCATACCCTCTGACTGACT ATGGACAGAATAAGGCATCGACAAGTCTTGAAAGGGTTCATGATGCAAGC GTAGGCGCAGTCCCCGACGACAACATCAAAAGGGTTGCCGAGATGAAGAA GAAAAAAAGGAAGCCAGAATCTGATCTTGTAGATACACAAGCTAATCCAA TGAAGGTTCCCTCGCTGCATGGTAGCGAGAAGCAAAAGGTTTCGAGGCAT TCAGATGAGGCGAACGCTATCAACATATCAACTGTGCTTGGTCTCCCATT CTATGATCAACAACAAAGCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.