Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA008582

[Submit comment/correction]

Sequence	AA008582
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA008582
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTAAATACTACCCTTAGCACCAATGTATTTCCATACACCCACCCACCCCC TCGTTCTTCTTTGGCGATAGGACTCGCTGTTCCCCTCTTCCGTGGCGCTC AGAGCAGCCAACCACAAGTTTCCGCGGCAGGCCGGCAGACGGCGCACAGG CGATAGGACACCCCCTCTTGCCCCGTTAGTCCTCCTCTCCTGGTTCATAC TTGTCTCGGTTTTAAATTCCAATTTCCGTTAAAATCTTGTTTTGGTAGCT CGGTTTAGTTTCCGATATTGGTGATCTAGCTTCTCCGACATAGGCTGCGA TTTCGATCGGCAACTTCAAAGACGCACCTCACGATGGGTTCTTGTTGTCG TTTCCCCCGTGCTACGCTCACCGGCTGTTTGATGAATTGTGTTATTGGTG CTGCTTGCCTGCTTTACTGCCGGCCCTTATTATATGCACACCAACTATTT GATAAGTGATGTTACGGGGCTGCATGTACTCTGTGTGCTATGCGCAACAA CTGTTTGATGAAATACTCATCCAGCCAACCTGTGTTGCAGTATCGTGCTG TGAGTAATGAGGCTTACAACCTACCGTATCTTCTTAAACACACGTAGAGG TAACTTCATCACCAGTTGGGAGGAGATTACGAAATTCAACCTGACGCACT CATCTGAGCACCAGAACTAAACGAAATTGTGCGTGTTCTTGCAAGTAATG GTCTATACCATCAGAAACTTGGAGGGATGGTTTTATTAATAGTAATAATA TCCAGTTCACGTTTAGAAGCGAAGGTAGGATCTGTTCGGTGTGTTGTAGT GCTTTATTCATATATATGTAATTATTTGTAAGCTATGGAAGCCATTTTTA AAAAGCATTGCTGGATTCACTTCACAGTTTAGTAGCACTAATGTGGTGTG TGCCTGAATTGTTTGCTATATGACAGGTTGGTCTTCCCAAATATCTGTCT CTTGCTACATTAAGCTCTTCTGTTCTTGGAAATGGCAGCACCAAAGCCCA TTACAAGGCTTATTTCTCACGTCATTCTTGATTTGGATGGTACCCTCTTA AATACAGGTGACTGACTTGCAAAGTTTTCCTGTATTTAAAGTTGATCATC CAAGGTAAACTCTGAATTCTCATCTTTGTTTGCCTTGTTTGTACCATTTG GCAGATTGTGTTGTAAGCCAAGTGCTGAAACCATTTCTTGTAAAAAATGG GAAAAAGTGGGACAGTAAGAAAGCTCACAAGTTTGTAGGGAAGACACCTT CTGAAGCTGCAGCAGTTGTTTTAGAAGATTACGGACTCCCTTATTCTACC GAAGAGTTTCTCTCTATGATTAATCCAATGTTCAGCGAGCAGTAATGTCA CAGGAACCTCTTTGTACCTCTCTATGCTTTGCAAAATGCATTTTTTTTGA GCTGAAACTGTAGGGTAGGCCCCAACAGCAGATTTTATTAAAAGGAAATA ATATTTACAAGAGAGGGAAAAGGAATTTACAGGACTTAGCCCGGGGCGTA GCCAAAAGAAACTACAGAGCATATCTAGCCAGGCAGTGAGGGAGGATTTC AGATCCTCCTTCATCCTATAAGAAAGAAGGAAGAGGTGATGCAGCACAAA GGTTGTGGAGGAACAACTCCACCTTGCTGCTATAATAAAGACAGCACAAA TGTTGAAGGAACCACTCCAACGTGCTGCGCTAGATATCGCTCTAGGGGCG TGAGCTAGATATCACTCTAGAGGCGGGGCCGTCAAGAGTTTAATCCAAAA CTCTTAACACACAAGATCTAGTCCAAGATCTTAAAACAGGAACACAAAGT TCTTTATTGATAGGTGAAGGTTACATAGTCTGCGTTCCATAGATAGAGGT GAGGACCTCTATTTATAGGCCTCATGAGCCTCCACTTCTTAGTTCTACTT ATAGCTAGAAGGCTCTAGAGAATACTACTTAAAACTAGGAAGTAAACACA AACAACATGGTTACAACTCACACTAGAACACTCCAGAAACTACTACAACA CATATGACTAAAAGACCAAATTACCTAGAATATAGTAGAAGCGTGTAGAA ACTAGTACTGGATTTTATTACTATTTTATTCCCACTACTGTCCCTCATCA CCTTTCCATCAGTTCGGACTTTTGGTTTAGATGGCTAGTGCATCAATTCA ATACTTTGTGCATAGTTTGACAATGTCCATCCACCAAAAAGAGCTAAAGA TGGTGGCTTGTGGTGTAGAATTGTTTTAACTCCTCCAAATCAGGTGGACC CAAGGGATGTCCTCTTGTTGAAAAATTTATGCAAAAAACTTGATGAGAAG GGCCTCATTGTGAGCAACGAGATTGGTGATGCCTAAACCATCCTTGGATT TTGGCCTGCAAACTAGGTCCCAAGCCGCCAAGGATTTAGGTCTGTTAGAA TTATCCAACTAGCCCCACATGCCAATTCTTCTGGATTTATCCACAATTTC AATGGTCCCCTCGGCTAGCTTAAGAGTGCACAAGTAGAAGCTGGGTAGCG AGCTTAGAATGGCCTTAGTCACCTTGATTTTTCCATCCAGTGGGAGAAAA GATGCAGTGATTGCAAGACGATGATTTATCCTAGAGTAGAGTGCGCCAAT GTCGCAGATGTGGGGTCTGCTTAGGCCCAACGGAGGCCAAGATATGTGAA GGGGAAAGTTTCCAGCTTACAACCAAAAATACCAGCCAGGAGGGTCGCTT TCTCATTAGTGAGATTAATGGGGAGGATGCAGGACTTGGCAAAATTAACC CTGGGACCTGTAGATTGAGCAAAGCTCTCGAGTATGCCTTTAAGGCAGAG GAGCTGCCGAGGACAAGCTTGCATAATTAGAAGGGTATCGTCCGCATATT GGATAATTGGAAATTCACCATTAACCGGCGGGATGGGGTGGTGGAGGAGG TTAACCAAGGAAGAAAATGACGCGCTATGAGATTTAGCGCCGGCTTCCCA AGATGATATACACGCTATAACTTGCTATAGCGTGCGCTATTTAAAATTGC TTTTGCAAAAAAATAATGATAAATATAGTCTAAACATAAAGGATTTCAGC ATCTAAAATTTGTCCAGGAACAGTTACATGCATAACCATTAAGCACAATA CATAAATAGCATAGGGACTGGGGAAAGTAATCGATCTGGTGGAGGTTGGG CTAGGTTAGCCTGTAGTATGGACCCTGGAAGGGTTTTGGGCCAATGGGCT GTAGTTTTTGCAATGCTAGGAAATAATGGCGCTACAGCGTTATGACAAAT AGCGTGCTTTAACAATGCTAACTTGAGATTAGCGGTGTTGAGCCAAAATA GCTTAAATGTAGCATCGACGCTCCAAATACACTCTAGCGTGCACTATAGC ACGCTATTTTTTTCCTTGGGTTTAACTGCCAAGCTTTGTTAATAGTCTTT GAAGAAGATCCGTGGTGGAGACATAGAGAAGAGGAGAGAGGGGATCACCT TGTCTTAGGCCTCCACAGCAGTGGAAAGTTTTCCCTGGGACACCATTTAG AAGGACCGAAGAAGTGCCAGAAGTGAGGATTGATTTGATCCATCCGTTGA AGCGGTCATCAAAATCATAATGTTTCAGCATAGAAAGGATCGCATCATGT TCAATCATGTCAAGAGCTTTAGTGAAGTCGAGTTTTAGTATAATGATCTC CCTTTTGGATTGATGACATTGATGAAGGAATTCAAAACTCTGGGCGAGAC AATCCTGAATAGTCCGGCTTTTAATGAAGCCGTATTGGTTCTGATGAACG ATTTTGAGGATCACCTTTTGTAGATGGTCCGCACGAAGCTTGGTGAGTAA TTTGAGGCACGAGTTGAGGAGCGAAATGGGCCTGTAGTCACCTAGATTTT CAGGATTGGGGACTTTTAGGATCAACATGATGTGTGAATTATTAATTCAT TGGAGATTGACGGAGCCATGAAAGCACCAAGGCAAAGAGCGTGAACGTCA TTTTTAACAATGTGCCAGCACCTCTTAAGAAACACAATGTTGAAATCATC CAGTCCCAGAGCACGGTCTGAAGTTAAGGATTTAATTATATTATCTATCT CTTATGAGGTGAAAGGGAGGGGCAGAGAATCCAGCCCATCCGTCCTATTA ACGAGGTTGCCAAAGGAGAAACGCATGGTCGGATTATCGTAGGATCCCAA ACACTTGGAGAAAGTATTCCAAATTATAGCAGCTTTGGATTCATGGTCAT TATAGGGGATTACCATGGCACTGCAGTGGGACATTTATTCCCTTTTCGGC TGCATTTTGTCCATAAGCTTGATAAAGTAGATTGGTTAGTTCAGTTTCAA TTGTACATGTGTATGTTCTCTTATCAATGTTTTTTCTCCCTGTACATTAT TTTGAGTTACTGAATACCCTTGGCAGCCTACTTTTGAAACAAAAAAATCT CGAATGCTGCTACTAGAAATCTTAAATCATACCTTGCTGAGGTGTGCCTA TGTTCTTGTGTTTTCATCTGCATATGCACTTGTTATGCATTAACATCTGC ATGCTTGGCTGTACTGGTAGTGAATAATTCATGGAAACGATAATAATACA ATGTTTATATAGGTTGACTTCAATATATCTTTGTGTTTATTAGTACATGC ATAAGTTATGCTACTTTCCTGCTCCTCTACAAGCAAGCATCTGGTATAAC CATTATGCGGTTTCAATGCAAAAAAGGAATTTCACTATTTATGACTAGTA TGCTTTAAAATTGCGCATTGAACTTATCAAATCACTGCAGAAGGAATTCT GCAAATGAGTTAGAATTACGTTTGGTCGATCTTACTTAAGCTCCATCGAT GCACTTTAAACAGCAAAGTGAACTCTGAGTATAGTGCAGAAAGTACTTAT TAAATAGAAAGGAAAAAGAAATTTCCTCATTCTAATGGTAATGGAAGCAT GTGTACAGCTCTTCATGATGGTTTTCTTACAGTAACTTGTGGTAAGGTTG TGATTGGTATTGGGCATGATGACAGAAGTAGTAAACTTCTCTCATGCTGT AATGTGTAAATTGTCCTGAAAAAAATCCAATGTATTTTTCACTTGCGATT GCATTCCTTCAGATATGTGACCAGCATATTAAATTTTGTATCCCAGATGG GGCAATATAAAAGCTCTTCCAGGAGCTAATCGGTTAATAAAACATTTGAA GAGTAACAGGCTACCAACTGCTGTAGCTTCCAACTCTTCAAGATCAAACA TTGATTCCAAAATTTCCTGCCATCAAGGTACCCTTTTCCGGTTTCCCCTA CTTCAGAGAAATCTGAAATCTTCATGTCCTTCTTTGTATTTGGTGAAGTG GTTTATCAAGTAATTTACTCTTATGATGTCTAGGATGGAAAGAGTATTTC TCTGCGATTGTTGGTGCAGATGAAGTAGAGAAAGGAAAGCCATTCCCAGA CATGTAAAACAGTGTGCTATATAATGTTTTCATTGCTGATACCTTATAGA TTTGTGATATTTATCTCGTTTAGTTGCTCGTGTTCTGCTCATGTGGTGGT ATTCAAGATTTTTGGAAGCTGCAAAAAGAATGAACGCTGATCCTTCAAAT TGCCTAGTAATTGAGGATTCCTTGTAAGTTTAGCCTTGGCTAACTTTTAT TTATTTATGTTAATGTTGTGTCCATGGAAAGGTTAGATACTTACAACATG TCACACTCTGCAGTGTAGACATTTTTTTGGTGGAGCACTTTTGATGGAAC AGAGTTTCATGTTTTGAAATGCCTGGATTGGCATGGAAATTTGTTTTTTA TTTCTCAAAGCTACATGTGTGGCTGCCTGCAGTAAAAACATAGTTTCAGT AACCATCCGATAGCTAAATCAAGAAATGTATTTCTTGCTTTAATTTAAGA AAAGAACATTGTCCGTCTATTTGACAGAGATAATTTCTGATATGACCGTT CTTCCATATCATAACATCCTACAGTGGTACTACTTGATTAATTCACTTAA TAATATTAATAATAAATCTTTGCAATAATTTTGAATGATGTAGATGCATT GGTGTTCCATATACTAGGTATATTGGGTTTTACATCTACCACCTGTAATT GTATTGTTTTTCTGGTCTGCACTCACTTTACTGGTTTCAAAATTTTAAGT TTAGCCTGTAGGGTCACAACAGTATACTTTAACATTGTCAATTAATGAAT GTGCCAGGCCAGGTGTTTCGGCTGGTAAAGCTGCAGGAATGCATGTTATA GCTGTACCTTCAGTACCCAAAGAGACTGATGAATTCAGCTCTGCTGATGA GATTATCAACTCCCTCCTTGACTTAAGGCCTGAAAAGTGGGGTTTGCCAC CCTTTAATGATTGTATGCTCTAATTCTTGGGACTATCTGTTTATCATTCT TAAGATTATGGACATACTCAATATATCTGGTTTTGAATCTTCTGCACAGG GATTGAAGGTACCTTACCGATAGAACCGTGGTTTATTGGTGGACCTGTGA TCAAAGGATTTGGTCGTGGTTCTAAAGTACTAGGAATACCAACAGGTATG GTGGAACATGCAAGTGAAGATAAATTTCATTAGCATGTTTTAAAGCCTCA GAAGAGTATAACTTAGTGACTTCACATGCTATCACTTCTATAATTGGTTT TGTATATATGTTATTTGTTTTGTTCATTCACGGAATTAAAATATACTCTA CCAGTTCATTTTTATGGTTTTCTTAATAGTAGTACACTCTTCTCGTTCAC TGATAATTTTATATTTGTCTGTCTTGTAGCGAACTTACCTGCAGAAAACT TTTCCGATATACTGTCAGAGCATACATCAGGTGTATACTTTGGCTGGGCT GGACTTTCAACGCGAGGCGTATATAAGATGGTCATGAGCATTGGTTGGAA TCCTTATTTTGACAACACAGAGAAGACTATTGTGAGTGTTCTTTGCACAA GGTGTTCAATGTTTGGTTTTATTAATTTGCTCTAAGAGGCATTGATTTCA GGAACCATGGTTGCTTCATGGTTTTGACGAGGACTTTTATGGAGAGGAGC TGCGCCTGGCTATTGTTGGGTACATACGACCTGAGGTAAATGAGGACCAA TCAACATTTATACAGGCAAAAGTAAGTTCCATTTTCACTAACTTGTGACA CTACCTCTCAAATGCTTAGGCCAACTTTCCTTCACTTGAGAGCTTGATAG AGAGGATTCATGAGGATGGCAGAATAGCAGAGAATGCCCTAGATTTACCG GAATATGTCAAGTACAAAGACTCGCCATATTTGAGAAACCCTTTGCAGCA GGGCACCAATTCTAATAGGAAAGTGGCAGAGCAAGAAGAGTTGAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.