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GrainGenes Sequence Report: AA028679

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Sequence
AA028679
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA028679
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCAAAGTTTGACTGTGAAAACTGTTTGGACTTTTCCAGATGAACTCAATG
GAGAAGGAGATTAACCGGCTCACGAGTTCACCTGCAACAGCAGACATGGC
AACATCCATGAGATTGATGAGGGAATCTGCTGGCCGGCACACACTGACGA
CTAAACCATTGCGGAGGCTCTTGGCAAAATAGAAAAGTCAGCTGTACTTG
TACTATATATTGACACAGATGGTAACGTGTATCCTTATATAATACTTGTA
CTTGTACTATATATTGACCCAGAGCCCTATGGAATACACAAGTTATGTTC
CTAGCACAAACATGTGAGAACGACAAGCTAACTGTCCAAGCAACATGACA
AATTTAATTTAATATTGACAATAAGTAGGTCCAAATAGATTATTGATCCA
TAGCCAAATGCAAGTATTTTAATTATGTTTGCATTTGTATTTCACTGGAT
CCTACGTTTCACATGGCATCCTATATATGTGCACTTTACTCTAGCAAAGT
TTGATCCTGGAAGTTGTTAGGGATTTTCCAGATGAAGTTCAGTGGAGAAG
TAGAGCACAACTCATTGCCGCCCTTTATCTTGCTCAGTGATGAGAGTCAG
TCACAACTCCATCTGTGAAATCTTATACATAACCTGTTTGTCTGCGCATA
TGTTGCTAATTTTTTACTAGTCTAGTCTTTAGTCGAGTGGCTTCTAACCT
CGTTGAAGGCTGTAACTTTATGCAGGGATTGGTACCTCATAGTGTCCAGC
ACGCAGTATCCTCCACGCTTGGCCTCTGAGAGCATCTTGAGCTGTACTAT
CATCCCGTAGTTGGTTATTTATTGCGCAGCCACCTCCTCAACGACGGTGC
CGACTCTCATCAGGAGGTGCTGCAGCCTCTCCATCTTCTCCTATGATTGT
GCATGGCTCAAGGAGTGTTACTTGTTCACCAGGAAGGAGATGAACCGGCT
CACGAGTTCACTTGTAACTGCAGATATGGCGGCCTCCATGTCCAGCAAGA
AGACGATCAGTGAGGGGACCACCCTCTGCCAAGTAGACAATTTGCTTAGA
GAAGTCTCCAAACCATTGCTTGTGACGAGTTCAAGGGTGAGTGACACTAG
TTGCATCCTTGCACAATAGTTGTATTTGTACTATAGGCTTAGGCGCGTGG
AGTACTATAGTTCTAGGCCCATGGCATATTCTTGGTCAGTGATTAGATTC
ACAACTTTCATACTTAGAACCCATTTAGTCTGCGTGGCCTAGTTTATGCT
AGTTCAGTGTTTAATCAGAAAATGTTGCACCTTGTGCATTCTTCAGAGTT
TAGGCTTGATCTGATGTTCGTCTCCATAATGTTAAAAATGGAAAATGTGA
AGCTAAAATTAATTAACATAGCAGTATATAGTATTCATCTCTTATGGAGA
AGCAGGACATGCACAACTTATCAAGCAGACTTATCAACATGTGTAGTGCG
AAGAAGTAAATAAGAATAAAAAAAAGGTTAACTCTTCTAGCATTTCATTT
ACCTGAGCTGGTGCTATATAGCAACAGCCACATTAGGAAGTTGAGCACTA
TAGTTCACTTTAGATTAACATAGGCTTAAACTGGTAACAAGGAAATGGTA
AATGAAGAGTAGAATCATGCCATTGTGTATACTTGGTCATTCCCGAGCTG
TTGGGTAACCTTGAGTGAAGGCGGCGAAGCAAATGACGCTCAGTCTCCTG
TTTTCCCCAGCATCAGATTTAGAGTGTGTTCTGAATGTTCACAAGTTCTC
AGAATACTTACATACGCAGCACTGTCTTATGTATGTTCAGTTTTCTCACA
ATGGTATATGGGTCAGGCTTTGTGCCATGGTGCGAGATAATGCTGTTATA
GTTATCTAAGATACGCAGGGGTGGTTGAATCTGATAGAATACACGATTTT
ATTTAAATTAATATATCTATTACATTTAGTCCAATGGTATATAATAATAC
AAGAAAAATACAAGCATTACAGTATACGAGTTGTGAAACAAAAGTTATAT
TGGTGCTCCTCGTCGCTTCCTCCCAGACAAGGCACTATTACCTTCATCAT
GTGTGTTCTGAGCATGACTTGTGACAAAGTGAGCAAATGAATTATAAGGG
GGCATCCTTGATTCCCATGAAACTAGCATGAAGTCTTCCTTAGGTCTAAC
ACTAGGATCTGCTAGAAGTTCCCGAAATGTCACACTAGGGAATTCCTCGA
TTGAAACATTATGTCTATAACGTGTCATGCTAAGTGGATGCAAGGCAAAG
TCCCTTATATCCACCGGCTGGCCTTGTTCTACATGCATGGTTGGGTGCGC
ACCATATACAGAGAGGTTTCTTTTAACCATTCTTAACCCCTTGTCCAATA
TGCAACTCCAAAACTGAGCATCGAGGTTCCTTCTCAACACATCTGCAAAG
GCATTTGTTGCGACAAGTGAACCTTGCATATTATGCAACACCTTGGCAAA
TTCATCTGCTATTTGTACTAGCCGAGGATGTTCTGCCGGGTCTGCACTCC
CAAATACCAGTGTCTTAAAAAGGTACCTCAACTCATCGTAAGACAGAACA
CTTAGGGAAATCGGTTTCACCGATCCAAAACGGGCTAATCTTGTAACTTT
ACTTATGATGATGATCTTGCTTCCCCTGCCCATTGTTATGACAAATGAGT
GAAACCTTTTCCAGTCATCATCACCTACATCAGAAGCAAACTCAATAACT
ACCAACATCATCCCAAACGTGGTTCTTCTCTGGTCAATTATCCTCATTAG
GTTATCTCCATTCAAGTGCAAAATGGAGGAGAAGCGCGAGCGCACCCTTT
CGTCACCACACGCATGAGCAACCAAAGTTTTCTTCCCAATTGCTGCACCA
CCTATGATCGGAAGAACTGCTGGTGTGTGATCACCAGCAGGGTCGTTATG
ATGCAACAAGAAACTCAAGAGCTTTTGCTTTTCAGCGTGCCGTCCGAACA
TGTAGTTTTCGGTGTAAACATAAACATCATATGGCCTACGAGACATGCTC
TCGCACCCACCCAGAAGCACAACAAATTCTGCCATGTTAGCAACAGCCAT
TTCTAAGCTTTCCATGGCACCATGTGACTCGAGTTGTGTGGCCTTATCAG
TTGTTGTTCGAGAACGCTTGGCTATGTACAAGCTGCTGCTATATGAGTTG
TTGCTGCTAACCTCGTCGAAGCTTGTGCCATCTTGGAGGGCTCGGTACAT
CGAGTTATCCAGCACACTGTATCCTCGGTACATGGCCTTTGAGAGCGTCT
TGAGCTGCATCATCATCCCGGAATTTGTTATGTATCGCTTGTCTGCCTCC
TCGACGATGGTGCAAACTCTCATCAGGAGATGCTGCAACCTCTCCTCCAC
CTGCTCCTCCGATCGTGGACGGCTCGGGGTGTACTTGTTCAGCAGGAAGG
AGATGAAGCGGCTAACAATTTCACCTGCTACTGCAGACATGACAACCTCC
ATGGTTTGGATTGATGAGGTGTGCTGTTGGTTGGTCTCTGGACAAATTTA
ACTAGGCCGGCCTCTGTGAAGTCTTGCAGTTACTCTTGGCTAAATAGAAA
AGTCTCCATGGATGACTTTGACTGTGATGATGAGAATACCAACTACATAC
TTAGGTATTAATCTTCGAGAGAGGATGTAATCATTTTGTTTATACATTGC
TCCTTTGGTTGGCTTTTCCACCAATTAGTTGGTGTGGCTTATTTTGTGAT
AGTTCAGTCTTTAACCGAAAACTGCTGCACCATGTACATTCTTCAGTCGT
AAGGAGATTAACTGGTTCACGAGGTTACCTTCAACTTCAGACATGGCAAA
CTCCATGGGATTGATGAGGGAAGCTGCTGGCCAGCATAGATGGACGACTA
AACCATTGCGGAGGCTCTTGGCAAAATATAAAAGTCAGGGACAAGTACAC
CATTGACAGTGATGAGTTCAAGGGTGGGTGAGACACAGACGCTGACATGT
ATCCTTATGTAAATACCTGTACATGTATTATATGTTGTCTCAGACCCCCA
TGGAACTCACAAGCTGCGTTCCTAACACAAACATGTGAGAACGACAAGCC
CACTGTCCAAGCAACATGGAAATACATAAGCTTTTCCATAGAAAATGCAG
TATTTTAATTATATTTGCATTTGTATTTCACTGGACTACATGGCATCCCA
TATATGTGCACTCTACTCTAGCAAAGTTTGACCATGGATATTGTTTGGGC
TTTTCCATATGCAGTTCAGTGGAGAAGCAGGGCTCAACCCATTGGCGAGG
AAATGGTATGTGCCCTTTATCTTGGTCAGTGATGAGAATCACAACTCCAT
ACTTTAGTAGTAATCTTTCAGAGGACATGTAACCAGTTTATTTGTACGCT
TGGTCCTTTGTTTTTTCAGAACCTATTTAGTTCTGTGTCTCATTTTGTGC
TAGTTCAGTGTTTAATCAGAAACTGTTGCACCTTGTCCATTCTTTAGAGT
TCAGGCTTGACCTGATGTTGATCTCCACAATGTTTAAAATTGAAATTGTG
AAGCTAAATGTAAGTATATTATTCATCTCTTATGGAGAAGTAGGACATGT
GCAACTTATCAAGTAGCCCTTATAATCAGAGGCTTAAATTGCACCTAAAC
GGCTAAGAAATGGTAAATGAAGAGTAGAATCACACCATTATGTATACTTG
GTCACTCCTGAGCCGTTAACGAACCTTGAGTGAAGGTGAATCAAATGATG
CTTTGTCTCCTGTTTTGCTCGGCTTCAAATTTAGTGTGTTCTGGATGTTC
AGAAGTTTCAGAATCCTTGTATACACAACACTTACGCATTCTTTTCTTAT
TTCTGTTCAGTTTTCTCACCTTGGTGTATATATATCAGGATTTTTGCCAT
GATAGAAGATAATGTTGTTAGTTATCTAAGGCATTGTGTTATTAGTTAAT
TTTTTGGCACATCACACACAAATCTTCATCTAATTTTATACAGTATTAGT
TGTTTGTTCATCGGTCGATTGAAGCCTGTGCACCTTCATGCTATCAACAG
GAACAAATTGCTATTCATAAACTATGCTATGACAATGATACTAGTTATGA
TGGTGCATAGAGCTCTTTCTTGTTAGTTTAGTTTCTGTTCAGGTTAGTTA
GCCACCTTATTAAAGACTAGCTAGAGCTACTGAGTGTTAGTAGATGTCGT
TGTTGGTTACTTAAGAAGATCTGGGGGATTGATCTGATAAAACATGCAAT
TTTACAGTTACTTGAGATCTCTAATACATTTGAATGAATCGTATACATGG
ACACATCAATTTGTTTTTAGATAAATAACATCCATTTGTCATGTATAAAT
CAATACAAACAATACTTAGATTACATGAATTTTAAAACAGAACTAGATCG
GTGCTCCTCGGCGCTTCCTGCCTGGCAAGGTATTTCCTTCATGTATATCC
TCAGCATGATTTGTAGCAAAATTAGCAAATGAATTATATGGGGGAATCCT
TGATTCCCATGTAATTAGAGTGAAGTCTCCTTTTGGTCTAACACTAGGAT
CTGTTATAAGTTCCCCAAATGTCACACTTGGCAATTCTTTCTTGACTGAA
ACATTACTTGTATAAGGTATCATCCTAAGTGGATGCAAAGCAATGTCTGT
TATGTCCACTGGTTGGCCTTGTTGTACAAGTGTGGATGGGGGCACACCAT
ACATGGAGAGGTTTCTTTCAACCATTCTTAACCCCTTGTCCAATATGCAA
CGCCAAAACCGAATATCAAGGTTCCTTCTCAACACATCCGCGAAGGTATT
TGTTGAGACAAGTGAACCTTGCGTACTGTGAAGCACCTCAGCATATTCAT
CTGCTATTTGTACTAGCCGTGGATGTTGTGCCGAGTCTATGCTTCCGAAC
GCCAGTGTCTTGAAAAGGTACCTCAACTCGTCGTAAGACAGCATACTTAG
GAAAATCGGTTTCACCGATCCAAATCGGGCTATTCTTTGAAGTCTACCTA
TGATGATGATCTTGCTTCCTCTGCACATTCTTACGAAAAATGCATGAAAC
TTTCTCCAGTCATCGTCAGATACATCAGAAGCAAACTCAATGACTACCAA
CATCTTCCCTTCCATTGTCCTTCTATGGTCATGTATTCTCAAAAGGCTTT
CTCCACTCAAGTGCAAAACAGTGGAGAAGTGTGAACGAACCCTTTCATCG
CGACATGCATGAGCAACCAAAGTTTTCTTCCCTACAGCAGCACCACCTAT
GACCGGAAGGACAGCCGGTGCACAATCACCAGGAGGGTCATTGTGCTGCA
GCAAGAACATCAAGAGCTTTTGCTTCTCAGTGTGCCGGCCAAACATAAAG
TTGTCAGTGTAAAGATAAACATCATAGGGCCTACGAGACATGCTCTCGCA
TCCACCTAGAAGCACAACAAACTCTGCCATGTCAGCAAGAGCGTTTTCTA
AGCTTTCCAGGGCACCGTGCAGCTCCAAACGCATGGCCTTGTCATGCTTC
TCAGTTATTGTTCGTGAGCGCTTGAGAGGAATGGCTAAACATAAGCTGCC
TCTAGATGAGTTGTTGCTGCTAACCTCGTCAAAGCCTGCACTGCCTTGGA
GGGCTGATCGGTACCTCATGGTGTCGTGTACGCGGTGTCCCTGGTAGATG
GCCTCTGAGAGCATCTTGAGCTGCACCAGCATCCCAAAGTTGGTTAGGTA
CCGTGCATCCACCTCCTGGATGACGGTGCCAGCTCTCATGAGGAGCTGAT
GCAACCTCTCCACCAATTTCTCCTCTGATTCTGCATGGCTCAAGGAGGAG
TGGTACTTCAGGAGGAAGGAGATTAACCGGCTCACGAGCTCACCTGCAAC
TGCAGATATGGCAACCTCCATGGGATACGGAAGCTGCAGGCGGGCACACA
CAGACGACTAAACCATTGCAGAGGCTCTTGGCAAAATAGAAAAGTCAGGG
ACAACACCATTTACAGCATTGACACTCAAGGGTGGTGAGAAACGGACGCT
GACATCCTTATATAATACCTGTACTTGTACTATATATTAGCCCAGAGCCC
CATGGAATACAGATTGCTTTCCTAACACAAACATGTAAGAACGACATAAT
ATTTTTTATATAATATTCACAGTAGGTAGGTCCAAAGTGGTTATTATCCC
ATAGAAAATTACAATTATTTTAATTGTTTATATTTCACTGGACTCCTACA
TTTTACATAACATGGCATCGCATATATGTTCACTCTACTCTAGCAAAGTT
TGACCATAGAAATTGTTTGGGCTTTTCCAGATGGACTTCAGTGGAGGAGC
AGGGCGCAAGTCATTGGCGAGGAAACGGTATGTGCTCTTTATCTTAGTCA
ATGATGAGAAGCACAGATCCATATTTTAGTAGTAGTCATCTTTCAGAGGA
CATGTAGCCAGTTTCTTTGTACGTTTGGTCCTTTGATTCTTCAAAACCCA
TCTAGTTCTGTGTCTTTTTTTTTTTGGTAGTACATCTAGTTCTGTGTCTT
TGTGCTAGTTCAGTGTTTAATCATAAACTGTTGCGCCTTTTGTGTTCTTC
AGAGTTCAGGCTTGACCTGATGTTGATCTCCACGATGTTTAAAATTGAAA
TTTCAAAGCTAAATGTAATCAACATATCAGTATATATGATTCATCTCTTA
CGGAGAAGTAGGACATGTACGTAAATCAAGGTGTCTAGCACGCTGTATCC
TCTGTACATGGCCTCTGAGCGCATCCTGAGACGCGTCATCATCCCAGAGT
TGGTTATGTATCGCCCATCCACCTCCTCAACGATGGTGCTGACTGTCATC
AGAAGATGCTGCAACCTCTCCACCCTCTTCTCCTCTGACTGTGCATGGCT
GGAGGAGTGGTACTTGTTCATAAGGAAGGAGATGAACCGGCTCACTAGTT
CACCTGTAACTACAGACATGGCAACCTCCATGGCTAGTGAGAAGACGTTT
GATCAAGGAAGCTGCTGCTTGCTCGGTCTCCCTAGATAATTAACTGGCCT
TTGGCGAACAAGCCAAGTTTCCTGGGATGACTAAATCGTTGATTGCGACG
AGTGGTTGGGTGCCAGACGGATACTTGTGTAAATGTCCAAACATGTGACC
AGGATTATCCATCGCTGAAGTATATATTTAATTCTCTTGCATCTGTCTTC
TGTTGGGCTACTTTTTATATCATACGTATGACGGAATGGCTAAGTTTGAC
CATGCAAACTGCTTCGACTTTTTCTAGATGAACTTGAGCGGAGAAGCAGG
ACACGACTCGTCATCAGCAAGGAAACAATGCTCGCCATTTTATCCTGGTC
AGTAGTGACGAGAATCAGAACTCCACCCTTGAATTATCTTCTAGGGGTCA
TGTAACAAATTTCTTTGCACGTTTGCTCCTTTGACTTCTTCGGAACCCAA
TCAGCACTGGTGTAGCTTATTTTTGTGCCTGTTGACTTTACCAAGAACGG
TTCCACCTTGCGCATTCTTCATAGTTCAGTGCTTCACCTGACGTGGGAAG
CTGCTGGCATCCGTGTGGCGAGTTCAAGGGTGGCATGCGTCCAAACTTTA
TGATAAGGACACATGCCAACTGTCCGAGAGGCATGAAAACATTGACCAGT
ATTATTAAGGTATGTCATTGACATCCACAGTACTGGGCTATGTCCAAACT
AATTAGTTATGTTTGCAAGATGTATGCTTAATAATTGTCGTTGCATCTGT
CCTGTCACATTTTACATATCAGGAGTTGGCATCCCATATCGGTGCCACTA
CAGTAGGAAAAATTGACAGTGGGATTTATTTGGGCCTTTTTCCAGTTGAA
CTTCAGCGGAGAAGTGGTGCTCAACTCGTCTAAAAGACGACTGTTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.