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GrainGenes Sequence Report: AA026626

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Sequence
AA026626
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA026626
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACGCTTCCACTGCCACGGTGCCGTACGCATTCCAGCGCAGCACCTCTGC
GTTTAGACCAAGCGCCACGAGGAATGTAGAACTCTGTCGACGTTCGTACT
CGCTAAATATAAAAATCGGGCGGAAGAAGAGACCGAGAGAGAGAAAGGGA
GATTTGACGACGGGATTCCTCGAGAAGCGACAGCTTCCATTGCCAGATCC
CTAGCGCTCCCGTTGCTCCATTCAAACCGACCGTTTCCGCCAGCGGTTTC
TCCTCCTCGGAGAGCGACCCACCCGCCGCGCTCGGCCGACATGTGGGCCC
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CCGCCCCCGCGGTTGTCGGCAGTGGTGCGGGTCGTCGTCGCGCTTCCTGT
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GGAGACACGCTCTTCACCCAGTCGTGGACTCCGGCCGCCGCCGATCCCCT
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GCATTGTTTGTGATATATCACTATTAGTCTACTATGACCTGTATTGCTTG
ATTCACGGAGCTGGAACTACGAAAGCACTAGCTGATGAGATTTTCAGTTT
CCATTTCCTCAGAAGTGAAGACAAGATAGATTGCTTGATAAATCATAAAT
CCCTAGATTAAGACATTAAGTAGCCTATCCAATATCTAGTGTGTTATTAG
AACATTGTGACCACAAACTTATGAACCCTGAGTGACTCCTGCGGAGTGAT
GGTGCTCACCAAGTTGCAGGGTATAACTAACATTTTGCTGTTGCCTCAGA
TAAAGCTTTACGTATATCTCCAAAAAAGAAAGTAAAACTATTTTTTCACG
AAAACGCAAAAGATTTGTGTTTCGATTCATTGATAGAAAATAAGTTATTT
CGACAAACTTTTATGGGAACCTAAAAAGTGAAGGTAGCAACCTGGATATA
GCTATAACGACTGCTGGCATGAGTTTTTGCCCTTTTTTGGCTATTATCTA
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ACAACTTATCCCTAACGCTGCAACTTTGTACAGTGTTGGGATATTTGGGT
CGGGAACTTCAAATACATTAATGAAAATGTACATTACTTAACAACAAGAA
TTCATTGGTACTCCCTCCGTTCCAAAATATAAGATGTTTTAGCCTTTTTC
TGGAACACATGTGTCTAGACGCCTTTTAGTGTGTAGGTTCACTCATTTTG
CTCCGAACCTACACACTAAAAGGCGTCTAGATACATGCATTTTAGAAAAG
GCTAAAACATCTTGTCATTTGAAACGAAGGGAGTAGCTCTTAAAAACATG
AGAATGCATGTGTCATATTTAGACGTTCAGCACTGCTACTGCATGCTTTA
CATTTTTAACTAATATTTAATGGGAAGCGTACAATTTGCTGGAGGTATAA
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TATGCTGGGCCTCAGATTTGACCTGCTTAATGTTTTTGGTGATTTAATAA
CGATTTCATAGATCATTCTGTAATCTCTATGACTAGTACTAACTACAAAG
TTCAATGTGGTTTAAGATTGTAAGATCTTCAAACTAGATCAACATCACAA
TAGGAAGTTGATGCTCATAATCTAGATGGTTATCGTATTGCTCAAACTAA
TCCACTGCTCAAACTAATCCACGATGAGCTTAGTAGTCACAGGATACTTG
CTGCCATGCCAGTTTTGTATGCGATTATCCAATATAATTAACCTAATTAG
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TTTGATATATGATTTTAATGAAAACTTTATCTTATTGCTATTTTGCTTTC
ATCTTGGAAATGAGCGAACTGATTGTCGTTCTCAGCACTTCTCCTTCTCT
GCTTTCATCTTGGAGTCGATCTGATTTTCAAGTTGTATTTTTTCTGTTCT
CCCAAGGACATGGCGGAAGTGATGGGGCGCATGGTTATGTTTCATCGCTT
GATCACGCTGTTGGTGACTTGGTACTGTTTCTTGAAGCACAATAACTGTA
TATAGACTTCAAGTCAGCTTGTTTTATATCTGGGCTTCCTTGAACTAATG
AAAGTTTCTTTGTGCGCAGAAAGAATTCTTAGAGGATGTTGTGTTGGAAG
AAAACCATGGTTTGCCATGCTTCTTATTTGGCCACTCCACAGGTGGAGCT
ATTGTTTTGAAGGTATGGTGGTATAACAGGCAATTAGACCTTATTTGGTT
GGCATCCTGGCCACTCCGTGCCTGGCCTGGGGCATCCCTGAGATCTGCCT
GAAGGTTGTTTGGTTGGCAACGTGGAGAAAAAGTTGGTGGCCTGGCCTGG
ATGACCTGGCATCTTAATTAGCCTTGACCAAGCAACTGATTTTGAGTTTC
TGGGTGCGGCGCAACATCCTGGGATCGCTAACCCCACTCCATTAGACAAG
AGGAGCAACCCCGCTTTCTTTTAGTCACATCCAGACTCTGGCTGCCGCTT
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TCTGCCTGATGTCCGCTGACTGCTTTGTCCGCCCGCGTGGCTGATCGTGG
CTCTGCCCCCATGGACTCCTGCAGCCCTAGGCCGCTGCGGTCTGCAGCGC
TCAGCACCGGACAAGCCCTACCTCGCCACAGTCAATACTTGCCCCAATCT
CTTCATCCATCTACTTCTCTTCTGTGTGTAATCATCTGTTTGACTATCTG
CTAGCTGTCTGGATTGTTTTTTTTTGTCTTTTCTCGCGAGTGTATGCTGC
TCTGTTAGTAATCGATTTGGTTTACTTCATGGAAAACAAAAGCGTACTAC
GTATTCTACGTTCTCAGCTACAATACACTCCTTTCTCTTCTACATGTTCA
CCCAGATCCAGGACTACAGCCAAACACTATACCTCGATTTCCAGGCAGCT
TTCAGCTACTACTTTTTGCCAGGCAGGGATACCAGGCTATCAATCAAACA
AGCCCTTAGATAATATTGTTTGATTCTCATCATAACTGGAATACTAAGTT
ACTAATTCTGATTCCTTTTGTTCACTGGTCATTCAAAGGCAGCACTAGAT
CCTTCTGTCGAAGTAAATATAGAAGGTTTGATCTTGACATCACCAGCTAT
TCATGTACAGCCGTCTCATCCGATTATCAAAGTAAGCACATATAATGTAT
GCCTTTCTTTCTAGTGGTTGCTGTGGGGTGGCTGTGGGGCCTTTGTTCTA
TGTACAACATCTCTACATCATGCGACCTTCGCACTCCCAGAATACTATCC
TCATATGTTTGATGTTACTTGAACGAAATGAAATCAGTATGGTGTTATTT
AACACTGAGAGATTTAGCTCTATATTTCAAATGATCTTATCATGTCAATG
CATAGCAATATGGTTATGTTGTGCTAAAACTCATTATTCATGTTAGTTGC
CACTGTGGTCTGCTTTAATATATGTTGCTTAAACATATTATTGTGTAGAA
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CTTCTTTTATATATGGACATATCCATTGAACATGTTCTGCATTTTTTATC
TTCTGTGTGAACCAGAGTGTGAATGCTCATAATATTATTTTAATTTGTCA
GATTGGCTACATAGTTTTTGTGAAGTTTAAGCAGCAGTATTGTAACAAGA
GGATACCTTTTTGAATTCCTGTAGGATCGAGATCATTGTTTTCCTCTCCA
ACATTTACTCACTAATTTAGTGTGTTATTTCTGTCATATTTGTATGGTTG
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ATATGAACCTTATTAAAAATGCGTGTTTCCAAATGCTTATATTTTTGGTC
ATTCTCAATGCCAGGTTGTTGCACCAATCTTCTCTGTGCTGGCTCCAAAA
TACCGAGTCAGTGCTTTGCATAGGAAAGGACCTCCTGTTTCCCGTGATCC
AGAGGCTCTGAGGATCAAGTACACTGATCCGCTTGTGTATACTGGACCGA
TTAGAGTTAGAACAGGCAATGAGATTCTCCGGATATCATCGTACTTGCAG
AGAAACTTAAGCAGAGTTACCGTCCCCTTTCTAGTTCTTCATGGGACAGC
TGACACGATAACTGACCCAAGGGCATCTCAACGACTCTACCAAGCATCAA
TGTCAACTCATAAATCTATAAAACTATATGACGGATATTTACATGATCTT
CTCTTTGAGCCTGAAAGGGATGATATAGCAAATGATATCATCACTTGGTT
GAGCTCAAGACTTAATGCTCTCCACGGATGGTAAGGTGAATCAGCTACGA
GGTGCTTTCACTTGTAACATGCTGTAGAAGAAGAAATTGTACTACATGAG
GTTTTAGCTTGCTGCCTCTGTTTTCGTAGTCGTTTTTGTGTAGTTACTTA
ATAAAGGGTATATGAAAGTTGAGATGTAAGCTATGCAAGAAATGATGTAC
TTGTGTTATACGCAATTAGTTAATATTATTTAAAAAGAAAAGGAATGAAT
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GCATGGGCCCAGAACTAGGAGATACTGCTGGTGTGTGCATTATTGGATAA
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TGCCACTTGTCAGTAACATTGTCCAATCCCCATGACAGCTATTTGTATGG
TGGAAGCTACAATTGTAGCTCTGTCTCCAGATATCACGAATCCAGCAACA
TTTTGTGGGTATACACTTTATTAGTCTCAAACTAACAACACCATGATCTT
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TGAATAACTTATTTCAATAGTTGATCAGGTAAACTAATGTTACAGAATTT
CTCACTTCTAACAAAGATTGTACTTTAACGTGGCATGTGCTGTACGTAAC
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TGCTTCTGAAATTGAAAGGTGACATAGAATAGATATTGACATTAAAAGAT
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TAAGCACCTGGTGACTGCTTAATGCGTGCTTGTGCACATATTCAGTATGA
CGTGTATCTTTTCGTTCTTGTTTTAGCCATTTGTGCTGTTGGAGACAAAG
ATATATTGCATTTTTTATGAGCCAATTATGCCTGTGGTAATGTCCCAATT
CTTTCAAATCCCTCTGTTACTATGCTGGCATAGCTATATCTTTTACATTT
TTTGCGAATTGGTGATGATTCACATTTCATTGGTTCCAAATATGTCCTTG
TGTATGTGTCGTGACCATCACTCCTACACGAATTCAGCCATGTTTCTTTG
TGCATCTTGCAGGTAGTGTTGATCGTAGTTTGTACTTAAAACCATTACCA
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ATTATGTATTGTTTCCTTGGAAATCTTCACACCTGTATACATAAAGCTGA
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GGTACCTTGATGGATATTAACAAACTATGCAAGTTGAGTGATGTTTATGT
CAGTTGAACTATTGATAGTGATGGTGGTTAATTTTTTTGTCATCATATTA
TTATTTATTTAACTGTAAGCAACTACGTTTCTCATCCTTATCACTATCAG
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ATTATGATATGCATACAGTTTTTTTTCAAGAAACTATCGCATGCACACAA
GGGTTAGCTGCTTATGCACCGTCTGCAATGTGCATCTAGGCATCTAGCCT
TCTAGTATGCTGAAGATATGCAACTGCAGAGTGGAGACCTACTTGAAGCC
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TGTAGTCAGATCTATCATACAAATGAACGAACACAAATTTTCCTCTTTTG
ATTTGGGACCATCCTAGTGTCCTGCCTTGGTTTCTCATGGCCCAAAAAAG
AACGTCGATGGTTTCACGAGACTGGTGCCTTGTCAAATGAAGAAACATGG
GACAAGCTAGAAGCCACAAAGTTGGTTGTTCAGGAAAATGAAAGGTGGGC
ACTATTCCTTCCTAGATGTGCTTGCTTTTGTCCCTTTTGGCACCCATTCT
TTTTATCCTTTTATTATTCTTAGATTTCTCTTTTATCAAATCACCAACTT
GTGGTTACTTCATGACCGCTAAACTAAAATATAAAACAACATGAGTTTTT
ATGTTCAGTTTTGTCCCATGAATTCACCATTAGTAATTTCTTTTCTCCTC
TGTGAAGAGGAGTTCAACCTGATAGCTATCGAAGGTAATATCTTCCATTT
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ACAGCTATGAGATCTTTTTTCCTTCCGAAAAACAGAGTCTTGAGATATTT
TCGTGTAGTAGACACATGCAAATAGGTACAAATGTCCAAATTCTAGCAAA
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TTAGATCCAATATGTAGTGTATATAAGTTAGCGGAAACGATGAGAAGCTT
CTTGACTTGCAACCCTGTCAACATCTTAGCTACTGCTTTCTCCCTTTCAG
TCCCTGCCCATTGCTCAGCTATATATTCTGAAACATTTGCCAGGTCTGTG
ATTACTTGCTCATGCATGCAGGTTCCTGCATGCCACTATTAGACAGCGAG
ACAGTCTCTTCCCTCTCACAGTTGGCTACCACAACATGGGAGAGAACAGA
AAGTTTGGACAAGTGAGTACACATTATTTGTAACTATTCCTTTCTTCTCT
GTTGCAGAATTGAAGCAAATAACAACTGATGTTCTTCTTCTAGATCATCC
TACCAAGGATGGTGACAAGTAAGATACTGCACCACCAGGAGCTGTGTGTC
CATCGATCCATGTCTGAGGTTTCAGGCGTAGTGGATGAAACATTGGGAAA
GAGGCCATTGGATGGGCAGGAAACACTGAAATACAGGTGATTTTTGTCGT
ACTCATAGCAATTAAGTTTGTTCATAGCATCCTGTTTCTGATAATTTCCT
GTGCACATGAAGGGTGTTCGCTAGTACATGGAATCTTGGTGGCATAGTAC
CATCAGATGATCTAAATTTGGAGGATTGGTTGGATACAAGGGCTAACTCC
TACGATATATATGTTCTAGGGTGCGTATCAACCTGCTATGTGCCAACTCG
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TGGTGCAGGTTCCAAGAAATAGTGCCACTCAATGCAATAAATGTGCTTGG
TCCTAGCAAGAGATGTGTATCTACAAAGTGGAACTCACTAATTGGGAAGG
CACTAAACCAAAAGAAGACACAAGATGGGGCAGAGCTGCACCATACAACT
ACAAATAGCAGTGCATCACAACAGGGATGCTTTAGATGCATCAGGAGCAA
GCAGATGGTGGGCATATTTGCCTCAATTTGGGTGAGAAGCAATCTTAGGC
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GCATATGTGCAGTCTCAGGAGTGTTGACCATGCACGTTGGTATGTTGATT
GCAGGGTTCAGTGTCAGTTCGATTCATGTTGCATGAGACGAGCTTTTGCA
TTGTTTGTTGCCACCTGGCTTCAGGTGGCAAACAGGGGGATGTGCTGCTG
AGGAATTTTGATGCAGCAGATATACTTGCAAGGACGAAATTCCATGGTGG
TGGAAACAAAAAACTGCCAAAGAAGATCCTGGATCACGAGTAAGTTAACA
GCATCCCAGCTCACTGGCTTCATGTGTTTCTAAGTTTTTTCTTTTGGTGT
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TTTTAGTATAAAAATAACGATGGATACTAATCCCTACATATAGGATTAGC
TTCTACCTTCCTCCGATGATTGTGTTTTTAATTTATAGGTTATGCGACAT
GAGGGTATCCCAGCTGAGAAGTAGGAATTCAGCAAGCTGCTAAATTCATT
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ATATGTTTATGGCATTTATTTTGTTTTCTCTTTATCATCTGTGCAGTCAA
GTACTTCTGCTCGGTGACTTGAATTACAGGATATCACTGGAAGAGACTGA
GACAAGGTTGCTGGTGAAAGCTAAGAATTGGTCCACGCTGTTAGAGAACG
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GTTCTAACAATGTTCTCTTTTTCTTCTGGTGACATTGCAGCTAGTGTCTG
AGTTCTCGACTGGTTGCCTTTTTGAAGGCTTTCAAGAAGGGCCAGTCACC
TTCTCTCCCACCTACAAGTACCAGCCAAACTCTGATCAGTACTACTGGTG
CTTCGAGGCGGCACGGGGGGAGAAGAAGCGTGCTCCCGCATGGTCAGCTA
CCTTGATGCCTAGATGGGATGAACTTCAGCAGGGACATGTTAATATGACA
CTGACTCTGTAACTTTCTGTGTGCAGGTGTGATCGCATTCTTTGGCGTGG
GAAGGACCTGAAACAAATCCAGTACGAGACTTGCGACTACAAGTTGTCGG
ACCATCGGCCGGTGAGAGCGGGTTTCTTTGCCGAATGCAAGATCAGGGGA
GATGGGGAGTCCCTTGGTGGCTTCATGCCATGAGCTCTGCAGATGACTGA
TGTCATAGGATGGAAATTTTGCCCCGTGTAGCCCAATTGGCAGAAATTGT
ATGTAAGAGTATTAAGTAGTCACATCCATAGCAAGCTAGAAAATAGGTCG
AATTTTTATGAGATCTCGAACGTTCAATGGCGAGTGGAGCGTGCACCTGG
AACTACAGGAGTCTTAAGTTGTTGTTAGCGATGCTGTATAAATTATTTGT
TTTATCATCTACTTATGTGTGAGCTTGGTTCTTCCATAACTTGTCTTTTT
TATTGAATGAACAAGTCGTTTGCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.