Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA005135

[Submit comment/correction]

Sequence	AA005135
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA005135
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGTGCTTGGGAGGAGAAAATGAACATGGAGTTGGCAATGGCGACGGCAT TGGTGGAAAAGATAACCAAAGAGAGGAGATCAAGATCATCAATAATCCCT TGGCACCGCTCGACATCAAGAACGATGAACCATCCGCAAAGGCGGTCACT GAAGCACAACTACCATGAGTGACGATGACAATTCCGTGTAATATGCATGA TGATCCTAGATACAACTAGTATTGAACCACTGTAATATAGATTGTTGATC CTATATACAATTAGTGTTGAACCACTAGAATATGGATGGCCCGTTGCAAC ACACAAACATGTCCTAATATATTTTTTAATCGCATCTTATATTAATTAAT TAACATAATCTTTGGCTAGAATATCAATAAAGAAGGATGGATTGTAATTG ATCCACCGACACCTCTTTCTATACTACTCCCTTCTTTCACTAATGTGAAA CAATTTAGATATTTTAAAATAGACTAGATTTAAAATAAAATGGATGAACC TAAACAATATAAGTGTCTAGATATATGATTTTTTTAAAGCTACATTAGTG AACGGATGGAGTATTAAAGATTGCTTGTTGCCAGGGTGGAAGGGACCATT TTACCCCTCATTCTCCTGATCCGCCCTAAACCAGGTTCCCCAGGCCCTCG CGCACCGGGCATCTCACTCGGTTCTCAGGCCGCCGGTCGCCATTCCGCCG CGCTGCCGCAGGAAAGCGTTCTCCTAGGTGCGTGCCCTCCCTTCCCATCC CCTCCCCCCGAGCTTCTTTTTTCCGATTCACTCTCCCCGAGCTCTCGCTC GTCTCGGCCTTCGGACTGCGTGTCGTTGCCTCGTTTGTCGATTGGGCGTA CGGGGAGCCCTCGAGTCTCGGAGATTGCGGTGGTGATTCGACGCCGTTGC ATTGCCTCGATGCGTTCGTCCGTTTCGTGGTTTGTGCGTGCGAGTAAGTA GTGGATGCTGTTCGGATGCGGAGAAATCGTGGCCATGGGCTAGGGTTGGG GGCACGGAGGAGCTACCATGGGACGAATCGTGGTTTTGAGATGGGGAAGG GGTGCTTCCATGGGAGGGAGAGGGGTGTAGGATGCCGAAAATGCTGCGTT AGCTATGATTTGGAAGGATTGGCTGTACTTGAGTGAGCTGGGACAGAAAA ATGGCATATAATTTGTAGCCCAATGTTGGACGTGGTGAATACCCAAATTT GTTGTGTAATAATTTATTATTATCATGCAGTTACTGGAAGAGCTGGGAAT GGAGGAGGGTGCGGCGACGGTGGAGAACTCAACGGTGCCCATGGTGGTGC CAGAGGTGTCTGTCGACGTGGAGCAGCATGCTGAGGGCTCAACTGTGTCT ACGGTGGTGCCGAAGGAGGTCGTTGGCGTGGACCAGCATGCTGAGGGCTC GACGGTGCCTATGGTGGTGCCAGAGGAGGCTGTTGACGTGGACCAGCATG CCAAGGGCTCGACGGTGCCAGAGGAGGCTGTCGACACGGACCAGCATGCT GAGGTCTCGACGGTGCCTATGGTGGTGCCAGAGGAGGCTGTTGATGCGGA CCAGCATGTCGAGGGATCGACTGTGCCTATGGTGGTGCCAGAGGAGGCTG CCAACGCAGACCAGCATGTCCAGGGCTCAACAGTGCCCATGGTGGTGCCA GAGGGGGCTGCTGATGCAGGCCAACGAGGTGAGGGTGTGGCGGCACCTAT GGAGCTGCCTGAGGCAACTGCTGACTTGGATCATCATATTGAGGATACAA CCACCAAGGACAAGCACGGGTAAGCGATTCTGCATATCATCTAGCTTTTA ATTTTTATCTCTGTCCTTATCGCGAAAAACTTGAAGCGAGCATAAAGATT CCTATTTATGGACAATAAATGTCTACCATTAATGGATGTGTGGCGCGTGC ATGTTGGTGCGCTGCTTGTTTCTCTATATCTTGAAGCGAAACACACACGT GCATACCAGCAAATCTGAATTCTACTAAAGTTAAAGGGTGGCTAATGCAG AAGCCAGCCACCATTGCGTTGATACACAGACATTTTTCCAGTTGTTTTCA CAGCCTTTTCTTAACATGTTCTTCATATTTTATTTGAATTACAATATGTC TAAAATCTAATTAGTTTTTTCACCAAACTTAGAGCTACGCTTCATGCTTA TGAGAGTGGATTTTGCGCTTTGTCTGGGTAAGTGCTCAGGCTATCTCACC CACACATATGTGCCCTGACATCTGTGCATCTTCTCTTCTCCAAGGGAACA GGTCTGCGCATATTCTCTCACCACACCTGTACTCACAATCATGGTTTTCA AGGCGTCGCTTAGGCGTCAAGCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTGCCTTGGA AAATCCACCGCTTTAGGCAATTAGGTGCCTAAAGCGTCCGCCTAATCGCC GCTTAGGCGTCAGAGCGCCGCCAGACCGCTCTAGGACGCCTTGGAAAACC ATGCTCACAATGGGGGTTGGAGAATGTGCATGGGTGAGAAAGTATGAGCA CTCACCCATACAAGTACAGATGGTTCCAAGCTAATGCATATTTGGTACAT TTCAAATAATGCAATAAATATCTGCATGGCCACAAATTAACTGAACATGC AAGAGCACATCATCCCCTTTCCACGTTCTGACACTCGGTCTGTGTCTGGT TGTGTTTATGAACTATCCAGCGTTTGTTCTCTTATATTGGCCTTTAAAAT TTGTGCTAACTGTAAGTTCGAAAATACTTACTGCAACATTACGTATACTC CTAAGCACATTGACTTAAGATTTGCTTTAACAAAGCTAGATATTTTGGTG TTTAAACTTGTTAATACTAAACTCGGCAATATATCTTGCAAAAACAAGAA ATGTCTTTGATCGGTATACAGTTTGTTGAGTCCAAGCTCTGTTTTCTTGG TTCTTAACATTCGAAAATGTGTTTCATTCCAGGGATACTGACGGAATTAT CAATGTTACTCCTGAGGAAATGAGAGGCATCATCGAAGTTATAGCTGACA CGGGAAAATTCTGGTATTATGCTGGACCTGGATGAATTTACACTCTTAAT GTTATTTAGAGATTCCTTGAATGTTGAAAGCAACTTCATTCTTCATATTT TCTGTTCAGATCTATAACTTATAACTAATTTTCTTCCTTATAAGAAGTAG ATGAACATGTTTTGTTTTTGTGTAATATGTGTATCAGAAGGTAAATAACT AGCATTTGAAAACGAGTAACAGTAGTCATTCTAGGTGAACCAAGCTTAGG TTGATTTAATTGTTCACTTTTAGTTTTGAATTTGAAGAGATAGTTGCTGG TCAGGAGCATTTGGACAAAATTTACTGGAGTGAGAATGTGAGGTTTCCTT TTTATTCTTGGCACTGTGATCAACTTCTGTTTGACAGGCACGAATGGAGT TTTCTCAAGAGGTTGTTGTCTCTCCAATTGATGCAGGTATGGGGAGGTAT GCCATGAAAAGAGTTTCACATTGTTTGTAGATCATTGTATTGGCTATGTT TTGTCAGAATATAGTAGCTTTACCTTCTAAACTGATTTTCATCATTTCAC ATATCAAGGTCTTGGGTGAATATTCTGAGGCTCAAATGGTGATCCGGGAA GATGGGCAGCAACCGAATCCTTTGGCTGCAGAGACACACTCAGAGCTGTT TAGCCAGCTCAATGATGGTACTGTTTTTAAGTCTTCAATTTGTCGTAAGC CTTCATATTTTGCCTTGCGAGAATGTTTTAACAAAATTCACATTATTGTA CGATATATTTGTTTTTGTCGGCCCCTTATAATCTGACAAGGTCCTAGACT CCCAGTACCTTCTCACTAAGTGCAGATTTATTAACTTAGGCATAGTTAGC AATCGGCCGTTGATCCCGGCGTGTAGTTTGTGTATTGTAATAAACTAATA ACTCATGTTTGCTGTTGAGAATATGAACTGCCGCTTTAGTGCAATTGAAG TCAAGGCACTAACATGCAGCTGTGTATCTGCTTTTACGAACATGAATAAG AGCATGTCTGGGAAACTTCAAGTTCTGTTATTGAAATCGTTGGTTTGTTT CACAATTCTCTTGCATGGCTTTGTAGTACTACTTACGTTTTGGATGAATA GCCTGCAGTTAAAAACATAAAATGACAGCAGCATTTGGTGGGTTTTGAAT TCTTTATTCAGCTAGCCACTTTGAATCTTTTTGGTATTACTGTGTTTTTA TTTTCAAAGCTGATGTCGAAAACAGTTGTAAACAGAACTGTCAGTTCTTC CACAAATCAGATTTAGGTTTAGAAGGTAGCTATTCTTCTGACATTTGCAC TGGGTTGTCATGTTATTTCGAATGGAATAATATCTCCATCCATAACTTGA TTTTTCTGTAAAAAAACGGTAGCCGAATACCAAAATATCCTAAGTTGATT TTACCGTATGAGATTATATATATAAAAGTGGTGATCTCTGATGTACTTTG TGTGGAGCATGAACAGATTTGTGATCATCTGTTTGCACGTTTTTGCAGCC CTCTTGAGGTTTGAAGAAGGTCCTCCATTTACACTACAAAGACTTTGTGA GGTGATGAATTTTTCCCTTTAGCCCGATTCTAAAATTTCTATATAGTGAT CTAATGCCGGCAACACAGTTACTCATGAAAGGAAGGTGATGTGGTTTCAT TTCTGTGTTGCATTGGTGTTAAAGGAGCCTTATACTAGTTTTGTGTCGAC AGATTTTGTTGGATCCAAAAGGAACATATAAGAAATTGTCGAAGCTTGCT TTGGCCTTGGAGAAGGTTTGTTAGCTGAACTTCCACAATCATGTAGAGCA TATCAGTAGTAACTTGTTCTTTGCTATGTTGCCCTGCACTTTGCAGTATA TGAGTTCAACCTGTTGATCTGGGGCCCAATTGTCTCAACTTTTTCACTTG TTAGACTATACAACTTGAAATGCCGGTTAATAGATTACAAGTAGGTTTTT GTGAACCAAAGTTGATCTTTGTTACCAACTTTAAGCTATTTTATTTTGCA GACCCTTCTAGTCACGTCTACTATAACGAAGTGTACCGACCCATACCCTG CTGCCCACGGTCCAAATTCCAAAGGAACAGCAATCACAGAAAACACAGAT CCTGTTGATATAAGGCCTGAAACGCTGCCGGAGCACCCTGCAGCAGTGCC CAATGGAACAGAGCATGCAGGAGGTGATGGTGACGAAGAGATGGCCGACG CAGAAGCCGAGGCGGCACCTATTAGCCATGATGTCGAGATGCAGGAGGAG AAGATTGATCAGATTGCTGATGTTAACTCAGATACAAACCCAGGTGCTGC AGTTGCTTGTGAAATGGTTAGTGCCAGTGAACAATCTCCGGATCCGCAAA GCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.