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GrainGenes Sequence Report: AA003053

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Sequence
AA003053
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA003053
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTCCTCCCTCGGCCGCGTCGCCCCTAAACCCACAATCTCGATCGTGTAG
GGTTTCCCTCCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGTTGGACGATCAGAGGCGC
GCAGGTATGCCCACCGTCCCCGGCCGACCCCTCATTTCCGCTCTTCTTTC
TCCAGTTTCTCGACGCCACCGAAGCGTCGCGGGGTTTTCTCCTTCCGCCG
CGTGCGTGCCCCGGGTGCAATGTCGAACGCCGCGTCCTCTGCTCTGCTCT
GCTCTTGGCCGCTTCGTGGTTTCGCGTGAGCTTGTTCATTTGGTGGAGCT
TTTGCTCCTTAAAGAAAAAATACCACCTTTTTTCCCCGCACGAGCGAGGG
TTTTCGCCTCGGGTGGTTTCAGATTGCGGGCTTGATCTGCTGTTTGTTTA
TACCCTGCGGTGGTTTGTGCCCTTCGGCGAGCCTGGTAGCGCCGAGTGCG
GTCAATTATGTTTTTTATTTTATTTTGCGCTTTTACTCCTGGATTGCGGC
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AAAGTCAAGCCTTCTTCGGTCCTACGTGCGCAAGTACCAATTGACATGAG
TGTTGAAAGCCTGGAGAAGTTCTGTAAAGAAGCAGCAAGATCATTCTTCA
GTGAAAGAGGACTAATCAGTCATCAGATAAACTCCTACAATGATTTTGTC
TCCCATGGACTCCAACAGCTCTTTGATTCTCTAGGGGAGATTTCTGTTGA
GCCTGATTATGATCCTTCAAAGAAGACAGGTGCCTGGAGACTTGCAACCA
TCAAGTTTGGCAGAGTGAAGCTTTTGAGGCCACAGTTTTGGACTGATAAC
AATGAGCTCGATGAGCAGACACTCAAACTCAAGCCTGTACATGCTCGCCT
CCAGAACATGACATACTCTTCTAAGATCGATGTAGAAATGACTGTTCAGG
TAAGGATGCTCCTTAGTCCTTACTCAGTGGAGAACTGTACTGTATTTGCT
AGAAGTAACTGCACTGTATTAATGGAAATGATAGGTTGATGCATGCCTTC
ATAGGGAATTTTTAGAATTCATCTCAATCCTTTCTAATAGTATTTTAAAC
TCTGTAAGGATCACAGAAGTGAATTGTTGTGGAACTTATGTTTGCTTGTT
GCGTTGGACGTCACATGACACTTTATGCATTTCTCTTATATGGTTTCTTT
TGCCGTACCTGCAAAGCTCTTGTAAGTTTGCATTACATGAGTTGATTATG
CTGTTTGTCAGCATTCTAAGCTTGGTCTCGAACACAGCTATTTTCCTCTC
TTAATAAGTGGATGTAAGATAAAGCTATTCTCCTGTCTGTAGTCAAGATA
TCATGTTGATTTTTTGTGTCTTGAGATCTTATTATATATTGTGTCATCTC
ATTTATAAGTGTTTTGAATGTATCAGGTTTACTCACTCGGGCCAAGCGAC
AAATCAAAAACCGGAAAGGATCCATATATCAAGAAAAAAGTTATATTACC
TCCTGAAACTAAATGGGTCACCGTTGGCAGGTTACCTGTCATGGTGAAGT
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GATCTATCCTTTTCATTCTGTTCTGATCTAATTTTACACAAAAATCATTG
TCTTGTCACTTGTATTGCACATTTTTATGGCCTTTAAAGAAGTCCCTGCT
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TATTTAGTAGAACCTCCGAATTCCACTCTATGCATCAGTCATGCATGAAA
GTAATCCTGCTACTTCCATACATATATATGAATTTAGCAAAATCTATCTT
AACTTGTGATATATATTTTAAGAATGTGACCATAGTTCAACTGAAACTTT
ATACCCTGTGCATTGCTATGGTTAAAAGAATCATACTATGTGTTTACAAG
ACTAATTTCTTTATTAATTTGAGGTGCTACGCAGTGTAGGCAGACTTCAT
ATAGATAGGGATGTTTTTGCAGTACAGAATGAACTGGATACTGAGCAATC
CAATCTCAACCTCAGTCGTTGGTAGCAAACCCAACGGTTGGCAGAATAGA
ACCCATATGAGTAAAGAAATTGATTGTGCTACTTAGATCTTCGTATAACA
CACCTGCATTACAGTTTAATTCTCTTGATGTAATTTTCAGTTGTTTAATT
GCCCATTTCCCAACTTTATTCAGATTTACCCTCTTCTGGAATGACTTTAA
GGAAGTCGTCTTACTTACGCCAAGCACAAAAGTTGTCTTTGTACCATATC
TGGTTTCTTAACCTCAAAGACTTATTGTTTTCAACTCTGTAGGCATTTAT
TGCTGAAGAACAGAAATGCTTGACTAGGATTTGGGTCAGTGACGTCCGGG
GCTGGCATGCCTCTTACTTGTCTCAAATCAAACGCGAAAAGGTCTACGTG
AAACTTATTGAGTCCAAAGACAATGATGGTCTCCACAAAGTCGTGAACCT
GTCTTTCTTGGGTGCGACTATGCCAATATGGATAATGTTCTTTGCACTTG
GTGTATCATCAGACAAGGAGGCTTTTAGTATGATTGATATACAAGATTGC
GATTCTTCTTTGATCAACATAATATCAGCCACCATAAAACAATCTCATGA
ACAATGTGAAGACTTCCGCAGAGGAGGAAGAGCCCGTCAGTATGTTGACG
AATTTATAAAAAAGACAAAGTTTCCGCCAGAGCAGTCATTTGATGGGTAT
GTGGGTAGTTATCTGTTTCCTGGTGTCAATGACAATAGGTGCAAAGCACT
TTTCTTAGGCTATATGATAAAATGTCTGCTAATGGCATACTGTGACCACC
GCAAATGTGACAATAAGGATGATTTCCGTAACAAGAGGCTAGATCTAGCA
TGTCAGCTGCTTCATAGAGAACTTCGGGGGCATCTTAGACATGTGGAGAA
ACGCATGGTTAAGGTAATGCAGAGACATTTGAGTGGTGATGGTGACATTC
AAGGTCTCGAACATTATGTCGATGCGTCAATTGTTACCAATGGTCTGCAA
CGTGCCTTCTCCACCGGTTCCTGGTCCCATCCACATAAATATGGAAGGTG
CTCAGGCATTGTTGCAACCCTCAGGAGAATAAATCAGCTTCAAATGATGT
CTGACTTGAGAAAGACAAGACAGTTGTCTGCTTATTGGGGAAGTTCTGGA
GATGCTAGATATCCGTAAGTTATTCCTTTTTAGACATGGTGATGCATGCA
TATTATATGCCTTGTAAGTATCCTATCATGAACTGACATGGGAAATCTTT
TTGTAGGAATCCCTCCTACTGGGGAAAGCTGTGTTTCATGTCCACTCCTG
ATGGTGAAAAATGTGGATTTGTGAAGAATCTAGCTGCTAGTGCTGTGGTT
AGCTGTGTAATGAGGGAGCCCTTGCTTGCCTTATTTGTCTCTTGTGGAAT
GAAGAAACTGGATGAAGTTCTTGTGCAAGAGTTTGGCGGTACAGACAAGA
TTTTCTTGAATGGAAATCTGGTTGGTGTGTGTGCATACCCAGGTGAATTT
GTTACGCATCTAAGGAATATGCGACGTAGCAAGCAAATCGATCCACAGGT
TTGCAGTTTGTCTATTTCTTAATTCTGCATAAACTGTCCAATTTTCACCC
ACGCTCATGTTAGTTTTTTACATTCTCGTGTTTGTTAGTTTTTGTACCTG
ATCCATTTGATCTTTCATGCCAATAAAATACTTTCTCATGATTTATTTAC
ATTATTCATTTTATTCGTGATTCTTAGTTTAATACCAAATTTAGGTAATC
CGAACTCAGACATTGTATATTTGAGATACATAATTGTTGGGCCATATTTT
GCCGCAAGCAGGAGAAAATGGTTTTCATATGTATACTGTTTCTTTGTGGA
ATATGTAAAAGCACATTTATTCCACAAGATACTGCTAACATGGCTCTTGT
TTCTATGTCTAACTTTGTTTAGGTGGAAATCAAAAGGGACAAGCAACATA
AAGAAGTTCGTGTCTTTTCTGATGCAGGGAGAATTCTAAGACCCCTTCTT
GTAGTTGAGAATCTTAAAAGCATCACTAAACCGAATGGTGAATCATACAC
ATTTTCGGAACTTATGAACCAAAATATTATTGAGCTGATTGGTGTTGAAG
AGGAGGAGGATATCCGATGTGCTTGTGGAATTAGGGATCTCTTTTCAGCG
GACAAAAAAGAGGGTCTTTTGTACTATACCCACTGTGAGCTTGACCCTTC
TTTCTTGCTAGGGTTGAGTAGTGGTATCATTCCCTTTGCCAACCACAACG
CTGCTCGGAGGGTTTTGATGCAAGCTGAAAAATTATCACAACAGGCTATT
GGCTACTCGTCTACAAATTCTCAGTATAGGGTCGATACTCTGTTTCATCA
AATGTACTATCCACAGAGACCCCTGTTCAAAACTGTAGTGTCTGACTGTC
TTGGTAAGAAAAACCATACCAGACCAGAGTATTTCAATGGCCAAAATGCA
ATAGTTTCAGTCAGTGTTCATCAAGGATTTAACCAAGAAGACTCCCTGGT
ATTGAATAGGGCTTCTTTAGAGCGTGGCATGTTCCGAACACTTCATTTCA
AGAGCTACAAAGCGCAGATAGAAAACAAAAATGTGACCAGACGACTCAAA
CACAGGGAGAGAATTGATTTTGGAAAAACCCAAAGCAAGAAAGGACTTGT
TGACAATCTGGATATGGATGGCTTACCATATGTTGGAGCAAGTCTTCGAA
GTGGCGACATTGTCATTGGAAAGGTTTCAGAGTCTGGTGAAGATCATAGC
ATGAAGCTTATGCATACTGAAAAGGGAATGGTGGATAAGGTTGTTATGTC
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ACACACTAAAATACATCTAGATACATACGAATCTAGGCAAATCAAAGTCA
GTTATTTGTGGATGGAGGGAGTACTTATTTACATGCTGTGGCATTAGTAC
TGCAAAACAGTTCTGCATGTCATTATATTTTATCTGGTTAGTTGTCTTTA
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CTCCTAGTTACTGCATATAGGTAATATTAGGGACCGCAATTGCTATCGGC
TCCCGTGATCCAGTGAGTTCTTTACTTTAAATGATTTCAAAAGAGTCTTT
GTTGTGAAAATTTTGGAAGTGTATTTTAAAATTTAAAATGTCCGAAAAAT
GCCATGCGAATGTGGAAATACTCCATGAATTTGCATGACTTAATGAAAAC
TATTTTTCATTCATGCATGGCCAAAAAAAGAGATAAGCTAGACTAACATA
GCGAAGTACCAAGCATATATTTTCTATTTCAGCTCACCATTTATGTTCAT
ATTGTTCAACCTGGAAATGAAAAATTGCAATTTTGCAGATCATAGTGTAT
TTCCTTATGTACACTAGCTGAATGCCCATGCGTTGCCATGGTCCTCATAA
TTTTTTTGCTTGTCACACATATAAATGTAGTACACATGAAAAATTCACAT
GTATTCAGAATTAGATGTCCAAATTCTAATAACACGTATTCCTGAAAATG
CATAGCATTCCTTCTTGCAATTAACCATTCTGGTTGAACTTTCCATTGAA
TTGTGACACATGGCATACCAAATGTTGATAAAATAGATTGCACTGCAATC
AATGACGAGACCAACAGCGGTCATACAACCGTACACCTGTTGAGATTAAC
CATGCAATTTTAATAGTTAGGACGCTAAGATCAAACCCCATCAATTTCAA
ATAAAATTCAGAAAATGTTTACAGAAGAACACATATTTCTTTTTTAGGGG
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TCCTTGAGAAGAAAAGAAGCAAACAAAAACATGGGTTGGTGTGTCGTCGT
CGCTCAACACTAGACATGGAACGCATCCGCAGTTCAGTCACCCCTCAACG
TCTCCACTCGACATCTAATCAGTCTGCACCCTCCGATGTCCTCGCTTATC
CTTTCGCGTGGGAAGCACTGATCAGTAAAAAGAAAGCTACTGTATCTTAT
ATTTCTCATCAATCTTTATTTCTATTGCATCGTCCCAATCGCTGTAAATA
CTCCTCCGTTCCGGTGTTTGGGGCTCAGGAGAAGAAACAGCACCACCAAG
GAGGATGCTTATTGGCTACGAGCGATTACCTCAGCCGATTATTTCCTCCA
ATCAGCCTACAAATAGGAACCGTGTGGTTTATTAGCCCATTAACTAAGGC
GGACTAAATTGTGCACGCATTGGTCAGATCCACTGCATGCAGCCTATAGT
ATTTTCCACCAGTGAAGAAAAGATGTCGTGGGACAGTGATTGTAGGGAAA
AAGAGGGAGTATTAATTATCCAGCAGGGCCTTAACCCTTGGCTAAACCGC
AACACGCAGATTTTCGAGTTAGGTCCTACACACCGGAAGCAGTAGCGATT
AAGCTAATTTGGAAAACTATCATAAGAAAAGGAATTAACATTGCCAAACG
CTACAAATAGAAATTTAGCTAACCTCAATCATCTCAGCAATTATGACGTC
AATCAATGTTGACTAACATGGAAAACTACCGTACCCTTGATAAAGCCGTG
GCGAGCTGTTGGACACTTTGATTGCTTTCCAATTTGCTTTATAATTCCCG
CGATTGTGGTGATCTTGGTTGTTAGGTTCTTTTATTTGCTTTCCATGTCT
TTTGTTTCAGTTCCGTGATTGTGGTGATCCCATAATTGTTGGTACCGAAT
ACACTTCCCTAATTATTGATTACCAACTTACCATAGCGATGGGCTTTCGG
GCGATCAGATGGTTATGATTCTTCCAATATTAAAAAAAATGTTGACCAAC
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ATACTGTAACTCAAACCCGGGTGGGCGAGCTCACCACCGTGAGCTCAAGC
CACCAAGCTAGCGCTTGGTTCTCATTCTTCTAATATTTGGTGCTGTGTTT
GAGCGCGATTTGACGGTCGTGATTGCTCTACTGTTTGTTTGATGTTCAAA
GTGATGTACCGATACCAAGTCCCATATAATAGTAAAGATAAGGGAATGTT
CTCGGAACTTTTTGAAACATGAAAAACTACCGTACCCTTGATAAAGCCGT
GGCGAGCTGTTGGACACTTTGATTGCTTTCCAATTTGCTTTATAATTCCC
GCGATTGTGGTGATCTTGGTTGTTGGGTTCTTTTATTTGCTTTCCATGTC
TTTTGTTTCAGTTCCGTGATTGTGGTGATCCCATAATTGTTGGTACCGAA
TACACTTCCTTAATTATTGGTTACCAACTTACCATAGCGATGGGCTTGTG
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ACAGGGGAATGATCCCTTCCTTGGCTATACATTGTTAGGTAGAAATGAGA
CTCTCTCCAGGCGTTTTTCACGCGGATAGCGCCCGGTTTATTTCAATCGC
GAATACTGCAATTCGAACCCGGGTGGGCGAGCTCACCACCGTGAGCTCAA
GCCACCAAGCTAGTGCTTAGTTCTCATTCTTCTAATATTTGGTGCTGTGT
TTGAGCGCGATTTGACGGTCGTGATTGCTCTACTGTTTGTTTGATGTTCA
AAGTGATGTACCGATACCAAGTCCCATATAATAGTAAAGATGAGGGAATG
TTCTCGGAACTTTTTGAAACATGAAAATACAGTTTCCAAACAAATTAATG
ATCTCAAATAAGCTTGAGAGGAAACATTCTCACCTATAAAGGTATCCTTA
TCTTTGTCAGTCTAGTTAAAATGTAGCCAACCGGGACCGAATGTTTCCTT
TGACCTTTCCCATCTTTGGTCAGTTTCTGATCTCTGTGGCACATTTTCCA
TCAACTGTAACGACATATACAAACAATACAATGTGACTTCAACATGAAGT
TGTGCACAAATATGGCTTATTTTTGTCTGGTGAATTCTTGGTTCTCACAT
GGTTGAACTTTAGAATCCATGGATCAAATATTTATGTTAATAGTTTGAAG
GTGGTTTATGATACAAGTATATTTGTATGATGTGACTGGTAATTCATTCA
AGTGCATAGCATGTATTTGAATTAGCCCATGTAATAGAGATTAAACATCC
ATTCTAGCAGTGTTACCTTTTGAGAACAAGCATTTCTTTCTTGGCTAACT
TGTGACATGTCTGTGAATGGATTGTTATACACTAACTTTGCTCATATTAT
TCATGACCTTGGTTTTAAAATTTTAGGAGATGATAGATGGCCTCCAATGT
TTGCCTTTATTAGTTAGATTAGAGTCTTGAGCCTCTGAGGTCACCTCAGC
TGCCACAGTATTATCAATCCTTGTTTTTTGTGTCCATATGTGTTCTGTTC
TAATGCCTGCGAGTGAACAATAATACCATTACTTTTCATGTTCTTAAAAT
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CCTCGTGTTGGAGACAAGTTTGCCAGTATGCATGGCCAGAAAGGAGTTGT
TGGTCTTTTGGATTCTCAGGAGAACTTCCCATTTACTTGCCAAGGAATAG
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GGTCAGCTGCTTGAGGCTGTGTTGGGTAAGGGAATTGCCCTTGGTGGGAT
GGCCAGATATGCAACACCATTCACCACTCCATCTGTGGACGTGATCACGG
AGCAATTGCACAAGTAAGTGTTTTTCCTTCAATTTTCGGTTGCAACCAAT
GTTTATCTTCTTTTGCACATAAACGGAATATAAGATACAAACCACATGTG
GTATATATTGTGAGACTCTCACTCATGTATATGCTTGTTTGATTGGACCC
CACATTCCAGGGCTGGTTTTTCAAGGTGGGGAGGGGAGAACGTTCTGAAT
GGTCACAATGGCGAAAGGATGCAGTCCTTGGTGTTCATGGGCCCAACCTT
CTACCAGAGGCTGACCCACATGGCTGAGGACAAGGTGAAGTTCCGTAACA
CCGGGCCCGTGCACCCGCTGACGAGGCAGCCAGTGCTAGACAGGAAAAGG
TTCGGCGGTGTGAAGTTCGGGGAGATGGAGCGCGACTGCCTCCTGGCTCA
CGGTGCCACGGCCAACCTCCACGAGCGTCTCTTCACGCTGAGTGACCAGT
CGCAGCTGCACATCTGCCAGGGGTGCGAGCGCGTGGCGAACGTGATCCTG
AGGCCTGTCGAAGGGGGGAAGAAGGTCCTTGGGCCCTACTGCGCGTTCTG
CAAGTCCGCGGAGAACATACTGCGGATCAAGGTGCCTTACGGCGCAAAGC
TGCTCTACCAGGAGCTACTCAGCATGGGCATTTGCCTCAAGTTCGAGACC
CAAGCCCGCTAGAACTTCACCGCTAGCTATCTGGGAAACGTCGTCGTCGA
CGATACAGAGCTCATTTTGTCAGGATGGATCACTCCCATCTTTTAATGTG
ATGATTGCTGAATTGTTAGCATGAATCTACCTTATGCTGTGAAACATGTA
CACAGCACATTAGAGAGATATTTAAGGAAAGGGAGGCATCACTATTCCCC
TTGGAACTTTCAGAAGACGGTTGTTGACGTTTATGGCTATCATTACTGAA
CCCTGTACTGGCTATCTTATTCGAGGAGATTTTAACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.