Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA000532

[Submit comment/correction]

Sequence
AA000532
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA000532
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTACTCCTACCTACTCCTACTTAGCTGCAGGCCCTGCACATTCTCCTTTC
TCACTGCATCAACCAGACGCGTCGACCAGGGCTATCATTCTCCTTGCAGC
CTACAGGTTAGTGCTTTCCCCATGGCTAATGCTCCTATTCTCCTTTGAGG
CCATCGGATGGTTTTATAGGAAGTACCTGCATCTTTGATCCTCACGTACG
TACATCGCTCTGTTACTGTGAGATCCGTAATTTAGGACCCTTTCTCTATG
TAAATTACCATTGATAATATTGTAGATATTTGTCGGGTGTGAGCTGGAAC
CTTTTCCATGCCAAACTCCTTAATTGTATAGTAGAATTTTAGATCTTAAC
TTTTCAAGCTCAATTCATCTATTGGTAGGGGGTCAATTAGGACAAGAGGG
GTCAGAATTTTCCAATGTTATTCGAGTTGTGTAAAGTATAAAGGCACATG
TTTTCTTTCTTTCTACTAGGAAATCAACGACATGAGCGATGCAAGTATGG
AGCCAACGGTTATGCCGCTCGATTTACTACGAGAAATCACTAATGGTTTT
TCCGAGGAGCAGATAATTGGTAGCGGTTCGTCTGGAAAGGTTTACTGGGT
AAGATTAATGATACTTCCTCCGTTCCAAAATAGATGTCTCAAATTTGTCA
AAATTTGATGAATCTAGACACTATTTAGTATATCCTAACATCGATAATAT
CTTGTGCCGTTACGACAAGTACTTCCTCTATGCAGAAATAAATGACTTAA
TTTTGTCTAAATTTGCATGTATGTAAACATGTTTTAGTGTACAGATACAT
TTAAATCTAGATAAAGCCAAGTCACTTATTTCTAGACAGAGAAAGTATTA
TTTTCTTAAGTAATAGATGCATATGGTGATTTGTGAACTTACATGATCCC
TGAAACAAAGCAAAGTAGCCGCAAACACAAAGGCTTCACGAACAATGCTG
CAAAAGATGTATCCCCATGGCAACTTTAGGGACCCACTGGACATCAGAAC
GATTTCTACTCTCGTATCATCTCTCTTATATTCAAGTCAAGAATCGCCCA
GCAACATTGGACCCCTGCCGGAATAAACTTCCCGACCACCAGCCACCTAA
GCCTAATGCCGGGGTGTTTCTGCAGACTAGCAGCTCCTTCAATGAAAAGC
AATCTATATCTATTTCTCTGCAGAATAATTCACATGATTTTAGCTGCACT
TCTCTCCATCTTGCAGCAGTAAATGATTTGGTTGTCCACATCTGAACATA
GCATTTTCTGTTTTACTGTACGAACTGGAAATTAAACGATGTGAAAATGT
TGGGCAGGGAGACCATGGGAAAAAGATTGCTGTGAAGAACTTCTATGATA
TGATAGGACTTGACGATAAGCAATTTCGGAACGAGATTAAGAACCTTACA
AGACTCAGACACAAAAATATTGTGTGGTTAGTTGGTTATTGCCACGATAC
TCAGAAAGTACAAGTAGAGCATGGAGGAAAATTGGCTTTTGCTGAAAAGA
CATATAAGGTGCTTTGCTTGGAGTATTTGTCTAATGGAAGCCTTGACAAT
TATCTTACTGGTAATGATTATGTTCTACTTGTTTGAGTTAGCATGTTAAT
GTGTCATTCTTGAAATTTACATCTCAAAAATTCTCCTTACTTGGTGCTTC
AGATGAATGCGATAGATATGATTGGCACACGGGCTATGGAATAATTAAGG
GGATTTGCCAGGGTTTAAAATATCTTCACCATGAATTAGATCCTCCAATT
TATCATTTGGATTTAAAGCCAGCCAATGTATTGCTGGATGAGAACATGGT
TCCTAGAATTGCAGATTTTGGAATGGCAAGGCTCTGTGGAGATGAACATA
TGCGAGCTGGAAAAAATTCATATGGAACACTGTAAGTTTAGTTCTTCATT
TGAACACAAATATAAGCATGGACATGTTTCTAGATTAGATGTATATAGTA
CCAGTAACATATTTATGAAATGTCATGCAGTGGGTACTTACCTCCAGAAT
TCATACGTAGCAATTTAGTCTCAAACAAGTTTGACATATTCAGCCTGGGT
GTCATAATCCTAAAGATAATGGCAGGACATGCGGGTTACTTGGATATCGC
CGAAATGCCTTCCTACGAATTCATTTATCTTGTAAGAGAATGTGGTGTTT
TAATCTAAACCATGTGTATGTATTCATCAGTAATACTTTGCTTATTTTAA
TATACTGCCCCTTTATTCTCTAAATCGGTAGGTGCAGACAAATTGGACGA
ATAGACTACTTGAAATATTCAATCTGAGACGTGCATATTCCGAACAAGTA
CGGATATGCATTGAGATTGGTTTAAGTTGTGTGCAGGAGGATCCGCACAA
AAGGCCAACTATACAGGACATTGTCAATATGTTGGAGGAGACAGAAACTA
AGTGTACTGATGCGGCAAAGAAAGACTTGATGCTTAATAATACTGTGAGT
AATGCTGGCTATTGACATATGTCCTTCTGCTTAAAACTTTATATTGGACA
TGAGTTCTCTTAGATTGATAGGTATCTATGGTATGAGGCTGGCTGGTTTA
GTGGTAGAGCTAGCATGAGCCATGAAGCCCACGTTTATGGAGTTATATGT
ATAGCCCACAAAAAAATGAATATAATCTCACAGGATAGTTTAGGTGATAT
AATTCAATCTGGGAACATATATAATAACAAGTATCTAGATGCAAATCCTT
TGAGAAATGAACCTTCCTCATCATTCAATATGGGATGACAACATGGTCAT
GTAATTAGAATGTTATAGATTGTATCTTAGTGTATGATTATTCCCTATTT
ACAGGAGGCAAAGTGGGGCTCTTATGAACCGGATGATCTTCCAAATGATA
GTAGAGTGATTTTGTATGTTCACTTCAGATTTTCATGTTTTGTTGCTTAC
CAACCATTACTTCAAGTATGTCATCGGCATGGAAAAAATTTCACCTCATT
GTTACATGGCACTACCTTTCAGGGATCGATTAAAAATTATAGCATCCACG
ATGTGTTTGAATGATAATAAGTACTCAGGTGATGGAAAATACATAGATAA
TTTCTTAATCATATCATATGTATTAATGTATACATACTTTTAACCAGCCA
ATCCATTAGCTAGTGTTGATGGATTTCAAATTGTGGGAACACCTCGACCA
GGGTTTACTTTACGAGCAAGTGGCTCCCCTAAAAATGGCACTACACATTG
TAATTTTCAGGTATGATATGTTTCGACTCTAGATTTTGATTCTTTTATGT
TTGCTATGAATATCAAAACCCTTCAATAAACATTTCACATGAAAATATTT
TTTCAGTGGGTTCGTCACCTTAGAGATGGCACCAAGCAACATATTGAAGG
TAAAGGAGGGAATTTGTCCTCCAACTTGTGTGATAACTTTCAGATAAAAT
TAAATATTCTCACTAGCTCCATATATGTGTTCTGCTATTTAGGTGCCATG
ATGGATGAATATGTGGTAACTGCTGATGATATTGGCACTCTTCTTTCTGT
AGAGTGCACTCCTGTGGGTGATGATGGTCGTAAGGTTGTTAACACATGTA
TTACTAAAATTTAGCGGCTATTTCGTGTCACAAACTACAAGCCCATGTTG
TCAATCTAAGTACATATTTTTTAGTGCAAAGTCTAGAAGTTATTAAAACT
ATTACAGAGCAACACCTTTTTGAACATGGAGCAAGCAGCTACACGAGTTC
AATAGAAAAAGTTTGTCCTAGGAAGATACTCTTTCTCTTAGTGACAACTA
ATACATATTTGCACTATTTTTTAGGAAATAACGAAGGCTAATGGAGGTGG
GGTTTTCTGCAGAACATAAAAAAAACTAAAGCTACACAAAACTATCTTCT
TGACCTTGTTTTTGGCGCTGTCCTAGAGTACAGTTCACTTTCTATACAAT
TTGATCAAGCTGGCTATGGAGGACAAGACACCTGCTTTGTCTAACATTAC
CATTATCTTGATTTAAACCTGATTTTTCACCCTCATGTTTTGAAGCATTT
TGTGGCTTCGATCTGTAATTCTATATGCCCGCGAACTTCTTGGTGTCCTG
ATAGGCTGACCTTTGTTTTGTGGGGTCTGTTTCACAGTTTGTTGGATCAG
TGTGTAAACAATAGTCTGTTGCACAACTTGTGAAGCACAAGCCCATTCTT
TGAAATACTATTAGTTGATTTGATATATGCATAAGAACATAACCATCTGA
CTTATATTTACAAAAGCCTACTTAGTCGTGGACTACTTTTTTCTGTTTTT
AGTATTCTCTTAGTCCAGAAAAAGCATGTTGTAGATTTCTCTAGATTCAT
ATGTATCTACACACTAAAACGCGTCTAGACACATGCGAATCTAGAAACAT
CTATGACATCCTTTACCGGATAGACGACAAAGTTTGCATATCAAGTTCAT
ATGTTAATGATGATTCCTTGGCTTGCACACAACCTCTTTTAAATATCCAG
TGGATAGAAATGCAGCTGCATTTTTTTGAATGCATGCCTCTAAAATGAAA
TTATGTACACCACAGACACATGAATTCTTTTTGACGATTTGTTTTTAAGT
TAGTTTTATCCAAAGTACTCTTGGTTGATATTTGAGTTTGATGAGTTCCT
CCTCTTGATTGTAGGGTAAATTGATGAGGAATTTTGCTAACAACAACAGT
AGGATAACCCATGGTAAGTGTATGATGTACATATTGTTGTCTTTTCAGAT
CTGTTTCTTTCTTTACTTGGTCTTTTTGGATCTCTGATAGCAGAAATTGT
ACGCCCTAGTCTAAGATAATTGGATCCACATTTTGTAATTGCCGATAACC
TCACTTCCATATTTTGAATTATAGAAAATCTTTTGGCACCACTACTTAGT
AGTCCATAGTTTATTGTTGATAAAGTGGAAATTTAATCGACAAAAAATGT
CTTTTTTCATGTTTGATAAAGGCTATATGCATCATACGATGCAGAGACCG
GGGTTTTTCTCCCCTTTTCGAAAAAATGTTTGATAGAATAAACGCATGGT
AACATTAAATCTATCTACCTATTATATATTAAAAGCAATATAAGAGGGTT
TTTAGAGGCACCCGATTGATCCACATCGTTAAAATTATTTAGACTGTTAG
ATAAGTAATTGATGGATATGATTTAACTGAAAATATAATTGTGTTACACA
TGTTACGTAATACACCAAGGGCACGTTCAAGTATTGAAAGGTGTCATATG
AGTCAAAAGGCCCATTTAACGCACCGCGTGAAATTCTTGAACAATGCAAA
AAAAATTCATCTGGCTTTTTTTTTTAGAAAACGCAAAGAGATAGAGTTGC
TACACGCCTCCAGGGAGGCAAACATCTAGGAAAAAAGCGATAAAAACTAG
TGGACATCCCAGGTTGTCGGGGCTATGTCCCTCAACCCCTTGGCCCCTGC
AAGAGCCCAAGTTGCGGCTTCCTCCTTAATCTTGGTGATTAGCCCGTGGA
TAGATCGCTGCGTACTCTTGAAAACGCAGTCATTCCGCGCCTTCCAAATC
TGGCTTAATTTTGTCCAACTTAGGTTTTCTAGGCAAAAAAGAGGCTGAAT
TGAAACATAGTACCGACATGAAGAAAAAACAATCGTAATTTTTGAGATAG
ACTGTTTCTCAATACATAGCCTAAGTTGAATTATTTGCACTAACCTAGGA
AAATCACATAAACTACCATCTTGAATTCACGTGTAGGGATACAAAAGTAG
GACATAGTTTGCAGATATCTACGTGATGCTAAAAACTGCCGGCAATGCGC
ACATTAACGAGTATATAAAAAGATCGAAATACATAAATATTTATAATCAA
AATTGGAAATCTAAAAATTTATACCTGGAAAAAGAAATTGCCAAAAAACA
AAGATATTTCATATGATTGGTCCGAGGATTATTTGTATGTAGGAGTAATC
AGCGTGGATATCTATTTGTTAGTACACCTCAAAAAATACTAATAAATATT
CTTGATCACAACTAAATGAGATCATACTCACATACAAGTATGCATGTCTA
TACATAATTGCTTTTGAAAATGACACTCCCTCAGTCTATAAATAAGTGAC
TTAGATTTGTCTAGATTCGCATATATCTAGAAATGTTTTAGTTATATAGT
CATCTAATTAATTTGGTGAATTTTTATTACAACTATTTTATATTTAAATA
CATGGTATAACCGGAAAGAAACATATATTTAATATTCTCACGGAACAGCA
AAGCATATGTATGACAATCCAATAGGACAACTGATCCTAATAGATAGGCC
GTCTTATTAGATAAATATCAGCTATATTGAATCATAATGCAAGAGAAAAA
ACTTTTTCCCTAAATTTTTCTCACAAACATGACATTGAAACACTAATTAT
GTGAACCCCCTTTATTAGTAGTCCACAATCAATAGATCTTCATATTGATA
TCTAAATGAGGCCGCACCCAATATATCATAATAATTGTAAATAACTAATC
ACAATGATATCTTGGCATGGACATATTTCTTCCTATAGTTTTGTCAGAAG
GTTAACTAGATGAGTGTTTTGCAATTGAGTTGAGATCCACAAGCTATTAG
CATAGCTTTTTTCGAATGAAAGAGCTATGACCACCGGTGCAAGAAGGAGG
AGTTTCGGTGGTAGACAATTAAGCATATGCTTGCACACGACAGAATGGCA
TATATAATATAATCACTATTAAAAAATATAAATAAAACATGCTTTTTGAT
ACAAGGTGTCACCTATAAGGGTGATCGTTCATCGATAGGATTGGGTAGTT
AAAAGAAAATTCTATAGACTACACCCACTTTGAAACAGACAGCAACTTTA
CATCTTAATGGCTCATTTAAACACCACGGGATAGCTGGCAAGATTGCTTT
AATTCTACGTGGAAATAAAGCATCACATACAATCACAAACATATGGTCAA
CACTATGGAAATATAACAATGAACAATTTTATGAAAAATAAAGATGATTA
AAGATGTTCCATACTGCTAGGATGTTTTATTCGCCTGATATCTTTGGTGG
TAGTAAATCAATAGCACATCTTATTGACATAATACGGATGTGCATGATTA
TAAAAAATAAAGAGAAAATAGAAAAAATAATTAAAGAGTAAAGATGTTGC
CCTCGCATTTGCGAGGGCCGCCATGGTAGTTAATACATATAGTAAACAAC
ATTTTTTCCTTTTTTGTTGTTGTTGCATATTTACTGCTGCACGTACATCT
TCCTAGTTATAAAGCACATAGCTCTTCCCAAGACTTGTTGAATTTTTCTT
ACTCCCTCCGTCCGGGATTACAATGTCACTTCATTTTTTTTGTGCCAAAC
TTTGACAAATAACTTACATATACAATCGGAAAGTTCTTTGAATATACTTT
TGGATGACATGTAAATTTTATTTGATTGACTAAATAATTAGTTGAAGTTT
GGCACGAATTTTTTTTCCTGTATTCCCGGACAGATGAAGTATTCATCATA
TGGACTAAGCGTCGAAACATTTATTCATTTATTACAGCAGCTTGGGGGTG
GAAAAAAAGTAGGGGGAAGGGAGGAGAAGATTTCTTGATATCGGTACTCC
CTGGATACCGTCGAGCCCCACGACTGCTTCCTTTCGGGCATCGAGAGACA
GGTGAACCCTCCACGGTTTGGCGCAGGGCAAGTCTTGGAGACCCAAGGCG
AAACTACAATCCCGGGTCCTCATCATATACATCAAAATAAGAATCTACTA
GATTTTATGGTGTGTCTTGGCGCGCGATCTCATAAAACTCGTGCCAAATC
ATGTTTTGTATAATGATCAGAAAAGAAGGCATGAAATTCCACGGAGGACA
GCAGGAACACATGGTTGTTATAGCACGCGGGGTTTATCGTTACGTGTGTG
TGAACCGTGAAGCATCTTTATCGATGCTAGCCCAACAACCTGAACCTGTA
ACCTATATTATGATTATAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.