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GrainGenes Sequence Report: AA019173

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Sequence
AA019173
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019173
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAATAATCCCGTTCGTGATTCCCAGAGGCAAGGGGGGATATGCAAAAAGT
GCATCCATCTTCCTCCTCTTCCAGGTAGGTCATCCTCGTGCCGGTTTACC
CTCTACCTCCCTCGAGACGGCCTCGTCGTCCTTCCCGGATCTACCTCGCC
GCCTCCTCCTCCTCCCGCACAAACCACCCACCGCCGGGGGAGGCGATCGG
GGAAGACCAAACACCAGGCGGAGAATCGAGGGGAAGCACGTCGAGGGAGT
AGAATAAAATGTTCAAGTTTCTCAAGGATGTGGTCGCGGGATCCGGATCG
GGCCTCAAGGACTTCCCCTACATCATTGGCGAGCCCCACGCCTCCGCCTG
GGGCTCCTGGGCGCACCACCGCGGTGTGTCCAAGGTACTCACGCTCGCAC
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GCTAATTCAGTTCAGTATTTTTCTTATTGCAGGTGCGCCATCCAAATATA
TTATCCTTTCTTCACAGTACTGAAGCAGAGGTTCCTGATGGACCTTCTGT
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CTCAAGTCGCACTAACCAAATGTAGTGTTTATTTCCATGCTAAGATTTAC
TGTGATTACATAACGGATAATGCTGAGGATCTTTAATAACACTCCTATGT
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ATTGTTTCTGAGAAGTCTAGAATTCTAGATGAATAGTTATTTACCATCTT
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AAATTGGTAACAATGCTCGTCTCAGACTGGTCATCCACCTGGTAGTTATT
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ACAGGTAGGGGCACAAATTCCTTGTACAAGAACTGGTATACTTCCTAGTA
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AGTGTTATTCTCATTGTGGCTAGTATAATGTGTTGCAGAGATGAGTATTT
TGCTTGGGGTCTTCATCAGATATCAAAAGCTGTGAGCTTTCTCAATAACG
ATTGCAAGCTCGTAAGTTCCTGCCTAATGTAACCCTTTTTTTATGCAAGC
TGTTTATCAATATTTTATTTTTTGTTGCTATCTGCTTGTAGATTCGATTA
TTTAGATGGTTGCTGAAATGCTGCTTGTATTGTATTCGATTATTTTGAAT
TTTTTGTTTGTATTGTTCTATTTTGTTCCAGACACTTAGCAAATTTCATA
TGTATGAATGTACCCTGAATTCCTGGAGTTACTGCATTATGCTTGTAGCC
CAGGCCATTTTCAGAACTTCTTTGTTTTGGGGTTCTATGGCTTTCAACAG
AGTTTTTCTAGTTATTACATGTTTGCCACGTTACCATATAAACCTTGGGT
TAATTGGATAGATGCCACTGCAATTTCCGGCTATTTGAGAAACACCAATA
CATATTTTGTCTTTCGATAAATGCCACTGCAATTCTATGTACATTTCATA
GATGCCATTATGCCTACTTAAACACACATACCGGTCAATATACACCGTAT
TTCCTGTCTACATACGTATACATGGTGGGCCCCATCTGAATCAGATTAGG
AAGAAAGCATGCGAAAAATATGTGATGGAATAAAATTGGAGAAAGCATAA
CTGTGACAGAATAAAATAGGAGAACCTAATAAGTTCCAAGTTCAACATCT
CATAATACAGCTCCAGGCTCAACTTCTCATAACATAGCTCCAAGTTGAAA
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TCTGCTCCAGGTTCAAATGGCCATCAGGTGCTGGCTGTTGGGAATCAGGT
CCTAGCCGCTGCAAATCAGGTTTTGGCTGCTCCAGGTAGTTGTTGCTGTC
CAGGACTGTTCCATCCGGTCAAAGAGGTGGGTCGGGGATGCGCAAATCAG
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CCAATGCAAGGGAGGACTCGGGGGGAGTTCCGTCTGGTCCTAGAAGCGGG
GAGAGACTGAGAATCATGTGCTTGCTGCTGGCTTCCGCCGCTGCCATGCT
CGCCGGCGAGGATATCAGGGGGAACTTCCGTCCGGTCTGAGAGGCAGGGA
GAGAGTGCGCAAGTCAGCTGCTCGCCGTCGCCATGCTCGCCTGCTTTCGC
CGCGCCGCCGCCAGTTCTAGGGTTGGGTTCCTGGGAGGTCAGGGGGTGTC
ACGTCCTAAGCAGATCTCGCGTGGGGCCCACCACATGGTGTATATTGGCC
GGTATGTGTGTTTAAGTAGGCATAACGGCATTTATGAAATGTACATAAAA
TTGCAGTAGCGTTTTTCGGAAGTCAAAATTTGCAGTGGTTTTTCTCAAGT
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TCATGCAAAATTATTTTCAGCGAGATCCTTAATTTGTTTATCTTTTTATA
AAAGGTTATAATAATGTTAAACATTAGTTAGCATTGGCATTTGATCATGT
GGGTCAACTAGTAGCATTGGCATTTGATCATGTGGGTCAACCAGTAGCAT
TGGCATTTGATCATGTGGGTCAACTAGCTTTACATTCAAAATATCCTTGT
CGATGCAGATGAGCCACATGTATTAAGCCACAGTCAGTTGGCTTTTATAT
TATAAATTTATGATACTCTGTTGATCATTTGGTTTCTTCTTTATTTACTC
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TTTTTCTTGCTTTACTGAAATGATACATTTATGTTTAAGAACTCATGCTA
AGTCAACCATGTTAGTTGGCATCATTTATTGATAGATACTTGGAAGATTG
ATAGAATGCACATGTAGTAGACATTACTTGTTGACCAATGATACATATAG
ATATTGTTGCAGTAGAACGTGTGTAGGCATTGCATACATTTCTGCTATAG
AGCCAAAGGCTAAGGTTGCACTGATGCCTAGGTACTCTTGTACCGTGCTA
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ACTCACTATGGCCAGGTTTTAATCGACTCCAGATATGGAAAATCCACAAC
CACTTCACATAATCCACGAAGGAGAATACAGGGCCTCATCTCCTTATGTG
TTTGTGAATTGTGACCTGATATTGCGATATTTTCATAACTGCATTGTTGA
AAATGACAATCACTGCCAGTACTTCAGTCATAAATGAGCTGATTGCTGTC
CTTTCATCAATTACAGGTTCATGGGAACGTATGCTTGACTAGTGTAGTTG
TTACGCAAACTCTGGACTGGAAGCTTCATGCTTTTGATGTTCTCTCAGAA
TTTGATGCCAATAACGAAGCTCCTGGTAGCCCCATGTTGGTAATGGCTCT
CAGTCAACACCTTTGTTAATGCTAGACTGATATGGCACTACATATAGTTC
TATTTCTGAGGATTTTGGTGAATGTTCAAACCACAATTTTATTTCAAGCT
CGGAAGTAGGAAATATGTTTCATTTTCTGTGACGACATTATATGTATGTT
TGAATCTATATAAAATATCTTCTCATATTTATTGTTCCTTCGCAGCAATT
CGAATGGCTAGTTGGAAATCAGTACAAGCCAATGGAGCTGACAAAGTCAG
ATTGGGTTTCAATTAGAAAATCCCCTCCATGGGCAATTGATTCCTGGGGA
TTGGGTGAGCTGAACTAACTCACTATATTCTAATAGGGTTCCTTCTCCTG
AGTTGGATTGGTGTGTGGGTTATTATGTTTATTTTTCTTGGTTTTAAATG
GTATTTCTTTCCAAACAGTTCCTTACGAGCTGTGCACAGTGCTGTTCTTT
ACATAACATGTGAAACTTGTTCAATTGTTTCATAATTGGGATCTCTCTGT
GTACGCGTAGTACTTTAAATCTTTCATGGTGAATGCTGCTCATTTTGCAT
TCTAGACAGAGTCACCAAAGGAAAAACTCGTCAAGTCTAAACTAATACAC
TCAGATGATATTACCTCTTCTGATATTTGTCCTTTGTGATACTTTTATTT
GGCGCACCATCCCTCTTTTTTTCTTCAACATTGGTTATTACATCTTGAAT
AACGGTTATTACATCCTGAATTAACGGTTATTACATCCTGAATAACGGTT
ATTACATCCTGAATAATGAAATAGTGAGAGCATATGAATCTTGTTAATTT
CCGCTAAAGAGATACCATATGTTACTCATTGCAGGGTGCTTAATTTATGA
GCTCTTTTGTGGTGGAAAGTTGACCAGGACAGAGGACCTTCGCAACATTG
CTTCAATCCCAAAGGTTAGCTTCCATGATTGCATTTTTTTTGGGGGGTTG
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AGTACATTATTTTGACATGGTTCCTGTGACTCTTAAAGTAAATGATTTCC
ATTTCTTTTGTTGCAGTCTCTGCTTCCGGATTATCAGAAGCTCTTGAGTT
CTACACCTTCTCGTAGAATGAATCCTTCAAAACTTATTGATAACAGTGGT
AAGTTCAATAGTTTTTCCTTGTCATTCAGACTATCATCTTATTTTGTGTG
ACATTTTCTTTTATTAATGCCGGTTTTCTTCAGTCTTGTTAATAATGCTG
CAATCCTTTTTACTCCCCAGACTATTTGCACTATGTTGCTTACAATTTTG
ACTTCTAATTTCAGAGTTTTTCCAGAACAAGTTGGTAGAGACCATCCAGT
TCATGGAAGTTCTTAATTTAAAGGACAGTGTTGAGAAAGATAGCTTTTTC
CGGAAACTCCCAAATATAGCAGAACAGCTTCCCCGCGAGATAGTTCTGAA
AAAGGTACGTGGAACTGAACCCATGAGGCTATGATCCTGTTTCTTTGGAC
TTTGGTGATATTCTGTGCAACCAACTGGAGTTCCTTGTTTATGTATGTAT
ATGGTCTACTTTGTGAATAGTTGCTCCCTGTATTGGCATCTTCTCTTGAA
TTTGGTTCAGCTGCTGCTCCAGCCTTGACTGTGCTGTTAAAGATGGGTTC
CTGGCTTCCAGCTGACCAATTTAGTACCAAGGTTTGTCTTAATTAATTTT
ACTTTCACTCAGTACATGTTAGTTTTGGCCATCCAGCAAAGACACTTTGA
GGGCTTCTTACACAAGTTGATAATACTGGCCTTTTTCAGGTTTTACCGAC
TATTGTGAAACTTTTTGCTTCGAATGACCGAGCTATCCGAGTTAGTCTTT
TGCAGCACATAGATCAGTTTGGAGAGTCATTGGCAGCACAAACAGTTGAT
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TGTTGGCATTTGACAGGAGTCTTAATGTATCTGCAGGTTTTTCCTCATGT
TGCTACTGGGTTCTCTGATACTTCTTCTTTTCTCCGTGAACTGACATTGA
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GGGCCAATGTTTGGTTGATCATGTCTGTTAGGTTTGCCACCTTAAGCTTA
TTTCATTGAAGAGTTTGGAATGATGGCCCACTATTGCCTTGGAGTTTTTA
CTTTTCTGTTCCCTTTAGATATGATATGAGTGTCAGGTGTGCACAAAACA
CTTCCTGTACTATGCTTGTAAAGAACAAATCCAGGGACTTCAGTTTGTTC
CATGTTCCTTTATTTTCCATGAAAGTTCTTTTCGCTAATCGGCTGTTCTG
TTACTGTAGTTATCTCAGCGTACAATCTCAGGATCTCTCTTGAAATATCT
CTCTAAGCTCCAGGTGGTGTTTCATTCTAATTTGTTTTTTAATCCAGTGA
TGCCTTCTTGGATATGAGATGGTTTATATTTAGTAAATGCATTGTTATTT
GTCTTCAGGTGGATGAAGAACCTGCAATCCGGACAAACACTACAATTCTT
CTTGGGAATATTTCAAATTACATGAATGATGGGGTTTGTCTCAAAGATGC
TCCGATCTTTGGTTGCTTGCTTTTATTGCTAGTTTTCCTTTGAAGTGTTA
CTTGGAGATGCTGCAGTTGTGGTCTCTCATTTTCAGATGCAGCAATTGGT
TCATACATCTAGGGAAATTTTGACCACCATTTTTTTAAAAGCTCTAAATC
CCAATTGTTTTTCTAGCCTTTTGTCTCCATGAGCAGGGTTTAATTTTCTG
TTAACACTGGCTGGTTACTGGTGGCACAAACACATAAAATAAAAGGATCG
GAAGAAAATAGTAGTTGGTTGGTAAATACCAGGAAAAAGGCACAGTTTGC
CCCAAAATGGGAACATAGCAGTATCTAGTAGCAAGCTTAGTAAGCTTAAA
TCTTTTATTGATTGATAGTGCAACTTCTGCATTTCCTTCTGTAGCCTGGA
TGCAGTGTTCATTCTGCTAGTTTTACAGTTCCACCCTATTTAGTCTTTAA
CATGGCTTTCTTTTTCTTACAGACTAGGAAACGAGTATTAATCAATGCAT
TCACAGTCCGTGCATTAAGAGATACCTTCCCTCCTGCTCGAGCAGCTGGT
ACATTAGCCTGAGAAGATGTGCTGTTGTACTATTGAGTAATCTTCCATTG
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CGCTGAGTGTCACTAGTTCATACTACGAAATGACAGAGATTGCAACTCGT
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AAGATGGCAAAATGTGATGTTCATCACATTATAACCTGTTGTTTTAGTTC
TTACTGTACTCGTACTTTTGTAACATCTCATCTTCCAATTAATCTGTTCA
ATTGTTTTATAGTGACGTGAGGACCAAGGCTTTCCAGGCTACTGATCAAT
TCTTGCAAATAGCAAAACAACATCATGAAAAGGTAGCATATGTAGTTTAT
CTGCTTACTATGAGTTCACTACAACTGTTTTATGACACTTTGTGGGTTGT
GGCGCATGTCACTATTTACACTCCCTTGGTTTTCTTTATTCCAAACGACT
GTCTCTCTAAAGCATGCGTTGGAGCAAATTATGACCAATACTTGTAATCC
TGACCCCACTTTTGGTCTGGATCTGATAAAAAAATGGAAGTGCCAGGCTC
ACACAAACCCGTCTTATCTGTAATACTAGGTTAATTAGTGCTCTGTGCTC
ATTCACTTTACTCCGTTTGACTATAATTGTCACAACTGTCACATATCTCT
GTTTCAAATTAACTGTCCATGGAGGAAATCTAGAGTGTAGTTAATGCAAT
ATTCCGACCTCCTACCTTTTAATCCCTTGGAAAAGGTTAAGTGATGGTTG
TGATAAGCTCAAACACTGGCTCATCGGAACCTGTAAGAATCTTAAGCACT
GGCTCACCTGAACCTACTGACGGAATAAATTTACCGTCCTTCTGAAAATT
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TGTATTTTCGTGGCATGTCCAAAAATAACAGAAATTAGAGCATATTATGA
CCATCTTTTGAAAATTTCAAAATAGAGTACCTGCGCTTGGGTGTACAAAG
TACATGCCATATGCATGTTCATTTATCATTAGTTATTTCTTACCGCTAGT
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CCCTTTATTGATGTTCCTGTTCTTATATTGTTATTTTCTTTGCTGTGTTG
TGTTTTATATAGCTTAACACGGGAGACAACAGGGCAGGCGAATCTACTGT
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TTCCAATCGTCATATGCGGGATTTACTTATTATGTCTTACAATTCAGCCC
CTTCATGTATGGTAATTGGTAAACCAGATTTCCCAATTCACCTTGCTTTA
AACCATTATCTATATTTTTTATTGGAATTGCATCTAGTATGTGTTTAAAA
CTTCAAATAAAAAAATCATATATCTAATTCAAAATTATATTGTTCTAGAA
GTTAGGGATAAGAACGGCTATCACCCTTTTTCATTTGAATATTATATTGT
TCTTGTTAGATTGTTTTCCTTATATATTCTCTGCATTAGTGAAGTTCCAC
ACGAGATAGAGCTCGAGTAAGACAGCAAAAGAGTATGCATTAGATTGGAT
AGCTAGAGATATAGTTCAGTTTGATTGGATTGCTAGAGGTAGAGTCCACG
TGTTAGGCGACAGGTTGAATCAAGCCTATAAAAGAATATGCACTGTAACA
TGTGGTTGGAGTAAAGAAGAATCAGCTCTCTCTCTCTCCCAAATAATCTG
TGTTCTTACTCCTTGAAATTTCCATTCAAGCCATGCCATTTGATAGTGTA
TGCGACGTTCATCCTATTGTGAACTGTTCACAACAGAAGTGTCCCATACT
ATGTTAGATCCCTTTACTTGTTCTGATGCTTAAGCCACTGACCAATGCAA
ACCATTATGTATTTATTGACTACATATGAACTTGTGCAGTTTATATCAAG
TTTTTTCTGGTTTTGTATGCAATTGAACAATTTATTATAACACATTTGTA
TTCAGGTGGGCCATGAGTTCTATTACTCAGAAAGGAAAACCTTCCGATCA
TGGTCCAGTATCTACTGCAAATGCCAATAACACTCAAGTTTCAGCACCCC
CCAGTGCCACATCAGGTATTGGTCCTTAGCTAAATTGCTTTAATCCTTGA
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AGGTTACAAGAAGGTGTAATAATTGTTTGAAACGAGGATTAATAAAAATT
ATAAACATGTGAATCCTCATGTTCGGTCAATTATATTGCAGCAGATACTC
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ACTGCACCAGCATTATCGGGCTCCTCTGTAGATGGATGGGGTGAAGTTGA
GAACGATAACCAGGAAGGGAATGGTAGCGACAACGAAGGATGGGATGATG
TAGATCCATTTGAGGAGAAGTCACCACCATCTCTTCTTTCCAACATACAT
GCTGCTCAGAAACGTCCGGTGGTGCAACCAAAGCAACCAAGTAAGTTATA
CTCTTTTTTGTCTGTTCATTCGTAATAACTCAAAAACATGCGCAGCTTCT
GCTAAAGCACTCAATGATTAATTCATTCTCTATTTTTTTTTCAATCATAG
TTCCAAGTTCATCAAGATCAAATCCAGCAATGGCACCAAAAGCAGAAGAT
GATGCTCTATGGGGTCCTATGGCTGTTCCAGCACCCAAAAGTGCATCGAA
ATCTGCAGACATCAAACCCTCGGTGTCACACAATAGTGACGATGACCTCT
GGGGTTCAATAGCGGCACCTCAGCCGAAATCATCTGGGAGGCCTTCGAAG
CCAGCAGCAGCAGCAAACAATGACGACCTATGGGGTGCCATCGCAGCACC
CCCACCGGCAACTAAAGCTAGGCCTCTAGCGTCATCAGGTAGGGGCCGAG
GAACGAAGCCAGCACCAAAACTTGGTGCTCAAAGAATAGGAAGGACTTCC
TCAACTGGGATGTAGAGTGCCATGATACAGTTGTTGTACAAGGATGTGTG
TTTTCCCTTTTTCCCCAGTTGCTCTGTCTAGGAGATCCCCCTTTTGTAAA
CTAGCCCAATCTTTTACATGGACATGATTTTGCCCATTGTATTACTTCAC
AATACGAGAGATCAGTAGATTTGTATATCAAAGGTAAAGTGCATGCACTG
TTCTATTAATATATGGTTTTGCCATTACCTTTCTGGGCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.