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GrainGenes Sequence Report: AA016145

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Sequence
AA016145
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA016145
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGCCTACCAGGACAGCTATCTCTAGCTGCCGCTTCCTCTCCAACCCCACC
GCCCCCGCCATTGCCAAGCCACCCGAGCGCCGCCCATGTCGAGGTTCTGG
AGACCGGGGTCGGAGAAGCCGAGCGCCTCGCTAGTCGACGATGAGGAGGG
TGGCGTCCTCTTCCTCCCGACCAATACCAGCTCTTCCCCCTCCGGGTGCG
CTCCCCAAACCCTAGACCCTCTGCCTCTCCCCTCTCCGTTCGCGCTCCCT
ACTTGCGGTTCCTAAACCTGTTCTGGGTGCTACTGCTTCTGTTGCGGTTG
ACGCAGGTTTGGGTACGCGTCGTTGGAGAGGCTCAGGCAGCGGCTGCCGG
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TCCTATCTAATTCTGTTTGTGCCCTAAAAAACATTCAACTTGGCTCCAAA
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TAACTTCATTGTATTTTGAACCAGTATCTTAAGGAGGCTGGTTGGGCTGA
GGGTGGTCGACTTATAGGTTGCACCCAGCCAAGACGATTAGCTGTGCAGG
TATCAAATCGTTTAAATCTTCATTCAGTTGTGCATCTTTTCTTAGATACT
ATATGAAACTAGGCCTCTCTTTACTGTTCGCACCAGATTATTCTTTTTGG
TATGTCCCTAGCCGTGGCACATAAGGCTCTCAGCTACTCATTTTTCGGGC
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TGTTTCAGAGTAGTCAGCCAGCAGAATCATATCCGTACTTACTGCTTAAA
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GATCAATTTCCCTTTTCAACACGTCTTAATAATTTGAACAGACTGTTGCA
TCAAGAGTAGCTGAAGAAATTGGTGTGGAACTTGGGGAAGAAGTAGGTTA
CACAATCCGATTTGAGGATCAAACAAACCCGGTATGATCAATTTTGTGTC
CTTCAGTGTTTCTTTATCTGAATTATGCATCGAAACACATTTTTCGGTGT
ATTGGCTCTATTTTTCTGCTTATACCCTACATCATTTGACAGGGTATGAC
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ATCCTCTTTTGACCAAATATAGGTACATTCTTATGACTCTCAATATTAGT
ACGACCTTAAATGGCAGTTCAAATTGTCACATGTCTATTTGTCATCATTA
CTCAACCATGTGATCAAATTGTATATCCTTATTGTGATTATACATTTGTG
GTGGTAATCATAGTGGAGTAAAAACACCTTTCTCAGTTGGATGGTTCCTT
ACTGATTTTACTTTATTCACATACCAATCCATGTTTTTGTTTCTTTTAGT
GTAATTATGATAGATGAAGCTCATGAACGATCCATTTCAACTGACATATT
GCTGGGACTCTTGAAAAAGGTTTGCAATTCTGAACATGCAGGCCAGATTT
CTCTTCAAGTTGTCTGTGAATAATATTCCGTTTCTGTTTTGCATGTTTCT
ATACATGAATTCACCAGATTCAACGCCGTCGGCCGGAGTTGCGTTTAATC
ATTTCCTCTGCAACAATTGAAGCAAGATCAATGTCAACCTTTTTCAGCCC
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TTCTTTTTGTATGCAACATTCCCAAGAAGTGCAGTGCAACTATCAGGAAA
TCATCGACAAAGTATTTGCCATGAAGATGATCTACGTAAAGGAGTGAAAT
TTCCTTTTAACTATATTAAAGTTTATATGATATCTTCGTCAGCCATGGAC
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GTCCTCAAATGTGATACACACCCCAATTTGTGCTAGCAAGTTAGTGATGG
CCTGATCTTTGAATTTTCGTTCATGCTCATGCGCAGGCGGAAGAATTCCT
TGCTCGAGCCTAGTGATGGTTTGCCAAATCCAGAACCTGCTATACTTTCT
GTCGAAGTATGTGTTGTTTGTTGATGAAATATAGATGGTGAAGGGGTCTC
TTCCTTATTGATGTGAGTACAATTTGGTTCTACAGGGTAGAGGGTACACA
GTGGAAACTCATTATGTGGAAGAGCCTGTCTCAGACTACCTGCAGGCTGC
TGTGAATACTGTTCTTATTATTCATGACAAGGTTAGTTATTTTGTGTTGT
GTAGCAAACAATAGATTCAATGTAGGTAGATTATCATGCTTCTTAAAATG
TTTTAATCATTTTGGAACATTTGGTTTCCTCACTGTCAGAGATTACACTT
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ATTAAAATTTTAGATGCTGTGCTGCAGCTTATATAACTTAACTACCGCTG
AACTATATGTGTGGATGTCAATTGTTTGCTACTCGATGAGTAGCAGGTCT
CATGAGCAATTAAATGCTCATTCTTGTAAGCATTGAAGCTCAAATTATGC
ATATCAGCTTCAATCACACATTCACACTGCATTTCTACCCAGAAAAATCG
AAACAGAAACTATAAACATCAAAATAAAAATGATTGTTATTCAATGTTGA
TTAAGAGACATAATCACATAATCCGCCAACATACTTATGGAGGAACGAAT
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GATCTGTAGACACATTTACCTTAAAAAGTAAGAATCTCGTCTACCTCACT
TCTCAACATTAATTCATAATATCTGTAGGCATATTTATCTTACACAGTAA
GCATCTCGTCCGCCTCACTTTTCAACATTATAGTTTATTATTATCAAACA
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CAGACACATTTTTTCTATTCTAGTCTTTGAGGCGTATTTGGAGCTATCAT
CAGTCATCTTTGTAGTATTATGGTGGTGTGTTTTCCAATAATTGTCTTTC
CTGAAGCACGAGTGAATAGTGGGATTCTAAAGGGTAGCAAAAATACTAAG
AGGGGCAGGGGGCAACCAAAGTTGACATGGGAAGAGGCAGTAAAAAGGGA
CTTCAAGGATTGGAGTGTACCTATAGATTTAGCACTTGATAGGACTGCAG
TACTAGAATGTGCAGGAATGTTAATCTACTTTTGTTGCAATTTGTTTATT
CTTTGGTTGCCATAGGTTTTCGTTGGGTTTCATCTCTAGCCTGTTATTTT
CCATTTTACTCTTTCCAATCATTCAATACCGGATAAATTTCTTCTATTAT
CATTTCTACAGGAACCACCAGGGGATATTTTGGTCTTTTTAACTGGCCAG
GATGACATAGAGGCTGCTCTTAGGTTGCTAAATGATGAAATTCAACACCT
TGGGAAACACTATTTTGGTAAAACTTTTTGCTGCATGTTTATGATAGAAT
AGGTTGCTCTTGAAATGGATGTCTGATCCTTGCGGGAAAAAAAGTGATTA
GCTTGCGGTAGTAAATTATAATGCATTTATAATTGCTTTGTTTCTCAGAT
TTGGTGATTTTGCCCTTGTACTCCGGCCTTCCACGGGGAGACCAAGTAAG
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GCCGACTTGCTGCTCCATGTTGACACTATTTAGTATTTGTTATCTTTCTA
GGACCTCATTTTTGCTCCTACTTCGAAAGGGAAAAGGAAAGTTGTGATAT
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GTAGGCCGTGGTGTATGTTGTTGATAGTGGATTTTCTAAGCAGAAGTGTT
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TATGGAACTGTTAATATTTCATCCGAGATAGAAAAATTGTGTAGTTTTTT
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GTATGTTGAGCAGTTTTGTTATTGAAGTATTGGGATTGGTGATGACCTCT
TTTATGTCAGTTCTTGATTTATTTATGCTGGTCTATTTTTATTCTTAAAT
CCTAATTCTTAACTCTATTTTTTGTTTAATGAATGTTTTCTTATCTACTG
TTTTGTTTCTTTTTTCCACCCTTACTTTTGAATATTTTCAAAGCCAAACT
TTCATGTATTGAATTCTATAGATCCAGTATTCTGTGGACTGTAGTATTTT
TCACCTTGGTGTGAAATACTTTACCTTTTTGTGCATCTCATAAGCTTATA
TCTCCTGCAGGCTTTATACAGAGGAATATTACCTAAATGAAATGCAGTCA
GATGGCATTCCAGAAATGCAAAGGTCTAACCTTGTTTCCTGCATAATACA
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TGTAGTGCTTCAAAGGGAATGATATTTGCTGAATGTTATAATCACCCTAC
CTTTTGTTGCTTATGCTGTACAAGGGAACTTTTGTCAGTTTCTGGCCTTA
TATGCAGGTCAACTAATTTTACATCACAAAATGACATGCATGGCAATATT
GTTTCACGCCGAGCAGTATAAATAGTATTTACACATGTGCTTTTCTTTAT
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TACTGATTTACTAAATAATAAATATATATTAGTATATCTCATGCTCATCG
GCACATTAATCAAGCTAGACTGTTAGGGCTTTTCTTCACATCACTAAACC
AATGGTGATTCATTCTAAAAAGTATCACACATAGATATAATTATGCTATT
TGTTCGATAAATTCTTGCCAATCCTTGGGCGTCTGACTTATACTACTGTG
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TGCACATAGTATAAGATTTATGAGTAATATATAACACATTACTTATTATG
TTCTGGATGACAGTTAAAAGCGCTAGGCATAGACAACATTTTGGGGTTTG
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CTATTTTCACTAGGAATCCTTGATGAAGATGCCAAACTAACAGTTCCTAT
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CCTATGATGCTTGATTAATGTGCATAACCATCAGGCATGCAGTGTTACTC
TGCTGAACTTGGTTGATACTTTCTGATAGCATGCGAAACTAAACTGCTAT
ATTGGCCATTCACTTGCAGGATTTTTTTTTGTACTTGTATGGGTTTTTAC
TACACTTGTGGTGAATAATGTTCTCTTCTCAAGTCAAATGGTTGTTAACA
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TATCTGTTCAGGTTAGGATTTGTCTCTCATAGCCCTTCATTATATGTGCT
ATTTTATTCTTGAATTGTTCTGACATCCGCCTATTTATAGTCTGTGTGGG
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GCTGCTGCTGAGGTTTGCAGAATAGTTTCTTGTTTACTCAGGAACCCTGA
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GATGTCAGTTAACTAGCACCACCACTTGAATGGACAGTTGCTCTTGTTTT
CAGATTTCAGCAAAATCCTCAACGTGTACTCTGCTTAAACGATTTCATGC
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TGCTCTTGACTCTTGTATTTATATTGTACCGCAGGGTGATCATGTAACAT
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AAAGAAATTTTAAAAAATAAGAATATGTGCATATCGAAAAACTATGTTAT
CTTTCTTTGCCGCACACATTCATTTTGAACAGCACTTTGTGTTCTTTGCT
GCAGAAGAAGGTAATTGAAATCAGGGCACAACTTGTCAGGGTAATGAAGA
GGTTTGGCATACCGCTGAAATCATGCGACAGAGATATGCAGGTAGGGATC
TTTCCAGTTTGTTTTTTCTCAAACACACATCAACATGGATGTCATTTTGT
ATTACTCGAAGCATCCGTAGAAAGGCGCGAAAACTTGCAGGGCAAACAGG
AAATAAAAATGCACAAAACTACTGAAACAAAAGCCTAGGCTATCAAAACA
AAACCTATCCTAAGCCACAGAAACATAAAGAAGGCAAAAAGAGCAAGGCG
CTACGGCCTGTCTAACATGTCTAGAAGCCTAGACTGAAGATGCAGCCTCC
TCAAGGCCTTTGCTGTGGCCAGCTTTCATCACTTGTGTTCAAGCAAGATG
TTTTCCGCAAGTGTATAGCGGGCTGGGCGTGCCCCAGCGAAGACGCAAGT
TTTTTTTTTCAGTTTCAATTATTATTTTTTCTTTGATACTTATGGCACAA
GTTCTCTGTGCATACCCGGGCAACTTCAAGTGTTCTCTCAAATGCCATTC
TGCAATTTTTTCGTAAATATTTTTTTTATCCCTATGATCCATATATCCTT
TAAAAGATCTCTACTTTGTCCATTTTCTGTTAGTTAAGTTGGTCATTCAA
GTGATATTCTTAACTGAATGAGAATGCATTTAGTTTTCAGATTGTGCTAT
TATTCATGTGCACTTTGGAAATTAGATCCTCTTATGAAATGGATTGACTA
TATCCTGCTTGATTTGCTTAAAACTTGACCGCACTCTAATTCGGCATAGG
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GTAAATATTACGTAGCAACTAGTTGTTTTCAGTATCTGCTTCGTTTTGTT
CCAATCCATGGTAAGTACTGCTGCAAATGCTTAAAACTTCCTGCCTGAAT
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ATGCACTTATGCTAACGGTATTGTTATCTTGGTATTCTGCAGGCAGTTAG
AAAGGCAATTATTGCTGGTTCATTTGCTAATTCATGTCATCTGGAGGTAT
TTACTCACATATTACATTATAGAGCAGATTTCATGTTATCATGCATCTCT
AACAGGTAGCATGTAACAAGAGCTTTGTTTCCCACATAAAGCCTAGTATG
CAATTAGGAGCTGCAAATTTTCCATGGTTCATCAGTAAACTGTTGTACAT
GTCCATACTGGCCAAAATATTGAAAATGGAACTACCTGCAGCCATCATCC
TAAGATTTCTTATGGCATATCTCACATTCCAGAAGAGCATGCCAGTCTTC
AATGAATGATTAGACCCTTGAAAGTGGTAAGATACAGATGAGAATCCCAA
CGAGCACATAAAGGGCAAAGGCCCTGGGATGGCCACACTTCTATCTAAGA
ACTTATCAACTAAATTTATCATTTTGTGGTTGACATGCCCGTGCACATTT
TTCTTCATTTAAGTGCAGCTATCAGCTGCATGCAGTTCTCATGTAAGTTG
CCAGTGACCCTACTAACTTCCTCTGCTACATAGGAATATGGCCAGAATGG
AATGTATAAAACAATTAGGACATCACAAGAAGTTTACATTCATCCATCTT
CTGTGCTCTTTCGGTGAGTTTATTTATTTTTACTCTGTTCGTTATTTCTT
TGGGTGTCCTTTTGGTATAGCTCCTTATGCACTTCATGACATTGCACTGA
CGTTTCAGGGTTAATCCAAAGTGGGTCGTGTACCAGTCACTTGTTTCAAC
TGACAAGCACTATATGCGTAATGTTATTGCCATTGAACCATCATGGCTCA
CTGAAGCTGCACCACATTTTTATCAGTTCCGGACACCCAATCCTGCTCCA
CACTAACTTTATTGTGGTAATTTCTTACTCAACAGTGTTTTCCTTCCGTT
TATCCATTGTAATAATGCTGTGAAGTTTCATATGTTAATATGAAACCTGG
TTGATTGCAGATAGTGGAATGTCACATTAATGACAAGAGTACTAAGGTAT
CACACCTTTTGCTCTTTGGCTAATGCACTAAGGTTGGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.