Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039156

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039156
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039156
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGGCACGTCCGGATTTACAGGCTCCCGACGTTCCGTTCCCCCTCCCCTC CACTTCTACCTTCCCCTCTTTCCACGGCTCAACCGTAATGCTGGCTCATC ATGATGAATGAACAACGGGTAGTAGTACTACCAGAATCGGCACGGGGAGT ACTTGCCAAAACACGCGCATCGCTTTCCCCCAAATCAAACACGCGAGAAT CACAGATACGCTTGGCTTCCCTCCCTCGTCCACAACTCATAACTTCGGCT TTGCTCCCCTTCCCCCTCCCCCACTTCGCCAACTTCCAAGTCCTTTATGT CAGGCGGCGGCGGGCTCGTGAGTAGCTAGCCTCTCGTGCTCGGCCGGGCC AAGGACAGGAGGAGATCTTCTGATTGCCTTGCCGAGCGAAGGAGGGGGCG ATGGTGGGGGAGCCGGCGAAGCGGCTGGCGCGGCGGGTGATGAGGAGGCC GCTGGAGAAGGCCGGGATGGTGGGGCTCGTCGCGGTGGCCGCGGCCGCCG TGGCGCTGGTGCTGCTCGTCTGCGCCGCATCGCTCCGCTGCTCGACCGCC TTCGACTACGCGCTGGCGGCGCCCAGGAAGCTCTGGAGCGGCGGGGTCTC CATCGCGGCCGAGGCGTCACCGTCAGAGAGGGCGCGCGTCAACGGCGCGG CGGCGGCGGCGCCGCCGCCGCCTCCACCGGTGGTGGGGGAGGAGTGCGAC CTGTTCGACGGGAAGTGGGTCTGGGACGACAGCTACCCGCTCTACGATTC CAGGGAATGCCCCTTCCTGGACCCCGGGTTCCGCTGCTCCGAGAACGGCC GCCCGGACGCGTCCTACTCCAAATGGCGCTGGCAGCCGTCGCGCTGCGAT CTCCTGAGGTTTGGTTCCAGTTCACTAGTAATTATTGCCGTGTCTTCGGT ACCAGATACCAGCCGGCTCCCCTCCGTTTGGTTACTGAATTTGGGGGGTT TCAGGGTTTAGATACGAATCCACTCGAATTTGGTAGTTTCGCCAATCTCG TCATGGAGAAATTTCCTGTTACTAGTAGAACCTTAAAAATAAACGCCTAC ATATACATGACGATCTGTGGTTGTGGGATGAACGTACAGTCCACATTTCT ACTCACAAATTCCAATCCAGGAAGGGGCCTTTGACATGTGGATAGGTGGC TTGCAGTTTAGGATGTCGAGTTGGGGTTCGTTTTCTAGCACCTCCTTTGG TCAACTAGTCAAAGCAATTAGGATGGCGATGCCTTTAATTAAACAAACAT GATGCAATCTAGCATTCAACAGGTTATCTTGTGGATATGACGCGGATTAA AAGCTGCAGCAGTAGTTCTGAATTCTGACTTGTGAGATGTAGATCCATGG GTGTCAATTTTATAATCTGAACCCTACTCAACATTAGATTATTGGAACAT GGTGCTGCAGACGACTGTCTCACCTTGGGTGTTGGTATTGTACTATACGA TTGGGAACACGATGCCCTTTCACCCTTTGCTCTGATTGACCTATAGTATA TAACAATGTCGTGCACAGAGTTAGTCCTTGGGTAAATACATTATTGGTAT CCTTTAATTACTCAGTCTGGCATGATGTCACCTTGCCACATGTGGTTATG AGAGGTGGTCTCTTCCTGTAATTTGCTGAGTCCTCTGTTATTTATACGTT GTTAAATGTTCTGTTCAGCTGCATCATGGAGTGTGCGATATCTTATTTAG TTAGCTTCGTTATTTAAATTTGGAAAACTGTAGTGAGTCTAGCCTAACTT TCTAGGGTCTATTTTCTGCCTTGTTACCAAAAACAAACCAAGTATTGATT CTTGTTTTCATGCATGTGAACAAATTTTACCTGGAGTAACTTCGCTGTCC TTCATAACCACAATTATAGGAGCTATTCTGGAATATTGCTATGTTAGGGG ATGTGCTATGTATATAAAAAGGTCAATTTGATGGAAGCATCATGAACCTG TAGAATGTTCAATTGTTTGCTGATTTCTTTTTCCTTGGTTAACCCAACCC AGTTTAAGTAAAGTTAAACTGGGTTATGAGAACAAATAGGATGGTATATA AATGAAAATGACAATCTAATGCCATCACAGCGTTATGTTGTATATTTTTA CTACCAAATAGGATGGTGTTAGTTACTAGTTACATGGCGCTAGTGCTAAC TGTAGCCATGCAGTACTGTGAAATTACCATCATTGCAAAGGCAGCTAAAT AACAACACATTGGTCCACTGCTGCTTCCATTTGATTTGTGCCGCTGATGG TGGCATTTAGAAAATCCACATGTTTACATTATGTAATGTATAGATGTGAC TGCAGCGAATAGCTTACTGTGCTTAGTGCATTACTGATGGACAGACAAAT CATGAGCCCTTATGGTGAAACAAGAAAGTGCCTTGTAATGAAGTTGGAAC TTGTACATTTGGCGCTTGTGAATTGTGATATAGTCAACCTTTACCTAGAA TAACCGAAGTACTAATCTTACTGAGAATATGACCGCCTTTGAGCAACTTG TAACTTCTTGGAAGCCTAAAATAATACTCCCTCTGATCCAAATTAATGTA CTCAGATTTGTCTAGATTCGGGTGTATCTAGTCATATTTTAGTGCTAGAT ACATCCGAATCTGGACAAATCTGAGTCCATTAATTTGGATTGGAGGAAGT AGCTGATTGCCAGGTCCTTTCTATTATGCAAGTTCATGATTGTTTTTTTT TACTTCTGATCATGTCTGTGCGAGCGGAACAACTTTAATAATCTGCACCT CTCCTCTACAATATTTGATGTCAACTTCCTGACTTGATCATATATTTTTC TTCCATTCCTTAGATTTGATGCCAAAATTATGCTCGAGAAGCTACGGAAC AGAAGAGTAGTATTCGTTGGTGATTCAATTGGAAGGAACCAATGGGAGTC TCTACTTTGTATGCTCTCTAGTGCTGTTCCTGACAAGAGCTCCATCTATG AAATTAATGGGAGTCCCATCACAAAGCACATGGGTTTCTTGATTTTCAAG TTTAGAGACTATAATTGCACTGTGGAGTATTACAGATCCCCTTTCATAGT CCTTCAAGGTCGTGCACCAGCTGGAGCCCCTAAGGTTGTCAAGTACACAA TTAGGGTGGATGCCATGGACTGGATGTCTGGCCGGGGTAGGTGGAGGGAT GCTGATATTTTGATCTTTAACACTGGGCATTGGTGGAACTACGAGAAAAC AATCAGAGGGTAAGCAACTCAGATTATATATTATGTTGACTTAATAACTT ATCCTGTTTTACTGTCAATTTTTATTGTAGATCTCTTCTTTCGACCGACC ATACTTCTTCACGGTCATGAATTCACCTTTCAAATTCGATATTAATATCC ACTGCTGATTAGTATATACACCAGATTAGTAGTTGGTTGATATACACACT CCTTTAATTTGTTAATTTGTACTCCCTCCATCTCAAAATAGATGTCGGAA ATGTGTTTAAATTTGGATGTAACTAGACACAAATTTAGTACATAGATATA TCCAAATTTAGACAAATTTGCGACATCGATTTTGAGACGGAGGGAGTATA TTTTTCTATTAGCTATTTCACAGAATGATGATACTATCACAGTTCATGTG AGTATCGAGGATATGGAATGTTAAGATGTGGTTAGAGCTAAATGCATAAA AGCAGGTCTTGGAACTGTTTTTATTCTCTACTAGAACAAAACCCGTGCGT TGCGTCATGATTAAATCAAATGAATATTATTTTAGTATTTTAAATCCACC AGAAGGCCAAATCTAAATTTTAGGAGCATTTGATTTGCATGTCCATCGTA CTGTGCAATAGTGGAAGCCCCAGAACATATAACTGAATTGGCATGCAGAT GGATGTAATAAGTTCGCCAAATGGATGCAAAAGAATAGTGCCAATGAAAA GCAATGAAACTGAAGATGAAAATATGGTAGATTTCTGCTACTTCCAGAAA TAGAAAGTCCACATAGAATTTATAAGATATTTAAAACCCAATTCGTCTAA AATACATTTTAATTAGCCATTTCGACATTGTATGGATGTAAAGCAGAAGC AAATTAAATATATCTTATTAAGTACGATGCATTTAGGATACTCAGGTATA ATATTAGGATGTTGTATTCATTCCATTTGAAATGTACTTAGTAGGTGTAT GAAAAAATCTTCCTCCTCTCGAAACCATTTTGCATGAGAGTTGAGAAATG ATGATTTGCTAAAGAAAACCAATTTAGTTTTTTATAATTTTGTTATTAAA AATAAATGAATCTACGAATACCATCTAATTAGGACAGGCATACATATATA GGAATAAAGATATGAGGTTGCCGTCTATGTCTTCTCTCCCCTAACGAAGC CAGAAGCAAGCAGACAAGGAAGCATGCAGTAACACTGTATTATGTGATAT GTGTATTGTGAAAAAACCAAAATAGATAAGGATTGTAATTAGGCATGTAA ATTCTAGTATTTCTCCCGTTTACTTTTGAGCATACCAAGATTTAAAAAAT TGCAAAATAACACAAATAATCAATAGTACTTTTGGTGATATATATTACTT CCTCTGTCTTAAAGTAGATGTCAAAAATTTGTCTAAATTTAGATGTATTT AGTCACAATTTAGTGTGTCGATATATCCAACTTTAGACAAACTTAAGACA TTTATTTAGGGAGGGAGAGAGTACTATGTTAACAGAATTTTACAGGCCAT GTGAATTAGTCTCGGCCAAAACAAACAATAAGCTACTCGTTCTGAAACTG AAACCCAACAGGAATGCTCAACATGAGCAGGTGCGCGACACAAGATTAGT TCTCCTGCCTAGTGCCTGCTCAATGCACGGCAAGGACAACCGCCTCTCGG CACTCGTAGGCAGGACCGCATGAGAAGAGAGGACCGCGGCTGCATCTCGC TCTCGGGTTATTCCGGTGCCGCGGTGCCACTCGAAGGTCACGAGCTCAGG GCAGAACGGGAGGTTGCAGGGATGGAGATGCCAGACCTATCTGGTTGTCC TCTTCTCGCTCACGACCTGATCAACTTCTCTTCCGTCCGACGTGTTTGCC ACCATGGTTCTGCTCTAATCAATGCTCTTTTTATGGTTCTGCACCAATAA CGTTTCGGTGGCATTGGTCTGTAATATGGAATTCGGTGGGAGGGCAAAAC GGTCCCAAAAAGTGTTGGACCGGGAGAAACACTTCGTGTTTTATTATTAG GTATAGATTAATCCATACAGAGAACTTACTACGTGCGGGATTTGGTTCCT AGCCTGATCTATCTGATGACTGATACGTCATTATCTGTAGTTCGTTTATT TTGGAATCAATTATTCGAGATCAGCATAATTGCATATTCCGTTTACTTGA ACTAGGCTTGCTTTATCCATAACAGGGGTGCCTATTTCCAAGAAAGAAAT GAGGTGAAGATGCAGATGACTGTTAATGATGCATACCAAAGATCAATACG AACACTATTCAATTGGCTTCACAAAGAAGTTAACACAAGCAAGACCCAGG TCATCTTCCGTACATATGCTCCTGTGCACTTCAGGTCTGCATAGTGAACC ACTTATCAACGCCATGTCTTCATTTTTGTGTTTCCTTGCTACTACCTCCG TTCCCAGATATAAGATGTTTTAGCCTTTTTCCGAAACACATGTATCTGGA CGTCTTTTAGAGTTTTAGTTTGTAGGTTCACTCATTTTTCTCTGAACCTA CACACTAAAAGGCGTCTAGATACATGTGTGTCAGAAAAAGGCTAAAACAT CTTATAATTTGGAACGGAGGGAGTCGAACATTACCTTGAAAACAATTATG TTTGAAGGCCCCAAACAATATCATCTCATGTTGCTGATTTAACACAATAA ATTTTGAAGTTTGGATTTACTCATTATGTTCTTGATTTGAAACTCCATGA ACTGCACTCCACTGAACATTTTTGTTCAACATATAATCCACCATTCAGCA GTCGTTATCACCGTTTTTATTGTCTTTTTGTTCAATATATAATCCACCAT TCAGCATTCTCCCATGGGTTTTGGGTTCTCATCGAGAGGCCTTGCTTCTC AAGGCAAATAAAATAGTGGCTTCCTGACCTTCTATGCTATCAAACACTAG ATTAGCTTCTCTCATTGTTGGTATCTATTGAAATCTTAAATTCATGAATA TAATGACTGCTCTAGATTAATCTTTGTTTTCCACAGAGGTGGTGACTGGA AGAGTGGAGGGAGTTGCCACCTGGAAACGCTTCCAGATGTGACACCTTTA AAATCACTGGAGGAATGGGCAGACCAGCTTCAACCTGTGCAAAATGTTCT TGGGAGCAGCATCAGACCCAAGTTGCCTGGGTTAGCAATACTGAATGTGA CACAGATGACAGCGCAGCGAAAAGACGGTCACCTCTCGATATACATAAGC CCTTCAGGACCTGTCCCTCTCCACAAACAGGATTGCAGCCATTGGTGCTT GCCTGGAGTCCCTGATACTTGGAACGAGCTTCTCTACGCTGTCTTCATGA AAAGGCAAATGATGATGGACCAAAACGTTTCCCTTGCTGGCTCAAGAACA CTGAACACTGGCTGACTAAATAGATGAAGTAGGCTACATGATGCTTGCCC GGTGAAGCTTGGAGTCTATGTCCTGCAGGTAGGTCATCATGAAAAAGCAA GATTCGTGATTCTCCCGCAGGACGACTCTGTCAATCTGCTTCCCAGTCAG GTAGCCCAATGGAAAAAAAACATTTTTGTAAGGTAGGAGATGTGGCTTGC AGGAAGCTGCACCACTCTGCTATGTTGTGTGCTGAAAGGTTAGTGAGTAT AAGAGCAAAATTTAAGGAATGCATATAGCTTACTGTGATTTGTATGTTTC ACAGAGGCGGCAAAAGTGTCAGCCGATGTGATCATATATCTTAGGGGCTG CAGTCAGTGATGTAAGTAAGTAGACTGGGTGCATTGATATTGGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.