Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA043937

[Submit comment/correction]

Sequence	AA043937
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA043937
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGGGAAAAGCGATGCTGGAGCTTCGTGTTAAACCATATGACGATGCAG AACAAAATATTATACAAGATCATTACAAAACTAGTATCATTAAGTTAATT ACAAACATATGATACGCAAGGACATGAAATAGAATCCATGCAACAACAAA AAAAAGGATATATGAAGGAGAAATGAACAAGACGACTACATATCAGTTCG ATCCTTGGTGCGCGTCGAGAGGGATCTTGAGGAATTCGAGATGATAGGAC CCGTCGTCTTCCTGCAGGCGGCCTTTCCCCACCAGGCTACCGTCTTTTCT GTTCTTGACATAGCAACGCCCACCGCCAAACAAAACGAGGTACCCACAAC CGGCGAGCTGCTGCACCGAGACCAGGGTATGTCCGGGTGCGAGCTCTTTG ACGTAATGTACATTGGGGATAGAGAAACCATGGCAGGCCAAGCTGCCGAC TCCTTCAGTTCGCAGGTGCCTGCGGTTGGAGGCGTCTACGGCGGGGGTAG CAGCAGCGGAGGTGCCTTTGAAGTCTTGAAGCAGTTCATGTATGGCCGTC CTGTGGACGCTGGCTCCTGAATCAAGGATGAAGCGCCTTTCTGCATGGGC GCCGGTAACCATTTTTGCGACGAGCATTACCGGACCAAACAGATAATCCC AAATCCGACAGAGGGGCTGATTTCCGCCCTTGGGGTCGGCTCCCTCATCC GGTGGTGGCTTGGGTATTCCCAAAAACTCTCCCTCCTGCTTCTCATATCT AGCACAAATCAAGTCCTGAATTTACTGCCGATCTAAGAAATTCCTCGCCT AGAGGTTGACATATACGAATTAATCTGATACAATCTAGCAGAGGAGGAGC AGGTTGCCGGATCGATATCATACCTGTTGCATGGCCTGGAGTCCGTCTTG GATGCGTCGATGCCCGGTGATGGGGAAGAAGAAGGCAGCGGCAACGCCAT CAGGCAAAGATAGGAAAAAATAAAAAGAAGTGTGAGTGCCGGTGAGGAAC TTGGCTACGCTAGATGGAGGAAAGTCCTTGGCCGACCTTATCTTTCCATT AGCCGCCCTTACCTGCTCCATTCGTTTATGTGTGGTGACGAAAAACCAAT GTAGACTATGATGTTGATACACTGTTCCACCACCACCAACCACCGGTGAC CAAGCAAAGCAACAGCACGCGTAGAGAGACCCCAGTTCTAGACCTGCGAC GAAGCAAAGCCGCGTGCGCCGTCGAAATCGAAGCCAACGAGAAAGCAGGC TATGCAGCAGCCACCGCCGACCTAGCACAGAAACTCTCCACTCTGTCCGC TGCCATGGTACGTCCCAGGCGAGAACGGAAGGACCCGTTAGACACGCTTG GGGACTGGGACTACTCGTTCCGTCCCATGCGAGAACAACGGAAGGAGCCG TTAGACACGCTGGGCGACTGGGACTACTCGTTCCGTCTGCGAATGAGCAC CACCTTCATGTTCCGGATGATCCGTGTGCAGGTGTTTTTCGCGAATGTTA TTGAGGCCAGGTAAAAATCTTGCTCCAATGAATCCCCACTTTTTTGGGAA ACCGATCATCCTTTTCATGCCATAAATTTGCTGATCTATTCATCTTGCAG CCTAAATCTAGCCCTGGTGTGCTATCACTTTGCCCGAAGGTAGGATCTCT CTGTCGCAAGCAACTGTTCTTCAAGCTCGCTTTTTCCATAGCTAGTCAAC TCAAAGTTAACAAATCATTCGCTGTTAAGTGCGGGGCGCTGGAACTGGAA ATAATCCTAATTTTAAGTTTGATTTACATGTATTTTATGAGTTATCGTTA TTTCGAATTGTGTTAGCAGTCAATTAAAGAATCCTGGACCGGACGGACGC TAGTTGTCTTTACGTTCTAGTTTAAGATAGCATGGGATGTACAGAGTACG GTTTGTATTCGTGTGTCCTAGGTGGGGCCTTAGCGCTGTATCCACATTTC GACAAAGAGCGCATTTTTTTATGTTTGTTGACTCTTATGTCGAGGTTAGA ATCCTGCTATGGATCCTTATACTTTCCAGAGATCATTGTTTTCTAGAATA CCTCCACAGATCATTGTGTTCAGCCTAAAACTTCTCTATTCTGTTCTTCT TGCAGATTAATCCGAGAACCACACAAAAGCCCATCGGACATCTTCTTGGG TTGCTTTGAAGATGTCATGTACGATCTTGTTATAACCTATTCATAATTTA TTTACCTGTACGAATTAAAATGCTTTCCACAACAAGGAAAATAAGATTTT ATAACCATTCTATATTAAGGCCAGTATGCAACAATGATTCCCTGTTTCAC ACCCTTTTATGTTTAATTGCGAGGGCATCATTGTATTGTGTTGAAAGTGT TTCTGGAATAATTTGCAAGTTTATGGTTATTCCCATTTTTTTGTCATGAA ATTACACGTTGTATTGTCACCATGAACATAAAGCTAAATATACTATTTCA TCTACCGTAAATATATTTAATCATCTTTAAATTGGCACTGAATCATGAAT TTTGCATTCCCAAAATACCACATCATAGTTATTTTGATTGCAATGGTGTT GTTTAAGTACAGAGTCTTCAGTTCAGGATGAAAACCCTAGTTCTGACCTT CATTGTTGTTCTGGGGCATGCTTTATTAATAGTTTTAACATCTGATGAGG CAATAAAATTACCAGTGTCCATTCCTTAAAATGGTGATGTGGTAGTACAT TACATATAAATCGTTGTATCCACTTAATAGTTATTTTGGACCATAAGCTT GCAAAGTTCACGAAGAATTTTTAAACATTTGAGGTGATTAACAATTAGTT GCTAGTGTTGTTTTGTTAAAGGGGTGCAGTAAGGGAGGATCCTACAATGC TTTATTAAAGAGAATTAGAAATCAAATAGCATATATGAGGACTTAAACCT GGTTGGTATATCCACTCTCTTAATTAAGTGACCTTGGCTTACTTTTTTTT GCTTGGCTTACTTCTTTGCTATTTTTAAATTCATCACACGAAAGTTTAGA TATTATTTCCATATCTTGAATCGTATAGAAATGGCAAAACGATCAGAGTT AACCTTTACACTTAACCCAACCAATTGTTTTTTTTTGTAGTTGCTAGGTG TCAAATTGCTCTATATGTACATAAAAATTAGATCTATATAAACTACTTTA AAATATATTTTTCTCATCCTCGTGGCCTTTCCATCCTTCTGATTGGATTT CAAATTAGATTCTAAAGAAATTGCATGGTTGTAGCTTCCATATGTCAGCA CTCATTCATGAGTGTGTATGCCTCCATAAAAAATAGGTGTTATGGCACGG CATGAATCTTCAAGAAAATTTCCATGTGAATATCCATTTTTTCCTTCATC CATTACTGAAATCTCAACTATTATTTTTTACCTATGAATCTCAACAATTT CTTGTGCATTCTTAAAATCATTATTATCAATGTCAAGCCACGTGTTAGAC ATATTATATTCGATAGAGTGAAATATTTTTGAAAAACACATTTCATAAAA TCTTTCAAAATGATTAGACAATACTTTATTGCGTATTTTTTGATTTATAT CTCACCACCATGTTTGGATAAATTTTTGTTTTACAAAAAAAATCATATGG TAATTTGAAGATGAACATGTCCCACTTATAGAGCCTAAAATCATGTCTTA GACTTGTACAATTTGTGATGCCACCCCATAAGTATACATGTTAGTACAAT ATTAAACATGCAGTTAATAGCAATAGGTCCTAGTAGAGTTTTATTAAAGG GACACAGTGATGTAGGATCCTACAGTTTATTCTTTTTGTTTTTAAAGATA ATTAGAAATCAAATCATATCCGAGAGGAGTTAAACCAGGTTGGTACCTCA ACATTCTTAATCAAGTGAACTTGGCTTAATTTTTTGCTAGTGATAGTAAT TAACCTATAAACTTAACCTGAACAATGGATTTTTTTATAATTGCGAGATG GCAAATTATTTTATTTGTATATAAAACTTAGATCTCTATAAACTACTTAA AAGTGTTTTTCTTTTCATTTCACATCCTCGTGGCTATTCTATCCTTCTAA CTCGAATTCAAATTGAATTCAAAAGAATTTGCATGGTTGCAGCTTCCATG TGTTACGTCTTATAAAAAGTAACGGGTACGCCATGAAGATTTTTAAAGTA ACGGGTACGATGTGAAGATTTTAAAAATCATGAGCTATCTTTCTATGCGA CTATCCGTATTTTATTCATTCATCCATGACTAAAATCTCAGCCATTGTTT TTTATCTCTAGATCTCAACCATTTCTTTTGGCTTGTCTCAAAATCATCAT TTGTCAACGTCGAACCCCATGTTAGACATATTATATTCGGTAGATTGTAA TTTTATGAAGAAACACGTTAGGAAAAGGCTCTTAAAATGATTAGAAGTCC TAGTAGAATACTTTATATACACATGATTTTTTAATACAAGAATAATTTTA AAAGTCACCGATAGGAAACAATTTAACCGAAAACCATTGCATTGATCTGC TGATGTCATTGATGATGTCAGCGCATGTATGTCAAGCCCGCCCGTTTCGT GTTGCACCTGGTCTTCTTTTAGGAAAGGCTGCAACACGTTGTTACCGTGC ATTGTAGGGTGTATGACATGAACTGGACTATATATTTGTATGTACGTAAC TTTTAGCTAATTATAGATCTAACAGTTTAAATACTTTAGAAGATATGGAT CAACCTAGTGTCTCAAAAAATACTCTTATATTGCTTATAGTATATAGTAC AACATATACGAAGAAACACGTAGCAAAAGGCTCTTAAAATGATTAGAATT CCTAGTAGAATACTTTATATGCACATGAATTTTTTAATACAAGAATAATT TTGAAAGTCATCGATAACAAATTCGCAAAAAAAAAGTCATCGATAAGAAA CAATTTAACCGAAAACCATTGCATTGATCTGCTGAAGTCATTGATGATGT CAGCGCATGCATGTCAAGCCCACCCGTTTCGTGTTGCACCTGGTCTTCTT TTAGAGGAAAGGCTGCAACACGTTGTTACCGTGCATTGTAGGTGCATGAC AAAAACCGGACTATGTATTTGTATGTATGTAACTTTTAGGTCTTTTAATC TCGTCTGCTAATTATAGATCTAACAGATTAAATAATTTAGAAGATGTGGA TCAACCTGGTGTCTCGAAAAACACCTTTATATTGCTTTTAGTATATAACA GTTTAAATAATTTAGAAGATGTGAATCAACCTGGTGTCTCGAAAAACATC TTTATATTTCTTTTAGTATATAATAGATAAAAAGAAACATTTGTAGAAGT AAATACTAAGCGCATCTCTAACCGATCCCCTAATAACGGTTAGAGTAGTA AAAGATGCCATTTTACTCCTATAAGTGTACCTAACCAAAGCCCAATCGGT GTTAACGGAGTAAATTTTTTAGGAGTTGGGTCGGCCGACTCCTATTTTCA CTCCTCCACCCCTCGGAGGAGTAAAACATTCCTCTCCTCCCACGCGTTCA CGCTCGCCTCTCCTTGGCTTCTCCTCCACCTCCGGCGAGCCTCGTCTCTG ATTGCCGCCACTCAAGCCACCACCAAAGACCGAGATGGCTCGATCTTCTC GCCGGCCATCCCTGCCGCCCATTCCCAGCGCTCGCCGCCATCGCAGCCCC CCGGCACTCCCGCTTCCTGCCACCATTCCCCTCATCGATTGGCATCACCC AAGCGCCAGGGGCAGCCCGGCGGTCCACCGGCATCCTTGACCTACCGGTG CCATCAACGCTGGTCTACCGCGGCATGCGGCAATGGTCGTGGGGGCGTCG GTCGCCGAAATCACCGACCACAACACCCACCGGAAGGTCTGGATCGATAC CTTCCAGTCGCCGGAGTAGGCGGCGCTGGCATACGACATGAAGAATGTCA AGCTCCACGCCTCCGACTGCGGCGATATCAACTTCCTGCTAGGGTGCTGC ATGGTGCCGGACTTGGAACTGGTCGGCTTTCGACTCATCTCCGACCGCGA GCTTCGGGAGGACAGGGAGGCCCATGAGCGCCTCGACGCGGAGCGCCTCG ATGTGGCAATGGCGACAACGCTCATCAGGCTCAACCCAGAGCTCGTCGAG GAGGAGTGGCAGGGCTCGAGGAATTCTCCCAGTCTAAGCGGAAGGTGGAT GCGGTGAAGAAGAAGGGGTTGCCTATGCTGCGGGGTCGTCGGCAGCTCCG GCGCTGGCCAGGGTGAGGAAGGAGGACATCGGCAGCTTCACGGGCCCGTC GACGGCGACAACGGTCATCGAGCTCGATAGTGACTCCTCCTTCGAGTGAG ACGAGGATTAGGTTAGGTTTAGTTGAAATCCGATCGGATTTAGTGAAATT CTGCCGACTTTTGGGTGTAATATGTATAAATTAAAGTAAATAAAAAAGTA GGTTTCAAATTCGGTTTGAATCGGTCAAATTTGATCAAATTTTGTGGTGA TCAACTGATTTCCTCCTCTAAGTTTTGTACTTCGGTTAGAAATAGCTATC GGTTAGAGAAGTACTTTTACTCTTCTCCGGAGGTTTACACCTCTAAACTT TAGGGGATCGGATAGAGATGCCCTAATCAAGTTGTAATGTTTTAACGCTA CATACCAGCCTGGAGTTTATGAAAGTACAAGATTCACACTGCTCTTCAAA ATGTGAACCGGTGATTTATCACCCTTTGATGGCAAAATCTTTGGTTTCCC TCTTTAAATTCCATTTAAAGGAATGAGAGGGTCTTCAAACACAAATTTTC TTTGCCATCGGAACTCTTCAGCAAAATCAGAATGGAAGGAAAGGAATGGA TCTTAGCCGGGCAAGAAACCTTGCGGCGCTTGTCGGCTGAACTTTGTTTT CAGGGTTGTGTTTTTTTATTTTTTTATGTCTTAGGCTCCCCATGTTTGCT CCTCCTATATCAATATAAAGGCAAAGCTTTTGCCTCATTTCAAGAAAAAA AATGTAAAAATAAATAGCAATCTAGTTATAATGTTTTAACGCTACTTACC AGTTTGGTGTTTCTGAAAGTACAAGCTACAACTTGCAATGGCATTATGTC ACACCATTTTTTCTTTCATTTCTATAGCTCCCCATAACACACTCCCACAT TGTTCTATTTTAGAGATAACAGTTACTGTGTTCTGTCCTGTTTAAGCATT TCCAGGTTTTCTTTTACCTGTTTATAATAAGTTCAGTAGAAAAAAAGCAT TTAATTTTTTAACTCAAGGGGCAATCCAATTATCGGTTCAGTTGGAAAAA CATTATGACTTAACATATAGCTAGACAGTTATTATTTATTTTACAAGAGG AAATATGATTTTTTAGGTGTGCCTTCCACAAAAAAAGGTGGACATTTGTT AAATTTTGCTGGCATCCATCCCTGTTGTATAACCACTATTATGGCTATGA CACAAGTCAGTGTATAAACTAATGTTTGTTTGAACATAACAGGATGGGTT GCCATGTTTCGAGGCAGAAGACTTCTTTTGAAAAGAAAAGGAGGACTACC TGGATCATGGATGTCTGGTCAACTGCTATTATGTTTTGTCCTTATATTAT TCAGGTATTACATTATTTTAGGACATATTCGTCTAGAAAGAGGCATTCCA TTATTTTGAAGGGATGTCTATATATATGAACTTGTTTCTAACTCTATAAT ACCACTCAAAAACAAACACAATTGATTTTATTATACATACTCTCTCCATT CTATATTAAGTGTCATTGGTTTCGTACAATGGAGAGAGTATTATTCTTTT GTGAAGTTTGATTTGTATTAGAATTTCTGCGAGTCATATGTCCAATTGGT TTAAATAGTACTGTGTGTCATTTAAATATGTTCTCATGATATGGCCCTTG TATTACGAATAAAACATGCAGCCATAAGTCCAAACTGAGTAGTACTTGTT TCTCCGTGAAGCAACACTAGATTGCTGATTATTTTATCTTTTGCCTCTTT GACAGCGGCTCCTGAAGCGCATCGAAAGCCAGAATTTCCCAAAACCAAGG TGCAGTATTTAACCACCAACTAGAGTTTCTGATACCAAAGCACATTCATC TTTTCTAATATCCTACCCGTAAGCTGTCACGTTTTCAAGAATCACGTGCA TATATCACTAGCGCTGAATTCGTTACGCCTTAATATTAGATGAGATTCTG ATGATGCTAGCCTGATCTATCATTCAGGATGAATCCTTCTGAAAAAATTG CGGCATTTGGTTCTTCTTCACCTGGTCGTGCTCACTTGATAATGGACTCT GGCGCCAGTTCACATTTTGTTGGTGACGCCAGTATGCTACAGGACATTAT ATATTTTCCTCATGACCAGCGTCAGAGTGTTTCCTTGGCAGATGGTTTCT GCCTTCCCATTGTTGGCATTGGGACTCTATTGTTCAATGGTCTGAGCGAG TGTGGGACCTATACTCGGTCCTACGGAGTCCCCAATGTCCGCTACGTGTC GGGCCTTGCGATGAACGTAATATCTGTCAGCCAGCTCGACAAAGAGCATG GCTTGTGCAGCGCCTTCCACAGCGGGAAATGCGAGATTGTGAAGGCCGGC GGAATCGTCATTGGGGAAGCTGCTCTTGTGGACCGCTTGTATGAGGTGGT CTACCTCCATGTCCCACGAGGACTGGAATTATAGAGGCATGTCATGTCGT TTGCACAATGCAAGTGTCAGATGATAGATCTCCGACCAATCGCTTTTCAC TGAGATAGATTTTTGTGTTAATATTGGTAGAGTTTGAACTATTTTCATTT TGCAAAACATTCCCTCTGTTAATACCATTGTTGACCAGCCTAGCTGCGCC GTGCTTCCTAGCTAGCTTACTGTTCCGCTAACTGATCTGACTATCAACTT TGTGGACATTCTTTTATTTGTATACGACACTGGCTATTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.