Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA043265

[Submit comment/correction]

Sequence	AA043265
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA043265
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAGCATGGCGGCTCCCTCTGTCCCCACTTTGAGGGTGGCGTGCTGCGC GCTCGGCCGCCTGGAAATAGGGCGAGCATCATCGTCTCCTCCATCTGGTC TGCAGGTACATGTGCTGCCTCATTCCCTATCTCTCTGCTCTCTCTCTCTT TCCCGACCCACTTTCTCTTCCTCCCCGAGCGTGGCGGCGGTGCTGGCGGC GTGGTGCAGCTGCCCTGAGCGCGGAAATCGACCTCCGCCGCGCGTCCCAA GCACACACGCTGCAATGGCAATGGATACGGAGGTTACCACCCTTTGACGA CAATGGACCAGGAGAAGGAGCTTACCTGAGCGGCCACCAACCCCCTCTCG TCTCCACCTACGTGCAAGAGCAGCTACAAAAACAGCCCGGGCCACCGCTG CAGCTGAGCTCACGTGAAAGGCAGGTAGCCAAAATCCCCTCTTCCTCTCT CCCTGTAATAATCTTGAGTATTATTTGTTTCTGCAGATTCAATGTTATGC CTAGAAGGTGCTCGACAAAATTCACAGCAGCTTGAAGTGGTCCAGGGCCT GGTAGTTGGTGGTGGATGTGTGTGAGAAAGCTTGCATATGATTTCAATGG AATGGGCAGCCTTTGCATGCCAGCCACTATGTGCTAAAAGTTAGGCTTCG AGGTAGTAGAATATGATGTCCGATTGTTAGTCTAATCGTCGCTACTACAT TTGTCAATCAGTTAATGCTTGAAAGAATATGGTTGATTTGTTAAGCTTTC GTATAAAATATATTCTCGAGCAACCAATTCTTTTGCATTTGCTGAGCAAT CTACGGATTCTGATACCTCACAGATTGAAGATCTTGGGTTCTTGGTGGAG ACAAGGGAGATAACAGTATCACGGACTAATGATGCTGTTCAACATATTCT AACGGTTAATTTCATAGCTGGAGTGTTTGATTATCCATTCTCAGACCCGT GTCTGCTCAATTTAATTCACTAAAAGGTAGAATGCATGTACACATATCTA TGATTATGTTGTTGTTGTTAATTCTTCTCCTTTTTCTGTTGGATTTATGT CACATTGGATATCACTCACCATTTATCATATGTTAAATTCTTAACCTTTC AGGAGCATCGGCTATTGGCAGTTGAGGTTGTACGGAACTCTTTGGTACTT CTGAAATGACAAGAATCAGAAGGAACCATTCCTTCCATTGGCAAGAAATG CAAAAGGAATACTCATTGCAGGGACAGGCTGAATAATGAATATTGGTGTG GTTGGTGGACAATAGCTTGGCAGGAGAGAGAATGGAAGGATAGCTCTTGG TAAGCAAAACACTCAACTCTGTGAGAATATATCGGGAATGGCATTTTCTA TTTGAGGGAACACTTATCATAACCTTTTTGCTAAGCACTGTTTGTCATCG GAAATACTATCCTTCTAGCTGATAAGTAGACGTGGATAATTTATGCCATG TTTTCAGGTGCCATGATTCATATAGAATTGAAATTGTTGCTTCAAAATTG ATGTTCAGGATTTTACAGGGAAATCGATGCATACAAAATTGAATTTTTTC ATTTTAGGATAAAGATTACCCTTCTTTTAGTTCATGATAGGCTTTATCGA GCCAGAGCATGTTAGAACAATTTTTTCTTATATTTACTTTAGCCGCACGC TAATATCTAAATAAACATTATCAGAATCTTTGGGCGACATTTCCAGCCTA TATGATTACTTGAAACAGAAAATCCCGGCATTTGCAACTTGCAACCATTT CCAAAATATACTCTTGTGCAATTATTATTTTTAGAACAATACAAAGATTT GGTTCTTGCTTCCACAGCAAATGAAAATGAACCTTGGCCGTGTCCATGTG TTATTTAGAGGAGAACTGGGAAGGGAACTAGAAGGATAAAAAGTACCCAC GGAGATGGAAGCTTTCTTATATATATATATATATGGAACATTGCCAGGTA TATCAACACTCCAAGTGGTTTTATTTTGAGTTGTTAGAAAATATGGTTAG GTATTATATTAAACTGTAGAATCTCATAGAAGTACTTGTGAGCTTAAATG TCATTAAACTTATGGACTACTTTTTTGTTTACATGTTTAGCTGAGAGAAC ATAGAGTCCCAACGGGGATATACTAATAGCCTGAGTTATTTATACTCAAT CTAACCGTCACATCTCTTGCCAGATTATGGCCATGCCACACCTTCAGTAG CCATCCTTTTAATACTGATTTGACTTATAATCCTTTTAAGATCAAGGTAT GGAAGCCTCCTCTTGCTTCTTCCTTTCTCGCTTGTTTTTGATCTTTTGCC CGAGGCTCTGGATGCCGGTCTTATGTCTAGCTTTTTTGCCATATGAAATT GTGGTATTTTACTTGTTACGAATAGTATGTATGATCTACTGTATTATTTG TGTTGGGTGTTCTCTTCCTGATTATATTCTAAGAAGATGAAATTGCTCAT AATCCATATGTTATACTCCCTGCGTCCCAAAATATAAGGCGCCTAATGAC GTTGAGTTTTGACTAAACCTTAGGCGCCTTATATTTTGGGACGGAGGGAG TACGTGTTACAGGTGTGGACTTCATTGGTTCTGAGAATTTTTATTTTGGC TCTACAGGATTCTGGTTCGTTTCTATCACGTATAACTCATTCTCCCTCAT GTCGTGCTCCCAAGATGATTATTTTGCTAATATTGAGTTGTCTGATGTTT CCGTGTTGGGTGGGCTGCTATTTTCCCTTTATGAGCATATGGTCAATACT CGACTCGGTTGCACCAATATATTAGAACTAGGATACTTGCCAAAGCTATC TAATTTGTCTTGGCTAGACCCTCGGTATAGTTAGTTAGATGTAAAATGGC TCAGAGATATACAGGTCCAGCTAGAAGTTCATCTTCCAATTGTACAAAGA TACATAGTCTCTCTTTGGCAAATGGCTCAGTACAACTAAAGCTGTACAAA GGTGCCGCTAGAACAGAGGTCGGGAATTAAAATCAAGTGAAGTGTACTGG GCTAGCTCAAATTGGTTGCTGAATGAGCTTGCAATGAATTAAAATATGGC CAATAACTTGCATGCTCCCATAATTTCATCGCCCTAGCATGACATCTCAA TGCACTGGATCAATACGGTTATTGGTGATTTTGTCCCAGTTTCAAAGACC ACTCATCTCTTGGTATTCAACTTAGCCAGGAAATGGTTCTAGAGACCATA TTGCCTTATTTTCACTGTTGTGCTATCAAAATTTATATTCTACCTATGTA CTCGAGCATAATAAGTTGTATTATATCTATCTTAAGTTGTATTATATCCA TCATCAGACTACAACTCTGTTTTTGTGATATTTTGGTTCATTCGCTGTTG TACAAAAAATGGGCGTCAAGCTGTGGATGTGGCATTTGCATATTCTCACA GGAGTCATGGACACCAATCTTGCCAAGTATTGTTCGATAAATCACATTGG TGGTGTATCTTCGCTGGACTATTAATCGTTTTAAGCTTACTTGTGCTTGC TCATACATGAGCAGCGCTTCTCTTGGTATATTGTTTTTAAAGATCATTCA TATAAGCGCATGTATTTAATCTTTATCCTATAATGTTATACTTATTTTAT CATTGAAACCATACCTTTTAGATTATTCTAGATGTCATCTCCAGTTGGCA TAAACTATTATAGAGTGTTCAAACTAAGCTGAAATGATTCCCAAATTTTG TTCAGGACAGATCAATTGACTTTGACGGTGCGGTGTAAAGGCGAGCGGAA CACGCAGTAGAGCAGGCATGTGCCACCTAAGATCTACGCATGAGATCGAG ACCAACTAGCAATGCGGTGGCCTCCTCAAGAAAGCGTGTGAGATCTCAGT TAGTACTCCATCTTTCACGGCCGCGATGGTATGAAAGTGCAGGTACATTT AACATATATGAGAACCAGCACTTTTCCTGCAAATGGATAAAGTATCCTGG CATTTATGCATCAAATGAATGTGTTAACAAGCCGATATTACATGAGATTA GTCTTTCATGGTCCTGTCATTTTGCTAATGTTACATACATGGGTGCTTAG TCATGGTTTTTTTTGCAGTGAAGGTTGTCTGCTAGGATTCCAAAGAAGAT GTACTCCTATATTTTATCGAAGATGCACTATGTAAGTGCAGAATGGAGGT GCTAACAAATCGGTAACTTTTGGTGGTGAATATAAATAGACTGGCATTTA GAATGAATTGAGAACCTCGGTCTATTATGTGCCAAAAACTTATTATAAAG CATGATAATTTGAGGAAGCTCAGTCTATTGGGCTGTTCAGCAATAGATGT TAGACTCGAATTTTACCAGCAGCAATTCATTCAAATCATTGATGAATATG GTGTCATTACTAATTTTACATATGCATGCTTTGTATGTGAAATGTCCCGA GTTGATTGATCTGAACCTCAACTCTTGTACGAATCTGCACCCAGGCATTA TGTCCTTTCCTGTTTCATCAGGTTGTCAAGTCAGTAACTGTTATTATCAT TGTCAAGAATGTGCATGCATTTGGGTGTCAAGATATGTTGATTGGTGCGG TTAGAAACCAGGTATTACATTGGTAACCCATTTCTCACTCCCAAGTAAAT TTCGTTTGAGCTTGAGATTCTTACCATAACTCAGCCAGTAATTTCAAGGT TATTAGATGGTCGATGTTTAAAGTGCTAAGCAGCAAACCATTTGCTATCA GCAATCAGAAATTGGAAGATACATTATCGCAGAATTACTTGCATACTATT TAGGAATGTTGCTCACCTGATGGATGTAAGCTTGGACATAATTAGACTGA ACCAAACAAACCCAAACTGAACTAAAAACTTCTTGCTCCTGTTTGAACTG CAACTCAGTAAGAAAAAATAGTGCTGTGTTTCCATTTTGGTCGGATATTT TTAATTTGGCTTTTGATTTTTGGCTTGGTTTTTTTCTTCAAAAACTGATA AACAGAAAGAATCTAATGCCGCAATGTGTATCAACTGGAGTCTAGCAAGG AGTAGGCAGTGAGGTTGAAGTTGTATCGGCTTGTAAGCTTATTTAGCTTA CTAATCATATTATCGGGCATGGTGCATATACATTATAATAGTCTGCCCTA TGTTGCATGTAACTATGTTGTAACCTAAGGGTTTGAAATTTTTGCTGACT TGCTGTACCTAAAAAAGGTATATAGTAGCATACATCTGAAGTGTGGATTA TCTGATGTTGTTGTGTTTTAAATTTCAGTAGCATACATCTGAAGAGTCTG GCCATGGGCTGTTATAAATTTCAGTAGCTAAGAACTTGACGTCGCCCTTT TCTTGGCCCAGTTTATTGAATTATTACCAGGCCTTTTACTCGTGCTTACA GCCCATTGTGATGTTCCAGGGTCATAATATATTATACCAAAGATCTGGGT CGTTTTCACTTGCCATTCTTCTCTCTGGTCGATGGCGATTCGACACATCC AATCAACCTAGATCCATCTACGGCCTACCCCTCGGCAAGGAGCTGATCCT CCTTCGTTCTGAATGCTACCGAGATCCATCAACTTCAGTTGGGTTTAGAT TGGAACTCCTATTCAACTTGACCTTTCGTCAGGATCCTTTTGGTGCTGTT ACATGGAGATTCTCTAAACAATGCCATGTGCAAATCACGTTAAAATTGTT AGTCAGCTGGCTGTTCTTATGCAACATGTAATCTGCGTTTTCAGATGTGC TGCTCTCTCATACTATCTTCTACTAACGTATTATAAAGTATTAAAGTACG ATTAGATTGAACGCTTCTTTATCTGAAATCTACTTGAATGTCTTCATCGA TTTTTCATATCGGCTTACATCTTATATTTTTTCTTATATGTTGGACGCTC GAGAGTCGAGGCGCCATTGCTGAAAGGCGGCGCCACCTCCTTCCTGTGGT GGAGCAAGCCACCGATGTCGGTGATGTGCTACATACCGTCACTGCACTGC TACAAGAGAACAATTTTTTCAACATTGCTGCAAGCGGCACTACCTCGATC TTCACCTGCCATAGCACTAGCCACACTAACATGGCAGTGACACTGGCGGA ATCGAGCCTAGGCAGGCTTAGGGCCTAACACAGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.