Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA031908

[Submit comment/correction]

Sequence
AA031908
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA031908
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCCAGTGCCGAGCCCAGTCCAGCACGCTCCAGCCCACGGTGCACCAGA
ATCCCCAAACCCACCTTGCTCTTCTTTCCGTTCTTCTATCGCTTTCCCGT
GAATGGAAGCTGCGCCACGCCCGCGGCATCAGCAACAGCACCACCGGCGG
GGCCGGCATCCCTAAATGCGCCGCCCTCTCGCCGGCGCCGCCGCCATCCT
CCGCCTCCGCATCCTCTCATCCTCCTCCTCCCGTCCCCTCGTTCCCTCGC
CCTCCCCGCTACACCTTCTCTGCCGCGACGACGACCGCGAGGACCGACAC
CCTACGCCTCCGTCTCCCCCATTCTCGCCTCGCCCGCTCCTCAGCTCCGC
CTTCGGTGCCCACGGCCTCCTCGGACTACGCGGGTGGAGGACGCTACCTC
CGGCAGCTTCCCCGCCCCGGGGAGGCGTCGCGGACGCGCCTCCTGTCCTG
CTCACAATATCCCGCAGTAAGAGGAGTGCCCCTTGCGCGCATCCTGCCCG
TGTCCTCGTTCCAGGGTTTGTTAGTCATCTTACGTTTTGTGTTGTTGCTG
TTTGAACGCAGGTTATTCTCTGCGCGTTGCCAAGAGCAAGAAGCAGACAC
ACTTCGACGATGAGCACAGGTGATTCGGATGCCCCCTTTTTTGTTCTGAA
AATAAGCTGCATAATTCGCACAATGATACCAATCAATTGATGTATTTTCT
TGTTTTGGTCACACTTTCCTTAAGTTAAGGAATGATTTTTAATGCTCTTC
AACTGTATGCTTATTTGTCTGCTGATGGGACAGAAATGCTATTGCCTCTA
TTATGTGATAGGCCATAATGTTATTCCATTTACAAAATTGGGAGAGTAAC
GGATGTGATGAGGTTATCTAAGATTGAAAGGAAAAGATTGTAGAATATGT
ACCTTATCTTGTTTGGAGGACTGATGAATGCTGTTCCTCCAACTAAATGA
GTAAGAAGGTCTACTCGGTAGTTTTTTTCATTTCTGGCAAAGTATGAATT
GTGATGGTCTCTCTCTTTGAAACACTCATGCCATAGTTACTAAGGGTATT
GGGTATTATTATATTTGTTATTTAAAATTTACATTGGCAATTTTGTTGAG
AAATAGTGAAAATTATTTGGCAATTTTGTTGAGAAATAGTGACAATTATT
TTATCATTGCATTCTTGAATTATTTCACAAGTTTATATTGATATACATTT
CGTTTCATGCAACTGCTATTTGTTTGATTTCAGCCATCGAGCAGTTAACA
CAGCACTTTTGTGCAATTTCCTCGTCTTCACGCTAAAGTTTGGTGTGTGG
TTTTCAACATCTAGTCATGTTATGCTTGCTGAGCTAGTGCATTCAGTTGC
AGACTTCGCTAACCAGGTAACTTTACCCTTTTTGGTGCTTATTTTTCTTT
CTTGTCTATTTCTTTCCTTGAAGTGAGATATCAGACCCAGGGACTAACTG
CCTATCAAACTTCAGGCTCTTCTTGCATATGGTTTGAGAAGTTCAAGACG
TGCTCCAGATGCTCTACACCCGTATGTATAACTTGTCAAATTGCAGTGCA
TGCTTTGTTAACAAATACCTGCCTTTCTTACTGCATTTTCCTCAGTTTGA
TAAACCAATCCCTTTTACCAAAAAGTCCAGTCATTTTCTTGGAAGTAAAA
TTTCATTGAACTGAACTATTAGTGGTAAGGGAGAATCCTGTTTTTAATCA
TTATATCATAAATAGTAGTCACTAGAGATCTAGTAACAATGCTTCCGATA
TATGCCATAAATAGAAGCGATGCCCTATGTCTTGACTCAATGATTACTTA
CCGTAGGCTAATCTCTTTTGCAGCTATGGTTATTCAAAAGAAAGATTTGT
GTGGTCCTTGATATCTGCGGTTGGAATATTTTGCTTGGGTTCAGGTGCTA
CTATTGTGCATGGAGTTCAGAACTTATGGAGTACTCAAGTATGATGCCAA
CGTATCCTTTAGTTCATTAAAAGATTTTGCATATGCATTCCATTTTGTTA
TCAAATGTTTTCCCTAAGTACATTTTTCATATCTTAATACTATTATTTCA
GACCCCCGAAAACATTCACTACGCCGCATTGGTGATTGGCGGGTCGATCC
TAATTGAAGGTGTTTTACACGAACACTTCTCTTTATTTATTTTAGTACTA
ATATTTTACTATGGTTGTAGTTGAGTAATGATGTTGTCTATTCAGGTGCT
TCACTTCTTGTTGCTATAAAGGCTGTTAAGAAAGGCGCAGCAGCAGAAGG
AATGAGTATCAGAGACTACATCTGGCGTGGTCATGATCCAACTTCAGTTG
CTGTTATGACTGAAGTGAGTAATGTGTTCTTAACTATCTAAACACCTTTT
TTCTTGTAGTCCAACCACTTCCTGCAACTAAGTACGAACTTGTATCTATG
TCATTTTTAATGTTTACTTTAGTTGCTCGTAATTGCCATCTTAATCGTTC
ATTTACCACTTATTACTTATCTTAACTTCCTTGATTTCCTTCTCATATTC
CATTATTGTCCGATAGGATGGTGCTGCTGTTACAGGTCTTGCTATTGCAG
GAGCATCTTTGGTGGCTGTTCAAATGACTGGAAACCCTATCTATGATCCA
ATTGGTTCCATCATTGTTGGTAACTTACTTGGAATGGTATGCAAGTTTTT
GTTGGTTCATATTTCTTTTGCTTCTGTTGGCTTATGTTTGTTCTTTTCCT
ACAAGTGAACTAGTCGTTACAAATGGATTTTTGTCCTTTTTTGCTCTGTG
CTTGAATTCAAGATTCCTGGTTCTGACAGTTTTGCTAACTTCTCCTTACA
AATTTTCATGAGTCTGAAACATATTGAAATGGATATCATCATGTTTTAGT
GTTGAAGCAAAGCTACGTATTCTGCCATCTGAATTCCCTACTCTTATATT
TTCTTATTGAATTATCTTTGTTATTGCATGGACTCATCCTGGTCTGTTAC
CAGATTGTAGCATTTTCTGACCTCATTATTTTTATGATGTGTTAGCCTCT
CGTCTTTTCAGGTTTTCCTCTAATTTTTCTTGTTAAAGCTTCTATCTATT
GCCAAATAATTCTCTTCTGTTATTTTATACTATTGTCTGTCCAATTATGC
CAAAAAGTGGCAAATGATGCTCTGTGCATCTGTGTGCCAGATAAAATAGT
ATCTTGGTTGTTGCATAAGAGTCAAACCAGCAACATGTGCTATCTGTTGA
AGAGGCTTTTTGCATGGACTGAATTTGATACAAATTTATGATTTTTGAAG
CTGCAAGACCAAAATTTTTGTAACTGCTACTTCTAATCTGATATAGTGGC
AGTATGTTTCTTGATGTATATTTCTTGTTGATTGCGTGAAGTCTGAAGTA
TGCTTTACTTAAATCTTATCCTGTAAAAAGTGCATACTTTTATTTGGTGT
CTGGTTTGTTCATTTTTTTTATATCACTTGGCATTGCATATCCTGCATTA
TTTTCATAGTGAAGTTGTTGATGCTACCCATGCTCTAGTGTGTGGTAAAC
TAGGGATACTGTCAGGCAACACTTACTATTTATTACTGTGAATAACCCAT
GACAAACTTATGCCAAATTAACATTTTTGTTAGTCTATCATTAGAAAACC
TTGTTTGTTTGAGTATGGGATGATAACTACAACCAGTTTCACTAGAACAT
AAACTTACAAGCTCTGAAAACCAACCATTTCCTGTTTTTTTCTATACAGA
ACTATAAATAAACTATTACAATGACCGACGACCAGTTTCAACCAATCATT
ATTTTCACTAAATACTATTGGAACTGAATAAGGGCTCTATATACCCAATT
TTTTCACACAGATGGTTTCTGCAAAATATATCGGCCCATCTGGGTTATGT
TTGCTCCCCTGATGGTTCGCTTCTCTTTGTTAATTCCTGTCCATGTTGTT
TTAGAGCAAGATTCAACAATTGTGCTATCTCTGTAGGTTGCGATTTTTCT
CATTCAGAGGAACCGGCACGCTTTAATTGGCAGGGCCATCGATGATCATG
ATATGCAGCGAGTTCTTGAATTTCTGAAATCTGATCCAGTAACTTCTCGA
TTGACCTAATTCATACAATAGTTTAGAAACTATGTTATGAAGCTGATGTT
GTTGCATCTTGCAGGTTGTAGATTCTCTTTATGATTGCAAAAGTGAGGTT
ATCGGACCAGGTTTCTTTAGATTCAAAGCAGAAATTGGTATAACTCTTTT
CATGTGCCATATTCTAGCTTACAGTTATTCTGTTTTATTGCCACTTTAGT
TCACACTTGTGAGGATAAAGCAGTTCCAGATTGAGGCGTTAGTTGCAATT
TTACAAATCGTTCCTTAGTCCACTCAGATTCTTTTTTGAAAGTTAATAAT
TATGGAGCCACTTTTTGGTTATCCTTGTTTGTTTTTATTTGATGAATTGG
CCCATCACTCATTAGTCTAGGACATGGCTATTGGATTACTATTGAGAAGG
AATACACTTCAGTGGGCTAACTATATGAGTTGGTGGCGGTTGACTGAGTC
AGTTTATGAACTATAATTTACTGTGATGTTACTTGAGGCTGTTTTTAATG
TCCAAAATTCCCATAGGGACATTGACTTGCCTGCAAGGATTTTCCCCTTG
TATTGGTATGGGAGGAAGAGTGTCCAGTAGACAGGCAGTGGTAGAGTAGT
AATCCTTTATTGCGAAACAAAAACATTCTGGAATTCAAAGCATGTATTCA
TTATGAATGTTTTTTCAAGTGGGTGCCACAGTTTGCTAATATCTTGACTC
CTCCCTTTCAAATTTGCTGATCTGTTGAGCTCATCTGTACTTGCTTGTTG
TATTTTCTCTTTCCTTTCTGATTTTGTCTTGACGGTTTATTAACCATCCC
ACAGATTTCAATGGAGTAGTCTTGGTGCAAAATTATATGAAAAGGACTGG
ACGTGGAGTATGGGCAAAACAGGTACTTTTTTTACTTTGAAGTAAAGTAG
TTCTAGTTTGTGGTTGCTGTCCGTTATGGGTAATGTTGTTTGCTCTGTTG
GCAATTTAGTGAGTAATTGCTAATTTATCTGCTTATCTGTCCTAATTGAA
GCAATCACTCAATTTACTGTTGAAATTGTAGGCATTATTTCTATTGCTTT
CTGCCTAGTGTTAGGGGTGGGGATATAAACTGAGGACCGAACTACCGAAC
GGAAAGAACCGGGACCGGAGCCAAACGAAGCCGACAAGTTCGGTATTAAA
TTCGGTCATTAGTTCTGCAAAACCGAATTAAATTCAGGAAATCTGGTTTT
GTCCTTGGGTTGACTAAACGGACCTAATAAAATCGAATGCGCGTACATGG
CGCCGTACATGGCGCAGCCCACTTCTCTAATTTTCTAAGAGCATCTCTAA
CAGCTGCTGCAAAATGCGGCAGCAGCCCAAATAACTACCAAATGCGGCAG
TGTGGGGCAAAAAAACGCCTCCAACAGTTGCCGCATCGGTGTTTGCTGCC
GCATTTTTTTGCGGCACTGCTCCCTCCTGCTGCATATTTGCGGCAGCGGA
TGCGCTGCCGCAACGCTGCCGCATTTCTACTTTGCAAGCGCGCCGGGACC
CAACTGCCATGTGAAACTTCCTTTTTTGCTTTGCCGTGCTGCAAAATGGG
GCAGCTGGTAAAGTGACGGCCGTTTTGGTGCCGCAAAATTGCAAATCAGC
TGCCGCATGTCACTTTTTTGCTGCCGCATTTTGCAGCAGCTGTTAAAGAT
GCTGTAAGGACTTCCCTCCTATCCTCTCCATCCTTTTAGTCATACAATGC
AGCCCCACACTAGAAGTGGTCGTGCAGTTGCCCCTGGCCTCCTGCATCGC
AGGTTCGCAGCTGCATCTTTAACCCCAACCGCAAATTAATGTCGCTACGC
TTCAGCCTCCAGTTTGCAACCGGTGGCGGTGGTTCAGCAGCACACGCTTG
GTGGCATCTCCTCCCTCTCCTTTCTTTTGGGCGCCCTTCTACCTCTTCCC
TTTCCACACTGGCGGCCAGCGTGGCTGCACTTCGACCTGCGAGGGACAGC
AGCCATGCTGTCATGGCGAGTGCACAAATTTACAAGATAAATCTGCAGCA
TTTACTTTTTGGTCCAGTTCGGTGATAACCGAGCCCCAAACCGATTTTTC
AGTGCACCGGAACCTCGGTTACCTCTTTTTAGATTGACCGATCGGTTGGC
ATTTTCCGGAAGCAAAAATTCTTTACTACCCGAAGGCCGAAGCATTGTAC
CGATCGCTTTGGGGGAACCGAATGCCCAGGCCTAGCTAGTGTCAGAAGTC
AGTCAGGCAATTGTTGTTTAGTGGCTTGTTCAATACACTGATATTAGTCT
GACACTTACATTGCAGAGAGTTGTGTAATTAATATTTCATGCTAACTGGC
GATGGCAAAAAGTTGAATCAACTGCATGTCCTTGCTGTAGAGTGGGAAAT
ATTAAGTGGAAACCCTCACTTCAATGTCAATTATGTGCACATACCAAGTT
TCAGTAATCTTCCCTAAAACACATGGGCCTATTGGGTGCACTAGCAACTT
GAGGTGTAGTAGGCTTCTAATTCAAAAATTTGAAAGTCATGAAATTTTTC
GAATTTTTTTTAATTCATACAACACATAAGACAAATGTGGGGCTGCATGT
CACAAATTTTTAGATTACAAATGCGACATGGAACTCAACAAACAAAAAAG
ACAAATTCGTTTTTGAATAGTGCCACCAGGATACTATTCATTCTAGATTT
GAATTCACTACTATTCATAGTCTGATTTTTCTTTTTTGTTTATGAAGCTG
TAATTCGAAATTAGATCTGAAAATTTGTGTCAAGGTAGTTGTGTATTACT
CTCTATGCCAGAAATTATTTTCAGAATTTTGGCGACTCTTGAGCTTGATT
TTTATTGGCCTAGTGCACGTGTGCACCTCCCCCAAAAAATACAAGTTGTA
GATGAAGGAAGAACTATAATTGTATAAATGTTCATCCAAGTTGCTTCACA
TCACTGTATGAGCTGCATTTTCACTGTTCATCTTCATTCATGTTTCACAC
ATTTAGAGGAAAATAGGAGGGGTTGCATTAGATACTTTCCTTTTGAGAAG
ATTGTATTCGAGGGATCCAGAGAACACCCTTGTTGTAAGATGGCAAACTA
CCATTTGATGTAAATCGAGCGATCCAGAGAACACCCTTGTTGTAAGATGG
CAAACTACCATTTGATGTAAAATCGTGTGCACTTCGATGTAAGCATCTCA
AAAAATCGTCAATAAAAAATAGTGGAGTAGATGAAGGGAGGATCTGTACC
CAAAGATTCATCTAAGTAGCTTTGGAGTATGAGTTGATTCTTTGCAGTGT
GATTGCTATTCCTTTTTCAGACATTCTCTCATGGCCATCAATCTCGATAA
ATGAGCGATAGCATTTTGATATAACCTTCTATTGTTTTATTTTTACAGTT
TCGGGAGGCTTCATTGAATAAGGATGACGCAGAGCTACGAAAGGTCATGG
CCAACTATGGTATGCGATATGTTGTATTCACAGGCTGTATGTGCTTGTTA
TCTTGTTGGTCTGAAAAGCCACGAAACTGCTTGTACAGGTGAGGGTGTAG
TAGATGCTCTGGGATATGAAGTGGATCGGCTGGAGTCGGAGATACAGAAG
ATCGTGCCTGGAATCAGACATGTTGACATTGAGGCGCACAACCCAGAAGG
GCTTTCAGTTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.